3WUAA

Spatiotemporal development of soaked protein crystal; derivative 3610 sec
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title Spatiotemporal development of soaked protein crystal
pubmed doi rcsb
total genus 45
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2014-04-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3wuaA00
2XTHA 1HMKA 5LA8A 1I1ZA 1HEQA 1LMTA 2YBJA 4E3UA 5A3ZA 1AZFA 4II8A 6LYZA 1YAQA 1I20A 1ZMYL 1JJ3A 1GE0A 1LZ9A 3TXGA 4H9AA 4RDSA 3B6LA 4MR1A 5HMJA 1XGTC 5IDDA 4XYYA 4N1CC 5FCPA 1UIEA 1VFBC 2Q0MX 2C8OA 3AJNA 2MEGA 2HECA 5KXSA 3TXHA 2Y8PA 5I4WA 4HTNA 1O23A 1DI3A 3GXRA 1B5WA 5I53A 1LJJA 4DT3A 1KIPC 3ATOA 2YSSC 3WL2A 2ZYPA 4H9IA 1GFHA 9LYZA 4WM6A 1T3PA 1IWWA 1DQJC 1GF9A 1IC7Y 1LSAA 1NBZC 2BQIA 1OUIA 2DQJY 4GCFA 1FKVA 1HMLA 1FBIX 1LOZA 1CNSA 1YROA 2DQCY 5KXTA 1LYYA 3QY4A 1LHIA 2YBIA 1QDRA 1JJ0A 1DKJA 1WQMA 2A7DA 4LT1A 4OOOA 4TX7A 4NGYA 5KXZA 3WVYA 1LTMA 1IWZA 4YEMA 4ET8A 154LA 135LA 1GFAA 1GBZA 2ZQ3A 5L3HA 3P64A 5F14A 1B7NA 1CKGA 1LSNA 1TAYA 2W1LA 3HBEX 4ETEA 4WLDA 2Z18A 4WG1A 1LSYA 4WM5A 1NDMC 4AGAA 1GEVA 4NWHA 4YF2A 1GE1A 4U3XB 4B4EA 4EMNA 2DQDY 4B0DA 1GFVA 3A95A 1LJ4A 3W6DA 1NMMA 1LZ4A 5LA5A 1WTNA 5EBHA 1F10A 1UUZC 1LSDA 4GN3A 1HENA 1IC5Y 5IHGA 2YBLA 1W08A 4PPOA 2FYCA 1BGIA 1QQYA 1GFGA 1D9UA 2MEIA 1QUSA 2ZYCA 1CKDA 4NHQA 3HBHA 5KJ9A 4M6DA 4WLTA 1H6MA 1ZVHL 1LSMA 4HJZA 4N0JA 1GAZA 3WXTA 4LYMA 8LYZA 4OWAA 4J1BA 4GCEA 4WM2A 1IWXA 5HNLA 3QNGA 1CJ9A 4YM8A 1LHMA 1LZBA 3TXBA 4CGEA 5KXLA 2MEEA 1B9OA 1BVXA 1LJNA 4W94A 1B2KA 4NSIA 4CHXA 1JTOL 1EQ5A 1SLYA 4PHIA 1REZA 4G4BA 1IR8A 3BKHA 4DC4A 3TMVA 1JKDA 2D4KA 3A90A 3ZVQA 1MLCE 1RJCB 3E3DA 1EQ4A 3W6AA 1GXXA 2FBBA 3G3BB 5I4YA 2VB1A 1LJKA 1LAAA 2B5ZA 4XENA 1GB3A 1ZVYB 4XJGA 4DYGA 4BADA 1IR7A 4A7DA 1A4VA 1CKFA 2YDGA 5FDJA 3A96A 1JKCA 5I5QA 3WPLA 1CJ8A 4Z98A 4N9RA 3WW6A 4H1PA 3AZ7A 5FELA 4Z46A 5APEA 3WPJA 1JKBA 5LVKA 2W1XA 4B49A 1LMNA 2ZNWY 1PS5A 4NSJA 2XJWA 1LSEA 1HC0A 1DXJA 4B1AA 3W6BA 4KL7A 4DD7A 1OQMA 4R0FA 1G7HC 1JTPL 2Z2FA 1QIOA 2DQIY 3M3UA 3P65A 1KXWA 1C45A 1GBWA 1OUGA 1GF7A 4XJIA 2X0AA 5LYZA 1FLQA 1YKYX 2MEHA 1NBYC 1DI4A 4J0LA 4TSBA 4ML7A 1NQIA 2BQOA 1LSCA 1JISA 1HEWA 4GN4A 4NSHA 5KXMA 2BLXA 1UIDA 4KPMA 1UICA 3N9CA 1JIYA 5F16A 4XJFA 4H9BA 1FLYA 4ZEEA 4Z41A 2F2NA 4HPEA 4H9EA 5LINA 1V7SA 4J1AA 2XBRA 5A3EA 1AM7A 4MCKA 1B7OA 1GE2A 1UBZA 3IWRA 4YEOA 4LT2A 2CJLA 1IP4A 2H5ZA 1WTMA 5APFA 1D6QA 5HLLA 2MEBA 4ANRA 5LYTA 3FE0A 1WVUA 1J1OY 2LYZA 2Z39A 5HQ1A 2BQHA 1B7QA 1D0KA 1RCMA 1LMAA 1RE2A 4NHTA 3W6CA 1GBYA 5B07A 2BQBA 4H8YA 1LHJA 3TXKA 2LYOA 5B06A 2YBNA 4HTQA 1KIQC 3ZVQB 5ILCA 1IP3A 4D9ZA 5KXKA 2I25L 5LVGA 3EXDA 5B05A 2HEDA 4LFPA 5LVIA 3D3DA 5KXOA 3B72A 2HEAA 1JPOA 5HNCA 3AGHA 1HFZA 1YKXX 1C08C 1GDWA 4DDAA 5T3FA 1IP2A 1IO5A 1GAYA 1HSWA 3RNXA 2BQKA 4OW1A 1OUAA 5LAFA 1NDGC 1NF5A 2FYDA 3LN2A 2PC2A 1TCYA 4EOFA 1LHLA 4H9FA 3WU9A 1REXA 1CKCA 1LYSA 3F6ZA 5AMYA 4IATA 1FKQA 1YL0X 4G9SA 1JHLA 2LYMA 4WLXA 4Z3MA 1F6RA 1JWRA 5I4XA 1JSFA 3WUNA 1FLUA 3B0OA 1UCOA 4HSFA 2CDSA 3W6FA 1INUA 3TXDA 133LA 1XEKA 153LA 1LZEA 3B0IA 4LZTA 1JEFA 1KXXA 1IIZA 1HHLA 4H8XA 1GB9A 4DD2A 3ZEKA 1GB6A 1IY3A 1HELA 3N9EA 1IOSA 1IOCA 4GCDA 1LPIA 3WULA 3T6UA 5I54A 2Z38A 6LYTA 3RT5X 5C6LA 3A8ZA 1UIBA 4CFPA 4G49A 4RW1A 5B59A 4NHPA 5LVHA 1OUCA 2NWDX 2DBTA 4NGVA 3LYMA 1BB4A 1JTTL 5II3A 1UIHA 3ULRA 2F30A 1UC0A 1BB7A 5LAGA 5M1YA 2ZNXY 193LA 3CSRA 4LYZA 4NGLA 3RZ4A 1BQLY 4LFXA 4W96A 3LYOA 1LHHA 1UIGA 2ZWBA 3W3EA 3CSQA 4PGJB 4ET9A 207LA 5KKIA 2H9JA 1GEZA 1GPQC 1B7LA 3CT0A 4RW2A 4XJDA 1TDYA 4BAFA 2HTXA 2CGIA 3EMSA 1GE4A 1WQNA 3EO5A 3LZ2A 5ILFA 1GBSA 4WL6A 4O34A 2MEFA 1NKHA 4PJ2C 3LHMA 4N8ZA 1LZSA 1OUBA 1GFKA 4TUNA 3KAMA 1DZBX 4FDYA 2BQLA 1B7MA 1YQVY 4OWBA 1BWHA 2AUBA 1JJ1A 3J4GA 3HFMY 4OOTA 3IJUA 1LYZA 4HP0A 3CB7A 1GFTA 1LSFA 1VDPA 3IJVA 3A3RX 1LZRA 1FLWA 4G4HA 2HU3A 3AW6A 1H87A 1LSZA 1IVMA 1B7SA 2D4IA 3AW7A 1C7PA 1DKKA 1GBOA 1UA6Y 3P66A 3CT5A 1LKRA 1GF3A 3CSZA 4ZFPA 1CJ7A 4C3WA 1BB5A 4DD3A 4NIJA 1IWVA 3WW5A 1GXV2 2H9KA 1NHEA 1TEWA 1UACY 4LYOA 2DQGY 5DL9A 1VDQA 3TXEA 1E8LA 1PZYA 1OUFA 4GCBA 4GLVA 3TMXA 1YAMA 3VWOA 1AT6A 1B7RA 1BB3A 1GFEA 2LZTA 4C5FA 5L3IA 1REMA 2HU1A 1HNLA 5F81A 1NWGA 3CT1A 5KKJA 1MELL 1OUEA 2DQAA 4UWVA 1IEEA 5E9RA 2HUBA 1REYA 1GDXA 2G4QA 2BQNA 1LZAA 5KXXA 3LZTA 3WUMA 1LJIA 1HSXA 4LYCA 4ETAA 4XN6A 2BQCA 1LJFA 1D0LA 4CJ2A 3TXIA 4GN5C 3B0KA 3SP3A 1VDSA 3WPKA 4ETDA 1OUJA 4LGKA 3AB6A 1BHZA 3QE8A 4H94A 1ZV5L 5KXPA 7LYZA 1HEPA 4WL7A 4DDCA 1C46A 4GLAA 1LJEA 2G4NA 2DQFC 4HPIA 1HEMA 3GXKA 1HF4A 3LYTA 5DN5A 1GF4A 1LZTA 1GFRA 2DQEY 1BVKC 1B5UA 4HTKA 5KXYA 1IP7A 1N4FA 1LZDA 2BQEA 2GV0A 3LYZA 4TTDA 1GB7A 2F4GA 1FN5A 1F0WA 4LT0A 1GBXA 2BQJA 3WU8A 4DDBA 5FEKA 1HEOA 1GF5A 1WQQA 1B0DA 5L9JA 1WQRA 5LXWA 4XADA 1IX0A 1LMQA 4TSCA 3AGGG 2Z2EA 1IR9A 4DD0A 5KXRA 1XEIA 1QTKA 4WMGA 2MEAA 1YAPA 2Z12A 1HFYA 2ZQ4A 1AT5A 1LJHA 2ZILA 4H92A 5KY1A 4X3BA 3FI7A 2HEBA 1UIAA 5F9UA 1HERA 1FDLY 1LSPA 1EQEA 1XGUC 2BQGA 3AZ4A 4LT3A 1UIFA 2A7FA 4QEQA 1LZ8A 3TMWA 1LKSA 1LZ6A 4ETBA 1RI8B 3AYQA 3WVXA 4B4JA 4PRQA 1GWDA 1LYOA 4NHSA 4NGOA 1AKIA 4WM3A 2FBDA 2ZIJA 2CWIA 4YENA 5C6JA 4WO9A 4ZIXA 1GHLA 5IELA 1VDTA 1IC4Y 1LZNA 3AGIA 1OUDA 1LHKA 2F4AA 3A67Y 1XFPL 1A2YC 134LA 5LIOA 1IP1A 5LVJA 1I56A 1XGPC 3OJPA 4P2EA 4QGZA 4WM1A 3TMUA 4I8SA 4NY5A 4NSGA 1XSFA 1VEDA 4GCCA 1LSBA 1LMPA 2N5ZA 5K7OA 1F6SA 1VATA 2HEFA 4N1EI 1LZGA 3A92A 1YIKA 4NGIA 2D4JA 4OWCA 1GE3A 5B1FA 2C8PA 1G7IC 3RW8A 4IASA 1BWJA 2Z19A 3WU7A 4NG1A 1Z55A 3A6BY 1D0MA 5APCA 1JKAA 1KXYA 4NWEA 208LA 4WO6A 4XJHA 3WYHA 4WG7A 4DD1A 1IOTA 5F9XA 1B5YA 1T6VL 3A94A 3D9AC 3MGWA 5D5FA 2BQFA 4NGJA 1B5XA 3HBDA 1CKHA 1OP9B 1C43A 4FJRA 4J7VA 4WM4A 3W6EA 3G3AB 3TXJA 4BAPA 3A3QA 1IWTA 1IY4A 1QSWA 4NFVA 2DQHY 1GB5A 4IJ4A 4MSTA 4I0CA 1BWIA 1GB8A 2BQDA 2I6ZA 3J6KA 2D91A 1QUTA 4H91A 3EBAB 4NGKA 3RU5A 1QDTA 132LA 4AXTA 1D6PA 1GF8A 2XBSA 4N5RA 4RLMA 2BAAA 4KXIA 5DN4A 1LSGA 1B5ZA 4TWSA 4DD9A 5LYMA 1QTEA 1TBYA 2I26L 4DWXA 1WVVA 5DM9A 5DLAA 3K3TA 1KIRC 4OWEA 3A93A 3TXFA 1J1PY 3CQLA 3P4ZA 1LZ5A 4KT3A 1XGRC 1DPWA 2G4PA 1GFJA 1IWUA 4XJBA 1LCNA 4H90A 5C6IA 5HMVA 2BQAA 5KXWA 1QSAA 1YL1X 2RSCA 1W6ZA 3WXUA 1WQOA 4WLYA 4ETCA 2HEEA 3A6CY 4UWUA 1IP5A 4LYBA 3WMKA 2IFFY 5APDA 4HV1A 1GF0A 4H93A 4YOPA 2MECA 3AZ5A 1LZ1A 4WOAA 1YKZX 4B4IA 1XGQC 2LHMA 1IOQA 1IORA 1G7MC 1OUHA 4M4OA 1YAOA 4L41A 4PRUA 2YBMA 1RFPA 1LZCA 1B7PA 1GF6A 4H9HA 5KXNA 4NGWA 3P68A 2YBHA 1SQ2L 1GD6A 1IWYA 1G7LC 1IP6A 2Z37A 3OK0A 1LMOA 2EQLA 4CFOA 1JITA 1HFXA 1GB0A 1XEJA 2W1YA 2BPUA 3T36A 1JSEA 1WQPA 4NGZA 4QDNA 2BQMA 2EPEA 4BS7A 3BKVA 2BLYA 5E4PA 1LJGA 3A34A 1ALCA 2EIZC 5JENB 2ZIKA 4H8ZA 1C10A 4NHIA 1B5VA 3WH1A 2YVBA 2D6BA 4LYTA 3AZ6A 1LMCA 2MEDA 3WUAA 1DPXA 1CJ6A 2EKSC 5J7CA 1GFUA 1LJ3A 2LZ2A 1DI5A 1VAUA 2WARA 1YANA 3M18B 1G7JC 1P2CC 4NG8A 1EL1A 1BB6A 194LA 4H9CA 5FHWA 1GB2A 4QY9A 4NEBA 2W1MA 5D5CA 4R6CA 4HJVA 4RLNA 1JUGA 2IHLA 1YILA 4G4CA 1LZYA 4UWNA 4OWHA 1J1XY 3N9AA 2DKVA 4HV2A 4HJYA 5B1GA 3A91A 5FSTA 3ATNA 1V7TA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5A3ZA 1AZFA 186LA 4EKPA 1LW9A 1GE0A 3B6LA 3GUKA 4W55A 1UIEA 2C8OA 2HECA 1DI3A 260LA 3ATOA 2F2QA 253LA 149LA 1ZYTA 9LYZA 1T3PA 1GF9A 2BQIA 1LSAA 4LDOA 1LYIA 2DQJY 3GUPA 1YROA 2DQCY 5KXTA 1QDRA 1LYFA 3DN0A 4OOOA 4LT1A 3WVYA 1IWZA 135LA 1GFAA 1CKGA 4ETEA 2ANXA 4WLDA 4WG1A 1LSYA 3C8RA 1GEVA 4B0DA 1LJ4A 1LZ4A 1SX2A 5LA5A 1UUZC 1LSDA 1HENA 1DYAA 3C81A 1L96A 2ZYCA 4NHQA 4WLTA 1H6MA 1GAZA 4LYMA 4J1BA 3QNGA 1L13A 2MEEA 3HUAA 1B2KA 4NSIA 4EKQA 2B75A 4G4BA 1IR8A 4DC4A 3TMVA 1QTZA 1JKDA 1L04A 3ZVQA 1EQ4A 1GXXA 5I4YA 1LJKA 1LAAA 4XENA 4DYGA 1ZVYB 1CKFA 1JKCA 1QUOA 5I5QA 3WPLA 4H1PA 3AZ7A 3WPJA 2OEAX 2XJWA 1G0LA 3W6BA 4KL7A 4DD7A 2DQIY 3M3UA 239LA 3P65A 1OUGA 215LA 1YKYX 4TSBA 1JISA 4NSHA 4I7LA 223LA 4XJFA 4H9BA 1FLYA 196LA 1G0MA 2F2NA 5LINA 2XBRA 1P37A 2Z6BA 3C7ZA 2MEBA 1LWKA 1B7QA 1RCMA 3W6CA 1L0KA 1LHJA 3HT9A 145LA 1T6HA 3DMZA 5B05A 213LA 2HEDA 3D3DA 3B72A 1LGUA 1YKXX 2CUUA 4DDAA 1IO5A 1GAYA 1C6AA 4W59A 2LZMA 1L83A 1L99A 3NY9A 4EOFA 1C6JA 1WTHA 5AMYA 1FKQA 4G9SA 4Z3MA 1LI2A 1FLUA 2B6WA 3TXDA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2XTH A;  1HMK A;  5LA8 A;  1I1Z A;  1HEQ A;  1LMT A;  2YBJ A;  4E3U A;  5A3Z A;  1AZF A;  4II8 A;  6LYZ A;  1YAQ A;  1I20 A;  1ZMY L;  1JJ3 A;  1GE0 A;  1LZ9 A;  3TXG A;  4H9A A;  4RDS A;  3B6L A;  4MR1 A;  5HMJ A;  1XGT C;  5IDD A;  4XYY A;  4N1C C;  5FCP A;  1UIE A;  1VFB C;  2Q0M X;  2C8O A;  3AJN A;  2MEG A;  2HEC A;  5KXS A;  3TXH A;  2Y8P A;  5I4W A;  4HTN A;  1O23 A;  1DI3 A;  3GXR A;  1B5W A;  5I53 A;  1LJJ A;  4DT3 A;  1KIP C;  3ATO A;  2YSS C;  3WL2 A;  2ZYP A;  4H9I A;  1GFH A;  9LYZ A;  4WM6 A;  1T3P A;  1IWW A;  1DQJ C;  1GF9 A;  1IC7 Y;  1LSA A;  1NBZ C;  2BQI A;  1OUI A;  2DQJ Y;  4GCF A;  1FKV A;  1HML A;  1FBI X;  1LOZ A;  1CNS A;  1YRO A;  2DQC Y;  5KXT A;  1LYY A;  3QY4 A;  1LHI A;  2YBI A;  1QDR A;  1JJ0 A;  1DKJ A;  1WQM A;  2A7D A;  4LT1 A;  4OOO A;  4TX7 A;  4NGY A;  5KXZ A;  3WVY A;  1LTM A;  1IWZ A;  4YEM A;  4ET8 A;  154L A;  135L A;  1GFA A;  1GBZ A;  2ZQ3 A;  5L3H A;  3P64 A;  5F14 A;  1B7N A;  1CKG A;  1LSN A;  1TAY A;  2W1L A;  3HBE X;  4ETE A;  4WLD A;  2Z18 A; 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 1XGR C;  1DPW A;  2G4P A;  1GFJ A;  1IWU A;  4XJB A;  1LCN A;  4H90 A;  5C6I A;  5HMV A;  2BQA A;  5KXW A;  1QSA A;  1YL1 X;  2RSC A;  1W6Z A;  3WXU A;  1WQO A;  4WLY A;  4ETC A;  2HEE A;  3A6C Y;  4UWU A;  1IP5 A;  4LYB A;  3WMK A;  2IFF Y;  5APD A;  4HV1 A;  1GF0 A;  4H93 A;  4YOP A;  2MEC A;  3AZ5 A;  1LZ1 A;  4WOA A;  1YKZ X;  4B4I A;  1XGQ C;  2LHM A;  1IOQ A;  1IOR A;  1G7M C;  1OUH A;  4M4O A;  1YAO A;  4L41 A;  4PRU A;  2YBM A;  1RFP A;  1LZC A;  1B7P A;  1GF6 A;  4H9H A;  5KXN A;  4NGW A;  3P68 A;  2YBH A;  1SQ2 L;  1GD6 A;  1IWY A;  1G7L C;  1IP6 A;  2Z37 A;  3OK0 A;  1LMO A;  2EQL A;  4CFO A;  1JIT A;  1HFX A;  1GB0 A;  1XEJ A;  2W1Y A;  2BPU A;  3T36 A;  1JSE A;  1WQP A;  4NGZ A;  4QDN A;  2BQM A;  2EPE A;  4BS7 A;  3BKV A;  2BLY A;  5E4P A;  1LJG A;  3A34 A;  1ALC A;  2EIZ C;  5JEN B;  2ZIK A;  4H8Z A;  1C10 A;  4NHI A;  1B5V A;  3WH1 A;  2YVB A;  2D6B A;  4LYT A;  3AZ6 A;  1LMC A;  2MED A;  3WUA A;  1DPX A;  1CJ6 A;  2EKS C;  5J7C A;  1GFU A;  1LJ3 A;  2LZ2 A;  1DI5 A;  1VAU A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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