4PJ2C

Crystal structure of aeromonas hydrophila plii in complex with meretrix lusoria lysozyme
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
122
structure length
122
Chain Sequence
FAGGIVSQRCLSCICKMESGCRNVGCKMDMGSLSCGYFQIKEAYWIDCGRPGSSWKSCAASSYCASLCVQNYMKRYAKWAGCPLRCEGFAREHNGGPRGCKKGSTIGYWNRLQKISGCHGVQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila
publication title The structure of the proteinaceous inhibitor PliI from Aeromonas hydrophila in complex with its target lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative exported protein
total genus 45
structure length 122
sequence length 122
chains with identical sequence D
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2014-05-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF05497 Destabilase Destabilase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4pj2C00
1D0MA 5KXPA 1XEKA 2CJLA 5J7CA 2Z12A 3AB6A 4NGIA 4UWNA 5I54A 1FLYA 2MECA 4KL7A 3WXTA 1G7IC 4NWEA 1LYZA 1HMKA 3A34A 2NWDX 1LZGA 1LHHA 1NDMC 3A93A 1YANA 3AZ6A 5HMVA 4H90A 5LVGA 3LYTA 2ZNXY 4G9SA 4CJ2A 2HEBA 4AGAA 2C8PA 3AJNA 4Z46A 1PZYA 4LYTA 1LMAA 4Z41A 5HNCA 3E3DA 1TCYA 1C7PA 2BQLA 2CWIA 4OWAA 3HBDA 4PRUA 4LYOA 1XGPC 2F30A 4B0DA 4DYGA 4OOOA 5K7OA 5LYMA 1BWJA 1GFRA 1DXJA 1NHEA 4PPOA 4TSCA 3QNGA 3WH1A 1WVUA 3WPJA 3A90A 4DD9A 1IWZA 5I4WA 4LFPA 1NKHA 1V7SA 4TUNA 4NSIA 3CSRA 4HTKA 5FCPA 4NSJA 1IWWA 1IP7A 1HSWA 1XFPL 4PGJB 2Z2FA 3TXHA 1UCOA 1QSWA 3TXEA 4G4HA 2FYDA 1B5VA 4LFXA 5DL9A 5L3HA 2HUBA 4BAPA 1KIPC 2ZYCA 1DKKA 3OK0A 4H9EA 1G7JC 4ETBA 1NF5A 1IWTA 2F4AA 1KIRC 1REZA 1QUTA 3LHMA 1DI5A 1EL1A 2YSSC 5IELA 4XJBA 4NHSA 1LTMA 1GFGA 5KJ9A 1BWIA 1B7SA 1GFEA 2G4PA 4XN6A 4TSBA 4YF2A 2BQOA 2MEEA 4BADA 1GB8A 1KXXA 2HEAA 1D0KA 1BHZA 4LT1A 1HMLA 3CSZA 4ZFPA 1HEPA 1FLUA 1LSFA 4RW2A 5B06A 4BS7A 6LYZA 1LZSA 5L9JA 2W1MA 1IY4A 4EMNA 4WM4A 4B4JA 1DPWA 4J1BA 1EQEA 1LHLA 1XSFA 1REXA 1QTEA 1W08A 1B7NA 2H5ZA 3TXBA 2FYCA 5DN5A 1JHLA 5LIOA 2MEBA 1QUSA 3TXJA 3WULA 1JKDA 5JENB 4DD0A 1YROA 2D4JA 1GXXA 3D3DA 1IWXA 1LZ4A 4CFOA 5B1GA 3BKHA 1DI3A 3AZ5A 1JPOA 1VDPA 2CDSA 4LZTA 5B1FA 4XJHA 4CFPA 5F16A 1B7RA 4OWEA 4N9RA 2YBLA 4H9FA 2DQAA 1OUIA 1OUHA 4W94A 1YAQA 1VFBC 3EXDA 3ULRA 3WUMA 5LVJA 1HEWA 3G3AB 1IP1A 3W6BA 1WVVA 5HMJA 1YL1X 1OQMA 1B7OA 3TXGA 1WTNA 1LPIA 1IIZA 5D5FA 1LSZA 5LVHA 4J1AA 3A3QA 1IC5Y 3TXDA 3IWRA 3W6EA 1GAYA 4IASA 1GFKA 4ZIXA 1IP2A 4HJYA 4LT0A 4RW1A 1LSYA 1LMQA 4Z98A 2BQCA 1FKQA 1GE0A 1LJNA 1LMOA 4LGKA 3TXFA 5KXSA 1FLQA 4OOTA 4P2EA 1B7LA 4HTNA 3TMWA 1JKCA 1B7PA 3WUAA 3CT1A 4WM1A 1ZVYB 1B9OA 4ETAA 1CNSA 5KXNA 2MEGA 3WVXA 1YQVY 1CKDA 1HSXA 1GBYA 1LZ1A 2MEAA 4DT3A 1GEZA 1G7HC 4NGOA 1CKCA 1IR8A 1GF6A 1WTMA 1D6PA 4FDYA 4DDBA 5APFA 4RDSA 1LYOA 5F9UA 1LZ9A 1JKAA 3WVYA 4GLVA 4N1CC 4H91A 1GB3A 1C10A 4IJ4A 1LKSA 4NHQA 2D91A 4MR1A 8LYZA 4OWHA 4A7DA 1LMNA 1IWYA 1GB2A 2W1XA 4I8SA 5E9RA 1GFHA 3CSQA 4WO6A 3AW7A 1WQQA 1GE2A 4H1PA 4GN3A 2XBSA 2YDGA 5C6LA 4H94A 4PRQA 4CHXA 5KXLA 1HELA 1GEVA 4AXTA 1GFAA 1LJKA 4M6DA 3A95A 1GB7A 1HFXA 5F9XA 1F0WA 4H8ZA 3WUNA 1GE1A 1LJ4A 1LSCA 1PS5A 1GWDA 1YILA 4PJ2C 2F4GA 4YM8A 2W1LA 3M3UA 5HQ1A 1G7MC 3CT5A 4DDAA 3AYQA 1JSEA 1B5YA 4UWUA 4NSHA 1SQ2L 2Z2EA 2DBTA 1JJ1A 1GDXA 1VAUA 1LZEA 2IHLA 3A96A 3B72A 4NFVA 3WMKA 3RZ4A 2LZTA 1AKIA 1JTPL 4N5RA 5FELA 2G4NA 3D9AC 3WU7A 1QIOA 1BB4A 1YAPA 5I4XA 2X0AA 1B7MA 4WLDA 2D4IA 5LVIA 1G7LC 2BQGA 3F6ZA 3KAMA 1LZNA 5B07A 1A4VA 2Z37A 1TDYA 1YIKA 1GBOA 1GFJA 3QE8A 4J7VA 2Z38A 1CKHA 1GFTA 3WXUA 1OUDA 1CJ7A 1AT6A 1CKFA 1JUGA 1MLCE 1J1OY 4XADA 3T6UA 1JWRA 3ATOA 3VWOA 2BAAA 1D6QA 1LYSA 1LMTA 1QSAA 2B5ZA 1D9UA 1V7TA 4EOFA 5B05A 1LSMA 1OUJA 2BQFA 4C5FA 4LYBA 1IWVA 1LHIA 1GBWA 4WG1A 1IOQA 3AGHA 2Z18A 1JJ3A 1KXYA 1C46A 1C08C 4W96A 5DM9A 2XBRA 2MEHA 4KXIA 1JJ0A 4WOAA 2YBJA 4CGEA 3CQLA 4GCFA 3LYOA 4GCBA 1DPXA 4DD2A 5KXMA 2N5ZA 4MCKA 1BB5A 4HJVA 5EBHA 3HBHA 5LYZA 4QDNA 4ET9A 1RJCB 2FBDA 1IP6A 4H9IA 4WLYA 3G3BB 3ZVQB 1FKVA 3AGIA 3QY4A 3W6CA 2YBMA 2MEDA 4H93A 1GF8A 1VATA 1RE2A 1GXV2 1ZV5L 2BQHA 2D4KA 4WLTA 1N4FA 4H92A 4YEOA 1YKXX 4NGYA 3P68A 1FLWA 2IFFY 2BQAA 4NSGA 1KXWA 1HC0A 1GBSA 1INUA 3RT5X 1KIQC 1LOZA 1W6ZA 5FEKA 3A8ZA 4D9ZA 4WL7A 2I26L 2ZQ4A 3WU9A 2D6BA 2G4QA 1WQPA 1BB3A 1UBZA 1WQNA 1UIFA 1UIHA 2ZIJA 1TEWA 4G4CA 4HPIA 1C45A 5F81A 3A91A 1IOSA 1IY3A 5IHGA 1I20A 1JITA 5KXYA 2YVBA 4GN5C 2BQNA 1DZBX 4NGWA 1LJHA 1YAMA 3A67Y 1JSFA 4HV2A 4B49A 4H9AA 1WQMA 1ALCA 1BB7A 1RI8B 132LA 1OUEA 1FBIX 4FJRA 3WPKA 1XGRC 4NHTA 1FDLY 4NG8A 1LZ6A 1NQIA 3GXKA 4Z3MA 3TXIA 1UC0A 5KXXA 2HECA 1GB0A 1LJIA 1H87A 2AUBA 1IC4Y 1T3PA 2BQDA 1O23A 1BGIA 5L3IA 5LA5A 5LINA 1C43A 1GDWA 1JKBA 4WM6A 4U3XB 1B5UA 5LA8A 4XYYA 1JISA 1GB6A 1J1XY 1GE4A 1LHKA 2EQLA 2DQIY 3LZ2A 1LZAA 1RCMA 4NGVA 5B59A 3P64A 4H9CA 3W6AA 4I0CA 1RFPA 4B4EA 1LJGA 5M1YA 2Z19A 3FI7A 3T36A 1IORA 1LHJA 1GF5A 1F6RA 4X3BA 4HSFA 2ZNWY 1OUFA 1HFZA 1XGTC 2BQJA 3IJUA 4N8ZA 1GD6A 1IP5A 3LN2A 4XJDA 4ML7A 1UIEA 3A3RX 9LYZA 3AZ7A 4KPMA 1A2YC 5I53A 3TMVA 1CJ6A 2XJWA 4ETEA 1VDQA 1EQ4A 1LJFA 5DN4A 4E3UA 193LA 2BQEA 1BQLY 1IP3A 2BQBA 3WW6A 1IR7A 3OJPA 4XENA 1CKGA 2EKSC 4ETCA 2LYMA 5KKJA 1LSBA 1REYA 4TWSA 1GPQC 4WG7A 1TAYA 4NY5A 3RW8A 4J0LA 5T3FA 1JIYA 1HENA 2ZQ3A 1IX0A 2HU1A 2HEFA 1DQJC 1OUCA 2EIZC 2YBIA 3FE0A 4G4BA 1UIGA 3B0OA 5C6IA 4WM5A 5LXWA 1GAZA 1QDRA 3LYMA 2BPUA 2WARA 1IO5A 3WYHA 3CT0A 1HHLA 1JTOL 1F6SA 4UWVA 1YL0X 5F14A 1XEIA 5LAFA 1BVKC 1JTTL 1LSGA 2RSCA 3EBAB 2GV0A 1VDTA 3EMSA 4XJFA 1GF0A 1AZFA 2BLXA 2BLYA 3ZEKA 4N1EI 4OWBA 2HTXA 1ZVHL 3MGWA 3P66A 208LA 1DI4A 4ET8A 2DQFC 1LSPA 5DLAA 4HV1A 4QEQA 2I25L 5KXWA 2DQJY 2LYZA 4ANRA 1IWUA 1GBZA 1LZRA 1NBYC 1GE3A 1OP9B 5APCA 3N9CA 4OWCA 1GBXA 2HEEA 4LYMA 5KXKA 2BQMA 4R6CA 3HFMY 4WM2A 1CJ9A 1QQYA 1YAOA 1Z55A 1LZCA 3W3EA 1HF4A 1UICA 1B5XA 1E8LA 1AM7A 1VEDA 3IJVA 4C3WA 2BQIA 4ETDA 3B0IA 2LHMA 2FBBA 194LA 1NWGA 5E4PA 3RU5A 4H8XA 4HPEA 1NBZC 1IOCA 1B2KA 1H6MA 4H8YA 4HJZA 3ATNA 1IC7Y 1IR9A 3J4GA 3A92A 4R0FA 1HERA 1LJEA 1JEFA 4LT2A 4HP0A 5C6JA 4MSTA 134LA 1HEQA 1HFYA 3GXRA 1XGUC 5FDJA 1LSNA 1XEJA 4NWHA 4NG1A 1OUBA 2LYOA 1D0LA 2H9KA 5KXZA 1WQRA 1VDSA 4H9HA 4B4IA 1AT5A 2DQCY 1LMCA 2DKVA 4NEBA 4XJGA 3AGGG 2YBNA 2F2NA 5KKIA 2LZ2A 5KXRA 4NGKA 5ILFA 4N0JA 5ILCA 4QY9A 4NGZA 154LA 2I6ZA 4NGLA 3WL2A 1LSAA 1LCNA 3M18B 5A3ZA 5AMYA 4TTDA 2YBHA 1LKRA 4GCEA 1LAAA 3A6BY 1REMA 4LYCA 1IVMA 3A6CY 4HTQA 5APDA 1LZDA 2ZYPA 4GCDA 1B5ZA 4II8A 4O34A 1LSDA 1GF9A 133LA 1QTKA 1YKYX 1UIDA 5APEA 3P65A 4WM3A 1GF3A 3P4ZA 1UIAA 3CB7A 2DQEY 1LZYA 1LHMA 4LT3A 1LZ5A 4BAFA 4M4OA 1T6VL 1P2CC 1GFUA 1GHLA 1I1ZA 3RNXA 5II3A 1LJ3A 1UIBA 4GN4A 1QDTA 4NGJA 3EO5A 4NHPA 4XJIA 5D5CA 4DD3A 2Y8PA 4NIJA 5KXTA 2HU3A 3TMXA 4YOPA 3W6FA 3WU8A 2DQHY 1GF7A 1I56A 2ZIKA 4G49A 3TMUA 4DD1A 1J1PY 153LA 1B5WA 3B0KA 3N9AA 1FN5A 4TX7A 2ZILA 3LZTA 2C8OA 4QGZA 1BB6A 6LYTA 2DQDY 1UA6Y 3A94A 2MEIA 1DKJA 1GB9A 4IATA 135LA 2W1YA 1EQ5A 2ZWBA 7LYZA 4RLNA 5I4YA 3SP3A 5FHWA 1LYYA 3J6KA 2A7DA 2BQKA 4WLXA 1SLYA 5KY1A 4DD7A 1LSEA 3W6DA 4DWXA 5KXOA 1LZ8A 4YEMA 3AZ4A 1HNLA 4RLMA 1GB5A 3HBEX 2XTHA 1OUGA 3BKVA 5I5QA 2Z39A 1IP4A 1HEMA 5IDDA 4L41A 4H9BA 1IEEA 1B0DA 1XGQC 1NMMA 4LYZA 4GCCA 1TBYA 1LZTA 4DDCA 3TXKA 1CJ8A 4YENA 3AW6A 1OUAA 4DC4A 4NHIA 3B6LA 4PHIA 5LAGA 5LVKA 3LYZA 1WQOA 1F10A 2VB1A 1BVXA 5A3EA 4OW1A 4KT3A 2H9JA 3N9EA 5HNLA 2MEFA 1ZMYL 4B1AA 207LA 3ZVQA 5LYTA 3WW5A 5HLLA 4GLAA 3WPLA 4ZEEA 1NDGC 1LMPA 2Q0MX 1GF4A 1UUZC 2PC2A 2CGIA 1B7QA 1LZBA 1YKZX 3K3TA 4WMGA 4WO9A 1GFVA 2A7FA 1LJJA 1MELL 1BWHA 1UACY 4WL6A 5FSTA 2DQGY 1IOTA 2HEDA 2EPEA 1HEOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L50A 1C6GA 2MECA 4YX7C 5I54A 3WXTA 1G7IC 1C64A 1HMKA 3A93A 5HMVA 261LA 5LVGA 3LYTA 3AJNA 1PZYA 4LYTA 1L82A 5HNCA 3C7YA 4PRUA 1XGPC 2F30A 237LA 5LYMA 1NHEA 1QT5A 189LA 4DD9A 5I4WA 4K5YA 180LA 1L96A 3CSRA 4HTKA 1IWWA 1P64A 1PQKA 3TXEA 2FYDA 244LA 2HUBA 3OK0A 1DKKA 1G7JC 4ETBA 2RAYX 2F4AA 4ARJA 1LPYA 1QUTA 1EL1A 4ZFPA 3SB8A 1LSFA 3G3WA 6LYZA 187LA 259LA 3FA0A 4WM4A 1C6JA 4J1BA 1REXA 1W08A 5DN5A 4I7JA 5LIOA 3TXJA 3WULA 1KW7A 2D4JA 226LA 1IWXA 3GUNA 3LZMA 4LZTA 5B1FA 242LA 2YBLA 1L16A 2DQAA 3ULRA 1P7SA 2B75A 1IIZA 1L89A 3HH3A 3TXDA 2RBOA 1L97A 3IWRA 4ZIXA 1IP2A 1LSYA 4W58A 1L91A 3TXFA 4P2EA 3TMWA 3SN6R 1G0JA 1CNSA 3WVXA 1CKDA 3SBAA 1G7HC 213LA 1CKCA 1IR8A 4LZMA 1D6PA 254LA 2OE4X 4MR1A 4A7DA 1GB2A 2W1XA 1GFHA 4WO6A 4W56A 4H1PA 4GN3A 5KXLA 4AXTA 258LA 4M6DA 3A95A 1L19A 1F0WA 3WUNA 1GE1A 212LA 1LSCA 1GWDA 108LA 4DDAA 1SQ2L 243LA 3C8RA 1LZEA 2IHLA 3WMKA 2LZTA 3WU7A 1YAPA 170LA 1L25A 4WLDA 1L90A 1G7LC 1CV5A 1LZNA 5B07A 1LWKA 4IAPA 3WXUA 3RZEA 1JUGA 4XADA 3T6UA 1L92A 3ATOA 2BAAA 1QSAA 131LA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1D0M A;  5KXP A;  1XEK A;  2CJL A;  5J7C A;  2Z12 A;  3AB6 A;  4NGI A;  4UWN A;  5I54 A;  1FLY A;  2MEC A;  4KL7 A;  3WXT A;  1G7I C;  4NWE A;  1LYZ A;  1HMK A;  3A34 A;  2NWD X;  1LZG A;  1LHH A;  1NDM C;  3A93 A;  1YAN A;  3AZ6 A;  5HMV A;  4H90 A;  5LVG A;  3LYT A;  2ZNX Y;  4G9S A;  4CJ2 A;  2HEB A;  4AGA A;  2C8P A;  3AJN A;  4Z46 A;  1PZY A;  4LYT A;  1LMA A;  4Z41 A;  5HNC A;  3E3D A;  1TCY A;  1C7P A;  2BQL A;  2CWI A;  4OWA A;  3HBD A;  4PRU A;  4LYO A;  1XGP C;  2F30 A;  4B0D A;  4DYG A;  4OOO A;  5K7O A;  5LYM A;  1BWJ A;  1GFR A;  1DXJ A;  1NHE A;  4PPO A;  4TSC A;  3QNG A;  3WH1 A;  1WVU A;  3WPJ A;  3A90 A;  4DD9 A;  1IWZ A;  5I4W A;  4LFP A;  1NKH A;  1V7S A;  4TUN A;  4NSI A;  3CSR A;  4HTK A;  5FCP A;  4NSJ A;  1IWW A;  1IP7 A;  1HSW A;  1XFP L;  4PGJ B;  2Z2F A;  3TXH A;  1UCO A;  1QSW A;  3TXE A;  4G4H A;  2FYD A;  1B5V A;  4LFX A;  5DL9 A;  5L3H A;  2HUB A;  4BAP A;  1KIP C;  2ZYC A;  1DKK A;  3OK0 A;  4H9E A;  1G7J C;  4ETB A;  1NF5 A;  1IWT A;  2F4A A;  1KIR C;  1REZ A; 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 1QDT A;  4NGJ A;  3EO5 A;  4NHP A;  4XJI A;  5D5C A;  4DD3 A;  2Y8P A;  4NIJ A;  5KXT A;  2HU3 A;  3TMX A;  4YOP A;  3W6F A;  3WU8 A;  2DQH Y;  1GF7 A;  1I56 A;  2ZIK A;  4G49 A;  3TMU A;  4DD1 A;  1J1P Y;  153L A;  1B5W A;  3B0K A;  3N9A A;  1FN5 A;  4TX7 A;  2ZIL A;  3LZT A;  2C8O A;  4QGZ A;  1BB6 A;  6LYT A;  2DQD Y;  1UA6 Y;  3A94 A;  2MEI A;  1DKJ A;  1GB9 A;  4IAT A;  135L A;  2W1Y A;  1EQ5 A;  2ZWB A;  7LYZ A;  4RLN A;  5I4Y A;  3SP3 A;  5FHW A;  1LYY A;  3J6K A;  2A7D A;  2BQK A;  4WLX A;  1SLY A;  5KY1 A;  4DD7 A;  1LSE A;  3W6D A;  4DWX A;  5KXO A;  1LZ8 A;  4YEM A;  3AZ4 A;  1HNL A;  4RLM A;  1GB5 A;  3HBE X;  2XTH A;  1OUG A;  3BKV A;  5I5Q A;  2Z39 A;  1IP4 A;  1HEM A;  5IDD A;  4L41 A;  4H9B A;  1IEE A;  1B0D A;  1XGQ C;  1NMM A;  4LYZ A;  4GCC A;  1TBY A;  1LZT A;  4DDC A;  3TXK A;  1CJ8 A;  4YEN A;  3AW6 A;  1OUA A;  4DC4 A;  4NHI A;  3B6L A;  4PHI A;  5LAG A;  5LVK A;  3LYZ A;  1WQO A;  1F10 A;  2VB1 A;  1BVX A;  5A3E A;  4OW1 A;  4KT3 A;  2H9J A;  3N9E A;  5HNL A;  2MEF A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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