194LA

The 1.40 a structure of spacehab-01 hen egg white lysozyme
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title High-resolution structure (1.33 A) of a HEW lysozyme tetragonal crystal grown in the APCF apparatus. Data and structural comparison with a crystal grown under microgravity from SpaceHab-01 mission.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME
molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
total genus 48
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1995-09-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 194lA00
4M6DA 2G4PA 3A92A 1XEJA 1LZCA 4IASA 5KXYA 5B1GA 5KXOA 2GV0A 3LN2A 3WH1A 4BAFA 3AB6A 5F81A 4XN6A 8LYZA 1LMNA 4WO9A 5LVKA 3ULRA 4W96A 1I56A 2CDSA 3A3QA 1GB5A 4II8A 4WOAA 4WG1A 3QE8A 2MEFA 3ZVQA 6LYTA 2ZNXY 134LA 4PRQA 3WPKA 4QEQA 4NFVA 1IWTA 1UCOA 3LZ2A 2BQFA 2H9KA 1SQ2L 4NHIA 2HUBA 3J4GA 1RE2A 4ZIXA 3QY4A 2EQLA 3AGGG 3MGWA 3WU9A 1DI4A 4CFOA 1FDLY 4H9CA 4H8XA 1QSWA 4H9IA 1XGUC 1HNLA 5F9XA 3WXTA 4ZFPA 1NKHA 1REMA 2HTXA 4XJDA 1ZV5L 1REXA 1BWHA 1XEKA 1GHLA 2ZQ3A 2ZYCA 3WVXA 5E4PA 1UICA 1AT6A 3N9AA 1SLYA 3TMXA 1LZ5A 4X3BA 5L9JA 3AZ5A 1J1OY 1UIFA 4NEBA 3WU8A 3WULA 2MEHA 4PPOA 1IOTA 1CKGA 193LA 1FN5A 1IP5A 2DQGY 1GB2A 2MEAA 4H9EA 1UC0A 4YEOA 3WW5A 4YM8A 1VDPA 1BB3A 1CJ7A 1GE4A 4LYTA 1BB7A 1GB6A 3WUNA 1OQMA 4B49A 1BQLY 4L41A 3GXRA 1HSXA 5LVJA 1NHEA 3AW6A 1G7HC 4GCFA 1JTTL 1LSFA 5I4XA 1OP9B 4H9HA 5FSTA 4KXIA 1LZSA 4DYGA 1GB0A 3LYTA 4NGYA 3IJUA 3D9AC 4OW1A 1BVXA 2RSCA 1LYYA 5F16A 4DC4A 1QQYA 5HMJA 3CT5A 4PGJB 1B7LA 4H9BA 1B5ZA 1IIZA 1NBYC 3A67Y 3TMWA 1QDTA 2C8OA 4RLMA 3F6ZA 1GFHA 3TXEA 1CKFA 2BQJA 4EOFA 1LSEA 1RCMA 2F4AA 1IWWA 1IY4A 1GF7A 1LZGA 2HEEA 194LA 2YBMA 1IP1A 5KKIA 133LA 1DPXA 1LZ4A 2BPUA 1E8LA 4NIJA 3N9CA 2FBDA 5KXLA 1YQVY 1DI5A 2G4NA 5FCPA 1IO5A 1RJCB 1UACY 3WXUA 5LVIA 5F14A 2Z12A 2B5ZA 2YBJA 3FI7A 1UIBA 3A90A 4DDCA 3TMUA 1UIAA 4Z41A 4IATA 1LMQA 1AKIA 1GBOA 1XSFA 2A7DA 2HEDA 1GE2A 4HTQA 3A96A 4LGKA 3ZEKA 1BB5A 3J6KA 1GB8A 5L3HA 3B0OA 3A95A 1LSZA 2ZIKA 2DBTA 5ILCA 1HEQA 3AGIA 1OUJA 4PHIA 3HBDA 1QIOA 1GD6A 1GF0A 153LA 1PS5A 1JTOL 3K3TA 1JSFA 1LJFA 1GFVA 1TEWA 1UA6Y 1IP6A 1GB7A 4LZTA 1G7JC 4NSHA 4OOTA 4XENA 3G3BB 1UUZC 3TXHA 1LZ1A 4GN5C 4DD1A 1LZ6A 3AGHA 2HEAA 1LSPA 1LAAA 4RLNA 5B59A 3WYHA 1KXXA 1HFXA 3A6BY 4N1CC 1RI8B 2MEEA 4XJHA 1VDQA 3WU7A 5A3ZA 5KXSA 4YOPA 4YEMA 4H92A 5IHGA 1GPQC 1HENA 5KXWA 1YAQA 1DQJC 4UWVA 1YL1X 1QTEA 2DQHY 4PRUA 5DL9A 2NWDX 4XJBA 3A8ZA 4HPIA 1JPOA 1C7PA 2YBNA 2BQLA 1CKCA 4GLAA 1HEMA 1IWZA 4WM3A 5HNLA 4DD3A 5I4YA 4XJFA 4HV1A 2D4JA 4LYCA 1UIGA 1B7MA 1GDXA 3P4ZA 1IC5Y 2G4QA 5KXPA 1WQOA 1LZEA 1T6VL 3P66A 1D0KA 3W6EA 4CFPA 4U3XB 4HTKA 1PZYA 2IHLA 4DD2A 1LJHA 4RW2A 3D3DA 2DQDY 1CKHA 4GCCA 4WMGA 2I25L 4GN4A 2DQAA 4ANRA 4BAPA 5II3A 2Z39A 2D91A 5DN5A 4R6CA 1HMKA 1LHIA 1QUSA 1ZVHL 4LFXA 4UWNA 1JHLA 1GFTA 1NMMA 1OUIA 4LYOA 4NGJA 5EBHA 4XJGA 4YF2A 1LMAA 1MELL 1WVUA 1YAMA 1KIRC 1WQRA 1GFRA 1OUCA 3TXJA 5KKJA 1LJKA 2CGIA 4DDAA 2ZQ4A 1IC4Y 4DWXA 2IFFY 2BQDA 1HEOA 1QDRA 1JKCA 3AZ4A 4GLVA 1IOCA 1OUAA 1LTMA 4J1AA 1YL0X 4NSIA 3WPJA 1IY3A 1XFPL 2EKSC 3T36A 132LA 1GF6A 1AM7A 1D6PA 5DLAA 1F6RA 3LYZA 4H9FA 5B05A 5LYZA 1YILA 1CJ6A 4ML7A 1FKVA 2ZNWY 4H90A 3TXKA 1EQ5A 1VAUA 1Z55A 1IWUA 1KXYA 5APDA 4Z46A 5C6JA 3HFMY 4HSFA 5A3EA 4DD0A 1LJGA 1LCNA 1H6MA 1T3PA 1UIDA 6LYZA 5LYMA 4HJZA 1JITA 2BQBA 1WQQA 2Z18A 3T6UA 3W6DA 9LYZA 1IR8A 1LZBA 1LZNA 3KAMA 5LAGA 4LT2A 3B6LA 3RW8A 4NGVA 1QSAA 5F9UA 1TAYA 1LMTA 1DI3A 1JTPL 3TXBA 2DQJY 3EO5A 5LIOA 1OUGA 1BHZA 1FKQA 1GE1A 2CWIA 5C6LA 4OWAA 5LXWA 1F0WA 4WL7A 1C08C 4FDYA 2H5ZA 1NF5A 2EPEA 1H87A 4LYBA 1LZTA 1LJIA 1REZA 4DDBA 4ET8A 4NWEA 5KJ9A 4I8SA 3EMSA 1LZRA 2BLXA 4G4HA 3IWRA 1LSYA 4OWCA 2YVBA 1JSEA 1LHLA 3CQLA 4HJYA 2Z2EA 1G7LC 1XGTC 5I53A 1GBZA 1GFAA 2LZTA 3BKVA 4KL7A 1JISA 4H93A 1BB6A 1GE3A 3W3EA 3QNGA 5LA5A 2DQCY 1LJ4A 2DQEY 2XTHA 5APFA 1GE0A 4G4BA 4UWUA 4OOOA 3LYOA 5KXKA 1B2KA 3ZVQB 1B7RA 1CKDA 1W08A 2HEBA 5D5CA 1TCYA 1B7NA 4MSTA 4WLTA 1IR7A 1GEZA 1ZMYL 2HU3A 1B7PA 2DQFC 4NG1A 1DXJA 1KXWA 4NWHA 4WG7A 1WQPA 2DKVA 4XADA 4WM2A 3VWOA 3A34A 5DM9A 5T3FA 4Z3MA 1B5YA 5JENB 4TX7A 1JKAA 1HFZA 1JJ1A 3M3UA 1FBIX 4YENA 5FHWA 1REYA 1I20A 1IP2A 3WW6A 1LSNA 2BLYA 3RU5A 3WL2A 1VEDA 5KXRA 1LMOA 2CJLA 2YBLA 1FLUA 5B07A 1XGQC 1LKRA 1GF9A 2YBIA 2N5ZA 1B7QA 2BQGA 1AZFA 4ETEA 4NHQA 4ETAA 5E9RA 1IEEA 2BQCA 2BQEA 1ZVYB 4B1AA 3P68A 1LZDA 2BQNA 1WTNA 1BVKC 4G4CA 5LVHA 3SP3A 2ZILA 5APEA 4CJ2A 1LSGA 1CNSA 1F10A 2EIZC 3P64A 4NGWA 2W1LA 4H94A 2Z38A 1N4FA 1CJ9A 1KIPC 1W6ZA 3WVYA 1HHLA 1LPIA 1DKJA 1VDTA 5KY1A 4H91A 1D0MA 1YKXX 1DPWA 4ETCA 1DZBX 1GFUA 1HFYA 4NGIA 3AZ7A 5FEKA 3B0IA 2MECA 4RDSA 2C8PA 4B4IA 1GF3A 1EQEA 4N9RA 1C43A 1JKBA 1YIKA 1A4VA 5I5QA 1B5UA 3A6CY 1YKYX 2XBSA 207LA 1UIEA 4AXTA 2Z2FA 3HBHA 4HTNA 1YANA 4HV2A 4GN3A 2D4IA 4WL6A 3ATOA 4DT3A 5L3IA 1B7OA 4KPMA 4NY5A 1IWXA 1LSBA 1XGRC 5KXNA 1WQMA 1LJJA 135LA 1RFPA 208LA 1NBZC 3LZTA 4IJ4A 4LT1A 4WM4A 2A7FA 2BQAA 4WM6A 5DN4A 2BAAA 1LJEA 4G9SA 3BKHA 4H9AA 3A94A 1C10A 4NHPA 4DD9A 5KXMA 3TXIA 1LZYA 1B7SA 1JJ0A 4HJVA 1IR9A 2LYMA 1GB9A 1GF8A 1O23A 3RNXA 2YBHA 2BQOA 5LVGA 2VB1A 4TTDA 1HSWA 3ATNA 4XYYA 3WMKA 4MR1A 1F6SA 3OJPA 3W6AA 1EQ4A 4ETDA 1V7SA 4NGKA 2FYDA 1B5VA 2H9JA 2BQIA 4C5FA 4ET9A 1IP7A 3AJNA 1OUFA 4LYZA 4NHSA 3CB7A 1JKDA 1LHKA 154LA 4NGZA 3RT5X 1YAOA 1NWGA 4LT0A 5KXZA 1GBWA 1LHMA 2ZYPA 4QDNA 1FLQA 3AW7A 1IOQA 1P2CC 2D6BA 4GCBA 4N1EI 4B4EA 1BGIA 3A3RX 1IWYA 2YSSC 4WLYA 4XJIA 5M1YA 1JWRA 1UBZA 2I6ZA 1LMPA 1LJNA 3LYMA 4H8YA 4TSBA 1GFGA 4WLXA 4AGAA 1OUEA 1NQIA 3FE0A 1LOZA 1D6QA 4HPEA 2LHMA 1NDGC 4HP0A 5APCA 2WARA 2YDGA 4H8ZA 4CGEA 2XJWA 1LSDA 4OWEA 3LHMA 1BWJA 1GB3A 1GEVA 1TBYA 1EL1A 5IDDA 4B4JA 2Y8PA 3P65A 1YKZX 4FJRA 5LA8A 1GAZA 5HLLA 2F4GA 3IJVA 3AYQA 1YROA 1ALCA 4LYMA 4O34A 2FYCA 4NG8A 4PJ2C 1IX0A 3W6BA 1HEWA 1HERA 1YAPA 1OUBA 3B72A 4WM5A 1C46A 1JJ3A 2HECA 5J7CA 2MEBA 2FBBA 1XGPC 3B0KA 1LYOA 1GWDA 5LINA 1JUGA 1FLYA 1JIYA 3N9EA 2Z19A 4A7DA 7LYZA 1WTMA 1CJ8A 1LKSA 4GCDA 1B9OA 2D4KA 4ETBA 2Q0MX 2HU1A 5K7OA 4LFPA 1J1XY 1NDMC 4J7VA 4NSGA 3EBAB 3OK0A 5B1FA 4M4OA 1GXXA 5I54A 5KXTA 2F30A 1INUA 1HEPA 3W6FA 1V7TA 1HF4A 1LZ9A 3AZ6A 3CSRA 1OUHA 1IOSA 1IC7Y 1QUTA 2LYOA 3W6CA 4EMNA 3RZ4A 1GBYA 1GBSA 2MEGA 1KIQC 2BQHA 2W1MA 4BS7A 1MLCE 4ZEEA 4WLDA 4N5RA 4NHTA 4N8ZA 4TSCA 5AMYA 1D0LA 1LSCA 5FELA 4BADA 2XBRA 3WUMA 3M18B 4J1BA 1DKKA 1GDWA 2HEFA 1IP4A 2W1XA 4B0DA 4D9ZA 1LZ8A 4NGOA 4LT3A 1GAYA 1LHJA 1HC0A 1LZAA 4N0JA 4KT3A 4NSJA 1VATA 3TXDA 2BQMA 3E3DA 5HMVA 1GF4A 3WPLA 1GFKA 2AUBA 3CSQA 3CT0A 3CT1A 3HBEX 1VFBC 1IWVA 1I1ZA 1UIHA 4J0LA 1WQNA 4WM1A 5B06A 2I26L 2LZ2A 5LYTA 4Z98A 1LJ3A 5FDJA 1IP3A 1C45A 4I0CA 1GFJA 1J1PY 3A91A 4DD7A 4W94A 1BB4A 3G3AB 2X0AA 2ZIJA 4OWHA 4RW1A 1JEFA 1OUDA 4E3UA 4P2EA 4R0FA 1LHHA 3TXGA 5I4WA 4TWSA 4WO6A 1IVMA 3CSZA 1FLWA 1B5WA 1VDSA 5HQ1A 1A2YC 4OWBA 4H1PA 2DQIY 1AT5A 2MEDA 1TDYA 4C3WA 2ZWBA 4TUNA 1BWIA 5KXXA 1D9UA 4CHXA 1HMLA 2PC2A 1B0DA 2W1YA 4MCKA 1G7IC 2F2NA 4QGZA 1GBXA 1XEIA 5D5FA 5C6IA 3TMVA 5ILFA 1GFEA 1LMCA 5HNCA 4GCEA 2Z37A 1WVVA 1LSAA 3EXDA 4QY9A 5IELA 3WUAA 1GXV2 4G49A 2MEIA 3GXKA 1LYZA 1LYSA 1G7MC 1LSMA 1QTKA 1GF5A 4NGLA 5LAFA 1B5XA 1HELA 3TXFA 3A93A 2BQKA 1IORA 2LYZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3C8SA 3A92A 4ARMB 5KXYA 5B1GA 1CU5A 2GV0A 3LN2A 3CDRA 4WO9A 3A3QA 4II8A 2MEFA 3ZVQA 241LA 1UCOA 3LZ2A 168LA 4H8XA 4H9CA 1P6YA 1G1VA 1REMA 2HTXA 1REXA 1XEKA 1AT6A 1LZ5A 1G07A 3WU8A 4PPOA 1L74A 2LC9A 3CDTA 1BB3A 3OE0A 1BB7A 1GB6A 4B49A 1L69A 1NHEA 1G7HC 137LA 4DYGA 1XJUA 4EKRA 1BVXA 234LA 2RSCA 3RZEA 1C69A 1KNIA 1B7LA 1L67A 1B5ZA 1IIZA 1NBYC 261LA 1QUHA 1CKFA 4EOFA 1L03A 1IWWA 1GF7A 5KKIA 3DMVA 1DPXA 1L14A 2BPUA 184LA 2FBDA 2NTGA 3WXUA 5LVIA 5F14A 2YBJA 1EPYA 4DDCA 3TMUA 1AKIA 1GBOA 3A96A 1GB8A 5L3HA 2ZIKA 4ARMA 153LA 1JTOL 1GB7A 2L78A 4LZTA 1G7JC 4NSHA 1LZ6A 4RLNA 3WYHA 3A6BY 1RI8B 166LA 111LA 1SX7A 1HENA 200LA 1DQJC 1YL1X 2DQHY 5DL9A 3FA0A 160LA 1IWZA 2B6YA 5I4YA 4XJFA 1IC5Y 2G4QA 4W51A 1CV4A 1T6VL 4I7OA 4HTKA 4U3XB 4DD2A 4WMGA 1CKHA 4ANRA 112LA 1L22A 1HMKA 1LHIA 1ZVHL 1NMMA 1OUIA 4XJGA 3GUPA 4YF2A 1LMAA 1GFRA 3TXJA 5KKJA 1LJKA 2CGIA 4DDAA 1XEPA 2ZQ4A 4DWXA 1HEOA 1IOCA 1OUAA 145LA 1YL0X 1QSBA 1XFPL 2B6ZA 1D6PA 246LA 3LYZA 107LA 1TLAA 3SBBC 126LA 5A3EA 1UIDA 5LYMA 1L86A 2BQBA 2Z18A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4M6D A;  2G4P A;  3A92 A;  1XEJ A;  1LZC A;  4IAS A;  5KXY A;  5B1G A;  5KXO A;  2GV0 A;  3LN2 A;  3WH1 A;  4BAF A;  3AB6 A;  5F81 A;  4XN6 A;  8LYZ A;  1LMN A;  4WO9 A;  5LVK A;  3ULR A;  4W96 A;  1I56 A;  2CDS A;  3A3Q A;  1GB5 A;  4II8 A;  4WOA A;  4WG1 A;  3QE8 A;  2MEF A;  3ZVQ A;  6LYT A;  2ZNX Y;  134L A;  4PRQ A;  3WPK A;  4QEQ A;  4NFV A;  1IWT A;  1UCO A;  3LZ2 A;  2BQF A;  2H9K A;  1SQ2 L;  4NHI A;  2HUB A;  3J4G A;  1RE2 A;  4ZIX A;  3QY4 A;  2EQL A;  3AGG G;  3MGW A;  3WU9 A;  1DI4 A;  4CFO A;  1FDL Y;  4H9C A;  4H8X A;  1QSW A;  4H9I A;  1XGU C;  1HNL A;  5F9X A;  3WXT A;  4ZFP A;  1NKH A;  1REM A;  2HTX A;  4XJD A;  1ZV5 L;  1REX A;  1BWH A;  1XEK A;  1GHL A;  2ZQ3 A;  2ZYC A;  3WVX A;  5E4P A;  1UIC A;  1AT6 A;  3N9A A;  1SLY A;  3TMX A;  1LZ5 A;  4X3B A;  5L9J A;  3AZ5 A;  1J1O Y;  1UIF A;  4NEB A;  3WU8 A;  3WUL A;  2MEH A;  4PPO A;  1IOT A;  1CKG A;  193L A;  1FN5 A;  1IP5 A;  2DQG Y;  1GB2 A;  2MEA A;  4H9E A;  1UC0 A;  4YEO A;  3WW5 A;  4YM8 A;  1VDP A;  1BB3 A;  1CJ7 A; 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 1MLC E;  4ZEE A;  4WLD A;  4N5R A;  4NHT A;  4N8Z A;  4TSC A;  5AMY A;  1D0L A;  1LSC A;  5FEL A;  4BAD A;  2XBR A;  3WUM A;  3M18 B;  4J1B A;  1DKK A;  1GDW A;  2HEF A;  1IP4 A;  2W1X A;  4B0D A;  4D9Z A;  1LZ8 A;  4NGO A;  4LT3 A;  1GAY A;  1LHJ A;  1HC0 A;  1LZA A;  4N0J A;  4KT3 A;  4NSJ A;  1VAT A;  3TXD A;  2BQM A;  3E3D A;  5HMV A;  1GF4 A;  3WPL A;  1GFK A;  2AUB A;  3CSQ A;  3CT0 A;  3CT1 A;  3HBE X;  1VFB C;  1IWV A;  1I1Z A;  1UIH A;  4J0L A;  1WQN A;  4WM1 A;  5B06 A;  2I26 L;  2LZ2 A;  5LYT A;  4Z98 A;  1LJ3 A;  5FDJ A;  1IP3 A;  1C45 A;  4I0C A;  1GFJ A;  1J1P Y;  3A91 A;  4DD7 A;  4W94 A;  1BB4 A;  3G3A B;  2X0A A;  2ZIJ A;  4OWH A;  4RW1 A;  1JEF A;  1OUD A;  4E3U A;  4P2E A;  4R0F A;  1LHH A;  3TXG A;  5I4W A;  4TWS A;  4WO6 A;  1IVM A;  3CSZ A;  1FLW A;  1B5W A;  1VDS A;  5HQ1 A;  1A2Y C;  4OWB A;  4H1P A;  2DQI Y;  1AT5 A;  2MED A;  1TDY A;  4C3W A;  2ZWB A;  4TUN A;  1BWI A;  5KXX A;  1D9U A;  4CHX A;  1HML A;  2PC2 A;  1B0D A;  2W1Y A;  4MCK A;  1G7I C;  2F2N A;  4QGZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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