2B6TA

T4 lysozyme mutant l99a at 200 mpa
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAAAINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Structural rigidity of a large cavity-containing protein revealed by high-pressure crystallography.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2005-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2b6tA00
195LA 1LYIA 3DMZA 119LA 1DYEA 1D3FA 3HDFA 140LA 3HT9A 3OE0A 197LA 145LA 113LA 1C65A 2Q9DA 1L80A 123LA 1L72A 1L76A 1XEPA 3OE9A 3D4SA 1L28A 1K28A 3V2YA 3HH3A 181LA 1L69A 4LDEA 3CDQA 4ZPUA 3C82A 3NY9A 110LA 3SB5A 170LA 1L74A 3HU9A 183LA 1QTDA 1L58A 255LA 3OE8A 4DAJA 128LA 258LA 1CX7A 3CDRA 2O79A 1L81A 206LA 3GUJA 4EKPA 225LA 3G3VA 2HULA 3DN4A 1SSYA 1LLHA 4E97A 1L02A 241LA 3RUNA 4I7RA 167LA 2OEAX 3DNAA 1L48A 1L57A 262LA 168LA 4ARJA 212LA 1CV5A 4I7PA 4GBRB 1L42A 3HUAA 1L10A 1L32A 4I7NA 2B6XA 1L96A 2LCBA 2RBSA 1L22A 1L68A 171LA 1LI3A 176LA 189LA 3DN6A 1EPYA 1QS9A 3C80A 163LA 1CV1A 205LA 1L40A 201LA 248LA 172LA 261LA 253LA 1C64A 2IGCA 3DN1A 161LA 226LA 1L17A 259LA 1L27A 1L87A 221LA 239LA 1CV4A 1L65A 2B6ZA 1PQOA 3DN0A 1C6EA 131LA 2OU8A 1L67A 254LA 2Z6BA 1L04A 118LA 1LWGA 2RB0X 1L77A 1KY1A 1C6HA 129LA 3L2XA 2OU0X 1L18A 1OVHA 1PQIA 3FA0A 1C6CA 1LYFA 3DMXA 1P3NA 222LA 1L66A 1PQDA 2OE9X 4YXAC 1LI6A 242LA 1KS3A 4DJHA 1C67A 4ARLA 1DYGA 1L98A 1KNIA 1C6JA 1L09A 1L99A 1L56A 1T8FA 2F47A 1SX2A 236LA 1QTVA 2RBOA 4ARMA 246LA 3ODUA 1L85A 3HTDA 4AQNA 1L36A 2ANVA 209LA 142LA 111LA 141LA 1C6MA 1L43A 213LA 1JTMA 2B72A 2HUKA 196LA 249LA 148LE 3C7YA 1L05A 1LYGA 2B74A 3HDEA 224LA 4ARMB 1L0KA 2QARC 237LA 120LA 1C6QA 1CU3A 1OV7A 137LA 3LZMA 4LDOA 1LI2A 4LZMA 1L38A 3V2WA 3VW7A 1CU2A 1L94A 1L55A 1L37A 198LA 3C8QA 1QTCA 1QTBA 3HTBA 1CUQA 2RBPA 3DKEX 234LA 200LA 4W57A 256LA 4EPIA 1KW5A 1L60A 1QTZA 1QUHA 1L0JA 3NY8A 2B6TA 1L46A 1G0MA 1G1WA 2HUMA 2OTYX 3SB9A 4S0WA 2B73A 175LA 199LA 173LA 3OE6A 4EKRA 218LA 3FI5A 1LGXA 240LA 3DMVA 152LA 143LA 2RBNA 178LA 1CV3A 109LA 1L39A 230LA 1L13A 1D9WA 1L45A 1CV6A 3DN8A 3L64A 138LA 1C6NA 1P2LA 2B7XA 1G06A 1QT7A 3FADA 4W52A 1LYHA 1L29A 1L41A 126LA 180LA 1C69A 1L52A 3SBBC 107LA 2OTZX 1T97A 3HT6A 1OWYA 1C6KA 1CVKA 3HH5A 4I7MA 4I7JA 1L61A 191LA 1LGUA 1QUGA 1DYCA 1QUOA 252LA 4OO9A 1L95A 114LA 216LA 2LZMA 1C68A 1QS5A 157LA 1D3NA 7LZMA 1L93A 3GULA 1C6IA 1KW7A 1L15A 112LA 3EMLA 4EPFA 2B6WA 1CUPA 3SBAA 1I6SA 1L62A 5I14A 1C62A 1ZWNA 1L53A 251LA 1L30A 1P37A 2LC9A 3HT7A 2NTHA 4DKLA 1LPYA 4YXCA 4I7TA 1OVKA 4GRVA 1L35A 192LA 1T8GA 1L12A 1P7SA 238LA 2RAZX 187LA 1T8AA 219LA 1L97A 243LA 1L00A 1P46A 2Q9EA 3QAKA 1L26A 1L20A 233LA 3HTGA 1L34A 1G07A 1CTWA 4ARQA 158LA 1C6LA 1D2YA 1P6YA 227LA 3G3XA 3HWLA 188LA 4PK0A 1L47A 4W51A 185LA 159LA 177LA 1XJUA 3GUNA 4W56A 228LA 2ANXA 3PBLA 1L01A 103LA 2OU9A 3CDOA 4W58A 2CUUA 1L90A 1L14A 2OE4X 4ARQB 1CU6A 2A4TA 1L03A 220LA 1L75A 257LA 1P64A 1C6TA 4W59A 4LDLA 1L21A 1L49A 104LA 164LA 229LA 3G3WA 3F8VA 1L91A 1L50A 174LA 1P2RA 3HH4A 245LA 1L11A 102LA 1DYBA 4ARPA 165LA 1G0KA 122LA 1LYEA 1L79A 1L63A 1C6GA 1D3JA 4W55A 1XJTA 3SB6A 1D2WA 1L89A 3PDSA 2O4WA 125LA 1L71A 1SWYA 235LA 214LA 231LA 4I7KA 1L64A 139LA 1CV0A 1G0PA 1QT3A 1OYUA 1L08A 186LA 1JTNA 4I7SA 232LA 1PQMA 156LA 144LA 1WTHA 2O7AA 1LW9A 115LA 1DYDA 4I7LA 4EKQA 3GUOA 2RB1X 1QTHA 1PQKA 1CX6A 3CDVA 4I7QA 3F9LA 1L92A 3HH6A 1LGWA 3NYAA 1G0QA 3C7WA 3JR6A 108LA 2F32A 1G1VA 3HUKA 146LA 1T6HA 162LA 160LA 1SWZA 1LYDA 1L24A 4YX7C 1P5CA 1D3MA 1L86A 1SX7A 1L07A 1L25A 1DYFA 2OE7X 217LA 4I7OA 1L19A 3CDTA 210LA 223LA 3HT8A 1L33A 1C6FA 244LA 250LA 3RZEA 1PQJA 3DN3A 2L78A 2F2QA 1L88A 1QSQA 4EKSA 151LA 2B6YA 150LA 1CU5A 1KY0A 3SB8A 2B70A 4W53A 1L73A 1C6PA 1NHBA 4EJ4A 1C60A 1L84A 1P56A 1QT6A 2RBRA 2RH1A 1QT4A 3GUKA 3C8RA 4PJZA 1C63A 1LYJA 3GUIA 1ZURA 155LA 260LA 166LA 130LA 3HU8A 215LA 1B6IA 1L51A 1L70A 1L44A 4EXMA 1C61A 1G0LA 1QSBA 1JQUA 3C81A 4K5YA 3C8SA 3DN2A 1CU0A 1L59A 3C83A 1L83A 1C6DA 2RAYX 1C66A 1G0GA 149LA 1OVJA 182LA 1OWZA 1DYAA 1OV5A 4W54A 211LA 1TLAA 190LA 1QUDA 1L82A 3SB7A 1L06A 127LA 4IAPA 169LA 1SSWA 1G0JA 147LA 2B75A 2RB2X 1L54A 1P36A 2NTGA 5LZMA 3UONA 6LZMA 3K2RA 1QT5A 1L16A 3GUMA 1ZYTA 1L23A 3GUPA 2RBQA 1L31A 247LA 3SN6R 1C6AA 1QT8A 2QB0B 1C6BA 3HTFA 3HUQA 1LWKA 184LA 3C7ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4HJVA 3WW6A 1RFPA 1GAZA 195LA 3CT5A 3J6KA 119LA 4II8A 1XFPL 3IJVA 140LA 3HT9A 3WXUA 2G4NA 1FLYA 4GN5C 1VEDA 197LA 2D4JA 113LA 2Q9DA 1C65A 4H92A 1L80A 123LA 4DT3A 3V2YA 1K28A 3HH3A 181LA 5B1FA 4W94A 2Y8PA 3C82A 2XTHA 4ETDA 1LHJA 2BQHA 2CWIA 3HU9A 183LA 1UACY 1GFAA 2MEHA 4HJYA 3CDRA 1UUZC 1SSYA 4G4CA 1CKHA 4A7DA 167LA 2OEAX 1L48A 1G7MC 3ULRA 3WYHA 1KIPC 1CV5A 1JIYA 1WQNA 4GBRB 1WQQA 3HUAA 1L10A 1LSFA 2MEAA 1L22A 4OW1A 1I20A 1EPYA 5C6LA 3TXKA 1N4FA 1B7QA 3A93A 1D0MA 1LMCA 3W6AA 4QDNA 1C64A 3WUMA 2Q0MX 1A4VA 1B5WA 1D6PA 3DN1A 3WU7A 1EQ4A 1IY4A 131LA 2OU8A 1JJ1A 4M4OA 1CJ6A 1IP7A 5KXRA 3A3RX 3A34A 5IHGA 1LZCA 2G4QA 1GE0A 1P3NA 1L66A 4NEBA 1LJNA 4D9ZA 5L3HA 1JWRA 4NHIA 1L56A 4ARMA 1REMA 4AQNA 142LA 111LA 4RW1A 2GV0A 2ZIJA 1B5UA 1LSMA 1NF5A 2F2NA 3WW5A 1ZVHL 2HEBA 1QUSA 1L0KA 5D5FA 120LA 4LDOA 3T36A 3V2WA 3VW7A 1L37A 5I4XA 1WTNA 1QTBA 4OOOA 4H9IA 3DKEX 3P64A 1YANA 1C46A 2Z38A 5F9UA 4HTQA 3WH1A 1TAYA 1G0MA 1OP9B 1HENA 5APEA 5F16A 1LJGA 1BB3A 4S0WA 199LA 5HMVA 4EKRA 4B4JA 1IX0A 5B07A 1CV3A 109LA 230LA 1GXV2 2ZWBA 1UIEA 4W52A 4XJDA 1BGIA 1C43A 1L29A 5D5CA 180LA 3SBBC 107LA 2OTZX 3HT6A 1CVKA 4I7MA 4H9BA 1T3PA 1UIDA 4LT1A 2Z18A 2Z2EA 4CFOA 1B7PA 1IIZA 4OWHA 4MR1A 3TMVA 1BWIA 1L93A 1LSGA 1INUA 2Z2FA 3LHMA 1XGPC 4LFXA 4EPFA 3SBAA 3AZ6A 5I14A 2YDGA 1L53A 251LA 1L30A 3A96A 1LZ9A 4NHTA 1D0LA 1LJJA 3W6FA 4YXCA 1OVKA 4GRVA 1L35A 192LA 1CJ9A 4QY9A 238LA 5LXWA 4WL6A 1XGUC 3EO5A 5KXNA 1IO5A 3EBAB 1NHEA 5EBHA 4LYTA 1LSBA 5LAGA 3WU9A 1L34A 1G07A 1CTWA 5B1GA 4ARQA 1D2YA 3G3XA 1BB5A 1HFXA 4QGZA 1QUTA 134LA 3GXRA 4GLAA 4W56A 2OU9A 2CUUA 4OWAA 1L90A 1GB8A 2OE4X 1CU6A 1UIBA 4RDSA 4RLMA 4TUNA 5HNCA 1RJCB 257LA 1J1PY 4LDLA 2BQJA 104LA 2FBDA 1P2RA 1OUDA 102LA 1DYBA 4HP0A 4NHPA 165LA 122LA 5A3EA 2BLXA 1L79A 2BQLA 1L63A 1D3JA 1GF3A 3AYQA 3P65A 3PDSA 1OUAA 2O4WA 1L71A 235LA 4CFPA 4I7KA 3B6LA 1CV0A 1IOSA 1GF6A 3ZVQB 232LA 1PQMA 1DYDA 4EKQA 3GUOA 2RB1X 5B05A 2I25L 1H6MA 5FCPA 4H8ZA 2LYOA 4NSGA 1REZA 1YKYX 1G0QA 6LYTA 3JR6A 1GAYA 2F32A 3HUKA 4DC4A 1T6HA 4NFVA 2LHMA 4ETEA 2Z39A 160LA 1LYDA 4YX7C 4ET9A 1D3MA 1LZAA 2XBSA 4NGWA 1H87A 4B4IA 1L19A 4PJ2C 3E3DA 3W6CA 1B7OA 1QTKA 1FKQA 1OUHA 2AUBA 1JTTL 2L78A 2RSCA 1QSQA 150LA 1KY0A 4XENA 4DYGA 4ML7A 1C6PA 4KXIA 2RBRA 1SLYA 3GUKA 1IWUA 1GBSA 1LYJA 1ZURA 260LA 130LA 3HBDA 1LZ6A 1IP2A 1GF0A 1L51A 1C61A 3WUAA 3VWOA 1JQUA 2ZYCA 3C8SA 2H9KA 3TMWA 3C83A 1L83A 1LZBA 1C6DA 2RAYX 149LA 1OWZA 3LZTA 4RLNA 1GXXA 3TXEA 4TTDA 1CKCA 3WXTA 1QUDA 3J4GA 3W6BA 5FDJA 4PRQA 1P36A 1UC0A 6LYZA 5LZMA 5DM9A 3UONA 1FKVA 4QEQA 1JEFA 1QT5A 1L16A 3N9EA 1HEQA 1L23A 3OJPA 5DL9A 1QT8A 2BQDA 4NIJA 2BQAA 3HUQA 184LA 4L41A 1YROA 5KJ9A 1LYIA 1DYEA 5F14A 3OE0A 4LYMA 1NQIA 1JHLA 3SP3A 1L72A 1O23A 1L76A 1F0WA 3D4SA 1L28A 3EMSA 1GHLA 1DPXA 4H8YA 8LYZA 110LA 1L74A 1IP1A 1AKIA 1TEWA 255LA 3CT0A 4DAJA 258LA 1L81A 206LA 2HULA 3DN4A 4CGEA 4J0LA 4E97A 3AJNA 1W08A 241LA 4I7RA 1CKDA 4NGOA 1D6QA 1LHHA 4H8XA 2ZNWY 168LA 212LA 4I7PA 1RE2A 1LZRA 1GB3A 132LA 1LMNA 1DI5A 2B6XA 4I0CA 2RBSA 2XJWA 1L68A 171LA 1GB2A 1UIFA 4KT3A 2DBTA 4DDAA 3C80A 1IWXA 1YQVY 1CV1A 1HC0A 1SQ2L 1PS5A 1L40A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4HJV A;  3WW6 A;  1RFP A;  1GAZ A;  195L A;  3CT5 A;  3J6K A;  119L A;  4II8 A;  1XFP L;  3IJV A;  140L A;  3HT9 A;  3WXU A;  2G4N A;  1FLY A;  4GN5 C;  1VED A;  197L A;  2D4J A;  113L A;  2Q9D A;  1C65 A;  4H92 A;  1L80 A;  123L A;  4DT3 A;  3V2Y A;  1K28 A;  3HH3 A;  181L A;  5B1F A;  4W94 A;  2Y8P A;  3C82 A;  2XTH A;  4ETD A;  1LHJ A;  2BQH A;  2CWI A;  3HU9 A;  183L A;  1UAC Y;  1GFA A;  2MEH A;  4HJY A;  3CDR A;  1UUZ C;  1SSY A;  4G4C A;  1CKH A;  4A7D A;  167L A;  2OEA X;  1L48 A;  1G7M C;  3ULR A;  3WYH A;  1KIP C;  1CV5 A;  1JIY A;  1WQN A;  4GBR B;  1WQQ A;  3HUA A;  1L10 A;  1LSF A;  2MEA A;  1L22 A;  4OW1 A;  1I20 A;  1EPY A;  5C6L A;  3TXK A;  1N4F A;  1B7Q A;  3A93 A;  1D0M A;  1LMC A;  3W6A A;  4QDN A;  1C64 A;  3WUM A;  2Q0M X;  1A4V A;  1B5W A;  1D6P A;  3DN1 A;  3WU7 A;  1EQ4 A;  1IY4 A;  131L A;  2OU8 A;  1JJ1 A;  4M4O A;  1CJ6 A;  1IP7 A;  5KXR A;  3A3R X;  3A34 A;  5IHG A;  1LZC A;  2G4Q A;  1GE0 A;  1P3N A;  1L66 A;  4NEB A;  1LJN A;  4D9Z A;  5L3H A;  1JWR A;  4NHI A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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