159LA

Control of enzyme activity by an engineered disulfide bond
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLAMLQAKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Alanine scanning mutagenesis of the alpha-helix 115-123 of phage T4 lysozyme: effects on structure, stability and the binding of solvent.
pubmed doi rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1994-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 159lA00
3HWLA 1L62A 1G0LA 1P6YA 4ARQA 3F8VA 3HU8A 1B6IA 4I7KA 1L30A 4EPIA 220LA 3GUPA 3C8QA 146LA 1C6DA 1L61A 1D2YA 1L58A 3HUAA 2RB1X 1C64A 3K2RA 1L11A 1LYDA 1L14A 1L03A 1QTCA 1D3MA 1D9WA 139LA 1L52A 1SSWA 3DN1A 4DAJA 144LA 155LA 1QUHA 4I7SA 4YXAC 1LLHA 252LA 2Q9DA 1L46A 1CV5A 142LA 148LE 1L04A 2ANXA 2LC9A 234LA 259LA 4I7LA 1QSQA 141LA 1L57A 3DMZA 1QTHA 256LA 1P5CA 2F47A 1L02A 1L18A 3D4SA 1L17A 143LA 1L20A 1L43A 3HDEA 1OV5A 1C65A 2HUKA 128LA 1CV0A 1P64A 219LA 2RAZX 1L82A 1L25A 3DMXA 1L98A 138LA 1C6HA 3C82A 1LYEA 1C60A 1LGWA 224LA 1XJUA 1L38A 1L65A 1CX6A 1T97A 1L37A 1JTMA 1L99A 1L31A 214LA 1L56A 3G3WA 3HH6A 1LYGA 3OE0A 4YXCA 123LA 2HULA 3SB5A 176LA 1DYEA 3HUQA 163LA 3NYAA 178LA 3GUOA 1G0PA 1C6QA 1CV4A 1LW9A 3C7YA 1G0MA 1L12A 198LA 1KY0A 1L27A 1SWYA 237LA 180LA 3OE8A 1DYCA 1C66A 3DN6A 1L45A 1I6SA 242LA 210LA 1PQJA 1DYGA 145LA 209LA 1CU5A 3G3XA 1L53A 1DYFA 4ARPA 1C6KA 4I7QA 3V2YA 225LA 1LYJA 1L44A 109LA 3DNAA 1PQKA 226LA 3GUNA 1P2RA 4K5YA 1L42A 1CV6A 3L2XA 3GUMA 1L71A 3V2WA 4DKLA 3HT7A 3HH4A 149LA 217LA 1L05A 218LA 2OU9A 1L54A 228LA 173LA 230LA 2O4WA 3SBAA 1LYHA 201LA 1CU3A 1ZYTA 2RBSA 2B6WA 200LA 4I7OA 129LA 246LA 3L64A 1L83A 1C6IA 1L21A 1WTHA 2OE9X 3SB9A 3QAKA 1C6LA 1L68A 1CUPA 1G0JA 1LWGA 235LA 3SB8A 192LA 140LA 4OO9A 4ARLA 1L09A 2O79A 1L77A 211LA 3PBLA 150LA 1LI6A 2RH1A 1C6NA 1C6CA 196LA 4ARJA 1L40A 1L33A 3FA0A 1PQOA 5LZMA 3LZMA 2QB0B 1L76A 1KW5A 2NTHA 1P37A 118LA 1ZURA 4IAPA 1L08A 3CDOA 191LA 3PDSA 4W52A 4GRVA 236LA 1C6BA 3GUKA 1SX2A 1XJTA 158LA 2OEAX 3UONA 137LA 1C61A 1OV7A 1EPYA 3CDRA 1G0GA 1JQUA 255LA 4I7RA 1L89A 3DN3A 187LA 1C68A 175LA 1L87A 5I14A 243LA 1QS5A 1T6HA 240LA 2CUUA 103LA 1L10A 3RUNA 1QUDA 1L29A 215LA 1CU0A 7LZMA 1SWZA 250LA 3C8RA 1L92A 221LA 3HDFA 1L91A 3SB6A 1L80A 1LPYA 1QT3A 1L22A 1C6TA 162LA 1PQMA 2RBQA 3SN6R 3CDTA 1DYAA 4ZPUA 1XEPA 127LA 1CX7A 4W57A 251LA 4DJHA 165LA 1L35A 1P2LA 3DMVA 190LA 1CU2A 4W51A 3ODUA 2RBOA 213LA 2A4TA 2F2QA 1QSBA 1QT8A 1L51A 1C6MA 1LI3A 4EPFA 2RAYX 3HH5A 1SX7A 233LA 2B6ZA 1L72A 1L49A 4GBRB 174LA 1DYBA 3NY8A 4PK0A 4I7NA 245LA 131LA 107LA 113LA 3HTDA 4W53A 3DN4A 1CTWA 206LA 4W55A 222LA 2RBNA 120LA 1L23A 1L06A 1KY1A 238LA 4EXMA 3EMLA 1OWYA 1QTZA 2OE4X 172LA 3OE9A 3HUKA 1L86A 181LA 151LA 1QT6A 3HTFA 122LA 249LA 254LA 4W58A 239LA 1OVKA 3FI5A 3HT9A 3GULA 1C6FA 4W59A 1QT4A 1P56A 1C6JA 2B70A 4I7TA 1L34A 1C6GA 4EKPA 4PJZA 1G07A 260LA 1NHBA 253LA 4W56A 244LA 1D3FA 1G0KA 1L41A 2B73A 1QTBA 3DKEX 1QTDA 1L19A 3DN2A 114LA 1L70A 3OE6A 1L97A 1D2WA 167LA 257LA 247LA 1L15A 3DN0A 3CDVA 1L36A 1LYIA 2B75A 2B7XA 2OTZX 4EJ4A 3C80A 4S0WA 1KNIA 1CV3A 3C81A 4ARMB 108LA 4EKQA 1L63A 1L69A 2B6YA 166LA 1P7SA 1L01A 3HTBA 3SB7A 1C63A 1L95A 1L81A 1P46A 1QS9A 3RZEA 3C7ZA 3CDQA 2Q9EA 2O7AA 1LYFA 4I7PA 1C67A 205LA 4ARQB 4YX7C 258LA 1L16A 223LA 1C6EA 4EKRA 4LZMA 1L96A 3JR6A 168LA 1L48A 3HU9A 2LCBA 1L47A 1TLAA 1DYDA 4I7JA 104LA 2RB0X 3HT8A 2OTYX 3C83A 1OWZA 1L64A 1C62A 3C8SA 1C69A 3GUIA 3F9LA 1L75A 177LA 130LA 1CU6A 161LA 126LA 1C6AA 1PQDA 2RBPA 4EKSA 2QARC 111LA 186LA 3G3VA 1L55A 102LA 231LA 2HUMA 2IGCA 3C7WA 2B74A 1LGXA 4W54A 2OU0X 2RBRA 1L67A 1K28A 1G1VA 232LA 1G1WA 262LA 1G0QA 1L59A 3HH3A 2ANVA 1QT5A 188LA 241LA 1L24A 3NY9A 3FADA 1CV1A 4LDLA 1P36A 4LDOA 3VW7A 227LA 195LA 2B72A 1D3NA 1CVKA 3GUJA 1C6PA 2B6XA 152LA 197LA 147LA 1T8GA 119LA 212LA 1L88A 2NTGA 164LA 182LA 2L78A 1L0JA 189LA 1L32A 1L90A 1L93A 248LA 1KS3A 185LA 1QTVA 1L13A 1OVJA 1JTNA 3HTGA 216LA 2LZMA 1L50A 261LA 183LA 6LZMA 1SSYA 159LA 4E97A 1G06A 1L26A 1L94A 1QT7A 1LI2A 1QUGA 1T8AA 1T8FA 3SBBC 184LA 2OE7X 1PQIA 199LA 160LA 1L74A 1L85A 1OYUA 1LWKA 2OU8A 1CUQA 1L66A 1L00A 1L84A 2B6TA 156LA 4LDEA 1L28A 1L39A 1L0KA 1L73A 115LA 2RB2X 4AQNA 1QUOA 4ARMA 169LA 171LA 1L07A 2F32A 1KW7A 1OVHA 110LA 112LA 2Z6BA 3HT6A 1LGUA 1ZWNA 170LA 1D3JA 229LA 4I7MA 157LA 1L79A 3DN8A 1P3NA 125LA 1L60A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L62A 4ARQA 3TXBA 1LZEA 3WW6A 146LA 3CQLA 3HUAA 3WPKA 1GB7A 2RB1X 1C64A 1L11A 4DC4A 3AGIA 1L52A 3DN1A 4H8XA 4I7SA 2GV0A 1WQRA 1CV5A 142LA 2W1XA 1LSAA 2ANXA 234LA 4I7LA 1QSQA 1GFVA 4TTDA 3OK0A 2IHLA 256LA 1P5CA 5I4YA 2F47A 1L18A 143LA 1L20A 4HJYA 3HDEA 3AYQA 1HMLA 4EMNA 3RW8A 3AW7A 2ZIJA 4NHIA 1JKAA 1RCMA 1YAPA 5KXNA 1C6HA 3C82A 3TMWA 1IR9A 3CT5A 1V7SA 4FJRA 1HSWA 2DQFC 1E8LA 1JTMA 3ZVQA 1L31A 2YBLA 214LA 4I8SA 3SB5A 176LA 4LFXA 3HUQA 2FYCA 1G0PA 1T6VL 1C6QA 1HC0A 1YROA 1L12A 3WUAA 1KY0A 237LA 4DQ5A 4B49A 1C46A 5I54A 3TMXA 1IIZA 4XN6A 3D9AC 2HEEA 4NGLA 4J1BA 1GFEA 4OOOA 109LA 3DNAA 1PQKA 3A3QA 1IWVA 4KL7A 4DT3A 2DQEY 3ATNA 1LOZA 2CGIA 2MECA 3HT7A 217LA 1L05A 2OU9A 5KXKA 2YBJA 1WVVA 1IP2A 3T36A 1NQIA 1QSWA 4IASA 1INUA 1LZYA 4I7OA 5LVKA 1PS5A 129LA 2A7FA 4R6CA 4XJDA 3SB9A 5IHGA 5J7CA 2H9KA 2ZNWY 3LZTA 4TSCA 1G0JA 4OWBA 3SB8A 1QDTA 4OO9A 4ARLA 1L09A 1NDMC 2FBBA 3ATOA 1I20A 2ZYCA 2C8PA 4EOFA 3WXTA 2NWDX 5APCA 1PQOA 4LT0A 1L76A 1KW5A 2YDGA 2IFFY 1ZURA 1L08A 4P2EA 3PDSA 3BKHA 4W52A 1UACY 1TCYA 1SX2A 1XJTA 1XFPL 158LA 5D5FA 1XEIA 137LA 3QNGA 4GCFA 4I7RA 1LKRA 1JTPL 1CNSA 3N9AA 1J1OY 2CUUA 1L10A 1B5VA 1CU0A 4ANRA 3A34A 1LSZA 2ZQ4A 1SWZA 250LA 1B7SA 1L91A 1L22A 1C6TA 162LA 3CDTA 4GN3A 2LHMA 127LA 1CX7A 4W57A 1H6MA 4DJHA 4LYZA 4D9ZA 3KAMA 4HJZA 5FHWA 2W1MA 1BWJA 213LA 1QSBA 1C6MA 3F6ZA 135LA 4HPEA 4EPFA 3HH5A 3AZ4A 2DQIY 3A6CY 1LMPA 3NY8A 4PK0A 4I7NA 245LA 1LSBA 107LA 113LA 1CKDA 4W53A 4WOAA 1UICA 1GEVA 1B7LA 2RBNA 1L23A 1OUHA 4J7VA 3K3TA 1OUIA 1F0WA 2Z18A 3HTFA 3P65A 122LA 3HT9A 1FLQA 3AW6A 1QT4A 1P56A 4YOPA 1C6JA 1KIRC 1LZTA 2C8OA 2EPEA 4EKPA 4NG8A 1IP6A 2DKVA 153LA 1LJIA 253LA 1NKHA 1KXXA 4WMGA 1L41A 2B73A 3DKEX 4PRQA 114LA 1UIDA 1A4VA 167LA 257LA 4W94A 1CKCA 3QE8A 2OTZX 3FI7A 2HU1A 2F4AA 4ARMB 1WQPA 4KPMA 4EKQA 166LA 1P7SA 1GF3A 1GBWA 1JWRA 5APEA 3BKVA 3A93A 4ARQB 2DQCY 3WH1A 1UC0A 4WLYA 1C6EA 4ETAA 4EKRA 2Z12A 5LAFA 133LA 1LHMA 3JR6A 168LA 3HU9A 4LGKA 4I7JA 104LA 2RB0X 2YBHA 4H8YA 5DLAA 1L64A 1C62A 4DDCA 5D5CA 4DQ7A 1CU6A 4ET8A 126LA 4KXIA 1HFZA 4EKSA 111LA 1GF8A 186LA 3AGGG 231LA 2MEIA 1OUEA 1LGXA 4TX7A 2RBRA 1L67A 1JPOA 1WQNA 5F9XA 1G0QA 188LA 1LSNA 5LXWA 195LA 2B72A 4WLXA 3GUJA 1LCNA 3M3UA 1DKKA 1NMMA 2B6XA 197LA 1DKJA 1OUCA 147LA 3ZVQB 4Z98A 1HMKA 1P2CC 4LYBA 2X0AA 4W96A 1L88A 4H91A 2NTGA 4PHIA 5F14A 4MCKA 1L32A 1L90A 1L93A 1KS3A 1QTVA 1GAZA 1JTNA 4QDNA 1GAYA 4GCDA 1MLCE 5F16A 2LZMA 183LA 1LMAA 1SSYA 1OUJA 1QT7A 4DDAA 1DI3A 2YVBA 184LA 1A2YC 160LA 1LYZA 1GB8A 2HEBA 3WVYA 4NSHA 1CUQA 1UIFA 1L00A 2DQDY 3HFMY 1XGUC 2D4KA 2DQHY 2BQEA 4NG1A 1GBZA 1AM7A 1OP9B 1OVHA 2Z6BA 1LGUA 2XJWA 3B0OA 1ZWNA 1NDGC 1GB3A 170LA 4H92A 4I7MA 3WW5A 236LA 125LA 1L60A 3HWLA 1JITA 1G0LA 1LZAA 1GFJA 1WTMA 5E9RA 4LT3A 3CT1A 1L30A 4I7KA 5I4XA 220LA 1D0KA 1IP5A 1C6DA 4TSBA 4NSJA 1C10A 1LYDA 1L14A 4O34A 1D3MA 1D9WA 1SSWA 4ET9A 4DAJA 1QUHA 2BQFA 4YXAC 4NWEA 1B5UA 1LMQA 2EIZC 252LA 2Q9DA 3IWRA 1GD6A 1L46A 1LJNA 1HHLA 2LC9A 259LA 4PGJB 1G7HC 1LZCA 1QTHA 1G7JC 1GF4A 3LHMA 1C43A 4BAPA 1DQJC 5A3ZA 1TEWA 128LA 1CV0A 5LYTA 2F4GA 5FCPA 5IELA 138LA 1GFRA 1LGWA 1JEFA 1LZSA 224LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1L62 A;  4ARQ A;  3TXB A;  1LZE A;  3WW6 A;  146L A;  3CQL A;  3HUA A;  3WPK A;  1GB7 A;  2RB1 X;  1C64 A;  1L11 A;  4DC4 A;  3AGI A;  1L52 A;  3DN1 A;  4H8X A;  4I7S A;  2GV0 A;  1WQR A;  1CV5 A;  142L A;  2W1X A;  1LSA A;  2ANX A;  234L A;  4I7L A;  1QSQ A;  1GFV A;  4TTD A;  3OK0 A;  2IHL A;  256L A;  1P5C A;  5I4Y A;  2F47 A;  1L18 A;  143L A;  1L20 A;  4HJY A;  3HDE A;  3AYQ A;  1HML A;  4EMN A;  3RW8 A;  3AW7 A;  2ZIJ A;  4NHI A;  1JKA A;  1RCM A;  1YAP A;  5KXN A;  1C6H A;  3C82 A;  3TMW A;  1IR9 A;  3CT5 A;  1V7S A;  4FJR A;  1HSW A;  2DQF C;  1E8L A;  1JTM A;  3ZVQ A;  1L31 A;  2YBL A;  214L A;  4I8S A;  3SB5 A;  176L A;  4LFX A;  3HUQ A;  2FYC A;  1G0P A;  1T6V L;  1C6Q A;  1HC0 A;  1YRO A;  1L12 A;  3WUA A;  1KY0 A;  237L A;  4DQ5 A;  4B49 A;  1C46 A;  5I54 A;  3TMX A;  1IIZ A;  4XN6 A;  3D9A C;  2HEE A;  4NGL A;  4J1B A;  1GFE A;  4OOO A;  109L A;  3DNA A;  1PQK A;  3A3Q A;  1IWV A;  4KL7 A;  4DT3 A;  2DQE Y;  3ATN A;  1LOZ A;  2CGI A;  2MEC A;  3HT7 A;  217L A;  1L05 A;  2OU9 A; 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