1I6SA

T4 lysozyme mutant c54t/c97a/n101a
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALIAMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords LYSOZYME
publication title Structural and thermodynamic analysis of the binding of solvent at internal sites in T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2001-03-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1i6sA00
1SX2A 3HDEA 1LI6A 1CX7A 1L16A 1P5CA 3DMXA 206LA 122LA 1CU3A 252LA 1QTDA 1L48A 6LZMA 157LA 1B6IA 3SB6A 149LA 3SB7A 3HU8A 1DYDA 1D9WA 1G0KA 1P3NA 4ARQB 3OE9A 1C6TA 3K2RA 1L01A 245LA 1QT6A 1L45A 146LA 1DYBA 103LA 123LA 1LYHA 1C6GA 244LA 3C7YA 1L82A 3SN6R 147LA 1CU2A 2OEAX 167LA 261LA 2RB0X 4GBRB 3GUOA 1L71A 3CDTA 1OV7A 4LDOA 1G0QA 3FA0A 2LC9A 2RBQA 190LA 1C65A 3CDQA 1C6BA 2RBNA 2CUUA 3HTGA 1CU6A 1L35A 112LA 1PQIA 1CTWA 3DN2A 151LA 3SB8A 1KY0A 1QTHA 224LA 144LA 1L80A 152LA 1L13A 1L56A 104LA 2A4TA 3SBBC 1L24A 1P56A 2HULA 3GUJA 2B7XA 1C6QA 109LA 1OVKA 237LA 1P64A 2RB1X 225LA 4EKPA 1SX7A 1L36A 3HWLA 1L23A 239LA 191LA 4ARQA 1QSBA 259LA 1C62A 1CV5A 1P37A 3ODUA 235LA 1C6LA 3SB9A 1C66A 1PQMA 128LA 3C82A 2OU9A 3DN1A 1L32A 1QUOA 1G06A 2B6WA 1L86A 2B6XA 1L40A 4ARJA 1L95A 1D2WA 246LA 110LA 2OTYX 1QS5A 1L09A 3HH4A 1KW5A 118LA 3NYAA 1CV6A 3SB5A 1L63A 215LA 4IAPA 130LA 1XJUA 1NHBA 1C6JA 1G07A 223LA 1P7SA 4YX7C 1L19A 3CDVA 1L08A 1G0GA 249LA 192LA 1KNIA 1D2YA 1LPYA 1L67A 3GUMA 1L29A 256LA 1QUGA 196LA 1C69A 1JTNA 3FI5A 1D3MA 2F2QA 4I7SA 155LA 142LA 1OWZA 108LA 1PQJA 3GUNA 4W54A 4EKSA 1OVHA 3CDOA 1C64A 3DMVA 2RH1A 3PDSA 2B75A 233LA 3DN3A 3OE6A 1G1VA 173LA 1L72A 1L31A 199LA 4W57A 257LA 102LA 1C6PA 1L91A 2OE9X 188LA 200LA 254LA 3EMLA 4ARLA 1G0JA 1LLHA 4EKQA 4DAJA 1L21A 139LA 1QSQA 2O7AA 217LA 4GRVA 4E97A 1L81A 5I14A 3JR6A 2NTGA 1SWYA 1L43A 1XEPA 3DKEX 107LA 182LA 1L12A 3HUAA 1L75A 1QTZA 1JTMA 250LA 3FADA 4I7TA 4S0WA 4W53A 1G0MA 198LA 221LA 3SBAA 4AQNA 2ANVA 219LA 113LA 1TLAA 2B6ZA 4ARMB 5LZMA 1PQDA 1L69A 1L37A 4W51A 158LA 3HT6A 1CVKA 1T97A 2Q9DA 1L44A 156LA 4EJ4A 243LA 1C63A 184LA 1L68A 3DN6A 1L14A 1L66A 3DNAA 1L49A 2OU8A 187LA 1L94A 176LA 1LGXA 1L07A 1D3FA 3HUQA 1CV4A 172LA 189LA 170LA 169LA 4ARPA 1DYCA 212LA 1L0JA 1KW7A 1C67A 3HT8A 1L70A 1I6SA 251LA 145LA 1QT4A 3C7WA 2QARC 1L04A 2Q9EA 3HT9A 1L02A 3G3WA 4I7JA 1OV5A 2B74A 1G1WA 1LGWA 3NY8A 1L47A 1LYEA 4I7OA 2ANXA 1QUDA 2O79A 209LA 197LA 3L2XA 1L50A 1L38A 1C6KA 115LA 1L28A 1LI2A 1QT7A 4W59A 3RZEA 1C6HA 211LA 1C6NA 2RBSA 3C81A 150LA 4PK0A 1OVJA 159LA 1L42A 1C6FA 1C6EA 238LA 119LA 2QB0B 1LYJA 4ARMA 241LA 138LA 3RUNA 1JQUA 4W52A 1L59A 186LA 1WTHA 1CUQA 201LA 1L05A 175LA 2B6TA 1L62A 1CX6A 1L64A 2RBRA 1LW9A 1CUPA 1DYFA 1L46A 3C8RA 4PJZA 3HTFA 231LA 2F47A 1P36A 4YXAC 129LA 1L11A 1KY1A 1L10A 166LA 4YXCA 3C8QA 1L77A 1L96A 205LA 1L73A 1C68A 1L58A 1PQOA 3DN8A 174LA 3GUIA 1CV3A 1G0PA 165LA 1T6HA 1ZURA 1L15A 2LCBA 1L76A 2L78A 2RBPA 160LA 1T8GA 111LA 2B70A 1L30A 1L61A 120LA 1LGUA 4OO9A 1L57A 163LA 1L90A 1L33A 1P46A 1G0LA 3C7ZA 4I7NA 1QUHA 2Z6BA 1T8AA 3F9LA 1QT5A 210LA 3OE0A 1T8FA 3QAKA 1XJTA 162LA 1L85A 1P2RA 2OTZX 1L89A 1L20A 4I7MA 3LZMA 185LA 1ZYTA 4DKLA 1L74A 1DYAA 4EPIA 127LA 1LWKA 1L54A 1C6DA 4EPFA 1L92A 258LA 3DMZA 1QT8A 3V2WA 3UONA 1QT3A 1DYGA 1L00A 2OU0X 3V2YA 3HH5A 232LA 2F32A 1CU5A 1L18A 2B72A 2OE7X 2RAZX 1SSWA 3VW7A 3GULA 2HUKA 143LA 229LA 1L52A 1L65A 4W56A 255LA 3F8VA 1C60A 242LA 1C6MA 236LA 4EXMA 2RAYX 3HDFA 3HUKA 3C8SA 1EPYA 125LA 1SSYA 1CV0A 168LA 1L25A 1LI3A 3C83A 1CV1A 3DN0A 228LA 1P2LA 1QTVA 3GUPA 1CU0A 1L0KA 3NY9A 247LA 1D3NA 164LA 1L06A 181LA 4LDEA 1L17A 260LA 4ZPUA 4LDLA 3GUKA 1L03A 1C61A 248LA 2O4WA 3G3XA 234LA 4I7PA 4I7RA 1L99A 1L88A 1OWYA 1QTCA 1L41A 161LA 171LA 141LA 253LA 183LA 1ZWNA 1L55A 2HUMA 177LA 1C6IA 178LA 1C6CA 1DYEA 1C6AA 1LWGA 220LA 131LA 3OE8A 1L34A 1SWZA 4I7QA 3HT7A 180LA 1K28A 226LA 3G3VA 2LZMA 2RBOA 213LA 4EKRA 137LA 3HTDA 1KS3A 262LA 1D3JA 2B73A 195LA 3PBLA 230LA 1PQKA 3C80A 1L27A 1L98A 1LYFA 3DN4A 2NTHA 1QTBA 4I7KA 240LA 1L84A 1L22A 1L83A 3HH6A 1L53A 1L39A 4K5YA 114LA 1L93A 1L51A 1LYGA 3D4SA 1P6YA 4W58A 3HTBA 126LA 222LA 4DJHA 4I7LA 1QS9A 1L87A 1LYIA 3HH3A 1L79A 218LA 2OE4X 214LA 148LE 1L26A 1LYDA 1L60A 2IGCA 3HU9A 227LA 4LZMA 3L64A 1L97A 4W55A 2B6YA 2RB2X 140LA 1OYUA 7LZMA 216LA 3CDRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4GN3A 3HDEA 1JSFA 3DMXA 206LA 122LA 1CU3A 1QTDA 1LMOA 6LZMA 4B4EA 3SB6A 4E3UA 1JTPL 4N5RA 2MEIA 5LVGA 1DI3A 1G0KA 4ARQB 1WQPA 1L01A 245LA 1L45A 4L41A 4N1CC 1DYBA 123LA 244LA 3C7YA 2ZILA 4I8SA 1L82A 1WQRA 3AB6A 1IOQA 261LA 1LMTA 2RB0X 1PZYA 3CDTA 1HENA 3FA0A 1B7SA 1JTTL 4RW1A 6LYZA 1IP1A 5KXMA 3D3DA 3HTGA 1CU6A 1L35A 1CTWA 1JHLA 1QTHA 4H9IA 3AW7A 2N5ZA 3WUNA 152LA 1B0DA 1L13A 2D4IA 104LA 1IC5Y 5LVHA 3GUJA 1SX7A 191LA 3AZ4A 133LA 5DN5A 3SB9A 1C66A 2BLXA 2OU9A 2CGIA 4D9ZA 1LJJA 1G06A 1YKYX 2I6ZA 1UC0A 3WYHA 1L40A 5LIOA 246LA 110LA 1FLQA 1QS5A 1LHMA 5DN4A 3NYAA 1CV6A 2C8OA 1L63A 215LA 2MEDA 4DWXA 4UWNA 1LYYA 3TMXA 1P7SA 2DKVA 2W1YA 2BQNA 3A95A 1B9OA 3WVYA 3RW8A 2HEAA 1D2YA 1L67A 3GUMA 4XADA 1BB3A 3FI5A 5KXSA 155LA 4YM8A 1QDRA 1JKCA 3CQLA 4XJDA 4EKSA 4WM1A 3DMVA 1C64A 3PDSA 2G4NA 4BS7A 5KXWA 1G1VA 1LZ5A 3CSZA 4W57A 2OE9X 3WU8A 4LFXA 4TSCA 3EMLA 1VATA 1REMA 3HFMY 1QSQA 2O7AA 1NKHA 3ZVQA 217LA 4GRVA 1LSNA 4R0FA 1SWYA 1XEPA 3DKEX 107LA 4G4HA 1L75A 3FADA 1GE1A 4HTNA 3AZ7A 5KXKA 4MR1A 4LFPA 1QUSA 4S0WA 1TLAA 5B59A 1RJCB 4J1AA 1A2YC 4W51A 158LA 1T97A 2Q9DA 9LYZA 1BQLY 1XEKA 4DD3A 4EJ4A 243LA 184LA 1L68A 3DNAA 1E8LA 1L94A 1PS5A 1LGXA 1L07A 172LA 1YL1X 2Z19A 1REZA 170LA 1LSEA 2QARC 1L04A 2Q9EA 4NGJA 4I7JA 1OV5A 1YANA 4XN6A 2H5ZA 197LA 4O34A 1CKDA 1C6KA 1CJ7A 2Z2EA 1GEZA 115LA 4OWEA 211LA 1C6NA 4PK0A 1IP3A 1C6FA 1C6EA 1IC4Y 241LA 1LYSA 5IELA 2DQIY 4PRQA 1J1PY 1EQ5A 5IHGA 5I5QA 1CUQA 1GF0A 2RBRA 1CUPA 1FBIX 4H9EA 1L46A 1P36A 1C46A 129LA 5D5CA 2D4KA 3IJUA 1JWRA 1JKDA 1G0PA 4ETBA 1GHLA 1L15A 2RBPA 4DDCA 1BB6A 111LA 1N4FA 3P66A 1LGUA 4AXTA 1LMCA 3EO5A 1IR7A 1L33A 1G7JC 1W08A 3A94A 5APFA 1G0LA 1DQJC 3C7ZA 1QUHA 2BQBA 1B7NA 3F9LA 4NHIA 1QT5A 4A7DA 1T8FA 3QAKA 1XJTA 5I4YA 1QQYA 1L85A 2ZNWY 2OTZX 3N9AA 4NGZA 1L89A 1L20A 4NHSA 2EKSC 4ZIXA 1LJKA 4H1PA 3LZMA 1YAPA 127LA 1LMNA 1GXXA 1L92A 3DMZA 3N9CA 1YIKA 5A3EA 2BLYA 4NSJA 2MEEA 1AM7A 3GULA 2HUKA 4J0LA 1L52A 1L65A 4DQJA 5LYMA 3F8VA 1C6MA 1G7MC 2BQLA 3WU7A 1LTMA 3TMUA 2ZIJA 2BPUA 164LA 1WQOA 3B6LA 181LA 4LDEA 4ZPUA 1NMMA 1BWHA 3MGWA 4N1EI 4I7PA 1DKJA 1L88A 1OWYA 1LSPA 1LSAA 1QTCA 1BWIA 1FLWA 4CHXA 1JITA 161LA 3KAMA 1FN5A 1C6AA 4NGYA 135LA 131LA 2DQGY 1GEVA 4YEMA 4Z41A 3HT7A 180LA 1LZEA 1B7OA 2A7FA 3A8ZA 4WLYA 4EKRA 3B0IA 4NY5A 3GXRA 2B73A 230LA 1L98A 1DI4A 1UUZC 1L22A 3LYMA 5KKIA 3WULA 1L39A 3W6BA 4H9AA 1REXA 4WLTA 4PRUA 222LA 4DJHA 3TXJA 1XGPC 1L87A 3HH3A 3A92A 4B49A 3AGIA 218LA 1LMPA 1LJNA 227LA 4DDBA 2RB2X 153LA 1HNLA 3CB7A 3TXGA 3LN2A 6LYTA 3CSRA 1P5CA 4GN5C 252LA 1KIRC 4HPIA 157LA 3W3EA 1C08C 1CKGA 4NSHA 3HU8A 1LYZA 5EBHA 1DYDA 1D9WA 3OE9A 3AZ5A 1D6PA 103LA 1LZ4A 3SN6R 2BQGA 1LZAA 1LJ4A 1GD6A 1Z55A 3TMWA 1HEMA 4LDOA 1IP5A 1G0QA 3A6CY 1O23A 190LA 3CDQA 1C6BA 1KIQC 2YVBA 3A34A 1YAQA 4ETCA 3DN2A 5B05A 5FHWA 1KY0A 1L80A 4RW2A 5LXWA 1VDSA 2H9KA 1JISA 1P56A 109LA 1ALCA 237LA 4J1BA 2RB1X 225LA 3SP3A 4DD0A 1HMLA 5KXYA 3HWLA 5KXPA 4G49A 4GCEA 1P37A 235LA 1C6LA 1LZNA 3HBDA 1NDGC 3FI7A 1IWUA 5KXLA 1VDQA 1L32A 3AGGG 2B6WA 2HEDA 1L95A 2RSCA 2OTYX 1QTEA 2C8PA 5LA8A 118LA 1HSWA 5FCPA 4FDYA 4HTKA 5DLAA 1DZBX 3ULRA 1YKXX 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4GN3 A;  3HDE A;  1JSF A;  3DMX A;  206L A;  122L A;  1CU3 A;  1QTD A;  1LMO A;  6LZM A;  4B4E A;  3SB6 A;  4E3U A;  1JTP L;  4N5R A;  2MEI A;  5LVG A;  1DI3 A;  1G0K A;  4ARQ B;  1WQP A;  1L01 A;  245L A;  1L45 A;  4L41 A;  4N1C C;  1DYB A;  123L A;  244L A;  3C7Y A;  2ZIL A;  4I8S A;  1L82 A;  1WQR A;  3AB6 A;  1IOQ A;  261L A;  1LMT A;  2RB0 X;  1PZY A;  3CDT A;  1HEN A;  3FA0 A;  1B7S A;  1JTT L;  4RW1 A;  6LYZ A;  1IP1 A;  5KXM A;  3D3D A;  3HTG A;  1CU6 A;  1L35 A;  1CTW A;  1JHL A;  1QTH A;  4H9I A;  3AW7 A;  2N5Z A;  3WUN A;  152L A;  1B0D A;  1L13 A;  2D4I A;  104L A;  1IC5 Y;  5LVH A;  3GUJ A;  1SX7 A;  191L A;  3AZ4 A;  133L A;  5DN5 A;  3SB9 A;  1C66 A;  2BLX A;  2OU9 A;  2CGI A;  4D9Z A;  1LJJ A;  1G06 A;  1YKY X;  2I6Z A;  1UC0 A;  3WYH A;  1L40 A;  5LIO A;  246L A;  110L A;  1FLQ A;  1QS5 A;  1LHM A;  5DN4 A;  3NYA A;  1CV6 A;  2C8O A;  1L63 A;  215L A;  2MED A;  4DWX A;  4UWN A;  1LYY A;  3TMX A;  1P7S A;  2DKV A;  2W1Y A;  2BQN A;  3A95 A;  1B9O A;  3WVY A;  3RW8 A;  2HEA A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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