1LCNA

Monoclinic hen egg white lysozyme, thiocyanate complex
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
publication title Structural effects of monovalent anions on polymorphic lysozyme crystals.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (LYSOZYME)
total genus 44
structure length 129
sequence length 129
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1998-10-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1lcnA00
5DN5A 2MEIA 1HMKA 2BQFA 194LA 1JTTL 1B7NA 4AXTA 1XGTC 4LYZA 1LSPA 1LSEA 2Q0MX 3WUNA 2A7DA 4WM6A 2I6ZA 4WG1A 2EIZC 1LZTA 3QE8A 5APEA 4EMNA 2LYMA 3AW7A 1GB3A 2BQKA 4Z41A 1UA6Y 2ZWBA 1GBOA 3A6CY 1LJ4A 2CWIA 153LA 4QDNA 1DI3A 2Z18A 3BKVA 4LT0A 5KXRA 3WVYA 1SQ2L 3LYZA 4E3UA 1HSXA 3CQLA 4ETBA 4ZIXA 5KXLA 1ALCA 1UIGA 4GN5C 3OJPA 1LJKA 4MSTA 4NGKA 1IIZA 208LA 2EQLA 4XADA 1WQNA 1BB6A 1CNSA 2BQEA 1O23A 2B5ZA 1HEQA 1LYZA 1DI4A 3CSZA 1LPIA 4PJ2C 3WUAA 3ATNA 4U3XB 2DQEY 2X0AA 3WMKA 1WQOA 4XJHA 5LYTA 1C43A 1LOZA 5I4YA 2FYDA 4XJGA 1E8LA 4J1AA 4WM1A 1JJ0A 3QNGA 1LSCA 2AUBA 1YQVY 4NSGA 4LYOA 5KXOA 1GDXA 1GDWA 3AZ7A 3IJUA 1GFVA 1VDPA 5M1YA 4H9EA 1W08A 1P2CC 1UIAA 2MEAA 3RU5A 3A95A 3HFMY 2ZNXY 4ETAA 3EMSA 4XJFA 3AGIA 154LA 4WLTA 4ET8A 1XGRC 4X3BA 1LKRA 2BAAA 2ZIJA 4LGKA 4GCEA 5I4WA 3VWOA 1CKFA 1LZ4A 2BQNA 4NGIA 3F6ZA 1WVVA 5B06A 1B7SA 2BQOA 1NKHA 1GB6A 1TCYA 1D9UA 1OQMA 1UIBA 4NGVA 3WXUA 1QUSA 5F81A 4NSIA 2YBJA 1GB5A 4KT3A 5LIOA 1IP2A 4B4IA 4DD0A 1JTPL 1VDSA 2FBDA 5J7CA 4NGOA 5IDDA 1AT6A 4HP0A 1DI5A 3MGWA 3M18B 1BQLY 2MECA 3TXGA 1YL0X 4ML7A 3P65A 1JKCA 1NWGA 4GLAA 4RDSA 1LJFA 4ET9A 2HU3A 1VFBC 4PPOA 2HEDA 4NGWA 1LZ6A 2F4GA 2W1MA 2YBIA 2HEEA 1IWUA 1NMMA 4L41A 4HJYA 3W6CA 3B0KA 1A2YC 2PC2A 3W6EA 2DQHY 4H91A 2D4KA 4CFOA 1H6MA 1LHIA 1REZA 2BQCA 1G7LC 4XJIA 3WUMA 1LMCA 1F6RA 2W1XA 5LINA 1IOCA 3EXDA 1GFAA 3WU9A 1IY3A 3IJVA 3T36A 5K7OA 1UIHA 2ZQ3A 1IWWA 2BPUA 5LVJA 4XJDA 1CJ6A 1D0MA 5KKIA 1NQIA 2Z38A 5FELA 5LVHA 1IWTA 1WQRA 2DQGY 1GAYA 1GB2A 4DD7A 5B1FA 2ZIKA 3TMXA 1RE2A 2XTHA 5HLLA 4D9ZA 1REXA 5E4PA 1QDRA 1VEDA 3LYMA 4IASA 3RZ4A 4LFPA 4B0DA 4PGJB 4H8XA 1FKVA 1GE3A 1NBYC 2ZYPA 1YAQA 4GCCA 1GD6A 1IWXA 1IVMA 5B07A 1LMQA 4IJ4A 3WH1A 1LZ9A 1REYA 1YKYX 2ZQ4A 3AB6A 4HV2A 1YANA 5F9UA 1LZ1A 1UC0A 1NBZC 4B1AA 4CGEA 3D3DA 3W6AA 2DQFC 9LYZA 2F30A 2BQDA 4PRUA 1GFGA 1IP1A 1RJCB 3J4GA 4N8ZA 4NSJA 1LJJA 1G7MC 1GBXA 2LYZA 4I0CA 5LAFA 1B7OA 1GE4A 3ZEKA 2BLXA 1B7MA 1BWIA 1JTOL 1W6ZA 3LZTA 1HEPA 5FHWA 1IWYA 1XGQC 4TTDA 4WLXA 3A94A 3ULRA 1GF6A 4NWHA 1TDYA 4N1CC 1RFPA 1D0KA 3TXIA 1LTMA 2C8PA 2N5ZA 1WQPA 1V7SA 3AZ4A 1EQ4A 1LKSA 1B7PA 1BWJA 1JITA 1WTNA 5I4XA 1ZVYB 2ZNWY 1JJ3A 2H9KA 1YL1X 2G4NA 3HBHA 1JKDA 1LSFA 1LYOA 4H8YA 4WO9A 4XJBA 3WL2A 3WU8A 5F14A 1LZAA 2HU1A 1HENA 4LYBA 3WW5A 4H1PA 3TMUA 1IC4Y 5L9JA 3ZVQA 5FCPA 2DQCY 1AKIA 4KL7A 3GXRA 1IP4A 4NIJA 1VDQA 3P68A 1IC5Y 4NEBA 4TUNA 4NFVA 2W1YA 1LYYA 3A3RX 4ETEA 3A3QA 1UUZC 3CT0A 1IEEA 4M6DA 193LA 2DBTA 3LZ2A 4DDCA 4WM3A 1GFJA 1PZYA 5T3FA 1LHMA 1LZSA 4WL6A 5DL9A 2HTXA 2YSSC 1JPOA 4NSHA 1DKJA 4WG7A 4YENA 1LJNA 2DQDY 2FYCA 1GFUA 1LMPA 1DZBX 2D4IA 1TEWA 4DWXA 3N9AA 5AMYA 1CKCA 4DD2A 4YEOA 1CJ8A 2MEFA 5EBHA 1TAYA 1LHKA 3AJNA 4B4JA 3LYTA 1HSWA 4YEMA 5A3ZA 5KXNA 4AGAA 3B0IA 3CT5A 1GF7A 1CJ9A 1F10A 4G4HA 4HTKA 4WMGA 3TXFA 2YBHA 3A34A 3A6BY 1FLWA 2MEBA 3IWRA 4NHTA 4NHSA 5KXXA 4UWVA 1YAPA 1RI8B 4WLDA 1GXXA 4NG8A 4BAPA 3AGGG 1NDGC 2Z2FA 4NY5A 1D6PA 1QDTA 1HERA 1GAZA 4B4EA 4DDAA 2ZILA 5HMVA 5KXMA 5B05A 3W6DA 5JENB 1FN5A 1IC7Y 1DQJC 5DLAA 4CJ2A 3BKHA 1DKKA 4DD9A 1INUA 4H9FA 1OUFA 2LZ2A 3TXDA 5KJ9A 1B5UA 1YILA 1HFYA 1GE2A 1YKZX 2LHMA 2XBRA 4RLMA 2BQLA 4N5RA 5LAGA 2EKSC 4NG1A 4P2EA 2CJLA 5LYMA 2BQIA 1HELA 3A92A 1D0LA 1VAUA 4WO6A 3W6BA 4YM8A 2H5ZA 3FE0A 4H8ZA 3TXEA 1OUHA 4DYGA 1BGIA 5F16A 4ZFPA 3AYQA 1HNLA 4MR1A 1KIQC 1IOTA 4DD3A 5KY1A 3CSRA 3J6KA 4LT2A 1UICA 4H93A 1B7RA 4N0JA 4NGZA 1REMA 4YOPA 1EQEA 1OUEA 4DT3A 5KXZA 5F9XA 1GBYA 1YKXX 4QEQA 1LZEA 3WVXA 1JKAA 3G3BB 4H90A 1I20A 1C08C 1WTMA 4C5FA 1VATA 1QUTA 4OOOA 4RLNA 5HNCA 4PHIA 1F0WA 1QSAA 1GBSA 4HSFA 1OUCA 5KKJA 1NHEA 5LVIA 1QIOA 5KXPA 1B5ZA 1HMLA 1LJEA 1LSZA 5LVKA 5LXWA 5DM9A 1OUAA 3EO5A 1G7JC 4I8SA 4J7VA 1D6QA 1N4FA 3B72A 1OUDA 1FLQA 1GPQC 4OWBA 1LZCA 1LZDA 2IHLA 2NWDX 4LT3A 1GFRA 4W96A 1HF4A 1LSDA 1LZYA 4ZEEA 5IHGA 2YBMA 5D5FA 4QY9A 4HPEA 4LZTA 1WQQA 3TMWA 1GFTA 1IP7A 4H9BA 2F2NA 4LT1A 1GXV2 133LA 3RNXA 3WW6A 4QGZA 1GF4A 2H9JA 1UIFA 4HJZA 1JIYA 3AGHA 1LJIA 5ILFA 3D9AC 1BHZA 1BWHA 4G9SA 1B9OA 1JJ1A 1LCNA 1GF9A 3KAMA 4HJVA 1B7LA 5KXSA 3WPLA 2XBSA 1B5VA 8LYZA 2GV0A 1LSAA 3EBAB 1XFPL 5FSTA 2Z39A 3ATOA 4NHQA 2IFFY 1IOQA 1LMNA 3TXJA 4NWEA 132LA 2LYOA 3A67Y 4YF2A 1CKHA 4LYTA 3SP3A 1FBIX 2W1LA 5E9RA 3P64A 4DC4A 1WVUA 2BQJA 3A8ZA 1GWDA 1KXXA 4Z98A 1YIKA 2F4AA 1GF0A 1ZMYL 2C8OA 1GE1A 1KXYA 2Z19A 2YDGA 3AZ5A 4KXIA 4OOTA 1FLUA 5LYZA 3T6UA 4NGLA 1BB3A 4ETDA 1B2KA 4R0FA 1B5XA 6LYZA 1BB7A 1TBYA 1CJ7A 1HFXA 4TWSA 1B5WA 4KPMA 3TXHA 2HEFA 4M4OA 1LMOA 1AZFA 2YVBA 2YBNA 6LYTA 3WU7A 4BS7A 1A4VA 1GEZA 2HEAA 4OW1A 1QSWA 4OWAA 4GN4A 4H9IA 1IP3A 4NGYA 1QTKA 1IY4A 4GCFA 3W6FA 1IOSA 5FEKA 2Z12A 1IP6A 2DQAA 1IP5A 1JEFA 5ILCA 5APFA 1MLCE 1FDLY 2HEBA 4RW2A 1HC0A 2HECA 4LFXA 1DXJA 1B7QA 4TX7A 4Z46A 1JSFA 1LAAA 4A7DA 1T3PA 1LHLA 1AT5A 1JHLA 1KXWA 1HEWA 1BB4A 4WM2A 4Z3MA 4HTNA 4BADA 1GB0A 4OWEA 5II3A 1LSNA 1B5YA 1B0DA 4J1BA 4WM5A 4DDBA 2G4PA 1EQ5A 1LZ5A 1UIEA 1JSEA 2DKVA 4GCDA 4J0LA 1UCOA 1AM7A 4II8A 3W3EA 1GBWA 4XN6A 3RW8A 1EL1A 207LA 5IELA 2MEEA 5KXTA 1BB5A 3AW6A 4WM4A 1NF5A 1HEOA 1PS5A 3WPKA 2I26L 3TMVA 2DQIY 1SLYA 3LHMA 5I53A 2YBLA 1IX0A 3LN2A 3OK0A 4O34A 3CT1A 4XENA 1KIPC 4TSCA 3B6LA 1XEKA 3CB7A 1LSYA 5C6JA 1J1PY 3TXBA 2MEHA 4DD1A 3A96A 3N9CA 4H94A 3WULA 2I25L 2WARA 4IATA 3QY4A 4GLVA 1RCMA 4OWHA 2A7FA 1UACY 4BAFA 4GN3A 5KXKA 1GFHA 3TXKA 1C10A 5C6IA 4UWUA 1IR9A 3AZ6A 1F6SA 1OUBA 1VDTA 4H9AA 1GE0A 1I56A 2RSCA 4HTQA 5B59A 1XSFA 2CGIA 4RW1A 1GFEA 1HHLA 1IWVA 5C6LA 1LZ8A 5FDJA 4N1EI 1T6VL 1LHJA 3FI7A 1GB9A 1GEVA 1IWZA 1LMAA 4CHXA 2CDSA 2D91A 1G7HC 1JKBA 1CKDA 2BQMA 1C45A 3WYHA 1NDMC 3WXTA 1HEMA 1H87A 2D4JA 1BVXA 1GB8A 5I54A 1JISA 3N9EA 1UBZA 1YAMA 2Z2EA 1LSMA 5L3IA 4WL7A 1LZGA 2BQBA 3LYOA 4G4BA 4FDYA 1LZNA 4G4CA 1MELL 1YAOA 2Y8PA 1XEJA 2ZYCA 1C46A 4G49A 4N9RA 4LYMA 1J1XY 1Z55A 4ANRA 1KIRC 1LSBA 3P66A 2BQGA 4LYCA 4FJRA 4H9HA 1GBZA 1IR8A 1C7PA 4H9CA 5L3HA 4W94A 2BLYA 3GXKA 1I1ZA 1XGUC 4NHPA 1GFKA 4MCKA 3A93A 1ZVHL 5B1GA 4GCBA 2MEGA 5HMJA 1FKQA 1LZBA 1LHHA 5D5CA 1QTEA 1FLYA 4NHIA 4C3WA 2LZTA 5HNLA 1XEIA 1JUGA 1J1OY 1LYSA 4TSBA 1IR7A 5APCA 3WPJA 3ZVQB 1WQMA 1LZRA 1QQYA 1GF3A 1DPXA 135LA 1LSGA 3K3TA 2EPEA 1CKGA 3M3UA 1DPWA 1GHLA 1IO5A 3A90A 4CFPA 5DN4A 5APDA 2MEDA 5HQ1A 2BQAA 1OUGA 5KXYA 4PRQA 4HPIA 4B49A 3HBDA 1GB7A 4WOAA 1LJ3A 1IORA 4EOFA 7LYZA 2XJWA 4R6CA 1OUJA 5A3EA 1LJHA 3P4ZA 4ETCA 4WLYA 1BVKC 1YROA 3HBEX 3CSQA 1GF8A 2BQHA 4H92A 1OUIA 2D6BA 3E3DA 4OWCA 1LJGA 1JWRA 2FBBA 4UWNA 2HUBA 4HV1A 1UIDA 1GF5A 2DQJY 1HFZA 5LVGA 1LMTA 2VB1A 3RT5X 1OP9B 4NGJA 1G7IC 1V7TA 1ZV5L 1XGPC 3B0OA 134LA 2G4QA 4XYYA 5LA8A 3G3AB 5I5QA 3A91A 5KXWA 5LA5A 2Z37A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2MEIA 4LYZA 1LSPA 1LSEA 3SB5A 2LYMA 1UA6Y 2ZWBA 153LA 3BKVA 5KXRA 4E3UA 1SQ2L 4ZIXA 3HT7A 1HSXA 1LYHA 2EQLA 212LA 1BB6A 2B73A 2B5ZA 1DI4A 148LE 3GUNA 1C43A 2FYDA 1SX7A 1JJ0A 3QNGA 185LA 1GDXA 5M1YA 1LWKA 4LDLA 1QT4A 4DAJA 3RU5A 3HFMY 3AGIA 1QTCA 3HH5A 4ARJA 2BAAA 4LGKA 141LA 190LA 3F6ZA 1K28A 1TCYA 1D9UA 4W56A 4DD0A 2OEAX 2FBDA 2MECA 3DN6A 1NWGA 1VFBC 1LZ6A 3FA0A 220LA 3W6CA 1LHIA 5LINA 1L41A 1GFAA 3OE8A 227LA 2RBQA 5LVHA 1NQIA 1IWTA 2RB1X 1L96A 4D9ZA 1REXA 1QDRA 3PBLA 4LFPA 4B0DA 4GCCA 1QSBA 1CU5A 1YAQA 1IWXA 1IVMA 5B07A 1LMQA 1G0MA 2ZQ4A 1DYCA 2BQDA 4I7JA 3LZMA 2RAYX 1LJJA 2LYZA 5LAFA 1B7MA 159LA 1JTOL 239LA 176LA 1GF6A 1PQMA 1L67A 1CU3A 1QTVA 4I7KA 1LTMA 1LGWA 1B7PA 1JITA 1L83A 1WTNA 3RZ4A 1C6MA 2H9KA 4XJBA 4DQJA 165LA 2HU1A 4LYBA 3G3VA 4H1PA 3TMUA 4LDEA 1LYJA 3ZVQA 2DQCY 1LI2A 3GXRA 1VDQA 3P68A 1C6FA 2W1YA 1LYYA 1P2RA 4ETEA 2LZMA 1L95A 4M6DA 149LA 3LZ2A 1LHMA 1LZSA 4WL6A 2NTHA 1DKJA 4WG7A 1GFUA 1CKCA 1HSWA 1OV5A 4G4HA 3SB9A 4WMGA 2MEBA 1YAPA 4EPIA 5HMVA 4B4EA 5KXMA 3W6DA 5JENB 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5DN5 A;  2MEI A;  1HMK A;  2BQF A;  194L A;  1JTT L;  1B7N A;  4AXT A;  1XGT C;  4LYZ A;  1LSP A;  1LSE A;  2Q0M X;  3WUN A;  2A7D A;  4WM6 A;  2I6Z A;  4WG1 A;  2EIZ C;  1LZT A;  3QE8 A;  5APE A;  4EMN A;  2LYM A;  3AW7 A;  1GB3 A;  2BQK A;  4Z41 A;  1UA6 Y;  2ZWB A;  1GBO A;  3A6C Y;  1LJ4 A;  2CWI A;  153L A;  4QDN A;  1DI3 A;  2Z18 A;  3BKV A;  4LT0 A;  5KXR A;  3WVY A;  1SQ2 L;  3LYZ A;  4E3U A;  1HSX A;  3CQL A;  4ETB A;  4ZIX A;  5KXL A;  1ALC A;  1UIG A;  4GN5 C;  3OJP A;  1LJK A;  4MST A;  4NGK A;  1IIZ A;  208L A;  2EQL A;  4XAD A;  1WQN A;  1BB6 A;  1CNS A;  2BQE A;  1O23 A;  2B5Z A;  1HEQ A;  1LYZ A;  1DI4 A;  3CSZ A;  1LPI A;  4PJ2 C;  3WUA A;  3ATN A;  4U3X B;  2DQE Y;  2X0A A;  3WMK A;  1WQO A;  4XJH A;  5LYT A;  1C43 A;  1LOZ A;  5I4Y A;  2FYD A;  4XJG A;  1E8L A;  4J1A A;  4WM1 A;  1JJ0 A;  3QNG A;  1LSC A;  2AUB A;  1YQV Y;  4NSG A;  4LYO A;  5KXO A;  1GDX A;  1GDW A;  3AZ7 A;  3IJU A;  1GFV A;  1VDP A;  5M1Y A;  4H9E A;  1W08 A;  1P2C C;  1UIA A;  2MEA A;  3RU5 A;  3A95 A; 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 4WL7 A;  1LZG A;  2BQB A;  3LYO A;  4G4B A;  4FDY A;  1LZN A;  4G4C A;  1MEL L;  1YAO A;  2Y8P A;  1XEJ A;  2ZYC A;  1C46 A;  4G49 A;  4N9R A;  4LYM A;  1J1X Y;  1Z55 A;  4ANR A;  1KIR C;  1LSB A;  3P66 A;  2BQG A;  4LYC A;  4FJR A;  4H9H A;  1GBZ A;  1IR8 A;  1C7P A;  4H9C A;  5L3H A;  4W94 A;  2BLY A;  3GXK A;  1I1Z A;  1XGU C;  4NHP A;  1GFK A;  4MCK A;  3A93 A;  1ZVH L;  5B1G A;  4GCB A;  2MEG A;  5HMJ A;  1FKQ A;  1LZB A;  1LHH A;  5D5C A;  1QTE A;  1FLY A;  4NHI A;  4C3W A;  2LZT A;  5HNL A;  1XEI A;  1JUG A;  1J1O Y;  1LYS A;  4TSB A;  1IR7 A;  5APC A;  3WPJ A;  3ZVQ B;  1WQM A;  1LZR A;  1QQY A;  1GF3 A;  1DPX A;  135L A;  1LSG A;  3K3T A;  2EPE A;  1CKG A;  3M3U A;  1DPW A;  1GHL A;  1IO5 A;  3A90 A;  4CFP A;  5DN4 A;  5APD A;  2MED A;  5HQ1 A;  2BQA A;  1OUG A;  5KXY A;  4PRQ A;  4HPI A;  4B49 A;  3HBD A;  1GB7 A;  4WOA A;  1LJ3 A;  1IOR A;  4EOF A;  7LYZ A;  2XJW A;  4R6C A;  1OUJ A;  5A3E A;  1LJH A;  3P4Z A;  4ETC A;  4WLY A;  1BVK C;  1YRO A;  3HBE X;  3CSQ A;  1GF8 A;  2BQH A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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