1A4VA

Alpha-lactalbumin
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
123
structure length
123
Chain Sequence
KQFTKCELSQLLKDIDGYGGIALPELICTMFHTSGYDTQAIVENNESTEYGLFQISNKLWCKSSQVPQSRNICDISCDKFLDDDITDDIMCAKKILDIKGIDYWLAHKALCTEKLEQWLCEKL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lactose synthase
molecule keywords ALPHA-LACTALBUMIN
publication title Structural evidence for the presence of a secondary calcium binding site in human alpha-lactalbumin.
pubmed doi rcsb
total genus 41
structure length 123
sequence length 123
ec nomenclature ec 2.4.1.22: Lactose synthase.
pdb deposition date 1998-02-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1a4vA00
2CWIA 1LAAA 4B4IA 1IY4A 1AT6A 2HEEA 2HTXA 1B2KA 1OUBA 133LA 1LJHA 2BQOA 1LSCA 1OUAA 3A6BY 4YEOA 5KKJA 1IWYA 1OP9B 2D4JA 4OOOA 1GB8A 1CJ8A 4N9RA 1D6QA 2D6BA 3TMUA 4XJIA 1QUTA 5LVJA 4PRUA 4H1PA 1HNLA 1LZ9A 1BHZA 1HEMA 3B0IA 4DD9A 2Z38A 1GF9A 3D3DA 1FKVA 1H87A 4OWEA 1CKHA 4R6CA 194LA 3AB6A 4O34A 1GB5A 1GF5A 4G49A 1FLYA 4E3UA 2Z37A 1JUGA 1FDLY 1GF4A 2DQJY 2ZILA 1YL0X 4WM5A 2DQIY 4HPIA 3EXDA 1V7TA 1REZA 4II8A 1O23A 1B0DA 3WW6A 3W6BA 4CHXA 2HU1A 4N1CC 4QEQA 3IJUA 4LZTA 1MLCE 1HSXA 4BAFA 3AGIA 3EO5A 4NSJA 3CQLA 4QDNA 4H9EA 4DD3A 1LZTA 1JIYA 5A3EA 3HBDA 3WU7A 1OUIA 1BB3A 1JJ3A 2WARA 1XFPL 1E8LA 4PJ2C 4ETDA 4NHSA 4WLDA 3G3BB 1IR8A 1UC0A 3A6CY 3ATOA 4H9HA 5FDJA 3QNGA 9LYZA 5K7OA 5LYTA 2N5ZA 1JJ0A 1FLUA 2ZWBA 1DXJA 3A3RX 1RCMA 1DKKA 1GBZA 3RW8A 3D9AC 4J0LA 2ZYPA 1B9OA 135LA 3F6ZA 1UIDA 1KIPC 4H94A 5F16A 4YM8A 3A34A 1UACY 1IORA 1LJKA 4GLVA 3LN2A 3WXUA 1B7LA 1LSNA 2BQNA 2BQIA 1IC4Y 1GDWA 1SQ2L 3TXFA 3ULRA 1VAUA 2DQFC 1YAOA 2HEAA 2LHMA 2D91A 2C8OA 3ZVQA 1LSBA 5M1YA 1OUEA 1RI8B 5KXYA 1IP2A 1LZYA 4L41A 1CKCA 2Z2FA 1XSFA 1GBWA 3B0OA 1LMPA 1I56A 3CB7A 1LOZA 1TDYA 3LHMA 3LYZA 5FCPA 4Z98A 5KXXA 4OOTA 4ETBA 4H9IA 1J1PY 5DN4A 1DI5A 4N1EI 3W6CA 3WUMA 4HV1A 3WU8A 4LYMA 3TMXA 4LYTA 1BB4A 4LFPA 2YBHA 1FLQA 1IC5Y 2BQMA 2HUBA 1LSPA 5HLLA 1JSEA 4DD1A 5KXMA 4NIJA 1AZFA 4WLTA 5APCA 1IP7A 4IATA 1H6MA 5KXLA 1GB2A 2XBSA 4NEBA 5I4YA 4WG1A 3E3DA 3FE0A 4H90A 1AKIA 3WPKA 2CJLA 3TXHA 4HTKA 2VB1A 1GBYA 4LT1A 1GAZA 2MEIA 1C46A 5B1FA 3B72A 4CFOA 5FHWA 1LZAA 4B4EA 5JENB 1XGQC 5T3FA 1LJNA 4WM4A 1LZNA 2GV0A 3WUAA 2BQAA 1LSGA 1GHLA 2BLXA 2DBTA 1IWWA 1ZVYB 2ZNXY 1ZVHL 4EOFA 1BVXA 2CDSA 1LTMA 1LYYA 3CSZA 1B7MA 4J7VA 4ZFPA 5KXWA 1IO5A 3WVYA 1DI4A 1GFHA 4NHIA 1LMNA 1IP4A 4N5RA 3A93A 3AZ5A 1IWUA 5B59A 1JJ1A 2A7FA 4KT3A 1GE2A 1NHEA 1NDGC 193LA 3T6UA 4NHTA 4OWHA 1EQ5A 4J1AA 4UWUA 4XJBA 1INUA 1UIEA 2PC2A 4XADA 4ETEA 3B0KA 2MECA 3EBAB 1KIQC 1GF8A 1BB6A 5KXZA 5HNCA 1D0MA 2D4KA 2MEEA 1A2YC 4H93A 1C7PA 1GF7A 4LYCA 5I5QA 1JPOA 1LYSA 2HEDA 4GCEA 1G7MC 1JTOL 5B07A 1WQNA 1REYA 3WW5A 1W6ZA 1LHLA 3A90A 3RT5X 1HFXA 1LHIA 2XTHA 1I1ZA 1XGUC 4NFVA 1IIZA 2DKVA 2W1MA 1VEDA 1NDMC 3P64A 2LZ2A 1EQ4A 4B4JA 2B5ZA 6LYTA 4ETAA 1LMCA 1B5UA 4LFXA 4LYBA 3M18B 1CKFA 1HELA 1YROA 1GXV2 5E9RA 2BQLA 4NHPA 2BQJA 1LJFA 2F30A 1LPIA 1KIRC 1QUSA 5HNLA 3HFMY 4DYGA 1LZ1A 1BB5A 6LYZA 1OUJA 3WU9A 5KKIA 1YKZX 3EMSA 1VDQA 1C43A 2RSCA 1B5VA 1NQIA 3MGWA 4HJZA 4RLNA 4GCFA 1BGIA 5KXRA 1GPQC 4NG8A 3J4GA 1QDRA 3W6AA 1UIHA 1HFZA 3TXEA 4NWHA 1KXWA 3N9AA 4GCBA 5II3A 2I26L 4WM3A 2Q0MX 1I20A 4OWAA 1GBOA 4U3XB 1JKCA 2C8PA 1LJJA 3OJPA 1HERA 1LZSA 1J1OY 1JSFA 3CSQA 1N4FA 2LYOA 4D9ZA 1HEOA 2YVBA 4GCDA 5LVKA 2H5ZA 1CKDA 4IJ4A 4LGKA 4WG7A 1IWZA 1GE0A 2IHLA 4HTQA 1HSWA 1BWHA 1G7HC 1BWIA 5LYZA 4ET8A 4W94A 4AGAA 1QSAA 1KXXA 5LVGA 4WMGA 1IY3A 4A7DA 2HEFA 1LJIA 1UIFA 4WOAA 1QSWA 1GWDA 1LSDA 2Z18A 4RW1A 1G7LC 1GFVA 1GE3A 2FBBA 5D5FA 4IASA 4C3WA 1GFTA 4DDCA 2BQHA 4MR1A 2YDGA 1GB3A 1LSAA 1FKQA 1GFKA 1GB0A 1TBYA 4XJHA 3W6DA 4HJYA 5LINA 1HENA 4TUNA 4BAPA 4TSCA 1JTPL 1B7RA 2CGIA 2LYMA 3P65A 3AW6A 4NGOA 4AXTA 3HBEX 2G4PA 4C5FA 1XGPC 1UCOA 5FSTA 4WL7A 3GXKA 1D0LA 4QGZA 1JKBA 4NY5A 3AJNA 1B7PA 3ATNA 1WVUA 1REXA 1FBIX 2BQDA 1XEKA 2H9KA 2F4GA 1JEFA 2YBIA 4Z3MA 1FN5A 1JITA 3TMVA 2D4IA 3FI7A 5AMYA 3SP3A 1P2CC 3WXTA 2YBLA 4N8ZA 3WUNA 1NMMA 1HFYA 5KXKA 1Z55A 1F6RA 1YAPA 1ALCA 1OUHA 3KAMA 5LXWA 1LSEA 1PS5A 2Z12A 1LZ5A 1YKXX 1GFRA 2FYCA 2BQGA 3AGHA 4TX7A 4DD7A 4MCKA 4WM6A 2H9JA 1GFAA 1OQMA 1BVKC 4NWEA 4WO9A 1WQQA 5KXNA 4DDBA 1HEQA 4OWCA 1RJCB 4NGLA 1LSFA 1XGRC 1LSYA 4I0CA 4H8XA 4LT0A 3LZTA 2LYZA 4TTDA 1LMOA 5F9XA 1UA6Y 3VWOA 1FLWA 1LKRA 1RFPA 5LIOA 1UICA 3G3AB 4NGYA 1TAYA 1B7QA 2EPEA 1B5ZA 1IWVA 5APFA 1EL1A 1D9UA 4XJGA 3QE8A 1GF0A 1HMKA 1OUFA 4LT2A 4PGJB 2DQGY 5ILFA 2BQCA 1YQVY 3GXRA 2BAAA 1LZ4A 4XENA 5LVIA 4UWVA 7LYZA 4DC4A 4H8YA 1LJGA 1F6SA 3LYTA 1OUGA 1B5XA 1LMQA 1D6PA 2F4AA 4CFPA 1B7NA 1VDTA 4Z41A 3K3TA 1HF4A 4YEMA 1DI3A 5J7CA 1QQYA 4LT3A 1GFEA 1HEPA 3IJVA 1TEWA 4DD2A 2YBNA 1DPXA 4FJRA 4PHIA 4EMNA 4YOPA 2EQLA 5FELA 2AUBA 3W6FA 1JKAA 1D0KA 1YANA 4H9AA 4XJDA 4YENA 4OW1A 1UIBA 1LCNA 1LZDA 1VFBC 1DZBX 2ZYCA 5I4XA 5KY1A 3TXIA 1HC0A 4WLXA 5E4PA 1IP1A 1LHMA 1OUCA 1GEZA 2FBDA 1IX0A 1TCYA 3QY4A 1XEIA 1LZBA 1HHLA 3RZ4A 1IWTA 1EQEA 2DQDY 2Z19A 4XYYA 3TXDA 4B0DA 4GN4A 1YILA 1LKSA 5DM9A 1IP5A 1VDSA 3AZ7A 3CT0A 1NKHA 4X3BA 2BQKA 2HU3A 3BKVA 3WPJA 1YKYX 5C6JA 1WTMA 1B5YA 3A3QA 4H8ZA 3AGGG 4B1AA 1OUDA 2W1YA 1GBXA 4N0JA 4ML7A 4KPMA 5IHGA 1UUZC 3P4ZA 1B5WA 3IWRA 5KXTA 1VDPA 2BQBA 3WULA 2G4NA 1LMTA 2I25L 1LZ8A 1VATA 208LA 4KXIA 2XBRA 2BPUA 2ZIJA 4HP0A 154LA 2MEGA 3CSRA 1GAYA 4HSFA 2EKSC 1CJ9A 4G4CA 1NBZC 4DT3A 1SLYA 3J6KA 2DQCY 1GFGA 3LZ2A 3WL2A 3ZEKA 1CKGA 4HPEA 3B6LA 4R0FA 2BQFA 2FYDA 5LA5A 3TXBA 5LYMA 4ANRA 5B06A 5A3ZA 5LAGA 4J1BA 4WM2A 5KXSA 3A67Y 4I8SA 4NG1A 1IC7Y 1IP6A 3LYOA 4TSBA 1G7JC 1GB7A 1WQOA 3A94A 1CNSA 4NHQA 2A7DA 2MEBA 4LYOA 5L3IA 4HTNA 1LSZA 1REMA 1LZEA 1IOTA 1WQPA 2ZNWY 2MEDA 4W96A 4WO6A 1BWJA 3LYMA 4QY9A 132LA 1A4VA 5IDDA 1QDTA 4XJFA 4Z46A 4GLAA 1JHLA 4RLMA 3ZVQB 4NSHA 1UIGA 3P68A 4CJ2A 4RDSA 1WTNA 1DQJC 1GB9A 1YAMA 1NWGA 4HJVA 3RNXA 1GE4A 2BLYA 3TXKA 1J1XY 4G4HA 4ET9A 5KXOA 1T3PA 4DD0A 3T36A 1T6VL 1V7SA 4NGVA 8LYZA 4H9CA 1IOQA 1YIKA 3TMWA 1C10A 5LVHA 1LZGA 5F9UA 1LSMA 2Z39A 1CJ6A 5LA8A 1CJ7A 3A96A 2W1LA 5DN5A 4PRQA 1DKJA 4G9SA 1B7OA 3W6EA 5I53A 4GN3A 3WMKA 4H91A 207LA 1WQMA 3P66A 2MEAA 4YF2A 3RU5A 4B49A 5FEKA 1UBZA 1GB6A 1QTKA 5KXPA 153LA 2NWDX 1GE1A 5DLAA 1IEEA 2IFFY 1F10A 1MELL 1WQRA 5APEA 1LJ4A 1WVVA 4LYZA 5LAFA 1ZV5L 2DQEY 2MEFA 4NSIA 5B05A 4PPOA 3W3EA 5L3HA 1GEVA 1JTTL 1LYOA 1DPWA 4H92A 1NF5A 1IOCA 2EIZC 3A95A 5D5CA 4H9BA 1G7IC 5DL9A 1IVMA 1GF6A 4H9FA 1LZ6A 5HMVA 1QTEA 1KXYA 5KJ9A 1JWRA 3A91A 1C45A 2X0AA 4RW2A 3OK0A 1GF3A 4NGIA 3TXJA 3AZ6A 5F81A 1IWXA 1JKDA 2I6ZA 4GCCA 4BS7A 1YAQA 1GD6A 3N9CA 1GXXA 1BQLY 1UIAA 5B1GA 1GFUA 4CGEA 3N9EA 1LJEA 5IELA 2ZIKA 4HV2A 5APDA 2YBMA 2HECA 2Y8PA 1LJ3A 4NGJA 1RE2A 1IP3A 3WVXA 4ZEEA 4BADA 2YSSC 1GBSA 3M3UA 5EBHA 1W08A 1LMAA 5L9JA 1LZRA 1AT5A 4NGKA 4G4BA 4P2EA 5HQ1A 1IR9A 3CT5A 1GFJA 1JISA 2Z2EA 1B7SA 1F0WA 4WLYA 2ZQ3A 4OWBA 3HBHA 1IOSA 1LHHA 4GN5C 1LHJA 3WH1A 3TXGA 4ETCA 5F14A 4KL7A 4NSGA 1NBYC 5ILCA 2DQAA 5HMJA 1YL1X 1ZMYL 2LZTA 2BQEA 2YBJA 1C08C 1HMLA 1LHKA 1GDXA 3A92A 3AZ4A 4NGWA 4DWXA 5I4WA 1PZYA 4NGZA 1LYZA 2XJWA 3WYHA 4MSTA 4UWNA 5C6LA 1HEWA 134LA 1QIOA 1BB7A 2W1XA 4FDYA 4TWSA 5I54A 4M4OA 4WL6A 2G4QA 5C6IA 2DQHY 3WPLA 1XEJA 3A8ZA 4M6DA 3CT1A 4ZIXA 4DDAA 1AM7A 2HEBA 1XGTC 3AW7A 2F2NA 4WM1A 1IR7A 2MEHA 2ZQ4A 3BKHA 1LZCA 4XN6A 3AYQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4GBRB 1IY4A 240LA 1AT6A 1B2KA 1IWYA 1C6NA 4N9RA 181LA 1PQDA 1HNLA 3C80A 4DD9A 1HEMA 1SSWA 2Z38A 3FA0A 194LA 3AB6A 1GB5A 1GF4A 1O23A 1B0DA 2B6ZA 4N1CC 1QTDA 1L11A 3HBDA 1BB3A 1CUPA 1XFPL 1C6DA 1G0JA 3G3BB 3A6CY 4ARQB 1DXJA 3A3RX 139LA 1L86A 1P56A 4J0LA 215LA 3F6ZA 165LA 1L67A 1LJKA 3LN2A 2BQNA 3DMVA 3ULRA 167LA 2DQFC 2A4TA 2D91A 3G3VA 1OUEA 158LA 1G1VA 1G0KA 4Z98A 5KXXA 5DN4A 261LA 4N1EI 4LYMA 1C63A 2YBHA 1FLQA 1IC5Y 1CV6A 1JSEA 1L38A 206LA 4NIJA 1AZFA 5APCA 4IATA 1GB2A 226LA 4H90A 1AKIA 2B6TA 4HTKA 235LA 126LA 1C46A 4CFOA 1L34A 1LJNA 169LA 4GRVA 1L63A 1LSGA 1GHLA 2BLXA 114LA 1IWWA 1ZVYB 4EOFA 4DJHA 2OU0X 2B6XA 3HTGA 3CSZA 4ZFPA 4J7VA 3WVYA 4EJ4A 1IP4A 3A93A 5B59A 1XEPA 4NHTA 4OWHA 4ARLA 1DYDA 2F47A 4ETEA 1L70A 3EBAB 4I7QA 1D0MA 2D4KA 1GF7A 3SN6R 5B07A 1WQNA 3A90A 3V2YA 1HFXA 1LHIA 168LA 1P2LA 1VEDA 103LA 2LZ2A 1L82A 6LYTA 177LA 1B5UA 4W55A 1L23A 5E9RA 2BQLA 4DYGA 1KIRC 3VW7A 5KKIA 1OUJA 4ARMB 1OVHA 1XJTA 192LA 1QT4A 102LA 227LA 4DQJA 3J4GA 1QDRA 1HFZA 3TXEA 4ARMA 1I20A 3HH3A 1CU0A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2CWI A;  1LAA A;  4B4I A;  1IY4 A;  1AT6 A;  2HEE A;  2HTX A;  1B2K A;  1OUB A;  133L A;  1LJH A;  2BQO A;  1LSC A;  1OUA A;  3A6B Y;  4YEO A;  5KKJ A;  1IWY A;  1OP9 B;  2D4J A;  4OOO A;  1GB8 A;  1CJ8 A;  4N9R A;  1D6Q A;  2D6B A;  3TMU A;  4XJI A;  1QUT A;  5LVJ A;  4PRU A;  4H1P A;  1HNL A;  1LZ9 A;  1BHZ A;  1HEM A;  3B0I A;  4DD9 A;  2Z38 A;  1GF9 A;  3D3D A;  1FKV A;  1H87 A;  4OWE A;  1CKH A;  4R6C A;  194L A;  3AB6 A;  4O34 A;  1GB5 A;  1GF5 A;  4G49 A;  1FLY A;  4E3U A;  2Z37 A;  1JUG A;  1FDL Y;  1GF4 A;  2DQJ Y;  2ZIL A;  1YL0 X;  4WM5 A;  2DQI Y;  4HPI A;  3EXD A;  1V7T A;  1REZ A;  4II8 A;  1O23 A;  1B0D A;  3WW6 A;  3W6B A;  4CHX A;  2HU1 A;  4N1C C;  4QEQ A;  3IJU A;  4LZT A;  1MLC E;  1HSX A;  4BAF A;  3AGI A;  3EO5 A;  4NSJ A;  3CQL A;  4QDN A;  4H9E A;  4DD3 A;  1LZT A;  1JIY A;  5A3E A;  3HBD A;  3WU7 A;  1OUI A;  1BB3 A;  1JJ3 A;  2WAR A;  1XFP L;  1E8L A;  4PJ2 C;  4ETD A;  4NHS A;  4WLD A;  3G3B B;  1IR8 A;  1UC0 A;  3A6C Y;  3ATO A;  4H9H A;  5FDJ A;  3QNG A;  9LYZ A; 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 2EIZ C;  3A95 A;  5D5C A;  4H9B A;  1G7I C;  5DL9 A;  1IVM A;  1GF6 A;  4H9F A;  1LZ6 A;  5HMV A;  1QTE A;  1KXY A;  5KJ9 A;  1JWR A;  3A91 A;  1C45 A;  2X0A A;  4RW2 A;  3OK0 A;  1GF3 A;  4NGI A;  3TXJ A;  3AZ6 A;  5F81 A;  1IWX A;  1JKD A;  2I6Z A;  4GCC A;  4BS7 A;  1YAQ A;  1GD6 A;  3N9C A;  1GXX A;  1BQL Y;  1UIA A;  5B1G A;  1GFU A;  4CGE A;  3N9E A;  1LJE A;  5IEL A;  2ZIK A;  4HV2 A;  5APD A;  2YBM A;  2HEC A;  2Y8P A;  1LJ3 A;  4NGJ A;  1RE2 A;  1IP3 A;  3WVX A;  4ZEE A;  4BAD A;  2YSS C;  1GBS A;  3M3U A;  5EBH A;  1W08 A;  1LMA A;  5L9J A;  1LZR A;  1AT5 A;  4NGK A;  4G4B A;  4P2E A;  5HQ1 A;  1IR9 A;  3CT5 A;  1GFJ A;  1JIS A;  2Z2E A;  1B7S A;  1F0W A;  4WLY A;  2ZQ3 A;  4OWB A;  3HBH A;  1IOS A;  1LHH A;  4GN5 C;  1LHJ A;  3WH1 A;  3TXG A;  4ETC A;  5F14 A;  4KL7 A;  4NSG A;  1NBY C;  5ILC A;  2DQA A;  5HMJ A;  1YL1 X;  1ZMY L;  2LZT A;  2BQE A;  2YBJ A;  1C08 C;  1HML A;  1LHK A;  1GDX A;  3A92 A;  3AZ4 A;  4NGW A;  4DWX A;  5I4W A;  1PZY A;  4NGZ A;  1LYZ A;  2XJW A;  3WYH A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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