1NMMA

Beta-1,4-galactosyltransferase mutant cys342thr complex with alpha-lactalbumin and glcnac
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
123
structure length
123
Chain Sequence
TELTKCKVSHAIKDIDGYQGISLLEWACVLFHTSGYDTQAVVNDNGSTEYGLFQISDRFWCKSSEFPESENICGISCDKLLDDELDDDIACAKKILAIKGIDYWKAYKPMCSEKLEQWRCEKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase activator/transferase
source organism Mus musculus
publication title alpha-Lactalbumin (LA) stimulates milk beta-1,4-galactosyltransferase I (beta 4Gal-T1) to transfer glucose from UDP-glucose to N-acetylglucosamine. Crystal structure of beta 4Gal-T1 x LA complex with UDP-Glc.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ALPHA-LACTALBUMIN
total genus 39
structure length 123
sequence length 123
chains with identical sequence C
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-01-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1nmmA00
2ZILA 1UBZA 1IOCA 3A8ZA 1HEQA 1IWTA 4WG7A 1H87A 3RZ4A 1LZRA 5FHWA 2D4JA 2ZQ3A 1YKZX 3N9AA 2BQMA 4OWCA 1T6VL 1XGTC 2LZ2A 5KXZA 4PHIA 1DPXA 1WVUA 2BQKA 1GF6A 4FJRA 4BADA 1AKIA 1CJ8A 3LYOA 1EL1A 1B7PA 3LHMA 1HHLA 6LYZA 2PC2A 1LZGA 5LXWA 1NBYC 1LYZA 1IEEA 3MGWA 132LA 3OK0A 1IP5A 1JISA 1C7PA 1A4VA 1WTNA 5KXWA 4LT0A 4EOFA 3FI7A 4B4IA 3T36A 1LSCA 1UC0A 1LZ8A 3B0IA 1WVVA 2BQFA 1LSNA 1GFJA 4NIJA 2A7DA 1BB4A 4J1AA 2N5ZA 2BQEA 5IELA 1NDMC 1NMMA 4NG8A 4PJ2C 3WVYA 1GFAA 3WPKA 1KIPC 1UIAA 4DD7A 1JWRA 1LSFA 5LINA 3E3DA 3FE0A 4RDSA 5APCA 1BB5A 1REMA 2VB1A 1GB2A 2ZYPA 2G4NA 4XJDA 4DD0A 1IWVA 2D4IA 1LMNA 4HJVA 4NGOA 3WW5A 1YL1X 2LHMA 4WM6A 1BB6A 1GB5A 4H9CA 1GWDA 1LOZA 1B7MA 4DT3A 4ETAA 3HBDA 2BLYA 1GEZA 1LHMA 1LZEA 5D5FA 2CJLA 4OWBA 3GXRA 1FLYA 5KXTA 7LYZA 5LYTA 1RCMA 1GF5A 1JKDA 1VDPA 3CQLA 1QDRA 2Z18A 4WL7A 1REXA 1BWJA 3LZ2A 1BQLY 5AMYA 2MEAA 4NHPA 1BGIA 2W1LA 4LYMA 5F81A 3TXDA 1D9UA 2Z37A 3AW6A 1J1XY 4BS7A 1UIFA 1GFVA 4FDYA 3WMKA 1CKFA 1B0DA 1QTKA 4J0LA 4YENA 4M4OA 3P64A 5I54A 1GFUA 1VDSA 1WQOA 4ML7A 4MSTA 1QSAA 4TX7A 3LN2A 1GAYA 1WQQA 1UIGA 2DQGY 5HQ1A 5K7OA 4WLXA 1JHLA 2B5ZA 3M18B 4N1CC 1LJ3A 1UUZC 3N9CA 3TXFA 1VFBC 2YBJA 3D3DA 1LKSA 5T3FA 4LYCA 1YIKA 4G9SA 5I4WA 1B7SA 194LA 1XEIA 2BQAA 3GXKA 1ZVYB 1YANA 1F6SA 1RJCB 2HUBA 4H8XA 4NY5A 1OUIA 4LFXA 4NGJA 4NGIA 1UIBA 1LZ4A 3CB7A 4UWUA 3RNXA 2FYCA 5JENB 1V7SA 1JJ0A 4HV1A 1B9OA 2XTHA 1F0WA 1JJ1A 1KIQC 1SLYA 1YL0X 4GN4A 4H9HA 3BKVA 4H90A 2MEGA 3CSQA 1GE2A 4DDCA 4I8SA 3TXEA 1LJGA 2ZQ4A 1DKJA 5M1YA 1CJ9A 1NKHA 1YAMA 3KAMA 2Z2FA 1BVKC 4LYTA 1LMCA 1FN5A 5DM9A 1HELA 4NGVA 1B7OA 5HMJA 4WO6A 3W6AA 4C5FA 4DDAA 1FLQA 1GE1A 1LJKA 4NWHA 1YAOA 8LYZA 1YKYX 3M3UA 2D4KA 5IDDA 1GB3A 2FBBA 3D9AC 5LVKA 3B0OA 3IWRA 4WM5A 5LVGA 1J1OY 4H93A 3QNGA 1IWWA 1QUSA 2MEBA 2F4AA 1LSEA 1OUFA 2IFFY 5F9XA 1REZA 2BQJA 4N0JA 2W1XA 6LYTA 3TMWA 3WU7A 3QY4A 1ALCA 4RLNA 5B07A 1G7MC 1CNSA 1LMPA 2HU1A 3A3RX 4H92A 1YQVY 4QDNA 5KJ9A 1OQMA 4WOAA 3CT5A 5DL9A 5A3ZA 1G7LC 1PZYA 2DQHY 4W94A 5F9UA 1LSMA 4XENA 4PRQA 1LSZA 2EKSC 4N9RA 3P65A 5LVHA 1I1ZA 5E4PA 4LT1A 5C6LA 1IR9A 2CGIA 1IC4Y 1LTMA 2I25L 4D9ZA 4XJHA 1LJHA 3CT0A 3WVXA 1LJ4A 1LSYA 4IASA 2ZYCA 4OWHA 1HEOA 1ZVHL 1LSBA 2D91A 1C46A 1QDTA 1IY4A 2BQBA 2XBRA 4XYYA 4LT2A 1B7QA 1IIZA 4NWEA 1EQ5A 1BWHA 1DI5A 1JTOL 4ET8A 1SQ2L 4QGZA 1DPWA 4GN5C 1RE2A 1LZ6A 4PRUA 4B4EA 2YVBA 1ZMYL 1KIRC 1IP4A 1D0LA 2ZIKA 1IC7Y 4WG1A 2BQNA 2X0AA 1GBZA 1LJIA 2MECA 3AGGG 4I0CA 3ULRA 1A2YC 5KXOA 1CKHA 1CJ7A 3W6FA 1XFPL 2F4GA 4B0DA 4WMGA 3EXDA 3AYQA 4QEQA 1AT6A 4B4JA 4ZEEA 153LA 1OUJA 1LZBA 1YAQA 3AW7A 1IP2A 3LZTA 1IY3A 1LMAA 1O23A 4NHQA 1UIEA 1OUDA 3WPLA 4DDBA 4ET9A 4HSFA 4ETBA 1IWXA 2Z2EA 3WUAA 1LHIA 1B5ZA 5LAFA 1HEMA 1H6MA 1LZ5A 4WM1A 3WYHA 3A3QA 1HC0A 1NDGC 1GAZA 1BB3A 5FDJA 1BHZA 4YOPA 2C8PA 1B5YA 1OUCA 3B0KA 2DQJY 4HTQA 3WL2A 4DYGA 5KKJA 1FKQA 1GFGA 134LA 1LZ1A 4N5RA 1DKKA 1P2CC 4WM4A 2MEDA 3P66A 1GBSA 4LYBA 4HTNA 207LA 2BQHA 1E8LA 4IJ4A 1GB8A 1LZDA 3HBEX 2EIZC 4R0FA 1YAPA 5LVIA 5APFA 4DWXA 3B72A 4NGKA 1LSGA 3HBHA 4H9IA 1EQ4A 3AZ7A 2EQLA 2CDSA 5KXKA 4H9AA 4XJBA 1AZFA 4GCEA 3TMUA 1IWZA 1LSAA 2H9JA 4XADA 2BLXA 1MELL 1IWYA 4OOTA 3TXKA 4NGWA 4P2EA 1RFPA 2W1MA 1UICA 4LZTA 5B06A 5LA8A 4WL6A 1GF9A 2DQIY 4NHSA 4PPOA 1GFEA 4H9FA 5KXXA 3A6BY 3LYZA 5C6JA 1LPIA 1LMTA 1JKCA 3A93A 4N1EI 5HMVA 4GLAA 4Z46A 4WLDA 1HFXA 3AJNA 3A34A 3TMVA 1IP7A 2D6BA 2H5ZA 1I56A 2ZIJA 2ZNXY 2YBHA 4DC4A 1IR7A 4PGJB 3J4GA 4RW1A 2FYDA 3P4ZA 4WO9A 4Z41A 1DI3A 5E9RA 4L41A 2EPEA 3TXGA 1GF8A 4MR1A 1LHJA 1YROA 3AZ5A 4NSHA 3OJPA 3F6ZA 4LYOA 4U3XB 1F10A 1B5XA 1INUA 3AGHA 4X3BA 4CJ2A 1D6QA 1QSWA 4CGEA 5IHGA 5LYMA 3ZVQB 2BAAA 3CSRA 3A91A 5L3IA 3TXIA 3B6LA 4KXIA 3ZVQA 4H1PA 1C43A 1GE3A 2Q0MX 1DI4A 1LJEA 4NFVA 1IOSA 2BQGA 9LYZA 1B7NA 1TBYA 5I5QA 1IP3A 1LHLA 4YF2A 4ZFPA 1IVMA 5LYZA 4NHTA 3WU8A 1XEKA 2LYOA 3G3BB 4OOOA 5APDA 2WARA 4NSIA 2AUBA 1GB9A 1LMOA 1GE4A 1UCOA 4LT3A 1HEWA 1V7TA 3A96A 1C10A 4OW1A 4TSBA 5HNLA 5B59A 1GXXA 2MEFA 3WPJA 4AGAA 4DD2A 2W1YA 3WULA 4NGLA 4YEOA 1LSPA 4H9BA 1GBOA 1N4FA 4XN6A 5DN5A 4NG1A 1JSFA 3LYTA 3RU5A 1HENA 4DD9A 4H8ZA 1HFYA 4H91A 1HMLA 4TTDA 3WUMA 135LA 2BQCA 5ILFA 2IHLA 4DD1A 1UACY 1WQMA 5L9JA 1DXJA 3WUNA 1WQPA 1AM7A 5LAGA 1CKDA 4DD3A 2BQDA 2DQFC 4BAPA 3TXJA 4LYZA 1B5UA 4KL7A 1GBYA 133LA 5LA5A 1OUGA 4NGYA 3ATOA 4H94A 1VAUA 4YM8A 1GE0A 1XGUC 5I53A 4J1BA 1PS5A 4TSCA 1GF0A 1VDQA 1UA6Y 4G49A 1YILA 3WXTA 2ZNWY 4CHXA 1C08C 2MEIA 3W6CA 1GDWA 3A94A 2F2NA 1XGQC 1QIOA 3CSZA 4GLVA 1NBZC 2YDGA 4RW2A 1HSXA 4XJGA 4GCBA 4XJFA 2XJWA 3WH1A 1KXYA 1BVXA 2Z19A 3BKHA 3CT1A 4HJZA 5APEA 4C3WA 2DBTA 2NWDX 1JJ3A 4QY9A 5F14A 2GV0A 5FCPA 4J7VA 1MLCE 3AZ4A 3RW8A 3TXBA 1TCYA 3W6DA 4G4CA 2F30A 2A7FA 4IATA 5DLAA 4CFOA 1GEVA 1IO5A 1UIDA 1FDLY 4MCKA 1KXWA 1LZTA 1HNLA 1LZSA 4A7DA 1LYYA 4GCFA 1HF4A 4NSGA 1GF3A 3TXHA 5HLLA 2YBIA 4AXTA 1GBXA 4NSJA 1VEDA 2HEDA 2YBNA 1TAYA 2YSSC 4UWNA 1BB7A 1CKGA 1FKVA 1GB0A 1LZAA 4O34A 5FEKA 5B1FA 2G4PA 1JIYA 2I6ZA 1LJNA 1HERA 4GCCA 1BWIA 1GB7A 1CJ6A 1B5WA 1VDTA 5FSTA 1TDYA 3WU9A 2HEAA 2XBSA 1GD6A 3A90A 3ZEKA 1W08A 4TUNA 2HEFA 4B49A 1XSFA 1JKBA 2LYMA 1GBWA 4KT3A 3W3EA 5C6IA 1NHEA 5I4XA 5B05A 1GFTA 2Z38A 1GFKA 1JTPL 1DZBX 3EMSA 1JEFA 1G7JC 1D6PA 1YKXX 5F16A 1XGPC 4HPEA 1EQEA 4GN3A 5KXPA 4YEMA 1LYSA 3IJUA 4HPIA 4OWAA 4ETEA 1GXV2 1B5VA 1LAAA 1LMQA 2DQDY 5EBHA 2LZTA 5KXRA 3AGIA 4NEBA 1CKCA 1DQJC 4HV2A 4ANRA 1QQYA 3QE8A 1F6RA 1FLWA 5B1GA 4B1AA 2CWIA 1GFHA 1W6ZA 2DQEY 3RT5X 1GF7A 3W6BA 1T3PA 4H8YA 1QUTA 4M6DA 5HNCA 1GB6A 1IOQA 1HSWA 4ETDA 1OUHA 154LA 1I20A 2DQCY 1JKAA 2I26L 3AZ6A 4GCDA 4E3UA 2MEHA 4WM3A 4XJIA 1KXXA 1RI8B 1GFRA 4BAFA 1G7IC 3K3TA 1LCNA 5KKIA 1GDXA 3EBAB 1HEPA 2HEBA 4II8A 1LYOA 4UWVA 3WW6A 1VATA 3A67Y 5KXNA 1GF4A 208LA 1NQIA 4G4HA 1LZCA 1LZYA 1WQNA 5KY1A 2H9KA 1OUBA 1WTMA 3A6CY 1LSDA 1QTEA 2MEEA 193LA 1HMKA 4HTKA 5KXMA 1IOTA 1GHLA 3T6UA 1JPOA 2HECA 4NGZA 4Z3MA 4LFPA 5A3EA 1LZ9A 1ZV5L 4EMNA 5I4YA 3LYMA 5KXSA 2BQIA 4OWEA 3ATNA 1FLUA 1TEWA 3VWOA 3SP3A 1D0MA 4H9EA 1WQRA 2HU3A 2YBMA 1HFZA 1J1PY 1NF5A 1OUAA 1B7RA 1LHKA 1LZNA 2Y8PA 2YBLA 3IJVA 4KPMA 4W96A 4CFPA 1NWGA 3HFMY 5ILCA 1LKRA 5KXLA 1B7LA 1LJFA 2HTXA 1IP1A 1FBIX 4HP0A 4RLMA 1IX0A 2DQAA 4NHIA 4WM2A 5D5CA 2FBDA 1REYA 4N8ZA 1JSEA 3EO5A 4WLTA 1LJJA 4HJYA 1IR8A 3G3AB 5DN4A 1JUGA 1XGRC 1IWUA 3W6EA 3P68A 1LHHA 5J7CA 1OUEA 5LIOA 1JTTL 2G4QA 3WXUA 3A92A 1JITA 4G4BA 4ETCA 3N9EA 4Z98A 2BPUA 1AT5A 2RSCA 4ZIXA 1G7HC 4LGKA 5L3HA 3TMXA 1UIHA 1IP6A 3AB6A 5LVJA 2Z39A 1Z55A 5KXYA 3J6KA 1OP9B 4WLYA 1XEJA 1C45A 2HEEA 2Z12A 1D0KA 1GPQC 4TWSA 1IC5Y 2BQLA 1IORA 1B2KA 2DKVA 5II3A 4R6CA 3A95A 2ZWBA 2BQOA 2C8OA 5FELA 2LYZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1H87A 1LZRA 3N9AA 4OWCA 2BQMA 5KXZA 2LZ2A 4ARMB 1WVUA 2BQKA 1AKIA 1CJ8A 6LYZA 256LA 1CVKA 1A4VA 4ARQA 5KXWA 4EOFA 3FI7A 2B7XA 2OE9X 2Q9DA 3WVYA 1KIPC 1JWRA 1REMA 233LA 174LA 2G4NA 4XJDA 3PDSA 1OYUA 1IWVA 4DD0A 2D4IA 4HJVA 3WW5A 1GB5A 1L65A 1GWDA 4ETAA 3HBDA 1FLYA 1JKDA 1REXA 5AMYA 4NHPA 4LYMA 1D9UA 3AW6A 4FDYA 1L83A 1B0DA 4M4OA 1WQOA 3NY8A 189LA 1L13A 1UIGA 1L56A 5K7OA 4WLXA 1LJ3A 3N9CA 2OE4X 1LKSA 3DN2A 2ANVA 1B7SA 4I7RA 226LA 2O79A 3D4SA 4I7PA 1LZ4A 2FYCA 1L71A 3GUIA 2XTHA 1KIQC 1JJ1A 4W51A 1GE2A 3TXEA 1LJGA 3DMXA 1CJ9A 1B6IA 1L21A 1YAMA 119LA 1LMCA 5HMJA 4C5FA 1LJKA 126LA 8LYZA 3M3UA 2NTGA 5IDDA 3D9AC 3B0OA 4H93A 3QNGA 1QUSA 1REZA 4N0JA 3TMWA 4RLNA 1LMPA 3A3RX 4H92A 181LA 5DL9A 1PZYA 1LYGA 2DQHY 149LA 1CU5A 4W94A 4XENA 252LA 4LT1A 2CGIA 2I25L 142LA 1LYHA 1LSYA 4IASA 2B6WA 4OWHA 1ZVHL 1QDTA 1L18A 4XYYA 4NWEA 1DPWA 1L04A 2B73A 1D0LA 2MECA 4I0CA 1JTMA 3W6FA 3EXDA 3SB5A 1OUJA 1YAQA 3LZTA 1IY3A 1LMAA 1CTWA 1OUDA 1L50A 1B5ZA 1L70A 1BB3A 5FDJA 2C8PA 3B0KA 1LZ1A 2MEDA 3P66A 5LVIA 3HBEX 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2ZIL A;  1UBZ A;  1IOC A;  3A8Z A;  1HEQ A;  1IWT A;  4WG7 A;  1H87 A;  3RZ4 A;  1LZR A;  5FHW A;  2D4J A;  2ZQ3 A;  1YKZ X;  3N9A A;  2BQM A;  4OWC A;  1T6V L;  1XGT C;  2LZ2 A;  5KXZ A;  4PHI A;  1DPX A;  1WVU A;  2BQK A;  1GF6 A;  4FJR A;  4BAD A;  1AKI A;  1CJ8 A;  3LYO A;  1EL1 A;  1B7P A;  3LHM A;  1HHL A;  6LYZ A;  2PC2 A;  1LZG A;  5LXW A;  1NBY C;  1LYZ A;  1IEE A;  3MGW A;  132L A;  3OK0 A;  1IP5 A;  1JIS A;  1C7P A;  1A4V A;  1WTN A;  5KXW A;  4LT0 A;  4EOF A;  3FI7 A;  4B4I A;  3T36 A;  1LSC A;  1UC0 A;  1LZ8 A;  3B0I A;  1WVV A;  2BQF A;  1LSN A;  1GFJ A;  4NIJ A;  2A7D A;  1BB4 A;  4J1A A;  2N5Z A;  2BQE A;  5IEL A;  1NDM C;  1NMM A;  4NG8 A;  4PJ2 C;  3WVY A;  1GFA A;  3WPK A;  1KIP C;  1UIA A;  4DD7 A;  1JWR A;  1LSF A;  5LIN A;  3E3D A;  3FE0 A;  4RDS A;  5APC A;  1BB5 A;  1REM A;  2VB1 A;  1GB2 A;  2ZYP A;  2G4N A;  4XJD A;  4DD0 A;  1IWV A;  2D4I A;  1LMN A;  4HJV A;  4NGO A;  3WW5 A;  1YL1 X;  2LHM A;  4WM6 A;  1BB6 A;  1GB5 A;  4H9C A;  1GWD A;  1LOZ A;  1B7M A;  4DT3 A; 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 4UWV A;  3WW6 A;  1VAT A;  3A67 Y;  5KXN A;  1GF4 A;  208L A;  1NQI A;  4G4H A;  1LZC A;  1LZY A;  1WQN A;  5KY1 A;  2H9K A;  1OUB A;  1WTM A;  3A6C Y;  1LSD A;  1QTE A;  2MEE A;  193L A;  1HMK A;  4HTK A;  5KXM A;  1IOT A;  1GHL A;  3T6U A;  1JPO A;  2HEC A;  4NGZ A;  4Z3M A;  4LFP A;  5A3E A;  1LZ9 A;  1ZV5 L;  4EMN A;  5I4Y A;  3LYM A;  5KXS A;  2BQI A;  4OWE A;  3ATN A;  1FLU A;  1TEW A;  3VWO A;  3SP3 A;  1D0M A;  4H9E A;  1WQR A;  2HU3 A;  2YBM A;  1HFZ A;  1J1P Y;  1NF5 A;  1OUA A;  1B7R A;  1LHK A;  1LZN A;  2Y8P A;  2YBL A;  3IJV A;  4KPM A;  4W96 A;  4CFP A;  1NWG A;  3HFM Y;  5ILC A;  1LKR A;  5KXL A;  1B7L A;  1LJF A;  2HTX A;  1IP1 A;  1FBI X;  4HP0 A;  4RLM A;  1IX0 A;  2DQA A;  4NHI A;  4WM2 A;  5D5C A;  2FBD A;  1REY A;  4N8Z A;  1JSE A;  3EO5 A;  4WLT A;  1LJJ A;  4HJY A;  1IR8 A;  3G3A B;  5DN4 A;  1JUG A;  1XGR C;  1IWU A;  3W6E A;  3P68 A;  1LHH A;  5J7C A;  1OUE A;  5LIO A;  1JTT L;  2G4Q A;  3WXU A;  3A92 A;  1JIT A;  4G4B A;  4ETC A;  3N9E A;  4Z98 A;  2BPU A;  1AT5 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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