3HH5A

New azaborine compounds bind to the t4 lysozyme l99a cavity - 1-ethyl-2-hydro-1,2-azaborine
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAAAINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Boron mimetics: 1,2-dihydro-1,2-azaborines bind inside a nonpolar cavity of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 61
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2009-05-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3hh5A00
222LA 1LWKA 1L41A 1OWZA 1QUHA 145LA 3DN1A 3HDEA 4ARPA 119LA 1C6MA 1L97A 2O4WA 2RBPA 239LA 1L98A 4DAJA 1C6CA 252LA 1C6QA 1C6LA 1L02A 1QTDA 151LA 1P46A 3HU8A 2RB0X 1C6JA 224LA 111LA 215LA 2RH1A 3C82A 180LA 1OV7A 2RAZX 1L43A 3JR6A 142LA 172LA 243LA 217LA 1L09A 1C6HA 1DYEA 3HDFA 3V2YA 2RBRA 3C81A 1ZWNA 3C8QA 1D3NA 262LA 187LA 1L06A 171LA 1B6IA 1L33A 3HTBA 4I7NA 2RB1X 131LA 211LA 1L47A 1CTWA 1C63A 189LA 225LA 1ZYTA 1ZURA 1L36A 1P56A 4AQNA 1JQUA 1L75A 1CX6A 1L17A 2OE7X 3HUAA 245LA 3DMXA 2RBSA 5LZMA 4W57A 1L74A 165LA 1L05A 1T8AA 3GUKA 1CU5A 4DKLA 1C68A 1DYGA 1D2WA 1L24A 1KW5A 168LA 4LZMA 2OEAX 126LA 2HUKA 230LA 123LA 1G0JA 3CDTA 4ARQA 196LA 1L10A 1NHBA 3DKEX 1KY1A 2OTZX 1L30A 1C62A 1P37A 1C61A 2OE9X 1CUPA 1XEPA 173LA 254LA 4I7RA 1L32A 3L64A 183LA 129LA 1L45A 3PBLA 1L01A 1QSBA 234LA 2B70A 1QUDA 3OE6A 139LA 1LYJA 157LA 1L92A 1L85A 4W52A 241LA 4EXMA 4I7LA 214LA 1CU3A 1L79A 258LA 3C83A 1L89A 1L44A 143LA 1L70A 147LA 1L31A 1TLAA 2OU0X 2O79A 2HUMA 3HH5A 6LZMA 107LA 108LA 2IGCA 152LA 3DMVA 3C8RA 3HTFA 2NTHA 176LA 1D3FA 1DYCA 4I7TA 1P2LA 3V2WA 256LA 141LA 212LA 1P2RA 1LYEA 1SSYA 235LA 3HT7A 2OU8A 1C6NA 127LA 3HU9A 1C64A 3DN3A 3HH3A 4W56A 1G0QA 3HT9A 1L12A 1C6GA 3G3VA 3GUNA 1L28A 197LA 164LA 1QTCA 4I7MA 4PJZA 229LA 255LA 2RAYX 1P6YA 1LGWA 2B73A 1L51A 3GUOA 118LA 2LC9A 1L11A 1QT5A 3DMZA 4GBRB 3DN4A 3EMLA 3L2XA 3F9LA 4W54A 1L23A 1CUQA 4I7PA 1L95A 146LA 1L39A 1KS3A 1G0KA 122LA 138LA 4W55A 1QTBA 3DN2A 195LA 1L72A 1L93A 1EPYA 1L82A 4I7SA 1L26A 2F47A 104LA 1L0KA 177LA 4S0WA 248LA 3GUJA 1C66A 1L52A 1QUGA 1CV5A 1L83A 3F8VA 3C8SA 1LYFA 1T8FA 1CV1A 113LA 2B6ZA 3HUKA 3DN8A 1C65A 1QS9A 4ARQB 185LA 1C6BA 158LA 3FA0A 4I7KA 140LA 110LA 1P3NA 3NYAA 1G0LA 1L94A 1L58A 1LPYA 103LA 1D3JA 2OE4X 251LA 3FI5A 237LA 1C60A 1L87A 231LA 1C6IA 4YXAC 137LA 3LZMA 4I7QA 4EKPA 2L78A 5I14A 260LA 3CDQA 182LA 1C6AA 3DNAA 1C69A 223LA 4ARMB 167LA 4ARJA 1SX2A 4W59A 1KNIA 1L22A 2OTYX 1LYDA 1L00A 4YX7C 1LGUA 2NTGA 169LA 3HT8A 1L38A 3SN6R 3SB9A 3UONA 148LE 1LI6A 1L84A 249LA 2RBQA 1QT6A 1C6PA 3D4SA 4GRVA 201LA 2LCBA 1LI2A 1LWGA 4K5YA 156LA 181LA 1CV6A 213LA 3CDRA 3GULA 3VW7A 250LA 1PQDA 3CDVA 1L76A 3QAKA 4ARLA 2F2QA 2Z6BA 1OVJA 1C67A 1L66A 1L03A 1PQMA 3SB5A 2B6TA 198LA 3CDOA 1L49A 1LYHA 1L62A 228LA 1L07A 1QTHA 199LA 257LA 114LA 1LI3A 1CX7A 2B6XA 1L04A 3GUIA 3RZEA 1QTVA 238LA 247LA 4EPFA 1L13A 1L55A 1L71A 4IAPA 226LA 1SWZA 1L57A 149LA 3SBBC 1L60A 220LA 1C6FA 1SSWA 1L90A 1LYGA 3G3WA 1T8GA 2O7AA 112LA 4DJHA 1L80A 1L64A 1T97A 1L96A 1L68A 1KY0A 4W53A 2B7XA 1L65A 3FADA 128LA 2QB0B 3HTDA 1OWYA 1D9WA 130LA 144LA 1JTNA 261LA 1L16A 3RUNA 3NY8A 1L37A 244LA 1L08A 115LA 209LA 1SWYA 3HTGA 1DYFA 1G1VA 200LA 1LW9A 1P7SA 1L27A 1G0GA 3C7ZA 3SBAA 1QSQA 1DYBA 1G07A 2CUUA 2LZMA 1SX7A 175LA 1G1WA 174LA 236LA 3DN0A 178LA 1D2YA 4I7OA 4ZPUA 1C6KA 2B6YA 2B6WA 4PK0A 1OVKA 1L53A 3OE0A 1QTZA 2HULA 125LA 3HH4A 184LA 1T6HA 3SB8A 1WTHA 1L81A 1KW7A 1L18A 1CU0A 1L56A 150LA 1L46A 1OVHA 4EKSA 1DYDA 3SB6A 3SB7A 1QT8A 227LA 1D3MA 3K2RA 1L0JA 233LA 4W51A 4I7JA 3HUQA 1L35A 1CV4A 1XJUA 210LA 3G3XA 1G0MA 186LA 4LDEA 1G06A 242LA 155LA 3PDSA 2Q9EA 1XJTA 1DYAA 1PQKA 4OO9A 1L20A 1L29A 159LA 1L42A 1L54A 162LA 1LLHA 1L50A 1LYIA 246LA 2B74A 4E97A 4EJ4A 3HWLA 1P5CA 3DN6A 1L63A 1K28A 1L69A 2B75A 2A4TA 1QS5A 1L59A 166LA 192LA 1OV5A 240LA 1L48A 4LDOA 3HT6A 1C6DA 1CU6A 3C7WA 1L67A 1C6TA 3NY9A 221LA 1P36A 1CV3A 3C80A 2RB2X 160LA 1L99A 190LA 1L34A 205LA 1CU2A 2Q9DA 2ANXA 163LA 1L88A 1L15A 253LA 102LA 3GUMA 4W58A 216LA 4ARMA 161LA 3GUPA 259LA 191LA 1L77A 3C7YA 1JTMA 170LA 1L19A 1LGXA 109LA 1L91A 3ODUA 1PQIA 2QARC 1G0PA 1L40A 219LA 2OU9A 2F32A 3OE8A 4EKQA 4EKRA 2RBOA 4YXCA 3OE9A 1L21A 1PQJA 1CV0A 1P64A 120LA 4EPIA 4LDLA 2RBNA 1C6EA 1I6SA 1QT4A 218LA 188LA 1QUOA 1PQOA 1L86A 7LZMA 1CVKA 1L61A 232LA 1L73A 1L14A 3HH6A 1QT3A 1OYUA 1L25A 2ANVA 1QT7A 2B72A 206LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2XJWA 5E4PA 4H1PA 3CSQA 4ARPA 119LA 2O4WA 2RBPA 1LHHA 1GBYA 4DAJA 2HECA 2W1MA 1B7MA 5KXNA 151LA 3HU8A 2RB0X 224LA 215LA 1LSFA 1D0MA 1OV7A 2Z12A 1L43A 3JR6A 3FE0A 1HC0A 217LA 1L09A 1YILA 3HDFA 5C6LA 1D3NA 1NF5A 1LJIA 1IP5A 1JJ3A 1L33A 1VEDA 4I7NA 2RB1X 4LYZA 1IP2A 5L3IA 2XQOA 3F6ZA 211LA 2I26L 2CDSA 4H8ZA 207LA 1IWWA 5IDDA 225LA 3RT5X 1ZYTA 1CKDA 1P56A 1CX6A 1L17A 4A7DA 4MCKA 3DMXA 2RBSA 5LZMA 1GBSA 4Z41A 1GXXA 4P2EA 1D2WA 1L24A 168LA 2ZNXY 3KAMA 2HUKA 230LA 1G0JA 1OP9B 3M18B 4ARQA 1TCYA 1NHBA 1KY1A 1VDPA 5FHWA 1IR8A 254LA 129LA 1L45A 1GF4A 234LA 2B70A 3P66A 4H9HA 3WPJA 5HNCA 1A4VA 1JTOL 2LYMA 1CU3A 1GD6A 4NHIA 1L44A 4HPIA 5B05A 1L31A 2OU0X 2O79A 5E9RA 4NSHA 4DD9A 2IGCA 108LA 4N1EI 3HTFA 5APFA 2NTHA 1IOCA 176LA 1IWVA 1QUTA 1DYCA 4I7TA 1P2RA 1HERA 3A3RX 3TMWA 1I56A 1C6NA 127LA 3ZEKA 1LMPA 5F14A 1LYOA 1C64A 3DN3A 4WO6A 3M3UA 1G0QA 1OUEA 1REZA 1GF3A 4AGAA 3WPLA 197LA 164LA 4PJZA 229LA 4QDNA 4H90A 3B72A 2B73A 3A6BY 2LC9A 1QIOA 4R0FA 3N9EA 4LZTA 4NWEA 1P2CC 1WVUA 2HEFA 1I20A 4ET8A 3LZTA 1FKQA 1CJ6A 1CUQA 1L95A 4KT3A 1LPIA 2BQLA 1YQVY 138LA 2CJLA 3DN2A 2F2NA 1F6RA 5HLLA 1LZAA 4I7SA 1GFGA 4WM3A 1UIBA 248LA 1B7LA 3RZ4A 1L83A 1LYFA 2MEDA 1T8FA 5T3FA 4GN5C 5F9XA 4NEBA 185LA 4DT3A 4I7KA 1HFYA 1P3NA 4IASA 1G0LA 1L94A 1L58A 1LPYA 1HEWA 3W3EA 2OE4X 3FI5A 1LJGA 231LA 1C6IA 2YBJA 3HBEX 4YXAC 4I7QA 4EKPA 2L78A 4WMGA 182LA 4MR1A 5LVHA 4LT2A 4Z3MA 1FLUA 1L00A 1UIEA 1GFTA 1NMMA 3SP3A 3B6LA 169LA 1LZSA 1UIAA 1L84A 2BQOA 2B5ZA 1QT6A 2LCBA 4K5YA 156LA 1CV6A 2FYDA 3CDRA 3GULA 4HV2A 1L76A 4Z46A 1OVJA 1L03A 1VFBC 3LYZA 2DBTA 3LYMA 3CDOA 1LYHA 4E3UA 4X3BA 1FDLY 1CX7A 1BVXA 1QTVA 2ZQ4A 4OWCA 4WLXA 1GDXA 1GBWA 1L13A 4WLDA 4IAPA 4LFXA 1IWZA 1SWZA 1L57A 132LA 1L60A 1LYGA 2O7AA 4B49A 112LA 1LZ1A 1FKVA 1T97A 1GF7A 4LT0A 1KY0A 5FSTA 4DD3A 3A6CY 1GBOA 4TWSA 4DYGA 1OWYA 3A34A 3LHMA 1UICA 4EMNA 1TDYA 1B7RA 2I25L 3NY8A 1YKXX 209LA 2YSSC 4GCEA 2BQBA 1G0GA 4DD1A 1QSQA 4YEMA 1FLWA 5KXTA 2LZMA 5DN4A 1SX7A 4LYBA 175LA 174LA 4DDBA 3DN0A 2DQCY 4ZEEA 5I4YA 1D2YA 4I7OA 4ZPUA 1C6KA 1OVKA 1IOTA 3B0IA 184LA 5HMVA 1T6HA 4B4EA 4HTQA 4PHIA 1C08C 4CJ2A 4G9SA 1KW7A 4YM8A 1LJNA 1IWUA 150LA 1IP7A 1OVHA 1NBYC 3SB7A 4BADA 1D3MA 5LVKA 4H9EA 3FI7A 4YENA 1G0MA 1GF0A 2ZILA 5I54A 1XJTA 5DL9A 4OO9A 1L42A 1BB5A 1L54A 246LA 2YBHA 2HEAA 1HENA 5C6JA 166LA 1OV5A 3WXUA 3HT6A 3C7WA 5F81A 1LMAA 1CJ7A 221LA 1LSAA 4H9FA 2FBBA 3WW6A 4H9IA 2RB2X 3AB6A 190LA 2BQKA 2Q9DA 1D0LA 1OUIA 1L15A 4ARMA 1UIDA 161LA 2EKSC 3WL2A 4LT1A 2YBIA 3GUPA 259LA 4ML7A 4YEOA 1DZBX 2YVBA 1JTMA 4RLNA 3ODUA 109LA 1PQIA 4YXCA 1OQMA 4XN6A 1QTEA 3VWOA 1IP1A 1CV0A 5DLAA 120LA 3WXTA 5LVIA 4LDLA 2RBNA 1QTKA 1D6QA 1IC5Y 2MEBA 218LA 1GB5A 2D6BA 1LMCA 1L73A 3HH6A 4PPOA 1OYUA 1RI8B 1QUHA 1YL1X 1QT7A 1DXJA 1IP3A 3AZ5A 5D5FA 3AGGG 1DPXA 4M6DA 1OWZA 2D4IA 4B4JA 1C6MA 5B06A 4WM5A 1UCOA 1LZYA 1PS5A 1C6CA 252LA 2BQNA 2RH1A 1GDWA 3C82A 1IR9A 3W6AA 2RAZX 154LA 4LYCA 3WUMA 2D4KA 4OWHA 1UBZA 4DD0A 2ZQ3A 1DYEA 1B5WA 1REXA 3V2YA 4ET9A 4NHPA 1IVMA 171LA 1UIHA 1JTPL 2Y8PA 3HTBA 5LAGA 2BQIA 2F4GA 1ZURA 1L36A 1IORA 4AQNA 1JQUA 3QNGA 6LYZA 1GFAA 2OE7X 4NSJA 1LSMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2XJW A;  5E4P A;  4H1P A;  3CSQ A;  4ARP A;  119L A;  2O4W A;  2RBP A;  1LHH A;  1GBY A;  4DAJ A;  2HEC A;  2W1M A;  1B7M A;  5KXN A;  151L A;  3HU8 A;  2RB0 X;  224L A;  215L A;  1LSF A;  1D0M A;  1OV7 A;  2Z12 A;  1L43 A;  3JR6 A;  3FE0 A;  1HC0 A;  217L A;  1L09 A;  1YIL A;  3HDF A;  5C6L A;  1D3N A;  1NF5 A;  1LJI A;  1IP5 A;  1JJ3 A;  1L33 A;  1VED A;  4I7N A;  2RB1 X;  4LYZ A;  1IP2 A;  5L3I A;  2XQO A;  3F6Z A;  211L A;  2I26 L;  2CDS A;  4H8Z A;  207L A;  1IWW A;  5IDD A;  225L A;  3RT5 X;  1ZYT A;  1CKD A;  1P56 A;  1CX6 A;  1L17 A;  4A7D A;  4MCK A;  3DMX A;  2RBS A;  5LZM A;  1GBS A;  4Z41 A;  1GXX A;  4P2E A;  1D2W A;  1L24 A;  168L A;  2ZNX Y;  3KAM A;  2HUK A;  230L A;  1G0J A;  1OP9 B;  3M18 B;  4ARQ A;  1TCY A;  1NHB A;  1KY1 A;  1VDP A;  5FHW A;  1IR8 A;  254L A;  129L A;  1L45 A;  1GF4 A;  234L A;  2B70 A;  3P66 A;  4H9H A;  3WPJ A;  5HNC A;  1A4V A;  1JTO L;  2LYM A;  1CU3 A;  1GD6 A;  4NHI A;  1L44 A;  4HPI A;  5B05 A;  1L31 A;  2OU0 X;  2O79 A;  5E9R A;  4NSH A;  4DD9 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
 2XJW A;  5E4P A;  4H1P A;  3CSQ A;  4ARP A;  119L A;  2O4W A;  2RBP A;  1LHH A;  1GBY A;  4DAJ A;  2HEC A;  2W1M A;  1B7M A;  5KXN A;  151L A;  3HU8 A;  2RB0 X;  224L A;  215L A;  1LSF A;  1D0M A;  1OV7 A;  2Z12 A;  1L43 A;  3JR6 A;  3FE0 A;  1HC0 A;  217L A;  1L09 A;  1YIL A;  3HDF A;  5C6L A;  1D3N A;  1NF5 A;  1LJI A;  1IP5 A;  1JJ3 A;  1L33 A;  1VED A;  4I7N A;  2RB1 X;  4LYZ A;  1IP2 A;  5L3I A;  2XQO A;  3F6Z A;  211L A;  2I26 L;  2CDS A;  4H8Z A;  207L A;  1IWW A;  5IDD A;  225L A;  3RT5 X;  1ZYT A;  1CKD A;  1P56 A;  1CX6 A;  1L17 A;  4A7D A;  4MCK A;  3DMX A;  2RBS A;  5LZM A;  1GBS A;  4Z41 A;  1GXX A;  4P2E A;  1D2W A;  1L24 A;  168L A;  2ZNX Y;  3KAM A;  2HUK A;  230L A;  1G0J A;  1OP9 B;  3M18 B;  4ARQ A;  1TCY A;  1NHB A;  1KY1 A;  1VDP A;  5FHW A;  1IR8 A;  254L A;  129L A;  1L45 A;  1GF4 A;  234L A;  2B70 A;  3P66 A;  4H9H A;  3WPJ A;  5HNC A;  1A4V A;  1JTO L;  2LYM A;  1CU3 A;  1GD6 A;  4NHI A;  1L44 A;  4HPI A;  5B05 A;  1L31 A;  2OU0 X;  2O79 A;  5E9R A;  4NSH A;  4DD9 A; 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