3LZTA

Refinement of triclinic lysozyme at atomic resolution
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords LYSOZYME
publication title Refinement of triclinic hen egg-white lysozyme at atomic resolution.
pubmed doi rcsb
total genus 52
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1997-03-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3lztA00
1GFAA 4DDCA 2ZYCA 1IR8A 3W3EA 4PJ2C 2I6ZA 3TXDA 4LYBA 2EKSC 2W1YA 1JISA 1JWRA 1D9UA 1UC0A 6LYZA 2C8OA 3WU9A 1IP5A 4XJDA 1BWHA 4R0FA 1CKFA 133LA 2MEIA 4B4EA 1JKCA 1LJ4A 1EQ4A 1H87A 4N8ZA 5FSTA 1V7TA 4NG8A 1IP4A 1W08A 2IFFY 3B72A 4Z46A 1LSYA 4PGJB 2YDGA 4XADA 3WH1A 1YAMA 1AM7A 1AZFA 3TMXA 1LMNA 3A6CY 1DI5A 1B7OA 2DKVA 2EPEA 4WM2A 5KJ9A 1GPQC 1IP1A 1LAAA 9LYZA 2YBJA 1MLCE 1LZ1A 1C7PA 4LZTA 4XJGA 3G3AB 1LKSA 1GBSA 4EOFA 5KY1A 154LA 2PC2A 1YL1X 2CJLA 5EBHA 4XYYA 2YBMA 2F30A 3CB7A 1T3PA 4LT0A 1TEWA 5B59A 5KXPA 1LZTA 1NQIA 5LAFA 5T3FA 4B1AA 2Q0MX 1WQRA 1NBZC 3P64A 5HMVA 4YM8A 3TXFA 1H6MA 1B7RA 3A91A 4NGWA 1GD6A 1CNSA 1IY4A 4GN3A 1KIPC 1WQQA 1KXWA 3AGGG 5LVHA 2ZIKA 3W6AA 1DI4A 4N9RA 1GB6A 4ML7A 4CGEA 1LSZA 4LYOA 1LJIA 3FI7A 1IOCA 4L41A 1BB4A 1LKRA 1C08C 1D0KA 1GF0A 1UIFA 2HEDA 3OK0A 4GCDA 4OWEA 3WW6A 4DD9A 2W1MA 1RFPA 4HPIA 4LT3A 1CJ9A 1B5XA 4HPEA 5F16A 2YBLA 5APDA 1LHMA 1JKDA 1JTPL 1B5UA 2MEBA 2ZQ3A 1XGUC 1CKGA 5IHGA 1WVVA 2D4KA 4OWCA 5KXRA 1SQ2L 1JITA 1REMA 2ZIJA 2D91A 1G7LC 3A34A 4J1AA 1AKIA 4G9SA 3B6LA 3WUMA 5HNLA 5KXLA 1BWIA 3BKVA 4WLDA 5E4PA 3TXGA 1OUHA 1I20A 1J1OY 3RZ4A 1LYZA 1WQNA 4YEOA 1LSMA 3EBAB 1PZYA 3M18B 2CDSA 3A94A 5LAGA 2H9KA 1IR7A 1BVKC 1JSFA 2XBRA 4NGIA 5B07A 4MSTA 1GB2A 1GEZA 1UBZA 1IP3A 4OOOA 3ULRA 2HTXA 5C6LA 3CSZA 4N0JA 2HU3A 4NG1A 1OUCA 1LZ5A 1LJ3A 5K7OA 1TDYA 5APEA 5B1GA 1D6QA 1GE3A 1GF3A 194LA 1HFZA 1GF9A 1HFXA 1LTMA 1WTNA 3A67Y 1F0WA 1SLYA 1XSFA 5J7CA 4IATA 1Z55A 2Z39A 3A8ZA 5LINA 1DI3A 1HEPA 4ETBA 4PPOA 1XGTC 1VFBC 3N9AA 1IP6A 1CKCA 1NBYC 1LMCA 1HFYA 5I54A 3EO5A 1YIKA 207LA 3AGHA 5ILCA 1B7PA 2BQIA 1LZ9A 1LPIA 4IJ4A 1GFJA 3SP3A 3ZVQB 4EMNA 5KXXA 1LMTA 4ETEA 5L3HA 5HMJA 1GBWA 1T6VL 2DQFC 3WXTA 1J1XY 1INUA 5II3A 4G4CA 1IWYA 1UIHA 5IDDA 1IX0A 1JKAA 4X3BA 4IASA 4H9BA 1JEFA 1RE2A 1GFRA 2ZWBA 2Z37A 4UWVA 2F2NA 4QDNA 3W6DA 4WM5A 1LJNA 4PRQA 4DDBA 1GB3A 1IWTA 4C5FA 3TXBA 4BADA 5KXWA 1TAYA 3A92A 3WU7A 1REZA 2MEFA 1XGPC 1BWJA 4NHQA 4GN4A 2FBBA 2HEEA 1IWZA 5FELA 1WVUA 1KIQC 4GLVA 7LYZA 1IR9A 1LHJA 1GF5A 1JJ3A 1LZNA 4NWHA 3GXKA 1LSGA 1UICA 1LSEA 1HEQA 2DQGY 1FKVA 5FHWA 2DQDY 1GEVA 1RI8B 3AYQA 4H91A 3AW7A 3LZ2A 1VEDA 2DQIY 1B9OA 5HLLA 4TSCA 4YEMA 1LSBA 3T6UA 3B0KA 3WVXA 1W6ZA 3ZVQA 1LMOA 3WPKA 4H9FA 1DQJC 2D4JA 3P65A 4OWAA 1LYOA 4M4OA 4H9HA 1YAQA 4NSJA 4C3WA 1LZGA 4Z98A 1NMMA 1N4FA 2DQCY 2N5ZA 3TXKA 1QDRA 4KXIA 1JJ1A 1GE2A 2DQHY 1AT5A 3F6ZA 3LHMA 3CT0A 3TMVA 4BS7A 1GDXA 5LIOA 1QSWA 1XEIA 2GV0A 4H8YA 1GXV2 4NSIA 3TMUA 4WG7A 1F10A 4NHTA 4UWUA 1NF5A 2DQJY 4RLNA 4W94A 5C6JA 1IP7A 4GN5C 1YANA 5KKJA 1UIEA 1B7NA 4HTKA 2D6BA 1VDSA 2BQLA 3M3UA 4CFPA 1LJFA 1CKHA 2LYMA 1G7JC 3OJPA 1LZ6A 2ZYPA 4LFPA 1GB9A 1E8LA 1OQMA 4WMGA 1B5ZA 5KKIA 1GB5A 1LZDA 3QY4A 3TXJA 4WL6A 3TXIA 1BHZA 4WL7A 4H9IA 4NFVA 1V7SA 1LMAA 4WM3A 2LHMA 4ZFPA 1BGIA 1J1PY 3W6EA 5A3EA 1IIZA 1KXXA 2XJWA 3E3DA 1HELA 3FE0A 1CJ8A 1D0LA 4YOPA 3A96A 3WXUA 4U3XB 1B7MA 2XTHA 4FDYA 4P2EA 8LYZA 2XBSA 1GFUA 4WM4A 4HTNA 5DL9A 5E9RA 1EQEA 5FDJA 2ZQ4A 1GFHA 2D4IA 1FLWA 1XFPL 2C8PA 5I5QA 1JKBA 3ZEKA 1HSWA 1B2KA 3P68A 4NGYA 3WVYA 4RDSA 1YL0X 1CJ6A 1G7HC 2G4NA 1ZVYB 1A4VA 1LJEA 2YSSC 3LYZA 3A93A 1NDGC 4M6DA 2HECA 3WMKA 2Y8PA 4ETDA 4WM1A 3ATOA 5D5CA 1IWXA 2HU1A 3CT5A 1ALCA 2YBIA 4Z3MA 1I1ZA 5DLAA 1HMLA 3A90A 1OUDA 2MEEA 5LVIA 2H5ZA 4HJYA 1JJ0A 5AMYA 1BB6A 1QIOA 2BLXA 4N1CC 5I4WA 1YILA 1NKHA 2W1XA 2BQCA 3MGWA 2HEFA 3AJNA 5APFA 3WYHA 4J0LA 2EQLA 1IY3A 3G3BB 1IORA 1REYA 3RNXA 4YF2A 1YQVY 2LZ2A 4I8SA 2I25L 4HV1A 1GWDA 1OUIA 4J1BA 2VB1A 2FYCA 4DT3A 4WO9A 1LJHA 1GB8A 4XJHA 5KXOA 3EXDA 134LA 3HBDA 5LYTA 4WG1A 4H93A 1QSAA 4BAFA 3B0IA 2Z12A 2HUBA 5KXKA 1BB5A 1GB7A 4H94A 3D9AC 4MCKA 1GFTA 1LCNA 4DD7A 5I4XA 1QQYA 1F6SA 4DD1A 5DM9A 5B05A 4NGLA 3W6BA 1VDTA 4OOTA 5KXZA 4ANRA 1GBZA 1DKJA 1DZBX 1JHLA 4XN6A 3AW6A 3BKHA 4HTQA 1IOQA 1GE4A 2Z18A 2A7FA 4LGKA 1LSPA 2BLYA 4DD0A 4PRUA 1LJGA 1AT6A 4CHXA 4H90A 4II8A 4FJRA 4CFOA 3IWRA 1D6PA 4H8XA 3TXEA 1JPOA 3HBEX 2Z19A 1XEJA 5L9JA 1EQ5A 4H8ZA 1OP9B 2BQHA 1GAYA 1LMQA 4LFXA 1IVMA 1OUBA 2LYOA 5KXSA 5KXNA 1IC5Y 1IO5A 1HENA 3HBHA 1HERA 1JTTL 1EL1A 1LZCA 2YBHA 4UWNA 4B49A 4KT3A 3CT1A 1HF4A 2BQNA 4NHPA 3LZTA 1UACY 2HEBA 2MECA 4LYTA 5F81A 2BQOA 4TX7A 3WPJA 4N1EI 1NDMC 1C46A 1YROA 5HNCA 193LA 1BB7A 2DQEY 2RSCA 5F9XA 1QUSA 2DQAA 2F4AA 4OWBA 1IWWA 4RW2A 3P66A 3AGIA 4TSBA 1LZAA 4XJBA 4ZIXA 4A7DA 1LZSA 1LZ8A 4XJFA 1RJCB 1IP2A 2MEDA 3AB6A 4WM6A 1GDWA 2WARA 4TWSA 1TBYA 3WULA 1MELL 1UIGA 1FLYA 4WLXA 4AXTA 1LSDA 2BPUA 2YVBA 3QNGA 1DPXA 3CSRA 5ILFA 2IHLA 4QY9A 2BQGA 1HMKA 2BQBA 1CKDA 2F4GA 2BQMA 1JIYA 4NEBA 4DD2A 1HC0A 1CJ7A 4OWHA 1VAUA 1OUJA 2FYDA 2H9JA 3AZ5A 3TXHA 1P2CC 4NGJA 1YKYX 2ZNWY 4LYCA 4NGKA 2FBDA 3GXRA 4QEQA 4H9CA 1FBIX 1RCMA 4WLYA 1FLUA 1LHHA 5KXMA 1B5VA 1JUGA 5JENB 4H92A 1HHLA 1OUFA 4G4HA 3LN2A 1O23A 5LVKA 3K3TA 1I56A 2ZNXY 5DN5A 4QGZA 3B0OA 5C6IA 1FLQA 3LYTA 4NGZA 4DYGA 3AZ4A 5B1FA 2MEGA 3ATNA 5D5FA 5LYZA 3WUAA 208LA 1WTMA 4LYMA 1GHLA 1ZV5L 1C10A 1LOZA 5I4YA 5LA5A 1B0DA 4HP0A 6LYTA 1LZ4A 4H9AA 1VDQA 4HV2A 1LZRA 1WQMA 5FEKA 2G4PA 1HEOA 1BVXA 1OUAA 1IOTA 1VATA 1XGRC 4WOAA 1UCOA 5KXYA 1BQLY 1KIRC 3W6CA 4CJ2A 3QE8A 3N9EA 3RT5X 1LJJA 4B0DA 1D0MA 4NY5A 4HJZA 1B7SA 1XGQC 3TMWA 1LMPA 4ETAA 1GF8A 5LVGA 3N9CA 1DKKA 3WPLA 1PS5A 4OW1A 4PHIA 1QUTA 132LA 2Z2EA 4DD3A 135LA 3WL2A 1C45A 4YENA 2DBTA 3J6KA 1NHEA 1GBOA 2X0AA 1B7LA 2BAAA 1GFVA 1FDLY 4I0CA 1IC4Y 4J7VA 1NWGA 1IC7Y 1LYSA 4KPMA 1OUGA 1WQPA 1IEEA 1VDPA 1YKXX 5DN4A 3IJVA 4B4IA 1YAOA 1FN5A 4WO6A 3AZ7A 3W6FA 1XEKA 1HNLA 4H9EA 2CGIA 4NWEA 1IWVA 4XJIA 4NSHA 3EMSA 4TUNA 1LHIA 1TCYA 1DPWA 4LT2A 3WUNA 5B06A 1FKQA 5APCA 4MR1A 4ET9A 1B5YA 1OUEA 4AGAA 2LZTA 4NGVA 1HEMA 1LHLA 1GBYA 1F6RA 5LA8A 3HFMY 1B5WA 4KL7A 3WU8A 5M1YA 1GAZA 3WW5A 2LYZA 1YAPA 1QTEA 3A95A 1GBXA 3VWOA 3CQLA 2BQFA 1LSCA 1IWUA 1B7QA 3A3QA 1LZEA 1UIDA 1REXA 3AZ6A 1WQOA 2BQEA 2ZILA 3RU5A 4LT1A 4E3UA 5LYMA 2BQAA 1ZVHL 2W1LA 3LYMA 4XENA 4ZEEA 4ETCA 1IOSA 1JTOL 2G4QA 2B5ZA 4NHIA 3T36A 2BQKA 5KXTA 2HEAA 1KXYA 4RLMA 2MEHA 4D9ZA 1QTKA 1DXJA 1ZMYL 1LZYA 2NWDX 4GCBA 5FCPA 1BB3A 4W96A 1GFKA 4Z41A 3CSQA 5F9UA 5F14A 1YKZX 4TTDA 5LVJA 2BQJA 3A3RX 5IELA 4GCEA 1GF4A 1HEWA 4GLAA 2I26L 1UIBA 3A6BY 2MEAA 4G4BA 1UUZC 4NIJA 4HJVA 4DDAA 1LHKA 1GF6A 1JSEA 2Z38A 3J4GA 5A3ZA 1LYYA 2A7DA 3P4ZA 5I53A 1GF7A 4BAPA 4DC4A 1GE1A 4GCFA 4R6CA 3IJUA 2EIZC 2CWIA 2BQDA 1GE0A 1LSNA 4O34A 1A2YC 3LYOA 5HQ1A 3KAMA 5LXWA 4DWXA 1LSAA 5L3IA 1G7IC 3RW8A 4LYZA 1C43A 1UA6Y 4NHSA 4B4JA 4G49A 3D3DA 4HSFA 4N5RA 4NGOA 4NSGA 4RW1A 1HSXA 4ET8A 1GB0A 1LJKA 1QDTA 1GXXA 1G7MC 2YBNA 2Z2FA 1GFEA 1UIAA 4GCCA 1LZBA 1GFGA 1LSFA 4H1PA 4WLTA 153LA 2AUBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3W3EA 1UC0A 1D9UA 1IP5A 1BWHA 4R0FA 1CKFA 4N8ZA 1V7TA 3JR6A 3PDSA 3B72A 1L85A 1L93A 4Z46A 2RB2X 1YAMA 1C6AA 3RUNA 1DI5A 1B7OA 5KJ9A 9LYZA 4XYYA 140LA 2F30A 1L32A 3CB7A 4LT0A 4LZMA 5B59A 5KXPA 5LAFA 4B1AA 2Q0MX 5HMVA 137LA 1B7RA 3A91A 2B6YA 1GD6A 1KS3A 1L20A 4GN3A 215LA 1CTWA 1KXWA 3AGGG 248LA 1L74A 1IOCA 1P5CA 4L41A 1BB4A 1L84A 1LKRA 2HEDA 1UIFA 205LA 1L42A 2W1MA 1L96A 1L06A 3HUAA 4LDLA 5IHGA 1WVVA 2D4KA 4ARLA 172LA 3DMXA 1G7LC 4G9SA 233LA 5E4PA 4YEOA 1LYHA 1PZYA 156LA 1JSFA 4MSTA 2LZMA 1UBZA 1IP3A 4OOOA 4N0JA 1QT8A 1TDYA 1T97A 3A67Y 1GE3A 1QT3A 1WTNA 1XSFA 3A8ZA 1L86A 1DI3A 4ZPUA 241LA 1B7PA 1L59A 3DN0A 3SP3A 1GFJA 4W51A 1LMTA 1T6VL 3WXTA 1P64A 1J1XY 5LZMA 4G4CA 2B6TA 2ZWBA 1CVKA 2OU0X 1GB3A 1L27A 1BWJA 1IWZA 1WVUA 4GLVA 1GF5A 4W59A 246LA 3AW7A 1VEDA 115LA 1L89A 3T6UA 1W6ZA 3ZVQA 4H9FA 1DQJC 2D4JA 1LYOA 1C6BA 4C3WA 1N4FA 2N5ZA 3TXKA 1QDRA 4BS7A 3TMVA 3CT0A 1JQUA 185LA 4H8YA 2DQJY 4W94A 1L46A 4I7OA 1VDSA 4CFPA 1LJFA 2LYMA 1GB9A 1OQMA 5KKIA 1D3NA 1V7SA 1G0KA 4ZFPA 1J1PY 1P2LA 1CJ8A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1GFA A;  4DDC A;  2ZYC A;  1IR8 A;  3W3E A;  4PJ2 C;  2I6Z A;  3TXD A;  4LYB A;  2EKS C;  2W1Y A;  1JIS A;  1JWR A;  1D9U A;  1UC0 A;  6LYZ A;  2C8O A;  3WU9 A;  1IP5 A;  4XJD A;  1BWH A;  4R0F A;  1CKF A;  133L A;  2MEI A;  4B4E A;  1JKC A;  1LJ4 A;  1EQ4 A;  1H87 A;  4N8Z A;  5FST A;  1V7T A;  4NG8 A;  1IP4 A;  1W08 A;  2IFF Y;  3B72 A;  4Z46 A;  1LSY A;  4PGJ B;  2YDG A;  4XAD A;  3WH1 A;  1YAM A;  1AM7 A;  1AZF A;  3TMX A;  1LMN A;  3A6C Y;  1DI5 A;  1B7O A;  2DKV A;  2EPE A;  4WM2 A;  5KJ9 A;  1GPQ C;  1IP1 A;  1LAA A;  9LYZ A;  2YBJ A;  1MLC E;  1LZ1 A;  1C7P A;  4LZT A;  4XJG A;  3G3A B;  1LKS A;  1GBS A;  4EOF A;  5KY1 A;  154L A;  2PC2 A;  1YL1 X;  2CJL A;  5EBH A;  4XYY A;  2YBM A;  2F30 A;  3CB7 A;  1T3P A;  4LT0 A;  1TEW A;  5B59 A;  5KXP A;  1LZT A;  1NQI A;  5LAF A;  5T3F A;  4B1A A;  2Q0M X;  1WQR A;  1NBZ C;  3P64 A;  5HMV A;  4YM8 A;  3TXF A;  1H6M A;  1B7R A;  3A91 A;  4NGW A;  1GD6 A;  1CNS A;  1IY4 A;  4GN3 A;  1KIP C;  1WQQ A;  1KXW A;  3AGG G;  5LVH A;  2ZIK A;  3W6A A; 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 5LA5 A;  1B0D A;  4HP0 A;  6LYT A;  1LZ4 A;  4H9A A;  1VDQ A;  4HV2 A;  1LZR A;  1WQM A;  5FEK A;  2G4P A;  1HEO A;  1BVX A;  1OUA A;  1IOT A;  1VAT A;  1XGR C;  4WOA A;  1UCO A;  5KXY A;  1BQL Y;  1KIR C;  3W6C A;  4CJ2 A;  3QE8 A;  3N9E A;  3RT5 X;  1LJJ A;  4B0D A;  1D0M A;  4NY5 A;  4HJZ A;  1B7S A;  1XGQ C;  3TMW A;  1LMP A;  4ETA A;  1GF8 A;  5LVG A;  3N9C A;  1DKK A;  3WPL A;  1PS5 A;  4OW1 A;  4PHI A;  1QUT A;  132L A;  2Z2E A;  4DD3 A;  135L A;  3WL2 A;  1C45 A;  4YEN A;  2DBT A;  3J6K A;  1NHE A;  1GBO A;  2X0A A;  1B7L A;  2BAA A;  1GFV A;  1FDL Y;  4I0C A;  1IC4 Y;  4J7V A;  1NWG A;  1IC7 Y;  1LYS A;  4KPM A;  1OUG A;  1WQP A;  1IEE A;  1VDP A;  1YKX X;  5DN4 A;  3IJV A;  4B4I A;  1YAO A;  1FN5 A;  4WO6 A;  3AZ7 A;  3W6F A;  1XEK A;  1HNL A;  4H9E A;  2CGI A;  4NWE A;  1IWV A;  4XJI A;  4NSH A;  3EMS A;  4TUN A;  1LHI A;  1TCY A;  1DPW A;  4LT2 A;  3WUN A;  5B06 A;  1FKQ A;  5APC A;  4MR1 A;  4ET9 A;  1B5Y A;  1OUE A;  4AGA A;  2LZT A;  4NGV A;  1HEM A;  1LHL A;  1GBY A;  1F6R A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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