1G0LA

Crystal structure of t4 lysozyme mutant t152v
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITVFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords PROTEIN (LYSOZYME)
publication title Structural and thermodynamic analysis of the binding of solvent at internal sites in T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2000-10-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1g0lA00
1PQMA 180LA 1CU0A 3G3WA 1C65A 1DYGA 1OVHA 128LA 1L46A 175LA 3GUIA 3PDSA 142LA 1OWYA 1LI2A 156LA 2OU0X 2Z6BA 4LDEA 2O79A 1L41A 1LYEA 4I7OA 1L06A 250LA 3CDVA 1L56A 1SX2A 213LA 3OE9A 4W54A 1CX7A 1QTHA 1C6JA 235LA 1QT5A 231LA 174LA 1L96A 223LA 1C6GA 4ARPA 1L42A 2OU8A 1OV5A 1QT4A 1L59A 183LA 3HWLA 1DYEA 258LA 155LA 1QT8A 3DMZA 1LGUA 1L25A 4LZMA 4W58A 2OE4X 3HH4A 4W57A 1SSWA 152LA 2O7AA 3NYAA 4PK0A 4I7MA 170LA 1LYGA 1C67A 3CDOA 157LA 3HTGA 1C6LA 1LGWA 2RB2X 2RAYX 1QTCA 166LA 108LA 2B73A 3RZEA 188LA 3HH6A 200LA 1G1WA 195LA 1OVJA 1JTMA 4PJZA 3F9LA 2A4TA 3NY9A 1L63A 1SSYA 225LA 3VW7A 2RBQA 1L74A 211LA 1L75A 1L82A 2RBRA 251LA 224LA 2OTZX 3HUAA 2ANVA 191LA 3C8RA 261LA 1DYBA 160LA 1L52A 238LA 2F32A 4YXAC 5I14A 2OE7X 1QSQA 3V2WA 3D4SA 4I7LA 148LE 1ZYTA 3RUNA 1L91A 1L04A 2RB1X 3GULA 1P37A 256LA 3LZMA 1L71A 1L50A 177LA 1L35A 149LA 1L55A 5LZMA 1LLHA 127LA 3DN0A 4I7JA 241LA 185LA 144LA 122LA 260LA 1C6AA 1L29A 4K5YA 3GUPA 4ARMB 3FA0A 1CTWA 3GUKA 3L2XA 164LA 1L68A 4OO9A 187LA 1L32A 217LA 3HU8A 1C64A 243LA 3C8QA 239LA 237LA 198LA 158LA 1D9WA 1C6TA 1CUPA 1C6EA 1L24A 2OTYX 1DYDA 229LA 245LA 1CU2A 253LA 2HULA 4YX7C 2RBSA 3SB7A 1QUDA 3L64A 1L22A 1L44A 2B6WA 2B6ZA 2RAZX 4S0WA 1XEPA 247LA 1L58A 1L14A 1SWZA 209LA 4DAJA 1WTHA 4EPIA 3HT7A 184LA 186LA 1L93A 1T8FA 216LA 242LA 1DYCA 1CUQA 1L73A 1TLAA 1QT7A 1P2RA 1CV0A 2ANXA 2B70A 2Q9EA 2OE9X 3OE8A 1L48A 3OE6A 1C6DA 1L65A 4AQNA 1L40A 3DMXA 3GUJA 1L03A 1L84A 1P7SA 2QB0B 1L79A 4LDOA 1XJUA 2Q9DA 1SX7A 2IGCA 4W52A 178LA 4YXCA 4LDLA 228LA 1L67A 176LA 2LZMA 1L61A 1L26A 210LA 1G0JA 1L0KA 1P3NA 1L21A 1QT3A 1L99A 1C63A 3CDQA 1C6BA 4EXMA 4I7SA 3UONA 1P36A 218LA 1LGXA 1QUGA 1C60A 246LA 3DN1A 190LA 234LA 1L66A 240LA 145LA 112LA 1K28A 131LA 1JTNA 232LA 1L64A 1L97A 118LA 1L53A 2OU9A 3HU9A 4ARMA 113LA 1QUHA 4ARQB 1L81A 262LA 4W56A 215LA 1C6NA 4GRVA 4W51A 1L31A 3V2YA 3SBBC 1L51A 4W55A 2QARC 3G3XA 3C81A 3HT9A 1C6PA 1QUOA 1D2WA 1T97A 1DYAA 1L38A 1LYIA 1L72A 4I7TA 3FI5A 162LA 130LA 110LA 3K2RA 236LA 1B6IA 2HUKA 1L36A 172LA 3GUOA 1LYHA 3PBLA 189LA 1C6HA 3DMVA 3HUQA 1P2LA 259LA 1C69A 205LA 1G0LA 212LA 2LCBA 1NHBA 1OWZA 3CDRA 1KY0A 3DN8A 4DKLA 1LYDA 2B75A 2B6TA 1G1VA 2F2QA 1L60A 1LI3A 3DN6A 3HH3A 220LA 3EMLA 119LA 4I7RA 1P46A 1P64A 2B6YA 1KW7A 1QT6A 196LA 4I7PA 150LA 3SB9A 3HDEA 199LA 1L27A 1L11A 1L92A 1QTBA 1G0QA 254LA 2O4WA 1JQUA 1LW9A 1LI6A 1QTZA 1D3MA 3HTDA 1L10A 201LA 2L78A 1L80A 3C80A 1OV7A 109LA 171LA 1CU3A 3C83A 169LA 4EKPA 1P6YA 1KW5A 1QS5A 1CV3A 2RH1A 4W53A 4W59A 1L12A 102LA 1L98A 3HH5A 1CV1A 1L43A 126LA 181LA 1L90A 1G0MA 1LPYA 1L19A 104LA 1L18A 2RBOA 255LA 227LA 6LZMA 1L01A 163LA 165LA 2B72A 1I6SA 3C8SA 1L95A 4ARQA 3JR6A 1C6MA 248LA 1QTVA 4EPFA 120LA 1T8GA 2RBNA 1PQDA 1PQKA 1L20A 103LA 1L70A 2OEAX 1L54A 1QTDA 1L09A 3OE0A 3SBAA 3HUKA 1EPYA 1T6HA 4GBRB 2F47A 3DN2A 1KS3A 1PQJA 2NTGA 3HT8A 167LA 1OVKA 2LC9A 1ZWNA 197LA 1L28A 1LWKA 1L39A 3DN4A 1L23A 1L30A 1L47A 1L05A 1L94A 1L33A 4IAPA 3C7ZA 173LA 2RB0X 3QAKA 1L88A 3CDTA 4I7KA 3DN3A 161LA 3FADA 1LYFA 4ARJA 3HDFA 1L83A 1L37A 1L87A 1G06A 1L49A 1L77A 3SB8A 1D2YA 222LA 244LA 3NY8A 1CV5A 1L17A 141LA 4E97A 1QS9A 1CV4A 257LA 249LA 146LA 2B7XA 138LA 233LA 4EKRA 1L76A 252LA 1L16A 1G07A 226LA 107LA 1P5CA 1OYUA 1LWGA 140LA 1QSBA 1CX6A 1L15A 192LA 137LA 1PQIA 1C6QA 4EJ4A 1DYFA 4I7QA 219LA 2B6XA 1C68A 115LA 1G0GA 4ZPUA 2NTHA 3SB6A 1L85A 1L07A 3C7WA 1KY1A 1XJTA 4ARLA 7LZMA 1C6KA 3G3VA 1L89A 4EKSA 1L08A 1C66A 1LYJA 129LA 3C7YA 3SN6R 3F8VA 1T8AA 1CU5A 1L86A 1D3NA 147LA 1L45A 1SWYA 1C6IA 159LA 3DKEX 1G0KA 1KNIA 3GUMA 3SB5A 230LA 4I7NA 4DJHA 111LA 114LA 1L00A 3ODUA 1C62A 182LA 1L62A 3C82A 4EKQA 3GUNA 1CVKA 1D3JA 3HT6A 2HUMA 1D3FA 168LA 1L69A 206LA 221LA 2B74A 1L02A 143LA 2RBPA 1CV6A 151LA 1P56A 1C61A 1CU6A 1L13A 139LA 123LA 3HTBA 1L0JA 1PQOA 214LA 1ZURA 1L34A 3DNAA 3HTFA 125LA 2CUUA 1C6CA 1G0PA 1L57A 1C6FA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4UWVA 1FDLY 1VEDA 180LA 1SQ2L 1YIKA 1B7PA 3M18B 2A7DA 2OU0X 1L41A 3WUMA 1GBOA 2H5ZA 4KPMA 1CX7A 1QTHA 1C6JA 235LA 5LVGA 174LA 4NY5A 223LA 1C6GA 4J1BA 4BS7A 5KXMA 1QDRA 1QT8A 2ZNXY 1WQNA 1LGUA 4H92A 4LZMA 4YEMA 1OUIA 4PK0A 4I7MA 1IC7Y 1UA6Y 1HFZA 1IP6A 4XN6A 1QTCA 1NHEA 2Z38A 166LA 1GFTA 1LJIA 3HH6A 4DT3A 3T6UA 1B5UA 1LZYA 1YAOA 3VW7A 5J7CA 1WQQA 5FHWA 1L75A 1G7JC 3TXBA 2RBRA 224LA 4GCFA 1QTKA 1ZVYB 2ANVA 3EMSA 5KXZA 1GF0A 1LJNA 2OE7X 3AGIA 1GBZA 4I7LA 3GULA 1IWYA 4ET9A 4DD9A 3LZMA 1L55A 3CT5A 5LZMA 4NGZA 4I7JA 3N9CA 185LA 144LA 122LA 1IP2A 1C6AA 1IP3A 1UCOA 3GUPA 1GF8A 3GUKA 4TWSA 164LA 4OO9A 217LA 2YBNA 1FLQA 1LSNA 4N1CC 1DZBX 243LA 5I54A 3WYHA 5LAGA 1D0KA 1OUGA 1CU2A 1LJHA 4NHIA 3WXUA 3AYQA 3SB7A 1LJFA 2CWIA 3A67Y 4N5RA 4S0WA 1GBXA 4M4OA 1WTHA 1WVVA 184LA 1YROA 1T8FA 3W6EA 3TXJA 2B70A 2LHMA 4GLVA 2OE9X 1L48A 5KXSA 4BAPA 3TXEA 1L79A 3IWRA 1LJKA 1SX7A 1W6ZA 1LJ3A 3TXFA 1GAYA 4DD2A 1QT3A 1B2KA 1L99A 4NGJA 1LSAA 3G3AB 4TX7A 2D91A 1GB8A 4I7SA 4XJGA 8LYZA 1FBIX 1KXXA 4H8YA 2FBDA 3CB7A 4AXTA 1CKFA 2BQGA 4HJVA 3P68A 1L81A 4H1PA 1D0LA 1UBZA 1GBSA 1UIBA 4W56A 1B0DA 1LCNA 1ZMYL 4GRVA 4B49A 1L51A 1BVKC 3HT9A 1C6PA 1RI8B 1CJ7A 1GEVA 1WVUA 1T97A 4WOAA 4NGIA 1B7MA 3FI5A 5LXWA 110LA 1B9OA 5F9XA 3WXTA 1LYHA 1FN5A 189LA 3DMVA 2H9KA 1NBYC 1C69A 1DI4A 1CJ6A 4WM1A 1G0LA 1QDTA 1IP5A 5C6IA 1QQYA 1OWZA 3DN8A 1LYDA 1UIFA 2B75A 1LJEA 3HH3A 4WLYA 1GF6A 3EMLA 4ZEEA 4UWNA 1LSFA 1LHMA 1F10A 1W08A 2I25L 4XJHA 4NEBA 1G0QA 1BGIA 1LMTA 4CJ2A 4G49A 3W6FA 1JTTL 1LI6A 1QIOA 1HNLA 2FYDA 3HTDA 1B7NA 2MEIA 1GFUA 1OV7A 3LHMA 3C83A 2EQLA 4B0DA 1P6YA 1JKBA 2BQMA 5LVJA 2LZTA 4HV1A 1L12A 2HEBA 4XJIA 1L43A 126LA 181LA 1G0MA 1LPYA 1L19A 1JSFA 255LA 1JPOA 1L95A 3LYOA 248LA 4OWAA 2ZIJA 1JKCA 3SP3A 1L20A 5DL9A 4CGEA 1I56A 3M3UA 1L09A 3WW6A 1NDMC 2I26L 1EPYA 4GBRB 1BHZA 3DN2A 1PQJA 1KIQC 3HBEX 1QSAA 1GFVA 1LWKA 1L39A 4PGJB 3DN4A 1BB5A 3A6CY 1BB4A 153LA 5ILCA 1A4VA 2YBJA 2BQLA 3QAKA 4UWUA 4YM8A 4ARJA 1L37A 1LZDA 1PS5A 1L77A 3ULRA 3A3QA 1BB3A 1CNSA 244LA 141LA 3J6KA 249LA 1SLYA 252LA 3RT5X 1C10A 1LJGA 1D6QA 1BWHA 1GBYA 4OWCA 3ATOA 4NGLA 1IP4A 1B7SA 1CX6A 5I53A 3WVYA 1XSFA 1B5ZA 2DQGY 137LA 1PQIA 1B7LA 1DYFA 219LA 2HU1A 2W1MA 4ARLA 4WM5A 1C6KA 3WU9A 1C66A 129LA 4N1EI 4ET8A 2D4JA 1LZSA 3P66A 5KXWA 1T8AA 2DBTA 1L45A 5F81A 2CJLA 1C6IA 3RW8A 4I7NA 1FKVA 111LA 3W6BA 114LA 4U3XB 1L62A 1L69A 1UIHA 1VDPA 221LA 5C6JA 1L02A 1WQOA 4BAFA 4H9HA 1F0WA 214LA 1LZ5A 3HTFA 3A96A 3AW6A 1C6CA 1FKQA 1LSYA 4HJZA 4NHPA 1HEQA 5AMYA 1DYGA 1L46A 4NGVA 1HEOA 1LI2A 156LA 4LDEA 3WUAA 1A2YC 1GB3A 4I7OA 5L9JA 3TXDA 4N9RA 1SX2A 3OE9A 213LA 5LA5A 1QT5A 4DD1A 4DD0A 1L96A 4ETBA 4YOPA 5KXRA 1GF7A 4NIJA 4R6CA 1L59A 3HWLA 1MLCE 258LA 3DMZA 5L3HA 1L25A 4EOFA 1JWRA 4W58A 1CJ8A 1UUZC 2MEFA 2OE4X 3HH4A 4W57A 152LA 4LGKA 3CDOA 157LA 4CFOA 3HTGA 1C6LA 1LYYA 5LAFA 2RB2X 4HV2A 4WG1A 3B0KA 3RZEA 1VAUA 200LA 195LA 3IJVA 4PJZA 3F9LA 3NY9A 4B4EA 1TCYA 1B5YA 225LA 4G4HA 5HQ1A 2DQJY 1HEPA 2HUBA 4L41A 3HUAA 1LHIA 1YANA 1C46A 1LZ8A 261LA 160LA 1L52A 1B5XA 238LA 2F32A 1LZCA 5KY1A 1HMKA 3V2WA 148LE 4OOOA 1LYSA 3OK0A 4P2EA 177LA 1JEFA 1LLHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4UWV A;  1FDL Y;  1VED A;  180L A;  1SQ2 L;  1YIK A;  1B7P A;  3M18 B;  2A7D A;  2OU0 X;  1L41 A;  3WUM A;  1GBO A;  2H5Z A;  4KPM A;  1CX7 A;  1QTH A;  1C6J A;  235L A;  5LVG A;  174L A;  4NY5 A;  223L A;  1C6G A;  4J1B A;  4BS7 A;  5KXM A;  1QDR A;  1QT8 A;  2ZNX Y;  1WQN A;  1LGU A;  4H92 A;  4LZM A;  4YEM A;  1OUI A;  4PK0 A;  4I7M A;  1IC7 Y;  1UA6 Y;  1HFZ A;  1IP6 A;  4XN6 A;  1QTC A;  1NHE A;  2Z38 A;  166L A;  1GFT A;  1LJI A;  3HH6 A;  4DT3 A;  3T6U A;  1B5U A;  1LZY A;  1YAO A;  3VW7 A;  5J7C A;  1WQQ A;  5FHW A;  1L75 A;  1G7J C;  3TXB A;  2RBR A;  224L A;  4GCF A;  1QTK A;  1ZVY B;  2ANV A;  3EMS A;  5KXZ A;  1GF0 A;  1LJN A;  2OE7 X;  3AGI A;  1GBZ A;  4I7L A;  3GUL A;  1IWY A;  4ET9 A;  4DD9 A;  3LZM A;  1L55 A;  3CT5 A;  5LZM A;  4NGZ A;  4I7J A;  3N9C A;  185L A;  144L A;  122L A;  1IP2 A;  1C6A A;  1IP3 A;  1UCO A;  3GUP A;  1GF8 A;  3GUK A;  4TWS A;  164L A;  4OO9 A;  217L A;  2YBN A;  1FLQ A;  1LSN A;  4N1C C;  1DZB X;  243L A;  5I54 A;  3WYH A;  5LAG A;  1D0K A;  1OUG A; 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