4LGKA

X-ray structure of the adduct between hen egg white lysozyme and au2phen, a dinuclear gold(iii) complex with -dioxo bridges linking the two metal centers
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title The mode of action of anticancer gold-based drugs: a structural perspective.
pubmed doi rcsb
total genus 43
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-06-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4lgkA00
4DDAA 5HQ1A 5F9XA 5LAFA 3RZ4A 1B7QA 1JTPL 2CDSA 2CWIA 4CFOA 3AZ7A 4TUNA 3ZVQB 3WPLA 1UCOA 5KXKA 1WQNA 1YL1X 1YAPA 1LMOA 2XBRA 7LYZA 4H8YA 3WU7A 4OWEA 1LJGA 1B7LA 2Z19A 3AW6A 3TXKA 1BB6A 1GE4A 1A2YC 1LOZA 1Z55A 5FSTA 1IWWA 2DQDY 1GFUA 3IWRA 1NMMA 1DKKA 1HFXA 2BQLA 1F6RA 4NGOA 4X3BA 4PJ2C 4C5FA 1JSFA 1DI4A 4H9FA 4TX7A 1B0DA 1HFYA 2MEEA 1I1ZA 1KXWA 4G4BA 3A91A 4HPIA 1LCNA 1XEKA 2D4IA 2Z2EA 3N9EA 4I0CA 2GV0A 1YAQA 5HNLA 3WUAA 4CHXA 5IDDA 2LZTA 1QSAA 1LHJA 4ZFPA 1W08A 2MEHA 2ZQ3A 2BQEA 3D3DA 3N9AA 1FN5A 1LHKA 4DD7A 1LZ4A 4WL7A 1GB8A 1GF0A 1WTNA 4NY5A 2LYOA 1GXXA 4XJBA 5APDA 2Y8PA 1OUHA 4DD3A 1LJFA 4DD2A 3LZTA 5M1YA 2BQBA 1D0LA 2HECA 1IOTA 1IC7Y 1PZYA 3G3BB 4NSHA 3W6BA 2I25L 1IVMA 4R0FA 1QTEA 3A6BY 5DM9A 1JKAA 1UIBA 3VWOA 5FELA 4RW2A 4CGEA 1JITA 4WM5A 1V7SA 1LMTA 2D91A 1BGIA 1IP7A 4H9BA 4TTDA 4HTQA 5LAGA 5B07A 2XJWA 4YOPA 1OUDA 1SLYA 1XGQC 2ZYPA 5LVJA 1A4VA 4MR1A 1GXV2 5B59A 1QDTA 2BAAA 3EXDA 3CT1A 1HNLA 3LYOA 4D9ZA 4WOAA 4GN3A 1GBYA 1OQMA 3EMSA 3TXHA 3W3EA 3W6CA 5LVHA 3K3TA 1LYOA 1QQYA 3TMXA 4B0DA 1LSBA 3FE0A 4ET9A 1B5ZA 1LJNA 1JJ3A 5KXSA 5HMJA 1WTMA 5KXXA 2MEFA 1GB7A 1JKDA 1F0WA 2FYCA 3MGWA 1GB5A 1LMCA 3CT0A 5C6JA 4NG1A 4H90A 1XEJA 3W6EA 2MEBA 5J7CA 1SQ2L 1YL0X 1IP6A 3WU9A 1GB3A 207LA 1IO5A 1GPQC 4H91A 4QEQA 3LYMA 3A3RX 3A8ZA 2YVBA 2BQHA 1H6MA 1OUCA 4WO9A 4AGAA 3P65A 3WUMA 1FLUA 1REYA 4HJVA 4LYTA 1TAYA 4NSIA 1LJIA 1VFBC 4GCDA 1JKCA 4H8XA 5A3EA 1AM7A 1LSAA 1HHLA 5LYZA 1LKRA 1B5UA 1HEOA 5E4PA 4H9HA 2HEBA 3WW5A 4PPOA 5HLLA 3A67Y 5LYMA 1H87A 1KIRC 1IP3A 1LSEA 2D6BA 1AZFA 5ILCA 4WLDA 1UIEA 2XBSA 1QUTA 1VATA 4XENA 5KXOA 1NDGC 2H5ZA 2EQLA 4I8SA 1C45A 1YANA 4EOFA 2YBNA 4YEMA 1IP4A 4Z3MA 1GAZA 2MEDA 1GEVA 3TXEA 1B7RA 3WPJA 1LPIA 5K7OA 4H9EA 3T36A 5F81A 3WPKA 1WQPA 1RE2A 4HTKA 3A92A 5EBHA 1HENA 3KAMA 1XSFA 4NHSA 4DWXA 4MSTA 1BB7A 1NDMC 2HUBA 3N9CA 1AT5A 4XN6A 1WQMA 2BQOA 5KJ9A 4G4HA 5APCA 4NGWA 4YM8A 5KXLA 2N5ZA 1GBWA 4O34A 2Z37A 3RU5A 1IWTA 4WM6A 4H8ZA 4WMGA 2BQFA 1UIAA 1LJEA 4J0LA 4NHTA 1DXJA 3WVYA 1LZSA 2C8PA 4WL6A 4Z46A 2EPEA 1PS5A 1GD6A 4DD9A 133LA 4NWEA 1JHLA 1I56A 4GN5C 5L3HA 1JISA 1TBYA 3QE8A 1LZ9A 1VDTA 1F6SA 1LYSA 4PHIA 135LA 1NKHA 1HC0A 1KIQC 1LZGA 2H9JA 3TXBA 1TCYA 4LZTA 1XGTC 5I53A 4B4IA 4NEBA 3CT5A 1OUEA 1GB6A 1GB9A 4QDNA 4OW1A 4NGVA 4N1CC 3LN2A 4XJFA 1REXA 6LYTA 5FHWA 1ALCA 3TXDA 1B7SA 4LGKA 4PGJB 4Z41A 1FLWA 2BQKA 1AKIA 3IJVA 2FBBA 3HBEX 5T3FA 2F4GA 1G7LC 3D9AC 1IX0A 1IR9A 4YEOA 2ZNXY 4WM3A 4YENA 1YIKA 4WLTA 4BS7A 4H93A 3A90A 1GFJA 1IC4Y 3AZ5A 3CSRA 5KXWA 1B7PA 1CJ7A 1LZAA 1EQ5A 3AZ6A 5I5QA 1IEEA 1NBZC 1JUGA 1LZEA 1GFEA 3GXRA 4TSCA 4ETAA 1GF9A 1D0MA 1CNSA 1LJKA 3RW8A 1BB3A 4B4EA 2A7FA 4OWHA 5C6IA 5ILFA 4NSJA 1P2CC 2MECA 3OJPA 3GXKA 4H9CA 5DN4A 4LYZA 3CB7A 4H94A 4BAFA 2CJLA 1ZV5L 1GEZA 1JWRA 4BADA 4IJ4A 4H1PA 1IWXA 4Z98A 1GDWA 2YBHA 1XEIA 1JTOL 1ZVHL 3A96A 2LZ2A 2D4KA 1LJHA 5DL9A 1IP2A 4RLMA 1JEFA 1D6PA 2IHLA 3A3QA 2YBJA 2BQNA 4QY9A 4WO6A 1LSDA 2LHMA 1IWUA 2ZILA 1GAYA 4WM1A 1HFZA 4II8A 4OWBA 1KIPC 2Z38A 3WW6A 4NG8A 5I4WA 5II3A 1B2KA 2BQIA 1VAUA 2DQCY 4XYYA 1IP5A 1IC5Y 1HF4A 1GE0A 1LZ6A 1LZNA 4KXIA 4U3XB 3F6ZA 3T6UA 2MEAA 1UIFA 1XGRC 1LMAA 3AGHA 2G4PA 2G4QA 5KXPA 3WYHA 5IELA 2DQAA 1UC0A 5B06A 4N5RA 1HEWA 1TEWA 2DQEY 1GE3A 3CSQA 1ZVYB 4ETBA 1KXXA 3TMVA 1LSCA 1CJ9A 1HSXA 3TXIA 2G4NA 3WUNA 1OUAA 1IWYA 1GWDA 4RLNA 2DQFC 5LA8A 5KXMA 1LJJA 2BQJA 1YROA 1OUGA 1LZDA 1BVXA 2LYZA 4MCKA 1UIGA 1IWZA 5KY1A 1B5XA 4B49A 1C7PA 1C46A 1YILA 2F30A 4NGKA 5KXYA 2YSSC 1REZA 1YAMA 1GB2A 1GE1A 1W6ZA 1IP1A 4M6DA 1LMNA 2HU3A 1LMQA 1GDXA 1WVUA 2BLYA 5AMYA 1GF6A 1B9OA 1BWJA 4GN4A 1B7MA 1G7JC 5DLAA 1HELA 1VDPA 1LHMA 4N8ZA 4PRUA 1LHHA 4HSFA 194LA 4HV1A 1N4FA 1BB4A 4LYMA 5I4XA 1G7MC 1J1XY 1LZ5A 4W96A 2W1XA 5APEA 2HEEA 3ATNA 1LSYA 2DQGY 2WARA 3CQLA 5D5FA 2BLXA 2X0AA 1QTKA 3E3DA 1LJ3A 3TXJA 1FLQA 1NWGA 3EBAB 4J1BA 1LSZA 3FI7A 2W1YA 3LZ2A 1XGUC 2ZNWY 1EQ4A 5D5CA 1GFAA 1WQOA 1UICA 1C43A 1CKFA 1XGPC 4LYOA 4NFVA 4NHIA 4PRQA 4G9SA 3W6FA 4DDCA 3B0KA 3W6DA 4DYGA 1GBSA 8LYZA 4WG7A 1G7IC 1KXYA 4DDBA 4NGIA 1DPWA 1VDSA 1UACY 2DQIY 3G3AB 3P68A 4UWVA 4HJYA 4DD0A 5FCPA 1JTTL 193LA 1GFRA 1OUIA 4FDYA 4GLVA 5DN5A 3WULA 2AUBA 4LYCA 3QY4A 2F2NA 4B1AA 4OWAA 5I54A 1MLCE 1BWIA 3LHMA 4ETEA 4HTNA 1ZMYL 153LA 2F4AA 5A3ZA 1T3PA 4H9IA 1CKHA 2BQDA 3WU8A 3WXUA 1NQIA 2LYMA 5LVKA 1BVKC 1LZYA 3BKVA 3M3UA 5C6LA 5LVGA 1IWVA 1GBZA 1G7HC 4A7DA 4C3WA 2YDGA 1I20A 3B0OA 1BWHA 3HBHA 4HJZA 4TWSA 4WLYA 3ZEKA 5LA5A 4AXTA 2I6ZA 3TMUA 1HMKA 1JPOA 5L9JA 5JENB 1IOQA 1GFHA 4LYBA 2IFFY 1OUJA 4WM4A 1JSEA 1MELL 2BQGA 3AW7A 1B5VA 5APFA 3A93A 1YKYX 2ZQ4A 3EO5A 3HFMY 1GFKA 2DQJY 3BKHA 2YBMA 4NGYA 4ZIXA 3LYTA 3CSZA 1FBIX 4E3UA 1D9UA 4KT3A 1J1OY 1GF3A 3A6CY 1GFTA 2Z18A 1LJ4A 4P2EA 4QGZA 1LZ1A 132LA 4LT0A 1NHEA 1OP9B 154LA 2B5ZA 1J1PY 1LYZA 1C08C 4OOOA 5B05A 2ZIKA 1GFGA 1QDRA 2ZYCA 3A34A 4NGLA 4UWUA 3WVXA 1LZ8A 2CGIA 4N1EI 3WH1A 1LSFA 1NF5A 1YAOA 1QUSA 4LT1A 4XJDA 1V7TA 1BB5A 1GF7A 1CKDA 1IR8A 1WVVA 3WMKA 4ANRA 2H9KA 4XJGA 3ATOA 1LZCA 1B7NA 1BQLY 2DQHY 4UWNA 2HEAA 5KKJA 4EMNA 1GF4A 1LSNA 4XJIA 3B6LA 5FEKA 4GLAA 4CJ2A 2ZWBA 1LKSA 1O23A 1WQQA 2HU1A 4FJRA 1XFPL 2YBIA 4H9AA 5KXZA 1INUA 1EL1A 3LYZA 1LSPA 5B1GA 1CJ8A 4KPMA 1HEMA 1DZBX 208LA 2MEIA 4GCBA 5HNCA 1LHIA 2C8OA 2NWDX 3HBDA 1LZBA 4YF2A 5FDJA 1GHLA 1B7OA 5HMVA 1DQJC 5LVIA 2Z2FA 1TDYA 1UIHA 2EIZC 1D0KA 1GE2A 2HEFA 1FDLY 3RT5X 4ETCA 5KXTA 1HEPA 1WQRA 2HTXA 4DC4A 4NGJA 1UUZC 1DKJA 3AYQA 4N9RA 1JIYA 1FLYA 4GCEA 4HP0A 1UIDA 4LT3A 1IY3A 5F14A 4XADA 3P4ZA 2XTHA 1LMPA 4NHQA 1AT6A 4IATA 5F16A 4DD1A 2Z39A 5I4YA 3P66A 4L41A 4NWHA 1BHZA 1RFPA 1T6VL 4IASA 1B5WA 4DT3A 2Z12A 4CFPA 1OUFA 4J1AA 2W1LA 3AGGG 1HEQA 4HPEA 2BQCA 4J7VA 2W1MA 4WLXA 1LSMA 3B0IA 3AJNA 5KXNA 1LZRA 1CKCA 4NSGA 3J6KA 3TXGA 1LTMA 4ML7A 4WM2A 1YKZX 1YQVY 3A94A 4RDSA 1IIZA 4LFXA 4H92A 4NGZA 5B1FA 4NIJA 1RI8B 5LINA 1EQEA 1GF5A 3WXTA 1IR7A 5IHGA 1JJ0A 1D6QA 4G4CA 4G49A 1E8LA 5LIOA 2RSCA 1QIOA 1GBXA 1HERA 1B5YA 1JKBA 4W94A 3J4GA 4ZEEA 1NBYC 1YKXX 3M18B 4OWCA 4GCFA 3AB6A 2VB1A 1HSWA 1DI3A 3B72A 2PC2A 1VEDA 1LSGA 1FKQA 5LYTA 1HMLA 2BPUA 1REMA 4B4JA 5LXWA 2Q0MX 1DI5A 3IJUA 3W6AA 4XJHA 2HEDA 1LYYA 3SP3A 3TMWA 1UBZA 2YBLA 2BQMA 1F10A 1GF8A 2BQAA 5E9RA 3P64A 3ZVQA 5KXRA 4BAPA 4ET8A 1FKVA 2DBTA 1VDQA 5F9UA 1IORA 1CKGA 4R6CA 3WL2A 1UA6Y 1OUBA 1CJ6A 2FBDA 4RW1A 1RJCB 134LA 4N0JA 4HV2A 4TSBA 5L3IA 2D4JA 3AZ4A 6LYZA 2A7DA 4WG1A 3QNGA 2FYDA 1LHLA 2I26L 1JJ1A 2ZIJA 4NHPA 1C10A 3TXFA 2MEGA 4LT2A 2DKVA 3A95A 3RNXA 1GFVA 9LYZA 1QSWA 2EKSC 1DPXA 1GBOA 4GCCA 4ETDA 1RCMA 1IY4A 4KL7A 3ULRA 3OK0A 1IOSA 1LZTA 4M4OA 4OOTA 1LAAA 3AGIA 5KKIA 4LFPA 1GB0A 1IOCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DDAA 3RZ4A 3AZ7A 4TUNA 3ZVQB 140LA 1UCOA 1C6MA 1YAPA 1B7LA 2B6ZA 2Z19A 1CV0A 2QB0B 129LA 1LOZA 1Z55A 1NMMA 1DKKA 1F6RA 4NGOA 212LA 4YXAC 2B7XA 4GBRB 1LCNA 4I0CA 4CHXA 3HTFA 2LZTA 1OVJA 1L65A 4EPIA 1GXXA 2Y8PA 1OUHA 4DD3A 4DD2A 2BQBA 1D0LA 2HECA 1QTDA 3G3BB 4NSHA 4DQJA 2D91A 1IP7A 1OUDA 1OVKA 5LVJA 1L70A 1GXV2 3NY8A 3NY9A 1HNLA 3LYOA 4WOAA 3TXHA 1PQOA 185LA 5KXSA 1WTMA 2FYCA 1LMCA 1L87A 3CT0A 4ARMB 242LA 1C6KA 2B6WA 1SQ2L 3WU9A 1L40A 3VW7A 1GPQC 198LA 3LYMA 120LA 4ARJA 2BQHA 1H6MA 1OUCA 4WO9A 1L76A 4GCDA 1LSAA 3QAKA 5HLLA 5LYMA 237LA 1LSEA 5ILCA 1C62A 1L07A 2H5ZA 3TXEA 1B7RA 196LA 1LPIA 3T36A 1SSWA 3C7ZA 2O4WA 3HDEA 219LA 4DWXA 2HUBA 1WQMA 6LZMA 4YM8A 155LA 1GBWA 4O34A 1IWTA 137LA 4H8ZA 4WMGA 112LA 1DXJA 3GUKA 3FI5A 133LA 5L3HA 1EPYA 230LA 1ZURA 1P56A 2RBSA 1TCYA 4LZTA 1XGTC 1GB6A 4DKLA 2LC9A 4NGVA 1L12A 192LA 3LN2A 1XJTA 3TXDA 1B7SA 4LGKA 1CUQA 3IJVA 1L79A 3D9AC 1LI2A 1L33A 213LA 1L86A 3A90A 1GFJA 1IC4Y 3AZ5A 1EQ5A 3AZ6A 1G1WA 187LA 1C64A 1LJKA 4DQ7A 1BB3A 119LA 4OWHA 5ILFA 3OJPA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4DDA A;  5HQ1 A;  5F9X A;  5LAF A;  3RZ4 A;  1B7Q A;  1JTP L;  2CDS A;  2CWI A;  4CFO A;  3AZ7 A;  4TUN A;  3ZVQ B;  3WPL A;  1UCO A;  5KXK A;  1WQN A;  1YL1 X;  1YAP A;  1LMO A;  2XBR A;  7LYZ A;  4H8Y A;  3WU7 A;  4OWE A;  1LJG A;  1B7L A;  2Z19 A;  3AW6 A;  3TXK A;  1BB6 A;  1GE4 A;  1A2Y C;  1LOZ A;  1Z55 A;  5FST A;  1IWW A;  2DQD Y;  1GFU A;  3IWR A;  1NMM A;  1DKK A;  1HFX A;  2BQL A;  1F6R A;  4NGO A;  4X3B A;  4PJ2 C;  4C5F A;  1JSF A;  1DI4 A;  4H9F A;  4TX7 A;  1B0D A;  1HFY A;  2MEE A;  1I1Z A;  1KXW A;  4G4B A;  3A91 A;  4HPI A;  1LCN A;  1XEK A;  2D4I A;  2Z2E A;  3N9E A;  4I0C A;  2GV0 A;  1YAQ A;  5HNL A;  3WUA A;  4CHX A;  5IDD A;  2LZT A;  1QSA A;  1LHJ A;  4ZFP A;  1W08 A;  2MEH A;  2ZQ3 A;  2BQE A;  3D3D A;  3N9A A;  1FN5 A;  1LHK A;  4DD7 A;  1LZ4 A;  4WL7 A;  1GB8 A;  1GF0 A;  1WTN A;  4NY5 A;  2LYO A;  1GXX A;  4XJB A;  5APD A;  2Y8P A;  1OUH A;  4DD3 A;  1LJF A;  4DD2 A;  3LZT A;  5M1Y A;  2BQB A;  1D0L A;  2HEC A;  1IOT A;  1IC7 Y;  1PZY A;  3G3B B;  4NSH A;  3W6B A; 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 2W1M A;  4WLX A;  1LSM A;  3B0I A;  3AJN A;  5KXN A;  1LZR A;  1CKC A;  4NSG A;  3J6K A;  3TXG A;  1LTM A;  4ML7 A;  4WM2 A;  1YKZ X;  1YQV Y;  3A94 A;  4RDS A;  1IIZ A;  4LFX A;  4H92 A;  4NGZ A;  5B1F A;  4NIJ A;  1RI8 B;  5LIN A;  1EQE A;  1GF5 A;  3WXT A;  1IR7 A;  5IHG A;  1JJ0 A;  1D6Q A;  4G4C A;  4G49 A;  1E8L A;  5LIO A;  2RSC A;  1QIO A;  1GBX A;  1HER A;  1B5Y A;  1JKB A;  4W94 A;  3J4G A;  4ZEE A;  1NBY C;  1YKX X;  3M18 B;  4OWC A;  4GCF A;  3AB6 A;  2VB1 A;  1HSW A;  1DI3 A;  3B72 A;  2PC2 A;  1VED A;  1LSG A;  1FKQ A;  5LYT A;  1HML A;  2BPU A;  1REM A;  4B4J A;  5LXW A;  2Q0M X;  1DI5 A;  3IJU A;  3W6A A;  4XJH A;  2HED A;  1LYY A;  3SP3 A;  3TMW A;  1UBZ A;  2YBL A;  2BQM A;  1F10 A;  1GF8 A;  2BQA A;  5E9R A;  3P64 A;  3ZVQ A;  5KXR A;  4BAP A;  4ET8 A;  1FKV A;  2DBT A;  1VDQ A;  5F9U A;  1IOR A;  1CKG A;  4R6C A;  3WL2 A;  1UA6 Y;  1OUB A;  1CJ6 A;  2FBD A;  4RW1 A;  1RJC B;  134L A;  4N0J A;  4HV2 A;  4TSB A;  5L3I A;  2D4J A;  3AZ4 A;  6LYZ A;  2A7D A;  4WG1 A;  3QNG A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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