207LA

Mutant human lysozyme c77a
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNAAHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords LYSOZYME
publication title A role of PDI in the reductive cleavage of mixed disulfides.
pubmed rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 45
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1996-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 207lA00
1GBSA 135LA 4NGWA 2BPUA 1BB6A 2C8PA 3CT0A 1IY3A 2MEAA 1LMPA 4XJFA 2BQEA 2CDSA 2HU1A 1LYSA 1PZYA 4PPOA 4PJ2C 3TXDA 1BGIA 2LYZA 1B7RA 4B4IA 1LZ9A 4EOFA 3RZ4A 1ZV5L 3KAMA 2FYDA 3LYOA 4ZIXA 1F0WA 1AM7A 1IWVA 1PS5A 1KXXA 1HSXA 1D6PA 2Z39A 1WVUA 4LYTA 5DM9A 3P4ZA 4XJDA 1GF9A 1HERA 1LCNA 4M6DA 4DD9A 4NY5A 3QY4A 5FDJA 1OUJA 2Z18A 4II8A 4MR1A 1GB2A 1UBZA 4LFPA 5LAGA 1GF7A 4NEBA 1TDYA 4RW2A 1VFBC 5KY1A 1IP6A 1NHEA 3LYTA 1UUZC 1JKCA 1B7NA 1GWDA 1LSEA 3GXRA 1LYOA 4WM6A 3W3EA 5LAFA 2YBJA 1QDRA 2YSSC 1OUBA 1F6RA 1IC4Y 4H9BA 1LJ4A 3GXKA 1LHMA 1C08C 2HEFA 4G49A 5FELA 4NGVA 1HEWA 2BLXA 3WH1A 4LT1A 2A7DA 1CJ6A 1RE2A 3AJNA 3SP3A 3J6KA 1WQPA 2Z12A 4B4EA 1LZTA 3WMKA 1YIKA 1FKVA 1HHLA 2BQCA 1LZBA 3RT5X 1LKSA 1UIBA 3TXIA 3CSZA 1JKDA 1XSFA 2A7FA 5LVIA 4WLTA 5ILCA 1LMCA 2WARA 1D9UA 7LYZA 1JJ3A 1OUFA 3WVYA 2MEEA 1TAYA 1YROA 1LZ8A 2X0AA 1GF5A 2G4PA 3B0OA 1QTKA 1UIHA 3ATNA 1IX0A 4WM1A 1DQJC 4GLAA 3TXGA 4HJVA 2HUBA 3B0KA 3IJVA 4J1AA 4X3BA 4TWSA 1JWRA 4NGKA 4WM5A 5KXZA 4OW1A 1LPIA 4XJBA 1UA6Y 1MLCE 1UICA 2DQGY 3N9CA 4NG8A 5I53A 2HEAA 4KL7A 1GFVA 1YAOA 4NSGA 4YEMA 1KIQC 4H8XA 5KXMA 1KXWA 1LJEA 1IEEA 4J0LA 5KXNA 4PHIA 5A3EA 1UACY 1UCOA 1B7MA 1VATA 2XJWA 3M3UA 5ILFA 2F2NA 2LHMA 4PGJB 5IHGA 5C6JA 1IWTA 4LFXA 1OP9B 1LJHA 1LZNA 5B59A 5LYMA 1OUCA 1YL1X 1LKRA 2W1MA 4Z98A 4XADA 4DC4A 1BB7A 1GAYA 2MEHA 3AGGG 3AZ5A 1WTMA 3B0IA 4WO6A 3ZEKA 4N9RA 1G7HC 1MELL 1OUHA 4PRQA 1HEPA 4B0DA 3TXJA 1LZCA 1T3PA 2BQJA 1HF4A 2Z38A 1B0DA 1TEWA 1GB7A 5II3A 1LSZA 4N1EI 4N5RA 5HMVA 4HJYA 3EMSA 2B5ZA 3CT1A 2ZWBA 1YANA 1G7IC 1KIRC 1QSAA 1IP4A 3K3TA 4BADA 1ZVHL 3LN2A 2HECA 1WQQA 3AW6A 5APEA 1BB4A 1GFAA 1HEOA 1C45A 3N9AA 4G4HA 5KXLA 3A8ZA 4XN6A 4WM4A 3BKHA 3TMUA 1LJKA 1XGTC 4NIJA 5IELA 1GFRA 5F9UA 4TUNA 1B2KA 4OWBA 2BQIA 2MECA 4RLNA 1B7LA 4KPMA 4GCCA 2ZNXY 1REMA 3CT5A 154LA 4FDYA 1I56A 2Z2EA 2BLYA 1LOZA 3FE0A 1IC5Y 3WPKA 4C3WA 5KKJA 4GN3A 2EIZC 4B1AA 1LSGA 2D4IA 5D5CA 1CKHA 1UIDA 1B5VA 2BQLA 4RDSA 5B05A 1WVVA 3A34A 3B6LA 4DD2A 1D0LA 4H91A 4LYZA 1W6ZA 1FKQA 3AZ7A 1IWWA 4R0FA 5I5QA 1P2CC 3MGWA 3AZ6A 4H90A 1BWHA 1QUSA 8LYZA 1CKCA 3AW7A 4NSJA 5FHWA 4NHTA 3LZTA 4CJ2A 3ATOA 2XBSA 1LJNA 2Z2FA 1N4FA 2XTHA 3ZVQA 2LZ2A 4ET8A 2LZTA 1LMOA 1GF3A 1GFTA 1BWJA 4B49A 1IVMA 3EXDA 1C43A 1GF0A 2ZIJA 4H1PA 1GEZA 2VB1A 4NWHA 5C6IA 4ET9A 4CFPA 1LHKA 3OK0A 1IOQA 1GD6A 1WQNA 1ZVYB 4J1BA 1AT5A 1JJ1A 3P68A 1XGUC 1GEVA 4OWHA 1LTMA 5KXPA 2BQHA 1RCMA 1REZA 2DQEY 5B07A 1GE0A 2H9JA 3QNGA 3HFMY 5I54A 1GE4A 1OUDA 2N5ZA 4GCDA 1NWGA 2Y8PA 3P65A 5AMYA 1GE2A 4WLYA 3WVXA 1JJ0A 2LYOA 4BAFA 1QIOA 2H5ZA 4ETEA 2EKSC 4ML7A 4OOTA 2BQMA 1GDWA 1JIYA 5KJ9A 1LZEA 1OUIA 3A6BY 2GV0A 4ZEEA 208LA 4TTDA 1JKBA 1GF4A 1OUAA 2G4NA 1GB6A 1GFKA 1LHHA 2DQFC 6LYZA 5FSTA 3P66A 1I1ZA 2W1XA 2CGIA 2CWIA 1IY4A 4NGZA 1GAZA 3W6CA 5FEKA 1DI4A 2RSCA 1CNSA 2BAAA 3M18B 1XGRC 2D6BA 4NHQA 5APDA 1H87A 4NGYA 5JENB 2BQDA 4N0JA 1GBWA 4WL7A 4YEOA 1B7PA 4RW1A 134LA 4NGJA 1B7OA 5KXSA 4NGOA 1GHLA 1LSPA 1NBZC 1GB8A 1VEDA 1LZYA 3N9EA 1UIEA 1KIPC 3WW5A 1XGQC 4QDNA 4HV2A 2I25L 4N8ZA 1JTOL 4LZTA 1QUTA 4Z41A 1YAPA 1XFPL 1EQ4A 1SQ2L 3A93A 1REYA 1IR8A 5EBHA 4DD0A 1LSNA 4TSBA 1BVXA 1LSYA 1GE3A 2I6ZA 1J1OY 4DDCA 3LHMA 5IDDA 3A6CY 4H93A 1HENA 1V7TA 4ETBA 1LMQA 1LZ6A 1WTNA 2EQLA 3WXTA 5DL9A 1JISA 5M1YA 2BQBA 1IWXA 1JITA 1F10A 1GB5A 4B4JA 1GXXA 5B1FA 1DKJA 5B06A 4WLDA 4UWNA 1GF6A 2BQKA 4EMNA 4W94A 4WOAA 1LAAA 3A94A 3WU7A 1IR9A 2ZQ3A 1DPXA 5KXWA 1CKDA 2I26L 4H9CA 5L3HA 1LMNA 2DQIY 3CSRA 2W1LA 4HPEA 1GPQC 1QQYA 5F9XA 1H6MA 1GFUA 2HEEA 207LA 4OWEA 1HNLA 4HTKA 1B7SA 1V7SA 4WM3A 3WUMA 3LYZA 3AZ4A 1IR7A 1WQMA 1IOSA 4UWVA 3WUNA 1VDPA 4LYBA 1YKXX 5LYTA 3WPJA 4WG1A 1TCYA 4CHXA 2DQAA 3G3AB 4GCFA 1FLQA 3EO5A 4XJIA 5L3IA 1XEJA 1VDQA 3OJPA 1IOTA 1UC0A 1IP3A 2DQJY 4N1CC 1FN5A 3A96A 5HNLA 1LZRA 3T36A 1FLWA 1JSFA 2NWDX 3TXBA 1HELA 1YILA 1CKGA 4NG1A 1AZFA 1LMAA 2DQDY 3W6DA 1IOCA 4BAPA 3WUAA 4LGKA 4WM2A 5LVGA 1LSMA 1NDGC 3A67Y 5KXRA 4W96A 4D9ZA 1NDMC 1G7MC 1NMMA 1B5YA 2LYMA 5DN4A 1GFHA 1GBZA 3TMWA 3TXEA 4NSHA 1YAMA 4FJRA 4ETAA 5KXXA 2CJLA 1VDTA 1LHJA 3TMXA 4OWCA 4QGZA 5E9RA 4C5FA 1I20A 1C46A 3AGIA 1JEFA 1OUGA 3HBEX 4NHPA 2DBTA 4OOOA 1LZ5A 1D0MA 1ZMYL 2PC2A 3LZ2A 1DZBX 1GBXA 2F4AA 1D0KA 2YBNA 1EQ5A 5KXKA 3VWOA 4J7VA 5HQ1A 4KXIA 4YF2A 1VDSA 3QE8A 5F14A 3AB6A 4DD7A 3A3RX 4TSCA 1JUGA 1IP5A 4HPIA 3WXUA 4BS7A 1LZGA 4H9FA 3LYMA 3P64A 1XGPC 1HSWA 2HU3A 3RW8A 4DYGA 153LA 2HEDA 1JTPL 3B72A 5HMJA 4ZFPA 5LINA 2G4QA 5I4WA 5KXYA 1BVKC 1CJ9A 1LJGA 3CQLA 4NHSA 4GCBA 5LA8A 1GE1A 133LA 1D6QA 4WL6A 1CJ7A 6LYTA 1CJ8A 1ALCA 2C8OA 132LA 2MEGA 1GBYA 1LYZA 3WYHA 4HP0A 2BQAA 1A4VA 1AT6A 2D91A 2IHLA 4QY9A 3TMVA 4ETDA 4NGIA 1LJFA 1IP1A 1NKHA 1NBYC 4H94A 4WG7A 3IJUA 1IP2A 4GLVA 3W6AA 1LSDA 1HFXA 1B5UA 1YKZX 2D4KA 3RNXA 5J7CA 4XJGA 1HEQA 1JKAA 1JTTL 1J1PY 1LJIA 1BHZA 3CSQA 5APCA 1FDLY 4XJHA 5F81A 2XBRA 1DKKA 9LYZA 1BB5A 1BQLY 1GBOA 4DD1A 1G7JC 1UIGA 1HEMA 4H9HA 5LVJA 5DLAA 1YKYX 4DD3A 5A3ZA 1F6SA 2MEDA 1FLUA 4MCKA 3A95A 1GFJA 1HMLA 4LYMA 1NQIA 4H92A 2FBBA 4NSIA 4PRUA 3WU9A 4ANRA 1LJJA 3ULRA 1DI5A 2HTXA 4DDAA 4DWXA 3E3DA 2BQOA 4HSFA 4P2EA 4YOPA 4Z46A 5L9JA 3TXHA 1GB0A 2ZQ4A 1FBIX 2AUBA 1B5WA 2Q0MX 1IWYA 3F6ZA 3IWRA 4LT3A 2MEBA 2FBDA 4GCEA 2YVBA 1GFGA 1CKFA 5K7OA 1C10A 3W6FA 4A7DA 4TX7A 5LIOA 1XEKA 2ZIKA 4H9AA 3ZVQB 4LT0A 4LYCA 2EPEA 4XENA 1IWUA 1GB3A 5HNCA 5LVHA 4O34A 1YL0X 2IFFY 3FI7A 1E8LA 3HBHA 2Z37A 3WPLA 1LSCA 1GF8A 4I0CA 1G7LC 4HTNA 5LA5A 5D5FA 2ZYPA 4G4CA 1B5XA 4IASA 4LYOA 4NGLA 2D4JA 4WLXA 1LHIA 4RLMA 1QDTA 1HC0A 4NFVA 193LA 3D3DA 5HLLA 1EQEA 2F30A 1LSAA 1Z55A 5LYZA 4H8YA 4WO9A 1LZSA 2YBMA 1DXJA 1B5ZA 2BQGA 5KXTA 5F16A 1GB9A 3T6UA 5C6LA 2HEBA 1J1XY 1LJ3A 2YDGA 1NF5A 4NWEA 3EBAB 3WU8A 4IJ4A 1FLYA 3TXFA 4KT3A 3WULA 3CB7A 4ETCA 4YENA 4M4OA 4I8SA 4WMGA 3A91A 3TXKA 4Z3MA 1LHLA 4AGAA 1C7PA 3WL2A 1QSWA 4G9SA 1OQMA 3A3QA 5LXWA 4AXTA 4H8ZA 4R6CA 194LA 4E3UA 5I4YA 3AYQA 1DI3A 1IIZA 1IORA 1REXA 1RI8B 1T6VL 4OWAA 2MEFA 2ZYCA 1BB3A 4HJZA 3W6BA 4MSTA 2FYCA 1LMTA 2DQHY 1TBYA 1IC7Y 4H9EA 1IP7A 3D9AC 4DDBA 1LZAA 1LZ1A 3A90A 1WQRA 2YBIA 5KKIA 4GN4A 3HBDA 5LVKA 1XEIA 5I4XA 3G3BB 5E4PA 1QTEA 1RFPA 3RU5A 4HV1A 4CFOA 4CGEA 1IWZA 4NHIA 1OUEA 2YBLA 4IATA 2DQCY 1O23A 1B9OA 1LSFA 1A2YC 1HMKA 1YAQA 1EL1A 1KXYA 2H9KA 4YM8A 4UWUA 1SLYA 3AGHA 4L41A 3BKVA 1BWIA 3J4GA 4QEQA 4U3XB 1UIFA 2F4GA 2MEIA 1LSBA 1LYYA 4HTQA 1GXV2 3A92A 2BQNA 1WQOA 1IO5A 1AKIA 4H9IA 4LT2A 1W08A 2W1YA 1RJCB 1LZ4A 1LZDA 2DKVA 1INUA 3WW6A 1DPWA 1VAUA 1GDXA 3W6EA 5KXOA 1UIAA 1HFZA 4DT3A 1HFYA 2Z19A 2ZNWY 1GFEA 5FCPA 2YBHA 5T3FA 4XYYA 1B7QA 1JPOA 1JHLA 5APFA 1YQVY 2ZILA 2BQFA 5DN5A 4G4BA 4GN5C 5B1GA 1JSEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
135LA 1BB6A 162LA 1LMPA 2BQEA 1L53A 2HU1A 4I7NA 1LYSA 4PPOA 3TXDA 2LYZA 1D3NA 3KAMA 2FYDA 1KXXA 3HUQA 1D6PA 5DM9A 1HERA 1JQUA 1G07A 260LA 254LA 3DKEX 3QY4A 4NY5A 1GF7A 4RW2A 1D9WA 3W3EA 5LAFA 2YBJA 1QDRA 1L01A 1LJ4A 1SWYA 3SB5A 1G0PA 2HEFA 2OU8A 1HEWA 3CDTA 1CJ6A 1WQPA 4B4EA 158LA 3WMKA 1YIKA 1L45A 1LKSA 1L95A 2A7FA 1LMCA 2WARA 7LYZA 3DNAA 1YROA 166LA 1LW9A 3DN3A 1D3JA 1L21A 4HJVA 3IJVA 3B0KA 261LA 5KXZA 2LC9A 4OW1A 4XJBA 1UA6Y 5I53A 1C6TA 1YAOA 5KXMA 1L84A 1IEEA 5A3EA 4PHIA 1UACY 1B7MA 1VATA 5C6JA 1G1VA 1OP9B 5LYMA 200LA 1QUHA 4DC4A 3AZ5A 1WTMA 4WO6A 3GUKA 1MELL 4B0DA 125LA 2RBRA 4I7QA 3TXJA 1B0DA 1TEWA 1GB7A 4EPIA 1L89A 3V2WA 3EMSA 3CT1A 2ZWBA 4BADA 3K3TA 2O7AA 1CUPA 1ZVHL 3LN2A 1L92A 4G4HA 3BKHA 1XGTC 1G0GA 1P3NA 2QB0B 1C6JA 186LA 199LA 4FDYA 2Z2EA 3WPKA 1LOZA 4B1AA 1UIDA 1C6AA 2BQLA 4AQNA 3HWLA 1C6QA 4DD2A 1OYUA 4H91A 1W6ZA 3L64A 3D4SA 103LA 164LA 4NSJA 2XBSA 3K2RA 2XTHA 1QTDA 1GFTA 175LA 3EXDA 4ET9A 4NWHA 2B73A 1QS9A 1IOQA 1GD6A 1ZVYB 1XGUC 1GEVA 3HU9A 1LTMA 1RCMA 213LA 2OE7X 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1GBS A;  135L A;  4NGW A;  2BPU A;  1BB6 A;  2C8P A;  3CT0 A;  1IY3 A;  2MEA A;  1LMP A;  4XJF A;  2BQE A;  2CDS A;  2HU1 A;  1LYS A;  1PZY A;  4PPO A;  4PJ2 C;  3TXD A;  1BGI A;  2LYZ A;  1B7R A;  4B4I A;  1LZ9 A;  4EOF A;  3RZ4 A;  1ZV5 L;  3KAM A;  2FYD A;  3LYO A;  4ZIX A;  1F0W A;  1AM7 A;  1IWV A;  1PS5 A;  1KXX A;  1HSX A;  1D6P A;  2Z39 A;  1WVU A;  4LYT A;  5DM9 A;  3P4Z A;  4XJD A;  1GF9 A;  1HER A;  1LCN A;  4M6D A;  4DD9 A;  4NY5 A;  3QY4 A;  5FDJ A;  1OUJ A;  2Z18 A;  4II8 A;  4MR1 A;  1GB2 A;  1UBZ A;  4LFP A;  5LAG A;  1GF7 A;  4NEB A;  1TDY A;  4RW2 A;  1VFB C;  5KY1 A;  1IP6 A;  1NHE A;  3LYT A;  1UUZ C;  1JKC A;  1B7N A;  1GWD A;  1LSE A;  3GXR A;  1LYO A;  4WM6 A;  3W3E A;  5LAF A;  2YBJ A;  1QDR A;  2YSS C;  1OUB A;  1F6R A;  1IC4 Y;  4H9B A;  1LJ4 A;  3GXK A;  1LHM A;  1C08 C;  2HEF A;  4G49 A;  5FEL A;  4NGV A;  1HEW A;  2BLX A;  3WH1 A;  4LT1 A;  2A7D A;  1CJ6 A;  1RE2 A;  3AJN A;  3SP3 A;  3J6K A;  1WQP A;  2Z12 A;  4B4E A;  1LZT A;  3WMK A;  1YIK A;  1FKV A;  1HHL A; 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 3EBA B;  3WU8 A;  4IJ4 A;  1FLY A;  3TXF A;  4KT3 A;  3WUL A;  3CB7 A;  4ETC A;  4YEN A;  4M4O A;  4I8S A;  4WMG A;  3A91 A;  3TXK A;  4Z3M A;  1LHL A;  4AGA A;  1C7P A;  3WL2 A;  1QSW A;  4G9S A;  1OQM A;  3A3Q A;  5LXW A;  4AXT A;  4H8Z A;  4R6C A;  194L A;  4E3U A;  5I4Y A;  3AYQ A;  1DI3 A;  1IIZ A;  1IOR A;  1REX A;  1RI8 B;  1T6V L;  4OWA A;  2MEF A;  2ZYC A;  1BB3 A;  4HJZ A;  3W6B A;  4MST A;  2FYC A;  1LMT A;  2DQH Y;  1TBY A;  1IC7 Y;  4H9E A;  1IP7 A;  3D9A C;  4DDB A;  1LZA A;  1LZ1 A;  3A90 A;  1WQR A;  2YBI A;  5KKI A;  4GN4 A;  3HBD A;  5LVK A;  1XEI A;  5I4X A;  3G3B B;  5E4P A;  1QTE A;  1RFP A;  3RU5 A;  4HV1 A;  4CFO A;  4CGE A;  1IWZ A;  4NHI A;  1OUE A;  2YBL A;  4IAT A;  2DQC Y;  1O23 A;  1B9O A;  1LSF A;  1A2Y C;  1HMK A;  1YAQ A;  1EL1 A;  1KXY A;  2H9K A;  4YM8 A;  4UWU A;  1SLY A;  3AGH A;  4L41 A;  3BKV A;  1BWI A;  3J4G A;  4QEQ A;  4U3X B;  1UIF A;  2F4G A;  2MEI A;  1LSB A;  1LYY A;  4HTQ A;  1GXV 2;  3A92 A;  2BQN A;  1WQO A;  1IO5 A;  1AKI A;  4H9I A;  4LT2 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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