5KKIA

1.7-angstrom in situ mylar structure of hen egg-white lysozyme (hewl) at 100 k
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title A Versatile System for High-Throughput In Situ X-ray Screening and Data Collection of Soluble and Membrane-Protein Crystals.
pubmed doi rcsb
total genus 47
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2016-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 5kkiA00
4BAFA 1LZ9A 3N9CA 1LMCA 1VATA 2BQEA 3CT5A 4H9EA 4ANRA 1IIZA 1CJ7A 1FKVA 1LSFA 1MLCE 2PC2A 1UA6Y 1WQMA 4XADA 4ZEEA 1PZYA 1BB5A 2YSSC 1CKGA 4H9HA 1NWGA 4ZIXA 4II8A 1LZNA 4LFPA 5LYZA 1ZMYL 1IOCA 1C08C 4OW1A 5LVKA 2ZIJA 1TCYA 4GN3A 8LYZA 4HPEA 1LSZA 1OP9B 1NF5A 1C46A 2HEDA 5KXKA 1BHZA 1NBYC 4XJIA 1YL1X 1CKDA 1FKQA 1B0DA 1GDXA 4NG8A 5LXWA 1BB4A 4GCDA 1SLYA 1WQOA 4H8YA 1GF7A 4A7DA 4QGZA 5F81A 4LT3A 1F6SA 5LVIA 1RCMA 2BQFA 3EBAB 3G3BB 5KXXA 4NGIA 1LMAA 1LZAA 3E3DA 5LA8A 2XTHA 1LZYA 1UCOA 4WLDA 4H94A 4WLXA 1B5VA 1IWZA 1GFVA 1AKIA 1GFJA 1GHLA 1DPWA 2GV0A 1HC0A 4TWSA 5F14A 4IJ4A 5I4YA 1LPIA 1REZA 3AGGG 1MELL 2MEBA 1G7HC 4J0LA 1B7QA 4W94A 1QUTA 2XJWA 1W08A 3B72A 1UIFA 3AB6A 4PGJB 4ETBA 5L9JA 3CB7A 1JJ0A 2W1MA 1ALCA 3LYTA 2ZNXY 5DM9A 4M6DA 5C6JA 1JITA 1REYA 2CWIA 5FEKA 3CT1A 1NMMA 1RE2A 1IWWA 1IX0A 5KY1A 3TMWA 3J6KA 1GB9A 1BVKC 4MSTA 4H91A 2MEGA 1OUJA 2F2NA 2BQOA 1KXWA 2D6BA 2Z12A 1UIDA 5D5CA 1VEDA 1AM7A 1LMNA 4L41A 4NGLA 4DD3A 2WARA 4WMGA 1LZRA 1OUGA 2H9KA 3W6FA 4DDBA 4XJGA 1UIEA 1GBSA 1DI3A 3A67Y 3WVYA 1GBXA 1REXA 2FBBA 1B7MA 1GPQC 2YBJA 2VB1A 5I4WA 5LINA 2HECA 1WVVA 3CQLA 4UWNA 1IY3A 3RZ4A 1B2KA 4WO6A 2F4GA 4XENA 1JPOA 4H9BA 3CSRA 1SQ2L 3FI7A 1UC0A 2X0AA 1GFRA 1NKHA 4HP0A 5A3EA 2EKSC 4LYMA 5I4XA 1HF4A 1LZTA 1G7MC 1BB3A 2YBHA 1LZBA 3LYMA 4HSFA 1IP6A 1CKFA 4WO9A 4B49A 1IWUA 1FLQA 1LKSA 4AGAA 4N1CC 1B5UA 1DKJA 1GF6A 1XGPC 1GBZA 5A3ZA 1IVMA 1IP7A 1LAAA 3BKHA 3AGIA 2HTXA 1B5XA 1VAUA 4HJVA 1YIKA 5KXLA 1DQJC 1QTEA 1LJNA 1XEJA 3IJUA 5KXYA 5C6LA 1LJGA 134LA 2LZTA 1VDPA 3WW6A 5AMYA 1GB3A 4GCFA 1OUEA 1RJCB 1IWYA 1YKXX 4N5RA 2ZILA 1W6ZA 1GDWA 1VDTA 3N9AA 4DC4A 1LJFA 4Z41A 4NGVA 3QY4A 1GEVA 3A6BY 3A94A 3T6UA 2CDSA 4NSJA 1O23A 1IO5A 2LYOA 4N1EI 4E3UA 3WXUA 1JUGA 3A92A 3J4GA 1JWRA 5IDDA 194LA 1LMQA 1IC5Y 1GE0A 1LJJA 1NDMC 1EQ4A 1LSAA 1UACY 1C7PA 1JSEA 4WG1A 2YBMA 4I8SA 1LSEA 1GB0A 1DI4A 2EQLA 4MR1A 4N0JA 1GB7A 1FDLY 1HMKA 5J7CA 3WUNA 4BADA 2EPEA 5KXZA 3VWOA 2YDGA 1BB6A 5E4PA 1GFKA 4H9IA 3TXDA 2H9JA 3OJPA 4B1AA 1IOTA 2Z18A 4DT3A 1UIHA 1JISA 1LYZA 3B6LA 4LYTA 1TEWA 3W3EA 3WULA 1LJ3A 1GE3A 1XFPL 4CJ2A 3W6AA 3TXFA 5IELA 4OWAA 4GLVA 3TXKA 1T6VL 4NHSA 1DI5A 1NDGC 1BVXA 5T3FA 5KXTA 1D6QA 4KPMA 4FDYA 4IATA 1LSYA 1G7LC 4WM1A 4YEOA 5F9XA 5JENB 2BQBA 1Z55A 1LZ8A 1XEKA 1LSDA 5IHGA 5D5FA 4HTQA 2ZYPA 4TSCA 1IWXA 1LSPA 1HFXA 4YM8A 3A3RX 5B59A 1C45A 1DXJA 3TXJA 3A95A 1LJIA 3P66A 2NWDX 2DQJY 5HNLA 5C6IA 5K7OA 1HSXA 1OUDA 1JTTL 4LT1A 2BLXA 2C8OA 2HEEA 3LHMA 3WYHA 2FBDA 2YBIA 3RW8A 1WVUA 3P68A 3AZ6A 2Z38A 1GB5A 1LSCA 4OWBA 1IY4A 9LYZA 1LZGA 2EIZC 1VFBC 1IP2A 1GF8A 4UWUA 2ZQ4A 1GFHA 4TX7A 1V7TA 5KKJA 2MEIA 1LTMA 1VDSA 1BWJA 3RT5X 3W6CA 4B4JA 4MCKA 5EBHA 1BQLY 1KXXA 4HV2A 5KXSA 1GXXA 4RLMA 1OUCA 5LYTA 1IC7Y 1YAPA 4ETEA 1YANA 3LZTA 2ZWBA 3HFMY 4DD9A 1GFUA 1LKRA 4KL7A 3A8ZA 4HTKA 1OUFA 2DQGY 2MECA 4HJZA 4NGOA 4YF2A 2ZYCA 2G4QA 1D0LA 4LT0A 3WMKA 4Z46A 4B4EA 4PRQA 5DLAA 4IASA 1LSNA 1WQPA 2C8PA 1I1ZA 5KXOA 5APDA 1YAOA 1NHEA 4YEMA 3WUMA 1LHJA 5HMVA 3WU9A 2W1YA 5ILFA 5KXPA 1BB7A 4WLYA 4X3BA 1JTOL 2B5ZA 2MEHA 1DZBX 5HMJA 3D3DA 3ZVQB 5B1GA 193LA 4AXTA 1OUBA 2H5ZA 3WW5A 2DQDY 1LHLA 2G4PA 2HEFA 4HPIA 1B7OA 3BKVA 4C3WA 3WPKA 3EO5A 5I54A 1ZVYB 1UIAA 5KXMA 4NHQA 1GFTA 4H93A 1H87A 133LA 2W1LA 1YILA 3QNGA 1D0KA 5LA5A 2MEEA 4OOTA 4DDAA 2LZ2A 4XJFA 1G7JC 1GE2A 4H92A 2I25L 5FCPA 1CKHA 5KXRA 1EQ5A 3ZEKA 3TXGA 3P4ZA 4TUNA 2HUBA 4HJYA 1LJKA 1F0WA 4WL7A 4H8ZA 4RW1A 4QDNA 2DQFC 4NG1A 4BAPA 4DDCA 5B05A 154LA 1YAQA 2FYDA 1AZFA 5F9UA 2BPUA 1A2YC 2AUBA 5APFA 1GB6A 4NGZA 1B7NA 1OUIA 1C10A 1GF0A 2BQDA 4WM2A 4Z98A 5KJ9A 3W6BA 3W6EA 4DWXA 5L3IA 4J7VA 4NY5A 4DYGA 1TBYA 2A7FA 4H1PA 4CHXA 1LSMA 2Q0MX 4EMNA 4XN6A 1CKCA 4ML7A 4RLNA 1LMOA 2BQHA 1I56A 2YVBA 5FHWA 1HMLA 2MEFA 1TDYA 5FDJA 4ETAA 1YL0X 2MEAA 1HEOA 4O34A 2BQNA 1H6MA 1KIPC 3IWRA 4WLTA 7LYZA 1BWHA 1D0MA 1EQEA 1HFYA 1LJEA 3WU7A 4P2EA 5ILCA 2XBRA 1XGUC 3A34A 4WL6A 2BQMA 5FELA 4PJ2C 6LYZA 1ZVHL 4GCEA 4XYYA 2MEDA 1LYOA 3W6DA 1LJHA 1OQMA 1LZDA 1GD6A 1GFEA 2ZIKA 2A7DA 1IOQA 1HENA 4LGKA 5LAGA 3RNXA 1QDTA 3WXTA 1C43A 3B0KA 4ETDA 5DN4A 4I0CA 1JKAA 1V7SA 4OWHA 2HEAA 5B1FA 4OOOA 1GF5A 3LYZA 4NGJA 2LYMA 4G49A 1IR8A 3WU8A 4J1AA 1IWVA 1GBYA 135LA 4WM3A 1LZ6A 1GB2A 1GF3A 1FLUA 2BQLA 2D4KA 4ET8A 3A6CY 2Y8PA 3TMXA 2DBTA 3IJVA 1XGRC 3AZ4A 4NHIA 4B0DA 3TXBA 1JJ1A 4H90A 1IOSA 1JKBA 3G3AB 4QEQA 1LSGA 2BQAA 132LA 1UICA 1LZEA 1IP5A 4NGKA 2BQCA 2DQAA 1JHLA 4LFXA 4DD1A 3WL2A 2HU1A 2I6ZA 4GLAA 1GBWA 2ZNWY 1INUA 2ZQ3A 5LVGA 1HEQA 4WM6A 1GXV2 1HEWA 1UIBA 1TAYA 1XEIA 3A96A 3LZ2A 4GN5C 3CSZA 1IC4Y 4LZTA 3TXHA 1B5ZA 1FLYA 1G7IC 2IHLA 1GFGA 4NHPA 4YENA 4NGWA 4NWHA 4ETCA 5LYMA 1JTPL 4G9SA 4NWEA 1WQNA 1A4VA 1N4FA 1WTMA 1IP3A 1B7SA 1BGIA 1UUZC 3AJNA 3AZ5A 3ATNA 4LYZA 4NHTA 5B06A 1LMTA 3WUAA 1KIQC 1XSFA 4J1BA 1QSAA 1RI8B 2CGIA 4M4OA 1YKYX 4WM5A 4PRUA 1LYSA 1OUHA 1LHMA 1PS5A 208LA 4N9RA 2D91A 5KKIA 4RDSA 1E8LA 2BQIA 3QE8A 1J1XY 5FSTA 1JKCA 3N9EA 3F6ZA 3CT0A 4CGEA 1AT6A 4R6CA 1IEEA 1IP1A 3B0OA 3OK0A 2DKVA 4OWEA 2RSCA 4TTDA 4H9FA 4R0FA 3TXIA 3RU5A 2LYZA 3KAMA 1DKKA 1B5WA 3WH1A 1F10A 1LOZA 4U3XB 3P65A 2D4JA 207LA 1YKZX 1CJ6A 1KXYA 1LHKA 3AW7A 4WOAA 1GBOA 1LCNA 1J1OY 3TMVA 2Z2FA 1BWIA 3M3UA 4DD2A 2BQJA 5APCA 2DQCY 1J1PY 1LSBA 4YOPA 2G4NA 3EXDA 5HQ1A 4LYOA 1QQYA 1HSWA 2HEBA 3AYQA 4GCBA 4ZFPA 1IR7A 1DPXA 1AT5A 1F6RA 1GF4A 2FYCA 1RFPA 2N5ZA 3T36A 4CFPA 3P64A 1T3PA 2BAAA 3B0IA 2HU3A 5I5QA 2IFFY 4W96A 3MGWA 3SP3A 3A90A 1LJ4A 153LA 1QDRA 1FN5A 1B9OA 1D6PA 5APEA 5LVJA 4WM4A 2CJLA 1LZ5A 4EOFA 4LYBA 1KIRC 2XBSA 1QIOA 1VDQA 2BLYA 2DQIY 2Z37A 1B5YA 1B7RA 1P2CC 1XGQC 4UWVA 1HNLA 4N8ZA 1EL1A 5HLLA 1B7LA 2D4IA 4GN4A 1GB8A 3HBEX 1IR9A 1WQQA 4GCCA 3HBHA 3K3TA 1CNSA 4H9CA 1WTNA 4PHIA 5LVHA 1GFAA 1HFZA 4OWCA 1GE1A 2YBNA 3TMUA 4XJBA 3FE0A 2W1XA 1QTKA 5E9RA 3A3QA 4NSHA 4HV1A 1YQVY 1CJ8A 1FLWA 1FBIX 3M18B 4LYCA 1JEFA 3ULRA 4D9ZA 1UBZA 1REMA 2F4AA 5I53A 1HELA 4HTNA 1JIYA 4NSIA 1LYYA 2I26L 5DN5A 3WPLA 4XJDA 5M1YA 3AW6A 1LZSA 1GEZA 4KXIA 1NQIA 2Z19A 3AZ7A 1OUAA 1D9UA 3GXRA 1IP4A 1LZCA 5LAFA 2LHMA 4LT2A 1GWDA 4C5FA 1JKDA 1IWTA 1LZ1A 5LIOA 1GE4A 4TSBA 3EMSA 5F16A 3A91A 4DD7A 5II3A 1LHHA 3TXEA 1HHLA 4G4HA 5HNCA 1B7PA 4RW2A 3LN2A 5B07A 2F30A 4NSGA 4NEBA 4ET9A 1QSWA 5DL9A 2BQKA 1QUSA 3AGHA 4B4IA 4WG7A 1JSFA 1IORA 2YBLA 5KXWA 3GXKA 3CSQA 2DQHY 4XJHA 2Z39A 1UIGA 1YROA 1GF9A 4FJRA 4DD0A 3D9AC 4BS7A 6LYTA 3ATOA 1LMPA 2BQGA 1HEMA 1GAZA 1NBZC 1HERA 1LHIA 4NGYA 4G4CA 1CJ9A 1GAYA 2DQEY 4PPOA 1HEPA 4CFOA 4H9AA 3LYOA 3A93A 4G4BA 5KXNA 3ZVQA 4NFVA 1LZ4A 1JJ3A 3HBDA 3WVXA 4Z3MA 5L3HA 1XGTC 4QY9A 1I20A 2Z2EA 4KT3A 4H8XA 1ZV5L 4NIJA 1WQRA 3WPJA 1YAMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1DYEA 4BAFA 1VATA 3CT5A 1LGUA 1UA6Y 4I7SA 4H9HA 2YSSC 1NWGA 1C08C 2O7AA 5LVKA 2ZIJA 1OVKA 1TCYA 4GN3A 8LYZA 1C6DA 1QTZA 223LA 1YL1X 1FKQA 4S0WA 3PBLA 4A7DA 4ARLA 1DYGA 4QGZA 5LVIA 1RCMA 2BQFA 5KXXA 4NGIA 1LZAA 4WLDA 4H94A 1L57A 1IWZA 1GFJA 1HC0A 5F14A 3AGGG 2MEBA 3FI5A 252LA 2IGCA 3V2WA 3EMLA 5LZMA 1L59A 1UIFA 1JJ0A 1ALCA 1L77A 1C6MA 1T6HA 2CWIA 1WTHA 1LYIA 1NMMA 3CDRA 1RE2A 1IWWA 1CUQA 1KW5A 1LYHA 4MSTA 1KXWA 200LA 2D6BA 3HH3A 4DD3A 1L11A 1OUGA 4XJGA 1DI3A 3A67Y 3WVYA 3UONA 3FI7A 1C6NA 3C8SA 1JTNA 1L65A 5I4XA 1G7MC 1BB3A 1G0QA 1LKSA 234LA 1XGPC 1IVMA 240LA 1B5XA 5KXLA 1DQJC 1L31A 1XEJA 3IJUA 1GB3A 4GCFA 1YKXX 1GDWA 4Z41A 3A6BY 3T6UA 4NSJA 4YXAC 2LYOA 3WXUA 3K2RA 1LJJA 5I14A 1CVKA 1UACY 4WG1A 262LA 1GB0A 4N0JA 1L15A 1FDLY 4AQNA 3SBAA 3WUNA 1XJTA 139LA 3VWOA 1CU2A 3TXDA 4B1AA 1UIHA 146LA 1LJ3A 3W6AA 4GLVA 5T3FA 5KXTA 167LA 1L40A 3HWLA 4IATA 4KPMA 1PQOA 4YEOA 5JENB 2BQBA 1Z55A 1XEKA 1LSDA 4HTQA 2ZYPA 4TSCA 3A3RX 113LA 1C63A 3P66A 1LJIA 1LW9A 5HNLA 3LHMA 1LYDA 3WYHA 3CDQA 3AZ6A 4IAPA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4BAF A;  1LZ9 A;  3N9C A;  1LMC A;  1VAT A;  2BQE A;  3CT5 A;  4H9E A;  4ANR A;  1IIZ A;  1CJ7 A;  1FKV A;  1LSF A;  1MLC E;  2PC2 A;  1UA6 Y;  1WQM A;  4XAD A;  4ZEE A;  1PZY A;  1BB5 A;  2YSS C;  1CKG A;  4H9H A;  1NWG A;  4ZIX A;  4II8 A;  1LZN A;  4LFP A;  5LYZ A;  1ZMY L;  1IOC A;  1C08 C;  4OW1 A;  5LVK A;  2ZIJ A;  1TCY A;  4GN3 A;  8LYZ A;  4HPE A;  1LSZ A;  1OP9 B;  1NF5 A;  1C46 A;  2HED A;  5KXK A;  1BHZ A;  1NBY C;  4XJI A;  1YL1 X;  1CKD A;  1FKQ A;  1B0D A;  1GDX A;  4NG8 A;  5LXW A;  1BB4 A;  4GCD A;  1SLY A;  1WQO A;  4H8Y A;  1GF7 A;  4A7D A;  4QGZ A;  5F81 A;  4LT3 A;  1F6S A;  5LVI A;  1RCM A;  2BQF A;  3EBA B;  3G3B B;  5KXX A;  4NGI A;  1LMA A;  1LZA A;  3E3D A;  5LA8 A;  2XTH A;  1LZY A;  1UCO A;  4WLD A;  4H94 A;  4WLX A;  1B5V A;  1IWZ A;  1GFV A;  1AKI A;  1GFJ A;  1GHL A;  1DPW A;  2GV0 A;  1HC0 A;  4TWS A;  5F14 A;  4IJ4 A;  5I4Y A;  1LPI A;  1REZ A;  3AGG G;  1MEL L;  2MEB A;  1G7H C;  4J0L A;  1B7Q A;  4W94 A;  1QUT A;  2XJW A;  1W08 A;  3B72 A;  1UIF A;  3AB6 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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