4WLYA

High pressure protein crystallography of hen egg white lysozyme at 380 mpa
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title High-pressure protein crystallography of hen egg-white lysozyme
pubmed doi rcsb
total genus 54
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2014-10-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4wlyA00
1CJ9A 1LZYA 2D4KA 4NHIA 7LYZA 5LYZA 1LZ6A 1JKAA 3BKHA 4GCCA 4J1BA 1GB2A 2ZYCA 3TXFA 1BB3A 1GBZA 4IJ4A 2D4IA 4WM1A 2F30A 3A34A 1B7RA 4H90A 4XJHA 5F9XA 4YM8A 1KIQC 8LYZA 1HEQA 1KIPC 2HECA 3LHMA 2XBRA 3IJUA 3LZ2A 1YAPA 1LPIA 1IY4A 3A3QA 3ZVQA 4G9SA 1FDLY 5LAFA 1GXXA 1ZVHL 5E4PA 4YEOA 4G49A 4QGZA 3ZEKA 4G4BA 1LZSA 1D6QA 1GB9A 1JJ1A 1P2CC 3CT5A 2BQNA 1BVKC 1OUJA 2DQDY 4OWCA 1LYSA 3VWOA 4DD1A 4QY9A 5IHGA 4LFXA 4RW2A 1GF3A 3WUAA 4LYBA 1TAYA 1LJJA 2MEHA 4XADA 2Z2FA 3B0IA 4R6CA 4GN3A 4UWUA 5L3IA 3W6CA 2HTXA 5L9JA 1IR9A 1RCMA 1GE4A 1KXYA 3WXUA 3J4GA 3TXIA 1JTTL 1LJIA 4DD0A 5LYTA 1REXA 1B5UA 4MSTA 1GB0A 1GFKA 1LCNA 1E8LA 2ZNXY 5F16A 5LVHA 1LZAA 5KXNA 3QE8A 1IWZA 1OUAA 4GLVA 2I25L 2W1MA 194LA 3IJVA 5F81A 4B49A 2YBIA 3LYMA 5FSTA 1CKCA 4ETCA 2BQHA 1GF7A 2H9KA 5DLAA 1INUA 1QSWA 2MEGA 4ZFPA 4N5RA 3GXKA 3N9CA 4H9HA 4HPIA 4ETAA 4HSFA 3CB7A 1OUIA 3RNXA 2I26L 4NGYA 4KT3A 4LT2A 4B4JA 2Z18A 2AUBA 4HTQA 1LHJA 1B7SA 3A6CY 4MR1A 2Z37A 4HJVA 1DZBX 3TXDA 1IOQA 1QTEA 1GXV2 1OUGA 3WU9A 3EMSA 1KXWA 1LYYA 1HMLA 1JJ3A 5HMVA 3RU5A 3WVXA 3N9EA 153LA 1UUZC 4BS7A 4DDAA 3A3RX 1NMMA 2F2NA 4WLYA 1GFJA 1WVUA 4LYCA 1UBZA 5FHWA 3WYHA 3HBEX 5T3FA 5I53A 1GEZA 1ZV5L 4I0CA 1D0KA 5M1YA 4NHSA 2BQLA 5J7CA 4EMNA 4NFVA 1MELL 3WVYA 1YAQA 4NGLA 1LMOA 5LXWA 1HC0A 1JHLA 4XENA 5DN5A 3HBHA 1N4FA 4CGEA 5B06A 207LA 3AZ4A 1BWIA 4W94A 1GAZA 4PGJB 1JITA 3EO5A 4RLNA 1UIAA 4CHXA 1IR7A 1PZYA 1GFHA 5IELA 1REZA 3LN2A 4AGAA 5KXTA 1JJ0A 5KXLA 1SLYA 1LMNA 1RJCB 1GF5A 1HELA 4HPEA 2I6ZA 4WO9A 4LYZA 4PJ2C 1LSAA 1IEEA 1GFUA 1B7MA 4H94A 4FJRA 4WM2A 3AGHA 4QEQA 1Z55A 1D6PA 132LA 1XGRC 4KXIA 5B07A 4M6DA 4TX7A 1WQRA 1MLCE 1OP9B 2BQJA 2ZNWY 1YROA 2BLXA 1W08A 4HTKA 1GBWA 4LT1A 1T6VL 1LJHA 4H91A 1XGQC 1LZ9A 4N0JA 4HP0A 1YAOA 1C45A 1VDTA 5DM9A 4GN4A 1C10A 2DQIY 3WULA 1IWWA 1EQ4A 3D3DA 4WLDA 1GFTA 4ML7A 1LJNA 5KXPA 2CDSA 1OUEA 2YDGA 5KXMA 3AW7A 3P66A 1YKXX 1LZ1A 3J6KA 1YKYX 1IP1A 4ZIXA 1LSBA 2CJLA 1LHMA 4H8YA 4LFPA 4N9RA 1B7LA 1TBYA 1UA6Y 1IWYA 4J7VA 4Z3MA 3CT0A 1QUSA 3QY4A 4IATA 1JWRA 4NSJA 1LZGA 1LSNA 1J1OY 2H9JA 1XSFA 2HU1A 2YBHA 4WM4A 5B59A 1AKIA 3IWRA 4NEBA 4DD9A 3W3EA 2IHLA 5FDJA 1WVVA 1LZ8A 1OQMA 5APFA 3M18B 5LVIA 1NWGA 1RFPA 4B4EA 1IOCA 4L41A 5DL9A 1GB7A 2Z19A 1A4VA 3WPLA 154LA 4H92A 3A95A 1LZTA 1IVMA 4Z46A 1FKVA 3A6BY 4NHPA 1HF4A 5EBHA 1C43A 5C6LA 5F14A 1LZDA 2EKSC 5II3A 1DI5A 1DKJA 2C8PA 2DQHY 1JPOA 1F10A 3RT5X 5KXYA 1D0MA 135LA 1LKRA 1CJ6A 4GCBA 1GB6A 1LHKA 2FYDA 4XYYA 4EOFA 1FLYA 1HFYA 1NF5A 1VAUA 1JKDA 1G7IC 3G3AB 2LZ2A 1IP5A 1GDWA 1VDPA 4U3XB 3SP3A 1RE2A 1LSEA 2ZIJA 1HEPA 5LINA 3AGGG 5D5FA 4BAFA 2HEAA 1XEIA 3FE0A 4NY5A 4DC4A 3ATNA 1JISA 4RW1A 1GAYA 2VB1A 4M4OA 1UIBA 4Z98A 5JENB 4P2EA 4PHIA 2FYCA 4Z41A 2ZILA 3EXDA 4H93A 1ZMYL 2W1LA 1JEFA 1GB5A 1B7PA 3P64A 4MCKA 1LSMA 1QDRA 1HSXA 1PS5A 1XEKA 2D4JA 4XJGA 5APCA 2ZQ4A 4TUNA 1EQEA 3F6ZA 1LSZA 4DD2A 1LHHA 5ILFA 5LA8A 1IO5A 2ZYPA 2YSSC 3LYOA 1QDTA 1NHEA 1QUTA 1A2YC 3CT1A 1BHZA 2DKVA 3HBDA 1C08C 1BB7A 5C6JA 2XBSA 3B6LA 4DD7A 1LJFA 1B2KA 1OUHA 1YQVY 4H8XA 1V7SA 3WUMA 4C5FA 4NGIA 2W1YA 4HTNA 1HMKA 3W6DA 1VFBC 1OUDA 2LHMA 1BB4A 1IORA 3WMKA 5LYMA 1IWUA 1YAMA 3K3TA 2IFFY 4O34A 4ZEEA 5KXKA 4TWSA 1JTPL 1FKQA 1HEMA 1HNLA 3A94A 5D5CA 4A7DA 4DYGA 5KXXA 1FLWA 1BQLY 1GDXA 1B7NA 1G7HC 4WL6A 1AM7A 1B5XA 2HEFA 3FI7A 2MEDA 1IOTA 5APDA 3OJPA 3CQLA 2N5ZA 2GV0A 1IP2A 4OW1A 4XJDA 3ATOA 4J1AA 2BQFA 5KXZA 4OWEA 1H87A 1GWDA 208LA 3T36A 1HEWA 3AB6A 5LVJA 3LYTA 4NIJA 1V7TA 1KXXA 4GCEA 1LZRA 4HV2A 3D9AC 4IASA 1DQJC 4BADA 1D0LA 1OUCA 3HFMY 4AXTA 4HJZA 1IWTA 1GEVA 1WTMA 5KJ9A 1DI4A 3P68A 4ETDA 1C46A 1XFPL 3E3DA 2BQCA 1IOSA 2ZQ3A 2F4GA 2BAAA 1LKSA 4DT3A 4J0LA 4GLAA 1YL1X 1LTMA 4G4CA 1BVXA 4GCDA 1NDMC 4H9AA 1AT6A 2YBLA 4ET9A 5A3EA 1IWXA 2DQAA 3AYQA 1BB5A 3AW6A 3TXBA 1CKDA 1YKZX 1LZCA 4NG1A 193LA 4NHTA 1D9UA 2A7FA 1UCOA 2ZWBA 5A3ZA 3T6UA 1VDQA 1LJGA 3CSRA 4LYTA 1B5YA 2YBMA 1WQQA 1W6ZA 2BQEA 3A90A 1IY3A 1JSFA 5HNCA 5I4YA 1UIDA 1IC7Y 1UICA 1GB3A 4H9FA 1HFZA 4B1AA 5KY1A 4D9ZA 3A92A 1HFXA 1B5WA 1B7QA 1LZ4A 1FN5A 4H9BA 4OOTA 1WQNA 4XJIA 4HV1A 1LJEA 2MEFA 2A7DA 4NG8A 4WG7A 3TXHA 5FEKA 1FBIX 1IC5Y 3A91A 4B0DA 1LMTA 1CKGA 4N1CC 2MECA 1UC0A 4NWHA 1GFGA 2D6BA 1LMPA 1DI3A 1VATA 2Z2EA 3ULRA 5C6IA 5KKJA 2BQGA 1B0DA 4ETBA 3P4ZA 1GF8A 3WU7A 3MGWA 4H9EA 1REYA 5APEA 2C8OA 5B05A 4NGOA 5K7OA 1LSCA 1LSDA 5I5QA 9LYZA 4UWNA 1XGPC 1DXJA 1LMCA 4OOOA 1LJKA 1QIOA 2XJWA 1LSFA 5KXOA 1LHLA 1LSPA 4HJYA 3TXEA 1T3PA 2EQLA 1GE0A 3N9AA 4DDBA 1GHLA 1FLUA 3WH1A 1LYZA 1YIKA 4XJBA 2HEEA 1XGUC 4XN6A 2X0AA 3TMWA 1KIRC 4WL7A 2BLYA 1CJ8A 1WQMA 4NWEA 2HEBA 3WUNA 4WM3A 5LA5A 3TMXA 5ILCA 1NDGC 134LA 4ETEA 2DQJY 1GFEA 1WQOA 3CSZA 1ALCA 4DWXA 4YOPA 1GBOA 4C3WA 2LYOA 4E3UA 3TXKA 4CFOA 1IIZA 1O23A 1VDSA 6LYZA 4WG1A 2EIZC 2W1XA 1JIYA 5KXWA 4ET8A 5B1FA 4BAPA 5KKIA 3LZTA 1QQYA 1JUGA 1QTKA 1LZBA 1B7OA 1LZ5A 1IX0A 1VEDA 2CWIA 1GPQC 1JSEA 1LZNA 2DQCY 2ZIKA 1OUBA 1LSYA 4LT3A 4PRQA 4FDYA 4RDSA 1QSAA 3WW5A 4B4IA 1IWVA 3AGIA 3RZ4A 3B0KA 4TSBA 2Q0MX 1REMA 1LHIA 4H9IA 4N8ZA 5I54A 1HSWA 2HUBA 1B5VA 1G7MC 3B0OA 1BWHA 1UIEA 1GE3A 1LAAA 2LZTA 3TXGA 3M3UA 2HU3A 4NSHA 1B9OA 5KXSA 1FLQA 1AT5A 1G7JC 2BQDA 2DQFC 4KPMA 3AZ7A 1JKCA 1I1ZA 4NHQA 2RSCA 4OWBA 4YF2A 5E9RA 1UIGA 1ZVYB 2YBNA 2Z39A 1DPWA 2BQIA 2YBJA 1LYOA 3TXJA 5I4XA 1IP7A 4WLXA 4XJFA 2MEIA 1B5ZA 3WL2A 4WLTA 1BGIA 1HERA 1F0WA 4GN5C 1GE2A 4WM6A 1GBXA 1J1XY 4TSCA 3P65A 1LMQA 4NSGA 4WM5A 4II8A 4H8ZA 1DPXA 1GF6A 1LJ3A 2CGIA 3A8ZA 3AZ5A 5DN4A 1AZFA 3LYZA 5L3HA 2XTHA 2DBTA 4UWVA 4WMGA 4CJ2A 5F9UA 2LYMA 3AZ6A 2PC2A 1G7LC 1IP3A 1WTNA 4NSIA 4QDNA 4DD3A 1H6MA 1YANA 1IP6A 3GXRA 2BQMA 2LYZA 2WARA 1I56A 4N1EI 2Z38A 4PPOA 4W96A 4LYMA 1SQ2L 1GF9A 1EL1A 5AMYA 3TMUA 3W6AA 1WQPA 1F6SA 3TMVA 1CKFA 1I20A 1CNSA 1LMAA 3A93A 2BQOA 3EBAB 4NGZA 4PRUA 4YENA 2YVBA 4ANRA 4LGKA 4KL7A 1CKHA 4WO6A 4X3BA 3ZVQB 1GBYA 3BKVA 4H9CA 6LYTA 3W6EA 3WW6A 1J1PY 3CSQA 1TDYA 1YL0X 4CFPA 4NGKA 4LZTA 2D91A 2EPEA 4TTDA 2DQEY 1JTOL 4OWAA 4LYOA 2G4NA 1GFAA 1GB8A 3OK0A 5HNLA 5HMJA 5KXRA 1TCYA 2BQBA 5IDDA 5FCPA 1HENA 1HHLA 5LVKA 1NBZC 1YILA 2G4QA 2MEEA 1NKHA 1LOZA 3QNGA 1LJ4A 1GD6A 4NGVA 1NBYC 2HEDA 1NQIA 4NGWA 1TEWA 2MEAA 1DKKA 2BQKA 2DQGY 5FELA 3WXTA 2BQAA 3B72A 133LA 4NGJA 4OWHA 2B5ZA 1UIFA 1XEJA 3WU8A 3W6FA 1RI8B 1IP4A 1JKBA 2FBDA 1LSGA 1IR8A 4I8SA 2BPUA 5I4WA 5HLLA 1LZEA 1F6RA 5LVGA 1BB6A 2MEBA 3W6BA 3WPKA 3WPJA 1IC4Y 2FBBA 5HQ1A 3G3BB 1GBSA 4H1PA 3A67Y 1EQ5A 4WOAA 5B1GA 5LAGA 1GFRA 4YEMA 2H5ZA 2F4AA 3A96A 4LT0A 2G4PA 1UIHA 4DDCA 1GE1A 2Z12A 4RLMA 3KAMA 4R0FA 1UACY 4GCFA 1HEOA 1OUFA 1XGTC 4G4HA 3AJNA 1BWJA 3RW8A 1GFVA 1CJ7A 1GF0A 1GF4A 2Y8PA 1C7PA 5LIOA 2NWDX
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1JTMA 5LYZA 1JKAA 3BKHA 1OWYA 3TXFA 1GBZA 4WM1A 4W59A 2L78A 4OO9A 5F9XA 2B7XA 2HECA 1PQKA 3IJUA 3LZ2A 232LA 3ZEKA 4QGZA 3HWLA 1L30A 1C6FA 3VWOA 5IHGA 1LYSA 4RW2A 4LYBA 171LA 4XADA 3C81A 2Z2FA 141LA 144LA 2F32A 1JTTL 4DD0A 5LYTA 138LA 4YXAC 4MSTA 1E8LA 5F16A 5LVHA 1LZAA 1L11A 3QE8A 2W1MA 5F81A 4B49A 3LYMA 4ETCA 5FSTA 1CKCA 2B6WA 5DLAA 172LA 1INUA 2MEGA 3GXKA 2A4TA 1OUIA 3RNXA 1L14A 4KT3A 4B4JA 3HTFA 2AUBA 2IGCA 1C63A 1L10A 3A6CY 1OUGA 1KXWA 1HMLA 1L44A 2F2NA 1LWKA 1SWZA 1GFJA 1WVUA 1QTCA 246LA 4NHSA 4IAPA 1YAQA 4XENA 1KY0A 4CGEA 5B06A 1L89A 5KXTA 4LYZA 4WM2A 4QEQA 234LA 4KXIA 143LA 180LA 1L92A 4TX7A 1WQRA 2ZNWY 1YROA 2BLXA 1LJHA 1L26A 2DQIY 3HH5A 4WLDA 145LA 2YDGA 1IP1A 2F47A 4LFPA 1LHMA 4IATA 1LZGA 1LSNA 184LA 4WM4A 3SB7A 1AKIA 2B6TA 4W54A 2IHLA 3M18B 5LVIA 1NWGA 1IOCA 4L41A 1CV0A 2Z19A 1A4VA 4H92A 1LZTA 1IVMA 4Z46A 4NHPA 5EBHA 1C43A 1G0KA 1DKJA 2DQHY 1F10A 2B6XA 5KXYA 3RT5X 142LA 226LA 1CJ6A 205LA 1FLYA 3G3AB 198LA 1RE2A 1LYGA 3FE0A 1L66A 1JISA 4P2EA 3EXDA 1L55A 2W1LA 3DN4A 1LSMA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1CJ9 A;  1LZY A;  2D4K A;  4NHI A;  7LYZ A;  5LYZ A;  1LZ6 A;  1JKA A;  3BKH A;  4GCC A;  4J1B A;  1GB2 A;  2ZYC A;  3TXF A;  1BB3 A;  1GBZ A;  4IJ4 A;  2D4I A;  4WM1 A;  2F30 A;  3A34 A;  1B7R A;  4H90 A;  4XJH A;  5F9X A;  4YM8 A;  1KIQ C;  8LYZ A;  1HEQ A;  1KIP C;  2HEC A;  3LHM A;  2XBR A;  3IJU A;  3LZ2 A;  1YAP A;  1LPI A;  1IY4 A;  3A3Q A;  3ZVQ A;  4G9S A;  1FDL Y;  5LAF A;  1GXX A;  1ZVH L;  5E4P A;  4YEO A;  4G49 A;  4QGZ A;  3ZEK A;  4G4B A;  1LZS A;  1D6Q A;  1GB9 A;  1JJ1 A;  1P2C C;  3CT5 A;  2BQN A;  1BVK C;  1OUJ A;  2DQD Y;  4OWC A;  1LYS A;  3VWO A;  4DD1 A;  4QY9 A;  5IHG A;  4LFX A;  4RW2 A;  1GF3 A;  3WUA A;  4LYB A;  1TAY A;  1LJJ A;  2MEH A;  4XAD A;  2Z2F A;  3B0I A;  4R6C A;  4GN3 A;  4UWU A;  5L3I A;  3W6C A;  2HTX A;  5L9J A;  1IR9 A;  1RCM A;  1GE4 A;  1KXY A;  3WXU A;  3J4G A;  3TXI A;  1JTT L;  1LJI A;  4DD0 A;  5LYT A;  1REX A;  1B5U A;  4MST A;  1GB0 A;  1GFK A;  1LCN A;  1E8L A;  2ZNX Y;  5F16 A;  5LVH A;  1LZA A;  5KXN A;  3QE8 A;  1IWZ A;  1OUA A;  4GLV A; 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 3TMU A;  3W6A A;  1WQP A;  1F6S A;  3TMV A;  1CKF A;  1I20 A;  1CNS A;  1LMA A;  3A93 A;  2BQO A;  3EBA B;  4NGZ A;  4PRU A;  4YEN A;  2YVB A;  4ANR A;  4LGK A;  4KL7 A;  1CKH A;  4WO6 A;  4X3B A;  3ZVQ B;  1GBY A;  3BKV A;  4H9C A;  6LYT A;  3W6E A;  3WW6 A;  1J1P Y;  3CSQ A;  1TDY A;  1YL0 X;  4CFP A;  4NGK A;  4LZT A;  2D91 A;  2EPE A;  4TTD A;  2DQE Y;  1JTO L;  4OWA A;  4LYO A;  2G4N A;  1GFA A;  1GB8 A;  3OK0 A;  5HNL A;  5HMJ A;  5KXR A;  1TCY A;  2BQB A;  5IDD A;  5FCP A;  1HEN A;  1HHL A;  5LVK A;  1NBZ C;  1YIL A;  2G4Q A;  2MEE A;  1NKH A;  1LOZ A;  3QNG A;  1LJ4 A;  1GD6 A;  4NGV A;  1NBY C;  2HED A;  1NQI A;  4NGW A;  1TEW A;  2MEA A;  1DKK A;  2BQK A;  2DQG Y;  5FEL A;  3WXT A;  2BQA A;  3B72 A;  133L A;  4NGJ A;  4OWH A;  2B5Z A;  1UIF A;  1XEJ A;  3WU8 A;  3W6F A;  1RI8 B;  1IP4 A;  1JKB A;  2FBD A;  1LSG A;  1IR8 A;  4I8S A;  2BPU A;  5I4W A;  5HLL A;  1LZE A;  1F6R A;  5LVG A;  1BB6 A;  2MEB A;  3W6B A;  3WPK A;  3WPJ A;  1IC4 Y;  2FBB A;  5HQ1 A;  3G3B B;  1GBS A;  4H1P A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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