1WTMA

X-ray structure of hew lysozyme orthorhombic crystal formed in the earth's magnetic field
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title Structural consequences of hen egg-white lysozyme orthorhombic crystal growth in a high magnetic field: validation of X-ray diffraction intensity, conformational energy searching and quantitative analysis of B factors and mosaicity.
pubmed doi rcsb
total genus 50
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2004-11-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1wtmA00
3A95A 1FKQA 4KPMA 4BS7A 3WPLA 1IP1A 1GDWA 1GEVA 4ETBA 1GAYA 5KXSA 3TXBA 5KXNA 5D5FA 1AT6A 1I1ZA 1HMLA 1NMMA 4WM1A 3WUMA 1JSFA 1LJNA 1A2YC 4HV1A 1HMKA 4WMGA 3AYQA 4NHIA 2N5ZA 2B5ZA 4HPEA 1VDQA 4WM5A 1OUJA 5KJ9A 5AMYA 1Z55A 4DT3A 4TSBA 4NHTA 2W1MA 4RDSA 4WLYA 2ZILA 1LCNA 1KIQC 3GXKA 1TBYA 4DD2A 1BWJA 2BQMA 5B05A 3OK0A 8LYZA 1CJ7A 5LVHA 3TXEA 1UACY 3WW6A 4OOTA 1HFZA 1VATA 3AB6A 1ZVHL 2F30A 1D0LA 1DI3A 4GN3A 1IX0A 1J1PY 4RLNA 1LYYA 2DQHY 1LHMA 1NBYC 1W08A 1IR7A 4WM2A 1XGPC 1TEWA 1IWUA 1B0DA 4WLTA 1LSBA 3EBAB 1D6QA 1LJ3A 1JPOA 5T3FA 4A7DA 4CHXA 1F6RA 2VB1A 1GF6A 3LYTA 4WL6A 4LYMA 3W6DA 4OWAA 1LMNA 1LZSA 3QY4A 2MEEA 1C45A 1LJFA 2CWIA 2HTXA 1UIFA 1UIEA 1HELA 3LYMA 4MSTA 4YEOA 2BQJA 4GCEA 1HFYA 3TXHA 1WQMA 4H93A 3TMWA 2BQFA 1GFAA 1NHEA 2BQAA 4WO6A 4ETAA 3BKHA 3KAMA 2YBLA 1GBXA 3EO5A 3ZVQA 1VFBC 4X3BA 1CJ8A 1GFKA 1EL1A 2BQOA 1V7SA 4QGZA 4RLMA 4G4CA 2HEDA 4MR1A 1G7LC 2HU3A 2ZYPA 4ETCA 1IOSA 1IC5Y 4HV2A 1WQPA 4B49A 4FJRA 2HEBA 3P66A 1REXA 1RCMA 208LA 2FYCA 3A91A 2YDGA 1HEPA 1KXXA 1BHZA 1DI5A 1LSCA 1YAOA 2RSCA 4GLVA 5FELA 4B0DA 2W1LA 1GBWA 1JKBA 2BAAA 3AW7A 4NY5A 3TMXA 5E9RA 207LA 1LJKA 1GFVA 4OWHA 5APFA 1MLCE 1GB7A 5FSTA 5APEA 1LZ9A 1B9OA 1DXJA 2Z12A 1HNLA 4NIJA 1GWDA 5L3HA 4HTNA 4NSGA 1KIRC 3FI7A 2XJWA 3CB7A 3G3AB 5FEKA 2DBTA 2YBJA 2Q0MX 3AGHA 4AXTA 1LZDA 5LAFA 4CFOA 4DYGA 5LIOA 1IORA 1J1OY 4QY9A 3A34A 1D0KA 3LYOA 4NSJA 4RW2A 4YM8A 1CNSA 5LA5A 4PPOA 1DPWA 1YROA 3W6FA 5L3IA 5KXOA 5IDDA 3WMKA 3WVXA 4WL7A 5DL9A 4H8XA 5KXKA 1NKHA 1GB6A 4L41A 4OW1A 1LPIA 1QTEA 2DQDY 1GF0A 3P4ZA 4NHQA 1B7LA 5EBHA 4ZIXA 4II8A 1EQ5A 2YSSC 5A3ZA 1GB8A 1JKCA 1NWGA 1XSFA 1IWZA 1BB6A 1FLWA 3MGWA 4H9BA 1QSWA 1LZYA 1BWIA 2DQIY 2G4PA 2ZIJA 2ZWBA 1GBSA 1GB9A 4HJVA 4LT3A 5APDA 4IASA 1D6PA 1C46A 2AUBA 4WG1A 4NGJA 1B7PA 1T3PA 1YILA 5LINA 2LZ2A 5A3EA 1B7OA 1JTPL 2DQCY 3RW8A 3D3DA 5LVGA 1IP3A 2Z2EA 1NF5A 1GAZA 4WM3A 2F2NA 3IJUA 1HEQA 3W6AA 4Z41A 2YBMA 4Z3MA 4CFPA 1GE0A 3CSQA 5KXPA 2MEAA 5B06A 4LYCA 3WPKA 2ZYCA 1C7PA 194LA 1LZNA 2DQGY 1FLUA 1B5WA 2Z2FA 1IP6A 3N9EA 3P64A 1YKXX 4WLXA 1WQRA 1IWWA 1XEIA 1CKGA 1CKCA 1GF3A 2HEEA 3HBDA 4XJDA 1GFUA 4GLAA 4GCCA 2BQCA 2BQEA 3E3DA 1HHLA 1G7MC 3IJVA 1FKVA 1LZCA 1JJ1A 1LYZA 1OUBA 1QDTA 1OUCA 1JWRA 5F9UA 4XJBA 4DD9A 1GF8A 4DDAA 4LT2A 3WPJA 3SP3A 1JUGA 4NGVA 4H94A 1IWXA 1BB7A 1FBIX 1PS5A 1IVMA 5LVIA 4CJ2A 1V7TA 1XFPL 1NDGC 2BQBA 2FBBA 1JHLA 4KL7A 1LYOA 4R6CA 2D4JA 1GFTA 4IJ4A 4ETDA 1BB4A 1C43A 2NWDX 1E8LA 4OWCA 1B2KA 3TMUA 1SQ2L 5KXTA 2W1YA 3WW5A 5IHGA 1DI4A 4LYTA 3TXIA 1CKDA 3TXFA 4XENA 4ANRA 5HMVA 1JTTL 4H8YA 2Y8PA 3A3QA 1UA6Y 1OUEA 1TDYA 2DQEY 1G7JC 5LYZA 1NQIA 1VDSA 1YKZX 1REMA 4DD0A 1FLYA 1LZ8A 4LYZA 3ZVQB 1WVVA 4ZFPA 2BQLA 1B5ZA 1LMOA 4AGAA 4GCDA 2G4QA 2PC2A 5C6IA 1IR9A 4FDYA 5KXXA 4C5FA 1LJHA 1LSGA 4WM4A 1OUFA 1XGUC 3T6UA 1XGRC 1LSEA 2LHMA 4M4OA 1GBOA 4TUNA 4DD7A 1F0WA 4J1BA 4KXIA 2BPUA 3WUAA 5JENB 1UICA 3W6BA 2EQLA 5F14A 153LA 4LT0A 1YAQA 1JSEA 5B07A 3RT5X 1UUZC 4G4BA 1LMCA 5F16A 4WLDA 2D6BA 1MELL 1YL1X 1ZV5L 5ILCA 4B4JA 1O23A 1YIKA 4J0LA 1GB0A 3IWRA 4WOAA 3RU5A 1F6SA 1GFHA 1LKSA 1UIDA 3CT5A 2IFFY 1JKAA 3ATNA 1LSDA 1B7NA 4G9SA 1UIGA 5HQ1A 1VEDA 3WXUA 4E3UA 1TCYA 1LAAA 4YF2A 3QNGA 5DLAA 1LZAA 4B4IA 4N1CC 1GPQC 1INUA 4Z46A 4PJ2C 4Z98A 1RE2A 1HEOA 2CJLA 1UBZA 4ET9A 2H5ZA 1IOCA 1EQ4A 4WM6A 1XGTC 4C3WA 1GB2A 3AJNA 3M3UA 4B1AA 5II3A 1B7RA 3FE0A 1GB3A 1FLQA 1IC4Y 1BQLY 5HMJA 1BB5A 5HLLA 1IIZA 4LGKA 1JTOL 4LFXA 193LA 1UIBA 4H9FA 4NSIA 3TXGA 4LYBA 154LA 1LHJA 4NGIA 2XBSA 1OUDA 1CKFA 3LYZA 4P2EA 1KXWA 4WG7A 6LYTA 1LTMA 4H9AA 3P65A 1HEWA 1YANA 1LJEA 1DPXA 1WVUA 3B72A 4RW1A 1CJ9A 1CJ6A 1JIYA 1GEZA 2HEAA 2FYDA 3D9AC 5KY1A 2I26L 1GXXA 4YOPA 1JJ0A 1RI8B 4H1PA 1DQJC 4N8ZA 1GF4A 1IWVA 1LJIA 1GBYA 2WARA 4HTQA 3A96A 4PRUA 1YL0X 4BAPA 1EQEA 1LJGA 3AZ5A 3WUNA 1LHHA 3CSRA 3LZ2A 3ATOA 3B0OA 4NGZA 1IWTA 4XJHA 5KKJA 5LYMA 3CT0A 4HSFA 4H9EA 1HENA 2D91A 4BADA 1C08C 2C8OA 1DKJA 2BQIA 2LYOA 2MEBA 4XYYA 4WO9A 1GBZA 4IATA 5I5QA 4DC4A 3HFMY 5HNLA 3W6EA 4W96A 4ML7A 3WL2A 2G4NA 134LA 2CDSA 2ZNWY 1GF9A 4NGWA 4ZEEA 1PZYA 3TXJA 1UCOA 4YENA 5B59A 4NSHA 2F4GA 1GE4A 4NG1A 2I6ZA 5D5CA 1LYSA 1FN5A 2EIZC 1XEJA 4U3XB 1GE1A 4EOFA 5KKIA 4UWUA 1VDPA 1B7MA 3W3EA 4DDBA 1VDTA 4LFPA 5F81A 5B1GA 3HBHA 1J1XY 4YEMA 3AGIA 1SLYA 1HFXA 1GFJA 2MECA 4J7VA 1G7HC 1GB5A 4ET8A 4HP0A 4H8ZA 7LYZA 3N9CA 4TSCA 1IR8A 2LZTA 2HECA 2DQAA 4NEBA 2MEGA 3EXDA 4GCFA 4MCKA 5APCA 2MEFA 4LZTA 1OUIA 5LAGA 1LSPA 5E4PA 1YQVY 3A90A 5IELA 4TX7A 1WQNA 5KXRA 1OP9B 5I4XA 1AT5A 1B5UA 1DKKA 1WQOA 4TTDA 5B1FA 4G49A 2BLYA 1IP5A 1VAUA 3A92A 4NGLA 1QDRA 1GDXA 1LMTA 1W6ZA 2IHLA 1LSZA 3B0KA 2W1XA 1IOTA 1IY4A 2Z39A 4GCBA 3LZTA 5L9JA 3QE8A 1GFRA 3WULA 3J4GA 1LMPA 1LHIA 1G7IC 2EPEA 3M18B 1GFGA 1HF4A 1H87A 4NGYA 1ZMYL 4QEQA 3AW6A 1HEMA 2F4AA 2DQJY 4NWHA 1LSYA 1RFPA 3WXTA 1GE2A 2D4KA 4O34A 5J7CA 2A7DA 3B6LA 4J1AA 1LZ6A 4R0FA 4N5RA 1LZ4A 3A93A 4HPIA 1OQMA 4I0CA 4KT3A 2MEDA 1BB3A 2Z19A 4B4EA 3AGGG 1YKYX 4H9HA 2BQGA 4XJIA 1B5YA 1N4FA 3LN2A 3P68A 3WH1A 1HSWA 3T36A 1H6MA 5LA8A 5C6LA 5KXZA 1HSXA 2I25L 2ZNXY 3WU8A 1GFEA 2HEFA 1B7QA 4PRQA 1WTNA 1BVXA 3WU9A 5I54A 5ILFA 1B5XA 1T6VL 4BAFA 3W6CA 1C10A 4LYOA 2X0AA 1FDLY 2FBDA 3AZ7A 1QIOA 1ALCA 3A94A 3CT1A 3EMSA 1TAYA 5DM9A 1D0MA 1REZA 1P2CC 1RJCB 2A7FA 3N9AA 5DN4A 1OUAA 1IP4A 3K3TA 4PGJB 1B5VA 2BLXA 1UIAA 5LXWA 4TWSA 1KXYA 1AKIA 4G4HA 1IP7A 1GE3A 4H92A 4UWVA 3WYHA 1QUTA 3GXRA 4HTKA 4XJFA 5KXYA 3G3BB 4I8SA 1LSAA 1LHLA 1LMAA 5I53A 9LYZA 4DD3A 4M6DA 4XJGA 3TXDA 2GV0A 1IY3A 2XBRA 4HJYA 3RNXA 1LZEA 1DZBX 1AM7A 1BWHA 2BQDA 4OWEA 5FDJA 2Z18A 1BVKC 5KXLA 4NHPA 1REYA 3OJPA 3BKVA 4DD1A 1JISA 2EKSC 1HERA 2DKVA 1OUHA 1IWYA 3J6KA 2MEHA 1LSFA 5LVKA 4CGEA 2Z37A 3WVYA 1F10A 1UIHA 1LSNA 1XEKA 1QSAA 1XGQC 2MEIA 1UC0A 2HUBA 1GF7A 4DWXA 1IC7Y 3A67Y 2YBIA 2H9JA 1KIPC 3A6BY 1WTMA 4UWNA 5DN5A 2C8PA 1GD6A 4H90A 2XTHA 3CSZA 5I4YA 2ZIKA 2CGIA 3F6ZA 1JITA 1IOQA 2YBNA 1YAPA 4OOOA 2BQHA 1WQQA 2LYZA 3A8ZA 1GXV2 1LOZA 1LZTA 4NHSA 5F9XA 1LZBA 6LYZA 4D9ZA 4HJZA 4NGOA 1I20A 1QTKA 5LYTA 4XADA 4DDCA 5KXWA 1IO5A 2D4IA 4GN5C 3TMVA 2DQFC 4W94A 4LT1A 4XN6A 3A6CY 1QQYA 3A3RX 2Z38A 5C6JA 2H9KA 3LHMA 1LZRA 2YVBA 1NBZC 3B0IA 3ZEKA 4H91A 1LZ5A 1HC0A 1AZFA 4OWBA 1GF5A 4NFVA 4N9RA 1D9UA 4NWEA 1JJ3A 4PHIA 5FHWA 3WU7A 1IEEA 5KXMA 4QDNA 1LZGA 2ZQ4A 2LYMA 1LJ4A 135LA 3AZ6A 3CQLA 4H9CA 1JKDA 3VWOA 5K7OA 1QUSA 3RZ4A 5M1YA 4N0JA 1YAMA 3HBEX 4EMNA 1CKHA 4NGKA 5I4WA 1BGIA 1B7SA 1IP2A 1GHLA 4H9IA 5LVJA 1LMQA 1NDMC 3AZ4A 3ULRA 1A4VA 1I56A 1LSMA 1OUGA 5HNCA 1LKRA 4N1EI 2YBHA 2HU1A 132LA 2BQKA 1ZVYB 4ETEA 2ZQ3A 4GN4A 1LHKA 3TXKA 133LA 1JEFA 2BQNA 5FCPA 1LZ1A 4NG8A 1LJJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BS7A 1IP1A 1GEVA 1L97A 3TXBA 5D5FA 4WM1A 107LA 1LJNA 4I7LA 3AYQA 175LA 5KJ9A 1L96A 4DT3A 2W1MA 1LCNA 3GXKA 4DD2A 5LVHA 3TXEA 1HFZA 1DI3A 1LHMA 1W08A 4LDOA 1OWYA 1GF6A 3W6DA 4OWAA 3QY4A 1C45A 1LJFA 1UIFA 4OO9A 1UIEA 4W52A 3TXHA 4W54A 3TMWA 1K28A 2ANXA 1GBXA 4G4CA 1L11A 1C63A 186LA 1WQPA 4B49A 4DQ5A 2HEBA 3A91A 1HEPA 1YAOA 5FELA 2W1LA 3TMXA 1JKBA 3AW7A 4E97A 1SSYA 1HNLA 4NIJA 4HTNA 3G3AB 2XJWA 2DBTA 2YBJA 4AXTA 3AGHA 4CFOA 4QY9A 1C69A 3LYOA 4RW2A 1LYFA 2RBSA 1DPWA 195LA 1YROA 5KXKA 4H8XA 3HUAA 1GF0A 1LGWA 130LA 2YSSC 5A3ZA 1JKCA 218LA 2DQIY 1GB9A 4WG1A 1C46A 1B7PA 1B7OA 152LA 3D3DA 1IP3A 4WM3A 1P2LA 3IJUA 157LA 4CFPA 3CSQA 1L67A 1CX7A 1P37A 1G0JA 1B5WA 1IP6A 1PQIA 1L88A 3HBDA 160LA 3IJVA 1FKVA 1LZCA 1LYZA 1OUCA 3DN1A 1QT4A 4XJBA 1GF8A 4NGVA 1PS5A 236LA 1V7TA 2BQBA 4R6CA 3WXTA 4KL7A 4CJ2A 4ETDA 2RBOA 166LA 4DQ7A 1BB4A 3C80A 1E8LA 4ARMB 1SQ2L 4ANRA 4H8YA 3A3QA 158LA 1G7JC 2LZMA 1L56A 1REMA 1YKZX 4DD0A 3ZVQB 4GCDA 1L57A 1L94A 4WM4A 1XGRC 1LSEA 1GBOA 4DD7A 1ZURA 2HUKA 3W6BA 1L14A 1LYDA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3A95 A;  1FKQ A;  4KPM A;  4BS7 A;  3WPL A;  1IP1 A;  1GDW A;  1GEV A;  4ETB A;  1GAY A;  5KXS A;  3TXB A;  5KXN A;  5D5F A;  1AT6 A;  1I1Z A;  1HML A;  1NMM A;  4WM1 A;  3WUM A;  1JSF A;  1LJN A;  1A2Y C;  4HV1 A;  1HMK A;  4WMG A;  3AYQ A;  4NHI A;  2N5Z A;  2B5Z A;  4HPE A;  1VDQ A;  4WM5 A;  1OUJ A;  5KJ9 A;  5AMY A;  1Z55 A;  4DT3 A;  4TSB A;  4NHT A;  2W1M A;  4RDS A;  4WLY A;  2ZIL A;  1LCN A;  1KIQ C;  3GXK A;  1TBY A;  4DD2 A;  1BWJ A;  2BQM A;  5B05 A;  3OK0 A;  8LYZ A;  1CJ7 A;  5LVH A;  3TXE A;  1UAC Y;  3WW6 A;  4OOT A;  1HFZ A;  1VAT A;  3AB6 A;  1ZVH L;  2F30 A;  1D0L A;  1DI3 A;  4GN3 A;  1IX0 A;  1J1P Y;  4RLN A;  1LYY A;  2DQH Y;  1LHM A;  1NBY C;  1W08 A;  1IR7 A;  4WM2 A;  1XGP C;  1TEW A;  1IWU A;  1B0D A;  4WLT A;  1LSB A;  3EBA B;  1D6Q A;  1LJ3 A;  1JPO A;  5T3F A;  4A7D A;  4CHX A;  1F6R A;  2VB1 A;  1GF6 A;  3LYT A;  4WL6 A;  4LYM A;  3W6D A;  4OWA A;  1LMN A;  1LZS A;  3QY4 A;  2MEE A;  1C45 A;  1LJF A;  2CWI A;  2HTX A;  1UIF A;  1UIE A;  1HEL A;  3LYM A;  4MST A; 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 2Z37 A;  3WVY A;  1F10 A;  1UIH A;  1LSN A;  1XEK A;  1QSA A;  1XGQ C;  2MEI A;  1UC0 A;  2HUB A;  1GF7 A;  4DWX A;  1IC7 Y;  3A67 Y;  2YBI A;  2H9J A;  1KIP C;  3A6B Y;  1WTM A;  4UWN A;  5DN5 A;  2C8P A;  1GD6 A;  4H90 A;  2XTH A;  3CSZ A;  5I4Y A;  2ZIK A;  2CGI A;  3F6Z A;  1JIT A;  1IOQ A;  2YBN A;  1YAP A;  4OOO A;  2BQH A;  1WQQ A;  2LYZ A;  3A8Z A;  1GXV 2;  1LOZ A;  1LZT A;  4NHS A;  5F9X A;  1LZB A;  6LYZ A;  4D9Z A;  4HJZ A;  4NGO A;  1I20 A;  1QTK A;  5LYT A;  4XAD A;  4DDC A;  5KXW A;  1IO5 A;  2D4I A;  4GN5 C;  3TMV A;  2DQF C;  4W94 A;  4LT1 A;  4XN6 A;  3A6C Y;  1QQY A;  3A3R X;  2Z38 A;  5C6J A;  2H9K A;  3LHM A;  1LZR A;  2YVB A;  1NBZ C;  3B0I A;  3ZEK A;  4H91 A;  1LZ5 A;  1HC0 A;  1AZF A;  4OWB A;  1GF5 A;  4NFV A;  4N9R A;  1D9U A;  4NWE A;  1JJ3 A;  4PHI A;  5FHW A;  3WU7 A;  1IEE A;  5KXM A;  4QDN A;  1LZG A;  2ZQ4 A;  2LYM A;  1LJ4 A;  135L A;  3AZ6 A;  3CQL A;  4H9C A;  1JKD A;  3VWO A;  5K7O A;  1QUS A;  3RZ4 A;  5M1Y A;  4N0J A;  1YAM A;  3HBE X;  4EMN A;  1CKH A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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