3HH5A

New azaborine compounds bind to the t4 lysozyme l99a cavity - 1-ethyl-2-hydro-1,2-azaborine
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAAAINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme
publication title Boron mimetics: 1,2-dihydro-1,2-azaborines bind inside a nonpolar cavity of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 61
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2009-05-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3hh5A00
1LYHA 1C6LA 1L00A 1QTHA 1D9WA 4I7LA 4GBRB 230LA 4ARLA 3HH4A 2B6YA 3GULA 215LA 4W54A 126LA 1L53A 1L84A 2RBRA 3GUNA 157LA 1L25A 4EXMA 1G1VA 2A4TA 175LA 1G0MA 1L15A 3RZEA 1SX2A 1L98A 2B7XA 152LA 1LGWA 185LA 4W56A 1QT7A 1L54A 4ARMA 232LA 1QSBA 4W52A 1C67A 1WTHA 2B6TA 1QTDA 1L33A 1QUGA 3HTDA 1D2YA 3SB6A 3HDEA 1OV7A 143LA 234LA 104LA 2B72A 164LA 2F47A 131LA 1P37A 4DKLA 200LA 102LA 3SBBC 1QT8A 209LA 1QTVA 2OU9A 3CDQA 1C64A 1OVKA 4EPIA 3C7YA 1KY0A 2O4WA 2HUKA 1CUPA 205LA 1QTCA 1ZYTA 1L01A 1CU5A 1L61A 2NTHA 3OE6A 3C8RA 245LA 1QT3A 1DYCA 1L32A 2B6WA 181LA 199LA 3C83A 1L68A 233LA 217LA 262LA 2O7AA 3HH3A 1L04A 155LA 1L05A 190LA 1LGXA 4S0WA 1LYDA 1L99A 176LA 2F32A 2OE7X 1G07A 3C81A 158LA 1PQIA 4I7TA 2RBOA 1TLAA 1L50A 1L40A 2F2QA 3HUQA 1L73A 2B75A 2Q9EA 129LA 1C6KA 1L08A 1C62A 3C82A 4E97A 3NY8A 1C65A 149LA 226LA 184LA 1L17A 171LA 4W51A 4PJZA 177LA 249LA 3HT6A 1QUHA 1CV1A 3EMLA 1C61A 3DNAA 3HT9A 4EKSA 3SN6R 1C6TA 2LCBA 3G3WA 192LA 3D4SA 235LA 1D3JA 4ARQA 1L09A 1PQJA 2RH1A 221LA 1P64A 1PQDA 1G0QA 1P36A 2OE4X 2NTGA 2OEAX 1L38A 3DN1A 1CV6A 1D3MA 3DN3A 113LA 2RAYX 163LA 1L71A 3FI5A 4EJ4A 3SB9A 223LA 1L13A 1L59A 1L88A 1L77A 1B6IA 174LA 1CX6A 4W59A 3C7WA 4LDLA 1L36A 197LA 123LA 172LA 1C6FA 4I7SA 150LA 1L24A 1CU6A 3CDTA 1CU2A 1L48A 1QT4A 3DMZA 1D3FA 1L47A 213LA 227LA 4DAJA 1L28A 1C6IA 159LA 1L18A 3HDFA 3HUKA 3HH5A 2QB0B 1D2WA 2CUUA 161LA 1L46A 4I7JA 122LA 148LE 1L11A 1L51A 1L43A 1PQOA 144LA 2OU8A 1KY1A 3OE8A 1P2LA 4ZPUA 4K5YA 1L16A 1L20A 2RB2X 1C6GA 1CU0A 2RBPA 3DN8A 1L60A 2IGCA 211LA 3C8QA 1L0KA 4LDEA 1KNIA 1L55A 1EPYA 1L45A 214LA 128LA 2B73A 5LZMA 1SWZA 1C6NA 1G0JA 110LA 3DMXA 169LA 1XJUA 3NY9A 1L79A 1DYDA 1L29A 1L67A 1C6EA 2Q9DA 1L12A 1L66A 1L37A 1CU3A 239LA 1L22A 103LA 1L69A 3C8SA 119LA 1XJTA 1T8FA 3HTFA 1G0GA 242LA 4YX7C 3V2WA 1L57A 3HUAA 3PBLA 224LA 1JTNA 1L35A 168LA 3FA0A 3FADA 253LA 3HT8A 1QS9A 1LWGA 138LA 1G0KA 1L39A 1L42A 3GUMA 162LA 1PQMA 4IAPA 4AQNA 130LA 2ANVA 1QTZA 4W57A 109LA 1C6BA 141LA 4I7QA 1OWYA 142LA 166LA 1P6YA 139LA 1L19A 256LA 1L26A 1QUOA 246LA 4DJHA 1NHBA 3NYAA 1C63A 4I7RA 170LA 1XEPA 165LA 160LA 1LWKA 1L93A 1C60A 3DN6A 4ARPA 4LZMA 1T8GA 1LW9A 1T6HA 2B74A 1I6SA 147LA 1L14A 1KS3A 1C66A 3GUKA 2QARC 1OYUA 3SB8A 206LA 145LA 1C6DA 3F8VA 3CDRA 3DN4A 118LA 4I7KA 188LA 1L10A 2LZMA 3DN0A 222LA 3DN2A 4EKPA 1CUQA 2HULA 1P2RA 4I7OA 1L81A 1QT5A 3SB7A 1C6QA 187LA 1L70A 1L56A 216LA 1L31A 248LA 1L30A 3JR6A 1L72A 180LA 1C69A 1C6JA 1SSWA 115LA 1L06A 2RB1X 3CDOA 1C6HA 3GUIA 3RUNA 1KW7A 1L75A 2OU0X 260LA 3HTBA 1L86A 4W55A 1L96A 2RB0X 173LA 1P7SA 186LA 198LA 182LA 1L95A 3HT7A 3LZMA 1L0JA 4I7PA 4GRVA 108LA 3V2YA 191LA 1ZWNA 183LA 1JTMA 2LC9A 1ZURA 1CVKA 4EKRA 2OTZX 1DYGA 1QT6A 1L80A 7LZMA 1L65A 2RBNA 2ANXA 3DMVA 1G0LA 1C6MA 1L91A 2RBSA 3HH6A 3HU8A 1C68A 258LA 2HUMA 1QSQA 1LI6A 1LLHA 229LA 1P56A 1L82A 140LA 1L34A 5I14A 4ARMB 1QTBA 4W53A 1L23A 1P3NA 1CV5A 195LA 210LA 1L49A 1L63A 1L52A 156LA 4I7MA 137LA 3CDVA 1L97A 4OO9A 3HTGA 1DYAA 3C7ZA 1L87A 4ARJA 1PQKA 212LA 1LYIA 231LA 2RBQA 151LA 4YXAC 3HWLA 1L94A 3HU9A 4PK0A 112LA 1DYEA 1L76A 219LA 3L2XA 3OE0A 4I7NA 1LYGA 255LA 1QUDA 3ODUA 3OE9A 120LA 1L89A 1LI3A 1OWZA 2OTYX 1CV0A 1DYBA 3G3VA 3GUPA 125LA 167LA 218LA 3SB5A 1LYEA 3K2RA 225LA 3SBAA 3GUOA 247LA 111LA 251LA 259LA 3VW7A 3DKEX 3GUJA 1L85A 1DYFA 254LA 1L83A 1CX7A 244LA 6LZMA 127LA 252LA 1OV5A 1CV3A 2OE9X 1OVHA 4LDOA 1C6CA 4W58A 1L64A 1D3NA 1L27A 228LA 1L74A 2Z6BA 2O79A 146LA 1P5CA 4YXCA 1JQUA 2L78A 114LA 3PDSA 1LYJA 201LA 1LPYA 1OVJA 4EKQA 107LA 2B70A 250LA 257LA 1L58A 1KW5A 1C6AA 2B6ZA 1QS5A 189LA 2B6XA 1T97A 1LI2A 1P46A 3UONA 220LA 1K28A 1SSYA 1LGUA 243LA 1SX7A 261LA 237LA 1L62A 241LA 1L92A 3C80A 1SWYA 1G0PA 1L07A 2RAZX 196LA 4ARQB 1G1WA 1L41A 1T8AA 1C6PA 1L21A 236LA 3G3XA 1CV4A 4EPFA 238LA 1LYFA 1CTWA 1G06A 178LA 240LA 1L02A 1L03A 3QAKA 1L90A 3F9LA 3L64A 1L44A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2ZILA 1LZSA 4GLVA 230LA 2LYOA 4ARLA 3HH4A 3GULA 4DDAA 1BWIA 215LA 4W54A 1IP4A 2RBRA 5LAFA 1BQLY 4EXMA 1YKYX 3CT1A 4DD0A 1LCNA 3AYQA 4R6CA 1WVVA 1SX2A 1L98A 2B7XA 185LA 1LSYA 232LA 1F0WA 1GB3A 1D0MA 3IJUA 3GXKA 4NFVA 1G7LC 234LA 2F47A 1WQPA 3T36A 5II3A 1OUAA 1LMNA 1QT8A 3CDQA 4X3BA 1GE2A 1NMMA 1TCYA 3C7YA 4KXIA 4OWEA 205LA 1VEDA 1ZYTA 1UIAA 4H1PA 1CKGA 2NTHA 3A6CY 3C8RA 1DYCA 2B6WA 4TSCA 199LA 1HSWA 1A4VA 3C83A 3AW7A 233LA 3HH3A 1B0DA 1CKDA 1L04A 1HC0A 1L05A 3WPLA 4S0WA 1L99A 2HEBA 2BLXA 1G07A 3LZ2A 4ET8A 1WQNA 1HFXA 1UCOA 1C6KA 3A3QA 3GXRA 4E97A 4TX7A 1C65A 4LYMA 3J6KA 226LA 184LA 171LA 4W51A 1GFEA 1BHZA 177LA 4Z41A 1CV1A 1IWTA 4EKSA 2BAAA 2D91A 1C6TA 4YEMA 1B5VA 1LJHA 1YANA 3G3WA 192LA 1GFTA 7LYZA 2YBHA 4XYYA 1PQDA 2OE4X 4DD9A 2RAYX 2W1YA 1DZBX 4YEOA 3FI5A 3AB6A 1JJ0A 1DPXA 2F4GA 2HUBA 1N4FA 2Z2EA 3SB9A 1TDYA 1NF5A 1G7JC 4DDCA 1B6IA 4GCFA 1REYA 174LA 5A3EA 2RSCA 1LSPA 4W59A 5ILFA 1LJKA 5KY1A 1L36A 1LMTA 1KXYA 1GE3A 1L24A 3CDTA 1CU6A 1LHHA 1GPQC 1L48A 2Q0MX 213LA 2FYCA 3HDFA 3HUKA 3HH5A 2QB0B 1JIYA 5LXWA 1VDPA 1L46A 1QQYA 4OOTA 4RLNA 2F30A 2OU8A 1P2LA 193LA 133LA 3P65A 5KXRA 5D5CA 1L16A 1L20A 3DN8A 1NQIA 1LSNA 2IGCA 4LDEA 1KNIA 3HBDA 1EPYA 1L45A 1IWUA 5LZMA 1SWZA 4NHQA 3NY9A 1BVKC 2PC2A 4H9IA 1L29A 1OUGA 1UIBA 3A93A 1L37A 1L22A 103LA 119LA 5KXPA 1G0GA 242LA 1FBIX 1IOTA 4NIJA 4LT3A 168LA 1LYOA 3FADA 1CKFA 1G0KA 3LZTA 1IY4A 2ANVA 109LA 3ATOA 4I7QA 1W08A 4KL7A 139LA 5KXKA 1QUOA 3NYAA 3WW5A 1XEPA 4DWXA 1LWKA 4H91A 2XBRA 4YOPA 1D0KA 1LZNA 5DN4A 4ARPA 207LA 1T8GA 1LW9A 2B74A 3AZ7A 1LSBA 147LA 1XEIA 1QUTA 1GAZA 4XJBA 2MEBA 1GB5A 3CDRA 118LA 3MGWA 1IP6A 1LKRA 2BPUA 1NDMC 1JWRA 5HLLA 1DKJA 2F4AA 3A6BY 1B7PA 1GF8A 1L56A 4WM1A 4I8SA 1XGUC 1C6JA 4ETEA 4M4OA 2RB1X 1IC7Y 5C6LA 1C6HA 1DPWA 2BQBA 3GUIA 3RUNA 1KW7A 1L75A 5AMYA 2OU0X 1JTTL 4NGJA 5I5QA 4J0LA 4H9AA 186LA 1HEWA 3AGHA 182LA 5FDJA 3HT7A 1DI5A 1JTMA 1HEQA 2EKSC 4TUNA 1DYGA 1QT6A 1OUIA 4ANRA 4BAFA 1RJCB 2ANXA 4J1AA 1LSDA 1G0LA 1C6MA 4XJFA 4NGYA 1LKSA 2YBJA 1INUA 1QSQA 1LI6A 2YVBA 4LYCA 1ZV5L 3AZ4A 1L82A 1REZA 1G7HC 4NWHA 1YAMA 1CV5A 1TAYA 3WUNA 5E4PA 1FLWA 1L49A 1L63A 1WQQA 4I7MA 4IATA 4DD7A 2DBTA 1BWHA 1GB0A 1XGRC 1GBOA 1KXWA 3OJPA 9LYZA 231LA 2RBQA 1GD6A 1LJGA 4YM8A 1L94A 112LA 1GF0A 2C8PA 3OE0A 1GBWA 4H8ZA 1IWVA 1VDSA 3ODUA 2HU3A 120LA 1LI3A 1HEMA 1CV0A 1JEFA 1LYEA 4P2EA 1ALCA 1L83A 1CX7A 127LA 5APCA 3W6CA 252LA 1GEZA 4ETDA 2OE9X 5KJ9A 228LA 1LJJA 5HNCA 5L3HA 1JQUA 114LA 2VB1A 5KKJA 1LYJA 1LPYA 107LA 2B70A 2Z19A 5LINA 1B7LA 1KW5A 4EMNA 5DLAA 1HELA 1QS5A 2HEEA 1LI2A 220LA 1K28A 3W6AA 1LMCA 3RNXA 1SX7A 1IO5A 241LA 1CNSA 1L07A 4ARQB 2BQOA 4GN5C 1D6PA 2DQAA 1GFHA 240LA 1L02A 1JSFA 1BB5A 138LA 1GXXA 1LOZA 1D9WA 4HJVA 4GN4A 4PRQA 4II8A 3TXGA 2YBNA 2Y8PA 5KXZA 4QDNA 157LA 1GB9A 1CJ6A 1G1VA 2A4TA 3G3BB 1LSZA 1FLUA 3RZEA 1LJIA 1XGPC 2G4QA 3G3AB 1CJ8A 152LA 4ARMA 1QSBA 5LYZA 4HJZA 3WVXA 1WTHA 1L33A 1QUGA 4GCDA 1D2YA 3HDEA 3W6EA 2BQGA 1BWJA 4DKLA 102LA 1C64A 1OVKA 1RCMA 3HFMY 1LZAA 1GF5A 4U3XB 2MEDA 1E8LA 4NHPA 1GE4A 3CSQA 5LA5A 1L68A 217LA 262LA 1GE1A 4NSGA 1PZYA 1ZVHL 155LA 4H93A 3IJVA 3OK0A 1IP1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2ZIL A;  1LZS A;  4GLV A;  230L A;  2LYO A;  4ARL A;  3HH4 A;  3GUL A;  4DDA A;  1BWI A;  215L A;  4W54 A;  1IP4 A;  2RBR A;  5LAF A;  1BQL Y;  4EXM A;  1YKY X;  3CT1 A;  4DD0 A;  1LCN A;  3AYQ A;  4R6C A;  1WVV A;  1SX2 A;  1L98 A;  2B7X A;  185L A;  1LSY A;  232L A;  1F0W A;  1GB3 A;  1D0M A;  3IJU A;  3GXK A;  4NFV A;  1G7L C;  234L A;  2F47 A;  1WQP A;  3T36 A;  5II3 A;  1OUA A;  1LMN A;  1QT8 A;  3CDQ A;  4X3B A;  1GE2 A;  1NMM A;  1TCY A;  3C7Y A;  4KXI A;  4OWE A;  205L A;  1VED A;  1ZYT A;  1UIA A;  4H1P A;  1CKG A;  2NTH A;  3A6C Y;  3C8R A;  1DYC A;  2B6W A;  4TSC A;  199L A;  1HSW A;  1A4V A;  3C83 A;  3AW7 A;  233L A;  3HH3 A;  1B0D A;  1CKD A;  1L04 A;  1HC0 A;  1L05 A;  3WPL A;  4S0W A;  1L99 A;  2HEB A;  2BLX A;  1G07 A;  3LZ2 A;  4ET8 A;  1WQN A;  1HFX A;  1UCO A;  1C6K A;  3A3Q A;  3GXR A;  4E97 A;  4TX7 A;  1C65 A;  4LYM A;  3J6K A;  226L A;  184L A;  171L A;  4W51 A;  1GFE A;  1BHZ A;  177L A;  4Z41 A;  1CV1 A;  1IWT A;  4EKS A;  2BAA A;  2D91 A;  1C6T A;  4YEM A;  1B5V A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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