3L2XA

Crystal structure of spin labeled t4 lysozyme mutant 115-119rx
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFCNSLCMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme
publication title Crystal Structure of Spin Labeled T4 Lysozyme Mutant 115-119RX
rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2009-12-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3l2xA00
1L47A 174LA 3GUMA 2O7AA 1L25A 3EMLA 3C7WA 1L14A 175LA 3OE8A 191LA 1L85A 1C6CA 4I7SA 227LA 1CTWA 4ARMB 1CX6A 122LA 1G0PA 2Q9DA 1L72A 2OTZX 170LA 1LI6A 3D4SA 1L0KA 7LZMA 115LA 2B6WA 125LA 1CV1A 1OV5A 240LA 2RBPA 1L52A 1SWYA 4EJ4A 1L51A 3C7ZA 3UONA 230LA 1D9WA 3GUJA 1DYGA 178LA 3JR6A 1CV4A 3HU8A 247LA 1CU2A 1L83A 246LA 2QARC 4I7RA 1LI2A 1QTDA 1L23A 2Q9EA 4W58A 4ARQB 127LA 3HH3A 3RZEA 245LA 2ANXA 169LA 214LA 228LA 3C7YA 1L77A 239LA 1DYBA 1CV6A 1C61A 3DKEX 3V2YA 4W57A 1L87A 1C67A 1L71A 1L76A 1L49A 143LA 3HTFA 188LA 3HTBA 4EPFA 3HH5A 1CVKA 2RAZX 1SWZA 260LA 1C6FA 1L68A 233LA 1L60A 1CUPA 1C6BA 3OE6A 4I7PA 3GUKA 158LA 182LA 1PQJA 1K28A 1OVKA 1QT6A 2B6TA 3OE0A 3CDOA 145LA 1P2RA 113LA 1L44A 1PQIA 1P56A 3C82A 2OE4X 3K2RA 2RB1X 3HDFA 138LA 1QTVA 1L48A 1D3NA 2RBSA 3C81A 4W54A 3DN0A 1C6QA 1LPYA 1OWZA 1L02A 1L08A 1CV0A 3LZMA 2OEAX 1CU5A 1T8FA 2B75A 144LA 3G3XA 2OE9X 107LA 165LA 1C66A 3C80A 1L34A 4S0WA 1L32A 1KY1A 222LA 3L2XA 1T6HA 4DAJA 1KW5A 1DYEA 1P37A 1QT3A 130LA 1PQMA 1D3JA 1G0QA 1LYEA 4LDLA 1L15A 1C6EA 1L43A 3HU9A 1JTMA 4W52A 1I6SA 3SBBC 244LA 161LA 3DMXA 3NY9A 231LA 3DN4A 4YX7C 172LA 1KW7A 237LA 1C6JA 140LA 104LA 2LCBA 1L30A 210LA 4LZMA 1SSYA 1C6MA 137LA 1L29A 3L64A 1WTHA 1QTZA 1QT4A 2RAYX 108LA 2IGCA 1LWKA 1JTNA 3SB6A 1L63A 3SN6R 4EXMA 1G1WA 196LA 1QSQA 1L31A 235LA 3HT8A 1OV7A 3SBAA 4DKLA 186LA 1L73A 4I7OA 1DYFA 1C6KA 229LA 1D2YA 3HTDA 3HUQA 1C6HA 1L46A 102LA 2O79A 1L42A 1C6GA 223LA 1C64A 4W56A 3CDRA 1P6YA 3PDSA 1QTCA 2RB0X 2HUKA 205LA 1L27A 215LA 103LA 1G0MA 3GULA 1L57A 1L20A 2F47A 3DN6A 4LDOA 1ZURA 1L41A 3DNAA 1G1VA 2NTGA 1L39A 1LGUA 1C6TA 1B6IA 2LC9A 1L95A 148LE 4ARJA 1LYJA 2RBRA 1QUGA 163LA 1C6IA 1T97A 2A4TA 251LA 2OU8A 3HWLA 4LDEA 1G0KA 216LA 120LA 4W51A 1D3FA 167LA 1CX7A 3HT7A 2OU9A 1L37A 1QSBA 2RH1A 1G0GA 1L24A 1QT5A 3DMZA 1CU0A 1QS9A 1P36A 213LA 248LA 3SB7A 1C63A 4EKQA 152LA 4K5YA 114LA 1L98A 1L97A 1L82A 2OTYX 1CV5A 3FADA 252LA 2RB2X 4I7NA 3HUKA 1P5CA 1QUOA 5LZMA 2L78A 2HULA 3F9LA 2F2QA 3C8SA 1L92A 2LZMA 1L36A 1LYFA 3GUNA 236LA 1CV3A 3HUAA 4YXCA 1C60A 3V2WA 1L26A 3FA0A 1ZWNA 4PK0A 3CDTA 1C6DA 129LA 3NY8A 212LA 4PJZA 146LA 156LA 1C6NA 2B6ZA 1SX7A 1L19A 4I7JA 1L67A 238LA 1OWYA 1LYHA 4YXAC 4I7MA 4ARLA 4EKPA 185LA 242LA 1SX2A 155LA 190LA 2NTHA 111LA 1L54A 1NHBA 184LA 1LYGA 4W59A 1LI3A 259LA 171LA 3HDEA 258LA 147LA 3FI5A 1QT7A 3HH6A 2CUUA 1L18A 157LA 1OVHA 1XEPA 3GUIA 1L91A 1L00A 1TLAA 3QAKA 112LA 1L89A 2ANVA 1L01A 3ODUA 4DJHA 3C8QA 177LA 249LA 142LA 209LA 126LA 141LA 1C6PA 219LA 1L04A 243LA 1QUHA 3NYAA 1L74A 3GUOA 1L90A 1PQDA 1L05A 261LA 1PQKA 1XJTA 226LA 217LA 149LA 4I7TA 5I14A 1L33A 3C8RA 1L59A 1L70A 1L21A 3CDVA 110LA 1L06A 2RBOA 1L10A 173LA 3HT6A 1P64A 1L09A 241LA 1DYDA 1KY0A 198LA 4I7LA 234LA 1L11A 1T8GA 1QTHA 1L28A 211LA 2OU0X 3DMVA 180LA 1L93A 3RUNA 1L07A 3OE9A 2RBQA 1L0JA 200LA 3C83A 4AQNA 128LA 224LA 1LGWA 4GRVA 1L86A 1C65A 192LA 4IAPA 1L38A 1LGXA 253LA 150LA 1L99A 4E97A 1D3MA 1G0LA 1L64A 1CU6A 1C62A 3SB9A 1CU3A 1L16A 4W53A 168LA 1L17A 1L22A 2F32A 3SB8A 1L81A 2QB0B 220LA 4I7QA 1C6LA 131LA 2HUMA 2B70A 1LW9A 1L84A 189LA 1L03A 2RBNA 176LA 1L12A 119LA 1L45A 166LA 1QTBA 3HTGA 1L69A 1G07A 1QS5A 3CDQA 164LA 250LA 2B6XA 1ZYTA 1D2WA 123LA 4EKSA 1DYAA 1SSWA 1T8AA 1L56A 3VW7A 1L62A 1DYCA 1L61A 4OO9A 255LA 1L96A 181LA 3F8VA 4ARMA 1P46A 257LA 201LA 3GUPA 4W55A 1KNIA 1L94A 1L80A 1L65A 1C6AA 1EPYA 2B7XA 1P3NA 3DN8A 254LA 139LA 206LA 2O4WA 2Z6BA 4EKRA 4EPIA 1KS3A 199LA 3SB5A 1XJUA 1G06A 1C69A 1C68A 232LA 1JQUA 1OVJA 1OYUA 3PBLA 256LA 1QUDA 118LA 1L79A 1LYIA 3DN2A 2B6YA 2B73A 1L35A 1G0JA 221LA 183LA 1L50A 1CUQA 1LYDA 1LLHA 151LA 2OE7X 4I7KA 4ARQA 3G3VA 160LA 1L88A 3G3WA 4ARPA 218LA 109LA 1L53A 197LA 3HH4A 3HT9A 4ZPUA 1P2LA 6LZMA 3DN3A 1LWGA 3DN1A 2B72A 159LA 1L75A 4GBRB 162LA 262LA 1QT8A 1L66A 1L55A 187LA 1L13A 1PQOA 1L58A 195LA 1L40A 1P7SA 2B74A 225LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1OP9B 2IFFY 1YKYX 4NGJA 1NKHA 4YENA 4NGKA 191LA 4X3BA 1ZVHL 1G0PA 4CGEA 1P2CC 1LI6A 1L0KA 2YDGA 5M1YA 2LZ2A 2B6WA 1CV1A 1OV5A 1B7LA 4LYMA 3WXTA 4DDAA 1L52A 2D4KA 3LYMA 3C7ZA 230LA 3OJPA 1D9WA 4NGIA 1OUHA 1CV4A 3A94A 1UUZC 1BVXA 246LA 1QTDA 3LYOA 4W58A 3M18B 3P4ZA 214LA 1HSXA 3FE0A 1CV6A 4OW1A 1D9UA 3V2YA 2XJWA 1IC4Y 1KIPC 143LA 1YROA 5T3FA 188LA 3TMUA 2BQHA 4G4HA 1BHZA 1NDMC 5HLLA 1LJGA 5HNCA 1IP3A 1OVKA 1QT6A 2I25L 4N8ZA 4HJZA 1L44A 3C82A 1J1XY 1KXYA 1LYZA 3K2RA 1T6VL 1YIKA 5D5CA 3AJNA 1QTVA 4W54A 1WQNA 1B7SA 4XJHA 1CU5A 2B75A 1JTOL 3EBAB 1HELA 2MEGA 107LA 4H90A 1LZRA 165LA 1SLYA 1L34A 1KY1A 2W1YA 193LA 1BWIA 4GLVA 1KW5A 1DYEA 2Y8PA 3WPKA 4LYCA 2HU1A 1LYEA 1L15A 1C6EA 1L43A 3AGHA 4I8SA 2H5ZA 4W96A 2C8OA 1CKDA 3ATOA 161LA 1D0MA 1CJ7A 172LA 1IC5Y 1XGPC 1C6JA 1GD6A 104LA 210LA 1SSYA 1L29A 3L64A 5APFA 4H9IA 4OWHA 4N1EI 1Z55A 4EXMA 3AGGG 235LA 3HT8A 194LA 2Z19A 1HHLA 4I7OA 1DYFA 1WTMA 1D2YA 1LOZA 1C6HA 4GN5C 102LA 1F10A 5HMJA 1QUSA 4W56A 3CDRA 3LZTA 3PDSA 2RB0X 2HUKA 1L27A 103LA 1SQ2L 3GULA 1ZURA 4GCDA 2BQBA 1L39A 4H92A 1B6IA 1NF5A 4ARJA 4IASA 4XJBA 3GXKA 5I4XA 3EXDA 1JJ1A 1IP1A 135LA 1IIZA 3B72A 4W51A 1D3FA 207LA 4H9FA 4FDYA 1L24A 3A3RX 213LA 248LA 1LMPA 1FBIX 2MEHA 152LA 2I6ZA 5B59A 1L97A 3FADA 133LA 1VFBC 1LSCA 1DKKA 1CNSA 4I7NA 1GF8A 1P5CA 1QUOA 4J1AA 3F9LA 2F2QA 2BQAA 1L92A 2LZMA 1B7QA 1L36A 1CJ9A 1CV3A 1C60A 2G4QA 3FA0A 4Z46A 129LA 146LA 5FEKA 2HUBA 1C45A 1GE0A 1NBZC 2DQFC 1JUGA 1L54A 4IJ4A 184LA 171LA 3CT1A 2BAAA 258LA 3WW6A 1JHLA 3HH6A 1GF6A 2F2NA 2C8PA 5KXYA 1N4FA 1D0KA 4H94A 1LZSA 2N5ZA 1JIYA 1L00A 1TLAA 4TSBA 1L01A 4ETBA 1IY4A 4NGWA 3GUOA 1D0LA 4NGLA 1L05A 3WU9A 261LA 2LZTA 1PQKA 2ZQ4A 1L33A 3WXUA 1F6SA 1HMLA 1L21A 3CDVA 3HT6A 1OUAA 1T8GA 234LA 4B4JA 1B9OA 1QTHA 2BLYA 3K3TA 3DMVA 1L0JA 4WOAA 4J0LA 2BQLA 200LA 4AQNA 1V7TA 4HTKA 2G4NA 128LA 1LMTA 1C65A 1NMMA 2A7DA 1WTNA 1IR9A 2D6BA 4IATA 1L99A 1QUTA 4E97A 5APEA 1L64A 3LHMA 1CU6A 1BB6A 2CGIA 4LYZA 4OOTA 1L17A 1L22A 4I7QA 131LA 4H9AA 4XN6A 2RBNA 2ZIJA 119LA 1FLUA 1L45A 4LYTA 1LKRA 5B1FA 3HTGA 1IOTA 1INUA 1QS5A 164LA 2MEEA 1OQMA 1B5VA 2ZNXY 4YEMA 1SSWA 1XEJA 1L56A 1DYCA 1L61A 4OO9A 2FYDA 255LA 1GXV2 1GB6A 1P46A 1L94A 3IJUA 3B0KA 1L80A 1L65A 4R6CA 5B05A 2O4WA 2Z6BA 1UIFA 1KS3A 5FSTA 4GN4A 1JQUA 4WO6A 2MEFA 5HNLA 4ETCA 4NIJA 4RW2A 3TXKA 1F6RA 1BWHA 1WVVA 3F6ZA 5LA8A 3WULA 2DQDY 2MEAA 109LA 1GEZA 4ZPUA 4U3XB 3AB6A 1LSAA 3DN1A 2B72A 3ATNA 1KXWA 1L75A 1BB5A 162LA 262LA 4TUNA 1QT8A 1L66A 4N9RA 1PQOA 5DLAA 3ULRA 1H6MA 195LA 1EQ4A 2W1XA 2B74A 4ANRA 4ETDA 1GF4A 2YBLA 1XFPL 3GUMA 3VWOA 4PJ2C 2Z2EA 5F81A 3ZEKA 4PPOA 1HEOA 3OE8A 1L85A 4DQ5A 1C6CA 227LA 122LA 1QDRA 1WQOA 2D4JA 3RZ4A 4H9BA 115LA 1YL1X 4WM4A 4NSGA 3WW5A 1GDXA 4EJ4A 1L51A 3UONA 4AXTA 1GB9A 1LJ4A 1VAUA 2EQLA 1LHLA 5F9XA 3LYZA 1DYGA 178LA 3TXGA 4NGYA 5APDA 4CFOA 8LYZA 1IWWA 2HECA 4OWEA 5LINA 4I7RA 1LI2A 1FDLY 4DQJA 5KKIA 5KKJA 3N9CA 2BQJA 5A3ZA 2YBHA 1DYBA 1WQRA 4M6DA 4UWVA 1CKHA 1GB0A 3DKEX 1ZVYB 4ET8A 1GBWA 2BQEA 4WM1A 3HTBA 3A93A 1LZCA 1AT6A 3HH5A 1CVKA 2RAZX 1SWZA 154LA 4DYGA 1A4VA 1C6FA 3AZ7A 4C5FA 1CUPA 2DQJY 1C6BA 1UIHA 3OE6A 1LJIA 1P2RA 1PQIA 2OE4X 4ET9A 1IR8A 1CKGA 4XJDA 4Z41A 3C81A 4L41A 1GBSA 3DN0A 1OWZA 4NG8A 1L08A 1GDWA 1OUDA 1GFJA 3G3XA 3P68A 1HERA 4RLMA 4S0WA 2MEDA 1B7RA 1B5XA 1I56A 1IP6A 4DAJA 1QT3A 1UC0A 3KAMA 4YEOA 3P65A 3HU9A 244LA 1V7SA 3LZ2A 4H93A 2LCBA 1L30A 4LZMA 4BAFA 3LN2A 1B5WA 4ZEEA 5C6JA 1VDTA 1GFEA 4XJGA 1WTHA 1QTZA 2RAYX 1B5YA 4G4BA 2IGCA 1VDQA 1LTMA 4B0DA 1LSZA 1L63A 4NSHA 1G1WA 4LT2A 3WUNA 1OV7A 1B7MA 229LA 5KXKA 1HFYA 3GXRA 3AZ4A 1IO5A 1LZEA 1C6GA 1GE1A 2IHLA 1P6YA 1F0WA 3IJVA 205LA 2HU3A 1ALCA 1L20A 2F47A 1RE2A 3DN6A 4NHQA 1L41A 2NTGA 4NGVA 1JJ0A 1C6TA 5F14A 1NQIA 4ML7A 2ZILA 1LYJA 1WQPA 5LVJA 1AKIA 1QUGA 2A4TA 4B4IA 3HWLA 5ILFA 216LA 1LSGA 3HT7A 4HTQA 5KXMA 1L37A 3TXFA 4LT0A 1G0GA 1LZ9A 1QT5A 3DMZA 2F4AA 1CU0A 4NHIA 1LZ6A 1P36A 5KY1A 5APCA 4K5YA 1L98A 5LVIA 2OTYX 3MGWA 2RB2X 4GCCA 2HULA 2Z37A 3GUNA 3HUAA 5HQ1A 3IWRA 3B0IA 4PRQA 1IWUA 1AM7A 1L26A 1LJFA 212LA 2MEIA 4NHPA 1YAMA 4YXAC 4ARLA 242LA 190LA 1TAYA 3WPLA 1LYGA 1NWGA 4W59A 259LA 5JENB 2CWIA 147LA 2YBJA 4NY5A 1KIQC 5F9UA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1OVJ A;  1OYU A;  3PBL A;  256L A;  1QUD A;  118L A;  1L79 A;  1LYI A;  3DN2 A;  2B6Y A;  2B73 A;  1L35 A;  1G0J A;  221L A;  183L A;  1L50 A;  1CUQ A;  1LYD A;  1LLH A;  151L A;  2OE7 X;  4I7K A;  4ARQ A;  3G3V A;  160L A;  1L88 A;  3G3W A;  4ARP A;  218L A;  109L A;  1L53 A;  197L A;  3HH4 A;  3HT9 A;  4ZPU A;  1P2L A;  6LZM A;  3DN3 A;  1LWG A;  3DN1 A;  2B72 A;  159L A;  1L75 A;  4GBR B;  162L A;  262L A;  1QT8 A;  1L66 A;  1L55 A;  187L A;  1L13 A;  1PQO A;  1L58 A;  195L A;  1L40 A;  1P7S A;  2B74 A;  225L A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1OP9 B;  2IFF Y;  1YKY X;  4NGJ A;  1NKH A;  4YEN A;  4NGK A;  191L A;  4X3B A;  1ZVH L;  1G0P A;  4CGE A;  1P2C C;  1LI6 A;  1L0K A;  2YDG A;  5M1Y A;  2LZ2 A;  2B6W A;  1CV1 A;  1OV5 A;  1B7L A;  4LYM A;  3WXT A;  4DDA A;  1L52 A;  2D4K A;  3LYM A;  3C7Z A;  230L A;  3OJP A;  1D9W A;  4NGI A;  1OUH A;  1CV4 A;  3A94 A;  1UUZ C;  1BVX A;  246L A;  1QTD A;  3LYO A;  4W58 A;  3M18 B;  3P4Z A;  214L A;  1HSX A;  3FE0 A;  1CV6 A;  4OW1 A;  1D9U A;  3V2Y A;  2XJW A;  1IC4 Y;  1KIP C;  143L A;  1YRO A;  5T3F A;  188L A;  3TMU A;  2BQH A;  4G4H A;  1BHZ A;  1NDM C;  5HLL A;  1LJG A;  5HNC A;  1IP3 A;  1OVK A;  1QT6 A;  2I25 L;  4N8Z A;  4HJZ A;  1L44 A;  3C82 A;  1J1X Y;  1KXY A;  1LYZ A;  3K2R A;  1T6V L;  1YIK A;  5D5C A;  3AJN A;  1QTV A;  4W54 A;  1WQN A;  1B7S A;  4XJH A;  1CU5 A;  2B75 A;  1JTO L;  3EBA B;  1HEL A;  2MEG A;  107L A;  4H90 A;  1LZR A;  165L A;  1SLY A;  1L34 A;  1KY1 A;  2W1Y A;  193L A;  1BWI A;  4GLV A;  1KW5 A;  1DYE A;  2Y8P A;  3WPK A;  4LYC A;  2HU1 A;  1LYE A;  1L15 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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