2B6ZA

T4 lysozyme mutant l99a at ambient pressure
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAAAINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme
publication title Cooperative water filling of a nonpolar protein cavity observed by high-pressure crystallography and simulation
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2005-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2b6zA00
3HT7A 1L96A 3V2YA 1K28A 1L20A 1PQMA 2A4TA 4AQNA 236LA 3DN2A 143LA 139LA 1L35A 250LA 196LA 1JTMA 3DMZA 1L47A 1L68A 156LA 2RB1X 1QUHA 3OE9A 3LZMA 3G3WA 1CV6A 3GUPA 162LA 3GUNA 173LA 1QSBA 1D3JA 201LA 216LA 140LA 1L71A 256LA 3RZEA 1L38A 1L07A 1LYEA 246LA 1L26A 1L31A 1L22A 147LA 2ANXA 1SWZA 1QT4A 114LA 3DKEX 1CU6A 1L95A 4I7NA 1G1VA 1L48A 4GBRB 1QTVA 111LA 3SBBC 184LA 245LA 1DYCA 1L83A 2NTHA 2OE9X 159LA 1L59A 1T8FA 3DN6A 1L05A 228LA 160LA 1C60A 3DN1A 244LA 261LA 4I7LA 4LDLA 1L64A 1L67A 1ZYTA 3C8SA 4PJZA 1L34A 1OYUA 1ZURA 3NY9A 3NYAA 1P2RA 3SB7A 3UONA 1L87A 1L74A 4EPFA 1CV0A 1C6IA 2F32A 1LYDA 1L23A 1L54A 3HH5A 234LA 4ARMA 252LA 2RB2X 4EKSA 1PQKA 165LA 191LA 1QSQA 206LA 1L88A 1C67A 4LZMA 186LA 223LA 198LA 3GUKA 1L16A 1LYIA 1P46A 210LA 215LA 2RBQA 1T8AA 3HH4A 1L45A 1L32A 4W53A 1XJUA 1P5CA 4ARQA 3EMLA 1L76A 1KW7A 1SSYA 1L42A 1L62A 1L12A 4W57A 1L01A 1OVJA 1C6EA 1QUOA 258LA 4EKPA 248LA 218LA 3DMXA 2IGCA 127LA 1OVKA 1L19A 1T97A 3C82A 1C6KA 1L51A 1PQIA 182LA 1QUDA 1EPYA 1L98A 237LA 1L93A 1L82A 188LA 1G0KA 1L50A 4EPIA 1L55A 1L30A 1L27A 1DYDA 5I14A 2HUMA 1CX7A 1OWYA 4LDOA 1P36A 1D3MA 1L04A 254LA 180LA 195LA 214LA 3NY8A 3C81A 1L72A 131LA 2QB0B 3DN8A 108LA 4S0WA 3FA0A 227LA 1P6YA 149LA 1G0QA 3SB5A 242LA 185LA 112LA 174LA 2F2QA 1LYFA 145LA 2Q9EA 2B75A 3HTFA 1L85A 1CU0A 230LA 2HULA 2OEAX 1KY0A 249LA 4YXAC 200LA 3SN6R 2L78A 103LA 2HUKA 2LZMA 1C6PA 4I7MA 1QTHA 148LE 167LA 3GUJA 141LA 192LA 1G07A 1L60A 142LA 1C6BA 1LYHA 3DNAA 1L58A 1C61A 171LA 1L21A 1C6FA 3F8VA 1DYGA 1L09A 1L11A 3GUOA 3OE6A 2B6YA 1L46A 2RBOA 1L57A 2RBNA 3D4SA 3GUIA 4DJHA 1C63A 161LA 1T6HA 1CV4A 1XJTA 4EKRA 164LA 4W51A 1LWGA 1L13A 1QTDA 1L36A 209LA 4EXMA 1C6CA 1L79A 247LA 243LA 1C6AA 1C6NA 3HT9A 1P2LA 1L84A 3CDRA 1L25A 1QTZA 2LC9A 107LA 1L24A 2OU8A 235LA 1L08A 3HT6A 2ANVA 4DKLA 2B6WA 4W55A 3PDSA 1DYEA 3L2XA 1OV7A 3HWLA 1LGWA 1LLHA 1T8GA 1I6SA 2QARC 1G0LA 169LA 1CU5A 3VW7A 1L02A 1QTCA 3HU9A 221LA 1L65A 4ZPUA 120LA 3HTDA 1LWKA 183LA 1CX6A 4I7SA 4I7OA 4OO9A 3HH6A 251LA 1L0KA 3F9LA 4ARMB 155LA 1JQUA 1DYFA 1SWYA 2B73A 1D2WA 1L86A 1PQDA 1C62A 2F47A 231LA 222LA 3HTBA 1C6GA 1D3NA 102LA 1C65A 1DYBA 4I7QA 4W52A 1LGUA 4ARQB 3PBLA 1C6TA 1LYJA 1L63A 2RBRA 197LA 1L43A 2B70A 158LA 1P3NA 3SB9A 1L49A 2Z6BA 3G3XA 1L40A 1L03A 253LA 4ARLA 3FI5A 1C69A 1C6LA 175LA 172LA 3C7WA 4YX7C 1P7SA 4EJ4A 115LA 1SX2A 1L90A 1L66A 3CDOA 1XEPA 2B6TA 1D3FA 150LA 2B72A 224LA 129LA 168LA 1D2YA 1G0PA 233LA 1L06A 4W56A 3K2RA 4I7PA 4YXCA 126LA 118LA 163LA 3CDVA 1L56A 3V2WA 1L28A 4E97A 1L73A 1QT7A 3HUKA 4PK0A 212LA 1L14A 1PQJA 151LA 226LA 255LA 4ARJA 122LA 2OE7X 3DMVA 3DN3A 1WTHA 1G0GA 1LI2A 1LYGA 2CUUA 1QUGA 1LI6A 104LA 4IAPA 1LI3A 1KW5A 2RH1A 144LA 2OU0X 7LZMA 1KY1A 1LW9A 1C6MA 2B6ZA 1L92A 3GUMA 2B74A 213LA 1QT3A 241LA 4I7RA 3OE8A 225LA 2NTGA 3DN0A 3HU8A 3HTGA 1L33A 1L80A 1TLAA 2OTZX 128LA 1L18A 2B7XA 1C64A 1D9WA 1KNIA 3QAKA 177LA 4K5YA 157LA 3ODUA 3C80A 3SB8A 1L15A 1L29A 1P56A 3C8QA 1QT6A 3CDQA 1L94A 3HH3A 2RAZX 2RBPA 146LA 2O4WA 3C8RA 205LA 123LA 190LA 152LA 3OE0A 138LA 1B6IA 1C6JA 1G1WA 4W59A 3FADA 4W58A 219LA 3SBAA 1L41A 2B6XA 3DN4A 189LA 3C7ZA 3SB6A 1L44A 1L37A 2O79A 4I7JA 137LA 1NHBA 1L97A 1JTNA 2RBSA 211LA 1KS3A 109LA 2OU9A 6LZMA 110LA 1L17A 2OTYX 1DYAA 3L64A 1L39A 119LA 3HUQA 113LA 1CUPA 1L75A 1C68A 259LA 4EKQA 238LA 3GULA 4LDEA 130LA 2RB0X 3JR6A 1QS9A 3G3VA 1C6HA 1QTBA 1L89A 4I7KA 1G0JA 1LPYA 187LA 1L70A 1CU2A 199LA 1CUQA 1P64A 1CU3A 239LA 1L52A 1PQOA 1SX7A 170LA 125LA 2OE4X 3HUAA 4DAJA 1CV3A 232LA 1L77A 166LA 1QT8A 1OVHA 1QT5A 262LA 1L81A 1L00A 4ARPA 1L69A 1L53A 1QS5A 1OV5A 1ZWNA 3C83A 1L91A 1C6QA 1L99A 4W54A 4GRVA 1G0MA 1LGXA 2Q9DA 178LA 2LCBA 2O7AA 1CTWA 5LZMA 217LA 1L61A 3CDTA 1P37A 260LA 3HT8A 220LA 240LA 1CVKA 1SSWA 3HDFA 3HDEA 1CV5A 176LA 1CV1A 181LA 1L10A 3C7YA 1G06A 1C6DA 1L0JA 1C66A 2RAYX 3RUNA 1OWZA 4I7TA 229LA 257LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3A3RX 1K28A 4ET9A 2DKVA 1GF8A 3N9CA 3A94A 4J1AA 196LA 1LAAA 3WH1A 156LA 4QEQA 1QUHA 1QDRA 3LZMA 1KIPC 3GUPA 1JISA 1H6MA 4H9EA 1CKFA 1BGIA 1QSBA 140LA 5AMYA 1L38A 4XJBA 1AKIA 2ANXA 3FE0A 1QT4A 1OUCA 3TXKA 1LJ4A 1QTEA 4M6DA 1FDLY 153LA 111LA 1OUHA 3QE8A 1P2CC 2NTHA 2OE9X 1T8FA 1LSPA 4NSJA 228LA 3DN1A 3A67Y 4HV2A 4LT2A 2BQBA 4LDLA 1OYUA 3IJVA 4ZFPA 2MEHA 1YKZX 1L87A 1L74A 4EPFA 1OUDA 4WOAA 1LZEA 4CFOA 1C6IA 5DN4A 2BLXA 5KXMA 1LZ6A 234LA 4B1AA 2BQMA 191LA 1OUFA 1L88A 1C67A 1P46A 1BVKC 4LYMA 1UICA 1L45A 1PZYA 3WW6A 4WL7A 4H9FA 4NGZA 4LT0A 3EMLA 1HMKA 1L42A 1OVJA 4Z98A 3KAMA 1BB4A 4KPMA 1GHLA 5I4XA 1L51A 4XENA 1LZSA 1BQLY 1L82A 4H91A 1OQMA 3G3AB 4EPIA 1DYDA 1LPIA 4NHQA 4LDOA 3A96A 1D3MA 1L04A 3B0OA 180LA 3M18B 1L72A 4H92A 3WUNA 2QB0B 108LA 3FA0A 1AT5A 1P6YA 1G0QA 5I4WA 3CSRA 1B7RA 1WTNA 1GEZA 145LA 1DZBX 2B75A 1L85A 2BQOA 2HULA 4NGVA 1GFUA 5F9XA 1KY0A 249LA 1GD6A 103LA 5LVGA 4TTDA 1B7OA 141LA 3WUAA 142LA 5LXWA 1C6BA 3DNAA 4H8ZA 1L58A 4DDAA 1GB6A 3CT1A 1C6FA 3F8VA 1IORA 4HPIA 5DM9A 2DQFC 1L57A 5F16A 4DJHA 3B0IA 5KXRA 1LJNA 1LSCA 4YF2A 4EKRA 4QGZA 1LWGA 4XJIA 4EXMA 5HQ1A 3HT9A 1JKAA 2A7DA 4BAPA 2OU8A 107LA 2B5ZA 4ML7A 4NFVA 1DYEA 1FLUA 3HWLA 1LGWA 3WU9A 3P65A 4N1EI 3VW7A 154LA 1J1OY 3WPLA 221LA 2MEFA 2DQCY 3P4ZA 1IWZA 120LA 1LWKA 3LN2A 1IC4Y 4H9HA 4AGAA 3HH6A 4FJRA 1JJ0A 1L0KA 4ETCA 1IP6A 6LYZA 155LA 2ZIJA 4DQ7A 1IP1A 2MECA 1L86A 1C62A 1GB7A 231LA 3IJUA 3HTBA 4G4HA 1KIQC 4E3UA 5IELA 1LGUA 4CHXA 3PBLA 1CJ7A 1LYJA 4LYZA 3D9AC 5D5CA 1LZGA 2HUBA 1CJ6A 1L43A 2B70A 1LJKA 1P3NA 3RW8A 1LSZA 3G3XA 1L40A 4UWUA 5KXSA 5B05A 5IHGA 4C3WA 253LA 4ARLA 5I53A 1LZNA 5B1GA 4TSCA 4EJ4A 4IATA 1XEPA 1LMPA 4NGKA 1B5ZA 3AJNA 168LA 1HEPA 1D2YA 3K2RA 1REYA 1T3PA 4I7PA 1XGTC 4YXCA 2D4KA 3V2WA 1L28A 1L73A 4PK0A 1VAUA 1L14A 151LA 5APDA 255LA 4I8SA 4UWNA 3TXIA 3HBEX 2OE7X 1INUA 2DQDY 1LYGA 4W96A 3ZVQA 1LI3A 2RH1A 4WLTA 2OU0X 4QDNA 1IR9A 2YDGA 1KY1A 2B6ZA 2ZNWY 4YEOA 5F9UA 1QT3A 1BWJA 3HU8A 1GBSA 4N8ZA 208LA 4LYBA 2Z2FA 2OTZX 1LZTA 4WG7A 1D9WA 4OW1A 4RLMA 3W6BA 3C80A 7LYZA 4WO9A 1L94A 3HH3A 4DC4A 146LA 2O4WA 1LZ8A 4XJGA 123LA 1GAYA 3LHMA 3OE0A 4GLVA 1WQMA 5DN5A 134LA 3DN4A 3C7ZA 1L44A 5B06A 1L37A 3RZ4A 4L41A 1NHBA 1XFPL 1GB9A 2BLYA 109LA 6LZMA 4PHIA 5LAFA 4KT3A 3J6KA 4ETDA 1IC5Y 2OTYX 2BQLA 1GDXA 3L64A 119LA 1WTMA 2IFFY 1CUPA 1L75A 5KKJA 1G7IC 4M4OA 1JSFA 3HBHA 1D0LA 1LJGA 2YVBA 1LTMA 1XGPC 3W6AA 4B4EA 1G0JA 5A3EA 1GB0A 1CU2A 4OWHA 4YM8A 1HSXA 3CSQA 1L52A 1PQOA 1B7SA 1DPXA 1EL1A 3HUAA 2ZNXY 4CGEA 1OVHA 1QT5A 2BQGA 262LA 1L53A 1ZWNA 5I4YA 3AZ4A 2BQNA 1G0MA 2D4JA 2ZQ4A 2Y8PA 1IWVA 133LA 1IOQA 1LYZA 2LYMA 1LSFA 2LHMA 176LA 1CV1A 2DQJY 3BKHA 1HEQA 2YBIA 5HMVA 1L0JA 4DDBA 4NSHA 4I7TA 4WM3A 1KXWA 1LMQA 261LA 257LA 6LYTA 4PGJB 3V2YA 1LKSA 1LHLA 1IO5A 3ZVQB 1L35A 250LA 3WVXA 3WULA 3TXFA 1HFZA 1WQQA 2MEGA 3G3WA 2FYDA 1HEWA 1KXXA 1GWDA 1L07A 4DQJA 4PRQA 4WLYA 246LA 1L26A 5LAGA 3RNXA 2MEIA 1DQJC 1LJHA 2YBHA 4HSFA 1G1VA 1HNLA 1HERA 1TEWA 1L83A 2Z38A 159LA 1L59A 3W6CA 3DN6A 1H87A 4GCCA 4NGWA 2D4IA 1D6QA 1HENA 5IDDA 160LA 1GPQC 244LA 3LYMA 4I7LA 4DD0A 1L64A 3QNGA 5EBHA 4EOFA 1ZYTA 3C8SA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3A3R X;  1K28 A;  4ET9 A;  2DKV A;  1GF8 A;  3N9C A;  3A94 A;  4J1A A;  196L A;  1LAA A;  3WH1 A;  156L A;  4QEQ A;  1QUH A;  1QDR A;  3LZM A;  1KIP C;  3GUP A;  1JIS A;  1H6M A;  4H9E A;  1CKF A;  1BGI A;  1QSB A;  140L A;  5AMY A;  1L38 A;  4XJB A;  1AKI A;  2ANX A;  3FE0 A;  1QT4 A;  1OUC A;  3TXK A;  1LJ4 A;  1QTE A;  4M6D A;  1FDL Y;  153L A;  111L A;  1OUH A;  3QE8 A;  1P2C C;  2NTH A;  2OE9 X;  1T8F A;  1LSP A;  4NSJ A;  228L A;  3DN1 A;  3A67 Y;  4HV2 A;  4LT2 A;  2BQB A;  4LDL A;  1OYU A;  3IJV A;  4ZFP A;  2MEH A;  1YKZ X;  1L87 A;  1L74 A;  4EPF A;  1OUD A;  4WOA A;  1LZE A;  4CFO A;  1C6I A;  5DN4 A;  2BLX A;  5KXM A;  1LZ6 A;  234L A;  4B1A A;  2BQM A;  191L A;  1OUF A;  1L88 A;  1C67 A;  1P46 A;  1BVK C;  4LYM A;  1UIC A;  1L45 A;  1PZY A;  3WW6 A;  4WL7 A;  4H9F A;  4NGZ A;  4LT0 A;  3EML A;  1HMK A;  1L42 A;  1OVJ A;  4Z98 A;  3KAM A;  1BB4 A;  4KPM A;  1GHL A;  5I4X A;  1L51 A;  4XEN A;  1LZS A;  1BQL Y;  1L82 A;  4H91 A;  1OQM A;  3G3A B;  4EPI A;  1DYD A;  1LPI A;  4NHQ A; 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