3B0OA

Crystal structure of alpha-lactalbumin
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
120
structure length
120
Chain Sequence
MQFTKCELSQLLKDIDGYGGIALPELICTMFHTSGYDTQAIVENNESTEYGLFQISNKLWCKSSQVPQSRNICDISCDKFLDDDITDDIMCAKKILDIKGIDYWLAHKALCTEKLEQWLC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Metal binding protein
source organism Homo sapiens
publication title Structural insights into the stability perturbations induced by N-terminal variation in human and goat alpha-lactalbumin
pubmed doi rcsb
molecule keywords Alpha-lactalbumin
total genus 41
structure length 120
sequence length 120
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-06-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3b0oA00
3M3UA 5FDJA 5KXOA 3M18B 5LVJA 4UWUA 1GFUA 3HBDA 3A34A 4WG7A 2A7FA 1H87A 1FLYA 1ZVYB 1LKSA 2HEEA 2YBJA 1IP3A 1IWWA 1KIRC 1FDLY 1YAOA 4XJFA 1JISA 5E4PA 1HSXA 1BVKC 2D91A 1LSCA 2YSSC 1HFXA 1QSAA 1XEJA 2A7DA 4BAPA 4YEOA 1DZBX 4E3UA 1FLWA 1V7SA 4ET8A 3ZEKA 1UA6Y 3LZTA 4WL7A 4B0DA 5II3A 4LYTA 1KXYA 1JTTL 2F4AA 2Z2FA 2FYCA 5FSTA 1GBXA 1IOCA 1OUEA 1B5UA 1G7MC 1FN5A 3WUNA 1LJKA 1NHEA 1QTKA 4TTDA 4UWNA 1LZ6A 1CKGA 1BWHA 1WTMA 1YROA 2BLYA 2MEEA 1GE4A 4WM2A 4ZFPA 4QGZA 1DI5A 1LSAA 1IX0A 3HBHA 1LSDA 1FLQA 2DQFC 2YBIA 4NGOA 4ML7A 5HQ1A 1NKHA 4H8ZA 3AGGG 4PJ2C 1G7IC 1LHLA 2BQCA 1LJ4A 4GCDA 5KXWA 5B59A 2N5ZA 1GB2A 2ZWBA 3EXDA 1F10A 1LAAA 2MEFA 4LT3A 2HU3A 3P4ZA 4LT1A 4C3WA 5KJ9A 1GXXA 2EQLA 4H1PA 4U3XB 5APDA 3WU8A 4NWHA 4YOPA 1QIOA 1JUGA 3CSRA 1IVMA 4DDAA 1REYA 5K7OA 1JKDA 5FEKA 1DI4A 4G4BA 3A94A 2BQEA 1HEMA 5F14A 1WQMA 1YKXX 6LYZA 1QSWA 1IWUA 1LZNA 4NWEA 4OW1A 2F2NA 4NG1A 4HPIA 3TXGA 1GDXA 1GF7A 1ZV5L 1RJCB 2LYZA 1GAZA 135LA 1F6SA 4WM3A 1C45A 3A6CY 2W1MA 3SP3A 1HEOA 2DQAA 3T36A 5DN4A 1OUBA 2WARA 3TXJA 3W6DA 5LVHA 1I56A 1DI3A 1IWVA 2W1YA 4LT2A 4LT0A 4TUNA 4WM4A 2BQNA 4BADA 1DXJA 4DDCA 2HUBA 1ZMYL 5M1YA 4QEQA 1GAYA 4DWXA 1OUCA 4GLVA 1CKDA 1UIHA 5HNLA 2BQBA 5KKIA 1O23A 4DD9A 1LSZA 4NGKA 2BQGA 134LA 1IWTA 1LKRA 2HEAA 3IJVA 5KXYA 1XGQC 2D4JA 2DQEY 2YBMA 3AZ4A 5FCPA 2Z39A 5APEA 5ILFA 3E3DA 1BB3A 1LMPA 1LYOA 2I26L 2DKVA 4CFPA 1GB0A 4M4OA 1GBZA 1LZAA 4H90A 2ZQ3A 1F0WA 4GN5C 5KXKA 4NGYA 3D9AC 1JPOA 2MEHA 1IP7A 1B7PA 2BQFA 1DKKA 3W3EA 3IJUA 2LYOA 1HFZA 4NGVA 5KXPA 4DD3A 5KKJA 1LZ5A 1PZYA 4G4HA 5A3EA 1GB8A 1NWGA 2BQMA 2IHLA 4NGLA 4RLMA 4RW1A 5FHWA 4NY5A 2H5ZA 3N9EA 1IR9A 3D3DA 4II8A 4PRQA 4HSFA 5IDDA 4NGZA 2ZYCA 2FBDA 2DQHY 2ZILA 2D4KA 1OUJA 4HJYA 4B1AA 4J1BA 2G4PA 1LHJA 4B4EA 4Z3MA 1HELA 3ZVQB 3HFMY 1KIQC 1RI8B 1J1OY 3RNXA 4YM8A 2FBBA 1ALCA 2Z2EA 1GFAA 2FYDA 4J7VA 1AM7A 3G3AB 1IP1A 1OUAA 1CKHA 3P65A 4ETCA 4WLTA 3QNGA 3WU7A 2NWDX 1B0DA 1NDMC 8LYZA 4KT3A 4LFPA 1IOSA 1CJ9A 1JKBA 4XN6A 2I25L 3WU9A 2YBLA 4AGAA 4BAFA 1KXWA 1YAQA 2DQDY 1GBOA 1LZEA 3CB7A 2Z18A 4WO9A 4H8XA 4OWAA 4XJHA 4OWEA 1LMCA 3W6BA 2HEDA 4PHIA 4ANRA 4XJIA 3A3RX 4LYOA 1LMAA 2G4QA 3WUAA 1IWYA 1HMLA 1FLUA 3AYQA 3KAMA 4BS7A 2H9KA 2YBNA 1BQLY 3WMKA 3MGWA 4LYBA 1B5XA 5HNCA 3TMXA 4DD7A 4I0CA 3EO5A 3A8ZA 5HMVA 1LJEA 1OUHA 2ZNXY 4KL7A 2W1LA 1H6MA 2BQJA 9LYZA 4WOAA 1IC7Y 4NHIA 4KPMA 1HC0A 1BHZA 2ZQ4A 1OUDA 1IO5A 3WH1A 1LYYA 4HJVA 3RZ4A 1IP4A 1GBWA 1QUTA 2LYMA 4Z98A 1CJ6A 1LJHA 1LPIA 4Z46A 1GB7A 1GFJA 5I4XA 1UIBA 1WQRA 207LA 1YL0X 2F4GA 5D5FA 1IC5Y 5B1GA 2XBSA 1INUA 1LSNA 4WM1A 194LA 1NBZC 2HEBA 4OOTA 1LHKA 3W6FA 1JKCA 1XGUC 1HMKA 5L3IA 1IP5A 4OWBA 4OOOA 3OK0A 3TMUA 1GE0A 2G4NA 193LA 5B06A 2RSCA 1HHLA 3A92A 3GXKA 1LJFA 1PS5A 4GN4A 1GFTA 2HECA 1JHLA 3A90A 1LCNA 1AKIA 1EQEA 1REMA 2BQKA 2BPUA 1B7QA 1D6PA 1UICA 1DKJA 1GE3A 1GF4A 1GEZA 2B5ZA 5I5QA 1BGIA 1WQQA 2HEFA 5T3FA 3AW6A 5B07A 1GHLA 1VDPA 1GB3A 4AXTA 1JEFA 1N4FA 5IELA 2BQOA 2MEGA 2PC2A 3AJNA 4HP0A 5LIOA 3WL2A 3LYZA 1WVVA 4H91A 1D0KA 4NSIA 1RCMA 1VDTA 1EL1A 3WPKA 4B4IA 1UIEA 4N8ZA 3WUMA 1EQ5A 1SQ2L 3WW6A 4QDNA 3IWRA 1LMNA 1YKYX 1LJGA 4CGEA 1B7MA 1D0MA 1GF9A 1GB6A 4LFXA 4NGIA 4WLDA 1B7RA 1LYZA 4TSBA 1YQVY 1FBIX 1CJ7A 3CT1A 2MEIA 4YEMA 4WMGA 5DM9A 1KXXA 1IY3A 5F81A 5KXSA 1IORA 1HEPA 1LZ9A 1W6ZA 4PRUA 3A91A 3WVYA 5LXWA 2XTHA 4DDBA 4LGKA 2ZNWY 1REXA 3AGHA 4ZEEA 1IOTA 1BVXA 1JJ0A 2F30A 2ZIKA 4MCKA 1LZBA 3LYOA 4X3BA 2XJWA 2BQLA 1IR7A 3B6LA 1JWRA 1WQOA 5F9XA 1XGPC 1JSEA 4NFVA 5L9JA 1CJ8A 1HFYA 1C10A 1LHMA 1UIGA 4PGJB 5HMJA 1SLYA 1YKZX 4N9RA 1IP2A 4RLNA 5I53A 3TXDA 5LAGA 1GE1A 1GF6A 4I8SA 4L41A 4N1CC 4KXIA 132LA 4D9ZA 153LA 2GV0A 2CDSA 4C5FA 1TDYA 1YAPA 1T3PA 5KXRA 4N0JA 1AT6A 1VEDA 1TCYA 2EPEA 1LZCA 4G49A 2HTXA 1HEWA 1OUFA 4P2EA 1E8LA 4NSJA 4H93A 4HJZA 3TXFA 1B5YA 1OP9B 1G7HC 1YL1X 4NHPA 5KY1A 3QE8A 5F16A 5B05A 4NHSA 1LZ8A 5DL9A 1XGTC 2D4IA 1C7PA 4ETBA 1JIYA 1JJ1A 4TSCA 3WPJA 1YILA 3A96A 3AGIA 4GCBA 2BQIA 4GCFA 4H9BA 5J7CA 1LSPA 4TX7A 2AUBA 1B9OA 4EMNA 1GFKA 2YBHA 4NIJA 4UWVA 1LSFA 1BB4A 3WVXA 4WLYA 1HEQA 1DPXA 1WVUA 1XEIA 4H9FA 4B49A 3W6EA 1GE2A 3BKVA 1D0LA 2ZYPA 5C6LA 3A6BY 1ZVHL 4RW2A 4ETEA 1QDTA 1GB9A 2YVBA 3CSZA 4GLAA 4O34A 4DT3A 1C08C 1DQJC 3VWOA 5LINA 1GFVA 3AZ6A 2Z38A 3ULRA 4NEBA 5FELA 4G9SA 1CKCA 1GWDA 3TMVA 5I54A 2C8PA 4LYZA 4YENA 4Z41A 1UCOA 4N1EI 4FDYA 208LA 2Y8PA 4H9AA 4NHTA 5DLAA 1TBYA 4DD2A 1DPWA 4WL6A 5LVGA 133LA 1VATA 5JENB 3FE0A 1HSWA 1RFPA 5EBHA 5B1FA 4DD0A 1HERA 3GXRA 3W6CA 5KXTA 4CHXA 1TEWA 1BB5A 5KXNA 154LA 3FI7A 4DC4A 1F6RA 3N9CA 2BQHA 2C8OA 1QTEA 1YANA 2X0AA 3ZVQA 3WULA 2D6BA 3QY4A 4WO6A 3W6AA 4H92A 1BB6A 1IY4A 1QDRA 3RU5A 3P66A 2DQJY 3ATOA 1GXV2 4EOFA 3LHMA 1KIPC 1LZSA 3WXUA 1A4VA 2CJLA 4GCCA 4A7DA 4ET9A 1B5ZA 1LHHA 2CGIA 1GEVA 1B5VA 1D9UA 1AT5A 1UBZA 2MEDA 3A95A 4HV2A 1QUSA 1VAUA 2MEBA 3A67Y 1HNLA 2Z12A 1XFPL 1B7NA 1LSBA 4H9HA 4XJDA 1RE2A 4W94A 1VDQA 1YAMA 6LYTA 1HENA 1J1XY 3ATNA 5I4YA 1UC0A 1G7LC 1AZFA 1NQIA 5A3ZA 3P68A 5AMYA 1LJJA 1LSGA 3WXTA 3BKHA 4GN3A 1GFGA 1XSFA 1LOZA 4FJRA 2DQGY 4ETDA 5ILCA 5LYMA 1QQYA 4R6CA 1JSFA 4B4JA 3A93A 1JKAA 4W96A 1B2KA 3LYMA 4H9IA 7LYZA 4CFOA 1NF5A 1GF8A 5IHGA 4OWCA 3K3TA 1W08A 1IWXA 1JJ3A 4NGWA 1YIKA 1VDSA 1GD6A 1LSYA 3TMWA 3N9AA 4H94A 3TXIA 2W1XA 1CNSA 5LYZA 3B0OA 1GF5A 3CT5A 4LZTA 1LZYA 5F9UA 1NMMA 5DN5A 4ETAA 2Z19A 1UIDA 2BLXA 1IC4Y 2ZIJA 4N5RA 1LZ1A 4NSGA 4XENA 1T6VL 3P64A 1NBYC 4LYCA 1D6QA 5LVIA 1LYSA 1GFRA 2HU1A 2Z37A 3CQLA 2DQCY 1GPQC 1OUIA 3TXKA 3TXBA 1WQPA 1WTNA 5KXMA 4DD1A 1B7LA 1C46A 1OQMA 1LMOA 1J1PY 1FKQA 1LZGA 1IWZA 1LJIA 5APFA 1BWJA 2I6ZA 1XEKA 2DBTA 1LZDA 2XBRA 4OWHA 4WG1A 5C6IA 1GF0A 3CSQA 4RDSA 5LYTA 1LZTA 1TAYA 3CT0A 4NGJA 3OJPA 4HV1A 1G7JC 4NSHA 3TXHA 2LHMA 4J0LA 4PPOA 1B7SA 3F6ZA 2BAAA 4H9EA 5LA8A 1GFHA 1GF3A 4J1AA 3RT5X 4XADA 5KXZA 5HLLA 1LHIA 1WQNA 4CJ2A 1BB7A 1LMTA 2YDGA 4HTQA 1LZRA 2H9JA 4DYGA 4H8YA 3TXEA 1MLCE 4IATA 2LZTA 1JITA 1IR8A 4XJGA 1MELL 4TWSA 2EKSC 3T6UA 5D5CA 1A2YC 1UACY 2MECA 3AB6A 2IFFY 5LVKA 1FKVA 1HF4A 1B7OA 4IASA 5C6JA 5KXLA 1IEEA 3J6KA 1VFBC 4R0FA 4NHQA 1GB5A 1V7TA 1LJ3A 4WM6A 1I1ZA 1C43A 1LJNA 1P2CC 5E9RA 5L3HA 1LTMA 1JTPL 1GDWA 1XGRC 3WPLA 1GBYA 4HPEA 3A3QA 3B0IA 3LYTA 4QY9A 1UUZC 4WLXA 3AW7A 1IP6A 1BWIA 1LSEA 3HBEX 3J4GA 3LZ2A 4G4CA 3B0KA 4HTKA 4LYMA 4NG8A 4M6DA 4MR1A 1I20A 2LZ2A 4MSTA 5LAFA 3EBAB 4ZIXA 1REZA 3EMSA 1NDGC 2EIZC 3RW8A 2DQIY 1LZ4A 3AZ5A 1EQ4A 1CKFA 2Q0MX 3G3BB 5I4WA 2VB1A 3B72A 4H9CA 1JTOL 5APCA 3WW5A 1LMQA 3AZ7A 1IIZA 1UIAA 1GBSA 4XJBA 4IJ4A 4XYYA 5LA5A 4HTNA 4WM5A 2BQDA 2MEAA 1LSMA 1OUGA 1B5WA 1Z55A 5KXXA 1IOQA 3WYHA 4YF2A 2CWIA 1GFEA 4GCEA 2BQAA 3LN2A 1UIFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
205LA 1GFUA 4UWUA 1FLYA 1C6TA 2YBJA 2RB1X 1IWWA 1FDLY 4XJFA 1BVKC 2YSSC 1HFXA 4YEOA 1V7SA 4ET8A 160LA 235LA 1C69A 1KY1A 1L20A 3LZTA 4WL7A 1CU6A 4B0DA 1JTTL 3L64A 1OUEA 3HH4A 177LA 1LJKA 1QTKA 4UWNA 3C82A 1L19A 1BWHA 4ZPUA 4QGZA 1L90A 3HT7A 1PQMA 2YBIA 1C6HA 1L22A 4NGOA 3FADA 1LHLA 247LA 2N5ZA 3EXDA 1F10A 2MEFA 248LA 3P4ZA 4C3WA 4I7OA 1L82A 3DMZA 3GUJA 3CSRA 182LA 1IVMA 2L78A 1DI4A 2BQEA 1HEMA 1LZNA 1CX6A 1XJTA 2LYZA 1L43A 164LA 4GRVA 1F6SA 218LA 4WM3A 2F2QA 2W1MA 3SP3A 1T6HA 2DQAA 5DN4A 222LA 4TUNA 4DDCA 4WM4A 4BADA 163LA 2BQNA 1DXJA 2HUBA 4DWXA 1OUCA 1UIHA 2OTZX 3G3WA 1O23A 3PDSA 5KKIA 260LA 1LKRA 3HUKA 3IJVA 2D4JA 2OE9X 256LA 5APEA 4M4OA 210LA 1L49A 1JPOA 2LYOA 1ZYTA 1PZYA 2BQMA 4NGLA 114LA 4NGZA 2FBDA 2DQHY 1L27A 1L32A 1L54A 1LLHA 4B4EA 1QUDA 1KIQC 2FBBA 2Z2EA 4J7VA 2FYDA 3G3AB 1CKHA 3WU7A 147LA 1JKBA 2I25L 4AGAA 4BAFA 1KXWA 1YAQA 2Z18A 3HWLA 1OV5A 4WO9A 3W6BA 2HEDA 1PQIA 4ANRA 3A3RX 4LYOA 1IWYA 3KAMA 2H9KA 2CUUA 1QT7A 5HMVA 1OUHA 1CV4A 1L88A 2BQJA 1L06A 2OE4X 1IO5A 1CJ6A 1GFJA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3M3U A;  5FDJ A;  5KXO A;  3M18 B;  5LVJ A;  4UWU A;  1GFU A;  3HBD A;  3A34 A;  4WG7 A;  2A7F A;  1H87 A;  1FLY A;  1ZVY B;  1LKS A;  2HEE A;  2YBJ A;  1IP3 A;  1IWW A;  1KIR C;  1FDL Y;  1YAO A;  4XJF A;  1JIS A;  5E4P A;  1HSX A;  1BVK C;  2D91 A;  1LSC A;  2YSS C;  1HFX A;  1QSA A;  1XEJ A;  2A7D A;  4BAP A;  4YEO A;  1DZB X;  4E3U A;  1FLW A;  1V7S A;  4ET8 A;  3ZEK A;  1UA6 Y;  3LZT A;  4WL7 A;  4B0D A;  5II3 A;  4LYT A;  1KXY A;  1JTT L;  2F4A A;  2Z2F A;  2FYC A;  5FST A;  1GBX A;  1IOC A;  1OUE A;  1B5U A;  1G7M C;  1FN5 A;  3WUN A;  1LJK A;  1NHE A;  1QTK A;  4TTD A;  4UWN A;  1LZ6 A;  1CKG A;  1BWH A;  1WTM A;  1YRO A;  2BLY A;  2MEE A;  1GE4 A;  4WM2 A;  4ZFP A;  4QGZ A;  1DI5 A;  1LSA A;  1IX0 A;  3HBH A;  1LSD A;  1FLQ A;  2DQF C;  2YBI A;  4NGO A;  4ML7 A;  5HQ1 A;  1NKH A;  4H8Z A;  3AGG G;  4PJ2 C;  1G7I C;  1LHL A;  2BQC A;  1LJ4 A;  4GCD A;  5KXW A;  5B59 A;  2N5Z A;  1GB2 A;  2ZWB A;  3EXD A;  1F10 A;  1LAA A;  2MEF A;  4LT3 A;  2HU3 A;  3P4Z A;  4LT1 A;  4C3W A;  5KJ9 A; 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 4HV1 A;  1G7J C;  4NSH A;  3TXH A;  2LHM A;  4J0L A;  4PPO A;  1B7S A;  3F6Z A;  2BAA A;  4H9E A;  5LA8 A;  1GFH A;  1GF3 A;  4J1A A;  3RT5 X;  4XAD A;  5KXZ A;  5HLL A;  1LHI A;  1WQN A;  4CJ2 A;  1BB7 A;  1LMT A;  2YDG A;  4HTQ A;  1LZR A;  2H9J A;  4DYG A;  4H8Y A;  3TXE A;  1MLC E;  4IAT A;  2LZT A;  1JIT A;  1IR8 A;  4XJG A;  1MEL L;  4TWS A;  2EKS C;  3T6U A;  5D5C A;  1A2Y C;  1UAC Y;  2MEC A;  3AB6 A;  2IFF Y;  5LVK A;  1FKV A;  1HF4 A;  1B7O A;  4IAS A;  5C6J A;  5KXL A;  1IEE A;  3J6K A;  1VFB C;  4R0F A;  4NHQ A;  1GB5 A;  1V7T A;  1LJ3 A;  4WM6 A;  1I1Z A;  1C43 A;  1LJN A;  1P2C C;  5E9R A;  5L3H A;  1LTM A;  1JTP L;  1GDW A;  1XGR C;  3WPL A;  1GBY A;  4HPE A;  3A3Q A;  3B0I A;  3LYT A;  4QY9 A;  1UUZ C;  4WLX A;  3AW7 A;  1IP6 A;  1BWI A;  1LSE A;  3HBE X;  3J4G A;  3LZ2 A;  4G4C A;  3B0K A;  4HTK A;  4LYM A;  4NG8 A;  4M6D A;  4MR1 A;  1I20 A;  2LZ2 A;  4MST A;  5LAF A;  3EBA B;  4ZIX A;  1REZ A;  3EMS A;  1NDG C;  2EIZ C;  3RW8 A;  2DQI Y;  1LZ4 A;  3AZ5 A;  1EQ4 A;  1CKF A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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