1IP1A

G37a human lysozyme
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESAYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords LYSOZYME C
publication title Role of amino acid residues in left-handed helical conformation for the conformational stability of a protein.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 52
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2001-04-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1ip1A00
4TX7A 2LHMA 1CKGA 5A3EA 3EBAB 4HTQA 4XJBA 2H5ZA 1HSWA 1LJFA 1UIFA 4H9AA 4NHTA 1JUGA 1EQ5A 1GPQC 1NWGA 1GEZA 1OUAA 1B7SA 1HEPA 1FLQA 1UICA 1IP7A 1UIBA 2A7DA 2Y8PA 3AZ7A 4ETEA 3RZ4A 3T6UA 1IC4Y 4A7DA 4H9FA 3KAMA 1NMMA 4ML7A 4LGKA 1LJ3A 4ET8A 4G4HA 1BWHA 1OQMA 1E8LA 1GEVA 1DPXA 1GB2A 4P2EA 1CJ9A 5KXMA 5LYMA 4H9CA 2DBTA 3WU8A 2LZ2A 4WM2A 1UBZA 4OWCA 1LHIA 1GB0A 3A92A 4NHPA 1G7IC 4DDBA 1CKFA 1G7JC 1GFAA 1IOSA 1LOZA 4ETCA 4U3XB 1HMKA 4NGIA 1LKSA 1LZTA 3FE0A 4OWEA 4XENA 1ZV5L 1IP4A 1G7MC 1IOQA 1JSFA 4FDYA 1RE2A 2HU3A 4XADA 4R0FA 1OUDA 1JWRA 1LZ9A 1CNSA 2C8OA 1P2CC 3RT5X 3AB6A 2BAAA 5LVJA 1KIRC 3HBHA 3EMSA 1IR9A 1LMCA 1NBYC 1UIGA 6LYZA 4N5RA 4O34A 5FEKA 4Z3MA 4NFVA 1GHLA 1JKCA 2BQFA 2RSCA 1GF8A 4M4OA 1LSYA 1NDMC 3OJPA 4G9SA 4LYTA 2MEIA 3WMKA 5A3ZA 1HERA 4NGLA 5FHWA 1FKVA 2BQOA 1BGIA 1GF4A 4CHXA 4XJGA 1LMQA 1WQNA 1LHLA 1YKYX 3A3QA 4UWVA 2YBJA 3A6BY 5AMYA 3AW6A 2HEBA 3B0IA 3WPLA 1LTMA 2ZNWY 3A8ZA 5DN4A 2HEEA 5C6IA 2CWIA 5KXPA 2BQEA 4N8ZA 1D0LA 1VDTA 1YL1X 1IORA 1GFKA 2LYZA 5HQ1A 1KXWA 2YVBA 1A2YC 1G7LC 4HV2A 4PPOA 2BQNA 1YQVY 1LMPA 1NHEA 1JJ0A 2BQKA 1HC0A 1YAQA 1GXXA 1V7TA 1F0WA 5IELA 3WVYA 5T3FA 4ZFPA 4TUNA 1RJCB 2HU1A 5B05A 4ZIXA 3A96A 4MCKA 4OWBA 2ZILA 5KXOA 5DN5A 1WQQA 5HLLA 4GCCA 1IX0A 1DPWA 5B59A 1AZFA 4II8A 3W6EA 2CJLA 3AGIA 1GBZA 1GWDA 2X0AA 1B7RA 2CGIA 2Z2FA 4H93A 5L3HA 5LVIA 3W6FA 1LYSA 1ZMYL 2HEDA 4QDNA 1YIKA 1HENA 2FBDA 2CDSA 5LYZA 1LSFA 1IEEA 5M1YA 1PS5A 4NHQA 1B7NA 4OWAA 1BB4A 1LMOA 1BB5A 4YEMA 1TBYA 2D4IA 3AZ6A 3GXKA 1UCOA 3A90A 3VWOA 1JJ3A 1LMAA 3ZVQB 2DQEY 1GBWA 1B0DA 2ZQ3A 2XTHA 3WU9A 1LJ4A 1WTMA 1NF5A 3RU5A 4EMNA 1GF6A 4CFOA 4NG8A 1FLYA 1LJKA 1LMTA 1UIEA 2BQMA 1BB7A 4DD3A 1TDYA 1F6SA 2LZTA 5KXNA 1INUA 5F9XA 2AUBA 1WQPA 4L41A 1FDLY 5B1GA 1BVXA 4NIJA 4HV1A 3WPKA 2BQCA 2G4PA 1J1XY 4G4CA 1BVKC 3EO5A 5C6JA 2YDGA 4OOTA 3BKHA 5LVGA 1OUCA 4DD9A 1C08C 1JKAA 3RNXA 4WOAA 1A4VA 1GB6A 1GE4A 1B5VA 1LHMA 1OUEA 3WXTA 5APFA 5KY1A 4GN5C 1OUIA 4B4JA 4B0DA 5LIOA 4B49A 1GF7A 3LN2A 4H8ZA 1QTEA 2PC2A 1LSCA 4R6CA 1GF3A 4H9IA 5FDJA 4XYYA 1LCNA 4QY9A 2FYDA 1UIHA 1XSFA 3AJNA 4AGAA 1W08A 1YKXX 2BQHA 2BQGA 4HJVA 1LJIA 5KXXA 1GF5A 1EQ4A 3ATOA 5I4YA 3AGHA 1GFTA 1LHKA 1W6ZA 2D4KA 2DQGY 3B6LA 3TXJA 1DI3A 1I20A 1KXXA 1I1ZA 1T3PA 2MEEA 2ZIJA 133LA 1LYZA 1BWIA 1VATA 1ALCA 2DQIY 1LZ5A 2IFFY 2ZYCA 1YAPA 3HBDA 1YKZX 1WTNA 4KPMA 1IWUA 2NWDX 5F81A 2GV0A 1GB3A 1JTTL 4XJFA 1LKRA 1TCYA 3WUNA 134LA 1YAOA 4WG7A 4DDAA 1LSNA 4QGZA 4EOFA 1VDSA 4DDCA 208LA 1CKCA 1HNLA 2D6BA 4CJ2A 3W6AA 4C5FA 1C46A 2MEFA 5KJ9A 5I54A 3TMWA 4FJRA 4NSGA 5K7OA 4LYZA 2F30A 1RI8B 1C10A 1QUSA 3A91A 1WQOA 4LT0A 3ZEKA 1GE0A 1UIAA 2Q0MX 3P64A 3W3EA 4GCDA 3TXDA 2D4JA 4ETDA 5FCPA 3W6BA 2YBHA 5KXSA 4TTDA 4TWSA 5LAFA 1MELL 2XJWA 1QQYA 3LYMA 3RW8A 1IOCA 1GFUA 1DQJC 1WQRA 2ZYPA 2DQFC 1IP5A 1HF4A 1UACY 4B4IA 2MEDA 3A95A 4GLAA 5LYTA 1GFEA 1GB8A 3WPJA 1G7HC 1GFVA 3ATNA 1H87A 4YENA 1FLWA 3CQLA 5IDDA 4DD7A 1LJHA 1GF9A 1JHLA 3P65A 5KXWA 3QNGA 4BS7A 4H9BA 4IASA 5APEA 1ZVYB 4NHSA 4YF2A 2Z2EA 1GF0A 193LA 1NQIA 2C8PA 5F9UA 3EXDA 1OUHA 3AGGG 3D3DA 4HTKA 3ZVQA 1VAUA 2LYMA 1IVMA 1DZBX 4NGZA 1LZNA 4WO9A 4BAFA 1D0MA 1GFGA 1GBXA 4ETAA 207LA 5I4WA 1JTOL 2F4AA 1IR7A 3CSQA 4LYBA 5HMVA 1B5YA 2BLYA 1H6MA 1BB6A 2BLXA 2EQLA 3N9EA 4WMGA 1NDGC 4WLXA 1LJJA 4MSTA 1XGQC 4WLTA 2IHLA 1LZGA 1CJ8A 1LZDA 2HEAA 132LA 4H91A 3SP3A 1J1OY 3E3DA 8LYZA 2MEBA 1IP1A 4LZTA 5KKIA 1LHHA 1IWWA 2BQAA 3N9CA 1IWVA 2ZNXY 1NKHA 4WG1A 3WU7A 4NY5A 4H1PA 4RW1A 1LSZA 4TSCA 1B7LA 4GN3A 1KIPC 1IO5A 1IP6A 4W94A 1PZYA 4LT1A 1LYYA 2BQIA 5KXKA 4C3WA 3D9AC 3TXBA 2DQHY 1LZYA 4LYCA 3P66A 3TXHA 1C43A 4LYOA 5E9RA 5F14A 2I6ZA 4UWNA 4YOPA 1GAYA 3TMVA 5KXTA 4DYGA 1B5XA 1CJ6A 1XEIA 2N5ZA 1HSXA 1CJ7A 3QE8A 4NSHA 1OP9B 1IP3A 1LZEA 1B5UA 1DI5A 1OUGA 1XGRC 2YBMA 6LYTA 1JPOA 5LVHA 1B7PA 1IWXA 3B0KA 5LAGA 1DXJA 1BB3A 4CGEA 4B4EA 1AT6A 1FLUA 1LSMA 1GFHA 1GBOA 4D9ZA 1WVVA 2YBLA 1UUZC 4RW2A 5B07A 1WQMA 5KKJA 3AZ5A 4X3BA 1GE2A 4AXTA 5ILFA 4PRQA 3CSRA 2F2NA 4NSIA 2G4QA 4RLNA 3A34A 4LT3A 4XN6A 4E3UA 1GE3A 2MECA 2EKSC 4H94A 4H8YA 5APDA 4Z46A 2YBIA 3J4GA 5B1FA 3WULA 5L3IA 1GB9A 3LYTA 3A67Y 4WM6A 5DM9A 3P4ZA 1HHLA 1LSGA 4IATA 1GE1A 4WL6A 2VB1A 4GCBA 4DWXA 4ANRA 1QUTA 153LA 2Z12A 5HMJA 1AT5A 1LJEA 1IWYA 4DD2A 2W1YA 3TXFA 4KL7A 2I26L 1IWTA 1OUJA 1LZ1A 3MGWA 1REYA 1IC7Y 1XEJA 1VDPA 2XBRA 1JITA 3QY4A 3A6CY 1LZ6A 3TXIA 1VFBC 2DQCY 1D0KA 1YROA 1DI4A 2MEHA 4KXIA 1B5ZA 4N1CC 1HELA 3TXKA 1HEOA 2XBSA 5C6LA 1HFYA 1LZCA 1HMLA 4NWHA 4W96A 3LZTA 2EIZC 4HJYA 2W1XA 2F4GA 1GFJA 1D6PA 1KXYA 1JKBA 2WARA 4GN4A 4HPEA 4WM4A 3B72A 1JJ1A 3B0OA 1IY3A 1HEWA 3G3BB 3ULRA 4G49A 1O23A 3WL2A 1VDQA 1B7MA 3IJUA 1GBSA 4DC4A 1F6RA 1JISA 3LYOA 1YANA 4B1AA 1QSWA 4OWHA 1OUFA 2A7FA 4UWUA 3N9AA 3TXGA 4WLYA 5I5QA 1IOTA 1LYOA 1GDWA 4H9HA 4HTNA 5DLAA 3TMUA 1BWJA 5DL9A 1XEKA 1JEFA 3WVXA 1IWZA 1XFPL 2BQBA 3WXUA 3G3AB 3LHMA 5D5CA 3OK0A 1RFPA 1REMA 1LJGA 7LYZA 3CB7A 4M6DA 1AM7A 4ETBA 2DKVA 1NBZC 4H90A 4NGJA 4HSFA 3AZ4A 4BADA 3AW7A 4ZEEA 4H92A 4H9EA 1TEWA 1IC5Y 3J6KA 4NGYA 4XJHA 3AYQA 4NSJA 5LA5A 4PGJB 1UIDA 5APCA 2LYOA 4NGWA 2I25L 4J1BA 1IIZA 1JIYA 4RLMA 5HNLA 9LYZA 4LFPA 2Z37A 2BQLA 1LAAA 4N1EI 1YL0X 3LZ2A 5EBHA 135LA 194LA 1XGTC 1LMNA 1KIQC 4H8XA 4NGOA 1C7PA 4N9RA 1HEMA 1FN5A 5LA8A 2W1LA 3M18B 3HBEX 1T6VL 1IP2A 4DD1A 5KXRA 2MEGA 4LFXA 1DKJA 4CFPA 3FI7A 3W6CA 1TAYA 4QEQA 1JKDA 5II3A 2HEFA 2G4NA 3A94A 4RDSA 5LINA 4XJIA 154LA 3LYZA 1JSEA 4NGVA 1HFXA 1LSEA 2DQDY 3CT1A 1LHJA 4TSBA 1GBYA 1XGUC 1FBIX 1LSDA 4GCFA 4XJDA 4Z98A 5KXZA 2DQAA 1GDXA 1I56A 1B9OA 1Z55A 3WW5A 1J1PY 2B5ZA 4NWEA 2YSSC 5FELA 4WO6A 4J7VA 2BQJA 2MEAA 1CKHA 3GXRA 4I0CA 2DQJY 4HJZA 1QDRA 4LT2A 4WL7A 1REZA 1SQ2L 3WH1A 1UA6Y 4NG1A 3CSZA 5B06A 2BQDA 1UC0A 1HEQA 1GD6A 1YILA 1GAZA 1V7SA 2W1MA 4LYMA 3TMXA 3CT0A 1BHZA 1CKDA 4PRUA 3IJVA 1N4FA 4J0LA 4WM5A 5E4PA 5JENB 3TXEA 3W6DA 1D6QA 1DKKA 1LZ8A 1JTPL 1LZSA 1GXV2 4NEBA 1B2KA 3P68A 2FYCA 5D5FA 5ILCA 4DD0A 5FSTA 2Z18A 2EPEA 1EQEA 2HUBA 1XGPC 5IHGA 2ZQ4A 4HP0A 4OOOA 1LZBA 4WM3A 1QIOA 1QTKA 4YM8A 5L9JA 3F6ZA 2BPUA 3WUMA 1IR8A 1RCMA 1BQLY 4KT3A 1GFRA 2H9KA 5KXYA 1REXA 1LSBA 2H9JA 1C45A 5I53A 1EL1A 1LJNA 1B5WA 2ZIKA 3WUAA 1B7QA 4GCEA 4GLVA 2FBBA 4IJ4A 3WW6A 4ET9A 2ZWBA 2Z39A 4PJ2C 1IY4A 4OW1A 4G4BA 5J7CA 2D91A 2Z38A 1OUBA 1SLYA 1WVUA 5KXLA 1VEDA 5LXWA 4NHIA 4PHIA 5LVKA 1HFZA 2YBNA 1B7OA 2HTXA 4Z41A 4HPIA 5HNCA 3T36A 3K3TA 1D9UA 3HFMY 1AKIA 1MLCE 3A93A 4J1AA 4DT3A 5I4XA 4MR1A 3WYHA 4NGKA 1QDTA 1LSPA 3A3RX 5F16A 3BKVA 1FKQA 3IWRA 1LSAA 1LZ4A 3CT5A 4I8SA 1F10A 2Z19A 4YEOA 1LPIA 1GB7A 1YAMA 1GB5A 4WLDA 3M3UA 4WM1A 4N0JA 1LZAA 1LZRA 1QSAA 2HECA 1ZVHL 4BAPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2LHMA 1CKGA 3HT6A 4HTQA 1LJFA 1L28A 137LA 1GEZA 1UICA 1HEPA 2Y8PA 1FLQA 4ET8A 2RAYX 4G4HA 1OQMA 1L80A 3GUJA 5KXMA 5LYMA 216LA 4H9CA 3WU8A 2Z6BA 1PQIA 1C63A 238LA 3L2XA 4ETCA 3C83A 1LZTA 1IP4A 1G7MC 4FDYA 2ANXA 1L56A 2RB1X 1JWRA 4I7KA 3HBHA 1L17A 109LA 1LMCA 1NBYC 1UIGA 6LYZA 5FEKA 1GHLA 1JKCA 1GF8A 2MEIA 1L55A 5A3ZA 1HERA 2OE4X 4NGLA 1LMQA 1WQNA 2YBJA 3WPLA 119LA 1LTMA 5C6IA 1L48A 1GFKA 1A2YC 4HV2A 166LA 1LMPA 3C8SA 5T3FA 3JR6A 4ARQB 1L0JA 1DPWA 1AZFA 3LZMA 3AGIA 5L3HA 1L61A 2RBRA 1L42A 2FBDA 5M1YA 1L07A 4OWAA 1LI6A 1P64A 1UCOA 1K28A 1JJ3A 1C6TA 1P37A 2DQEY 1LJ4A 2BQMA 1XJUA 3OE0A 3K2RA 1L27A 2CUUA 4NIJA 5I14A 261LA 225LA 2G4PA 3EO5A 4OOTA 5LVGA 1OUCA 1L62A 1A4VA 1L36A 2B6XA 1DYBA 1OUEA 5APFA 5KY1A 2F2QA 4H8ZA 4DQ5A 1P7SA 4AGAA 1YKXX 2BQGA 1EQ4A 5I4YA 3GUMA 3TXJA 1G0QA 1I20A 1OVHA 4IAPA 1LYZA 1BWIA 3HBDA 4KPMA 1YAPA 2B75A 5F81A 169LA 2NWDX 4I7QA 227LA 3DN3A 3WUNA 134LA 1LSNA 4EOFA 208LA 4C5FA 5I54A 1JTMA 2B73A 4LYZA 234LA 1GE0A 1L81A 4GCDA 5LZMA 262LA 5FCPA 1LWKA 2YBHA 3SB9A 125LA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4TX7 A;  2LHM A;  1CKG A;  5A3E A;  3EBA B;  4HTQ A;  4XJB A;  2H5Z A;  1HSW A;  1LJF A;  1UIF A;  4H9A A;  4NHT A;  1JUG A;  1EQ5 A;  1GPQ C;  1NWG A;  1GEZ A;  1OUA A;  1B7S A;  1HEP A;  1FLQ A;  1UIC A;  1IP7 A;  1UIB A;  2A7D A;  2Y8P A;  3AZ7 A;  4ETE A;  3RZ4 A;  3T6U A;  1IC4 Y;  4A7D A;  4H9F A;  3KAM A;  1NMM A;  4ML7 A;  4LGK A;  1LJ3 A;  4ET8 A;  4G4H A;  1BWH A;  1OQM A;  1E8L A;  1GEV A;  1DPX A;  1GB2 A;  4P2E A;  1CJ9 A;  5KXM A;  5LYM A;  4H9C A;  2DBT A;  3WU8 A;  2LZ2 A;  4WM2 A;  1UBZ A;  4OWC A;  1LHI A;  1GB0 A;  3A92 A;  4NHP A;  1G7I C;  4DDB A;  1CKF A;  1G7J C;  1GFA A;  1IOS A;  1LOZ A;  4ETC A;  4U3X B;  1HMK A;  4NGI A;  1LKS A;  1LZT A;  3FE0 A;  4OWE A;  4XEN A;  1ZV5 L;  1IP4 A;  1G7M C;  1IOQ A;  1JSF A;  4FDY A;  1RE2 A;  2HU3 A;  4XAD A;  4R0F A;  1OUD A;  1JWR A;  1LZ9 A;  1CNS A;  2C8O A;  1P2C C;  3RT5 X;  3AB6 A;  2BAA A;  5LVJ A;  1KIR C;  3HBH A;  3EMS A;  1IR9 A;  1LMC A;  1NBY C;  1UIG A;  6LYZ A;  4N5R A;  4O34 A;  5FEK A;  4Z3M A;  4NFV A;  1GHL A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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