155LA

Control of enzyme activity by an engineered disulfide bond
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFANALRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Alanine scanning mutagenesis of the alpha-helix 115-123 of phage T4 lysozyme: effects on structure, stability and the binding of solvent.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 56
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1994-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 155lA00
1L22A 3SB6A 1L25A 107LA 3SBBC 206LA 1G1WA 2LC9A 216LA 3OE0A 192LA 3NY8A 157LA 1D3FA 1L88A 167LA 145LA 261LA 4W53A 2HULA 1P7SA 3CDQA 1C6GA 4EPFA 1P37A 4YXCA 1L67A 3HH5A 1T6HA 146LA 1L85A 4ZPUA 1L29A 1L62A 234LA 1XJTA 4I7OA 1L21A 232LA 1P64A 200LA 1OVKA 1L16A 190LA 164LA 173LA 2B6XA 3L2XA 3HTDA 1L05A 1L24A 3DNAA 253LA 1LW9A 1C64A 1C6CA 1L27A 3HWLA 177LA 1DYGA 215LA 4ARPA 231LA 1D2YA 1DYDA 1OYUA 1L10A 1L57A 2OE9X 4W51A 1L31A 1SX2A 212LA 110LA 1KY1A 245LA 1C61A 1LGXA 1ZWNA 1L17A 1QSQA 222LA 3DMVA 1PQMA 262LA 1C6DA 3HH3A 1CUQA 163LA 168LA 1C6MA 1L53A 1L39A 2CUUA 159LA 4I7SA 1L99A 2LZMA 1DYEA 1L03A 1C6AA 129LA 178LA 3HH4A 1P2LA 3HU8A 1L20A 1L56A 144LA 1I6SA 1D3MA 1L87A 1SSWA 247LA 4ARMB 174LA 1SSYA 1P36A 248LA 151LA 1L51A 1PQDA 2RB0X 1G0QA 1L55A 2F32A 147LA 2OTZX 230LA 4LZMA 2HUMA 1JQUA 176LA 1L30A 131LA 223LA 1G0GA 2O79A 1DYCA 1L04A 3DKEX 1L60A 1LLHA 1LYIA 113LA 1PQOA 1L65A 260LA 165LA 1L08A 1L52A 4I7RA 1L71A 1G0MA 1ZYTA 2RBOA 123LA 3C7WA 1C6TA 4YXAC 1L0JA 5I14A 1QT8A 3F9LA 1D9WA 3CDVA 2HUKA 102LA 3C83A 240LA 2RAZX 3SB9A 241LA 161LA 1KNIA 3GUMA 1C6QA 250LA 1CV4A 1C68A 1G06A 258LA 1L76A 2RH1A 1L70A 3DN8A 3DN4A 1CU0A 162LA 1L94A 1QUGA 140LA 2B74A 1CVKA 1LYFA 138LA 2RBPA 187LA 186LA 2OU8A 4I7JA 4W57A 2A4TA 1P56A 3HT9A 220LA 1L11A 1OWYA 4EKSA 1L34A 4ARLA 6LZMA 1L0KA 1L47A 160LA 2LCBA 155LA 3F8VA 3C8SA 259LA 3GUKA 3ODUA 3PBLA 1QUHA 3DMXA 3GUIA 249LA 4I7QA 1L45A 1QTZA 198LA 1CV0A 143LA 246LA 119LA 236LA 1CX6A 126LA 205LA 1SWYA 1T97A 4W55A 1C6EA 1L01A 3DN2A 1L58A 3OE9A 1P6YA 3DMZA 1L89A 1L84A 4PK0A 1L81A 1CTWA 191LA 1D3NA 1L09A 3C7ZA 128LA 1PQKA 1L73A 1L40A 199LA 211LA 2OU0X 1QT5A 226LA 2OTYX 1L69A 3DN6A 218LA 1QS5A 1L12A 1L74A 1L42A 3SB8A 1OV7A 1C6HA 4IAPA 1CU6A 1OWZA 1L66A 103LA 158LA 1LYGA 3DN0A 1C6JA 166LA 1DYBA 108LA 3CDRA 5LZMA 3CDTA 2RBRA 255LA 1JTMA 1C66A 1QTBA 224LA 175LA 1QT4A 196LA 1L80A 1C6FA 256LA 1C60A 1C6PA 1C6NA 1NHBA 2OE4X 1C69A 182LA 3HT8A 3PDSA 3NYAA 1L07A 1C67A 1LPYA 1L96A 4I7LA 2RBSA 141LA 3SB7A 2Z6BA 4E97A 1T8GA 188LA 4DAJA 1KS3A 1JTNA 3FADA 3DN1A 1C62A 3GUPA 3OE8A 1KY0A 2B6TA 1L14A 3EMLA 2O7AA 201LA 4LDOA 1L28A 1XEPA 2RBQA 169LA 239LA 127LA 4ARQB 214LA 2NTHA 1G0KA 1G07A 4EKPA 2F47A 3HU9A 4DJHA 130LA 2RB2X 1LWKA 2B6YA 3RZEA 2OE7X 3JR6A 3CDOA 3C8RA 4I7NA 4W54A 4EKQA 233LA 1L15A 3HTGA 3D4SA 1L19A 1L97A 1SWZA 2RAYX 1CX7A 1L32A 1L36A 1LGUA 225LA 4YX7C 1CU2A 3G3XA 184LA 2B6WA 171LA 181LA 1L86A 185LA 1G0JA 1CU3A 1L44A 1LYJA 2B6ZA 1QT6A 1L98A 1QTHA 244LA 1P2RA 4I7KA 2OU9A 4W59A 1QTCA 1L18A 1LGWA 1L02A 4ARJA 1C63A 4ARMA 1L50A 3C7YA 1L54A 2IGCA 1LI3A 1T8FA 1CUPA 1L83A 172LA 3SN6R 1L93A 4EJ4A 104LA 112LA 1WTHA 118LA 3GULA 2Q9EA 1LI2A 1SX7A 1C6IA 3FA0A 4K5YA 1D2WA 3HT7A 1L49A 1DYFA 252LA 3SBAA 4GBRB 149LA 1XJUA 4W52A 235LA 109LA 3HTBA 1L33A 254LA 1C6BA 1L92A 1P46A 1L41A 2QARC 1G0PA 3HDEA 237LA 4EXMA 3C81A 1QSBA 1P3NA 1K28A 1LYDA 238LA 1OV5A 4S0WA 3HUQA 1L95A 213LA 1QTDA 1L46A 1PQJA 1L35A 1OVJA 189LA 3QAKA 2L78A 1L23A 139LA 1C6KA 1CU5A 3GUNA 1EPYA 1PQIA 251LA 4W58A 2RBNA 3DN3A 3GUJA 4AQNA 2QB0B 3GUOA 4LDEA 2B75A 1L06A 3HDFA 4I7MA 2NTGA 1L00A 1G0LA 2B7XA 3G3WA 3G3VA 1LYHA 2OEAX 1CV3A 1OVHA 1DYAA 114LA 197LA 2O4WA 243LA 4PJZA 3RUNA 170LA 3HUKA 1LYEA 1B6IA 229LA 1L63A 1L38A 2ANVA 217LA 2F2QA 1CV5A 1L68A 1L13A 3UONA 142LA 180LA 1T8AA 210LA 1L64A 3HT6A 4GRVA 1KW7A 1D3JA 111LA 156LA 1CV1A 1L82A 1C65A 1L75A 242LA 257LA 1LWGA 4LDLA 3K2RA 2B70A 3HUAA 4DKLA 1ZURA 1QT3A 1L37A 3C80A 115LA 1QUDA 137LA 4I7TA 4EPIA 1KW5A 1QUOA 209LA 148LE 3HTFA 120LA 195LA 1L48A 4I7PA 183LA 3C82A 4OO9A 1L91A 1L59A 1L90A 2Q9DA 3V2WA 1L72A 2B72A 1L77A 2ANXA 1LI6A 3SB5A 219LA 1P5CA 152LA 3V2YA 227LA 1CV6A 4W56A 1L43A 2B73A 1G1VA 3OE6A 1TLAA 1QT7A 1QTVA 3C8QA 7LZMA 1QS9A 1L61A 2RB1X 4EKRA 150LA 1L79A 3HH6A 122LA 1C6LA 3L64A 3NY9A 221LA 3FI5A 4ARQA 3VW7A 3LZMA 125LA 228LA 1L26A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3SBBC 1JIYA 2HEFA 2HECA 2MEGA 5KXZA 132LA 216LA 4YEMA 3OE0A 192LA 1RFPA 3AW6A 1GBOA 1D3FA 1W6ZA 1L88A 1TEWA 1JPOA 2HULA 1P7SA 3FI7A 1P37A 5FEKA 3W6EA 1OUGA 4H9IA 3WYHA 1H6MA 234LA 1XJTA 1HMLA 2F30A 1CKCA 3IJVA 1FLYA 200LA 5II3A 3L2XA 1OUBA 1L05A 4CFOA 5KKJA 2D4JA 4N8ZA 1L27A 3LYZA 4NFVA 4TUNA 1D2YA 1DYDA 3P68A 1L10A 3CSQA 1B7SA 1SX2A 1LYSA 212LA 2ZWBA 1BWIA 3WPKA 4WMGA 4H9BA 1LJKA 1OUFA 5B06A 1ZV5L 1PQMA 262LA 1C6DA 3HH3A 2DQCY 6LYZA 1CUQA 1B5WA 1RJCB 1BWJA 1A2YC 1L03A 1LZ4A 1HELA 2D6BA 2BQLA 4ARMB 1YQVY 174LA 2H9KA 1B9OA 2D4IA 3RU5A 1LZ8A 4IASA 1IEEA 1B7PA 1LHHA 176LA 4MR1A 1DYCA 1NHEA 2YBHA 2BPUA 1L60A 4B4EA 4CFPA 5LXWA 1G0MA 1ZYTA 1WVUA 2H5ZA 3C7WA 123LA 2Z2FA 3P66A 4YXAC 3CSZA 4IJ4A 1J1XY 1GAYA 2HUKA 5KY1A 2RAZX 3A91A 1YILA 2XBSA 4MSTA 3GUMA 1GB3A 1IWXA 5LAGA 5KXMA 1G06A 1L76A 4N9RA 1GAZA 3DN4A 1CU0A 1GE4A 1QUGA 2A7DA 187LA 2OU8A 4W57A 220LA 1LZEA 1TBYA 4WM6A 2NWDX 160LA 3ODUA 2D91A 1IY3A 4QDNA 249LA 198LA 1JKCA 246LA 5KXLA 1CX6A 2YBJA 1SWYA 2MECA 4W55A 1C6EA 1L01A 1IR8A 1VAUA 3AYQA 3DN2A 4C5FA 4DDBA 1IP3A 1D9UA 1GPQC 1HEWA 4DD0A 1CNSA 3A8ZA 1L09A 3J6KA 2FYCA 1L73A 199LA 2OU0X 1IP7A 4Z98A 2MEHA 1QS5A 1L42A 2DBTA 5E9RA 158LA 1IC4Y 4H1PA 1LJGA 3B0IA 4TSCA 2EKSC 2RBRA 1OUJA 255LA 1GDWA 4RLNA 3KAMA 1G7JC 1QT4A 1QDRA 1L80A 1MLCE 1T3PA 182LA 3HT8A 1L96A 4I7LA 1HFXA 4LZTA 1DKJA 1I20A 2Z6BA 3W6CA 7LYZA 1T8GA 1XGUC 4NHIA 1LSDA 4H94A 4N1CC 3OE8A 1GBXA 1G7MC 4O34A 3D3DA 1LKRA 1L28A 2RBQA 239LA 1YL0X 4XJBA 5KXNA 1GE3A 3BKHA 3CDOA 3A90A 3HTGA 3D4SA 9LYZA 1NDGC 1IORA 1LSZA 5I5QA 1A4VA 1CX7A 1L32A 1L36A 1GF4A 4YX7C 1LMPA 4LYCA 4ZIXA 171LA 1L86A 1LZYA 2YDGA 1G0JA 193LA 5DN4A 1O23A 2B6ZA 3WL2A 1QTHA 4W59A 1L18A 2LYOA 1L02A 2BQFA 4ARJA 1RI8B 1WQQA 1QUSA 3CT1A 5F9UA 4NSIA 1LZTA 4GN4A 172LA 1DXJA 3SN6R 1L93A 4EJ4A 1JUGA 118LA 4LT2A 3WXUA 4NSGA 5KXTA 1GB5A 5LVKA 1LZ9A 4GBRB 235LA 3HTBA 4ETCA 3WW5A 4LYOA 1C6BA 1L92A 1G0PA 4DD3A 4EXMA 4G4CA 1LYDA 238LA 2MEBA 1PQJA 1L35A 1VATA 1BB4A 3QAKA 4B49A 1C6KA 1GB0A 4PGJB 4ETAA 2RBNA 2DQGY 2W1MA 5ILFA 2B75A 1LZ6A 1JKDA 1CV3A 1DYAA 114LA 1JISA 5T3FA 1NQIA 197LA 1B6IA 1SQ2L 1B7LA 5HNCA 1CV5A 1JJ1A 1XFPL 1IOQA 1L64A 3HT6A 1KW7A 1LZ1A 1C65A 1LWGA 1GFUA 3HUAA 5D5CA 2FBDA 1ZURA 5KXOA 4NGWA 1JTOL 137LA 1IP5A 3WPLA 1QUOA 1OUIA 1UIGA 5DM9A 3HTFA 1LMOA 1L48A 1C46A 4I7PA 1DKKA 1OUHA 4YOPA 3C82A 4OO9A 1AZFA 1UACY 4IATA 4OWHA 4G4BA 3V2WA 2Z37A 2ANXA 1HF4A 1LI6A 1GE2A 2BQDA 1OUCA 1REZA 152LA 4HSFA 3V2YA 4DQ7A 4LGKA 4WG7A 1DZBX 3TXFA 1WTMA 1QS9A 3P65A 4J0LA 1KXYA 4EKRA 1L79A 3G3BB 208LA 1C6LA 3TXHA 5F81A 3LZMA 5DLAA 1L26A 3SB6A 4NHTA 1L25A 1PS5A 4WLTA 1KIQC 1LZNA 2LC9A 3NY8A 167LA 145LA 1GB9A 1DPXA 3CDQA 1AT6A 2DKVA 1CKHA 4YF2A 4XJDA 146LA 4ZPUA 4NHSA 1L29A 2ZYPA 4I7OA 4N5RA 1BHZA 1REXA 1L16A 164LA 173LA 1RE2A 2B6XA 4YENA 1L24A 2LHMA 1C6CA 3B0KA 3HWLA 4GCBA 4DD2A 4ARPA 1GFHA 1OYUA 1CJ9A 4W51A 5HMVA 3B0OA 4N0JA 1TCYA 1ZWNA 4DD9A 4NWEA 1L17A 1V7TA 1L39A 3ZVQB 1LZAA 4XN6A 4TSBA 1DYEA 2MEDA 1C6AA 2FBBA 129LA 178LA 1P2LA 1GXV2 4NHQA 1L56A 1JSEA 4CHXA 2A7FA 5KXRA 1I6SA 3AZ7A 1D3MA 247LA 1LKSA 1VDQA 1GF6A 4LT3A 4W96A 1YKXX 1L55A 1IIZA 2F32A 2HU1A 1VFBC 4NGIA 1NBYC 230LA 2HUMA 2YBLA 1JQUA 5LA8A 4DT3A 4YM8A 131LA 1G0GA 1LMCA 2O79A 1XSFA 4H9AA 4XYYA 2DQIY 1PQOA 1L65A 260LA 165LA 1L08A 4WM3A 4PJ2C 3RW8A 2RBOA 4NY5A 1C6TA 3TMVA 1WQMA 1L0JA 3CDVA 2C8OA 3C83A 1QDTA 1YAMA 4N1EI 241LA 1GBWA 4H8XA 1B7OA 1C08C 3QY4A 1GFVA 5F9XA 1GF0A 3DN8A 3TMXA 134LA 2BQBA 1GBYA 2A4TA 1P56A 3HT9A 1L11A 4PHIA 4KT3A 3HBEX 4I8SA 1IP2A 3ATNA 3F8VA 3C8SA 259LA 3PBLA 1BB6A 4HTNA 1QUHA 5LA5A 1E8LA 1F6RA 1HSXA 143LA 119LA 3CSRA 205LA 3M18B 4H8ZA 4FDYA 1L58A 1P6YA 1YKYX 3DMZA 4PK0A 1L84A 3ULRA 191LA 3C7ZA 3AB6A 1PQKA 1L40A 226LA 3LYMA 4KL7A 1OUEA 1XGPC 1L12A 3F6ZA 1TDYA 5FHWA 3SB8A 1FBIX 1OV7A 1CU6A 1UIBA 1I56A 1OWZA 5C6IA 4NG1A 1HMKA 1BWHA 3DN0A 4R0FA 5LIOA 5LZMA 135LA 256LA 1C60A 5APCA 1C6NA 1HENA 4Z3MA 4HPEA 3VWOA 1C43A 1LPYA 1LZSA 2HEEA 4EMNA 188LA 5KXWA 153LA 1JTNA 1SLYA 4QEQA 2CWIA 3OK0A 2Y8PA 1C62A 3GUPA 3EMLA 3LN2A 1OP9B 3LZ2A 127LA 1JKBA 4ARQB 1LZRA 2BQOA 214LA 1GEZA 2F47A 1CJ7A 2BQHA 3RT5X 1INUA 130LA 4DDCA 2I26L 2OE7X 5LINA 4W54A 233LA 3TXGA 1LSEA 4D9ZA 2Q0MX 184LA 1G7HC 4NGKA 5IHGA 1QSAA 1ALCA 3HBHA 1RCMA 5IELA 1QT6A 2EPEA 1LSNA 4RDSA 1P2RA 3W6AA 1C63A 2ZNWY 1B0DA 2IGCA 4BAFA 1KIPC 2BQJA 3K3TA 1T8FA 1LMNA 1LYZA 1HEPA 3A94A 3WPJA 3TXKA 5I4YA 1SX7A 2DQJY 3FA0A 1GXXA 5FCPA 2HUBA 3SBAA 149LA 1GF3A 1XJUA 1L33A 4DQ5A 3LYOA 1P46A 237LA 4LYTA 4HP0A 3C81A 1IWVA 4WLDA 1OV5A 1XEKA 3HUQA 3CB7A 213LA 1BB7A 3A6CY 1BVXA 1IX0A 3QNGA 4QY9A 1IWYA 3BKVA 6LYTA 2H9JA 1G7LC 5I53A 1JJ0A 4OWCA 4FJRA 251LA 1YKZX 3DN3A 4AQNA 4XJFA 2NTGA 1L00A 1NWGA 2B7XA 3G3VA 1LYHA 4J7VA 4NHPA 2O4WA 4CGEA 2BQNA 4PJZA 2XJWA 3RUNA 170LA 3HUKA 1GB6A 3LZTA 1L63A 1JKAA 2F2QA 3W3EA 3T6UA 180LA 210LA 1LZGA 3WVYA 1W08A 111LA 4AGAA 156LA 1CV1A 1L82A 3RZ4A 3K2RA 4H8YA 1OUDA 2AUBA 1AM7A 3WW6A 1REYA 3A93A 2XTHA 3WU7A 1GE0A 1GF9A 1LJ4A 120LA 2BLYA 1GB8A 183LA 1MELL 1L59A 2Q9DA 1REMA 1L72A 1L77A 1LHIA 4Z41A 3SB5A 3A3QA 3WMKA 227LA 2ZQ4A 1I1ZA 1CV6A 4W56A 1GFKA 1L43A 2B73A 3OE6A 1TLAA 1OQMA 2BQGA 5B59A 7LZMA 5LYZA 2RB1X 1WVVA 1C45A 4PRUA 4GCFA 4NGJA 4UWUA 2Z2EA 1NMMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3SBB C;  1JIY A;  2HEF A;  2HEC A;  2MEG A;  5KXZ A;  132L A;  216L A;  4YEM A;  3OE0 A;  192L A;  1RFP A;  3AW6 A;  1GBO A;  1D3F A;  1W6Z A;  1L88 A;  1TEW A;  1JPO A;  2HUL A;  1P7S A;  3FI7 A;  1P37 A;  5FEK A;  3W6E A;  1OUG A;  4H9I A;  3WYH A;  1H6M A;  234L A;  1XJT A;  1HML A;  2F30 A;  1CKC A;  3IJV A;  1FLY A;  200L A;  5II3 A;  3L2X A;  1OUB A;  1L05 A;  4CFO A;  5KKJ A;  2D4J A;  4N8Z A;  1L27 A;  3LYZ A;  4NFV A;  4TUN A;  1D2Y A;  1DYD A;  3P68 A;  1L10 A;  3CSQ A;  1B7S A;  1SX2 A;  1LYS A;  212L A;  2ZWB A;  1BWI A;  3WPK A;  4WMG A;  4H9B A;  1LJK A;  1OUF A;  5B06 A;  1ZV5 L;  1PQM A;  262L A;  1C6D A;  3HH3 A;  2DQC Y;  6LYZ A;  1CUQ A;  1B5W A;  1RJC B;  1BWJ A;  1A2Y C;  1L03 A;  1LZ4 A;  1HEL A;  2D6B A;  2BQL A;  4ARM B;  1YQV Y;  174L A;  2H9K A;  1B9O A;  2D4I A;  3RU5 A;  1LZ8 A;  4IAS A;  1IEE A;  1B7P A;  1LHH A;  176L A;  4MR1 A;  1DYC A;  1NHE A;  2YBH A;  2BPU A;  1L60 A;  4B4E A;  4CFP A;  5LXW A;  1G0M A;  1ZYT A;  1WVU A;  2H5Z A;  3C7W A;  123L A;  2Z2F A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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