1OVHA

T4 lysozyme cavity mutant l99a/m102q bound with 2-chloro-6-methyl-aniline
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCAAINQVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme
publication title Testing a Flexible-receptor Docking Algorithm in a Model Binding Site
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2003-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1ovhA00
1L03A 1L90A 4DJHA 236LA 1KS3A 3CDOA 1C68A 3HH5A 3CDRA 1C6IA 4EKSA 1L44A 5I14A 1C6KA 214LA 5LZMA 1L42A 3DMXA 224LA 255LA 3NY9A 2OE9X 4ARPA 217LA 211LA 192LA 239LA 1CU3A 3DN4A 1L87A 216LA 1L43A 4ARJA 3C8RA 1L75A 156LA 250LA 1L70A 1C6EA 1C69A 2RB0X 3DN0A 2OTYX 1PQMA 2NTGA 2OTZX 3SB7A 1C61A 1L59A 200LA 2F2QA 195LA 1QTDA 1L49A 1L83A 2RBQA 1L73A 1XJTA 1P36A 1C6TA 109LA 1L63A 3L64A 1OV5A 1PQKA 252LA 191LA 1L19A 212LA 1L18A 102LA 1QT5A 4LZMA 3HTDA 1I6SA 1L05A 3HH3A 1L41A 258LA 196LA 3V2WA 2B75A 4DKLA 257LA 3SN6R 1C63A 1D3NA 1LWKA 223LA 243LA 173LA 1NHBA 4I7MA 1C65A 4EKRA 2OU8A 1CVKA 108LA 1L94A 2O7AA 1L12A 138LA 1C6LA 187LA 4W57A 259LA 1SWZA 2B73A 178LA 3HT8A 198LA 3NY8A 1C6DA 1L29A 4I7NA 222LA 4LDOA 2B72A 1OVJA 1L99A 168LA 1P6YA 3C81A 1C6FA 1C67A 2F47A 1L55A 1LI2A 4GBRB 1G0JA 1QTHA 1LGXA 1LI6A 1QT7A 1G0LA 3C82A 1D9WA 1CU2A 1L98A 1CTWA 1L93A 6LZMA 4EKPA 184LA 151LA 238LA 4I7KA 1QS5A 1QTCA 2LCBA 1LYDA 1L82A 1QSQA 1QTBA 120LA 1G0QA 4K5YA 176LA 4I7TA 7LZMA 1CU0A 2B6WA 4I7RA 225LA 1L25A 1DYGA 1DYAA 3GUMA 4PK0A 4ARQA 242LA 3F8VA 148LE 1D3MA 125LA 1PQOA 233LA 3HTGA 4W59A 1C6GA 253LA 1PQJA 2B6ZA 3HTFA 4ARMA 4S0WA 4EKQA 4EPFA 226LA 1L06A 1CV1A 228LA 1LPYA 4IAPA 4EJ4A 115LA 181LA 1G06A 1C6HA 142LA 1SX7A 1L88A 1KW7A 1L51A 1G0KA 2RAYX 1QTZA 123LA 1L61A 1CU6A 1P2RA 113LA 3JR6A 3GUOA 256LA 1L35A 3C7WA 107LA 3NYAA 248LA 247LA 2IGCA 3HH6A 1L40A 1L69A 2RBSA 1CV6A 3DNAA 2ANVA 1L13A 2F32A 1KW5A 1P7SA 221LA 1L71A 3G3VA 1G0PA 1L66A 131LA 172LA 1L62A 1L89A 2B74A 209LA 186LA 1L85A 249LA 2O79A 152LA 4W53A 4I7PA 169LA 3GUJA 2RB2X 1L74A 1C60A 175LA 4W54A 1DYCA 2A4TA 1L39A 1CU5A 254LA 1WTHA 1QT3A 210LA 1OWYA 3UONA 130LA 3GUIA 1L36A 3SBAA 1P64A 1C6BA 1CV0A 2NTHA 141LA 126LA 3DN3A 1TLAA 3C7YA 1QUGA 1C62A 1P46A 1L10A 1L91A 2QARC 1L67A 2Q9DA 3GULA 1C6NA 237LA 1LYJA 2OEAX 3VW7A 3C83A 4LDEA 1QUHA 1ZURA 3DN6A 3SB5A 205LA 2LZMA 1L27A 3V2YA 177LA 1L38A 4GRVA 4W52A 2RBOA 3HT7A 1P2LA 3QAKA 2LC9A 1L80A 149LA 1OV7A 1L86A 119LA 1L45A 1L21A 1DYDA 2RBNA 2B70A 2HUMA 215LA 1G07A 1EPYA 167LA 1L50A 3SB6A 188LA 1CV3A 171LA 1L56A 157LA 4YXCA 2B7XA 3C8SA 3HT6A 1D3JA 2RH1A 1L46A 4AQNA 1L54A 240LA 165LA 1L20A 1L26A 4YXAC 1L23A 1KNIA 4W56A 2OU9A 2Z6BA 1L97A 1T97A 3CDQA 3HDFA 1L65A 1L52A 4EXMA 227LA 4E97A 185LA 1PQIA 3DMZA 3G3WA 1L02A 1CUQA 213LA 1L0JA 1P5CA 1L92A 128LA 1C66A 111LA 1L68A 164LA 1L58A 1KY0A 3C7ZA 1SSWA 229LA 260LA 2OU0X 1OWZA 3GUPA 146LA 1L0KA 3LZMA 140LA 2RBRA 3GUKA 1DYEA 230LA 1P56A 3K2RA 1L14A 234LA 244LA 3FI5A 3PBLA 1XEPA 1LYFA 2O4WA 3HH4A 1QUDA 1L24A 206LA 143LA 129LA 1LYGA 1QTVA 4I7LA 4ARQB 2RBPA 1L28A 1L76A 3L2XA 183LA 1L07A 4W58A 3C8QA 1ZYTA 118LA 182LA 1CV5A 4W51A 144LA 3HWLA 3SB8A 1C6MA 262LA 2B6TA 3FA0A 4I7QA 4W55A 1L09A 3DN2A 1T8FA 114LA 4ARMB 150LA 3EMLA 3DN8A 1T8AA 3DKEX 1L01A 3ODUA 1L81A 2QB0B 1L77A 139LA 1LLHA 1T6HA 122LA 1D3FA 219LA 4ARLA 145LA 1QS9A 2L78A 1LYHA 241LA 4OO9A 1L47A 1OYUA 2OE4X 170LA 103LA 1OVHA 2Q9EA 4LDLA 2HULA 158LA 1L32A 218LA 3C80A 3HUAA 4YX7C 1SWYA 1G1WA 231LA 1L37A 190LA 2CUUA 4I7JA 3DN1A 1P37A 166LA 1LYEA 3OE9A 1G0GA 1LW9A 3HU9A 1JTNA 3DMVA 1LGWA 1CX6A 1C6AA 1PQDA 160LA 3HT9A 3HU8A 1C6PA 1P3NA 3FADA 2RB1X 3RUNA 1ZWNA 235LA 3HTBA 1CX7A 1QUOA 1KY1A 220LA 1L08A 2HUKA 3RZEA 2B6YA 4ZPUA 1L72A 1L95A 137LA 4I7SA 1DYFA 1L15A 3HUKA 163LA 1LWGA 3SBBC 1L34A 232LA 2B6XA 1L53A 112LA 1L31A 104LA 1L04A 1L64A 3HDEA 1C64A 1QSBA 155LA 1LI3A 2OE7X 251LA 174LA 1L17A 3HUQA 1CUPA 162LA 1L30A 1QT8A 3D4SA 4DAJA 147LA 4PJZA 1XJUA 1QT6A 1L57A 1L60A 1L84A 246LA 1JTMA 1LGUA 189LA 1L16A 1G0MA 1DYBA 1K28A 1OVKA 1T8GA 3G3XA 3OE8A 261LA 1L22A 1CV4A 1L79A 127LA 161LA 110LA 1SX2A 1SSYA 245LA 201LA 1C6QA 3PDSA 2ANXA 3CDVA 1LYIA 4EPIA 3GUNA 3OE0A 2RAZX 3CDTA 1QT4A 1L11A 1B6IA 4I7OA 1C6CA 1G1VA 197LA 1L00A 180LA 1JQUA 3SB9A 1D2WA 159LA 1L33A 199LA 1C6JA 3F9LA 1D2YA 1L48A 3OE6A 1L96A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1GE3A 4WMGA 1KS3A 1C68A 3HH5A 4EKSA 1LZSA 1XEIA 1L42A 3DMXA 217LA 2A7FA 4WM4A 2ZILA 1L87A 216LA 3C8RA 1L75A 1WQOA 250LA 1EQ5A 1C6EA 4NEBA 1GEVA 3EMSA 3AZ5A 8LYZA 3IWRA 1C69A 2RB0X 3WVYA 2F2NA 3BKVA 2OTYX 1PQMA 1YAPA 4WL7A 1YAOA 1B5WA 2OTZX 4WLXA 1QTDA 1L73A 4PGJB 3AGGG 1LJNA 1LAAA 1YKXX 1L63A 4B49A 4WO6A 1PQKA 4BAPA 252LA 212LA 2DQAA 1LMOA 4YEOA 1LKRA 102LA 1B7MA 1QT5A 3CT0A 1L05A 196LA 1C10A 4DKLA 1W6ZA 257LA 2W1MA 2Z18A 2YBMA 3SN6R 243LA 3GXKA 1NHBA 2OU8A 108LA 1A4VA 4G4BA 1FLWA 187LA 1DKKA 1YQVY 1UC0A 1D6QA 198LA 1REZA 1B2KA 4LDOA 5HMJA 4HV1A 168LA 2XJWA 134LA 5E4PA 1DXJA 1TAYA 2F47A 1L55A 1N4FA 1LI2A 1G0JA 1QTHA 4NIJA 3RW8A 1LI6A 5LYMA 4DQ5A 1L98A 1JPOA 6LZMA 4H94A 3TMXA 1QTKA 151LA 1C45A 1QS5A 2LCBA 1OUIA 1QTBA 4G9SA 1G0QA 1LTMA 4K5YA 5LA8A 1CNSA 176LA 1HEWA 1IP5A 1CU0A 1LYOA 1QUSA 4H9IA 4H9BA 3GUMA 1JITA 3F8VA 148LE 1D3MA 1GB8A 233LA 2WARA 4H91A 2ZQ4A 2ZWBA 5KJ9A 228LA 4IAPA 1LPYA 4EJ4A 1GB7A 115LA 2ZIJA 1G06A 5KXTA 1GXV2 1HFYA 1KW7A 1UUZC 1LJIA 3WUMA 123LA 3AZ4A 1P2RA 3EO5A 2F4GA 208LA 3GUOA 4C5FA 107LA 4WO9A 3HH6A 1OP9B 3AZ7A 1BB3A 4H9AA 2RBSA 1GB9A 1LSAA 1FLYA 4Z98A 1L71A 1G7IC 4CHXA 4ETAA 1WTMA 249LA 4TTDA 3GUJA 1WVUA 2FBBA 4W54A 4UWVA 1EL1A 1ALCA 1WTHA 3A6BY 2EQLA 1INUA 1QT3A 4J1BA 1UICA 130LA 3GUIA 3SBAA 126LA 3DN3A 3C7YA 1QUGA 1C62A 2DBTA 1P46A 1XEJA 4HP0A 1LSCA 2Q9DA 1KIRC 2OEAX 3FI7A 1L27A 5LINA 4GRVA 4GCDA 4DD1A 3T6UA 1L21A 4WOAA 1YAQA 1G7LC 1G07A 167LA 1L50A 1HEMA 3OK0A 4HJZA 4YOPA 3SB6A 157LA 2B7XA 3C8SA 1IWUA 5K7OA 1L46A 4M4OA 240LA 1L20A 1LZ1A 1L23A 1LZGA 3TMUA 1GFVA 1GE2A 1L97A 1JKBA 1UIFA 2C8OA 1XGUC 1T97A 3HBEX 4FJRA 4E97A 4LYTA 4CGEA 5LYTA 4NGLA 4RW2A 5LYZA 3WL2A 4P2EA 1GBSA 1L0JA 128LA 1C66A 4MSTA 5KXOA 4DDBA 1J1XY 1IVMA 1IR7A 1SSWA 2G4NA 2BLYA 1JJ0A 260LA 194LA 4N8ZA 1OWZA 1GBYA 1Z55A 1VEDA 140LA 3GUKA 2ZNXY 1DYEA 4WL6A 4HPEA 4OWCA 1LHHA 1BB7A 1LJ4A 1UIAA 1LOZA 1HFZA 3A96A 4J1AA 1QUDA 1L24A 206LA 3TXKA 1IWYA 1QTVA 4PPOA 2YBHA 5KXLA 1QSWA 9LYZA 5HNLA 2EIZC 1BVXA 1L09A 1LYZA 4GCEA 4ARMB 114LA 1IR8A 4KPMA 4NFVA 193LA 1CKDA 150LA 3EMLA 3DN8A 4B4JA 1T8AA 3DKEX 1NF5A 1LJFA 1LKSA 1LLHA 2CGIA 122LA 1D3FA 3TXGA 2L78A 1LYHA 1GB3A 3W6AA 5APCA 4R0FA 1L47A 5LVGA 2Q9EA 1LHMA 1LYEA 3OE9A 1G0GA 1LW9A 1JSEA 1LGWA 2DQHY 5KXWA 1C6PA 1P3NA 1KIPC 1B5ZA 2DQIY 1RFPA 1L08A 2HUKA 1L95A 137LA 4I7SA 3A92A 3MGWA 112LA 1IOQA 4ETEA 3HDEA 3W6BA 1QSBA 3TXBA 1G7MC 155LA 3EXDA 1GXXA 1IC4Y 251LA 3HUQA 162LA 1L30A 1L57A 4WLDA 246LA 1JTMA 1G0MA 1K28A 1OVKA 1GFJA 3G3XA 1JJ1A 1L22A 3A3RX 1JWRA 161LA 4CJ2A 245LA 201LA 2DQJY 4QGZA 4ETDA 1GB6A 1GE0A 1GF9A 4EPIA 3GUNA 1KXXA 1C43A 207LA 5LXWA 4WLTA 1TCYA 4X3BA 2Z2FA 4NGVA 1FKQA 4WM2A 5LVJA 2IHLA 1VATA 1L00A 1LJGA 2FYCA 3SB9A 1D2WA 1LHKA 159LA 1L33A 1GWDA 1LSYA 1C6JA 3F9LA 1D2YA 4NG8A 4XJIA 1L96A 4ZEEA 4ZFPA 1L03A 1BVKC 2Z37A 4M6DA 214LA 224LA 4ARPA 1UIEA 211LA 192LA 1CU3A 3WVXA 1L43A 5C6IA 1IORA 1IY3A 3DN0A 1LZAA 2BQBA 5KXSA 4DT3A 4PRUA 5IDDA 1NHEA 200LA 1P36A 1VFBC 3WH1A 3TXIA 4A7DA 1TEWA 1NQIA 1L19A 5I4WA 3AJNA 2H9JA 1W08A 4XN6A 4LZMA 3HH3A 258LA 1ZVYB 3CQLA 1XEKA 1LZBA 4O34A 1PS5A 1ZVHL 4QEQA 3AZ6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1GE3 A;  4WMG A;  1KS3 A;  1C68 A;  3HH5 A;  4EKS A;  1LZS A;  1XEI A;  1L42 A;  3DMX A;  217L A;  2A7F A;  4WM4 A;  2ZIL A;  1L87 A;  216L A;  3C8R A;  1L75 A;  1WQO A;  250L A;  1EQ5 A;  1C6E A;  4NEB A;  1GEV A;  3EMS A;  3AZ5 A;  8LYZ A;  3IWR A;  1C69 A;  2RB0 X;  3WVY A;  2F2N A;  3BKV A;  2OTY X;  1PQM A;  1YAP A;  4WL7 A;  1YAO A;  1B5W A;  2OTZ X;  4WLX A;  1QTD A;  1L73 A;  4PGJ B;  3AGG G;  1LJN A;  1LAA A;  1YKX X;  1L63 A;  4B49 A;  4WO6 A;  1PQK A;  4BAP A;  252L A;  212L A;  2DQA A;  1LMO A;  4YEO A;  1LKR A;  102L A;  1B7M A;  1QT5 A;  3CT0 A;  1L05 A;  196L A;  1C10 A;  4DKL A;  1W6Z A;  257L A;  2W1M A;  2Z18 A;  2YBM A;  3SN6 R;  243L A;  3GXK A;  1NHB A;  2OU8 A;  108L A;  1A4V A;  4G4B A;  1FLW A;  187L A;  1DKK A;  1YQV Y;  1UC0 A;  1D6Q A;  198L A;  1REZ A;  1B2K A;  4LDO A;  5HMJ A;  4HV1 A;  168L A;  2XJW A;  134L A;  5E4P A;  1DXJ A;  1TAY A;  2F47 A;  1L55 A;  1N4F A;  1LI2 A;  1G0J A;  1QTH A;  4NIJ A;  3RW8 A;  1LI6 A;  5LYM A;  4DQ5 A;  1L98 A;  1JPO A;  6LZM A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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