4ML7A

Crystal structure of brucella abortus plic in complex with human lysozyme
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title Structural Basis for the Inhibition of Human Lysozyme by PliC from Brucella abortus
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 48
structure length 129
sequence length 129
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-09-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4ml7A00
1XGRC 4TSBA 4YOPA 1SQ2L 2DQEY 4Z98A 1JITA 2HEEA 3AZ6A 3B0OA 3TMVA 5DN4A 4H9IA 4CFPA 5IDDA 2LYMA 1GE3A 5KKIA 2MEBA 2HEBA 5KXWA 2HECA 2D4KA 1LHMA 3ZVQA 4H9FA 5B06A 1IWUA 4OW1A 4PRQA 4PPOA 4NHTA 1EQEA 2YSSC 4B0DA 4B4JA 1GXXA 3WXUA 3A91A 5APEA 1GDWA 5C6IA 3B6LA 1IEEA 4DYGA 2MEHA 3W6CA 2CDSA 1GFUA 2D6BA 3CT5A 5I5QA 2HU3A 3TXGA 5KXKA 3GXRA 1B0DA 1JWRA 1PS5A 2FBDA 1BB7A 4ET8A 1WTMA 1JSEA 1YQVY 1GFHA 1H87A 5LVGA 3AGGG 2FBBA 5LVHA 4H1PA 2BLYA 4HTQA 1GB8A 1UIDA 4Z41A 1LJJA 1YAMA 3ATOA 1BQLY 4WO6A 5KXTA 2Z19A 4WM6A 2LZTA 1WQMA 3QE8A 1BWHA 1H6MA 2BQDA 3P68A 1LSEA 2MEAA 1LJKA 4H8YA 7LYZA 1LHLA 3CQLA 4XJBA 3WU8A 1OUBA 1UCOA 3CT0A 1LJ4A 4RLNA 4WLYA 4B1AA 1HERA 3N9AA 4LT2A 4XADA 2XBSA 4Z3MA 1JISA 1HENA 1VDPA 2WARA 4G49A 135LA 1B7LA 1LMCA 2D4JA 1BWIA 2F4GA 3WVXA 1YAQA 3A6CY 4LT0A 1QDRA 4QY9A 1PZYA 1T3PA 4WMGA 5HNLA 1IC5Y 4NGZA 1J1XY 1C45A 1LMPA 1YANA 4XJGA 4C3WA 1UBZA 1GF6A 1OUCA 1WVVA 4OWCA 1HEPA 4GCEA 3WVYA 2C8PA 4BADA 1JEFA 2F2NA 194LA 3AW6A 3TXEA 5ILFA 3WW6A 4BAPA 5KXZA 1VEDA 132LA 1HELA 2ZWBA 5T3FA 1GAYA 5D5FA 1GF0A 1V7SA 1XSFA 3LYTA 4CGEA 1OP9B 4HSFA 4FDYA 1QTKA 4WO9A 1TDYA 4YENA 4H9EA 4BS7A 4RW2A 4HPIA 153LA 3WUMA 1NBYC 1GHLA 4ETCA 1UIEA 1NBZC 4OWHA 1BB4A 1LZEA 1NDGC 4IATA 1B5UA 4OWAA 1IORA 3WUAA 1LJHA 4B4IA 1DI3A 5LYMA 1LSBA 1ZV5L 3ATNA 1BB6A 2X0AA 3RT5X 5F9UA 1JTPL 3A6BY 4J1AA 1G7IC 4NGJA 5F16A 2Z38A 1GB3A 1YKZX 2DQJY 4HJZA 1LHKA 1LAAA 1LZ4A 4ZFPA 1GB5A 1GF5A 5I4XA 3W6BA 1IOQA 1UC0A 1NMMA 4CJ2A 5LVJA 4LYCA 1TBYA 3QNGA 4OWBA 1D0LA 4ZEEA 2ZYCA 1YROA 1DPXA 2A7DA 3A95A 1LZGA 1IP1A 5HLLA 3HBHA 5B1FA 2D91A 3A3QA 5KXMA 1YL0X 1LZSA 1AZFA 1LMQA 4DD7A 1CKDA 1G7HC 3MGWA 4DDBA 1G7LC 1JIYA 2MEFA 3WW5A 3WU9A 5HQ1A 2ZIJA 5B05A 4H94A 2BQKA 208LA 5E4PA 1IO5A 9LYZA 6LYTA 1GFJA 1ZMYL 5DL9A 5E9RA 2BQAA 4WLDA 1NWGA 1HFXA 2VB1A 3TXBA 2Q0MX 1XEJA 1LJGA 1YAPA 4YEOA 4YF2A 2H5ZA 4PJ2C 5LIOA 1DKKA 1C10A 1B9OA 1KIRC 2BQJA 1LCNA 3AGHA 4NWHA 1HEQA 2Z37A 1J1PY 5KXRA 4Z46A 5LYTA 5KXPA 5KY1A 3WXTA 4KPMA 1LPIA 1REZA 1B5YA 4LYMA 1O23A 2EIZC 1UIBA 4NGOA 4N9RA 1FLQA 1GF3A 4H9AA 2BQGA 1IX0A 1OUIA 5HMVA 4G4CA 3CSZA 6LYZA 5M1YA 5ILCA 4TX7A 1DI5A 4KL7A 3W6AA 3B72A 4NGKA 4NSIA 1VDQA 1GWDA 5L9JA 4RDSA 3WMKA 4GN4A 5A3EA 1JHLA 1BHZA 2A7FA 1YKYX 2IHLA 2I26L 5FSTA 2DQCY 4ANRA 2XBRA 1EQ4A 2GV0A 1AKIA 2BQCA 4DD2A 4DT3A 1DQJC 1GB6A 3A34A 1HFYA 1LZ6A 3TXKA 4PHIA 1CKCA 1F6RA 2EQLA 2Z12A 1LYOA 3HFMY 4XYYA 1QDTA 4YM8A 1IWVA 4OOTA 3EMSA 4N8ZA 4CHXA 1FKQA 3TXJA 3LYMA 3EO5A 1LMOA 1WTNA 2G4NA 1UA6Y 1HFZA 1I1ZA 5JENB 1C43A 4NWEA 1XGQC 1LHHA 3T6UA 2DQHY 2YBIA 2BQLA 1IP2A 2BQOA 2RSCA 4RLMA 1IR7A 4WLXA 1QQYA 1GXV2 1LJ3A 1B7PA 5LA5A 1XGTC 1BVKC 1GE1A 1GFVA 1GB0A 2I6ZA 2HEAA 4WG7A 4DD1A 4DD9A 1AT6A 1B7OA 2CJLA 2YBNA 4LFXA 1IP7A 4E3UA 1LSYA 4IASA 4ML7A 1OUDA 1E8LA 3HBEX 3WUNA 2N5ZA 1AM7A 1BB5A 2XJWA 4TTDA 2AUBA 4NG1A 1A2YC 1GAZA 1LSAA 4HJYA 1VDSA 3CSRA 4DDAA 4HP0A 3AYQA 4J0LA 4NGWA 2Z2EA 5DM9A 1B7MA 3P65A 1D0MA 4H9BA 5LAGA 1LYYA 3WPLA 4HTNA 1V7TA 2ZNWY 1UACY 4LFPA 2I25L 4EMNA 5APFA 4ETDA 4LZTA 3M18B 1B7SA 1GFGA 3CSQA 1IP5A 1NKHA 4XJIA 3ULRA 1B5ZA 4D9ZA 1MELL 4NEBA 1FN5A 3TXFA 4DC4A 1BGIA 1N4FA 3OJPA 4NG8A 2HEFA 4U3XB 1GFKA 3GXKA 5FDJA 2HU1A 1BVXA 4TUNA 4C5FA 4H91A 1IOSA 1CJ9A 3KAMA 3ZVQB 1XEKA 4W94A 1IY4A 3EBAB 4N0JA 1GFTA 3TMXA 1GEVA 4DD0A 2MEEA 3AZ5A 5FEKA 1NF5A 1XGPC 1FLUA 1TEWA 2CGIA 4A7DA 4X3BA 3LYZA 2H9KA 3G3AB 1REYA 4H93A 3AJNA 2ZILA 1KIQC 4N5RA 3D9AC 5APCA 5FELA 3QY4A 4ETEA 1LJNA 1QIOA 4WOAA 1DXJA 1EL1A 4NY5A 2F4AA 1DPWA 133LA 4L41A 1F0WA 1D0KA 4G4HA 1LSFA 3HBDA 1D6QA 1GBWA 2YVBA 1LZTA 1A4VA 5HMJA 2FYDA 3AB6A 5KXLA 3IJVA 1GFEA 3D3DA 1LYSA 5DN5A 1F6SA 5KXNA 2Z39A 1RE2A 5FCPA 4NGIA 1YL1X 1GFRA 5LAFA 1LMNA 1HNLA 1HSXA 2LYOA 1GF4A 1LZCA 5F9XA 1LHJA 3E3DA 3B0IA 1LZRA 5APDA 4H9CA 1OUFA 1VATA 4H90A 5I54A 1HEMA 1FLYA 1OUGA 4XJHA 1QUSA 5KKJA 1CKHA 1RJCB 1UICA 2IFFY 5B59A 1OQMA 1P2CC 1JTTL 1GE4A 3G3BB 4MCKA 3TXHA 4NHIA 2BLXA 193LA 1HMKA 3N9CA 4PGJB 2DBTA 1B7QA 2HTXA 3WPJA 207LA 2BQIA 1DKJA 2CWIA 2W1MA 1LMAA 1GB7A 1QTEA 5KXOA 1BWJA 5A3ZA 3IWRA 4LYTA 1J1OY 4KT3A 5J7CA 4OOOA 3W3EA 1VFBC 1LZAA 1IWTA 4WM1A 1IP6A 4IJ4A 2MEIA 2Z18A 5B07A 1B7RA 5KXYA 1HSWA 1OUJA 3A67Y 1FBIX 1FDLY 2BQNA 1LSGA 1GE2A 3W6FA 1ZVHL 1LZBA 3LZ2A 1UIAA 4ETBA 4O34A 1CKGA 3EXDA 3TXDA 5K7OA 4TSCA 3A93A 1GBXA 2BQBA 1GBSA 3CB7A 4UWNA 4NFVA 4NHQA 1LZ8A 1UIGA 4GN5C 4B4EA 4GLAA 1B5VA 5FHWA 1KXXA 1LSCA 3M3UA 1GF7A 4N1CC 3WL2A 3CT1A 2YDGA 1IWYA 1HEWA 5D5CA 3T36A 3J4GA 1LJFA 3LZTA 1D6PA 4R6CA 5LVKA 1YAOA 2DKVA 4I0CA 2MECA 1GFAA 4WL6A 2Y8PA 1NHEA 3OK0A 4HTKA 1GF8A 1LMTA 2F30A 2LYZA 5I53A 1IWZA 4GCFA 1LZYA 1C7PA 1LHIA 4XENA 3A90A 2DQFC 3LYOA 3TXIA 3WH1A 1T6VL 1HHLA 2BQFA 5LVIA 3J6KA 1C46A 4LGKA 1RI8B 1HC0A 1GE0A 4H8XA 1XFPL 1D9UA 3WU7A 3F6ZA 4FJRA 1GPQC 1KXWA 5I4WA 1EQ5A 1DI4A 5IHGA 4LYZA 1CJ6A 3LHMA 4WM2A 1JJ3A 4R0FA 2D4IA 2XTHA 4N1EI 2PC2A 1GD6A 4NHPA 3N9EA 2ZQ3A 1LYZA 1MLCE 5LYZA 1WQNA 2HEDA 2ZNXY 4ZIXA 3K3TA 3W6EA 2HUBA 5B1GA 4GCBA 1LSNA 1NQIA 4DWXA 4NGLA 1IWWA 2Z2FA 3RU5A 5LINA 1QSWA 3FE0A 4LYBA 3WPKA 4HJVA 3WULA 4WL7A 4NGVA 2ZYPA 2YBJA 1IC4Y 4H8ZA 1QUTA 4HPEA 4RW1A 4GCCA 4H92A 3W6DA 2DQGY 1XEIA 1ZVYB 1FLWA 3AGIA 5C6LA 3A96A 4J1BA 3ZEKA 2ZQ4A 5LXWA 134LA 1IOTA 1B7NA 1CKFA 1JKBA 1I20A 4I8SA 4XJFA 2YBMA 1W08A 3RW8A 5C6JA 4NGYA 8LYZA 4WLTA 4XJDA 1WQQA 5II3A 1B2KA 4QGZA 2ZIKA 3P4ZA 1NDMC 1OUAA 5EBHA 3B0KA 2W1LA 4CFOA 1GB2A 4GCDA 2DQIY 2MEGA 1JSFA 4PRUA 1IC7Y 3A92A 4UWUA 4DD3A 1AT5A 1BB3A 5KXXA 1LSZA 4ET9A 1YILA 4B49A 3A3RX 4WG1A 4OWEA 4NSHA 1JUGA 1WQRA 1G7JC 3A94A 3BKVA 1LJIA 1IR9A 2C8OA 1IIZA 2FYCA 1LZ5A 1LSMA 1GF9A 5KXSA 3A8ZA 2H9JA 1LSPA 4LYOA 4GN3A 1G7MC 3SP3A 1WQOA 1WQPA 1JJ1A 1Z55A 3RNXA 1HF4A 154LA 1FKVA 2W1XA 3AZ7A 4H9HA 2G4PA 1I56A 2MEDA 1ALCA 1UIHA 1IP4A 4XN6A 2DQAA 5F81A 1LZ9A 1HMLA 3P66A 1GBZA 4LT3A 4M4OA 5IELA 1UIFA 1UUZC 4J7VA 1HEOA 2BQHA 3TMWA 3WYHA 1JPOA 2EKSC 1CNSA 3BKHA 4P2EA 5L3IA 5KJ9A 4HV1A 3AZ4A 4NIJA 4NSGA 1TCYA 1B5XA 3LN2A 1GBOA 1B5WA 1C08C 1REMA 3P64A 1GDXA 1RFPA 1WVUA 1RCMA 1JJ0A 4AXTA 1TAYA 4DDCA 4UWVA 2LZ2A 3VWOA 1JKAA 4M6DA 4EOFA 2BQMA 4G9SA 1IVMA 1GEZA 1CJ7A 1LKSA 1REXA 4NSJA 5AMYA 4QEQA 1JKDA 4YEMA 5I4YA 1GBYA 4GLVA 5HNCA 2BPUA 3FI7A 1LKRA 4TWSA 3IJUA 1W6ZA 2G4QA 4WM5A 1OUHA 4WM4A 3TMUA 1LOZA 4BAFA 1YKXX 4AGAA 1IY3A 1XGUC 4NHSA 1OUEA 4KXIA 2YBLA 4G4BA 4MR1A 1LZDA 4LT1A 1IWXA 1LJEA 1LZ1A 1YIKA 1IP3A 1INUA 5DLAA 1CJ8A 1LZNA 5LA8A 1GB9A 4ETAA 4II8A 1IOCA 1LTMA 1F10A 2NWDX 1KIPC 2LHMA 4HV2A 1VAUA 5L3HA 4WM3A 1LSDA 2W1YA 2BQEA 1IR8A 2BAAA 5F14A 4MSTA 1JTOL 3RZ4A 2DQDY 4QDNA 4W96A 1KXYA 3AW7A 1JKCA 1QSAA 1SLYA 2B5ZA 2EPEA 2YBHA 1VDTA 1DZBX
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1XGRC 1JITA 3TMVA 4CFPA 2MEBA 1L48A 2D4KA 3ZVQA 4PRQA 3A91A 1GDWA 1IEEA 5KXKA 3CT5A 3LZMA 2HU3A 3GXRA 4I7SA 120LA 1BB7A 1CX6A 1WTMA 1YQVY 2FBBA 257LA 1YAMA 158LA 1LHLA 222LA 3CT0A 1CV6A 2RH1A 1LJ4A 4RLNA 4WLYA 3N9AA 4LT2A 235LA 1JISA 1HENA 4G49A 3NY9A 1BWIA 2F4GA 1YAQA 4WMGA 1IC5Y 2NTGA 1DYGA 4C3WA 3HTGA 4GCEA 3WVYA 2C8PA 194LA 112LA 1PQJA 1GF0A 1V7SA 1XSFA 3LYTA 1L89A 1OP9B 4YENA 4FDYA 4RW2A 4HPIA 1GHLA 1L49A 1LYFA 1C6BA 3RZEA 4OWAA 4B4IA 4IATA 5LYMA 3V2YA 1P5CA 1BB6A 1LW9A 3A6BY 4J1AA 249LA 185LA 1C61A 5F16A 2Z38A 5I4XA 198LA 1UC0A 1QT8A 1T8FA 4CJ2A 231LA 1CX7A 2D91A 1LWKA 3FA0A 1YL0X 1L04A 2B74A 211LA 5B05A 4PK0A 1HFXA 2VB1A 4PJ2C 1C10A 1B9OA 3AGHA 1HEQA 4Z46A 4AQNA 2LC9A 5KY1A 4KPMA 1LPIA 1B5YA 1LYEA 3CSZA 4G4CA 4NGKA 1L13A 4NSIA 4I7RA 4GN4A 1JHLA 1T97A 2IHLA 2I26L 1L81A 5FSTA 2DQCY 4ANRA 115LA 1AKIA 3CDRA 4DD2A 4DT3A 3A34A 3DMXA 3HTDA 2F47A 1QDTA 3SBBC 2CUUA 4OOTA 3EMSA 1L32A 221LA 126LA 1L0JA 1UA6Y 131LA 1DYEA 1LHHA 3GUIA 4EKRA 1BVKC 4DD1A 1QT3A 1AT6A 2CJLA 183LA 1L40A 3HBEX 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1XGR C;  4TSB A;  4YOP A;  1SQ2 L;  2DQE Y;  4Z98 A;  1JIT A;  2HEE A;  3AZ6 A;  3B0O A;  3TMV A;  5DN4 A;  4H9I A;  4CFP A;  5IDD A;  2LYM A;  1GE3 A;  5KKI A;  2MEB A;  2HEB A;  5KXW A;  2HEC A;  2D4K A;  1LHM A;  3ZVQ A;  4H9F A;  5B06 A;  1IWU A;  4OW1 A;  4PRQ A;  4PPO A;  4NHT A;  1EQE A;  2YSS C;  4B0D A;  4B4J A;  1GXX A;  3WXU A;  3A91 A;  5APE A;  1GDW A;  5C6I A;  3B6L A;  1IEE A;  4DYG A;  2MEH A;  3W6C A;  2CDS A;  1GFU A;  2D6B A;  3CT5 A;  5I5Q A;  2HU3 A;  3TXG A;  5KXK A;  3GXR A;  1B0D A;  1JWR A;  1PS5 A;  2FBD A;  1BB7 A;  4ET8 A;  1WTM A;  1JSE A;  1YQV Y;  1GFH A;  1H87 A;  5LVG A;  3AGG G;  2FBB A;  5LVH A;  4H1P A;  2BLY A;  4HTQ A;  1GB8 A;  1UID A;  4Z41 A;  1LJJ A;  1YAM A;  3ATO A;  1BQL Y;  4WO6 A;  5KXT A;  2Z19 A;  4WM6 A;  2LZT A;  1WQM A;  3QE8 A;  1BWH A;  1H6M A;  2BQD A;  3P68 A;  1LSE A;  2MEA A;  1LJK A;  4H8Y A;  7LYZ A;  1LHL A;  3CQL A;  4XJB A;  3WU8 A;  1OUB A;  1UCO A;  3CT0 A;  1LJ4 A;  4RLN A;  4WLY A;  4B1A A;  1HER A;  3N9A A;  4LT2 A;  4XAD A; 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 1HF4 A;  154L A;  1FKV A;  2W1X A;  3AZ7 A;  4H9H A;  2G4P A;  1I56 A;  2MED A;  1ALC A;  1UIH A;  1IP4 A;  4XN6 A;  2DQA A;  5F81 A;  1LZ9 A;  1HML A;  3P66 A;  1GBZ A;  4LT3 A;  4M4O A;  5IEL A;  1UIF A;  1UUZ C;  4J7V A;  1HEO A;  2BQH A;  3TMW A;  3WYH A;  1JPO A;  2EKS C;  1CNS A;  3BKH A;  4P2E A;  5L3I A;  5KJ9 A;  4HV1 A;  3AZ4 A;  4NIJ A;  4NSG A;  1TCY A;  1B5X A;  3LN2 A;  1GBO A;  1B5W A;  1C08 C;  1REM A;  3P64 A;  1GDX A;  1RFP A;  1WVU A;  1RCM A;  1JJ0 A;  4AXT A;  1TAY A;  4DDC A;  4UWV A;  2LZ2 A;  3VWO A;  1JKA A;  4M6D A;  4EOF A;  2BQM A;  4G9S A;  1IVM A;  1GEZ A;  1CJ7 A;  1LKS A;  1REX A;  4NSJ A;  5AMY A;  4QEQ A;  1JKD A;  4YEM A;  5I4Y A;  1GBY A;  4GLV A;  5HNC A;  2BPU A;  3FI7 A;  1LKR A;  4TWS A;  3IJU A;  1W6Z A;  2G4Q A;  4WM5 A;  1OUH A;  4WM4 A;  3TMU A;  1LOZ A;  4BAF A;  1YKX X;  4AGA A;  1IY3 A;  1XGU C;  4NHS A;  1OUE A;  4KXI A;  2YBL A;  4G4B A;  4MR1 A;  1LZD A;  4LT1 A;  1IWX A;  1LJE A;  1LZ1 A;  1YIK A;  1IP3 A;  1INU A;  5DLA A;  1CJ8 A;  1LZN A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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