2N5ZA

Mycobacterium tuberculosis: a dynamic view of the resuscitation promoting factor rpfc catalytic domain
Total Genus 13
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
13
sequence length
82
structure length
82
Chain Sequence
GAMGPSPNWDAVAQCESGGNWAANTGNGKYGGLQFKPATWAAFGGVGNPAAASREQQIAVANRVLAEQGLDAWPTCGAASGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Resuscitation-promoting factor RpfC
publication title NMR Structure and Dynamics of the Resuscitation Promoting Factor RpfC Catalytic Domain.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 13
structure length 82
sequence length 82
ec nomenclature ec 3.-.-.-:
pdb deposition date 2015-08-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2n5zA00
1LZ6A 1GAZA 1OUDA 1GD6A 1C10A 1JJ1A 4MSTA 1OUEA 2BQKA 1IY3A 2IFFY 1F6RA 3LHMA 4GCDA 4NSIA 5F16A 5B1GA 3WMKA 3WUAA 3WUMA 3ZEKA 5KKIA 153LA 1O23A 1EQ4A 1LZYA 1FBIX 1UIFA 4XJHA 1I56A 2BQAA 4HTNA 3TMXA 4M4OA 1IX0A 3W6CA 4YEMA 1LOZA 1UIEA 4U3XB 4HTKA 1D6PA 2FBDA 1IWYA 4WM3A 1G7LC 4Z98A 1LJGA 1D6QA 1E8LA 1JKDA 2C8OA 1KIQC 5HNCA 2HUBA 3WULA 1TDYA 3AZ7A 2DQGY 3CT1A 5APDA 4CGEA 1DPXA 1LJ3A 4HPEA 4GN3A 4LT3A 4XJGA 4PPOA 1LZNA 4WM1A 2F4GA 2DQCY 1LSGA 4XJDA 1NF5A 1B7RA 1LZ8A 1B5YA 1GFUA 1CKDA 2ZNXY 4TTDA 4RW2A 4WL7A 5L9JA 1XGUC 208LA 2HU3A 5ILCA 1GB9A 4WM6A 1UA6Y 2YBNA 4MCKA 4N1CC 1HSWA 1J1PY 1LSYA 2CGIA 3W6AA 1VDQA 1TEWA 1VDSA 5II3A 4QY9A 3HBHA 1LZEA 4DD7A 1YQVY 2VB1A 1WQNA 4OWEA 4WLXA 2YBJA 3GXKA 5IHGA 1YANA 2D4KA 4X3BA 4B4IA 2ZQ3A 4IATA 2I25L 1LZ9A 1RI8B 1AT6A 4XYYA 5LXWA 5F81A 3AYQA 1KIPC 5B1FA 1LHHA 4FDYA 4NGOA 4OWCA 4OWHA 4LT2A 3AW7A 1YL0X 1LSMA 154LA 2D4IA 3WYHA 1LHKA 3LYZA 3T36A 3ULRA 2HU1A 4M6DA 3BKVA 1XEIA 4D9ZA 1HNLA 3WPKA 1GXV2 1LMTA 1DQJC 5KXMA 4GN4A 1QSWA 3P66A 5KXPA 1GFJA 4B0DA 3A6BY 4PHIA 5ILFA 2HEEA 4YM8A 1VEDA 1FLUA 2BQIA 1GWDA 1LSEA 5M1YA 4NWEA 4RDSA 4GCBA 5L3IA 4G9SA 4ZIXA 1B7QA 3WH1A 1YIKA 3LYTA 1CKCA 1XGTC 1XGPC 3CQLA 3J4GA 4NSHA 5KJ9A 1RE2A 4WLDA 4BADA 2Z2EA 2N5ZA 1LJNA 3G3AB 4KL7A 4NWHA 4WMGA 1HMKA 1IIZA 3AGGG 1BB5A 3T6UA 1B5UA 2BQBA 1GBWA 1VDPA 2MEGA 3W6FA 2W1YA 4OOOA 2MEFA 1DI3A 1FLQA 1XSFA 3AW6A 6LYTA 3IWRA 1IEEA 3GXRA 2IHLA 1IWUA 1CJ9A 1IR8A 4LT0A 4HV2A 4ETBA 4H9CA 3IJUA 2DKVA 1JITA 1WVUA 5APCA 4G4CA 4LYBA 2DQDY 3CB7A 2NWDX 4L41A 5F9UA 4H8XA 4N9RA 1LMOA 2AUBA 1JSEA 2YBIA 1JTPL 3WW5A 3AB6A 1IC5Y 1LZTA 1QTKA 5B59A 1LZSA 9LYZA 5I53A 1B7LA 1JKAA 3WPJA 1GE4A 2ZILA 3WW6A 1GFEA 3A90A 4H9EA 1IWZA 1UC0A 4GCCA 3WL2A 1LAAA 4HSFA 5KXSA 1OQMA 4HTQA 1IOTA 2DQFC 2ZYCA 4LT1A 3A96A 1TBYA 1UIHA 5E4PA 1EQ5A 4CFOA 4OW1A 2F2NA 5HMVA 1OUBA 4WM4A 1LZRA 4H9AA 4ET8A 4HJZA 5I4WA 8LYZA 2Z12A 4AXTA 4B4EA 4NHTA 2DBTA 3WU7A 1B7PA 2ZIKA 3FI7A 1LZ1A 1GB0A 3LN2A 3J6KA 2CDSA 4W96A 1G7IC 5KXWA 4II8A 1SLYA 5B06A 5C6LA 3TXHA 1NKHA 4NFVA 5HQ1A 1NDGC 1UIBA 5KXLA 4O34A 3B6LA 4RW1A 1G7MC 4LYTA 1LCNA 1W08A 2ZNWY 2D4JA 1GB3A 2X0AA 5LVIA 1CJ6A 1B5VA 1F6SA 1YROA 3QNGA 5A3EA 4IASA 4NGWA 1BWJA 1QTEA 2F4AA 3B0OA 4XJBA 1C43A 3AZ4A 2ZQ4A 1LJHA 1GBZA 4BAPA 5LINA 1IP2A 1EL1A 3ATOA 1IR7A 4ML7A 1WQMA 1YILA 1A2YC 3RW8A 4R0FA 1LTMA 1OP9B 1YKXX 3N9EA 1BB6A 1NBZC 134LA 4KT3A 4ETDA 5DN5A 2H9KA 1DXJA 1ZVHL 2EIZC 3RNXA 1B2KA 1WQOA 4PGJB 5E9RA 2LHMA 5FDJA 1HSXA 5DL9A 1FKQA 2LZTA 5LAGA 3A3QA 5KXXA 1IWXA 2BQJA 1KXXA 2MEAA 2YBLA 1F10A 3LZTA 1J1XY 1GDXA 1UIGA 5J7CA 3A92A 3LYOA 2EKSC 5AMYA 3TMWA 1BGIA 5LA8A 1EQEA 1RJCB 2Z2FA 1JJ0A 4ETCA 1IP4A 4NSJA 1OUIA 5IELA 1B7MA 1LHJA 2LYOA 5I54A 4DDCA 1GE0A 4NY5A 3TXJA 4ANRA 2ZIJA 1LJKA 3CSRA 5FHWA 1FN5A 1PZYA 2Q0MX 1GB6A 1P2CC 2Z38A 4WLTA 1SQ2L 1GHLA 3TXGA 1DKKA 1J1OY 1XEKA 5KXTA 4DD0A 4PRUA 3WPLA 1LYSA 4RLMA 1YKYX 1ZVYB 1HEOA 1HEWA 5I5QA 135LA 1TAYA 1LSAA 2BQCA 2Z19A 2MEIA 4ZEEA 1B7NA 1HHLA 5IDDA 1IY4A 2CJLA 3D3DA 4NG8A 1I20A 3QY4A 4ETEA 4NGIA 1CKGA 4WOAA 5HNLA 4H91A 2A7FA 1HFXA 4C5FA 1QSAA 1GDWA 1CKHA 2BQHA 2D6BA 4NHSA 3D9AC 4YENA 1B9OA 1QIOA 3BKHA 2YSSC 4NGVA 3WVXA 1VATA 5APEA 5F9XA 4TSCA 2HEAA 2WARA 5LIOA 1UBZA 3VWOA 1IC7Y 4J1BA 4H8YA 4EOFA 1IVMA 2H9JA 1HFZA 3IJVA 1WTNA 4LGKA 4TWSA 3A6CY 4LYZA 1GXXA 4DD9A 1JHLA 2GV0A 4RLNA 1JJ3A 1LMAA 3TXIA 1B5WA 3W6BA 1QUSA 4A7DA 5LVKA 4Z41A 2BQOA 1AKIA 1AM7A 1LZDA 1OUGA 4H9BA 1C7PA 4YEOA 5LYMA 1IOSA 1HC0A 1TCYA 1GFAA 3QE8A 1GBYA 4Z3MA 1GEZA 3WU8A 4B1AA 194LA 1NDMC 2HEFA 2BQLA 2XTHA 3RZ4A 4AGAA 4NEBA 1HEMA 4H9FA 1KIRC 4WG7A 1G7JC 1GBXA 3OJPA 5FELA 4B4JA 1GF3A 4DDAA 1IP3A 3F6ZA 4QDNA 4N0JA 4GCFA 1JPOA 1GF0A 4NHQA 1AZFA 1BQLY 1GF7A 1H87A 4WG1A 1FDLY 2EQLA 1IR9A 1JTTL 1KXYA 3WU9A 3AGIA 2D91A 1XEJA 2BPUA 5EBHA 1GB2A 4OWBA 5LYTA 2W1MA 3SP3A 4CHXA 1I1ZA 4G4BA 4H1PA 2HTXA 3B0KA 5D5CA 193LA 3KAMA 1HENA 2Y8PA 1YL1X 1IWTA 4OWAA 5D5FA 4XJIA 5FEKA 4N1EI 5KXKA 4GN5C 3AJNA 4CJ2A 4I0CA 3RU5A 3LYMA 4BAFA 1KXWA 2HECA 4NGYA 1JIYA 5KY1A 4NGLA 1GF5A 5LYZA 2EPEA 2YVBA 3HBDA 1IP7A 3RT5X 1VAUA 1T3PA 1D0KA 4NG1A 4BS7A 2YDGA 1GF4A 3B0IA 6LYZA 1QUTA 1LZ4A 1B5ZA 3WVYA 2Z37A 1GFTA 4PJ2C 5C6JA 1YAPA 1YAQA 1BVKC 1JISA 1DKJA 1C08C 4H9IA 1HFYA 1LZCA 4J1AA 5T3FA 1IC4Y 4UWNA 1GB7A 1LKRA 1LZAA 1UCOA 1XGQC 4H90A 1JTOL 5C6IA 1FLWA 1DI4A 3A93A 1UIAA 4DD2A 1JWRA 1DPWA 1IOCA 1GAYA 1LMNA 2BLYA 1YAOA 2H5ZA 1REZA 4R6CA 1B7SA 5FSTA 1B7OA 1IP5A 1T6VL 2RSCA 4LFXA 4ETAA 5F14A 1CJ7A 1GF6A 4GLAA 1ZV5L 1WVVA 5B07A 4LYCA 1IWWA 3AGHA 3W6DA 2MECA 1C45A 1DZBX 4EMNA 1LZ5A 1V7TA 2Z39A 3G3BB 4NGJA 1VFBC 4C3WA 1LJJA 4N5RA 4WM5A 2BLXA 2HEDA 5KKJA 1LHIA 4HP0A 4LYMA 4W94A 1XGRC 1QQYA 4NHIA 3ATNA 1LHLA 132LA 1LJ4A 3FE0A 1G7HC 4DD3A 3WUNA 3EO5A 2FYCA 1MLCE 3A34A 5LVJA 1MELL 4IJ4A 1GB5A 2CWIA 1BVXA 1IWVA 3HFMY 3P65A 1YKZX 5LVHA 2DQEY 5LVGA 3TXEA 4E3UA 1HEQA 1N4FA 2BQMA 3EBAB 1GE1A 1GFKA 1HERA 1LKSA 4H93A 1YAMA 4DD1A 2PC2A 1LMCA 4DT3A 2I6ZA 3A94A 1NHEA 4NHPA 5HMJA 5KXNA 4ET9A 1LSPA 3N9AA 3A91A 4B49A 5JENB 1BWIA 1OUCA 2F30A 1D0LA 4OOTA 1RCMA 3LZ2A 4HPIA 2C8PA 4WLYA 1NQIA 1V7SA 1UICA 1GFVA 1FLYA 3A95A 7LYZA 1GBOA 5DN4A 1LSNA 4H92A 4WL6A 4XADA 1GF8A 3A8ZA 1REYA 1IO5A 1FKVA 3AZ6A 5KXOA 1GF9A 1GFHA 2ZWBA 1CKFA 3A3RX 2BQFA 3HBEX 207LA 4GCEA 4N8ZA 4UWVA 1F0WA 4KXIA 5KXYA 4DC4A 3TXDA 2ZYPA 4PRQA 4TX7A 1D0MA 3OK0A 1JEFA 1LZBA 4HJVA 1GFGA 1IP6A 1GE2A 2LYZA 4NIJA 1LZGA 5DLAA 2BQNA 2MEEA 3EMSA 1WQRA 3MGWA 2MEHA 4G4HA 1VDTA 4LFPA 4NGZA 4WM2A 4XENA 5HLLA 5B05A 2LZ2A 4MR1A 4HV1A 2DQAA 4TSBA 5LAFA 1H6MA 1UUZC 3W3EA 1GE3A 3TXKA 4FJRA 4H94A 4DWXA 1IORA 5DM9A 1IP1A 2DQIY 1AT5A 1C46A 4QGZA 5APFA 1QDRA 4YF2A 1GB8A 3TXBA 3TMUA 1GPQC 4DYGA 3AZ5A 1LHMA 5FCPA 4UWUA 3TMVA 1OUAA 1INUA 2Z18A 5KXRA 1NMMA 1W6ZA 1OUJA 2W1LA 3EXDA 1REMA 1LYZA 2BQGA 1ZMYL 5I4XA 2MEDA 1PS5A 5L3HA 1NBYC 3CT5A 1JUGA 1BB4A 1GBSA 1XFPL 1OUHA 1CJ8A 2BQEA 4CFPA 1B0DA 1JSFA 2YBHA 3A67Y 3TXFA 2G4PA 4J7VA 1QDTA 1WTMA 3M3UA 4LYOA 4NSGA 1BHZA 4LZTA 1LJIA 1CNSA 1B5XA 1LPIA 1LJFA 3WXUA 2G4QA 1REXA 4H9HA 4WO6A 1GEVA 1HEPA 3P64A 3ZVQB 3M18B 2XBSA 3CSZA 1LSBA 4I8SA 5A3ZA 4J0LA 1LYYA 4XJFA 5KXZA 1LSCA 2YBMA 3CSQA 2LYMA 1LJEA 2BAAA 2MEBA 2BQDA 1LSZA 1LYOA 2DQJY 1UIDA 1BWHA 4P2EA 3P68A 3W6EA 1WQQA 1JKCA 2DQHY 1LSDA 4Z46A 1UACY 5LA5A 2FYDA 4KPMA 4GLVA 3B72A 1A4VA 1HF4A 2B5ZA 4HJYA 4WO9A 4YOPA 1LSFA 2G4NA 1D9UA 3CT0A 1GFRA 1Z55A 2XJWA 2HEBA 4QEQA 1JKBA 4TUNA 2FBBA 1BB3A 1IOQA 4NGKA 3E3DA 4G49A 4DDBA 1HELA 1HMLA 4H8ZA 1LMQA 1BB7A 3ZVQA 1LMPA 1RFPA 3N9CA 2W1XA 2I26L 3WXTA 4XN6A 2A7DA 5K7OA 5I4YA 133LA 1ALCA 1DI5A 1NWGA 1OUFA 2XBRA 3K3TA 1WQPA 3P4ZA 4ZFPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LZ6A 3HT6A 1C10A 1JJ1A 5B1GA 4ARQA 2RB0X 155LA 108LA 138LA 1O23A 1EQ4A 1FBIX 1I56A 1IX0A 4U3XB 149LA 1G7LC 4DJHA 1C61A 5HNCA 2B72A 3WULA 1LJ3A 4HPEA 1KY0A 1P36A 4XJGA 4PPOA 180LA 1LSGA 3V2YA 1LZ8A 151LA 1L67A 2LC9A 3W6AA 1LSYA 4ZPUA 3SB9A 1LZEA 4DD7A 1L15A 5IHGA 1YANA 4X3BA 4IATA 2I25L 1LHHA 4OWCA 4LT2A 1YL0X 154LA 2D4IA 1C6KA 4M6DA 4D9ZA 1XEIA 1HNLA 2NTGA 3CDQA 3P66A 1CV3A 225LA 1SX2A 4PHIA 5ILFA 3HTBA 2B74A 1D3NA 1L81A 5M1YA 4G9SA 3WH1A 1CKCA 4NSHA 1L77A 1LJNA 4W58A 1ZYTA 4KL7A 4WMGA 1B5UA 2MEGA 4YXAC 3GUIA 1D3JA 2W1YA 1DI3A 1FLQA 1CTWA 1DYFA 3GXRA 1L12A 1QTZA 2ANVA 1L00A 1JSEA 1B6IA 3AB6A 1IC5Y 3C81A 1C6HA 3GUPA 1L27A 3A90A 4GCCA 237LA 4EXMA 241LA 1TBYA 4I7LA 4OW1A 1OYUA 8LYZA 4AXTA 1QT4A 4I7MA 1C6BA 3J6KA 190LA 4II8A 1NDGC 4O34A 7LZMA 2X0AA 1CV6A 3AZ4A 1IR7A 3N9EA 4ETDA 2H9KA 4E97A 1DXJA 5E9RA 3RZEA 2LHMA 1FKQA 1C64A 3A3QA 4IAPA 1CV0A 1KXXA 1PQDA 3TMWA 201LA 3JR6A 3C8RA 4ETCA 1IP4A 1G0JA 4I7QA 3TXJA 1LJKA 3CSRA 148LE 1GB6A 2Z38A 4PRUA 3SB8A 3C83A 209LA 1HEOA 1TAYA 1IY4A 2CJLA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1LZ6 A;  1GAZ A;  1OUD A;  1GD6 A;  1C10 A;  1JJ1 A;  4MST A;  1OUE A;  2BQK A;  1IY3 A;  2IFF Y;  1F6R A;  3LHM A;  4GCD A;  4NSI A;  5F16 A;  5B1G A;  3WMK A;  3WUA A;  3WUM A;  3ZEK A;  5KKI A;  153L A;  1O23 A;  1EQ4 A;  1LZY A;  1FBI X;  1UIF A;  4XJH A;  1I56 A;  2BQA A;  4HTN A;  3TMX A;  4M4O A;  1IX0 A;  3W6C A;  4YEM A;  1LOZ A;  1UIE A;  4U3X B;  4HTK A;  1D6P A;  2FBD A;  1IWY A;  4WM3 A;  1G7L C;  4Z98 A;  1LJG A;  1D6Q A;  1E8L A;  1JKD A;  2C8O A;  1KIQ C;  5HNC A;  2HUB A;  3WUL A;  1TDY A;  3AZ7 A;  2DQG Y;  3CT1 A;  5APD A;  4CGE A;  1DPX A;  1LJ3 A;  4HPE A;  4GN3 A;  4LT3 A;  4XJG A;  4PPO A;  1LZN A;  4WM1 A;  2F4G A;  2DQC Y;  1LSG A;  4XJD A;  1NF5 A;  1B7R A;  1LZ8 A;  1B5Y A;  1GFU A;  1CKD A;  2ZNX Y;  4TTD A;  4RW2 A;  4WL7 A;  5L9J A;  1XGU C;  208L A;  2HU3 A;  5ILC A;  1GB9 A;  4WM6 A;  1UA6 Y;  2YBN A;  4MCK A;  4N1C C;  1HSW A;  1J1P Y;  1LSY A;  2CGI A;  3W6A A;  1VDQ A;  1TEW A;  1VDS A;  5II3 A;  4QY9 A;  3HBH A;  1LZE A;  4DD7 A;  1YQV Y;  2VB1 A;  1WQN A; 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 4DYG A;  3AZ5 A;  1LHM A;  5FCP A;  4UWU A;  3TMV A;  1OUA A;  1INU A;  2Z18 A;  5KXR A;  1NMM A;  1W6Z A;  1OUJ A;  2W1L A;  3EXD A;  1REM A;  1LYZ A;  2BQG A;  1ZMY L;  5I4X A;  2MED A;  1PS5 A;  5L3H A;  1NBY C;  3CT5 A;  1JUG A;  1BB4 A;  1GBS A;  1XFP L;  1OUH A;  1CJ8 A;  2BQE A;  4CFP A;  1B0D A;  1JSF A;  2YBH A;  3A67 Y;  3TXF A;  2G4P A;  4J7V A;  1QDT A;  1WTM A;  3M3U A;  4LYO A;  4NSG A;  1BHZ A;  4LZT A;  1LJI A;  1CNS A;  1B5X A;  1LPI A;  1LJF A;  3WXU A;  2G4Q A;  1REX A;  4H9H A;  4WO6 A;  1GEV A;  1HEP A;  3P64 A;  3ZVQ B;  3M18 B;  2XBS A;  3CSZ A;  1LSB A;  4I8S A;  5A3Z A;  4J0L A;  1LYY A;  4XJF A;  5KXZ A;  1LSC A;  2YBM A;  3CSQ A;  2LYM A;  1LJE A;  2BAA A;  2MEB A;  2BQD A;  1LSZ A;  1LYO A;  2DQJ Y;  1UID A;  1BWH A;  4P2E A;  3P68 A;  3W6E A;  1WQQ A;  1JKC A;  2DQH Y;  1LSD A;  4Z46 A;  1UAC Y;  5LA5 A;  2FYD A;  4KPM A;  4GLV A;  3B72 A;  1A4V A;  1HF4 A;  2B5Z A;  4HJY A;  4WO9 A;  4YOP A;  1LSF A;  2G4N A;  1D9U A;  3CT0 A;  1GFR A;  1Z55 A;  2XJW A;  2HEB A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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