1OVJA

T4 lysozyme cavity mutant l99a/m102q bound with 3-fluoro-2-methyl_aniline
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCAAINQVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Testing a Flexible-receptor Docking Algorithm in a Model Binding Site
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2003-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1ovjA00
1CX6A 4I7LA 180LA 239LA 1SX2A 2HUMA 171LA 1QT5A 4EKPA 2RB1X 3FADA 3GUJA 2ANVA 1XJTA 250LA 1L98A 3JR6A 4I7SA 243LA 1KW5A 257LA 236LA 3GULA 1L42A 3F8VA 1OVHA 1L71A 3HDFA 1L28A 1PQMA 1CU5A 4ARJA 1G0GA 3DN1A 1SSWA 1KS3A 1L43A 1C6CA 1XEPA 3HDEA 195LA 245LA 235LA 1L35A 1G0LA 151LA 1G0KA 183LA 130LA 129LA 1L60A 231LA 1L72A 114LA 156LA 1P3NA 1DYGA 1XJUA 160LA 1L68A 1L85A 1LWGA 1L15A 122LA 3SB6A 145LA 162LA 1LGXA 1L54A 1T97A 4EKSA 1L27A 192LA 2OTZX 3DMZA 4EXMA 2RBPA 1L38A 3DMXA 1L99A 1LYHA 4W55A 139LA 3CDRA 4DKLA 166LA 261LA 119LA 104LA 3NY8A 2B6ZA 1L02A 1QT8A 1L26A 4ARQB 2RBNA 128LA 4K5YA 1LPYA 4W53A 144LA 176LA 1L52A 1L81A 3HTBA 3HUAA 127LA 165LA 1L61A 2O79A 4ZPUA 4ARQA 1C69A 4W58A 3SB8A 258LA 3F9LA 1DYFA 1C6MA 1LI2A 112LA 143LA 3SN6R 1L10A 1L32A 223LA 221LA 3V2WA 1G06A 1QSQA 2RAYX 4I7JA 5I14A 191LA 1L67A 254LA 1OV5A 1D2WA 4EKRA 241LA 3FI5A 1LYIA 1L09A 1SX7A 4S0WA 242LA 1JQUA 1CX7A 1QTBA 1C6LA 238LA 4LZMA 1OVJA 1KY0A 1JTNA 3C81A 3C7YA 5LZMA 249LA 184LA 1OWZA 1L83A 1L30A 1L0JA 103LA 1P64A 1C6TA 1L00A 1PQIA 1OV7A 3OE6A 4YXCA 1P36A 200LA 230LA 1L97A 1CU3A 3HWLA 1T6HA 1DYAA 1L55A 3C80A 1L22A 2O4WA 3CDOA 3HH5A 2Q9EA 4W57A 232LA 1P37A 1QUDA 3C8RA 1CUPA 228LA 1QTVA 4I7MA 1CTWA 1L66A 3SBBC 3GUMA 172LA 1L73A 210LA 167LA 3RUNA 2RB0X 3DN6A 1DYEA 1PQDA 2OTYX 213LA 169LA 137LA 1C6HA 1OVKA 1G1VA 1L14A 1L96A 3L2XA 3C8SA 1SWYA 3ODUA 1JTMA 209LA 2B6YA 4EJ4A 170LA 2F47A 1KNIA 1P2LA 3HU9A 2NTHA 4ARPA 1L75A 1C6DA 1QT6A 216LA 2L78A 227LA 2RBQA 3UONA 3DNAA 1L01A 4I7QA 1L06A 1C65A 1D2YA 2LZMA 3HUQA 1L11A 4ARLA 149LA 2Q9DA 2RB2X 3G3WA 138LA 140LA 226LA 1T8GA 1LW9A 1P2RA 2IGCA 1QT3A 150LA 1G0JA 1D3FA 222LA 1PQOA 219LA 158LA 1CV6A 1C6AA 247LA 1D9WA 3C7WA 147LA 1QSBA 3GUNA 4YX7C 3C8QA 1L62A 182LA 3SB9A 3HH3A 177LA 120LA 1C6PA 3CDTA 3CDQA 1L50A 1QS9A 4I7NA 3DKEX 2OE7X 248LA 1T8AA 1C6EA 3DN4A 1B6IA 3NYAA 1L33A 1L58A 1L92A 1L77A 3C83A 1QTCA 4E97A 3HT6A 4LDOA 1L70A 1L80A 3D4SA 1DYCA 225LA 1DYBA 1L79A 237LA 4EKQA 1LLHA 233LA 3DN0A 197LA 198LA 2OU0X 1L29A 1L37A 1L91A 3HUKA 3GUPA 224LA 4YXAC 1P6YA 1C6BA 2LCBA 113LA 218LA 1L16A 3CDVA 4I7PA 1EPYA 2HULA 1C62A 2B7XA 111LA 1C6GA 4LDEA 2OU9A 2F32A 1CV3A 211LA 107LA 1L56A 4I7RA 3GUKA 3OE8A 4W59A 1C6IA 1L48A 175LA 1L93A 217LA 1L18A 1L19A 4I7OA 1L44A 181LA 1L90A 1QTZA 3LZMA 1L20A 4OO9A 1TLAA 1CV4A 1K28A 4DJHA 1C61A 1L39A 4I7TA 186LA 2O7AA 157LA 4LDLA 163LA 3HTDA 1P56A 3DN8A 108LA 185LA 1L59A 1LI3A 1L34A 3OE0A 152LA 3DN3A 3PDSA 1QTHA 1CU2A 1OYUA 118LA 2OE4X 1OWYA 164LA 1LWKA 2B72A 173LA 1L63A 252LA 212LA 214LA 259LA 234LA 2ANXA 1L82A 3QAKA 2RBOA 3SB7A 205LA 251LA 2Z6BA 2NTGA 3HT7A 1QT7A 1CV5A 3V2YA 1C68A 1G1WA 255LA 2RH1A 1P46A 3FA0A 1LYJA 102LA 3C82A 123LA 1G0MA 1L69A 4W54A 3K2RA 1PQJA 1LYDA 244LA 1L64A 206LA 215LA 2OEAX 1KY1A 1LI6A 2RBSA 1LYFA 1QTDA 1QT4A 2RAZX 3PBLA 159LA 4W52A 109LA 1L41A 262LA 2CUUA 1L04A 142LA 1L86A 3EMLA 4EPFA 2B70A 4PJZA 3HT8A 155LA 1D3JA 3HTFA 260LA 246LA 1L49A 2HUKA 1LYEA 1L17A 1G0QA 3SB5A 3G3XA 1L31A 4ARMB 4EPIA 1CV1A 3HTGA 4GBRB 1CUQA 3L64A 141LA 1L25A 3HT9A 1G0PA 1L40A 110LA 3HU8A 190LA 1L89A 4ARMA 1KW7A 1QS5A 1C67A 3VW7A 1CU0A 1L51A 178LA 220LA 6LZMA 2B6XA 1L46A 3SBAA 161LA 1L53A 1C6KA 3HH4A 1D3MA 174LA 125LA 1L36A 1L24A 1CU6A 1P7SA 1T8FA 2B74A 1C63A 201LA 1WTHA 2LC9A 3DMVA 1QUGA 3HH6A 1L57A 256LA 148LE 1L65A 1L87A 1LYGA 4I7KA 4PK0A 1L84A 1QUOA 126LA 1LGUA 4W51A 1C6JA 3C7ZA 2B6WA 196LA 188LA 168LA 2QB0B 4W56A 1C6QA 4GRVA 4IAPA 1ZURA 1I6SA 3DN2A 1L03A 1P5CA 115LA 2B73A 1L0KA 187LA 3RZEA 199LA 3NY9A 1C64A 2F2QA 2RBRA 1SSYA 1ZYTA 3G3VA 1DYDA 1QUHA 189LA 2B75A 3OE9A 1L88A 1L13A 3GUIA 1L74A 1L12A 1L47A 253LA 1NHBA 1L08A 1L21A 1G07A 1L95A 1CVKA 1C60A 1L76A 1L05A 131LA 1C6NA 229LA 1CV0A 1L07A 1PQKA 2OU8A 2B6TA 7LZMA 1ZWNA 3GUOA 2QARC 1C66A 146LA 240LA 1D3NA 1L23A 2A4TA 4DAJA 1SWZA 1L45A 1L94A 4AQNA 2OE9X 1C6FA 1LGWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2IHLA 5APDA 2D4JA 3T6UA 5K7OA 1XEJA 4QEQA 1DPWA 3JR6A 4PJ2C 2A7DA 1LZEA 3TXKA 1KW5A 1YKZX 257LA 3GULA 4NWHA 4ET8A 1CU5A 3DN1A 1C6CA 1IC5Y 1G0LA 5KJ9A 3B0OA 5APCA 5KXLA 183LA 4NGOA 5T3FA 4DDBA 1C7PA 154LA 2DKVA 1LAAA 4HV1A 114LA 2Z39A 4O34A 1DYGA 1XJUA 2Z12A 4DD3A 207LA 1LWGA 5EBHA 3LN2A 162LA 1L54A 1B9OA 2OTZX 4EXMA 1GDWA 3WU8A 5B07A 1L38A 1YILA 1LYHA 139LA 5KXXA 1JITA 3NY8A 1L02A 1B7PA 1IP4A 1LPYA 4W53A 1T6VL 3LYTA 1GB7A 1OUGA 4YEMA 4WM2A 1UIHA 3SB8A 258LA 5KKIA 2AUBA 1GBOA 4UWNA 1P2CC 1LMPA 1L10A 1AM7A 4ETDA 1BWHA 221LA 3G3BB 2EKSC 5FCPA 3V2WA 3WPKA 1G06A 1YL0X 1QSQA 1D2WA 1LPIA 2W1MA 2WARA 1B7NA 1GFTA 1C6LA 1DXJA 5LZMA 1L83A 1QTEA 1L0JA 103LA 1GB9A 4J1AA 3OE6A 1B5YA 4YXCA 200LA 230LA 4BAPA 1HEOA 3C80A 4GCFA 1L22A 2O4WA 1QUTA 1B7MA 232LA 4G9SA 4HTKA 1HFZA 1P37A 3C8RA 4NHSA 1WVUA 1OUEA 1QIOA 1GAYA 2RB0X 4NG8A 2OTYX 1CJ8A 213LA 4RW2A 1GB2A 1H87A 137LA 1C6HA 1OVKA 1BHZA 4H8YA 5KXSA 3L2XA 4NGWA 3ODUA 1GB6A 1JTMA 5HNCA 2ZIKA 1P2LA 2NTHA 1JTPL 3EMSA 5FHWA 2L78A 1GDXA 1HFXA 1IP5A 2BQEA 4CGEA 2Z38A 1LCNA 3AGIA 1C65A 4MSTA 1D2YA 2LZMA 149LA 3CSQA 5M1YA 1WQNA 4OW1A 1C43A 1GBXA 2IGCA 1YIKA 5I53A 1BVKC 1BVXA 1IX0A 1YL1X 4KXIA 1EQ4A 1D9WA 3C7WA 4YF2A 1B2KA 1KXWA 1OUHA 5FEKA 4Z3MA 4TWSA 3W6BA 3AW6A 1GB0A 1LJEA 4WM5A 1OUAA 1ZVYB 120LA 4H1PA 3CDTA 3CDQA 1L50A 1QS9A 4B4IA 2C8PA 4Z46A 2OE7X 1T8AA 1GHLA 3G3AB 3NYAA 3A3QA 4E97A 225LA 237LA 1CNSA 1LLHA 233LA 1BWIA 4XJGA 198LA 1L91A 4FJRA 4N9RA 1LZ5A 1NWGA 1CKGA 218LA 5KXWA 1B5ZA 4I7PA 1HC0A 4U3XB 1C62A 3QE8A 1IP2A 1C6GA 3QY4A 3A93A 2F32A 4H8XA 1JIYA 107LA 2DQGY 3GUKA 175LA 1JSFA 5DN4A 3WUMA 1GF9A 4OO9A 1TLAA 1CV4A 3RNXA 1NDGC 4YEOA 1C61A 1D9UA 3EXDA 1L39A 163LA 3WW5A 3ZVQA 4NY5A 132LA 1NBZC 1L34A 2PC2A 1CU2A 4PHIA 4HSFA 1FLYA 1BGIA 4OWAA 164LA 1VEDA 2ZWBA 1OUDA 1GFVA 2BQFA 1IVMA 1LYYA 2EPEA 5F9XA 2DQJY 3QAKA 2RBOA 5KY1A 1HHLA 205LA 2GV0A 2NTGA 3HT7A 2DQAA 1QT7A 3F6ZA 255LA 4J0LA 3FA0A 1DZBX 4DYGA 4GN3A 2YBLA 244LA 1YAPA 206LA 215LA 2RBSA 1AT6A 1QT4A 1F10A 3PBLA 1L41A 1L04A 3ULRA 1L86A 1REZA 2B70A 5LA8A 1YANA 1D3JA 3AW7A 1GB8A 1LYEA 5I4WA 3G3XA 4EPIA 3HTGA 1CJ9A 1GEZA 1MLCE 3HT9A 1JPOA 2BPUA 3M18B 4ARMA 3CT1A 1KW7A 3VW7A 1VDPA 2LYMA 178LA 1NHEA 5FELA 4ET9A 4OWHA 1G7MC 1D3MA 4X3BA 1L36A 2B74A 201LA 2D6BA 3DMVA 1XEKA 4MR1A 4PK0A 148LE 4AGAA 2HTXA 1QUOA 1EQEA 1C10A 1XGTC 1JSEA 1GEVA 188LA 2BQCA 168LA 3D3DA 3KAMA 1ZVHL 1VFBC 2NWDX 1C6QA 3DN2A 4NHTA 2B73A 1LZBA 187LA 4C3WA 1LHHA 1C64A 2HEBA 1IR7A 1I56A 3TXJA 1D0LA 1DYDA 8LYZA 1QUHA 1L88A 1L13A 1IWYA 1KIRC 1G07A 1L95A 1GFKA 1C6NA 1E8LA 4ANRA 1LHIA 1GFEA 1L23A 3OJPA 5J7CA 4DAJA 2C8OA 1A2YC 3TXBA 1CKHA 2OE9X 133LA 4NSHA 4UWVA 1CX6A 4I7LA 239LA 2MEHA 1GWDA 4HJZA 2HUMA 3WUNA 1QT5A 4EKPA 2ANVA 1XJTA 250LA 4XJBA 5I4YA 1LJFA 5KKJA 3RW8A 4XYYA 3HDFA 2BQGA 1PQMA 4OOTA 3B6LA 5LIOA 1IO5A 1IWUA 1KS3A 4DD2A 1GFAA 235LA 1HFYA 1L35A 1LJ3A 4GLVA 1WQPA 1G0KA 1QTKA 3CB7A 1GFUA 2MEBA 2FBDA 1LZ4A 4IJ4A 2A7FA 5IELA 4WG1A 3WU7A 3T36A 2ZNWY 160LA 1L68A 1VDQA 2HECA 3SB6A 4OWEA 4XJHA 3LHMA 1T97A 1L27A 1A4VA 2RBPA 3DMXA 1L99A 3CDRA 1H6MA 4NG1A 2B6ZA 2XQOA 1L26A 1LSZA 1HEQA 4K5YA 1FN5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2IHL A;  5APD A;  2D4J A;  3T6U A;  5K7O A;  1XEJ A;  4QEQ A;  1DPW A;  3JR6 A;  4PJ2 C;  2A7D A;  1LZE A;  3TXK A;  1KW5 A;  1YKZ X;  257L A;  3GUL A;  4NWH A;  4ET8 A;  1CU5 A;  3DN1 A;  1C6C A;  1IC5 Y;  1G0L A;  5KJ9 A;  3B0O A;  5APC A;  5KXL A;  183L A;  4NGO A;  5T3F A;  4DDB A;  1C7P A;  154L A;  2DKV A;  1LAA A;  4HV1 A;  114L A;  2Z39 A;  4O34 A;  1DYG A;  1XJU A;  2Z12 A;  4DD3 A;  207L A;  1LWG A;  5EBH A;  3LN2 A;  162L A;  1L54 A;  1B9O A;  2OTZ X;  4EXM A;  1GDW A;  3WU8 A;  5B07 A;  1L38 A;  1YIL A;  1LYH A;  139L A;  5KXX A;  1JIT A;  3NY8 A;  1L02 A;  1B7P A;  1IP4 A;  1LPY A;  4W53 A;  1T6V L;  3LYT A;  1GB7 A;  1OUG A;  4YEM A;  4WM2 A;  1UIH A;  3SB8 A;  258L A;  5KKI A;  2AUB A;  1GBO A;  4UWN A;  1P2C C;  1LMP A;  1L10 A;  1AM7 A;  4ETD A;  1BWH A;  221L A;  3G3B B;  2EKS C;  5FCP A;  3V2W A;  3WPK A;  1G06 A;  1YL0 X;  1QSQ A;  1D2W A;  1LPI A;  2W1M A;  2WAR A;  1B7N A;  1GFT A;  1C6L A;  1DXJ A;  5LZM A;  1L83 A;  1QTE A;  1L0J A;  103L A;  1GB9 A;  4J1A A;  3OE6 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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