1FKQA

Recombinant goat alpha-lactalbumin t29v
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
124
structure length
124
Chain Sequence
MEQLTKCEVFQKLKDLKDYGGVSLPEWVCVAFHTSGYDTQAIVQNNDSTEYGLFQINNKIWCKDDQNPHSRNICNISCDKFLDDDLTDDIVCAKKILDKVGINYWLAHKALCSEKLDQWLCEKL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords ALPHA-LACTALBUMIN
publication title Contribution of Thr29 to the thermodynamic stability of goat alpha-lactalbumin as determined by experimental and theoretical approaches.
pubmed doi rcsb
source organism Capra hircus
total genus 42
structure length 124
sequence length 124
ec nomenclature ec 2.4.1.22: Lactose synthase.
pdb deposition date 2000-08-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1fkqA00
3WMKA 4MSTA 4O34A 1IIZA 5I4XA 207LA 4NY5A 4OW1A 4B4IA 1C08C 1VEDA 5II3A 1LSBA 2D4IA 1YANA 4G4HA 1QSWA 1IOSA 2W1XA 1UCOA 5B05A 5KY1A 1QUSA 2HEEA 1HMLA 1WQRA 4XN6A 1UIDA 4OWEA 1AT6A 1JSFA 1LZYA 1UC0A 4MCKA 4YM8A 4WG7A 4WG1A 1LJ4A 1LHJA 1CJ8A 5DL9A 4ET9A 2W1YA 1OUGA 1CNSA 2EPEA 3HBEX 4HJZA 5FCPA 1HC0A 4PHIA 3GXRA 5B07A 1XEIA 3EMSA 1HEPA 1JITA 2FBDA 1FLUA 4LYZA 5D5CA 3ULRA 3QE8A 4XJGA 1AZFA 3WVXA 2D6BA 5LAFA 5J7CA 1GAYA 1LZBA 5LIOA 4B0DA 1G7HC 1IWYA 2RSCA 3CT1A 1GFGA 4HSFA 1GF0A 2YDGA 2VB1A 1GPQC 4NG8A 1JHLA 4NGLA 1FBIX 3WL2A 1GDWA 4ETAA 2HTXA 4CFOA 4WO9A 1B0DA 1F0WA 1CJ7A 1IWXA 1JKDA 4LYTA 4WM6A 1LYYA 4YOPA 5FSTA 4CGEA 1GB3A 1TAYA 4H93A 5I5QA 3TXHA 1GB6A 2MEBA 1C46A 1LYZA 3IJUA 2BPUA 3A90A 4KPMA 4D9ZA 1LSEA 1UBZA 1GF5A 3WW6A 5HQ1A 1LJFA 1DQJC 1WQMA 1A4VA 1NKHA 4J1AA 1PS5A 4NGZA 4PJ2C 4LFPA 1YAPA 2XTHA 4GLAA 1BQLY 3AGIA 1LCNA 2H9JA 3P65A 1E8LA 1TCYA 4TWSA 135LA 1LPIA 1VDPA 3ZEKA 1VFBC 3A6BY 5LYZA 2ZQ3A 4H9CA 5LVHA 1YAQA 1DKKA 1F10A 1O23A 154LA 4DD2A 2ZNXY 1B7OA 4NHQA 4B1AA 1JUGA 3A91A 5ILFA 1B7LA 2W1LA 1NDMC 1WQOA 3P68A 3AW6A 5LVKA 1CKCA 1HEWA 4WM4A 1G7JC 5KXMA 1LJJA 2Z38A 3TMWA 2EKSC 2DQFC 4H92A 1VDTA 3ATNA 2YBIA 4TSCA 4B4JA 5LINA 1XEKA 1LJEA 2ZILA 1RI8B 1VDSA 1LSFA 2ZQ4A 4LYOA 1B5YA 5KXRA 1JIYA 1PZYA 3B0IA 1LJHA 5F9XA 4FJRA 4LFXA 1YKZX 3A93A 1D6QA 4G9SA 3TXDA 2BQHA 1JTPL 4PRQA 3A3RX 1UACY 2DQDY 5E9RA 1FN5A 1JWRA 2HEDA 1N4FA 2XJWA 4NGKA 3WUAA 3WPLA 4WO6A 1YQVY 1LZ5A 2HECA 2I25L 4ETEA 3MGWA 2YSSC 3J4GA 3P64A 5IELA 1WVVA 4AGAA 3WVYA 1I1ZA 1GEVA 1MLCE 4II8A 4NWEA 1LZCA 4M6DA 1BWHA 1LZEA 1TDYA 4DT3A 132LA 2YBMA 3OK0A 4IATA 1GBXA 5KXPA 4NSHA 3D9AC 5JENB 3A92A 4QGZA 1IC5Y 1YKXX 4DD1A 2BLYA 2X0AA 1ZV5L 4NGWA 4NHTA 1HMKA 3KAMA 4WM2A 3A8ZA 5HLLA 3W6BA 3T36A 4AXTA 4RLMA 4U3XB 1B2KA 3TXFA 4M4OA 1P2CC 2MEGA 4RW2A 4C3WA 4ETCA 1IR7A 2BQNA 1LZSA 4XJFA 4DDBA 1GFUA 2DBTA 1GBSA 3IJVA 3P4ZA 4N9RA 7LYZA 4CJ2A 3WUNA 3RW8A 3A34A 1B7MA 2G4QA 1B5ZA 1GF4A 4TTDA 1LOZA 2F2NA 2NWDX 5F9UA 1JKBA 1GB9A 208LA 2A7DA 3RU5A 1LZAA 1T3PA 1LJNA 4P2EA 1OUBA 3N9CA 4HJVA 4NHPA 2BQKA 2WARA 1LSAA 5C6IA 3TXEA 1YIKA 1LHIA 3WUMA 1GB7A 3WXUA 4H1PA 1GBZA 4QDNA 1GBYA 2PC2A 4WL6A 3LN2A 1CJ9A 1W6ZA 3ZVQA 1IWWA 4DDAA 3F6ZA 4QEQA 1OP9B 5LVGA 1LJ3A 4HTKA 1B9OA 1TEWA 3LYMA 4XJDA 4H90A 5HNCA 1OUFA 2C8PA 3N9AA 1CKHA 1BWJA 3CSRA 4LGKA 1GD6A 1GFKA 4NIJA 4WM3A 5APEA 1V7TA 4WLYA 1DKJA 1OUDA 4GCEA 1DI3A 1DI4A 2DQAA 3B6LA 1BB5A 5APDA 4RLNA 1JJ0A 2DQIY 2MEEA 134LA 2BQGA 3AZ4A 4ET8A 1GB5A 3A3QA 1IP3A 4WLXA 1GE4A 2F4AA 1WTNA 4H8ZA 3AZ5A 1IC7Y 1LSZA 1NDGC 1XGPC 5F14A 1JKCA 3LYZA 1OQMA 1REMA 2DQJY 3LZTA 4N8ZA 5HNLA 1RFPA 2Z12A 3CSQA 3M18B 1LSCA 4LYBA 1GFHA 2D4KA 4GCBA 4MR1A 5D5FA 4YEMA 1H87A 4H9HA 1UUZC 1B7SA 2XBSA 2BQOA 4XJBA 5I4YA 1SQ2L 1LZGA 2BQDA 3B0OA 4DC4A 5L3IA 1LYOA 2FBBA 1REXA 1KIPC 1LHMA 4BAPA 6LYZA 4WLDA 2HU3A 1B7NA 5FELA 4TSBA 1G7LC 1GXXA 1AT5A 4TUNA 2YBLA 5C6LA 1WVUA 1GFTA 2CGIA 2EIZC 4XYYA 1NMMA 3LYOA 3VWOA 5APCA 1LJKA 1GE3A 1LSNA 4HPIA 1GF8A 1FKVA 4IJ4A 4LT0A 1GB0A 1XGRC 5LXWA 4KL7A 4WM5A 2DQHY 5KJ9A 2CWIA 1QQYA 4J1BA 1A2YC 5FHWA 1GEZA 1UA6Y 3W6AA 5LVIA 1G7IC 1HHLA 1LMAA 1YAOA 1HFYA 4NSGA 4C5FA 1GF3A 4FDYA 3T6UA 5LYTA 1SLYA 1LZNA 2MEFA 3CB7A 1LMCA 5KXWA 1CKGA 1REZA 1OUJA 2Z39A 2HEBA 1JTOL 4IASA 3TMXA 153LA 3AGHA 1RCMA 1HENA 3BKVA 3TXIA 1IEEA 1C43A 3CT5A 1JSEA 3RZ4A 3RNXA 3EBAB 1LZRA 2BLXA 3SP3A 4N0JA 3EO5A 5KXKA 1QTEA 3J6KA 1FKQA 1D0MA 5KXZA 4GN3A 2LHMA 4NHIA 5B1GA 4EMNA 1C7PA 1IP7A 2LZ2A 2Z19A 5LA8A 4DYGA 5T3FA 4ZEEA 4G4BA 4HJYA 5KKIA 4WMGA 1LZ6A 1LAAA 3TXGA 5LA5A 5E4PA 4NSJA 1LTMA 1LHHA 1YILA 4B49A 5ILCA 2LYOA 1DXJA 3WU9A 3WULA 5B59A 1W08A 2H9KA 1KXXA 5B06A 1G7MC 5IHGA 1NQIA 4XJIA 2AUBA 1V7SA 1LYSA 1FLWA 2BQEA 2DKVA 2MEDA 2YBJA 4OWHA 4XADA 1IR9A 1LSPA 3A96A 3G3BB 3WYHA 1LZ8A 5LVJA 1J1OY 1VAUA 2MECA 2ZYCA 3A67Y 2Z2FA 1JKAA 4NGOA 9LYZA 1GAZA 1LSMA 1GF9A 4DD9A 3W3EA 1JEFA 1LZ9A 1HNLA 1IWVA 1XFPL 1IP1A 1VDQA 1LJGA 5I4WA 1RE2A 1H6MA 5APFA 1TBYA 5C6JA 1NBYC 4H9EA 1QIOA 2BQIA 2BQFA 2LYZA 1LKRA 2MEAA 1YROA 1IORA 4WLTA 193LA 1REYA 3AJNA 1YAMA 3HFMY 1DZBX 2XBRA 2ZYPA 3TXJA 5IDDA 1LHLA 2N5ZA 5K7OA 5F16A 1UIEA 1XSFA 5EBHA 5KXOA 4G4CA 1F6RA 2CDSA 1WQNA 3AZ6A 4LYCA 3ZVQB 2G4PA 4PGJB 2BAAA 2YBHA 4LYMA 4NGJA 5HMVA 2ZWBA 1HFXA 1ZVHL 1GFVA 3CSZA 4ETBA 2BQBA 1J1XY 5DN4A 3WH1A 1BB7A 1IP5A 3FE0A 4GCCA 2FYDA 1IWZA 4I8SA 1JTTL 1IP4A 4OOTA 4PRUA 1BB4A 4UWNA 1GE1A 3LZ2A 5FDJA 1BHZA 1D0KA 1INUA 3P66A 5F81A 1DPWA 1HEQA 1GF6A 1KXWA 1DPXA 3WU7A 4CFPA 3B72A 1UIHA 1XGTC 1B7PA 3WU8A 4NHSA 1OUCA 3W6FA 1HERA 4LZTA 5FEKA 1GWDA 1QDRA 4YENA 4ZIXA 4OWBA 3E3DA 4R6CA 4DD3A 4DWXA 1EQ4A 3W6EA 1QDTA 1GF7A 1NWGA 4HV1A 1WQPA 5I53A 5L3HA 4BS7A 1GFAA 2ZIKA 4HTNA 1IWUA 1HELA 4N1EI 1B5WA 3WPJA 2Z37A 4HV2A 1KXYA 2HEAA 1GDXA 4YF2A 4E3UA 5L9JA 1I56A 4NSIA 4KXIA 1GBWA 3WPKA 2LYMA 4LT1A 4XENA 1EQ5A 1BB3A 3W6CA 1FDLY 2LZTA 2Y8PA 2CJLA 3K3TA 3CQLA 194LA 1XGUC 4X3BA 2I6ZA 3WXTA 2D4JA 1KIRC 3B0KA 1IP2A 4KT3A 1VATA 1LSGA 4N5RA 5KXNA 3FI7A 4UWUA 1QUTA 4NGVA 1B5XA 1FLQA 1OUEA 1ZMYL 1BWIA 3TXBA 4XJHA 1YKYX 4NEBA 2DQGY 3N9EA 2DQEY 3A6CY 3QY4A 5KXXA 1B7RA 3A95A 1B5VA 2IFFY 1OUIA 1QTKA 2YVBA 5KXSA 3WW5A 3HBDA 2Z18A 4H9FA 4H8XA 2BQAA 4WOAA 5A3EA 3G3AB 1LZDA 5KKJA 1JJ1A 3TMUA 4NGYA 1HEMA 4ANRA 3TMVA 1CKDA 1RJCB 4NWHA 4H8YA 4W96A 1LSDA 4Z41A 1BVXA 1JJ3A 1GFRA 1UIBA 4J0LA 5KXLA 4H9BA 3QNGA 2MEHA 1J1PY 1IO5A 3ATOA 1UIAA 1LKSA 1YL0X 5LAGA 1LZ4A 4B4EA 4GCFA 1NHEA 1HSWA 1LMNA 1GE2A 4TX7A 1C10A 1HF4A 1WTMA 1CJ6A 1T6VL 3A94A 1NF5A 1BVKC 2W1MA 2IHLA 1KIQC 3LHMA 1XEJA 1D0LA 1GE0A 3BKHA 1LZ1A 1Z55A 1BB6A 2GV0A 4G49A 6LYTA 2HUBA 5DN5A 1IOTA 2H5ZA 2I26L 1OUAA 4NG1A 1IR8A 1IC4Y 1B5UA 4GN4A 2DQCY 4LT2A 2HEFA 1LMPA 3AZ7A 2A7FA 4H9AA 5HMJA 1HSXA 1LMTA 1D9UA 1NBZC 2EQLA 3CT0A 4Z98A 1IOQA 1YL1X 1BGIA 4NGIA 2FYCA 3D3DA 4LT3A 4ZFPA 1OUHA 1IVMA 1UIGA 2BQMA 2MEIA 5LYMA 1UIFA 1LZTA 3IWRA 4WM1A 5DM9A 1GFJA 2F30A 1ZVYB 4NFVA 4R0FA 1GB8A 1HEOA 4H91A 1IX0A 1HFZA 1MELL 1JISA 1LMQA 1LSYA 2D91A 3EXDA 4OWCA 5AMYA 4UWVA 4BAFA 4DD0A 1LJIA 4GCDA 2BQCA 2HU1A 3AB6A 3AYQA 1IY4A 3AGGG 1D6PA 4HTQA 2BQJA 4GN5C 133LA 2Z2EA 1CKFA 2Q0MX 4ML7A 4L41A 4Z46A 1EQEA 1F6SA 4H9IA 2B5ZA 4RDSA 5KXTA 1IWTA 1I20A 3M3UA 3LYTA 1FLYA 4BADA 2YBNA 2ZNWY 5KXYA 1DI5A 1GXV2 1XGQC 4J7VA 4OWAA 4WL7A 1AM7A 4DDCA 4N1CC 5DLAA 1IY3A 4PPOA 4HP0A 1UICA 4QY9A 1IOCA 5A3ZA 5M1YA 1ALCA 2C8OA 1LMOA 3RT5X 2F4GA 4OOOA 4I0CA 1AKIA 1QSAA 1GBOA 2ZIJA 3GXKA 4HPEA 3W6DA 4A7DA 2G4NA 4YEOA 4CHXA 4DD7A 3AW7A 4EOFA 1WQQA 4Z3MA 4H94A 3HBHA 4RW1A 1C45A 3TXKA 4W94A 1LHKA 1B7QA 5B1FA 1EL1A 2BQLA 4ETDA 5I54A 1GB2A 1JPOA 4GLVA 3OJPA 1IP6A 1GHLA 8LYZA 1GFEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
130LA 3OE9A 3WMKA 1T8GA 207LA 1C08C 3NY8A 5II3A 2D4IA 2L78A 5B05A 1OVJA 1HMLA 144LA 4WG7A 126LA 1L67A 1G0LA 2EPEA 169LA 252LA 4I7QA 239LA 2FBDA 1JITA 2D6BA 183LA 1L57A 5J7CA 1GAYA 4B0DA 1GF0A 3WL2A 2VB1A 4NG8A 1FBIX 1DYDA 1P2RA 5I5QA 3QAKA 3IJUA 2BPUA 3SB9A 3OE8A 4PJ2C 4GLAA 2XTHA 2H9JA 1E8LA 4TWSA 138LA 1LPIA 3ZEKA 3A6BY 2ZQ3A 1C6JA 1DKKA 1F10A 1O23A 1JUGA 1L08A 2W1LA 1NDMC 165LA 4WM4A 5KXMA 1LJJA 2DQFC 1KY1A 1OV5A 3ATNA 5LINA 1LJEA 167LA 1VDSA 3VW7A 163LA 5KXRA 2HULA 1LJHA 1L49A 1YKZX 3A93A 1D6QA 4G9SA 3TXDA 2BQHA 2A4TA 4PRQA 1L80A 210LA 4W59A 1CU5A 4WO6A 4EKQA 182LA 3MGWA 170LA 1MLCE 233LA 1GBXA 3D9AC 5JENB 1YKXX 1C69A 1ZV5L 1L92A 4LDEA 4NGWA 131LA 2ANXA 1B2KA 4LDLA 1C65A 1P2CC 2RB2X 2DBTA 1C6AA 3IJVA 3P4ZA 4N9RA 118LA 4CJ2A 1LOZA 208LA 1LJNA 3RUNA 4NHPA 2BQKA 215LA 4H1PA 3LN2A 1QUDA 4DDAA 1L11A 4QEQA 1OP9B 1LJ3A 4HTKA 3LYMA 4LGKA 3CSRA 3WULA 1G0GA 1L26A 4WLYA 2DQAA 1DI4A 109LA 1L96A 1BB5A 1JJ0A 2MEEA 1L30A 1LGUA 253LA 1QS5A 2F4AA 1L25A 1XGPC 3LYZA 3CSQA 4LYBA 1GFHA 4GCBA 5D5FA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3WMK A;  4MST A;  4O34 A;  1IIZ A;  5I4X A;  207L A;  4NY5 A;  4OW1 A;  4B4I A;  1C08 C;  1VED A;  5II3 A;  1LSB A;  2D4I A;  1YAN A;  4G4H A;  1QSW A;  1IOS A;  2W1X A;  1UCO A;  5B05 A;  5KY1 A;  1QUS A;  2HEE A;  1HML A;  1WQR A;  4XN6 A;  1UID A;  4OWE A;  1AT6 A;  1JSF A;  1LZY A;  1UC0 A;  4MCK A;  4YM8 A;  4WG7 A;  4WG1 A;  1LJ4 A;  1LHJ A;  1CJ8 A;  5DL9 A;  4ET9 A;  2W1Y A;  1OUG A;  1CNS A;  2EPE A;  3HBE X;  4HJZ A;  5FCP A;  1HC0 A;  4PHI A;  3GXR A;  5B07 A;  1XEI A;  3EMS A;  1HEP A;  1JIT A;  2FBD A;  1FLU A;  4LYZ A;  5D5C A;  3ULR A;  3QE8 A;  4XJG A;  1AZF A;  3WVX A;  2D6B A;  5LAF A;  5J7C A;  1GAY A;  1LZB A;  5LIO A;  4B0D A;  1G7H C;  1IWY A;  2RSC A;  3CT1 A;  1GFG A;  4HSF A;  1GF0 A;  2YDG A;  2VB1 A;  1GPQ C;  4NG8 A;  1JHL A;  4NGL A;  1FBI X;  3WL2 A;  1GDW A;  4ETA A;  2HTX A;  4CFO A;  4WO9 A;  1B0D A;  1F0W A;  1CJ7 A;  1IWX A;  1JKD A;  4LYT A;  4WM6 A;  1LYY A;  4YOP A;  5FST A;  4CGE A;  1GB3 A;  1TAY A;  4H93 A;  5I5Q A;  3TXH A;  1GB6 A;  2MEB A;  1C46 A; 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 1LMP A;  3AZ7 A;  2A7F A;  4H9A A;  5HMJ A;  1HSX A;  1LMT A;  1D9U A;  1NBZ C;  2EQL A;  3CT0 A;  4Z98 A;  1IOQ A;  1YL1 X;  1BGI A;  4NGI A;  2FYC A;  3D3D A;  4LT3 A;  4ZFP A;  1OUH A;  1IVM A;  1UIG A;  2BQM A;  2MEI A;  5LYM A;  1UIF A;  1LZT A;  3IWR A;  4WM1 A;  5DM9 A;  1GFJ A;  2F30 A;  1ZVY B;  4NFV A;  4R0F A;  1GB8 A;  1HEO A;  4H91 A;  1IX0 A;  1HFZ A;  1MEL L;  1JIS A;  1LMQ A;  1LSY A;  2D91 A;  3EXD A;  4OWC A;  5AMY A;  4UWV A;  4BAF A;  4DD0 A;  1LJI A;  4GCD A;  2BQC A;  2HU1 A;  3AB6 A;  3AYQ A;  1IY4 A;  3AGG G;  1D6P A;  4HTQ A;  2BQJ A;  4GN5 C;  133L A;  2Z2E A;  1CKF A;  2Q0M X;  4ML7 A;  4L41 A;  4Z46 A;  1EQE A;  1F6S A;  4H9I A;  2B5Z A;  4RDS A;  5KXT A;  1IWT A;  1I20 A;  3M3U A;  3LYT A;  1FLY A;  4BAD A;  2YBN A;  2ZNW Y;  5KXY A;  1DI5 A;  1GXV 2;  1XGQ C;  4J7V A;  4OWA A;  4WL7 A;  1AM7 A;  4DDC A;  4N1C C;  5DLA A;  1IY3 A;  4PPO A;  4HP0 A;  1UIC A;  4QY9 A;  1IOC A;  5A3Z A;  5M1Y A;  1ALC A;  2C8O A;  1LMO A;  3RT5 X;  2F4G A;  4OOO A;  4I0C A;  1AKI A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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