2B6TA

T4 lysozyme mutant l99a at 200 mpa
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAAAINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme
publication title Structural rigidity of a large cavity-containing protein revealed by high-pressure crystallography.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2005-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2b6tA00
1C6CA 4S0WA 2B74A 236LA 1L29A 1QT5A 1XEPA 4I7KA 1QT8A 244LA 4W57A 225LA 1QT4A 1LI2A 1L27A 1LYFA 2B73A 2Z6BA 137LA 2RBQA 2CUUA 3HT9A 1L03A 2OE9X 2RAYX 240LA 1G07A 2B6WA 3SB5A 2L78A 3HTGA 229LA 3GUPA 3C7ZA 2HUKA 139LA 1L42A 2B70A 110LA 1PQIA 4IAPA 1KNIA 1L05A 4ARQB 160LA 2ANVA 2B6YA 107LA 3HT8A 1L00A 1L64A 3DN2A 1SX2A 222LA 3HH4A 1LI6A 4EXMA 1L19A 1L44A 1G06A 3NYAA 3HTFA 129LA 1L38A 127LA 4I7MA 152LA 3F8VA 3DMVA 3FA0A 1L43A 4W54A 1L25A 250LA 219LA 120LA 164LA 4I7QA 1QT6A 3GUNA 159LA 245LA 1CTWA 4PJZA 3C8SA 1L36A 1L09A 2RBNA 211LA 4E97A 241LA 4DAJA 3NY8A 1L71A 1L95A 3PDSA 261LA 189LA 4W53A 235LA 1T6HA 3L64A 3CDVA 1QUGA 1QTVA 1L96A 248LA 224LA 1C6PA 1DYAA 247LA 1L82A 251LA 3HU9A 4EKQA 190LA 1L01A 2HUMA 131LA 1D3FA 220LA 172LA 112LA 199LA 168LA 1P2RA 1EPYA 2F47A 3CDOA 1L92A 218LA 1L11A 4ARLA 1WTHA 1L53A 1LGXA 4YXAC 1G0MA 205LA 1L89A 260LA 195LA 3PBLA 1L26A 180LA 2RB1X 1L10A 143LA 1L91A 1QTHA 3HT6A 2NTGA 1CX6A 1L47A 2NTHA 3EMLA 1CX7A 1C6AA 200LA 1LGUA 145LA 1L54A 174LA 1L49A 185LA 1L81A 1L75A 158LA 173LA 1NHBA 1L55A 1PQMA 1G0JA 1CV0A 1QSQA 4K5YA 1KW5A 3SB9A 1L62A 1CV6A 1L23A 3HUQA 1L79A 1L31A 1L08A 166LA 249LA 2HULA 3DN3A 115LA 1QTDA 3HTBA 119LA 1LYDA 1T8FA 3CDTA 125LA 6LZMA 1C6NA 1QTBA 1L34A 1QUHA 7LZMA 213LA 253LA 2IGCA 4PK0A 3D4SA 1L22A 3G3VA 1LYHA 1L16A 233LA 4ARMA 141LA 4EJ4A 1G1VA 1QUOA 1C65A 1ZWNA 1QSBA 103LA 1L67A 1L60A 1L90A 1L84A 1L46A 1T97A 2OEAX 183LA 4ARJA 242LA 4I7LA 223LA 128LA 1L61A 1KW7A 3SBBC 1SWZA 1C6LA 1DYDA 2B75A 1L20A 1L70A 1C6MA 1CU3A 1C6KA 212LA 4EKPA 147LA 1JQUA 3DN8A 186LA 1L76A 209LA 216LA 5LZMA 1B6IA 3HDFA 1L0JA 1QT7A 1L65A 4YX7C 1P46A 151LA 171LA 1QS5A 4ARMB 182LA 1CV3A 221LA 2Q9EA 4GBRB 1G0LA 2OU9A 4W58A 2QB0B 3HH3A 4I7PA 1L21A 215LA 201LA 1LPYA 3HU8A 192LA 3C80A 146LA 1TLAA 169LA 1DYFA 3SB7A 1CUQA 3C7WA 3HDEA 4AQNA 1L69A 2O79A 1D9WA 3HH6A 1L72A 2O7AA 161LA 252LA 178LA 3NY9A 1C64A 4LZMA 1OWYA 3OE0A 1P56A 170LA 1L12A 259LA 3LZMA 1L66A 3OE8A 1L14A 149LA 206LA 3V2YA 4W59A 4W56A 1CV5A 114LA 4EKSA 113LA 239LA 126LA 2OTYX 2OE4X 162LA 1CU0A 4EPFA 3DMXA 1CU6A 1G0PA 155LA 1C6IA 1L33A 4LDLA 4DJHA 1L13A 1QTZA 4W55A 3C8QA 2QARC 108LA 1C6EA 1L48A 4GRVA 1ZYTA 1PQKA 1L97A 3GUIA 254LA 3K2RA 4EPIA 2RBPA 177LA 1JTMA 246LA 3DN6A 227LA 1D2WA 1LYJA 1C6BA 104LA 2RAZX 1DYEA 1L41A 2RBOA 3HTDA 4W51A 3RZEA 197LA 4LDEA 1XJTA 1C63A 1OVKA 1L52A 4I7SA 148LE 1L88A 3C81A 262LA 144LA 1L17A 1L02A 237LA 1OVJA 1LWKA 122LA 130LA 1LW9A 3G3WA 187LA 2A4TA 3DMZA 231LA 3QAKA 1L28A 1L04A 3HT7A 3SBAA 4EKRA 2OTZX 232LA 165LA 1L93A 109LA 2O4WA 3HWLA 196LA 2OE7X 2RB0X 1QS9A 3C83A 184LA 4I7JA 181LA 3JR6A 1L51A 1L59A 102LA 3GUMA 1DYCA 1K28A 3GUKA 1C62A 176LA 1L24A 2F32A 4LDOA 1LI3A 163LA 1CUPA 1LLHA 1CU2A 1QT3A 3CDQA 111LA 1L63A 2B6ZA 1QUDA 217LA 1L99A 1L40A 243LA 1KS3A 1LYEA 2LC9A 2F2QA 4OO9A 191LA 210LA 1L30A 1P7SA 3OE9A 150LA 2RBSA 1DYBA 230LA 1C68A 1I6SA 3DN0A 1LGWA 2ANXA 3GUOA 1D2YA 3VW7A 1L18A 1PQDA 1KY1A 1L83A 1L37A 1ZURA 1L56A 3SN6R 3G3XA 1L15A 1C6HA 3L2XA 2B7XA 3SB8A 3CDRA 4DKLA 1CV4A 2OU0X 175LA 1SWYA 4ARPA 198LA 118LA 4I7RA 1C69A 138LA 1L0KA 234LA 2B72A 1CVKA 1L57A 1L73A 3C7YA 3DKEX 3FI5A 3UONA 3OE6A 2LZMA 1D3NA 1C6GA 1PQJA 1L39A 1P64A 1QTCA 1L07A 255LA 1C6QA 1CU5A 1D3MA 238LA 1G0QA 2B6XA 1L50A 1C6DA 1L98A 3HUAA 167LA 1L94A 3DNAA 1L86A 1KY0A 1P3NA 3HH5A 1OVHA 142LA 1L85A 1P36A 1P6YA 3V2WA 1C60A 1P2LA 3HUKA 3F9LA 1OV5A 3RUNA 214LA 156LA 1C61A 1G0GA 140LA 1T8AA 1LWGA 226LA 4I7TA 1L74A 3GUJA 3C82A 256LA 2RH1A 1JTNA 1T8GA 1L80A 1LYGA 1PQOA 1D3JA 3DN4A 1C6FA 3GULA 2RB2X 1L32A 3SB6A 1L45A 258LA 4W52A 3FADA 2LCBA 4I7NA 1OWZA 188LA 1XJUA 4I7OA 5I14A 2Q9DA 2B6TA 1SSWA 1L77A 2OU8A 1C6JA 1OV7A 1SSYA 1C66A 1LYIA 157LA 1L58A 1L06A 1L68A 3DN1A 1G1WA 3ODUA 3C8RA 2RBRA 1C6TA 1L35A 1P37A 1OYUA 1P5CA 228LA 4ZPUA 257LA 123LA 4YXCA 1DYGA 1CV1A 1C67A 4ARQA 1G0KA 1SX7A 1L87A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3WW5A 3B0IA 1C6CA 1A4VA 1B7QA 1UIHA 2B74A 2BQHA 4S0WA 1A2YC 1L29A 2Z2EA 3G3BB 4YEOA 1QT5A 1LPIA 1QT8A 1F0WA 5F9XA 137LA 1LMCA 2CUUA 1L03A 240LA 4TWSA 2B6WA 3HBDA 2L78A 2DQDY 1ZVYB 3C7ZA 2ZWBA 2HUKA 110LA 1L05A 1RJCB 1HENA 2ANVA 5KXMA 3ULRA 5I54A 3HT8A 1LZCA 3BKHA 3HH4A 5EBHA 1DZBX 4HJZA 1BB7A 3F8VA 1GE1A 4NFVA 2DQJY 250LA 2BAAA 1GFUA 1QT6A 2BQKA 2H9KA 159LA 4OWEA 1LHLA 133LA 3WXTA 4PJZA 1LZBA 2EKSC 1L09A 4E97A 241LA 5KY1A 3A8ZA 4H9CA 235LA 1T6HA 1UUZC 1QTVA 224LA 4MSTA 4M6DA 247LA 1L82A 1B5VA 1L01A 1GB5A 3GXRA 1QUSA 1EPYA 1L92A 3TXDA 5FELA 3AJNA 1LZ9A 2BQJA 3LYZA 205LA 1LYYA 1IX0A 1L89A 1IR9A 4WLDA 1XEJA 2XQOA 3PBLA 4WMGA 143LA 5A3ZA 1LJ4A 1CX6A 2NTGA 2F4GA 3EMLA 1J1PY 4ETCA 174LA 1L81A 3TMWA 4NGOA 4C3WA 4K5YA 2Y8PA 1KW5A 2DQHY 4X3BA 2H5ZA 1Z55A 4RW2A 4H8ZA 2MEHA 4XJHA 249LA 4OWAA 4LFXA 2ZQ4A 2CWIA 4UWNA 2LZ2A 1QTBA 1HF4A 213LA 3WMKA 2CJLA 4RW1A 3A93A 2IGCA 4DD3A 1L22A 3G3VA 1L16A 233LA 1REZA 5LVGA 141LA 4PJ2C 2XBSA 4WM4A 4EJ4A 4TUNA 1QSBA 4ANRA 5A3EA 1L60A 4II8A 5KKJA 1AM7A 223LA 1GFKA 1C6MA 1B5YA 1CU3A 186LA 2MEDA 216LA 1JKBA 5LZMA 2HEEA 1B6IA 1DI4A 1HERA 1CV3A 221LA 4GBRB 5LXWA 1G0LA 2OU9A 4HTQA 2BQFA 1L21A 4PHIA 192LA 5C6IA 3W6DA 146LA 1WQPA 1CUQA 2O79A 4WLXA 3A95A 1B9OA 178LA 3W3EA 1LSCA 3OE0A 170LA 1LJJA 2YDGA 3TMXA 1UIAA 1L12A 1D0MA 1L66A 1GBYA 4OOTA 193LA 2HU3A 1RCMA 4EKSA 2F2NA 1VFBC 126LA 1LMQA 4NHPA 5JENB 1IC4Y 162LA 3DMXA 155LA 1C6IA 4KXIA 4WL7A 2MEGA 3P66A 5KXXA 4HJVA 5KXZA 4OW1A 1D9UA 1JTMA 1IP6A 1D2WA 1SQ2L 3HTDA 197LA 2RBOA 4W51A 3RZEA 4HPEA 4LDEA 1XJTA 1YILA 1OUFA 1C63A 5B06A 1L52A 1DPXA 5DN5A 1QQYA 4ET9A 1WTMA 1LZ6A 1B5ZA 4NG8A 5KJ9A 1LWKA 1LW9A 5DN4A 231LA 4LT2A 2HU1A 4XJDA 1L93A 109LA 4PGJB 1XGRC 3TXBA 3WUNA 1UIDA 3C83A 1GBOA 2OE7X 2RB0X 184LA 1JKAA 4P2EA 102LA 4H91A 3GUMA 1INUA 5D5FA 1LSDA 1K28A 3W6EA 1L24A 1FKVA 1LI3A 1JJ3A 4WM2A 4H9FA 111LA 1L63A 4DDCA 217LA 4H9IA 2IFFY 1XGUC 1IY3A 1LYEA 1AT6A 1GB9A 1REXA 4W96A 4GCBA 5KKIA 3WPKA 4EOFA 1GB6A 3DN0A 4LFPA 4NGVA 4WG7A 3GUOA 3IWRA 1LZTA 1PQDA 1FLQA 1CKFA 5APCA 1QTKA 1L15A 2B7XA 3CDRA 2OU0X 175LA 1LHIA 198LA 1GE2A 4I7RA 5KXLA 138LA 1LHHA 234LA 3AZ6A 1L57A 3C7YA 4Z46A 1BB6A 2LZMA 255LA 1L07A 1G0QA 2FBDA 2B6XA 3CSRA 4WO9A 3HUAA 1B7SA 2X0AA 1GDXA 1L86A 2FBBA 2CGIA 1OVHA 3WXUA 4NHIA 4LYTA 1N4FA 4LZTA 3F9LA 4J1BA 4G4CA 4QGZA 1G0GA 4N1EI 5I4YA 1T8AA 1B7OA 1ZMYL 1HFZA 1C43A 1L74A 1IWZA 1JTNA 2WARA 1T8GA 1QUTA 1IP4A 1LJNA 1PQOA 5L3HA 3DN4A 4XYYA 2ZIKA 3SB6A 3FADA 4I7NA 1GFGA 1OWZA 4H8XA 5L3IA 2I26L 2B6TA 1C6JA 1LOZA 4DT3A 4R0FA 1C66A 4DQ7A 1L58A 1OUEA 2G4QA 1W6ZA 1P37A 1TCYA 1LHKA 257LA 1VDSA 4ARQA 3QNGA 1SX7A 1L87A 2BQEA 1B5UA 3WL2A 1C08C 2HUBA 1TBYA 244LA 4G49A 225LA 1KXWA 1CJ9A 1LYFA 2Z6BA 2RBQA 3P68A 2PC2A 4H94A 1G07A 3AZ4A 4DQJA 4DDAA 3HTGA 229LA 5B1GA 1JTTL 4BAPA 4TTDA 3GUPA 1NF5A 5ILFA 1JWRA 139LA 1LMTA 4U3XB 1GF8A 4B1AA 4H9BA 5L9JA 1W08A 5APDA 4ARQB 4YEMA 160LA 4RLMA 4ETEA 2B6YA 2EPEA 1L64A 1SX2A 4NGYA 1LI6A 1L19A 1LYOA 5LVHA 1L44A 2HEFA 1GFAA 2MEIA 5IHGA 2IHLA 2ZYCA 4DD9A 1G7MC 1IEEA 127LA 4NGIA 4I7QA 1B5XA 3B0KA 5C6JA 3B0OA 1CTWA 3C8SA 2RBNA 211LA 2Z18A 4PRQA 2W1XA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3WW5 A;  3B0I A;  1C6C A;  1A4V A;  1B7Q A;  1UIH A;  2B74 A;  2BQH A;  4S0W A;  1A2Y C;  1L29 A;  2Z2E A;  3G3B B;  4YEO A;  1QT5 A;  1LPI A;  1QT8 A;  1F0W A;  5F9X A;  137L A;  1LMC A;  2CUU A;  1L03 A;  240L A;  4TWS A;  2B6W A;  3HBD A;  2L78 A;  2DQD Y;  1ZVY B;  3C7Z A;  2ZWB A;  2HUK A;  110L A;  1L05 A;  1RJC B;  1HEN A;  2ANV A;  5KXM A;  3ULR A;  5I54 A;  3HT8 A;  1LZC A;  3BKH A;  3HH4 A;  5EBH A;  1DZB X;  4HJZ A;  1BB7 A;  3F8V A;  1GE1 A;  4NFV A;  2DQJ Y;  250L A;  2BAA A;  1GFU A;  1QT6 A;  2BQK A;  2H9K A;  159L A;  4OWE A;  1LHL A;  133L A;  3WXT A;  4PJZ A;  1LZB A;  2EKS C;  1L09 A;  4E97 A;  241L A;  5KY1 A;  3A8Z A;  4H9C A;  235L A;  1T6H A;  1UUZ C;  1QTV A;  224L A;  4MST A;  4M6D A;  247L A;  1L82 A;  1B5V A;  1L01 A;  1GB5 A;  3GXR A;  1QUS A;  1EPY A;  1L92 A;  3TXD A;  5FEL A;  3AJN A;  1LZ9 A;  2BQJ A;  3LYZ A;  205L A;  1LYY A;  1IX0 A;  1L89 A;  1IR9 A;  4WLD A;  1XEJ A;  2XQO A;  3PBL A;  4WMG A;  143L A;  5A3Z A;  1LJ4 A;  1CX6 A;  2NTG A;  2F4G A;  3EML A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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