4WM2A

High pressure protein crystallography of hen egg white lysozyme at 600 mpa
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title High-pressure protein crystallography of hen egg-white lysozyme
pubmed doi rcsb
total genus 52
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2014-10-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4wm2A00
4NGZA 2BAAA 5KXKA 1LZSA 2LZTA 1YL0X 2DQDY 5KXSA 1MELL 2HUBA 3OJPA 4NHPA 4XADA 1LSDA 1GF4A 3HBDA 1YKZX 2D4KA 4IASA 4B49A 1D6PA 3LZTA 4M4OA 3BKVA 1Z55A 2D6BA 2D4JA 3AZ7A 3QNGA 2HECA 1REXA 5LVIA 1LSCA 1GFTA 1LAAA 1ZV5L 5HMJA 4HJZA 1V7TA 1GF0A 1W08A 1IX0A 2EIZC 4TUNA 3WL2A 3TXBA 134LA 4KT3A 3A3RX 4I0CA 1GD6A 1IWWA 2HU3A 1UIDA 5B59A 1OUDA 1YIKA 3AYQA 1GFUA 1IOTA 1LYSA 1NBZC 2LHMA 4UWUA 3WUAA 3WYHA 4DD0A 1IC7Y 1JSEA 4R6CA 1UIHA 5A3EA 4H90A 2BQJA 1LSAA 1WVVA 1A4VA 3ZVQB 3LN2A 4G49A 3A95A 3T36A 5KXNA 1IP3A 1NQIA 2FBDA 3TXDA 1B2KA 3WU8A 3WPKA 3WXUA 1HELA 1GBXA 4B4JA 5D5CA 2BQAA 2ZQ4A 4HTKA 135LA 1HMKA 1FKVA 4WM5A 4NG8A 1KIPC 4NGLA 1GWDA 3LYZA 5LYZA 4DDBA 4H8YA 4NIJA 5A3ZA 1D9UA 1DKKA 1LHKA 5LYMA 1LKRA 133LA 4DD2A 1J1PY 4N9RA 1B5UA 4WM4A 1JTOL 2LYMA 1LJHA 1GB6A 1GDWA 1LKSA 4MCKA 2RSCA 2Z12A 5I54A 1IY4A 1LZCA 1WTNA 1REZA 1GFGA 4GN4A 4XJDA 4RLNA 1JWRA 1IP4A 1WQPA 4DDAA 1N4FA 4W96A 1HF4A 1XGUC 3MGWA 5II3A 4BADA 1XGPC 1GBWA 3A91A 1B5XA 2IHLA 1LZ8A 2ZWBA 2YBHA 3A3QA 2BQLA 4BS7A 5LINA 3IJVA 5B05A 1GF9A 4NGVA 1IO5A 4H9CA 1NMMA 5B1FA 1YAMA 4XN6A 1QQYA 132LA 2PC2A 4ETBA 2EPEA 1QDTA 4DD9A 1WQMA 4HJVA 2MEAA 5DLAA 1VEDA 3AZ6A 4HTNA 3B72A 1GB7A 3AGHA 5C6LA 1GFAA 1CJ7A 5KKIA 4H9FA 1D0MA 2G4NA 1CJ8A 1NHEA 1NKHA 4NGYA 5LIOA 2LZ2A 3A6CY 1B5VA 1TAYA 5APFA 4BAPA 1LMTA 4LFPA 1T3PA 1GFRA 4Z41A 4LYCA 2DQHY 193LA 4G4HA 3LHMA 5APDA 3GXKA 3J4GA 4ZFPA 1GB5A 3LZ2A 1BHZA 1LJ3A 5LA8A 1TDYA 4A7DA 3W3EA 1HEMA 1LSGA 1JITA 1VDPA 1REYA 2WARA 3ULRA 4HJYA 2FYDA 1IP6A 4NY5A 4WM6A 2DQAA 3K3TA 5LVHA 3N9AA 4CHXA 1YKYX 1ZMYL 4WLYA 3WH1A 1XGRC 4HV1A 1B5YA 1DPXA 1LJGA 4G4BA 4TSCA 3WU7A 1LMPA 2HEAA 5I53A 4CFOA 4DDCA 1UBZA 4GCBA 4N1EI 1TEWA 1FKQA 1JJ3A 2BLXA 4LYTA 4KL7A 4WG7A 1TCYA 4XJBA 1RI8B 3SP3A 1QTKA 1LZNA 4XJHA 1LJJA 1HMLA 3WULA 5E4PA 3WUNA 4WM3A 2Z18A 3A67Y 3N9EA 1OUIA 4LT2A 2Q0MX 5I4XA 1OUEA 4DD7A 1IR7A 4WLDA 5B1GA 5IELA 3WPJA 3G3AB 1LHJA 1V7SA 1AKIA 2YDGA 1BGIA 1GEVA 1UIFA 1GHLA 1GFHA 4ML7A 4DWXA 5KXWA 1GDXA 2CJLA 5AMYA 4XYYA 2NWDX 3A96A 3AW7A 4RLMA 5HNCA 5F16A 5APCA 1LHHA 1GPQC 1JSFA 3CT0A 1JKCA 2Z2FA 2Z19A 4UWNA 1LSMA 2YVBA 4OWEA 2Z39A 1LYZA 1IOQA 194LA 4NHIA 4LGKA 1LZ4A 1WVUA 1GBZA 3IWRA 4H91A 2MEEA 5DN5A 1CNSA 1LTMA 1QSAA 1JISA 2BQGA 3D3DA 1C10A 5LVJA 3ATNA 2IFFY 1JTTL 2W1XA 1DQJC 1GE4A 2YSSC 1G7JC 5I4YA 1YKXX 5KY1A 4ZIXA 1OP9B 4H8ZA 3RNXA 1F0WA 1EQEA 1C08C 4H9EA 4NWHA 4B1AA 1B5WA 1GE2A 3TXFA 2ZYCA 5FELA 1LYOA 1B7MA 2MEBA 4L41A 2XTHA 4RW1A 5KXRA 5DL9A 207LA 2X0AA 4TSBA 2BLYA 4NGWA 1G7LC 4LT1A 4NGKA 4YM8A 1SLYA 1HEWA 1OUGA 3OK0A 4LT3A 4H9IA 1O23A 1UACY 3W6DA 1FLYA 3CB7A 3ZEKA 1UUZC 2ZIJA 4YOPA 2YBNA 1GFVA 3EMSA 4NFVA 2BQDA 1LZGA 1LSZA 3QE8A 1I1ZA 4OWCA 1VATA 1CKGA 1FDLY 1JKAA 1GB8A 4MSTA 4NHQA 4DD3A 4H92A 1LJEA 4GCEA 5FSTA 4EOFA 1J1OY 4GCFA 3LYMA 3M18B 5T3FA 5IHGA 4OOOA 3P65A 1FN5A 2DQJY 1GE3A 1LMAA 4PGJB 1IIZA 3CSZA 1HSXA 1LCNA 3A34A 3CSQA 4NSHA 1BB6A 1NDGC 5APEA 3TMVA 5F81A 1GE0A 4XJGA 2F2NA 2ZIKA 4H9HA 4WO6A 4R0FA 1GF6A 1WQOA 2Z38A 4P2EA 1YAQA 1H6MA 1IR9A 1HSWA 3A94A 3WU9A 1MLCE 4I8SA 5KXLA 4H1PA 4GCCA 1IOCA 1UC0A 1IP7A 1UIEA 1XEJA 2D91A 2XBRA 2BQKA 3GXRA 1UICA 4LYOA 1D6QA 3G3BB 1AZFA 3CQLA 1PS5A 3A6BY 5DN4A 4ANRA 1XGQC 1EL1A 4O34A 4IATA 3B0KA 4DC4A 1GF7A 1JTPL 4GCDA 4OWBA 5I4WA 1QSWA 3WW5A 1LJIA 1DZBX 4ETEA 2HU1A 5KXXA 3A90A 4MR1A 2YBMA 1LZRA 1LMNA 1IP2A 3WPLA 1OUFA 4ETDA 4J7VA 1XGTC 3W6EA 1F10A 1J1XY 1GE1A 3FI7A 3A8ZA 4PPOA 1GB3A 4RW2A 3TXKA 2YBLA 4N1CC 5DM9A 1HFZA 2LYZA 1AT6A 2EQLA 5KXPA 1GEZA 4OWHA 4X3BA 5JENB 1B5ZA 1UCOA 4HSFA 2MEHA 1IWUA 1F6RA 2MEDA 1LZBA 3F6ZA 5L3IA 1JEFA 4CGEA 4WG1A 3LYOA 1VDSA 4WM2A 1IWVA 1GBOA 3CT1A 5B07A 1FLWA 1DPWA 4NG1A 2CGIA 2HEDA 2VB1A 3T6UA 1TBYA 3RU5A 5KXOA 1HFYA 1HNLA 1QDRA 4W94A 2F4AA 1VFBC 1B7LA 2Y8PA 1UIAA 1RE2A 4WM1A 1BB5A 1YL1X 2ZYPA 1XEIA 5C6JA 2CDSA 1CKCA 2HEFA 4HPIA 1NDMC 1XSFA 2H9JA 4GLAA 1IWTA 1G7MC 4G9SA 1LSYA 1I56A 4NGJA 2MEGA 1QTEA 1I20A 1BWHA 3FE0A 4DT3A 4G4CA 1BVXA 4HP0A 3AZ4A 1BB3A 4GN5C 1HEQA 1GAYA 4U3XB 1XFPL 2YBJA 3ATOA 3WUMA 1CJ9A 4E3UA 5FCPA 3WVXA 4H8XA 4KPMA 1G7HC 1LSPA 2ZILA 3AGIA 3AZ5A 2CWIA 3CSRA 5K7OA 3RZ4A 5LAGA 1LHLA 1EQ4A 1QIOA 5L9JA 4TX7A 1GB2A 1NF5A 1UA6Y 1GXV2 4XJFA 3W6CA 1W6ZA 4RDSA 4BAFA 6LYTA 4ET8A 4NHSA 4LYZA 5LVGA 2EKSC 2BQNA 1UIGA 3HBEX 2N5ZA 4LZTA 4ZEEA 4QY9A 4H94A 1C7PA 4WMGA 4WO9A 1LYYA 1P2CC 1LMCA 2ZNWY 5KXZA 1B7QA 5LAFA 4AXTA 3A93A 3WMKA 1IP1A 4N5RA 5FEKA 3P66A 1YANA 1BQLY 1HEPA 1OUHA 7LYZA 1YAOA 5HQ1A 1H87A 1LSNA 3TXJA 2BQMA 2XJWA 4CJ2A 1INUA 2B5ZA 1D0LA 1YQVY 2BQHA 2F30A 1ALCA 4NWEA 4J0LA 4C3WA 1LZEA 3BKHA 3WXTA 4IJ4A 1DI4A 3W6BA 153LA 3TMXA 3P64A 1LOZA 2AUBA 5HLLA 5KXMA 1IWYA 3QY4A 1IEEA 1DI3A 1C46A 5KXYA 1B7SA 2GV0A 1LZYA 3W6AA 4AGAA 3TXHA 4FJRA 4XENA 4DYGA 2G4QA 4Z46A 3B0IA 4LYMA 1IVMA 1HFXA 4KXIA 4QDNA 1LHMA 1JKBA 1LZ1A 1DKJA 1LMOA 1IORA 1G7IC 4PRQA 2C8PA 4N8ZA 1GF5A 2BPUA 2W1MA 2DQGY 4NGOA 4N0JA 4WL7A 1LZTA 1RJCB 1BWJA 1LHIA 1LZAA 1OUCA 1B7OA 4NSIA 4WL6A 8LYZA 1T6VL 1VAUA 3P68A 2MECA 2ZQ3A 1LZ5A 1FBIX 3B6LA 2I25L 1IP5A 4Z98A 1YAPA 2BQCA 4B0DA 4QEQA 2ZNXY 4D9ZA 2DQEY 1FLUA 2H9KA 2MEFA 1LPIA 1VDTA 3A92A 4HPEA 4OWAA 4WOAA 5M1YA 1REMA 3AW6A 4WLTA 1RCMA 4LT0A 1KXWA 4GN3A 1GBYA 1GFKA 1DI5A 1LZ6A 1F6SA 3AB6A 1WQRA 3CT5A 3W6FA 4J1BA 2FYCA 5ILCA 1EQ5A 2BQBA 1CKFA 1GF3A 3EBAB 4XJIA 1JKDA 2DQCY 4TWSA 5KKJA 1LJNA 1PZYA 1OUAA 4DD1A 2I6ZA 2Z2EA 5LVKA 5LYTA 4H9AA 5C6IA 4WLXA 5HMVA 1AM7A 1LSBA 1GFEA 1OUBA 1IWZA 1HHLA 2DQFC 1IR8A 2XBSA 3M3UA 1HERA 4NSJA 2HEBA 4OW1A 3TXGA 3TMUA 1SQ2L 1LZDA 1B7RA 1JJ0A 2A7FA 4PJ2C 5I5QA 4YF2A 1QUTA 3AGGG 4NGIA 5LA5A 154LA 2Z37A 5FHWA 5J7CA 1A2YC 1DXJA 1FLQA 1KXYA 1LSFA 1GB0A 1ZVHL 2A7DA 1GF8A 2YBIA 4UWVA 4C5FA 1D0KA 1VDQA 5F9UA 1BB7A 4M6DA 1IC5Y 3KAMA 3WVYA 2DQIY 1HC0A 5IDDA 4B4IA 5KJ9A 4QGZA 1C45A 2BQEA 2F4GA 1CKHA 4ETCA 1LJKA 2G4PA 4LYBA 2HEEA 5EBHA 5L3HA 1E8LA 4NHTA 1GAZA 4FDYA 1IWXA 4CFPA 2W1YA 4NEBA 1LJFA 2DBTA 4B4EA 3D9AC 2H5ZA 3N9CA 1WQNA 4HTQA 3TMWA 1YROA 4EMNA 3RW8A 2BQFA 2D4IA 9LYZA 5FDJA 4ETAA 1CJ6A 3EXDA 3LYTA 1IY3A 1KIRC 1LJ4A 2FBBA 4PHIA 5KXTA 2I26L 4LFXA 1B7NA 4J1AA 5B06A 2DKVA 1WQQA 2C8OA 3AJNA 1B7PA 2BQIA 4TTDA 3TXIA 1LSEA 1CKDA 3IJUA 208LA 1BWIA 3EO5A 1NBYC 3WW6A 2LYOA 5LXWA 1JUGA 4YENA 3P4ZA 4PRUA 1KXXA 1QUSA 3HFMY 1HENA 4HV2A 1NWGA 1B9OA 4ET9A 2W1LA 5HNLA 3VWOA 1JJ1A 1IOSA 1LMQA 4OOTA 1C43A 1RFPA 3B0OA 4YEMA 1HEOA 1XEKA 1BB4A 1B0DA 5F14A 1LZ9A 1KIQC 6LYZA 1BVKC 3ZVQA 5D5FA 1JPOA 3RT5X 4YEOA 2BQOA 1WTMA 4II8A 4H9BA 4H93A 3J6KA 2HTXA 1UIBA 1ZVYB 1OQMA 1YILA 3HBHA 4GLVA 4NSGA 5F9XA 1GBSA 1OUJA 3E3DA 1GXXA 5ILFA 1GFJA 2MEIA 1IC4Y 1AT5A 3TXEA 5E9RA 1JHLA 4Z3MA 1JIYA 1GB9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1QUHA 2LZTA 1YL0X 2DQDY 1QUDA 2HUBA 2RBSA 4NHPA 4DQ7A 2D4KA 4IASA 4B49A 1D6PA 2D6BA 1LSCA 1GFTA 1ZV5L 1W08A 4TUNA 4I0CA 5B59A 3AYQA 3G3VA 4G49A 3A95A 1NHBA 5KXNA 2FBDA 1G0PA 5D5CA 2BQAA 2ZQ4A 3CDTA 5LYZA 5A3ZA 149LA 1LKRA 1L88A 1JTOL 1LJHA 1GDWA 1C6IA 4EJ4A 1GFGA 150LA 1JWRA 164LA 4W96A 5II3A 1L70A 4BADA 2A4TA 180LA 227LA 3SBBC 2YBHA 4BS7A 3IJVA 1GF9A 4NGVA 1T97A 3G3XA 2OTYX 2B73A 132LA 4DD9A 249LA 3AZ6A 170LA 4EKSA 1KS3A 5C6LA 1GFAA 4H9FA 2LZ2A 3A6CY 1B5VA 1TAYA 5APFA 1LMTA 1T3PA 2DQHY 3J4GA 4ZFPA 3V2YA 1LSGA 1L42A 1VDPA 4HJYA 2FYDA 2DQAA 3K3TA 4EPFA 1YKYX 1ZMYL 189LA 4HV1A 4TSCA 2RAYX 4CFOA 259LA 4DDCA 1JJ3A 4WG7A 4KL7A 114LA 1QTKA 4XJHA 5E4PA 4LT2A 2Q0MX 1L31A 1OUEA 1SSWA 5B1GA 5IELA 3G3AB 2YDGA 165LA 4LZMA 1C6LA 1UIFA 1GHLA 4ML7A 4I7PA 5KXWA 1L37A 2NWDX 3A96A 4RLMA 5F16A 2NTGA 5APCA 3CT0A 1GPQC 1C6AA 2Z2FA 4UWNA 1LSMA 2Z39A 1IOQA 3HTDA 172LA 1P56A 1L63A 2MEEA 1LTMA 5DN5A 1C10A 3ATNA 178LA 1DQJC 3CDOA 1L52A 1G7JC 5I4YA 205LA 1L30A 5KY1A 239LA 1C08C 4H9EA 1PQMA 1GE2A 2XQOA 1L43A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4NGZ A;  2BAA A;  5KXK A;  1LZS A;  2LZT A;  1YL0 X;  2DQD Y;  5KXS A;  1MEL L;  2HUB A;  3OJP A;  4NHP A;  4XAD A;  1LSD A;  1GF4 A;  3HBD A;  1YKZ X;  2D4K A;  4IAS A;  4B49 A;  1D6P A;  3LZT A;  4M4O A;  3BKV A;  1Z55 A;  2D6B A;  2D4J A;  3AZ7 A;  3QNG A;  2HEC A;  1REX A;  5LVI A;  1LSC A;  1GFT A;  1LAA A;  1ZV5 L;  5HMJ A;  4HJZ A;  1V7T A;  1GF0 A;  1W08 A;  1IX0 A;  2EIZ C;  4TUN A;  3WL2 A;  3TXB A;  134L A;  4KT3 A;  3A3R X;  4I0C A;  1GD6 A;  1IWW A;  2HU3 A;  1UID A;  5B59 A;  1OUD A;  1YIK A;  3AYQ A;  1GFU A;  1IOT A;  1LYS A;  1NBZ C;  2LHM A;  4UWU A;  3WUA A;  3WYH A;  4DD0 A;  1IC7 Y;  1JSE A;  4R6C A;  1UIH A;  5A3E A;  4H90 A;  2BQJ A;  1LSA A;  1WVV A;  1A4V A;  3ZVQ B;  3LN2 A;  4G49 A;  3A95 A;  3T36 A;  5KXN A;  1IP3 A;  1NQI A;  2FBD A;  3TXD A;  1B2K A;  3WU8 A;  3WPK A;  3WXU A;  1HEL A;  1GBX A;  4B4J A;  5D5C A;  2BQA A;  2ZQ4 A;  4HTK A;  135L A;  1HMK A;  1FKV A;  4WM5 A;  4NG8 A;  1KIP C;  4NGL A;  1GWD A;  3LYZ A;  5LYZ A;  4DDB A;  4H8Y A;  4NIJ A;  5A3Z A; 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 1VDQ A;  5F9U A;  1BB7 A;  4M6D A;  1IC5 Y;  3KAM A;  3WVY A;  2DQI Y;  1HC0 A;  5IDD A;  4B4I A;  5KJ9 A;  4QGZ A;  1C45 A;  2BQE A;  2F4G A;  1CKH A;  4ETC A;  1LJK A;  2G4P A;  4LYB A;  2HEE A;  5EBH A;  5L3H A;  1E8L A;  4NHT A;  1GAZ A;  4FDY A;  1IWX A;  4CFP A;  2W1Y A;  4NEB A;  1LJF A;  2DBT A;  4B4E A;  3D9A C;  2H5Z A;  3N9C A;  1WQN A;  4HTQ A;  3TMW A;  1YRO A;  4EMN A;  3RW8 A;  2BQF A;  2D4I A;  9LYZ A;  5FDJ A;  4ETA A;  1CJ6 A;  3EXD A;  3LYT A;  1IY3 A;  1KIR C;  1LJ4 A;  2FBB A;  4PHI A;  5KXT A;  2I26 L;  4LFX A;  1B7N A;  4J1A A;  5B06 A;  2DKV A;  1WQQ A;  2C8O A;  3AJN A;  1B7P A;  2BQI A;  4TTD A;  3TXI A;  1LSE A;  1CKD A;  3IJU A;  208L A;  1BWI A;  3EO5 A;  1NBY C;  3WW6 A;  2LYO A;  5LXW A;  1JUG A;  4YEN A;  3P4Z A;  4PRU A;  1KXX A;  1QUS A;  3HFM Y;  1HEN A;  4HV2 A;  1NWG A;  1B9O A;  4ET9 A;  2W1L A;  5HNL A;  3VWO A;  1JJ1 A;  1IOS A;  1LMQ A;  4OOT A;  1C43 A;  1RFP A;  3B0O A;  4YEM A;  1HEO A;  1XEK A;  1BB4 A;  1B0D A;  5F14 A;  1LZ9 A;  1KIQ C;  6LYZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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