4LT2A

Hewl co-crystallized with carboplatin in non-nacl conditions: crystal 2 processed using the eval software package
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
publication title Carboplatin binding to a model protein in non-NaCl conditions to eliminate partial conversion to cisplatin, and the use of different criteria to choose the resolution limit
rcsb
molecule keywords Lysozyme C
total genus 47
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4lt2A00
1G7HC 1AM7A 3EMSA 1LSCA 2H5ZA 3AGHA 4TWSA 1C08C 1REYA 5KXZA 1KIPC 1LKSA 2IFFY 1JJ1A 1YAMA 3AZ6A 4XENA 5KXOA 4O34A 5DL9A 4DYGA 1F6SA 1OUCA 207LA 3A90A 4HJYA 4WLYA 2MEHA 5B1GA 4WM2A 1IY4A 3WVXA 2ZQ4A 1GF0A 4HTNA 1FKVA 1GB5A 4GCEA 2YBHA 3W3EA 3EO5A 1FN5A 1HSWA 2FBDA 1WTNA 1GF8A 1B7NA 2ZYCA 3P64A 1GE3A 1LSPA 1NBZC 1LJIA 1UUZC 135LA 134LA 1GHLA 1LJ4A 3HBHA 2C8PA 4WMGA 1BVXA 3B0OA 4MCKA 1CJ6A 4NHQA 5L3HA 3A96A 4KXIA 2D4JA 1D6QA 4CJ2A 1FKQA 1OUBA 1LJ3A 1WQOA 1LZ4A 1F6RA 1GF5A 1GF3A 4U3XB 2BQOA 3A92A 4WM5A 1UIHA 2X0AA 5AMYA 4XN6A 2GV0A 2BQFA 1YKZX 3N9CA 5DN4A 3W6AA 3P66A 4LYCA 2ZWBA 3TXIA 1HEWA 4H9EA 1QSAA 3EXDA 1PS5A 1UIBA 3WW6A 3D3DA 1C10A 1HHLA 3HBEX 4TX7A 1LJEA 4NY5A 3G3AB 1XGRC 4NGKA 1LHLA 4NFVA 5LYZA 4KPMA 1HENA 5FCPA 2BQNA 5L3IA 1D6PA 1ZV5L 1YQVY 1TCYA 4H92A 5E9RA 132LA 5LAGA 4DT3A 2BQBA 2HEEA 3P65A 1IWWA 7LYZA 1B5XA 3CSRA 1CKHA 1DKKA 4B4EA 4TSBA 4PHIA 1IWXA 4DD2A 1QTKA 4J0LA 5E4PA 5HQ1A 1IO5A 1LSFA 1JSFA 1DI4A 1VEDA 3LYMA 4NGYA 1B7OA 1UACY 3M3UA 1SLYA 1GDXA 1UIGA 5B1FA 4WL7A 4UWUA 4PGJB 4AGAA 5I54A 2BQKA 5KJ9A 4H9HA 5APDA 4GLVA 1CJ9A 3A6CY 3QNGA 1LSYA 1NKHA 4NGVA 4BS7A 3GXKA 1E8LA 4J7VA 1GEZA 2DKVA 5APFA 4AXTA 1CKFA 2DQHY 4XJFA 4X3BA 3WXTA 3N9AA 3CB7A 2ZIKA 4WL6A 5I53A 1B5ZA 3LHMA 4PRUA 2VB1A 4DC4A 1IY3A 5IDDA 4N5RA 1OUEA 3W6EA 4GN5C 1LPIA 1GE1A 4I0CA 5KY1A 4ETBA 4NGJA 3TMXA 4GCDA 4NGOA 1G7IC 1IP3A 1IP5A 4B1AA 4M6DA 4LYTA 3HBDA 4NGZA 1KXXA 2XTHA 1LMNA 1JKBA 4HJVA 4W96A 1LZ8A 2BLYA 3QY4A 4YF2A 4H9IA 154LA 1YKYX 4G4HA 3RNXA 1IWZA 1FLQA 3OJPA 2DQDY 1C7PA 1LJHA 4II8A 5KXSA 3AW7A 1ALCA 1GBZA 1BB3A 1BB7A 1V7TA 1Z55A 4HV2A 2EKSC 4EMNA 2Z38A 1GFGA 1LSNA 1OUHA 1JTTL 1NQIA 1OUAA 1B2KA 1WTMA 1LHJA 2A7DA 2YBLA 5DN5A 3KAMA 1B5YA 1HF4A 4OWEA 1HEOA 1YAPA 3CT0A 4GN3A 3AZ4A 5T3FA 5KKIA 193LA 2HEBA 4I8SA 4NHIA 1IORA 1GFRA 4ETCA 4ETDA 1WQNA 1NDGC 1LSMA 4PRQA 3SP3A 1B5VA 3WPLA 3RW8A 1MELL 1GFEA 1BB5A 1VDTA 1YROA 1H6MA 1INUA 1HFZA 1VDQA 4LZTA 4HV1A 1BWIA 1GD6A 3AYQA 4J1BA 1I56A 1CKDA 2MEAA 1B5UA 2BQCA 3TXEA 4H9BA 1FBIX 1G7LC 1H87A 5FHWA 3ZVQB 2DBTA 3WU9A 1LSGA 4OOOA 1JKDA 4YEMA 4M4OA 1WVVA 4LGKA 4NSGA 1LZBA 3VWOA 4Z41A 1LSDA 1QTEA 2Z2EA 3A94A 5A3ZA 5JENB 4HTQA 5LYMA 1IEEA 2ZYPA 3B0KA 3EBAB 3WXUA 4EOFA 4XJDA 1IVMA 1LZ9A 1QSWA 2A7FA 2G4PA 1A4VA 1UICA 5HMJA 2C8OA 1LZRA 5FSTA 6LYTA 3A67Y 4J1AA 2BQJA 3HFMY 5IELA 1HEQA 1JTPL 3J4GA 5I4YA 3FE0A 5APEA 1GBSA 4XJGA 2Z19A 4NHPA 5EBHA 1IWYA 1LZ5A 3LYZA 2Z2FA 4ETEA 3WL2A 4N9RA 1LZSA 1UIAA 5F16A 1OUIA 5FELA 2BQEA 2FBBA 4N8ZA 3AZ5A 4W94A 2HEDA 3CSQA 5LVIA 3CT1A 4RW1A 3TMUA 1GAYA 4TTDA 4H9AA 1QDRA 1P2CC 1LHMA 2LYZA 2F4AA 1EQEA 2D4IA 1IWTA 3WMKA 1YL0X 1REMA 4B4IA 4E3UA 1LYOA 5B05A 2YSSC 2MEGA 3A95A 5APCA 1GF6A 4H1PA 2N5ZA 1XGUC 1REXA 3TMVA 1PZYA 1YILA 5B06A 1WQQA 2YBJA 1KIRC 1GFKA 3CQLA 2CDSA 2LYOA 1WQMA 2Z12A 3W6FA 1GPQC 1QQYA 4WM4A 4LT0A 1JTOL 1LJGA 3TXBA 5B07A 4NSIA 2BLXA 2CWIA 5C6JA 2DQEY 5LVKA 4C3WA 1TAYA 2XJWA 1DKJA 4QGZA 1AKIA 5KXXA 1QUTA 1UIDA 4WG7A 1SQ2L 1B7SA 1BVKC 1FLYA 2YDGA 1V7SA 2ZNWY 1GB6A 1NBYC 1C43A 4WM3A 4CFPA 1UIEA 4RLMA 5KXLA 2BQLA 3WYHA 1W08A 1VDPA 1KXWA 2BQAA 4WLXA 1GE2A 1AT5A 1DZBX 3AW6A 5FDJA 2BQHA 1D0KA 4DD7A 3OK0A 1DPXA 4Z46A 1RFPA 4BAPA 3A91A 1BHZA 3AB6A 3IJVA 5KXYA 1GB8A 3D9AC 4FJRA 3WPJA 5IHGA 3WUNA 1B7RA 1UC0A 1AT6A 3AZ7A 1DXJA 4XYYA 3W6BA 1XSFA 1D0MA 1RCMA 2Q0MX 1TBYA 4B4JA 194LA 1GE0A 1UIFA 4YOPA 3WPKA 5C6LA 1VDSA 1LZCA 3ATOA 2D6BA 4HJZA 5LXWA 1HEPA 4LFPA 3AJNA 1I20A 3CSZA 3G3BB 1IWVA 1G7MC 4LT3A 5DLAA 4NIJA 2HECA 1YL1X 3A8ZA 1WQPA 1LYZA 1WQRA 1GF7A 2HEAA 1DQJC 2HU3A 2MEBA 4WLTA 4NSHA 5ILCA 3K3TA 1HELA 1HMKA 4XJIA 4OWCA 2BQGA 1GBOA 1NHEA 3A34A 4H8ZA 4NWEA 4GCCA 5KXMA 1LZ6A 1GDWA 4G9SA 1QUSA 4YM8A 4FDYA 1IOTA 3W6DA 2YVBA 1LSZA 1BB6A 3CT5A 2G4NA 3WU8A 1NDMC 5K7OA 1ZVHL 4HPIA 5LVGA 4H8YA 3LYOA 1YKXX 2LHMA 4ANRA 4NGWA 1DI3A 2MEDA 1LMOA 1N4FA 1LJFA 2HEFA 2Z18A 3LN2A 4G49A 4YEOA 4P2EA 2LZTA 5KXPA 5C6IA 4IJ4A 1GBWA 1GAZA 2FYDA 1JUGA 1A2YC 1IWUA 4H91A 1LZAA 1HNLA 4DDAA 5A3EA 2CJLA 3LZ2A 5LVHA 1LTMA 1YANA 4CHXA 1IOQA 3TXJA 5HLLA 2YBMA 4DD9A 1TEWA 4GCFA 1BWHA 5ILFA 2FYCA 4L41A 3TXHA 2WARA 1B7QA 4HPEA 4ZIXA 2BQIA 1GFTA 4G4BA 2AUBA 2B5ZA 1HERA 1YAOA 4H9CA 3A93A 1IOSA 1GXXA 3ATNA 1REZA 2XBSA 4BAFA 5KXWA 5KXNA 4IASA 2YBIA 5D5FA 4GN4A 1EQ4A 3E3DA 1F10A 1O23A 4NHSA 1HC0A 1OP9B 4NGLA 1IP2A 5I4XA 1CKCA 1B0DA 4DD0A 133LA 5DM9A 1NMMA 5KXRA 1GB3A 1LZGA 1HSXA 4WOAA 5HNLA 4QEQA 1LOZA 4ZEEA 3ZVQA 2HUBA 1VATA 1T6VL 4RW2A 4PJ2C 1LSBA 4DWXA 1GBXA 1IC7Y 4IATA 1VAUA 1D9UA 5B59A 1J1OY 3WVYA 1G7JC 2EQLA 1LSEA 4DDBA 4QDNA 1LHKA 1JITA 1JISA 4XADA 1XGTC 1JJ3A 1BWJA 1WVUA 4XJBA 4R6CA 1GF4A 3BKVA 2G4QA 1I1ZA 2W1MA 1B7PA 1LMCA 3WULA 1GEVA 3F6ZA 3T36A 3WUAA 1HEMA 1LMTA 5LA8A 2Z39A 2MEEA 3A3QA 5D5CA 4DD1A 1UA6Y 1ZMYL 1DI5A 4OOTA 1D0LA 1YIKA 3TXGA 2DQFC 3TXFA 9LYZA 3RZ4A 4NWHA 1KXYA 4LT2A 2F30A 4ML7A 1XGQC 4NEBA 1NWGA 5LINA 1GWDA 1GE4A 1LYYA 2W1XA 1JJ0A 1JHLA 4XJHA 2BQMA 2MEIA 1BB4A 3MGWA 3P4ZA 1J1PY 2HTXA 3BKHA 1J1XY 3AGGG 2NWDX 1HMLA 4PPOA 4WM6A 4HSFA 3B72A 2DQIY 1CKGA 4H90A 4N1CC 1XGPC 2I26L 4GCBA 5HNCA 8LYZA 1BQLY 1IX0A 1HFYA 1LJNA 4WO6A 1JEFA 1GFUA 4KL7A 1UCOA 3P68A 2I6ZA 3RT5X 5KKJA 1OUFA 4ZFPA 4YENA 2LZ2A 208LA 4Z98A 2DQJY 2D4KA 3A3RX 2ZIJA 1QDTA 1IR9A 1IIZA 3ULRA 1KIQC 1LZEA 4OWAA 1XFPL 3ZEKA 4DDCA 1BGIA 4LYZA 1FDLY 2W1LA 3WU7A 4BADA 4RDSA 3B6LA 1GB9A 1ZVYB 1OUJA 1IOCA 1XEIA 4NHTA 3GXRA 4ETAA 5F14A 1IR7A 4LYBA 4WO9A 2F4GA 1GFVA 3WUMA 1JIYA 1FLWA 1FLUA 2BQDA 3FI7A 4LYMA 5F9UA 4ET9A 3LZTA 4RLNA 4TUNA 3T6UA 1CNSA 5HMVA 4WLDA 153LA 1B5WA 1C46A 2Z37A 4NSJA 4H94A 4HP0A 5II3A 1IP1A 5J7CA 2MECA 1GFJA 2BPUA 1XEKA 4H93A 4LFXA 4KT3A 4LT1A 5LAFA 3N9EA 5LIOA 1IP6A 1IR8A 3TXKA 1IC4Y 1LMQA 1GFHA 1RE2A 4B49A 5I4WA 1JPOA 1LCNA 3B0IA 1LZYA 1NF5A 1LHHA 4QY9A 3W6CA 5L9JA 1RI8B 4LYOA 4WM1A 1CJ8A 1QIOA 4NG1A 4OWBA 1XEJA 4B0DA 2Y8PA 1JKAA 4MSTA 4Z3MA 1C45A 1GF9A 1W6ZA 3LYTA 2F2NA 5I5QA 2PC2A 3J6KA 4N1EI 1LZDA 4TSCA 4WG1A 1AZFA 2EIZC 1EQ5A 1LZ1A 1LHIA 5KXTA 2DQGY 1F0WA 1JSEA 1LKRA 1LJKA 2IHLA 1OUGA 3RU5A 1GB0A 4R0FA 2ZNXY 1LAAA 1LZNA 1LZTA 1UBZA 2D91A 3IJUA 1IC5Y 1T3PA 1TDYA 4OWHA 1GBYA 1CJ7A 1VFBC 1OQMA 4C5FA 1EL1A 1MLCE 2CGIA 1IP7A 1LYSA 2DQAA 3WW5A 1GFAA 1GXV2 2RSCA 2EPEA 4H9FA 2ZILA 1GB2A 3AGIA 2LYMA 6LYZA 4ET8A 2BAAA 1B7MA 3IWRA 5F9XA 1JWRA 2HU1A 2ZQ3A 4HTKA 4UWNA 5FEKA 3WH1A 3QE8A 4D9ZA 1IP4A 5M1YA 1YAQA 1LMPA 1LJJA 2XBRA 4DD3A 4GLAA 5LYTA 1B9OA 5F81A 1LMAA 4MR1A 4N0JA 4UWVA 5LVJA 4NG8A 1HFXA 2H9JA 2I25L 4NGIA 2MEFA 3TMWA 2YBNA 2H9KA 3A6BY 1OUDA 1JKCA 1LSAA 2DQCY 3M18B 4G4CA 1DPWA 1GB7A 4OW1A 1RJCB 4CGEA 4CFOA 3TXDA 5KXKA 4A7DA 1B7LA 2W1YA 5LA5A 4H8XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1QT5A 1AM7A 3AZ6A 1JJ1A 1YAMA 1OUCA 1D2YA 1DYBA 4WM2A 1IY4A 1GB5A 3W3EA 3OE9A 222LA 4I7JA 3HBHA 3B0OA 2O7AA 1CV1A 1FKQA 1WQOA 1LZ4A 1GF3A 3HT9A 1QT4A 1UIHA 2NTGA 209LA 3W6AA 175LA 235LA 1HEWA 1UIBA 3DKEX 1L41A 1LPYA 5LZMA 4NGKA 2ANXA 5LYZA 1HENA 5L3IA 1D6PA 4H92A 1OWZA 249LA 7LYZA 3CSRA 4TSBA 147LA 2OTYX 4ARPA 3GUMA 3RUNA 1LSFA 1B7OA 3M3UA 4EKPA 1GDXA 254LA 1L24A 4H9HA 1NKHA 1E8LA 4J7VA 2DKVA 229LA 1CKFA 1KNIA 1QTCA 4XJFA 4PK0A 1C6GA 3C8SA 3CB7A 5I53A 3LHMA 4DC4A 1OV5A 4ETBA 260LA 4GCDA 1G7IC 1IP5A 4B1AA 155LA 4LYTA 3HBDA 150LA 4I7QA 3HTGA 4W96A 2BLYA 1FLQA 2NTHA 1CTWA 3C83A 4II8A 1ALCA 1BB3A 2EKSC 1GFGA 3NYAA 4AXTA 4I7NA 1JTTL 1LHJA 6LZMA 2B72A 3KAMA 1L66A 4OWEA 1L54A 149LA 4GN3A 3CT0A 4I7SA 2HEBA 1IORA 2LCBA 140LA 1WTHA 1MELL 3RW8A 1GFEA 1YROA 1C66A 1BWIA 1L86A 3HT7A 214LA 1B5UA 3TXEA 3CDTA 5FHWA 1DYGA 1LSGA 4LDEA 4M4OA 1WVVA 4NSGA 4Z41A 2B70A 1SX7A 3HTDA 1CV3A 2B6WA 2Z2EA 3A94A 3WXUA 4XJDA 1IVMA 4W59A 2F47A 165LA 1UICA 190LA 3A67Y 5IELA 1HEQA 1L31A 1L48A 1LZ5A 4ETEA 5F16A 4YX7C 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1G7H C;  1AM7 A;  3EMS A;  1LSC A;  2H5Z A;  3AGH A;  4TWS A;  1C08 C;  1REY A;  5KXZ A;  1KIP C;  1LKS A;  2IFF Y;  1JJ1 A;  1YAM A;  3AZ6 A;  4XEN A;  5KXO A;  4O34 A;  5DL9 A;  4DYG A;  1F6S A;  1OUC A;  207L A;  3A90 A;  4HJY A;  4WLY A;  2MEH A;  5B1G A;  4WM2 A;  1IY4 A;  3WVX A;  2ZQ4 A;  1GF0 A;  4HTN A;  1FKV A;  1GB5 A;  4GCE A;  2YBH A;  3W3E A;  3EO5 A;  1FN5 A;  1HSW A;  2FBD A;  1WTN A;  1GF8 A;  1B7N A;  2ZYC A;  3P64 A;  1GE3 A;  1LSP A;  1NBZ C;  1LJI A;  1UUZ C;  135L A;  134L A;  1GHL A;  1LJ4 A;  3HBH A;  2C8P A;  4WMG A;  1BVX A;  3B0O A;  4MCK A;  1CJ6 A;  4NHQ A;  5L3H A;  3A96 A;  4KXI A;  2D4J A;  1D6Q A;  4CJ2 A;  1FKQ A;  1OUB A;  1LJ3 A;  1WQO A;  1LZ4 A;  1F6R A;  1GF5 A;  1GF3 A;  4U3X B;  2BQO A;  3A92 A;  4WM5 A;  1UIH A;  2X0A A;  5AMY A;  4XN6 A;  2GV0 A;  2BQF A;  1YKZ X;  3N9C A;  5DN4 A;  3W6A A;  3P66 A;  4LYC A;  2ZWB A;  3TXI A;  1HEW A;  4H9E A;  1QSA A;  3EXD A;  1PS5 A;  1UIB A;  3WW6 A;  3D3D A;  1C10 A;  1HHL A;  3HBE X;  4TX7 A;  1LJE A;  4NY5 A; 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 1IC4 Y;  1LMQ A;  1GFH A;  1RE2 A;  4B49 A;  5I4W A;  1JPO A;  1LCN A;  3B0I A;  1LZY A;  1NF5 A;  1LHH A;  4QY9 A;  3W6C A;  5L9J A;  1RI8 B;  4LYO A;  4WM1 A;  1CJ8 A;  1QIO A;  4NG1 A;  4OWB A;  1XEJ A;  4B0D A;  2Y8P A;  1JKA A;  4MST A;  4Z3M A;  1C45 A;  1GF9 A;  1W6Z A;  3LYT A;  2F2N A;  5I5Q A;  2PC2 A;  3J6K A;  4N1E I;  1LZD A;  4TSC A;  4WG1 A;  1AZF A;  2EIZ C;  1EQ5 A;  1LZ1 A;  1LHI A;  5KXT A;  2DQG Y;  1F0W A;  1JSE A;  1LKR A;  1LJK A;  2IHL A;  1OUG A;  3RU5 A;  1GB0 A;  4R0F A;  2ZNX Y;  1LAA A;  1LZN A;  1LZT A;  1UBZ A;  2D91 A;  3IJU A;  1IC5 Y;  1T3P A;  1TDY A;  4OWH A;  1GBY A;  1CJ7 A;  1VFB C;  1OQM A;  4C5F A;  1EL1 A;  1MLC E;  2CGI A;  1IP7 A;  1LYS A;  2DQA A;  3WW5 A;  1GFA A;  1GXV 2;  2RSC A;  2EPE A;  4H9F A;  2ZIL A;  1GB2 A;  3AGI A;  2LYM A;  6LYZ A;  4ET8 A;  2BAA A;  1B7M A;  3IWR A;  5F9X A;  1JWR A;  2HU1 A;  2ZQ3 A;  4HTK A;  4UWN A;  5FEK A;  3WH1 A;  3QE8 A;  4D9Z A;  1IP4 A;  5M1Y A;  1YAQ A;  1LMP A;  1LJJ A;  2XBR A;  4DD3 A;  4GLA A;  5LYT A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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