4ML7A

Crystal structure of brucella abortus plic in complex with human lysozyme
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
publication title Structural Basis for the Inhibition of Human Lysozyme by PliC from Brucella abortus
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
total genus 48
structure length 129
sequence length 129
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-09-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4ml7A00
1SLYA 1WVUA 1BWHA 2DQCY 1GEZA 3GXRA 4RLNA 4N8ZA 1GB2A 1GHLA 1PZYA 3HBHA 5F16A 5KXPA 4HTQA 1B5ZA 4LYTA 2PC2A 4XJIA 4KPMA 4H91A 5IHGA 1RFPA 2LYMA 3B6LA 4R6CA 1XEKA 3LN2A 1QUTA 4WM3A 1GB9A 1UIFA 4B4IA 5APDA 1LYSA 1LKSA 4IJ4A 1B5XA 1DPXA 3WUNA 3WYHA 4LYOA 4B4JA 4H9IA 5HNCA 1KXYA 1T3PA 4PJ2C 5LIOA 4NSIA 5EBHA 1LZ5A 1TBYA 4LFPA 4TUNA 1HSXA 4M4OA 3TXFA 2VB1A 1UIBA 2Y8PA 1LJJA 4MR1A 4WM5A 3CQLA 1LJHA 4ZEEA 3RU5A 8LYZA 5HMVA 5KXRA 1LSEA 5A3ZA 1O23A 1E8LA 1HEOA 1DKKA 1JIYA 2HECA 5C6JA 4NSGA 5C6LA 1CNSA 1LZ6A 4Z3MA 1HEPA 4H8ZA 1JSEA 2W1XA 3N9EA 4L41A 3TXJA 1J1PY 4RW2A 3N9AA 4GN5C 5LYZA 4LYBA 1J1XY 1FDLY 5HNLA 1FLUA 4QGZA 4DT3A 2C8PA 3N9CA 6LYTA 1JITA 5D5CA 1RJCB 1GBXA 5ILFA 1GFAA 3A93A 3WU7A 1CJ7A 2HEFA 4R0FA 5I4WA 1IOCA 1IEEA 2Z2EA 2MEIA 2BQNA 1IOSA 4BAPA 1LMNA 2DQIY 1LKRA 1V7SA 2DQFC 4G49A 3AB6A 1YKZX 1LYZA 3GXKA 3A6BY 4QEQA 5KY1A 3ATOA 4QDNA 1B2KA 3B0IA 1BHZA 4B0DA 3A91A 3KAMA 3TMXA 2EQLA 1QTKA 4OOOA 4G4BA 3E3DA 4LT2A 1GXV2 1VDQA 3AZ5A 1UA6Y 4HV1A 4N1CC 3EBAB 4DC4A 4LT0A 5KXKA 5KXXA 1IY4A 4NHIA 1BB5A 1FLWA 2I25L 1LMTA 1RE2A 1GFJA 3TXKA 2MEBA 4UWNA 1LSGA 2BQHA 1GFTA 1MLCE 1LCNA 2BQJA 1UIEA 1OUDA 3HFMY 4U3XB 1UUZC 1YKYX 4PGJB 4W94A 3RNXA 1IP6A 2LYZA 4HJVA 5I4XA 5I4YA 1LYYA 4XJFA 3TMWA 5E4PA 4NHSA 1QQYA 3IWRA 2A7DA 1JPOA 4HJZA 4NWHA 1BVXA 1GFEA 3G3AB 1LZYA 4NY5A 1LZCA 3EMSA 1EQ5A 5I54A 1LSBA 3VWOA 1GE1A 1CKCA 2YBLA 2D4JA 1DKJA 3OJPA 4W96A 5KXZA 1GDXA 4HTKA 3WVYA 1T6VL 4Z46A 1XGQC 3QNGA 1WQPA 1C08C 1Z55A 4N9RA 1LMOA 4OWHA 1GE4A 4H92A 1QSAA 4H9AA 1LZEA 2ZIJA 4NHQA 2F4GA 1IORA 5KJ9A 5LVGA 2HEBA 1PS5A 1IWTA 4BADA 1YILA 1AT5A 4LT3A 3TXIA 1GE3A 1WQMA 3WH1A 2HTXA 4OWCA 1IC4Y 1HELA 1YROA 1BVKC 2LZTA 3LYTA 2HEEA 5B1FA 1GFVA 1NQIA 4ET9A 1GWDA 1IR8A 1IWWA 2EIZC 3P65A 4HPIA 4YF2A 5KXTA 1JTTL 1GB6A 5LVJA 1C7PA 5B05A 5FELA 1HC0A 4YEOA 3WL2A 3A3QA 3W6BA 1JEFA 4BAFA 4ANRA 1F0WA 4DD9A 2YBHA 1NWGA 2W1YA 1EL1A 1IOQA 1D0MA 1DQJC 1UIHA 4NSJA 1LHKA 1LZ8A 1IY3A 1VEDA 1LMCA 1YAOA 4WM1A 1LTMA 1GFKA 1INUA 5KXYA 2CGIA 4J1BA 193LA 5C6IA 4ETBA 5LVIA 2DQJY 5J7CA 2BQIA 1JJ3A 4CFPA 1NKHA 1WQNA 3RZ4A 4LZTA 2ZNXY 1D6QA 5APCA 1AZFA 1G7HC 4J7VA 1KIQC 1LZNA 1LSDA 4LT1A 1WTNA 3F6ZA 4NG8A 1VDPA 4BS7A 2CWIA 4DDBA 1G7MC 1GD6A 4D9ZA 1HFZA 1W6ZA 3A67Y 4OOTA 1B7PA 2BPUA 3AW7A 3J6KA 1ZVYB 1JKDA 2MEGA 1HFXA 1P2CC 4N5RA 4YM8A 1JKAA 2H9KA 1G7LC 4H9EA 1VFBC 1LJGA 2D4KA 2CDSA 4NGIA 2DKVA 2MEEA 2ZIKA 1C45A 1MELL 1HEWA 4WLTA 3ZEKA 1GF8A 1YAQA 2Z39A 3IJUA 2XTHA 4WMGA 1AT6A 4C5FA 1TDYA 3MGWA 5KKIA 5LXWA 1N4FA 7LYZA 2BQFA 1TAYA 5FSTA 3BKHA 2HEAA 4FDYA 4WG1A 1D9UA 3QY4A 4WO6A 1G7JC 2H5ZA 1XFPL 2ZYPA 5FDJA 4KXIA 5KXNA 4H8XA 4XJBA 1JTPL 3ATNA 4XADA 3IJVA 4DD0A 3OK0A 4HSFA 2FBBA 2D6BA 2W1MA 3CSRA 3EO5A 1GFGA 3A8ZA 2BLXA 1LZ4A 1JKCA 4E3UA 1KIRC 1OUJA 3B0OA 4UWVA 1KXXA 5B06A 1NF5A 4ET8A 2YBMA 4H93A 2DQDY 4YOPA 1DPWA 1LZBA 1OQMA 154LA 3WUAA 3AZ6A 1H87A 2BQOA 4I8SA 5L3HA 1BB6A 1KIPC 4XJDA 2ZQ3A 4HP0A 4WL7A 1UIGA 3WPJA 3LYMA 5JENB 3A6CY 1XEJA 2MEAA 4NHPA 3P66A 1LSPA 132LA 1W08A 4H9FA 4NEBA 4NGJA 1BGIA 4ZFPA 2XJWA 1HNLA 2BQMA 1QTEA 5B1GA 1AKIA 5LAGA 2YBJA 1HMLA 1TCYA 1WQQA 1OUEA 3WXTA 1GF4A 5FEKA 1GB0A 2C8OA 4DD1A 1GBSA 1NMMA 3WMKA 1CKDA 1OP9B 3WULA 1FN5A 1CKFA 4NGVA 3P68A 4KT3A 4LYZA 2A7FA 1WTMA 4OW1A 5F81A 4G4HA 3G3BB 1V7TA 2BQAA 4WM4A 1IP7A 1LZRA 1XSFA 1OUGA 4GN3A 5LA5A 4XENA 4QY9A 3LYOA 1LHHA 3TXHA 4DWXA 5LA8A 153LA 5F9UA 1FKQA 2YDGA 194LA 1B7OA 2CJLA 4IATA 1F6RA 4OWBA 1D6PA 4DD3A 1UIAA 2ZWBA 5K7OA 1GXXA 1HSWA 1IP2A 1QUSA 5APFA 5M1YA 4G4CA 1IO5A 1XGPC 1FLQA 4DDCA 1GBYA 1NDGC 1REMA 1EQEA 133LA 1IP1A 1YAPA 2D91A 1GE0A 4YENA 5DLAA 4Z41A 1OUBA 1IWXA 1B7QA 2MEFA 3AZ7A 3J4GA 2NWDX 1UIDA 3AZ4A 1GF6A 4P2EA 1YAMA 4EOFA 3D9AC 1BWIA 2B5ZA 1IWVA 1LJKA 4NWEA 4H1PA 1ZV5L 1IWZA 4NHTA 1QSWA 4TTDA 1IP4A 1LSAA 2YSSC 4TX7A 4DYGA 1B7SA 2HU3A 5KXSA 1BB7A 1LJNA 2F2NA 3FI7A 1OUAA 4A7DA 5KXMA 4WM2A 2BQLA 207LA 1UCOA 2FYCA 2YBNA 3TXGA 3WVXA 2FBDA 1REXA 2IHLA 3W6FA 4ETEA 2BQBA 3CT0A 4NIJA 3AGGG 2YVBA 4GCCA 4II8A 2LZ2A 5KXOA 1IP5A 3M18B 2LHMA 1GFRA 2G4PA 1GFUA 4GCDA 3W6AA 1HERA 2IFFY 1HFYA 4PRQA 4B4EA 1AM7A 2DQAA 3M3UA 4X3BA 3WW5A 1D0LA 5DN5A 3WPLA 1B7RA 1FBIX 2Z18A 4GLVA 5LINA 4ML7A 4RLMA 1F6SA 4RDSA 2DQEY 1B5WA 4NGYA 2HU1A 5E9RA 1UC0A 4PPOA 1OUHA 2BQEA 1LMAA 5IDDA 3W6DA 5FCPA 5KXWA 3EXDA 1WQOA 1IIZA 3LHMA 5F9XA 1GPQC 1J1OY 4OWAA 5A3EA 1IC5Y 4CJ2A 5KKJA 4GCBA 4GLAA 1B7MA 1JJ0A 4HPEA 1JWRA 1DXJA 1DI3A 1VAUA 2D4IA 4WM6A 4NSHA 3W6EA 3CSQA 4H9BA 3ZVQA 1LSYA 4J0LA 1HMKA 4B49A 1REZA 3AGIA 1ZVHL 1A4VA 3CSZA 1SQ2L 2ZQ4A 3AGHA 1LSCA 1GF5A 1CKGA 1JSFA 1YIKA 1JHLA 1LSNA 2W1LA 3HBEX 1C10A 1GF3A 2F30A 3A34A 5B07A 1A2YC 1GDWA 4FJRA 4WOAA 4NGWA 3LZTA 5LVHA 1OUIA 2EPEA 4H9HA 5DL9A 1B7NA 2BQDA 1CJ8A 3TMVA 134LA 2RSCA 3P4ZA 1GB3A 1YL1X 1UACY 6LYZA 2WARA 1LHMA 3ZVQB 4NFVA 1GBZA 2MEHA 4PRUA 5F14A 2BLYA 3AYQA 2HUBA 1JUGA 1B0DA 1B5UA 4NG1A 4GN4A 4EMNA 1NHEA 1XEIA 1BWJA 1JTOL 4CGEA 5I53A 1B7LA 3B72A 1LHJA 2Z2FA 4J1AA 1LZGA 5HMJA 1GF7A 2LYOA 1BB3A 3LZ2A 4HJYA 1B5YA 1UICA 1I1ZA 3A94A 3CB7A 5APEA 3WPKA 3WU8A 3A92A 5KXLA 4LYMA 135LA 1DZBX 1LSMA 4AXTA 3WW6A 1GB5A 2MEDA 1GE2A 2I26L 4TSBA 1LJ3A 5DN4A 4CHXA 5B59A 3SP3A 4H94A 3RT5X 5L3IA 4WG7A 2H9JA 5I5QA 4N1EI 2ZNWY 4UWUA 1ALCA 2ZYCA 3TXBA 4HV2A 4N0JA 1KXWA 3WXUA 1LHLA 1XGRC 1VATA 2G4QA 4LGKA 1LAAA 1FLYA 1LJEA 5T3FA 1CKHA 1NBYC 4H90A 2XBRA 1HENA 4Z98A 4WLXA 1GF9A 2HEDA 2N5ZA 4XJGA 5D5FA 3TXDA 1LJFA 5AMYA 1OUCA 3A95A 1OUFA 3WU9A 4AGAA 1BQLY 1GBOA 2ZILA 1GAZA 3QE8A 4DD2A 5L9JA 4XN6A 5HLLA 1IC7Y 2X0AA 2Z12A 3A90A 4NGKA 2MECA 3HBDA 5LYMA 1LHIA 3CT5A 4GCFA 1C46A 4NGLA 5IELA 1IP3A 4ETDA 1VDSA 2DQHY 1GB7A 4NGOA 1GEVA 1IR9A 2Q0MX 1LMQA 1HHLA 1B9OA 1UBZA 5FHWA 4ZIXA 9LYZA 1QDTA 4WLDA 3WUMA 3W3EA 2I6ZA 3FE0A 3B0KA 4H9CA 4IASA 2Z37A 1WQRA 1LSFA 1QIOA 2AUBA 3AW6A 3RW8A 1DI4A 1LZAA 3AJNA 5ILCA 1YKXX 1IWYA 1LZSA 4NGZA 2FYDA 4TWSA 2DQGY 4B1AA 1IR7A 2BAAA 4RW1A 4TSCA 1TEWA 4XJHA 4MCKA 3P64A 4GCEA 2GV0A 2XBSA 4C3WA 1IX0A 1IWUA 208LA 4O34A 3TXEA 1XGUC 1NBZC 3LYZA 3W6CA 1GF0A 1YL0X 1GAYA 4M6DA 1LJ4A 1JKBA 1NDMC 3A96A 1HF4A 2G4NA 1GB8A 1JJ1A 1GBWA 4CFOA 4WLYA 4HTNA 1LOZA 1CJ9A 1QDRA 4PHIA 1GFHA 3ULRA 3D3DA 3T6UA 1HEQA 5HQ1A 1I56A 4WO9A 3T36A 4DDAA 5DM9A 3TMUA 1C43A 1LZ1A 2BQKA 1F10A 1YQVY 1VDTA 4H8YA 1ZMYL 1H6MA 2Z19A 4DD7A 2BQGA 2DBTA 4I0CA 2YBIA 1B5VA 1CJ6A 3BKVA 5LAFA 4ETCA 3K3TA 1IOTA 2Z38A 1REYA 1BB4A 4ETAA 1FKVA 1LZ9A 5LYTA 1JISA 1LSZA 1YANA 1DI5A 4WL6A 1D0KA 1LZTA 1XGTC 1LPIA 4YEMA 4LFXA 2EKSC 1LMPA 1EQ4A 1RI8B 2BQCA 3CT1A 2F4AA 4G9SA 1IVMA 4LYCA 4MSTA 1G7IC 1I20A 1HEMA 1WVVA 4OWEA 1LJIA 1RCMA 3A3RX 4KL7A 4XYYA 5LVKA 1LYOA 1LZDA 5II3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1SLYA 1BWHA 3GXRA 1GEZA 1G0JA 5F16A 1RFPA 120LA 3LN2A 1CU0A 2NTGA 1GB9A 1UIFA 5APDA 236LA 1JTNA 5HNCA 4M4OA 1HSXA 3TXFA 1TLAA 1LJHA 1JIYA 144LA 119LA 5C6JA 1CNSA 1LZ6A 1L79A 1JSEA 1LYEA 3N9EA 2RBQA 3N9AA 5LYZA 1J1XY 4DT3A 3N9CA 3WU7A 1L33A 1LMNA 167LA 4QEQA 3V2WA 3ATOA 4QDNA 4AQNA 1BHZA 1L36A 3A91A 1QTKA 4ARQA 1B6IA 1L18A 2CUUA 1VDQA 4HV1A 4N1CC 2O4WA 1L22A 4LT0A 3C80A 2I25L 1RE2A 3GUPA 1GFTA 3HFMY 1YKYX 3RNXA 1IP6A 3C82A 4XJFA 1C6TA 1QQYA 3HTFA 4NHSA 1L50A 1L68A 4HJZA 4NWHA 1GFEA 1CU5A 4NY5A 1LZCA 4W54A 1LSBA 1GE1A 168LA 2D4JA 1DKJA 1C6KA 1L70A 4W96A 1GDXA 192LA 1XGQC 3C81A 255LA 4H92A 3ODUA 198LA 5KJ9A 1QTCA 1DYFA 109LA 2LZTA 3LYTA 1GWDA 1L30A 5LVJA 3P65A 1GB6A 1C7PA 5FELA 3WL2A 1QUOA 1F0WA 2RB0X 1ZWNA 1LZ8A 1C6CA 1L77A 1LTMA 5KXYA 1K28A 2CGIA 3DN1A 193LA 5J7CA 4CFPA 5APCA 2ZNXY 1KIQC 3F6ZA 4NG8A 4DDBA 1GD6A 3DMZA 3A67Y 3HTGA 1P2CC 166LA 4YM8A 2H9KA 191LA 2CDSA 2ZIKA 3ZEKA 3C7WA 2Z39A 3HH6A 5LXWA 206LA 1L0JA 2RBSA 4FDYA 1CUPA 3ATNA 4XADA 3IJVA 3VW7A 1DYCA 3OK0A 1GFGA 1LZ4A 3B0OA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1SLY A;  1WVU A;  1BWH A;  2DQC Y;  1GEZ A;  3GXR A;  4RLN A;  4N8Z A;  1GB2 A;  1GHL A;  1PZY A;  3HBH A;  5F16 A;  5KXP A;  4HTQ A;  1B5Z A;  4LYT A;  2PC2 A;  4XJI A;  4KPM A;  4H91 A;  5IHG A;  1RFP A;  2LYM A;  3B6L A;  4R6C A;  1XEK A;  3LN2 A;  1QUT A;  4WM3 A;  1GB9 A;  1UIF A;  4B4I A;  5APD A;  1LYS A;  1LKS A;  4IJ4 A;  1B5X A;  1DPX A;  3WUN A;  3WYH A;  4LYO A;  4B4J A;  4H9I A;  5HNC A;  1KXY A;  1T3P A;  4PJ2 C;  5LIO A;  4NSI A;  5EBH A;  1LZ5 A;  1TBY A;  4LFP A;  4TUN A;  1HSX A;  4M4O A;  3TXF A;  2VB1 A;  1UIB A;  2Y8P A;  1LJJ A;  4MR1 A;  4WM5 A;  3CQL A;  1LJH A;  4ZEE A;  3RU5 A;  8LYZ A;  5HMV A;  5KXR A;  1LSE A;  5A3Z A;  1O23 A;  1E8L A;  1HEO A;  1DKK A;  1JIY A;  2HEC A;  5C6J A;  4NSG A;  5C6L A;  1CNS A;  1LZ6 A;  4Z3M A;  1HEP A;  4H8Z A;  1JSE A;  2W1X A;  3N9E A;  4L41 A;  3TXJ A;  1J1P Y;  4RW2 A;  3N9A A;  4GN5 C;  5LYZ A;  4LYB A;  1J1X Y;  1FDL Y;  5HNL A;  1FLU A;  4QGZ A;  4DT3 A;  2C8P A;  3N9C A;  6LYT A;  1JIT A;  5D5C A;  1RJC B;  1GBX A;  5ILF A; 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 2LYO A;  1BB3 A;  3LZ2 A;  4HJY A;  1B5Y A;  1UIC A;  1I1Z A;  3A94 A;  3CB7 A;  5APE A;  3WPK A;  3WU8 A;  3A92 A;  5KXL A;  4LYM A;  135L A;  1DZB X;  1LSM A;  4AXT A;  3WW6 A;  1GB5 A;  2MED A;  1GE2 A;  2I26 L;  4TSB A;  1LJ3 A;  5DN4 A;  4CHX A;  5B59 A;  3SP3 A;  4H94 A;  3RT5 X;  5L3I A;  4WG7 A;  2H9J A;  5I5Q A;  4N1E I;  2ZNW Y;  4UWU A;  1ALC A;  2ZYC A;  3TXB A;  4HV2 A;  4N0J A;  1KXW A;  3WXU A;  1LHL A;  1XGR C;  1VAT A;  2G4Q A;  4LGK A;  1LAA A;  1FLY A;  1LJE A;  5T3F A;  1CKH A;  1NBY C;  4H90 A;  2XBR A;  1HEN A;  4Z98 A;  4WLX A;  1GF9 A;  2HED A;  2N5Z A;  4XJG A;  5D5F A;  3TXD A;  1LJF A;  5AMY A;  1OUC A;  3A95 A;  1OUF A;  3WU9 A;  4AGA A;  1BQL Y;  1GBO A;  2ZIL A;  1GAZ A;  3QE8 A;  4DD2 A;  5L9J A;  4XN6 A;  5HLL A;  1IC7 Y;  2X0A A;  2Z12 A;  3A90 A;  4NGK A;  2MEC A;  3HBD A;  5LYM A;  1LHI A;  3CT5 A;  4GCF A;  1C46 A;  4NGL A;  5IEL A;  1IP3 A;  4ETD A;  1VDS A;  2DQH Y;  1GB7 A;  4NGO A;  1GEV A;  1IR9 A;  2Q0M X;  1LMQ A;  1HHL A;  1B9O A;  1UBZ A;  5FHW A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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