3TXBA

Hewl co-crystallization with cisplatin in aqueous media with glycerol as the cryoprotectant
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title Experience with exchange and archiving of raw data: comparison of data from two diffractometers and four software packages on a series of lysozyme crystals.
pubmed doi rcsb
total genus 45
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2011-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3txbA00
2IFFY 4P2EA 1REYA 4KPMA 4UWNA 4WG7A 5LVHA 1DKKA 3W6FA 2YBLA 1IR7A 1CKHA 2EPEA 2DQCY 3FE0A 3CSZA 1XEKA 1AZFA 1A2YC 1VATA 4C5FA 4TTDA 2W1XA 2AUBA 2ZIKA 5LINA 4OWBA 1B7RA 2IHLA 5KXWA 1EQ5A 4HJZA 4OWHA 3TXDA 4LT2A 1Z55A 4LYCA 1SLYA 1UIGA 4G4HA 4J0LA 5I5QA 1FKQA 1LHKA 1CJ7A 1LCNA 4LGKA 1LZTA 3OJPA 3WVXA 3WL2A 1GF7A 1UACY 4FDYA 5B59A 1OUAA 4R0FA 1LKSA 1GFHA 2BQIA 2D4KA 1LZAA 2HEDA 1P2CC 4NHIA 1LMNA 1JIYA 2DQHY 1GBWA 4B1AA 4DT3A 1LZ5A 1YKXX 4DYGA 5FELA 4WLTA 3ATOA 1GFJA 4AXTA 1CNSA 2Y8PA 1GE4A 1LZ8A 3W3EA 1LTMA 5KXKA 4HPIA 1REMA 5FEKA 1XEJA 3WUMA 1O23A 4DDCA 1GB9A 1B5ZA 1IX0A 1IP1A 1LJJA 1IOSA 4J7VA 1LYZA 1LJIA 2BQHA 4XJDA 133LA 1AT5A 4WG1A 2BQAA 4PRQA 2YBHA 1GPQC 4GCEA 207LA 5KKIA 4LYBA 3EMSA 1YIKA 4ETBA 1GEZA 1XGRC 1C7PA 4B4EA 5IHGA 4NG1A 3IJUA 1D6QA 3HFMY 4H8XA 4EOFA 4WM5A 2D4JA 4W96A 4J1AA 3A6CY 2CJLA 1HEOA 1OUEA 4NGVA 1FDLY 3WULA 2HTXA 1JJ3A 5F9UA 2YBMA 3EXDA 4E3UA 1GFTA 4KL7A 1C46A 1VDQA 4AGAA 4NGKA 2I26L 3AZ4A 1PS5A 4TSBA 1A4VA 1D0LA 1BVXA 1I1ZA 3ATNA 3CQLA 2ZNXY 1LYYA 4D9ZA 1W08A 1LMTA 4HTQA 5ILCA 1FN5A 4G9SA 2HUBA 4LYMA 1B5VA 2XJWA 1DI4A 4H9BA 4NGOA 4NY5A 5L3IA 1IP6A 1LJ3A 1LZ9A 4RW2A 4QDNA 1BWIA 4ZIXA 4WLXA 1RI8B 1GBOA 4WO9A 4ETAA 1LZ6A 1GFGA 5IELA 2ZQ4A 1LJ4A 4H9CA 1IR8A 1NDMC 3TXHA 3W6BA 3QNGA 3WPJA 4RLNA 3E3DA 4MCKA 5DN4A 2ZWBA 1LZRA 5K7OA 1KIPC 4LT3A 1HEQA 1OUHA 3WXUA 4NGWA 4OWCA 3W6DA 1VDPA 4HJVA 3WMKA 5C6JA 3LYZA 4NWEA 5LVIA 3WXTA 1GF0A 3EBAB 4UWVA 4DD0A 1IEEA 1T6VL 5DLAA 1LHJA 2C8OA 1UC0A 4BS7A 2ZYCA 3WH1A 2XBSA 2XBRA 5A3ZA 4WM4A 3P4ZA 2CDSA 4ET9A 1GB5A 1LSGA 1D0MA 1RCMA 4NIJA 3A90A 1JJ1A 5AMYA 5C6IA 1DKJA 4NHSA 1JHLA 5L9JA 4B4JA 1WTMA 4MSTA 2DQDY 1C10A 1GBXA 1BWHA 1JITA 4U3XB 1GF8A 1HSWA 2GV0A 1JTTL 2FYDA 2F4GA 3CSRA 4LZTA 3W6EA 4PPOA 1INUA 1LMOA 1J1PY 1JWRA 1NKHA 3G3AB 4NSJA 4BAPA 1GB3A 5KJ9A 1XFPL 5D5CA 2WARA 1LHHA 1B7QA 5HNLA 1B7NA 3A67Y 3TMUA 1GFRA 1GE1A 4PGJB 4XJBA 2HEAA 3TXEA 1G7MC 1GAZA 3A96A 5KXYA 4GCFA 2W1LA 1IIZA 4I8SA 4NSHA 1IWYA 1GFUA 5ILFA 3TXGA 1OUCA 1YL1X 2I6ZA 1GB2A 2HU1A 4LFPA 4R6CA 1QUSA 1BB7A 1GBZA 1TBYA 1WQOA 2CWIA 2ZQ3A 4II8A 1IY4A 4CJ2A 3ZVQA 1F0WA 1VEDA 4NWHA 1YKYX 1G7HC 4WL7A 3B0OA 5LVJA 3B0KA 2C8PA 4IASA 1G7JC 3IWRA 4DD3A 5II3A 4Z98A 3QE8A 1IVMA 1B5XA 4H94A 4TX7A 4HSFA 1MELL 4CFOA 4L41A 1LSMA 4Z3MA 4ANRA 5FDJA 4WLDA 2DQFC 2DQGY 4DDAA 1GB7A 4O34A 3TXKA 3B72A 3F6ZA 2ZNWY 2PC2A 1LZNA 1EQ4A 1N4FA 1V7SA 1DPXA 1CKFA 3RNXA 3WU7A 7LYZA 4ZEEA 2Z18A 1IP3A 1LSDA 3LZ2A 1FKVA 4LT1A 5IDDA 1GHLA 4GN5C 5I54A 3WVYA 3P65A 2MECA 5LVKA 4LFXA 4YF2A 3TMWA 132LA 1OUGA 1IO5A 4NGYA 3TMVA 4DD2A 1FLWA 4N1CC 4CFPA 5APFA 2MEIA 1H6MA 2MEFA 1UIBA 1GWDA 5B06A 1H87A 1LSYA 1XGUC 3A95A 1MLCE 1GF4A 2BPUA 1GFVA 3WPLA 3WUAA 5M1YA 1OP9B 2ZIJA 5B1FA 5L3HA 1QSWA 3WU8A 1XGQC 4C3WA 1B0DA 2DQAA 1D0KA 5B07A 5LIOA 1YAMA 1LHMA 1ZV5L 3OK0A 1B5YA 4H92A 2B5ZA 3W6CA 1B7MA 3LN2A 1IP7A 1IC7Y 1UIFA 2BQOA 4KXIA 4YENA 1LJFA 1LSAA 1NWGA 1RJCB 3AW7A 4H9AA 4PJ2C 2BQDA 3HBHA 3KAMA 4WMGA 2F4AA 2BQFA 1GB0A 1BQLY 1LYOA 4YM8A 1YROA 1OQMA 2BQJA 2Z19A 1LHIA 5DM9A 3RT5X 1REZA 3D3DA 5F16A 3AZ7A 2W1MA 1I20A 1LZBA 1BB4A 1V7TA 1IWVA 1YQVY 4TSCA 4XYYA 1QQYA 3AW6A 4IJ4A 1NBYC 4OW1A 3RW8A 5LYMA 3LYMA 1YILA 194LA 5D5FA 3A93A 2HU3A 2CGIA 1EQEA 4G49A 3HBDA 4XJFA 5F9XA 4NGZA 2BLXA 5KXTA 154LA 1JPOA 1HFZA 1LMAA 5EBHA 1C43A 2DQIY 2G4QA 4NFVA 1OUDA 3CT5A 3CT0A 1RE2A 1LZ4A 2XTHA 1JJ0A 1IOTA 1GE3A 2A7FA 5HQ1A 3B0IA 4OOTA 2EIZC 3BKHA 2LYMA 3P64A 3N9CA 1GF5A 5KXLA 4DC4A 1FLQA 2YBJA 4H91A 8LYZA 1KXWA 1WQRA 1VAUA 2N5ZA 1IWZA 4TWSA 5I53A 5J7CA 4ETDA 3EO5A 3J4GA 1LZ1A 1DQJC 1JTOL 1HEWA 1YAOA 2MEDA 4WM6A 4PHIA 1CKDA 1G7LC 1QUTA 4EMNA 3A8ZA 1B7PA 2W1YA 1LHLA 3LYOA 1NMMA 3BKVA 1FLYA 4RW1A 2G4PA 3D9AC 4DWXA 4NHTA 2DQJY 2BQCA 4H8ZA 4TUNA 135LA 1HENA 1LSFA 2BLYA 4J1BA 2MEAA 2D91A 3VWOA 5FSTA 4H1PA 4NG8A 1NHEA 1UIDA 2BQNA 4XADA 2YVBA 3RU5A 2DQEY 3N9AA 5KXSA 2BQKA 2DKVA 4HTKA 3T36A 1GB6A 4WM2A 1W6ZA 1UIAA 4WL6A 1IOQA 4QY9A 4HPEA 4MR1A 4H90A 3LZTA 1JKCA 3A92A 4W94A 4WO6A 1B7OA 1DI3A 1IOCA 2F30A 3TXFA 5I4XA 4YOPA 4G4CA 1UCOA 2H5ZA 3A34A 2YDGA 4N8ZA 5DL9A 1JKBA 1LSZA 1DPWA 4OWEA 1QIOA 1TDYA 4XJIA 5APCA 2BQGA 5KXOA 1WQPA 1WQNA 1IWWA 4DD1A 1CJ9A 5KXZA 3HBEX 1YAQA 3P66A 1LMPA 3SP3A 1ALCA 3AZ6A 4OWAA 3WW6A 5KKJA 1HHLA 2D4IA 4H9IA 4N5RA 4H8YA 4LYZA 2LHMA 1YANA 2LZ2A 1BB6A 1LOZA 4LT0A 4UWUA 3P68A 1XGTC 1QDRA 1CKGA 1GB8A 3T6UA 2Z39A 1ZVYB 4CGEA 1HSXA 1CJ8A 1GF9A 2DBTA 2LZTA 2Z12A 1OUFA 1LZDA 1IC4Y 1FBIX 1QDTA 2ZYPA 1UBZA 5KXMA 1KXXA 5E9RA 2Q0MX 2MEGA 3AGGG 1GXV2 1LSEA 1B7LA 1LJEA 1QTKA 4IATA 4NSGA 1GE2A 2Z2FA 3TXIA 1CJ6A 2MEHA 1TAYA 4ETEA 1GFEA 1BB5A 5LVGA 1JEFA 4PRUA 1LYSA 1F10A 4YEOA 1AT6A 2MEBA 1WVVA 1GAYA 1LJGA 1VFBC 3AB6A 1IC5Y 1LJHA 4H9FA 4M6DA 2FBDA 5HNCA 2Z2EA 5HMVA 1GFKA 1LZEA 1OUIA 2A7DA 1E8LA 1HMKA 3CB7A 1UUZC 1LJKA 1BVKC 1D9UA 1HFXA 3LHMA 4M4OA 5LA8A 2Z37A 2EKSC 2X0AA 4B0DA 3RZ4A 1IWUA 5HLLA 4B4IA 1KIRC 1IORA 1YAPA 2BQEA 2HECA 4ML7A 4DDBA 4XN6A 1T3PA 2BAAA 2NWDX 193LA 5FHWA 2BQMA 6LYTA 1BWJA 4N1EI 1G7IC 1HEMA 1UICA 1UA6Y 4CHXA 1HELA 1ZMYL 4WM1A 5KXXA 4OOOA 4NSIA 1XSFA 2FYCA 5LAFA 4HTNA 3A91A 2H9JA 5B05A 5B1GA 1LSNA 2HEEA 5I4WA 1HFYA 1LZGA 3GXRA 2F2NA 3TMXA 4A7DA 2MEEA 1NBZC 1GXXA 3GXKA 3CSQA 3M18B 4B49A 2HEFA 1VDSA 3AZ5A 1KIQC 1LSPA 1ZVHL 4GCCA 1B5UA 3J6KA 3QY4A 4KT3A 4GCDA 5C6LA 1B5WA 1GEVA 4LYTA 1I56A 4QEQA 1NF5A 1LZSA 1IR9A 4GN3A 1NQIA 1XEIA 9LYZA 4NHPA 4DD9A 4NGIA 1DXJA 5A3EA 1BHZA 1J1XY 1VDTA 4G4BA 5KY1A 6LYZA 1JSEA 1D6PA 1YKZX 153LA 1WTNA 2Z38A 1IWXA 1GBSA 1JKAA 4XJHA 1J1OY 2YBNA 1JUGA 1LKRA 5LAGA 2H9KA 3A3QA 3ZEKA 5LYTA 2HEBA 4ZFPA 4GCBA 3A6BY 1HF4A 3TXJA 2YSSC 1AM7A 1KXYA 1B7SA 1BGIA 1DZBX 4H93A 4H9HA 4WM3A 5KXPA 1HERA 3AGIA 5DN5A 1GF3A 1WQMA 1WVUA 4N9RA 5LA5A 3WW5A 5KXRA 4QGZA 4XENA 3WPKA 1YL0X 1LSBA 3WU9A 1UIEA 1DI5A 1OUBA 1QTEA 2FBBA 3LYTA 4HP0A 1JSFA 3B6LA 1CKCA 1XGPC 3AJNA 4ETCA 1REXA 4N0JA 3W6AA 1GBYA 5APDA 1EL1A 5T3FA 4FJRA 3ULRA 1IWTA 1LAAA 5E4PA 3ZVQB 1LPIA 1IY3A 3IJVA 1JTPL 3WYHA 2EQLA 134LA 5F81A 3MGWA 1LZCA 4WLYA 1GDXA 3AYQA 5HMJA 5JENB 1FLUA 1C08C 3CT1A 1B2KA 1HEPA 1TEWA 1HC0A 2G4NA 4WOAA 1GFAA 1JKDA 3AGHA 4NHQA 1SQ2L 4GLVA 4HJYA 1HMLA 5F14A 4GLAA 1F6RA 2YBIA 5LYZA 3K3TA 2LYOA 4LYOA 1AKIA 1QSAA 1GDWA 4DD7A 208LA 2BQLA 1RFPA 4XJGA 4HV1A 5FCPA 1IP5A 1B9OA 1LZYA 1OUJA 2RSCA 4YEMA 1LMQA 1PZYA 1IP2A 1GD6A 4NEBA 4Z46A 4ET8A 1WQQA 5KXNA 2BQBA 1GE0A 1LJNA 4GN4A 1F6SA 1LSCA 1LMCA 4RDSA 3TXBA 1IP4A 4X3BA 5I4YA 4H9EA 2VB1A 5APEA 2D6BA 1TCYA 3FI7A 4HV2A 3G3BB 4RLMA 5LXWA 4BAFA 4NGJA 4Z41A 1GF6A 1UIHA 1HNLA 4BADA 1BB3A 3WUNA 2ZILA 3A94A 4I0CA 1NDGC 3M3UA 2I25L 1C45A 1JISA 4NGLA 3A3RX 3N9EA 2LYZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
214LA 1L92A 4WG7A 2EPEA 2DQCY 3FE0A 114LA 223LA 1VATA 5LINA 2ZIKA 2AUBA 1L44A 5KXWA 1EQ5A 4HJZA 4LT2A 4LYCA 1SLYA 1P3NA 1LHKA 4LGKA 3OJPA 3WL2A 1P2RA 198LA 1GFHA 2D4KA 1LZAA 2OEAX 3L64A 1YKXX 1KNIA 4HPIA 161LA 1GB9A 1B5ZA 155LA 1L20A 3HT7A 1IOSA 3HU8A 4LDEA 1L13A 1AT5A 4PRQA 1GPQC 4ETBA 1GEZA 1P46A 1XGRC 1CVKA 1L34A 2ANXA 1D6QA 4H8XA 1L17A 2D4JA 1PQKA 236LA 1L45A 3EXDA 4E3UA 1GFTA 249LA 4AGAA 4NGKA 127LA 3FI5A 2I26L 4TSBA 1A4VA 1I1ZA 3CQLA 3OE6A 2ZNXY 103LA 1LMTA 5ILCA 4G9SA 2XJWA 4NY5A 1IP6A 1LJ3A 4WO9A 1GBOA 3HUKA 1LZ6A 3EMLA 4H9CA 1C6MA 3WPJA 3E3DA 2ZWBA 256LA 5K7OA 1LYHA 1OUHA 4NGWA 3W6DA 1G0PA 3LYZA 5LVIA 1GF0A 3EBAB 5DLAA 2RB2X 1LSGA 113LA 1P5CA 123LA 1JHLA 3V2YA 4MSTA 3CSRA 2QB0B 1J1PY 1NKHA 2O7AA 5KJ9A 1B7QA 1B7NA 1L65A 144LA 4XJBA 1G7MC 1GAZA 3A96A 4I8SA 1GFUA 1GB2A 253LA 4R6CA 1L40A 1BB7A 1TBYA 2ZQ3A 1L21A 3FADA 1G7HC 1KY0A 4DQ7A 4IASA 1G7JC 4DD3A 4Z98A 1LPYA 4H94A 1MELL 3GUKA 4L41A 4ANRA 5FDJA 3NYAA 1GB7A 3B72A 200LA 146LA 1C6AA 1QTZA 1GHLA 3P65A 1L16A 1QTVA 1C67A 1LYJA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2IFF Y;  4P2E A;  1REY A;  4KPM A;  4UWN A;  4WG7 A;  5LVH A;  1DKK A;  3W6F A;  2YBL A;  1IR7 A;  1CKH A;  2EPE A;  2DQC Y;  3FE0 A;  3CSZ A;  1XEK A;  1AZF A;  1A2Y C;  1VAT A;  4C5F A;  4TTD A;  2W1X A;  2AUB A;  2ZIK A;  5LIN A;  4OWB A;  1B7R A;  2IHL A;  5KXW A;  1EQ5 A;  4HJZ A;  4OWH A;  3TXD A;  4LT2 A;  1Z55 A;  4LYC A;  1SLY A;  1UIG A;  4G4H A;  4J0L A;  5I5Q A;  1FKQ A;  1LHK A;  1CJ7 A;  1LCN A;  4LGK A;  1LZT A;  3OJP A;  3WVX A;  3WL2 A;  1GF7 A;  1UAC Y;  4FDY A;  5B59 A;  1OUA A;  4R0F A;  1LKS A;  1GFH A;  2BQI A;  2D4K A;  1LZA A;  2HED A;  1P2C C;  4NHI A;  1LMN A;  1JIY A;  2DQH Y;  1GBW A;  4B1A A;  4DT3 A;  1LZ5 A;  1YKX X;  4DYG A;  5FEL A;  4WLT A;  3ATO A;  1GFJ A;  4AXT A;  1CNS A;  2Y8P A;  1GE4 A;  1LZ8 A;  3W3E A;  1LTM A;  5KXK A;  4HPI A;  1REM A;  5FEK A;  1XEJ A;  3WUM A;  1O23 A;  4DDC A;  1GB9 A;  1B5Z A;  1IX0 A;  1IP1 A;  1LJJ A;  1IOS A;  4J7V A;  1LYZ A;  1LJI A;  2BQH A;  4XJD A;  133L A;  1AT5 A;  4WG1 A;  2BQA A;  4PRQ A;  2YBH A;  1GPQ C;  4GCE A; 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 5DN5 A;  1GF3 A;  1WQM A;  1WVU A;  4N9R A;  5LA5 A;  3WW5 A;  5KXR A;  4QGZ A;  4XEN A;  3WPK A;  1YL0 X;  1LSB A;  3WU9 A;  1UIE A;  1DI5 A;  1OUB A;  1QTE A;  2FBB A;  3LYT A;  4HP0 A;  1JSF A;  3B6L A;  1CKC A;  1XGP C;  3AJN A;  4ETC A;  1REX A;  4N0J A;  3W6A A;  1GBY A;  5APD A;  1EL1 A;  5T3F A;  4FJR A;  3ULR A;  1IWT A;  1LAA A;  5E4P A;  3ZVQ B;  1LPI A;  1IY3 A;  3IJV A;  1JTP L;  3WYH A;  2EQL A;  134L A;  5F81 A;  3MGW A;  1LZC A;  4WLY A;  1GDX A;  3AYQ A;  5HMJ A;  5JEN B;  1FLU A;  1C08 C;  3CT1 A;  1B2K A;  1HEP A;  1TEW A;  1HC0 A;  2G4N A;  4WOA A;  1GFA A;  1JKD A;  3AGH A;  4NHQ A;  1SQ2 L;  4GLV A;  4HJY A;  1HML A;  5F14 A;  4GLA A;  1F6R A;  2YBI A;  5LYZ A;  3K3T A;  2LYO A;  4LYO A;  1AKI A;  1QSA A;  1GDW A;  4DD7 A;  208L A;  2BQL A;  1RFP A;  4XJG A;  4HV1 A;  5FCP A;  1IP5 A;  1B9O A;  1LZY A;  1OUJ A;  2RSC A;  4YEM A;  1LMQ A;  1PZY A;  1IP2 A;  1GD6 A;  4NEB A;  4Z46 A;  4ET8 A;  1WQQ A;  5KXN A;  2BQB A;  1GE0 A;  1LJN A;  4GN4 A;  1F6S A;  1LSC A;  1LMC A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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