180LA

Protein flexibility and adaptability seen in 25 crystal forms of t4 lysozyme
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYEIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Complex (hydrolase/cell wall)
molecule keywords LYSOZYME
publication title Protein flexibility and adaptability seen in 25 crystal forms of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1995-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 180lA00
2O4WA 1G07A 2RBQA 1G0KA 1LI6A 233LA 1L41A 4W58A 1JTMA 2RAZX 1C6JA 3NY9A 165LA 2OE9X 3SB9A 151LA 1CUQA 118LA 3FA0A 1LWGA 242LA 1QTHA 1L93A 1C62A 3DMVA 148LE 1L16A 1SWYA 1C6NA 3DN1A 115LA 1L84A 3C8QA 241LA 4GRVA 1C60A 147LA 140LA 1G1WA 1L57A 2RBPA 5I14A 192LA 1L26A 4DKLA 1L48A 2F32A 1LYGA 231LA 1DYFA 178LA 1L08A 4W54A 2RB0X 1DYEA 1L92A 168LA 4ARJA 3DKEX 1CTWA 3C8RA 1L40A 246LA 172LA 1C63A 146LA 239LA 1QT5A 4I7OA 235LA 1T8AA 3FADA 3GUPA 2OTZX 1L15A 1D9WA 216LA 1QUGA 1C69A 2RBSA 3CDVA 189LA 1LYHA 1QSBA 3ODUA 1L99A 1QTVA 221LA 2HUKA 1PQMA 3HDEA 4YXAC 4W56A 155LA 1L60A 2HUMA 4GBRB 1PQIA 3SB7A 1L06A 1K28A 1C6EA 1L09A 2RBOA 3NYAA 188LA 240LA 164LA 1ZURA 1L94A 1P7SA 1CX7A 3G3WA 220LA 1CV6A 1L90A 228LA 1L76A 114LA 4W53A 185LA 1L0JA 1L91A 3C7WA 1KW7A 4EJ4A 3OE0A 1DYCA 1PQKA 4W59A 4ARQB 4I7JA 211LA 1L45A 227LA 3FI5A 1PQOA 2ANXA 1OWYA 1QTCA 1L47A 1OVHA 3V2YA 174LA 3G3VA 1OV5A 1SWZA 1G0JA 4W51A 2QB0B 199LA 111LA 1L64A 1LYFA 4ARQA 1L18A 4DAJA 1L98A 1KY1A 2OTYX 176LA 3JR6A 1L71A 215LA 1QUDA 234LA 1OWZA 249LA 3CDOA 1QTBA 257LA 1KS3A 4I7QA 195LA 1L43A 2RBNA 3PBLA 1LPYA 3HWLA 1L05A 3CDQA 1CU0A 3DMXA 1WTHA 3HT8A 1L11A 1XEPA 122LA 2LZMA 1C6DA 1LYJA 4K5YA 1C6IA 1L19A 1OV7A 108LA 131LA 119LA 3DNAA 198LA 1P37A 3C81A 3QAKA 225LA 2RH1A 4W57A 1PQJA 142LA 210LA 4W55A 1LI3A 110LA 2B73A 3G3XA 1L69A 4YXCA 150LA 4YX7C 3CDRA 212LA 1ZWNA 1L62A 1L66A 205LA 2QARC 1L13A 1L81A 3HTDA 1L67A 1L86A 2RAYX 213LA 1LLHA 2LC9A 1C6GA 3HT7A 2B6ZA 1L31A 2OE4X 1G06A 1L22A 1LWKA 1L37A 206LA 1P36A 2OEAX 4ARMA 4ARPA 3SB8A 3GUNA 4E97A 1P6YA 3HU9A 1P3NA 1L00A 181LA 1C61A 1CX6A 4I7MA 244LA 1P5CA 3DN2A 6LZMA 1L14A 130LA 1C64A 4W52A 1DYGA 1L53A 5LZMA 217LA 2OE7X 1CU2A 3UONA 1L25A 1L23A 1LGUA 3VW7A 3SN6R 1D3MA 4S0WA 1L77A 255LA 1L97A 1LGXA 3C8SA 1EPYA 238LA 163LA 247LA 1CV0A 1C6MA 1L33A 1P46A 2B6YA 1CV4A 3F8VA 3C82A 3HUAA 1L95A 259LA 3HUQA 190LA 2B72A 1XJTA 1C6FA 1C6CA 1L79A 253LA 4AQNA 2IGCA 4I7KA 1CV1A 1QT4A 128LA 1C65A 186LA 2O79A 4I7RA 3OE6A 182LA 162LA 175LA 129LA 1L68A 127LA 1G0PA 1L88A 1L96A 1OYUA 3C7ZA 2RBRA 261LA 1CU3A 3F9LA 1LYIA 237LA 1B6IA 1P56A 1CV3A 152LA 1CU5A 1QT7A 2OU0X 3GUIA 3LZMA 1G0MA 2OU8A 141LA 1D3JA 107LA 1L32A 1L39A 245LA 1OVKA 3D4SA 3GULA 1OVJA 1L55A 1CV5A 4I7SA 256LA 252LA 1DYDA 3OE9A 1L36A 1L89A 224LA 2NTGA 1L38A 177LA 1C67A 1L20A 1L17A 1L82A 3HTBA 3OE8A 3HH6A 1L10A 126LA 2F47A 1D2YA 1L59A 1LI2A 1PQDA 1L50A 103LA 4PK0A 1L12A 2A4TA 1L28A 3EMLA 1QTDA 3DMZA 125LA 184LA 1JTNA 1L35A 1LYDA 251LA 4EPFA 1G0GA 2B6TA 2LCBA 3C7YA 1D3FA 4LZMA 1P2RA 4PJZA 3GUKA 4ARMB 236LA 2NTHA 260LA 1L34A 1G0LA 3HH3A 226LA 1L80A 1KW5A 1NHBA 1C6QA 3NY8A 4I7PA 4ZPUA 157LA 104LA 1L61A 1QS9A 196LA 1L02A 169LA 1L21A 4EKSA 2Z6BA 160LA 1L83A 2O7AA 1DYAA 3SBBC 1L74A 1CUPA 113LA 229LA 1T97A 3L2XA 4LDLA 1T6HA 2OU9A 243LA 1C6LA 248LA 167LA 3SB6A 1I6SA 4EPIA 1G0QA 3HUKA 1KY0A 222LA 156LA 1P2LA 4DJHA 138LA 3RUNA 4EKRA 1D2WA 1LW9A 1QS5A 1CU6A 1QSQA 1LGWA 1TLAA 1L54A 3GUOA 2B6WA 1G1VA 2Q9DA 3DN8A 3HT9A 3C80A 1L30A 3RZEA 1L65A 1QT3A 137LA 1L07A 230LA 1C6KA 1L85A 197LA 1L70A 2B70A 183LA 1C6PA 171LA 1QT6A 1T8FA 3L64A 1L29A 1L03A 1SSWA 232LA 1C66A 3HH5A 1C6BA 1C6TA 1L73A 1SX2A 1LYEA 1L49A 1QT8A 262LA 1XJUA 2B6XA 218LA 1L58A 1P64A 200LA 3DN6A 201LA 3HTFA 1L46A 1L87A 166LA 1L44A 1D3NA 1L24A 139LA 3K2RA 158LA 3CDTA 4ARLA 3HU8A 3HTGA 4IAPA 173LA 3HT6A 1L04A 1L42A 120LA 1L72A 4EXMA 112LA 4I7LA 4I7TA 1L75A 3HH4A 1L63A 4EKQA 3SB5A 2Q9EA 1L0KA 1L56A 4I7NA 1L01A 214LA 2F2QA 3V2WA 149LA 1ZYTA 4LDEA 7LZMA 1L27A 1QTZA 180LA 102LA 2L78A 144LA 4LDOA 2HULA 1SX7A 145LA 3SBAA 1SSYA 3GUJA 1C68A 3DN3A 123LA 2ANVA 1QUOA 258LA 1DYBA 143LA 2B75A 3C83A 191LA 159LA 250LA 1T8GA 254LA 4EKPA 187LA 2RB1X 1CVKA 109LA 3HDFA 1L51A 1QUHA 2B7XA 2CUUA 1C6AA 1JQUA 223LA 3DN4A 219LA 209LA 2RB2X 1C6HA 2B74A 3PDSA 3GUMA 1L52A 3DN0A 1KNIA 4OO9A 161LA 170LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2O4WA 2DQCY 1LZ4A 1LZ5A 1LI6A 4D9ZA 5C6LA 8LYZA 1IP3A 2RAZX 1C6JA 3SB9A 4LFPA 1FN5A 3ZVQA 3TXJA 3TXGA 1VFBC 4NG1A 1LWGA 1L93A 4UWUA 1L16A 3DN1A 1L84A 3C8QA 4GRVA 6LYTA 2VB1A 147LA 140LA 5I14A 1L26A 2F32A 3TXIA 1BB4A 4LGKA 4N5RA 1GF6A 178LA 2RB0X 1QIOA 1VATA 5IELA 4J1AA 168LA 4ARJA 3WPKA 4KL7A 3TMVA 1D9UA 235LA 3AW7A 2BQGA 2YBLA 2OTZX 5DLAA 3IJUA 4ANRA 1D9WA 216LA 1LJNA 1LSCA 1QUGA 1JSFA 2RBSA 2BQBA 3WMKA 1QSBA 1QTVA 221LA 1GFRA 2HUKA 5E9RA 2F4GA 4H9AA 1JIYA 1GB9A 4W56A 2YBHA 1VDQA 1L06A 1GHLA 4WM3A 4LYTA 3W6CA 2ZWBA 1GB5A 4X3BA 1C43A 1CX7A 1UCOA 2XJWA 5LVJA 228LA 1L76A 1GBSA 3A8ZA 3B0KA 3C7WA 2FYDA 1B5XA 3OE0A 4C3WA 1OUIA 4MR1A 2BLYA 2FYCA 1N4FA 4XJHA 1D6PA 1OVHA 3V2YA 5KJ9A 174LA 1LSDA 2QB0B 4DDBA 4WG1A 1L98A 234LA 1OWZA 3CDOA 2G4PA 5IDDA 4DC4A 1QDTA 3HWLA 1L05A 5LIOA 4CJ2A 1CU0A 1WTMA 4NSIA 1OP9B 3HT8A 1L11A 2LZTA 1LYJA 1C6IA 1L19A 1OV7A 1DPXA 5APFA 5F14A 225LA 2DQEY 1LJFA 142LA 210LA 3G3XA 110LA 1IWTA 1LHKA 2BQIA 5ILFA 205LA 3A6CY 5JENB 213LA 3ULRA 2Z39A 5KXMA 4HJZA 1LJGA 4IJ4A 1P36A 2OEAX 4B0DA 5M1YA 4ARPA 3GUNA 1C10A 3FE0A 4LYCA 1C61A 1UIFA 1GE0A 1LJ4A 1P5CA 6LZMA 3EXDA 4W52A 1GPQC 4HV1A 2DQJY 5L9JA 1L23A 4GN4A 2YBNA 4NGKA 1D3MA 1B5WA 3W6AA 3WVYA 1L97A 4W96A 1INUA 1EPYA 1J1OY 1YILA 1CV0A 1UIGA 1C6MA 2B6YA 1CV4A 4NGYA 5LYZA 2CWIA 3HUAA 4HSFA 1L95A 4DDCA 1GFGA 1L79A 1B7NA 4ETAA 1QT4A 3OE6A 182LA 1LJIA 3AW6A 2ZQ3A 1G0PA 4NHTA 3LYOA 4YOPA 5J7CA 1CU3A 3BKVA 1LAAA 5KXXA 152LA 2ZIKA 1QT7A 1GB8A 4R6CA 5I4YA 2OU8A 1HSXA 4WM2A 1LMAA 3GULA 256LA 1GE4A 4UWNA 3K3TA 1DYDA 3SP3A 177LA 1RJCB 1L20A 1BWIA 1L17A 1CKFA 4H9FA 2LYZA 2F47A 1GBYA 1UUZC 3TXBA 4OWHA 5D5CA 1L28A 1QTDA 3DMZA 184LA 251LA 1OUDA 2ZNXY 3P68A 4WLDA 3A67Y 1D3FA 4GCEA 3N9EA 4NG8A 3QE8A 1LPIA 1B7LA 1GFTA 9LYZA 4DD2A 3HH3A 226LA 3NY8A 4WOAA 4ZPUA 1L61A 1NQIA 5HMJA 2DQDY 2DQAA 1L83A 2O7AA 4ETBA 4LT1A 113LA 167LA 2LYMA 1LSGA 1GFUA 4ZEEA 1VDPA 138LA 6LYZA 3T6UA 1CU6A 1LGWA 1TLAA 4G49A 1DI3A 5L3HA 3KAMA 3WPLA 2Q9DA 154LA 3DN8A 2H9JA 1YKYX 3WUNA 3HT9A 1L30A 1REMA 230LA 2YDGA 4PJ2C 1PZYA 1HFXA 1L29A 1HMLA 3HH5A 3ATOA 1GEZA 1SQ2L 2BPUA 4CGEA 3CT5A 2Z19A 3A90A 1LZYA 1QSWA 262LA 1CKCA 4DD9A 1LHHA 3DN6A 5B07A 201LA 1MELL 1D3NA 3K2RA 158LA 1G7LC 1I56A 1LKSA 3D3DA 1XEJA 3B72A 173LA 4NGJA 1L42A 4RLMA 4EXMA 4I7TA 2XBSA 1IWZA 2BQFA 1IOTA 214LA 4BADA 3V2WA 149LA 1LHMA 1ZYTA 1BWHA 1QTZA 3AZ4A 5DM9A 4ETEA 1GFVA 4HPIA 2Z12A 2G4NA 3ATNA 1SX7A 4CFPA 1ALCA 3DN3A 4OOTA 2ANVA 1QUOA 258LA 3AZ6A 1T8GA 5HQ1A 254LA 4EKPA 187LA 3LYTA 4HJVA 1AKIA 4TUNA 1GF5A 2N5ZA 1KIQC 1L51A 4PGJB 1JQUA 1JKCA 3VWOA 4HJYA 4G4CA 2RB2X 2B74A 5EBHA 3M3UA 3BKHA 4OO9A 1B5YA 1I20A 1JTMA 2EPEA 2HU3A 1HNLA 4RLNA 118LA 1LSZA 4XN6A 3G3BB 3WH1A 1TBYA 1J1XY 4WM6A 1UIHA 1C62A 1C6NA 1BVXA 2BQKA 1HMKA 241LA 4Z98A 1GB6A 1C60A 4II8A 1L57A 2RBPA 4R0FA 192LA 1G7JC 4DKLA 1L48A 231LA 4DQ5A 1AZFA 1L08A 2DQFC 1DYEA 1GBZA 1JISA 3DKEX 4H9CA 3C8RA 5I4WA 172LA 1C63A 4NGIA 239LA 5LVGA 2LHMA 3GUPA 1C69A 4TWSA 3CSRA 1L99A 2BQEA 3HDEA 4YXAC 4DWXA 3M18B 5KXKA 155LA 4Z41A 2HUMA 4GBRB 1RI8B 1PQIA 3SB7A 1XFPL 1LSMA 1L09A 4G4BA 1QDRA 240LA 4LT0A 2DKVA 3AZ5A 4XENA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2O4W A;  2DQC Y;  1LZ4 A;  1LZ5 A;  1LI6 A;  4D9Z A;  5C6L A;  8LYZ A;  1IP3 A;  2RAZ X;  1C6J A;  3SB9 A;  4LFP A;  1FN5 A;  3ZVQ A;  3TXJ A;  3TXG A;  1VFB C;  4NG1 A;  1LWG A;  1L93 A;  4UWU A;  1L16 A;  3DN1 A;  1L84 A;  3C8Q A;  4GRV A;  6LYT A;  2VB1 A;  147L A;  140L A;  5I14 A;  1L26 A;  2F32 A;  3TXI A;  1BB4 A;  4LGK A;  4N5R A;  1GF6 A;  178L A;  2RB0 X;  1QIO A;  1VAT A;  5IEL A;  4J1A A;  168L A;  4ARJ A;  3WPK A;  4KL7 A;  3TMV A;  1D9U A;  235L A;  3AW7 A;  2BQG A;  2YBL A;  2OTZ X;  5DLA A;  3IJU A;  4ANR A;  1D9W A;  216L A;  1LJN A;  1LSC A;  1QUG A;  1JSF A;  2RBS A;  2BQB A;  3WMK A;  1QSB A;  1QTV A;  221L A;  1GFR A;  2HUK A;  5E9R A;  2F4G A;  4H9A A;  1JIY A;  1GB9 A;  4W56 A;  2YBH A;  1VDQ A;  1L06 A;  1GHL A;  4WM3 A;  4LYT A;  3W6C A;  2ZWB A;  1GB5 A;  4X3B A;  1C43 A;  1CX7 A;  1UCO A;  2XJW A;  5LVJ A;  228L A;  1L76 A;  1GBS A;  3A8Z A;  3B0K A;  3C7W A;  2FYD A;  1B5X A;  3OE0 A;  4C3W A;  1OUI A;  4MR1 A;  2BLY A;  2FYC A;  1N4F A;  4XJH A;  1D6P A;  1OVH A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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