1I6SA

T4 lysozyme mutant c54t/c97a/n101a
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALIAMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Structural and thermodynamic analysis of the binding of solvent at internal sites in T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2001-03-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1i6sA00
4ARMB 3OE6A 140LA 1DYBA 1T6HA 1C64A 1L02A 1C63A 1LGXA 3HTGA 1JQUA 118LA 3CDRA 1L62A 1SWYA 262LA 5I14A 255LA 2B7XA 4AQNA 2OU9A 2RB2X 1L63A 176LA 110LA 2B6WA 1L96A 245LA 216LA 3G3WA 129LA 1QUHA 2B70A 3C7WA 3CDQA 246LA 163LA 1CV5A 1DYGA 260LA 164LA 3C83A 1QTBA 131LA 1C66A 2B6ZA 1C6PA 1P2RA 1C6HA 1PQKA 1QTCA 3SB7A 1L43A 2OU8A 1JTMA 2O4WA 2IGCA 1L42A 123LA 2OE9X 1LPYA 3C81A 1L52A 4I7TA 1C67A 139LA 1OWYA 212LA 2B73A 3DN8A 234LA 2NTHA 1QS9A 1QT5A 1L18A 2NTGA 5LZMA 150LA 3GUNA 1JTNA 4ARQB 1LWGA 1C6NA 248LA 1L90A 3DN1A 127LA 2O79A 2RB1X 1T8GA 1L80A 130LA 1L54A 251LA 3ODUA 1ZYTA 222LA 1SX7A 1CV3A 3SBAA 1QT8A 3OE9A 195LA 3NYAA 119LA 1L39A 1CU6A 242LA 1XJUA 128LA 4EJ4A 3HUAA 211LA 1L44A 1LYDA 200LA 1L64A 214LA 3V2YA 3SB6A 1LYFA 1L56A 1L84A 229LA 126LA 220LA 3F8VA 1P37A 2B6XA 3HUQA 196LA 2RB0X 174LA 1L23A 1QT6A 4GBRB 2RBNA 1C61A 2HULA 2LCBA 3L2XA 239LA 1L71A 3C82A 217LA 4ARMA 3EMLA 6LZMA 1C6GA 1P7SA 2CUUA 3HH6A 158LA 1CV6A 1QSBA 148LE 4DJHA 2OTZX 1L13A 1L41A 3G3VA 1L66A 4YXAC 169LA 1P46A 1C6AA 3DMXA 2F32A 3QAKA 1LYGA 1QUDA 1P36A 1C6DA 102LA 1L92A 166LA 175LA 1L95A 1QUGA 1C65A 1TLAA 1C6MA 4I7QA 1L67A 3DKEX 1L22A 3L64A 3SBBC 1L07A 182LA 4K5YA 4GRVA 209LA 1L0KA 1L17A 1L48A 1L59A 224LA 3GUKA 7LZMA 162LA 170LA 192LA 1L50A 1L55A 1C6EA 1L70A 3DN4A 1L49A 3HT7A 1L04A 1OYUA 199LA 185LA 4EPIA 1CV0A 1C6QA 198LA 177LA 1OVJA 1QTDA 3C8RA 1L0JA 218LA 2RAZX 2Z6BA 1DYCA 1L47A 4W55A 1L57A 1P3NA 2B72A 2OTYX 1C60A 1SWZA 1CV4A 244LA 2Q9DA 3K2RA 1C6CA 1SSWA 1D3MA 1L06A 1L82A 4I7MA 1L25A 3G3XA 4LDEA 215LA 3C80A 1L87A 3HH3A 4DAJA 4IAPA 1G06A 4W59A 3SB9A 1D3FA 1L79A 3CDTA 3FA0A 219LA 1CV1A 3C7YA 1C69A 1CVKA 183LA 1G0KA 1C6FA 1K28A 1L94A 3HH4A 1KW5A 1QTZA 237LA 3DMZA 1L99A 3DN2A 188LA 253LA 149LA 3FADA 4W57A 1L88A 3DN3A 3GUJA 3VW7A 1LYHA 1G1VA 3C8SA 3HH5A 205LA 125LA 1L69A 167LA 1KY1A 1L98A 235LA 4W52A 1OVKA 1L11A 256LA 3FI5A 1ZURA 143LA 1L75A 3GUOA 107LA 1G0JA 4I7LA 2F2QA 1LGUA 4OO9A 1L45A 1XEPA 1L30A 1I6SA 3HT8A 1LYEA 1B6IA 1L97A 213LA 3SB8A 2RBSA 3GUIA 3SB5A 186LA 1L77A 3DMVA 1QTHA 1L32A 210LA 4EKRA 2O7AA 1KW7A 1CUQA 3DNAA 4EKQA 2QB0B 159LA 3HTFA 1C6BA 4PJZA 1T8AA 109LA 113LA 1WTHA 157LA 1G0QA 1L46A 1G0GA 4ARLA 232LA 2B6YA 1CU0A 1L00A 226LA 1L38A 178LA 2HUMA 1PQJA 3DN0A 1L12A 4ARPA 1L86A 1LLHA 187LA 152LA 1T8FA 3GUMA 1L51A 1XJTA 236LA 4W53A 1L37A 1L20A 201LA 3OE8A 4I7NA 4I7RA 112LA 1L74A 1C6KA 4W51A 1G0LA 3OE0A 171LA 1L19A 2HUKA 252LA 197LA 1L03A 145LA 3HT9A 4ARJA 104LA 2RBQA 120LA 2RAYX 1P2LA 1QT7A 1DYAA 258LA 3C7ZA 1LGWA 165LA 1L31A 1L91A 4ZPUA 2OEAX 1L68A 233LA 122LA 4W58A 2ANVA 1G0MA 1DYEA 151LA 1NHBA 3HTBA 2RH1A 3D4SA 250LA 3JR6A 3CDVA 1QUOA 4I7JA 1G1WA 1ZWNA 1C68A 1CU2A 238LA 3PBLA 1DYDA 240LA 4ARQA 1L72A 261LA 1L15A 254LA 115LA 3CDOA 141LA 3GUPA 4I7SA 1L16A 1L58A 1PQOA 1PQIA 4LZMA 1L60A 1L76A 2L78A 227LA 1C6IA 4E97A 1L29A 1G0PA 1OV5A 3HTDA 137LA 1OV7A 4PK0A 2RBRA 3HWLA 4DKLA 2Q9EA 3C8QA 114LA 172LA 3HDFA 1KNIA 3GULA 1QT3A 3HUKA 146LA 1L28A 1D2WA 1OWZA 1L01A 1P64A 103LA 168LA 3RUNA 1SSYA 1L65A 1LWKA 1D3NA 1L36A 1L93A 4YX7C 108LA 160LA 1LYJA 1CU3A 1L21A 1D3JA 4EPFA 4EXMA 1P6YA 3UONA 1G07A 184LA 1L10A 1L26A 1L08A 1C6LA 173LA 231LA 230LA 1LI2A 2A4TA 223LA 1L33A 2B74A 3F9LA 1L34A 1L27A 221LA 243LA 191LA 2OE4X 138LA 1CUPA 3LZMA 180LA 4EKSA 1L09A 2QARC 1C6JA 1L89A 3DN6A 1L53A 161LA 1L40A 1PQDA 1C6TA 3V2WA 1L14A 2LC9A 4I7PA 1PQMA 259LA 3HU9A 1KS3A 1L61A 225LA 4W56A 2B6TA 1LI3A 4LDOA 3HU8A 190LA 2F47A 1LW9A 3RZEA 1T97A 1L24A 142LA 1P56A 1QTVA 1QT4A 181LA 2OE7X 2LZMA 1CX6A 1CU5A 2OU0X 3NY8A 4YXCA 3NY9A 111LA 4EKPA 1CX7A 1L83A 3PDSA 1QSQA 4LDLA 4W54A 156LA 3HT6A 1D9WA 2RBPA 1QS5A 1L85A 2B75A 189LA 257LA 1LYIA 4S0WA 1L05A 1EPYA 1OVHA 144LA 4I7KA 249LA 241LA 3HDEA 247LA 1L35A 3SN6R 2ANXA 1CTWA 1C62A 1DYFA 1L81A 228LA 206LA 2RBOA 1D2YA 1KY0A 1P5CA 1L73A 1SX2A 1LI6A 4I7OA 147LA 155LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BADA 3A3QA 1DYBA 1QQYA 1T3PA 2BQEA 3HFMY 1LGXA 3CDRA 1RI8B 262LA 4WM6A 5A3ZA 3FE0A 1IP4A 4NHQA 4O34A 2CJLA 1L63A 135LA 2B6WA 1L96A 1P2CC 245LA 3A95A 4OWEA 3C7WA 3CDQA 4TX7A 3CT5A 1LMAA 1GF9A 9LYZA 4LFXA 1QTCA 4TTDA 5LAFA 4XJGA 1IP3A 123LA 1YAOA 1LJHA 4XJHA 3TXJA 234LA 1CKCA 2A7DA 1QT5A 1L18A 2NTGA 1G7LC 1C6NA 4GCCA 1KIPC 1DI3A 5L9JA 1L90A 4RLNA 1T8GA 3T6UA 1ZYTA 222LA 1QDTA 4WM5A 195LA 2Z38A 1IC7Y 3A67Y 6LYZA 4HTNA 3IJUA 4IASA 4FDYA 229LA 1LYOA 220LA 1AT6A 1JPOA 1YROA 5LAGA 1B5VA 1DKKA 3P66A 1VAUA 1YKXX 4Z46A 5FDJA 1C6GA 1F0WA 1LJFA 1CKHA 4CJ2A 3HH6A 2AUBA 5KXNA 1CV6A 1QSBA 148LE 2OTZX 4N5RA 1L13A 1L41A 3G3VA 1L66A 3TMUA 4IJ4A 5F9XA 4XJIA 102LA 4WM3A 4H94A 1B5ZA 1TLAA 4I7QA 3DKEX 1REYA 2H9KA 3SBBC 5I4XA 1L59A 224LA 1LMCA 7LZMA 5I4YA 192LA 5JENB 1L55A 1C6EA 4M4OA 2BQGA 7LYZA 4DD3A 1C10A 2H9JA 2DQHY 3HBDA 1GB5A 198LA 4OWCA 5F16A 3C8RA 2C8PA 5APDA 4W94A 1GFEA 4DQJA 1GXXA 4ANRA 4NGKA 1JJ0A 1RJCB 1SWZA 1V7TA 2D4KA 1GBZA 3C80A 3HH3A 2I25L 3FA0A 219LA 1IWZA 5F81A 1CV1A 1B5XA 1CVKA 1G0KA 1IWWA 1C6FA 1K28A 1LSGA 1GE2A 1HENA 3HH4A 1KW5A 1QTZA 4G49A 2MEFA 237LA 1L99A 5FSTA 1LHMA 4W57A 4LZTA 1L88A 1YIKA 3C8SA 3HH5A 4WO9A 205LA 125LA 4KPMA 1AT5A 1L11A 3W6CA 1ZURA 143LA 1L75A 1GE1A 4NHPA 2A7FA 1O23A 5KXXA 1XEPA 1I6SA 3TXGA 3WU8A 1LYEA 1QUSA 4MR1A 5KXWA 3AZ5A 186LA 1GF7A 3DMVA 2BQNA 5APFA 4EKRA 1GFHA 3DNAA 1IY4A 3RU5A 1GHLA 5LVKA 1QDRA 159LA 3HTFA 4PJZA 1LHLA 1G0QA 1L46A 1UBZA 1ZMYL 232LA 2BQKA 4NGLA 1L00A 178LA 2N5ZA 1PQJA 3M18B 1JSFA 1JJ1A 134LA 4NIJA 236LA 1L37A 4PJ2C 1GE3A 112LA 1L74A 3OE0A 3MGWA 252LA 145LA 1VDTA 1IP1A 1P2LA 5FELA 3J4GA 165LA 1L31A 4TSBA 1GAZA 2OEAX 3WUAA 4C3WA 1VEDA 1J1OY 1G1WA 261LA 1L15A 1FKQA 2DQGY 1A2YC 1L58A 1HFYA 1PQOA 4DD1A 1LSEA 1DZBX 1L60A 1QSAA 1VDPA 4N0JA 4DQ5A 1OV7A 3WU9A 2CGIA 5K7OA 1UIEA 1REXA 3T36A 4OWHA 3A3RX 1QT3A 4LT2A 146LA 1D2WA 5ILCA 1L01A 1P64A 3EO5A 1CJ6A 1HEPA 3RUNA 1LJNA 4WLYA 1LZ5A 1LWKA 3P64A 1L36A 4Z98A 1INUA 1L93A 1B5YA 108LA 1I1ZA 1L21A 2I26L 4XN6A 3UONA 4DD0A 1LHHA 1L10A 1L08A 173LA 231LA 4ET9A 1GFTA 1LJ3A 223LA 1L33A 5B07A 1WQMA 221LA 2Z37A 3A6CY 2OE4X 1CUPA 4AXTA 1L09A 5DM9A 3WW6A 1C7PA 2DKVA 1DQJC 2LZ2A 1L53A 4HSFA 1IP2A 1C6TA 5HNLA 4OWBA 5LA8A 4I7PA 1B7MA 4UWUA 225LA 4W56A 1LYZA 3CB7A 1B5UA 3TXBA 4LDOA 2F47A 1LHJA 3RZEA 4L41A 1YANA 1REMA 1QTVA 1CX6A 3NY9A 4EKPA 4LYZA 1L83A 156LA 3HT6A 1IP6A 1GB2A 1QS5A 2RBPA 1L85A 2BLYA 3D3DA 1UCOA 1CJ9A 1GFVA 5KXYA 1FDLY 4YF2A 247LA 1GBSA 1L35A 2BAAA 1C62A 3LN2A 1YL1X 5KJ9A 228LA 1KY0A 2BQBA 4Z3MA 1LJIA 1LZRA 1JIYA 140LA 1T6HA 1C63A 1JQUA 2EIZC 4HJYA 1GFJA 1SWYA 4B49A 1GB3A 4R0FA 3ATOA 5I14A 5L3HA 2B7XA 1GWDA 2F4AA 5L3IA 2OU9A 4YEOA 2RB2X 110LA 4XJDA 4Z41A 3G3WA 208LA 1EQ4A 129LA 1QUHA 1WQNA 1FKVA 3QE8A 4WMGA 4NSIA 4NGVA 1CV5A 2D91A 2DQCY 1UIDA 4R6CA 5I54A 1LMNA 3P65A 1ZVYB 2B6ZA 1P2RA 1C6HA 1L43A 2OU8A 5M1YA 2O4WA 153LA 4X3BA 1L52A 4DYGA 3BKVA 4MSTA 5J7CA 5C6LA 139LA 1OWYA 1EL1A 2NTHA 2H5ZA 1GB9A 2BQOA 2BQAA 1GXV2 1LZCA 1LCNA 5A3EA 4WM4A 3W3EA 150LA 3GUNA 1WTNA 1LWGA 1IC5Y 127LA 1L80A 1L54A 4DWXA 4ETEA 1SX7A 1CV3A 4N9RA 5DLAA 128LA 2FYDA 4NGZA 1AM7A 1L44A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4BAD A;  3A3Q A;  1DYB A;  1QQY A;  1T3P A;  2BQE A;  3HFM Y;  1LGX A;  3CDR A;  1RI8 B;  262L A;  4WM6 A;  5A3Z A;  3FE0 A;  1IP4 A;  4NHQ A;  4O34 A;  2CJL A;  1L63 A;  135L A;  2B6W A;  1L96 A;  1P2C C;  245L A;  3A95 A;  4OWE A;  3C7W A;  3CDQ A;  4TX7 A;  3CT5 A;  1LMA A;  1GF9 A;  9LYZ A;  4LFX A;  1QTC A;  4TTD A;  5LAF A;  4XJG A;  1IP3 A;  123L A;  1YAO A;  1LJH A;  4XJH A;  3TXJ A;  234L A;  1CKC A;  2A7D A;  1QT5 A;  1L18 A;  2NTG A;  1G7L C;  1C6N A;  4GCC A;  1KIP C;  1DI3 A;  5L9J A;  1L90 A;  4RLN A;  1T8G A;  3T6U A;  1ZYT A;  222L A;  1QDT A;  4WM5 A;  195L A;  2Z38 A;  1IC7 Y;  3A67 Y;  6LYZ A;  4HTN A;  3IJU A;  4IAS A;  4FDY A;  229L A;  1LYO A;  220L A;  1AT6 A;  1JPO A;  1YRO A;  5LAG A;  1B5V A;  1DKK A;  3P66 A;  1VAU A;  1YKX X;  4Z46 A;  5FDJ A;  1C6G A;  1F0W A;  1LJF A;  1CKH A;  4CJ2 A;  3HH6 A;  2AUB A;  5KXN A;  1CV6 A;  1QSB A;  148L E;  2OTZ X;  4N5R A;  1L13 A;  1L41 A;  3G3V A;  1L66 A;  3TMU A;  4IJ4 A;  5F9X A;  4XJI A;  102L A;  4WM3 A;  4H94 A;  1B5Z A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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