159LA

Control of enzyme activity by an engineered disulfide bond
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLAMLQAKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Alanine scanning mutagenesis of the alpha-helix 115-123 of phage T4 lysozyme: effects on structure, stability and the binding of solvent.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1994-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 159lA00
1L04A 233LA 3OE6A 1L86A 1L48A 1T97A 200LA 241LA 2RB0X 1L91A 1LGWA 4I7KA 252LA 246LA 1DYBA 4ARJA 186LA 250LA 3DN4A 3D4SA 178LA 1TLAA 1G0MA 1C66A 1L19A 3DMVA 5I14A 4W51A 229LA 4IAPA 1CV0A 168LA 1G0GA 4YXAC 3G3XA 220LA 3CDRA 1L69A 3HWLA 183LA 1L62A 234LA 1EPYA 2LCBA 165LA 1OVJA 4W58A 111LA 1D2YA 3C81A 1C63A 2ANXA 1KS3A 1L60A 195LA 1LWGA 1L26A 3ODUA 236LA 225LA 1L37A 1QS9A 1LYDA 248LA 261LA 188LA 1C6BA 2RBQA 1L85A 1QTBA 1L80A 1L29A 4EKPA 102LA 4W59A 4I7NA 4I7RA 166LA 1OVHA 1LLHA 3DN1A 1L32A 1L03A 1LYFA 1L23A 1G1WA 1L44A 3V2YA 112LA 1LWKA 1LGUA 1LI2A 174LA 4DKLA 249LA 120LA 2RAYX 1C65A 1LYJA 209LA 1G0PA 175LA 3K2RA 3C8QA 4W54A 1L73A 1QTCA 161LA 3GULA 238LA 151LA 1C6CA 1L56A 3C82A 1L70A 1L0KA 3HUKA 145LA 1PQMA 205LA 1L81A 4EXMA 1CV5A 125LA 3SB7A 128LA 1G1VA 1C64A 3SB9A 141LA 1P2LA 243LA 1CU0A 3GUJA 1L35A 1L95A 1P6YA 3HH4A 1P56A 184LA 1DYGA 2RBOA 2RB1X 1L08A 4E97A 1L51A 1QSQA 3F8VA 177LA 1JTMA 228LA 1CV6A 2B7XA 4ARPA 3SB5A 224LA 2B75A 2B73A 1P2RA 3OE8A 1SX2A 197LA 1L61A 1C6TA 4I7SA 3HU9A 2OTZX 245LA 3OE9A 1PQJA 1L66A 4I7LA 1C6FA 4I7JA 171LA 1L40A 1CU5A 110LA 1XJTA 1D3FA 2OU9A 226LA 4I7TA 4PK0A 222LA 3HDEA 3DKEX 152LA 4S0WA 1DYCA 1NHBA 1L64A 219LA 1CUQA 2Z6BA 138LA 147LA 3V2WA 2B74A 3HUAA 1LYGA 1C6LA 4W53A 4AQNA 1OVKA 1ZWNA 235LA 2RB2X 3NY9A 4EKSA 4EPIA 187LA 2Q9EA 4ARLA 3C8RA 1L21A 118LA 1P64A 144LA 1CV4A 1QT4A 1L17A 1L41A 213LA 1D3JA 1G0QA 1QT6A 3FADA 1LW9A 4EKQA 1L97A 1G06A 1C6JA 4W57A 129LA 1L39A 2OU0X 1L13A 258LA 1LPYA 1L16A 4LDEA 1L58A 1T8FA 1L54A 3C80A 1KW7A 1QUDA 3HTFA 2A4TA 260LA 1OV7A 1L49A 1L82A 3DMZA 2F47A 2B6WA 2O7AA 1QT8A 231LA 3HUQA 1DYFA 1L76A 2F2QA 2B6XA 2OE4X 3DN0A 4DAJA 1L96A 1CX7A 156LA 4I7PA 4EPFA 1L50A 1DYAA 4LZMA 3OE0A 1KNIA 3SB8A 1C6MA 1G07A 1LI3A 221LA 1G0KA 1C6DA 172LA 1B6IA 1KY1A 1L00A 1T8AA 237LA 1L22A 3JR6A 3F9LA 4K5YA 3CDTA 3PDSA 163LA 2B6TA 223LA 1L89A 2RAZX 3GUPA 108LA 1LYHA 1XJUA 3C8SA 1KY0A 159LA 114LA 139LA 142LA 164LA 1D2WA 157LA 3GUKA 1L14A 1SSYA 1CX6A 3DN3A 127LA 1LYIA 2NTHA 3HH3A 3HTDA 1L10A 2HUMA 216LA 148LE 3CDQA 1P37A 4LDOA 180LA 1L34A 2QB0B 1L20A 198LA 1LGXA 3G3WA 122LA 1C6QA 1L87A 1D9WA 167LA 3DNAA 230LA 7LZMA 1L59A 2NTGA 4EJ4A 1CTWA 4OO9A 1QTHA 242LA 3FI5A 4LDLA 253LA 210LA 113LA 1L72A 2O79A 149LA 1P3NA 2QARC 150LA 1WTHA 4I7MA 3HTGA 3DN8A 1L94A 1LYEA 1QUOA 3HDFA 3SBAA 1D3MA 1G0JA 2LC9A 1L75A 1C61A 115LA 1L79A 3GUIA 1L90A 239LA 1C6IA 1XEPA 255LA 2OE7X 4ARQA 4I7QA 2O4WA 1OYUA 189LA 1OV5A 1L65A 1C67A 181LA 2HULA 1C6KA 1L68A 3L64A 1T6HA 2OE9X 1L99A 3CDOA 1L71A 3EMLA 4PJZA 1C6PA 1L46A 1P36A 130LA 1SSWA 2ANVA 137LA 3NY8A 1L33A 3HH6A 256LA 1CU3A 227LA 1QS5A 1QTDA 2B6ZA 1L45A 1C6GA 3SBBC 1T8GA 162LA 1C68A 1L92A 2L78A 211LA 1QT5A 214LA 1PQOA 259LA 2B6YA 1L55A 199LA 1L11A 1D3NA 1L36A 3L2XA 1PQIA 3HH5A 1L31A 1I6SA 1C6HA 3UONA 1C6EA 212LA 3SB6A 192LA 1SX7A 1L30A 1QTVA 1L28A 1P7SA 1JTNA 104LA 1L93A 4DJHA 262LA 155LA 1L83A 126LA 3GUNA 103LA 3C7YA 1G0LA 4YXCA 2OEAX 109LA 1OWZA 1CV3A 1QTZA 2RBNA 1C69A 1L15A 2RBSA 146LA 1L53A 2B72A 3C83A 158LA 3HT6A 1PQDA 4I7OA 1L57A 1KW5A 1L42A 2CUUA 3RZEA 1L74A 190LA 4W56A 2OU8A 1CU6A 173LA 1ZYTA 3HT9A 4ARQB 119LA 1L77A 3G3VA 182LA 1L07A 1L0JA 1L88A 232LA 3C7WA 1P5CA 254LA 1L63A 4EKRA 4ARMA 3CDVA 170LA 1K28A 1P46A 1L25A 1CUPA 2B70A 3VW7A 1L12A 1L01A 3QAKA 1L38A 4YX7C 257LA 1CVKA 247LA 3DMXA 1L05A 1QT3A 1C60A 218LA 1L84A 244LA 1SWZA 1DYEA 251LA 3PBLA 1LI6A 3C7ZA 2RBPA 1QT7A 3RUNA 1CV1A 2LZMA 4GRVA 3NYAA 1L67A 1OWYA 143LA 1L98A 240LA 3LZMA 131LA 196LA 3HT7A 1L24A 1C62A 4W52A 1L43A 2F32A 3HT8A 1C6NA 1L18A 4ZPUA 4W55A 2Q9DA 123LA 1L02A 160LA 3DN6A 2RH1A 107LA 169LA 6LZMA 1DYDA 185LA 206LA 1PQKA 4GBRB 3SN6R 1L27A 176LA 1QUGA 1L09A 5LZMA 2HUKA 1L47A 3GUMA 2OTYX 1C6AA 3FA0A 2IGCA 1L52A 1CU2A 1ZURA 201LA 3HTBA 1QSBA 140LA 2RBRA 3DN2A 1L06A 4ARMB 1JQUA 1SWYA 3HU8A 3GUOA 215LA 1QUHA 217LA 191LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3KAMA 3WH1A 1L86A 1L48A 5I4XA 1LJFA 3CSZA 3P4ZA 200LA 241LA 1EQ4A 1L91A 4NHTA 1LGWA 2BQLA 3TMUA 1DYBA 3D4SA 1HNLA 1TLAA 1G0MA 1L19A 4DD2A 5KXSA 1PS5A 229LA 4WOAA 220LA 4H9HA 1IP3A 4P2EA 4GCEA 1L69A 183LA 1LZEA 2Z39A 1D2YA 2ANXA 1L60A 1GFUA 1REMA 1L26A 4WLXA 2XBSA 236LA 1TCYA 4MR1A 3A94A 1LZGA 3WPLA 2XBRA 102LA 4I7NA 1LHHA 5I4WA 1YANA 3DN1A 5JENB 3AZ4A 4HTKA 5LVHA 1L44A 4LZTA 1TEWA 2W1XA 174LA 5LVJA 1YKZX 249LA 4OOOA 209LA 2BQAA 1HEWA 3C8QA 4W54A 5B1FA 1GFEA 5LINA 1JITA 1GFHA 2YVBA 1C6CA 4GLAA 1JWRA 4H9FA 3C82A 4NGIA 154LA 1HF4A 2W1LA 1DPXA 128LA 5APEA 1NBYC 4H9AA 1L35A 5E4PA 2EPEA 4LT0A 184LA 1AKIA 1L08A 5KKJA 4XJHA 1QSQA 1D6QA 1FLQA 2YBJA 1O23A 1JTMA 228LA 2YDGA 1GAYA 4XJBA 4I7SA 207LA 171LA 1HMLA 1D3FA 4OWAA 5E9RA 4I7TA 1QSAA 1GBXA 4S0WA 5B07A 4CHXA 1GDWA 219LA 1YAOA 4OW1A 1D0MA 2B74A 3HUAA 1LJ3A 3HBHA 1LYGA 235LA 2RB2X 4EPIA 187LA 4N1EI 5FELA 3WXTA 3FADA 3WUNA 1SLYA 2LHMA 3TXDA 4EKQA 1L97A 1C6JA 1LTMA 1L39A 5LVGA 258LA 1L16A 1GB9A 1QDRA 1QUTA 1T8FA 3C80A 1OUGA 4PHIA 3AJNA 2X0AA 1ZMYL 2NWDX 1L49A 1L82A 2F47A 4ANRA 1LZYA 3A93A 2O7AA 3W6BA 1QT8A 3HUQA 1NDGC 1IC7Y 3DN0A 1JKCA 1F6SA 4G4CA 4N0JA 1L50A 4LZMA 5LVIA 1C6MA 237LA 1KY1A 2DQJY 1B6IA 3F9LA 4K5YA 3CDTA 3PDSA 1B9OA 1JEFA 163LA 3AGIA 2B6TA 223LA 4NG8A 4OWEA 1IP5A 1GFVA 1KY0A 4G49A 4LYTA 139LA 1RJCB 127LA 3A95A 4ETDA 1LYIA 1LYYA 5L3IA 1JJ1A 4YOPA 3A6BY 1L10A 3W6AA 180LA 4HJVA 1L34A 5KXTA 1FLUA 1LZ9A 4WM5A 4PRQA 1C6QA 230LA 1L59A 5II3A 1GB5A 2MEGA 1CTWA 4OO9A 253LA 1L72A 2I25L 4WM1A 3RW8A 3G3AB 5DLAA 3ATNA 1OUDA 3SBAA 4ETEA 1L75A 3GUIA 4CGEA 1L90A 4YF2A 5LYTA 3WYHA 189LA 3ATOA 5B05A 3WU7A 1INUA 5F14A 1L65A 4IATA 1C67A 4LT2A 2BQCA 3TXBA 3L64A 2OE9X 4LYOA 4GCCA 4PJZA 3ZEKA 1L46A 130LA 1LZRA 3NY8A 1IWUA 3HH6A 1WTNA 1JTPL 1VDPA 1L45A 1C6GA 1L92A 132LA 211LA 2LYOA 259LA 1JHLA 2B6YA 3L2XA 2Z38A 212LA 3SB6A 1T6VL 1P7SA 2D4KA 4ETBA 3CT5A 1YAPA 1REZA 1L93A 4XADA 4LYZA 5HMVA 1LCNA 1LHJA 1C69A 2RBSA 2B72A 3C83A 4WO9A 158LA 4NGVA 1ZVYB 4Z98A 2ZNWY 3AYQA 1L57A 1L42A 1LMTA 3RZEA 1L74A 1ZYTA 3HT9A 4WM4A 1JIYA 182LA 1L07A 4DD7A 1P5CA 3A8ZA 254LA 4EKRA 4ARMA 2AUBA 1P46A 1CUPA 4Z41A 4J0LA 3QAKA 1GEVA 4PPOA 257LA 193LA 1RFPA 1L05A 4KT3A 2HU1A 218LA 4B4JA 1L84A 4FJRA 4DT3A 1G7HC 1DYEA 2LZTA 3C7ZA 1YL1X 4NWEA 1HEPA 196LA 1XEKA 3HT7A 1C62A 4QGZA 2HEEA 1GAZA 4NSIA 4ZPUA 1BB3A 2XTHA 1OUAA 107LA 2RH1A 1LSMA 2BPUA 4X3BA 1QUGA 1KXWA 1L09A 4NSJA 2G4NA 1JPOA 2MEIA 1VDQA 2OTYX 5LA8A 1JTOL 1L52A 2DQAA 3MGWA 4I0CA 1QSBA 1BB4A 2F30A 4AGAA 1B5WA 3DN2A 1SWYA 4LYMA 3WPJA 4HV1A 191LA 1TAYA 1GF3A 3A6CY 2DQHY 1T97A 2RB0X 3A3QA 1D0KA 4Z3MA 1LZTA 4I7KA 1REYA 3AGHA 252LA 250LA 3DN4A 1GFTA 1C66A 3DMVA 2EKSC 1F10A 2GV0A 1G7LC 3W6FA 1D9UA 1CV0A 168LA 1G0GA 1DKKA 1C46A 7LYZA 3HWLA 1CKDA 1WQOA 4BADA 1E8LA 3T36A 2LCBA 3TXIA 3W3EA 4YEOA 2HEDA 3C81A 4UWUA 2ZIJA 4NHPA 1KS3A 195LA 1LWGA 3ODUA 1DI4A 248LA 1QS9A 1LYDA 261LA 1KIRC 1T3PA 1C6BA 3LHMA 1GFAA 1VDSA 4DQ5A 4W59A 1OVHA 1CJ8A 3B0OA 1IY4A 1L03A 1GBYA 5KXXA 1VAUA 1LI2A 4DKLA 1IWZA 5HNCA 1C65A 1LZCA 135LA 194LA 1IX0A 2XJWA 161LA 1L56A 1L0KA 1DKJA 3HUKA 145LA 4GN5C 4NGWA 4WLDA 205LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3KAM A;  3WH1 A;  1L86 A;  1L48 A;  5I4X A;  1LJF A;  3CSZ A;  3P4Z A;  200L A;  241L A;  1EQ4 A;  1L91 A;  4NHT A;  1LGW A;  2BQL A;  3TMU A;  1DYB A;  3D4S A;  1HNL A;  1TLA A;  1G0M A;  1L19 A;  4DD2 A;  5KXS A;  1PS5 A;  229L A;  4WOA A;  220L A;  4H9H A;  1IP3 A;  4P2E A;  4GCE A;  1L69 A;  183L A;  1LZE A;  2Z39 A;  1D2Y A;  2ANX A;  1L60 A;  1GFU A;  1REM A;  1L26 A;  4WLX A;  2XBS A;  236L A;  1TCY A;  4MR1 A;  3A94 A;  1LZG A;  3WPL A;  2XBR A;  102L A;  4I7N A;  1LHH A;  5I4W A;  1YAN A;  3DN1 A;  5JEN B;  3AZ4 A;  4HTK A;  5LVH A;  1L44 A;  4LZT A;  1TEW A;  2W1X A;  174L A;  5LVJ A;  1YKZ X;  249L A;  4OOO A;  209L A;  2BQA A;  1HEW A;  3C8Q A;  4W54 A;  5B1F A;  1GFE A;  5LIN A;  1JIT A;  1GFH A;  2YVB A;  1C6C A;  4GLA A;  1JWR A;  4H9F A;  3C82 A;  4NGI A;  154L A;  1HF4 A;  2W1L A;  1DPX A;  128L A;  5APE A;  1NBY C;  4H9A A;  1L35 A;  5E4P A;  2EPE A;  4LT0 A;  184L A;  1AKI A;  1L08 A;  5KKJ A;  4XJH A;  1QSQ A;  1D6Q A;  1FLQ A;  2YBJ A;  1O23 A;  1JTM A;  228L A;  2YDG A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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