3QNGA

Crystal structure analysis of lysozyme-bound fac-[re(co)3(l-serine)]
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title Post-protein-binding reactivity and modifications of the fac-[Re(CO)3]+ core
pubmed doi rcsb
total genus 45
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2011-02-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3qngA00
3QE8A 1GDXA 1VDPA 1YILA 1C43A 1IR7A 2MEBA 4OOOA 5KXZA 2MEHA 3ZVQB 1JJ3A 1NBZC 2DKVA 1GBSA 4PGJB 1GWDA 2D4KA 4C3WA 3A90A 1VDTA 4KL7A 4XJGA 4H9BA 2HU1A 5LAFA 4E3UA 1GAZA 5LVGA 1SLYA 4Z46A 2D4IA 5LVKA 5J7CA 4LYOA 1FDLY 1KXWA 1QSAA 1EQEA 1PZYA 1B7LA 4NGVA 4BAPA 4XJBA 5ILCA 1YL0X 3WU8A 1GF4A 2W1XA 1GE0A 5I4XA 1C45A 1LYZA 3E3DA 1G7MC 1GF9A 5KXOA 2EPEA 1LZ4A 1CJ8A 1GBZA 3AZ7A 1AM7A 153LA 3B0KA 4NY5A 1TCYA 1LHLA 4GN3A 4B49A 2HEDA 4NGZA 4M6DA 9LYZA 1F6SA 1UIEA 4H92A 2VB1A 5F9XA 4O34A 1BWJA 3GXRA 1LMCA 1CNSA 4HTQA 1LPIA 1C7PA 5B05A 3A3QA 4IASA 2DQAA 4NGIA 4YENA 2G4QA 1F6RA 3WPJA 4ET8A 4QY9A 3P68A 5KXXA 4N0JA 1B7SA 1ALCA 1B5ZA 1OUFA 1DQJC 1LZEA 193LA 1GFKA 4ETDA 1KIQC 5DL9A 1XGPC 1B0DA 1VEDA 4YEMA 3P65A 4YF2A 2HUBA 4BS7A 5DN5A 4H8XA 1LSCA 4WM1A 5KXKA 1FN5A 2ZNXY 3A6BY 2HEAA 4CFPA 1DI5A 1HNLA 4H9CA 1B2KA 3TXKA 1JKCA 6LYZA 1GF3A 4NGWA 1JWRA 1B9OA 1GB6A 1VATA 4WM4A 1HFZA 1AKIA 1GB0A 4DC4A 2D4JA 3W6EA 1VDQA 4N1EI 1JHLA 4WM6A 1LHJA 1KXYA 3BKVA 1FLUA 5LIOA 3WMKA 4XYYA 1JKDA 5A3EA 4OWBA 1HFYA 5K7OA 3AW6A 3IJUA 4NHPA 2BQLA 1GHLA 5FHWA 1LZ1A 3QNGA 1IX0A 1XSFA 2HEBA 2HTXA 5HLLA 4HPEA 1DPXA 1CJ6A 1P2CC 3CSZA 3AYQA 1YQVY 4AXTA 1MELL 2DBTA 1GD6A 2CDSA 2H9JA 4HSFA 1BB3A 4LT0A 1G7HC 2BQFA 2LYMA 2BQAA 1B7PA 3AZ4A 4LFPA 2YBHA 4CJ2A 1QIOA 2LYOA 3A96A 4UWUA 2BQBA 1IR9A 4XADA 4G4CA 1UUZC 4ET9A 1GF7A 3D9AC 1JKBA 2Z18A 1XFPL 3FI7A 3TXHA 1JEFA 2RSCA 4OWHA 4AGAA 4PHIA 5II3A 1QUSA 1D0LA 4H9FA 1QQYA 4I0CA 5IHGA 1TDYA 3KAMA 4WLYA 1C46A 2BLXA 3M3UA 5FSTA 1VFBC 1DKJA 4DD0A 1GPQC 1OUEA 1BB4A 2BQHA 2Z19A 1XGTC 1W08A 5KY1A 5FELA 4HPIA 1LYOA 3VWOA 2DQEY 4NG8A 1OQMA 1RCMA 3AB6A 4H8ZA 4P2EA 1RE2A 2LZ2A 1WTMA 1KXXA 2MEAA 1H87A 154LA 4NHQA 3ZVQA 4TTDA 1G7LC 1GBYA 4G49A 4GN5C 5LYZA 2PC2A 4WO9A 2WARA 4B1AA 4NG1A 4TUNA 2Z2EA 5B1GA 1VDSA 3W3EA 1GE2A 1YL1X 207LA 4LFXA 1CJ7A 1GAYA 1JUGA 1XEKA 3N9EA 4X3BA 1HEOA 3EBAB 3AGIA 4XJDA 1B5XA 1DPWA 1GFHA 3LYZA 1NDMC 4Z41A 4DDBA 4HP0A 1BB5A 1E8LA 1LZAA 4DYGA 1XGQC 1LZRA 4WMGA 5IELA 3AW7A 1LSNA 3QY4A 3TXEA 2HEFA 4PRUA 4BADA 1IOTA 1OUAA 2D91A 4NGYA 4NGLA 2YDGA 3EXDA 4NEBA 3WW6A 2F30A 5KXSA 1O23A 2BQJA 1IC5Y 1UIAA 132LA 3WPKA 1HC0A 2DQCY 1NWGA 5FCPA 5HQ1A 4LYCA 1GF0A 4B4EA 1LZSA 4DT3A 4H1PA 1GBXA 4NSJA 3CQLA 5APFA 4R6CA 3RU5A 5I53A 5IDDA 2DQHY 1LSYA 5LYTA 1B5VA 4HTKA 5HNCA 1HMKA 4II8A 1MLCE 4WL6A 1LJHA 3LYTA 4UWNA 2BQGA 5B07A 1LSAA 1REZA 3P4ZA 3TXBA 5FDJA 1LMTA 1IEEA 4RW2A 3M18B 1DI3A 3TMVA 4CGEA 1GF6A 1LHKA 3A6CY 1GBWA 1SQ2L 1WQQA 4DWXA 4ETEA 2MEIA 2BQCA 5LVJA 2I26L 1GB7A 1YKYX 1A2YC 1F10A 3A3RX 2ZYCA 4WOAA 5KXMA 1B7QA 2FBDA 1YAQA 3B0OA 1UIHA 4NSIA 3BKHA 5DM9A 4WLXA 1HEMA 1CKGA 1LSEA 2DQJY 4QDNA 4QEQA 2IHLA 2Z12A 3TXGA 4J0LA 3HBDA 3LYMA 6LYTA 1HEWA 3LN2A 1JTOL 2ZILA 5C6JA 3P64A 4H91A 1IY3A 4XJFA 3AGHA 5I4YA 1UIFA 3ZEKA 134LA 1IOSA 3OJPA 2MEGA 1CJ9A 2FYCA 1OUGA 3B6LA 4DDCA 4HJVA 1T6VL 4HV1A 4H9IA 4ZIXA 1BWIA 3OK0A 4IJ4A 1HEPA 4H9EA 4DD9A 4H93A 1IWYA 2N5ZA 5C6LA 5I5QA 1LZ5A 3W6CA 1LJIA 1HSWA 5T3FA 1CKHA 1F0WA 1JKAA 4R0FA 1GFGA 4WM2A 1WQOA 1D6QA 1IOCA 1D6PA 2A7FA 1GFRA 4LYZA 1REYA 1BVXA 1IWXA 2HU3A 2XBRA 1XEIA 4YOPA 1BB6A 1UA6Y 1BVKC 1JTPL 1LSZA 4LGKA 4G4HA 1AZFA 1B5UA 4GLAA 2YBNA 2YBMA 3WPLA 5E4PA 5I54A 1WQPA 2W1MA 3WU9A 1LMQA 1W6ZA 2I6ZA 1LZYA 3WU7A 1KIPC 4ETBA 5KJ9A 1GB3A 1IR8A 1QTEA 3B0IA 3WVYA 2C8OA 3A34A 3F6ZA 1HFXA 2MEFA 2YBIA 1IP5A 3ATNA 5KXNA 4DD2A 3G3AB 2DQIY 4G9SA 1ZMYL 3TXDA 5FEKA 1BB7A 1HELA 1UBZA 2ZWBA 5C6IA 1HSXA 1LMAA 2XTHA 3AZ6A 4G4BA 2F2NA 1GB9A 4WLTA 3TMWA 1YIKA 4ZFPA 1IWUA 1LAAA 5AMYA 4BAFA 5B59A 1BWHA 1OUDA 4N1CC 5HMJA 1ZVYB 3EMSA 2ZNWY 1LYYA 3CT5A 4N8ZA 5LVHA 3EO5A 4GCFA 1B7RA 4A7DA 4LT3A 4W94A 1LMOA 4NHIA 2DQGY 3WYHA 4ML7A 3LHMA 2X0AA 3G3BB 1G7IC 4NIJA 1JIYA 4WM5A 4YEOA 5B06A 3TXFA 5L9JA 1FLQA 3RW8A 4FJRA 1KIRC 1LZBA 4D9ZA 4YM8A 3FE0A 1JJ1A 1HERA 1LZ9A 4OW1A 1JSEA 1LOZA 1GB5A 4NGOA 1QSWA 135LA 5APDA 4FDYA 4LYTA 4OWAA 1AT6A 3W6AA 3T6UA 2FBBA 4B4IA 3RT5X 4H90A 1IC7Y 1J1PY 1B5WA 1FLWA 2BQIA 4DD1A 5D5FA 4LZTA 5DN4A 2MEDA 3LYOA 3D3DA 4EMNA 2W1LA 1B5YA 1IOQA 1LJ4A 2LYZA 4J1AA 2YVBA 2BLYA 1EQ4A 3CT1A 4TSBA 4WLDA 1LHMA 1LMPA 1OUIA 4PRQA 5F81A 3W6BA 1D9UA 1IWZA 2XJWA 5LINA 3TXJA 1C08C 1B7MA 1LSBA 3J4GA 4WG1A 4PJ2C 4ETCA 1QUTA 4TSCA 1LJJA 1OP9B 4NGJA 1GDWA 1NHEA 3WVXA 3K3TA 3WXTA 1YANA 2ZQ3A 3LZTA 2XBSA 1XEJA 1DXJA 1Z55A 1D0MA 5HMVA 1GFVA 2Q0MX 1GE1A 1OUBA 1IP3A 3B72A 2GV0A 4L41A 2MECA 2MEEA 1RJCB 4Z98A 2BQOA 4ETAA 1JTTL 7LYZA 1B7NA 2B5ZA 4H94A 2CWIA 2G4NA 1UICA 4XJHA 5A3ZA 1LJKA 4NFVA 3TXIA 1LJFA 1WQNA 4RW1A 4NSHA 3A92A 2F4AA 1LZ8A 1PS5A 3IJVA 4HJZA 1DZBX 1OUHA 4RLNA 5M1YA 4GLVA 1LZDA 1LJ3A 2EQLA 1LJEA 2Z2FA 1LSFA 3IWRA 4XJIA 4XENA 1HENA 1TBYA 3N9AA 4XN6A 3GXKA 1LZCA 4TWSA 1RFPA 5KXWA 5F9UA 2D6BA 1D0KA 1LHHA 4MSTA 4H8YA 1J1OY 4OWCA 1LTMA 2LHMA 1INUA 2EIZC 1YAOA 4GN4A 4QGZA 1YAPA 2AUBA 4RDSA 194LA 1BQLY 1LSPA 1GXV2 1DI4A 4WG7A 2HEEA 5KKIA 1HMLA 1LHIA 4NHTA 1LYSA 5LAGA 5HNLA 5APEA 2Z37A 4RLMA 4B4JA 5JENB 1LCNA 133LA 1B7OA 1UC0A 2BAAA 1JSFA 3CSQA 1NDGC 4H9HA 3ATOA 4LT1A 4HV2A 4C5FA 1JISA 1LZGA 3N9CA 3AGGG 1WTNA 1GE4A 5F14A 5LXWA 5LVIA 1GBOA 4WM3A 1RI8B 1IWVA 4PPOA 2A7DA 4DD7A 1IIZA 1LZTA 1BHZA 1I20A 5LYMA 1IP2A 1GEZA 1IP1A 3TMXA 1TEWA 3WUNA 1GEVA 1GF8A 1LZ6A 5KXYA 1GXXA 5KXLA 1LKSA 1REMA 1CKCA 4ZEEA 1OUCA 1EL1A 3W6FA 1GFUA 5KXPA 4NWHA 1UIGA 2C8PA 2DQFC 3A95A 2H5ZA 1FKQA 3A91A 2ZIKA 1N4FA 1GFTA 2H9KA 4MCKA 2BQNA 3HBHA 1V7SA 3HBEX 4N5RA 3WUMA 4DD3A 1HF4A 1IWTA 5F16A 3A8ZA 1NF5A 3AJNA 1IC4Y 3W6DA 5L3IA 5L3HA 1EQ5A 1YKZX 4WO6A 1LJNA 3AZ5A 4GCDA 1HHLA 1UACY 4HJYA 1JJ0A 1LMNA 5DLAA 1YAMA 1LJGA 4NGKA 4CHXA 4DDAA 1I1ZA 1TAYA 4KXIA 3WXUA 3WUAA 2Z38A 3A93A 1DKKA 1WVUA 2Z39A 2EKSC 2NWDX 4KT3A 5B1FA 3WH1A 5KXRA 1GFJA 3ULRA 4GCEA 1XGRC 3J6KA 2BQDA 1AT5A 1LZNA 3A67Y 5D5CA 1V7TA 2FYDA 1QDTA 4EOFA 4NHSA 1QDRA 5LA8A 3WULA 2YBLA 3CT0A 4Z3MA 4NWEA 2CGIA 1VAUA 3CB7A 4GCCA 5I4WA 1LSMA 1FKVA 4TX7A 1CKFA 5KKJA 1G7JC 1GB2A 1T3PA 5LA5A 3TMUA 4H9AA 1LKRA 4NSGA 3RZ4A 4LT2A 1IORA 4WL7A 2YBJA 5ILFA 1UCOA 4UWVA 4M4OA 1NBYC 5EBHA 1IP7A 2W1YA 1NMMA 2BQMA 1ZVHL 3A94A 3HFMY 1GB8A 1YROA 4KPMA 1IP4A 1FLYA 1UIDA 2YSSC 1XGUC 8LYZA 1GE3A 3CSRA 1REXA 3MGWA 1GFEA 2G4PA 2ZIJA 3LZ2A 2BQKA 4I8SA 4HTNA 3WW5A 2CJLA 4OWEA 1WQMA 2DQDY 1JPOA 4IATA 1IP6A 1UIBA 4LYBA 3T36A 1OUJA 3SP3A 1YKXX 1WQRA 1NKHA 4W96A 3RNXA 4N9RA 4J1BA 1I56A 2LZTA 1IY4A 4LYMA 4OOTA 4GCBA 1A4VA 5APCA 1ZV5L 1J1XY 4J7VA 3P66A 1WVVA 1IO5A 4U3XB 5KXTA 1GFAA 1QTKA 1C10A 2I25L 1LSDA 1IVMA 4MR1A 4ANRA 2Y8PA 1JITA 208LA 3WL2A 1NQIA 1LSGA 4B0DA 2ZYPA 4CFOA 1H6MA 1HEQA 2BQEA 5E9RA 2BPUA 1FBIX 2ZQ4A 1BGIA 1CKDA 1GF5A 2IFFY 2F4GA 2HECA 1IWWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3QE8A 1GDXA 2MEBA 1JTMA 1JJ3A 2RBRA 2RBQA 4KL7A 1VDTA 4XJGA 4DJHA 1LI2A 129LA 1QSAA 4NGVA 3WU8A 1GE0A 1QTCA 1GF9A 5KXOA 1QT4A 1XEPA 114LA 3B0KA 4NY5A 4NGZA 1L51A 1C69A 4O34A 181LA 1BWJA 3OE8A 1LMCA 3A3QA 2DQAA 4YENA 2G4QA 3WPJA 1C6CA 5KXXA 1EPYA 229LA 200LA 2HUBA 4BS7A 2Z6BA 1LSCA 5KXKA 3A6BY 1L37A 3SB7A 3TXKA 1JKCA 6LYZA 3C81A 1GB6A 176LA 3CDOA 211LA 1JHLA 1LHJA 1KXYA 3BKVA 5A3EA 1HFYA 1L95A 3AW6A 3IJUA 2BQLA 1LZ1A 3QNGA 5HLLA 2B7XA 1L0JA 225LA 2CDSA 4HSFA 1G7HC 102LA 1OV7A 1B7PA 1L74A 4OO9A 2LYOA 1IR9A 1P46A 2Z18A 2L78A 1CUPA 4I7MA 2RSCA 4ZPUA 4PHIA 4H9FA 4I0CA 1I6SA 5IHGA 5FSTA 1L98A 1D9WA 1C60A 2DQEY 1RE2A 1WTMA 2MEAA 118LA 3SBAA 4NHQA 1QSQA 4TTDA 1L25A 4GN5C 2WARA 4NG1A 2Z2EA 4EXMA 1GAYA 1XEKA 4XJDA 1L03A 3LYZA 1GFHA 1NDMC 4Z41A 4EJ4A 1LZAA 4DYGA 5IELA 3AW7A 1LSNA 2B6XA 3TXEA 2O7AA 4NGLA 4NGYA 2YDGA 1O23A 3WPKA 120LA 3C7WA 1SX2A 1OWYA 224LA 1B6IA 4HTKA 4II8A 3LYTA 1REZA 1IEEA 4RW2A 1L18A 3DN2A 3TMVA 1LHKA 1SQ2L 3C83A 5LVJA 1L32A 1QT7A 148LE 1A2YC 4E97A 1B7QA 4WLXA 1HEMA 1CKGA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3QE8 A;  1GDX A;  1VDP A;  1YIL A;  1C43 A;  1IR7 A;  2MEB A;  4OOO A;  5KXZ A;  2MEH A;  3ZVQ B;  1JJ3 A;  1NBZ C;  2DKV A;  1GBS A;  4PGJ B;  1GWD A;  2D4K A;  4C3W A;  3A90 A;  1VDT A;  4KL7 A;  4XJG A;  4H9B A;  2HU1 A;  5LAF A;  4E3U A;  1GAZ A;  5LVG A;  1SLY A;  4Z46 A;  2D4I A;  5LVK A;  5J7C A;  4LYO A;  1FDL Y;  1KXW A;  1QSA A;  1EQE A;  1PZY A;  1B7L A;  4NGV A;  4BAP A;  4XJB A;  5ILC A;  1YL0 X;  3WU8 A;  1GF4 A;  2W1X A;  1GE0 A;  5I4X A;  1C45 A;  1LYZ A;  3E3D A;  1G7M C;  1GF9 A;  5KXO A;  2EPE A;  1LZ4 A;  1CJ8 A;  1GBZ A;  3AZ7 A;  1AM7 A;  153L A;  3B0K A;  4NY5 A;  1TCY A;  1LHL A;  4GN3 A;  4B49 A;  2HED A;  4NGZ A;  4M6D A;  9LYZ A;  1F6S A;  1UIE A;  4H92 A;  2VB1 A;  5F9X A;  4O34 A;  1BWJ A;  3GXR A;  1LMC A;  1CNS A;  4HTQ A;  1LPI A;  1C7P A;  5B05 A;  3A3Q A;  4IAS A;  2DQA A;  4NGI A;  4YEN A;  2G4Q A;  1F6R A;  3WPJ A;  4ET8 A;  4QY9 A;  3P68 A;  5KXX A;  4N0J A;  1B7S A;  1ALC A;  1B5Z A;  1OUF A;  1DQJ C;  1LZE A;  193L A;  1GFK A;  4ETD A;  1KIQ C;  5DL9 A; 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 5B1F A;  3WH1 A;  5KXR A;  1GFJ A;  3ULR A;  4GCE A;  1XGR C;  3J6K A;  2BQD A;  1AT5 A;  1LZN A;  3A67 Y;  5D5C A;  1V7T A;  2FYD A;  1QDT A;  4EOF A;  4NHS A;  1QDR A;  5LA8 A;  3WUL A;  2YBL A;  3CT0 A;  4Z3M A;  4NWE A;  2CGI A;  1VAU A;  3CB7 A;  4GCC A;  5I4W A;  1LSM A;  1FKV A;  4TX7 A;  1CKF A;  5KKJ A;  1G7J C;  1GB2 A;  1T3P A;  5LA5 A;  3TMU A;  4H9A A;  1LKR A;  4NSG A;  3RZ4 A;  4LT2 A;  1IOR A;  4WL7 A;  2YBJ A;  5ILF A;  1UCO A;  4UWV A;  4M4O A;  1NBY C;  5EBH A;  1IP7 A;  2W1Y A;  1NMM A;  2BQM A;  1ZVH L;  3A94 A;  3HFM Y;  1GB8 A;  1YRO A;  4KPM A;  1IP4 A;  1FLY A;  1UID A;  2YSS C;  1XGU C;  8LYZ A;  1GE3 A;  3CSR A;  1REX A;  3MGW A;  1GFE A;  2G4P A;  2ZIJ A;  3LZ2 A;  2BQK A;  4I8S A;  4HTN A;  3WW5 A;  2CJL A;  4OWE A;  1WQM A;  2DQD Y;  1JPO A;  4IAT A;  1IP6 A;  1UIB A;  4LYB A;  3T36 A;  1OUJ A;  3SP3 A;  1YKX X;  1WQR A;  1NKH A;  4W96 A;  3RNX A;  4N9R A;  4J1B A;  1I56 A;  2LZT A;  1IY4 A;  4LYM A;  4OOT A;  4GCB A;  1A4V A;  5APC A;  1ZV5 L;  1J1X Y;  4J7V A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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