1LJNA

Crystal structure of tuekey egg lysozyme complex with di-n-acetylchitobiose at 1.19a resolution
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVYGRCELAAAMKRLGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTHATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSKNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIASGGNGMNAWVAWRNRCKGTDVHAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystallographic dissection of the thermal motion of protein-sugar complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords lysozyme C
molecule tags Hydrolase
total genus 50
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2002-04-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1ljnA00
4TWSA 3LYZA 1B5XA 3CSQA 4LYZA 1FLUA 2W1XA 4UWUA 2H5ZA 3B6LA 1TAYA 2DQIY 1T3PA 1GBOA 1UIFA 1RJCB 3VWOA 3WPJA 1GBXA 1OUGA 1UIGA 4M6DA 2D4KA 5J7CA 4XJFA 4MR1A 5LYTA 2MEIA 1QUSA 1B7RA 1IOTA 4WM1A 3CT5A 3WUAA 2X0AA 1LSBA 4CHXA 1B5YA 2ZYCA 1GF8A 5HLLA 1GEZA 4G4CA 2ZIKA 4ETAA 3HFMY 5AMYA 5KXXA 1NBZC 1UIHA 2EIZC 1LMPA 4GLAA 1OUEA 1LSNA 1UIEA 2BQMA 1G7LC 3M3UA 3ZVQB 4WM2A 1OUAA 1LHJA 4LYTA 1DPWA 1GFAA 1REMA 1UCOA 1NDGC 3AYQA 3HBHA 1J1XY 1GDXA 3AZ4A 4Z98A 4XYYA 1IR7A 1LKSA 3AGIA 1OUCA 4RW2A 5DN4A 1YANA 2BQHA 1WQMA 2DQFC 1VEDA 4YF2A 1UACY 1RE2A 2CDSA 2FYDA 4HPEA 1NKHA 5KXTA 2G4NA 1IWYA 1GF4A 1OUHA 4H8ZA 4HSFA 1DZBX 4HTQA 1LHKA 1IX0A 2FYCA 1ZV5L 1YAMA 4ET9A 1IP1A 153LA 2DBTA 1GBZA 1LAAA 3N9EA 4LYBA 1EQ5A 4B4IA 1Z55A 1JKBA 1GF0A 1GDWA 1UBZA 3A95A 1HMLA 3TXKA 8LYZA 1JJ1A 1OUDA 2EKSC 1D0KA 4N5RA 208LA 1E8LA 2DQAA 1FLWA 1RFPA 1IC7Y 2Z38A 1LMCA 2HEFA 4DT3A 4HJZA 3B0OA 1D6PA 1GB7A 1LMAA 3W6BA 1NMMA 1C10A 2GV0A 1LYOA 2WARA 1QQYA 4HTNA 5D5CA 1LJ4A 3P66A 3WW6A 2G4QA 1IY3A 2F30A 4KT3A 1LSDA 3ATNA 3GXKA 4NGLA 1LZNA 4H8YA 1BB7A 4CFPA 1KXWA 1DKJA 2FBBA 1GB5A 1SLYA 4MSTA 4GN3A 3ZEKA 4H92A 4H9IA 5F14A 3QNGA 2MEEA 5E9RA 4H94A 4N1EI 1LJNA 1JHLA 1G7IC 4XJBA 3LN2A 4Z46A 4WLYA 1G7JC 4WLTA 1WQOA 4NHSA 1IC4Y 1IWZA 1VATA 3AZ6A 3WU7A 194LA 3CSZA 1NQIA 4DWXA 4DDCA 2YBHA 1GE2A 1LMQA 3TXHA 2Z37A 1LMNA 1RCMA 5HQ1A 2W1YA 1C46A 5C6IA 4LT0A 3W6FA 1KIQC 1LOZA 2LZTA 1LZRA 1DQJC 1IEEA 1BWIA 4XADA 3TMUA 4DDAA 4GCBA 1GHLA 1NF5A 4NGOA 4GLVA 1JUGA 4NIJA 3TMXA 3WMKA 1UIDA 1LHIA 5C6JA 2XBRA 1XFPL 4R0FA 4XN6A 2Z19A 5KXRA 4H93A 1IY4A 1REXA 1A4VA 3LYTA 4G49A 1GBSA 1GD6A 4NSJA 3P68A 1B5ZA 4XJIA 5L3HA 2HU3A 193LA 1T6VL 5KXNA 4ET8A 2YBLA 4HJYA 3CSRA 1IORA 4TSCA 1DI3A 1CNSA 3TXBA 1F6RA 2MEGA 2Y8PA 2F4AA 1LZ6A 2LYZA 3RT5X 1FKVA 1GE3A 1GF3A 5LVIA 1D0LA 1LJKA 3AZ5A 1JISA 4H91A 4TSBA 5I4WA 4WOAA 2HEBA 1LHMA 1HEPA 5ILFA 1OUJA 1GF9A 1KXXA 3P4ZA 4DD1A 1GWDA 4GN5C 3W3EA 7LYZA 2IFFY 2DQJY 3BKVA 4UWNA 1IR8A 4CFOA 3GXRA 3T6UA 3WULA 2BQDA 4WM5A 1CJ9A 5A3EA 1HSWA 2IHLA 4DDBA 2EPEA 4XENA 5DN5A 1B5VA 2XTHA 1FKQA 3TXEA 4ETBA 2I26L 4H9FA 1JTPL 2I6ZA 4NFVA 5FELA 4BS7A 1GB8A 4XJDA 5KXKA 4DD2A 2F4GA 5KXYA 4AXTA 3WW5A 3WUNA 5FEKA 4QEQA 1GB6A 5D5FA 4WG1A 1CKHA 4B0DA 134LA 1IOSA 4DD0A 5B59A 1RI8B 4DC4A 4H90A 1UIBA 4B4JA 2HEDA 2MEAA 1LSEA 4Z3MA 1OUBA 1GE0A 1REYA 4H9HA 4NGZA 4OWAA 3FI7A 2G4PA 3CT0A 3T36A 5LYZA 1TDYA 4H9AA 4DD9A 1DKKA 4LFXA 4ETCA 4DYGA 5FDJA 2Q0MX 1YL1X 3IJUA 4NGYA 1IO5A 1XGUC 4XJGA 4ZEEA 1XSFA 4TX7A 5IHGA 4M4OA 5LAGA 2LYMA 3EXDA 1C43A 2N5ZA 1BGIA 4NEBA 1LJFA 4OWCA 5HMVA 1SQ2L 4N1CC 4WM3A 2BQNA 5B1GA 1CKFA 1GFTA 2RSCA 1BB5A 1HENA 2BQAA 2HU1A 1TBYA 1QSWA 4RDSA 3ZVQA 5B05A 3D9AC 4J1AA 207LA 1CKCA 4N0JA 1QDRA 1JKCA 1LZCA 1YILA 3LYMA 3WVXA 5APDA 4KPMA 4OOOA 4O34A 2EQLA 4BAPA 4NHTA 1GF7A 5LVHA 1HMKA 2W1MA 4QGZA 1BVXA 1GFHA 5HMJA 1IP3A 4ETEA 1JITA 2CWIA 4HJVA 1MLCE 1LSYA 5L3IA 1GFUA 6LYTA 1HHLA 1BVKC 4LT3A 1GB9A 3A3RX 2ZNWY 3D3DA 4WMGA 3WUMA 1IWVA 3A96A 3N9AA 4TUNA 1LHHA 2BLYA 3TXDA 5K7OA 1IWWA 4IASA 5B1FA 2Z2EA 4P2EA 1B2KA 1IP2A 1ZVYB 3G3BB 4HPIA 1DPXA 2BQLA 1ALCA 1IOCA 4H9EA 1KIRC 1YKZX 3A3QA 5FHWA 1GBYA 5I4XA 2DQEY 1LJIA 1UC0A 4TTDA 5APEA 4HP0A 1N4FA 1B7MA 1BHZA 1IP6A 5KXLA 4KL7A 4G9SA 1WTNA 2DKVA 1A2YC 2Z18A 4BAFA 1FLQA 2LYOA 4LT1A 2PC2A 2ZQ4A 2B5ZA 1GFEA 1LJEA 2BQKA 4WLXA 3WU8A 1DI4A 4QY9A 3G3AB 1GFJA 1LZGA 5LA5A 1B5WA 2W1LA 2YSSC 3P64A 1G7MC 4OWHA 3A94A 2HEAA 3WYHA 1IWUA 5E4PA 2CGIA 2DQGY 2YBNA 4ANRA 4G4BA 1YKYX 4OW1A 4I8SA 5KY1A 4W96A 1HEMA 3TMVA 3WPLA 1GF6A 5F9XA 2LHMA 1GB2A 1LSCA 4U3XB 5KXZA 1OQMA 1JKAA 2A7DA 3WL2A 4IATA 1JSFA 3LHMA 4LYMA 1LSFA 4NHIA 1XEJA 2BQGA 4LGKA 3A6BY 1IP7A 1LMOA 1B7OA 1GFRA 4NSHA 1XEKA 1OUIA 2I25L 2MECA 1VDQA 2HECA 2ZQ3A 3MGWA 1B0DA 1HERA 4NGKA 5HNLA 1HEQA 5LA8A 4YOPA 1WQNA 1EQEA 4IJ4A 3OJPA 3WXUA 4WM6A 1IP4A 1CJ8A 4G4HA 4NGJA 4ETDA 4RW1A 1YKXX 5L9JA 3J6KA 1YROA 3AW6A 1AT6A 2MEDA 3EMSA 4II8A 1JJ0A 9LYZA 2F2NA 1P2CC 1HFYA 3AJNA 1IWXA 1G7HC 1HFZA 4YEMA 4GCFA 1LJHA 4E3UA 5LXWA 3WPKA 4CJ2A 4NGWA 1LCNA 4KXIA 5I54A 3HBDA 4UWVA 5LVGA 4ZIXA 3CQLA 4PJ2C 3A34A 1LJGA 4FJRA 4LYOA 5A3ZA 1UIAA 1HFXA 1VAUA 4OWEA 3OK0A 1YAQA 1LJJA 2YDGA 6LYZA 1B9OA 5KJ9A 3AZ7A 4WO9A 1ZVHL 2HEEA 3RZ4A 2H9JA 1LZTA 1MELL 1LTMA 1NBYC 1W6ZA 135LA 4H9BA 2ZWBA 3RW8A 1GBWA 2H9KA 1F6SA 1JKDA 3LZTA 3TXJA 3WVYA 4EOFA 2Z2FA 2A7FA 1HEOA 4L41A 1GXXA 5DLAA 2BQBA 1QUTA 4H8XA 3ULRA 1FBIX 1WQRA 1O23A 1IP5A 1TCYA 5APFA 3WXTA 1DXJA 1LZ4A 1VDPA 3RU5A 4OOTA 1B7LA 1J1PY 3P65A 4WM4A 3EO5A 1LZBA 2YBMA 3BKHA 1GFKA 3B72A 4NG8A 1BWJA 1LZEA 3QY4A 1QSAA 3FE0A 4PPOA 2DQHY 5I53A 1GPQC 1UICA 4EMNA 5LVKA 1AZFA 1GFGA 4GCEA 1D9UA 5APCA 1JJ3A 3IJVA 4YENA 1JWRA 5KKJA 1XEIA 3N9CA 4ZFPA 4RLNA 3B0IA 2AUBA 5F9UA 5LVJA 2D91A 1JTOL 1GE4A 1YAOA 3CB7A 4YM8A 4X3BA 5T3FA 1YIKA 1JTTL 3IWRA 1B7NA 1CJ7A 4RLMA 4NGIA 1VFBC 1XGPC 2NWDX 3AGHA 1GB0A 4N8ZA 3W6DA 2BQIA 1F0WA 1WVUA 1FDLY 1HSXA 1BB3A 3LZ2A 1B7PA 4NY5A 1HELA 4Z41A 4ML7A 4WL6A 1KIPC 2ZYPA 1PS5A 4H9CA 4OWBA 3K3TA 4LZTA 5B06A 1H87A 2Z39A 2MEHA 3LYOA 1GE1A 1UUZC 4PGJB 3TXGA 4DD3A 2BAAA 4WL7A 2XJWA 5F16A 1HF4A 3KAMA 133LA 1GB3A 4H1PA 1D0MA 4PHIA 1LSZA 1IWTA 3A6CY 1NWGA 1LZDA 1QTEA 4I0CA 1LJ3A 2BQCA 2ZNXY 4HV2A 3TXFA 1FN5A 1JPOA 2VB1A 1CKDA 1DI5A 2D6BA 1LHLA 1LYYA 5B07A 1QIOA 1F10A 1LZ9A 1NHEA 5FCPA 3SP3A 3EBAB 5LAFA 154LA 1EL1A 3B0KA 2CJLA 1C45A 2YVBA 5JENB 5HNCA 3A93A 3HBEX 3A8ZA 1D6QA 5KXSA 4XJHA 1GAYA 1V7TA 2BQOA 2LZ2A 1LZYA 1OUFA 4NHPA 4FDYA 1IIZA 1LSGA 1H6MA 2HUBA 3WU9A 2FBDA 1YL0X 1IOQA 1AM7A 1VDTA 1BB4A 4WO6A 3TMWA 3ATOA 5F81A 2BLXA 1LSPA 1XGQC 1CJ6A 2D4JA 5KXOA 4A7DA 4CGEA 1AKIA 2XBSA 5DM9A 1FLYA 3AW7A 1CKGA 1ZMYL 1OP9B 1V7SA 1INUA 1W08A 4WLDA 2YBJA 4LYCA 2HTXA 1YQVY 2ZILA 3AB6A 1C7PA 1HNLA 1LMTA 4LT2A 4C3WA 1GFVA 2BPUA 4PRQA 3RNXA 2DQDY 4D9ZA 1B7QA 1LZ1A 2BQFA 4NSGA 4DD7A 1EQ4A 2C8PA 2MEBA 1LSAA 4QDNA 1NDMC 1WQQA 1TEWA 2D4IA 3AGGG 5FSTA 3TXIA 5KXPA 5C6LA 4MCKA 3A67Y 1LZAA 1VDSA 1WTMA 1LPIA 1JSEA 1REZA 3A92A 1B7SA 3M18B 1LZ5A 4C5FA 2MEFA 2BQJA 4J7VA 5IDDA 4B1AA 4WG7A 3W6AA 1IC5Y 5M1YA 2YBIA 4NWHA 1HEWA 1J1OY 4GCDA 1LKRA 1JEFA 132LA 1LZ8A 4HV1A 4R6CA 4BADA 1LSMA 1I56A 1B5UA 1IR9A 3A90A 5I5QA 4LFPA 4PRUA 1LZSA 5IELA 3W6EA 5LINA 4GCCA 5KXWA 1C08C 1BWHA 5LIOA 3CT1A 4W94A 1QTKA 1LYSA 5DL9A 1HC0A 5II3A 1YAPA 1WQPA 1BQLY 1WVVA 4NWEA 1GEVA 1I1ZA 4N9RA 4J1BA 2DQCY 3W6CA 1I20A 4HTKA 2ZIJA 4GN4A 5KXMA 1XGRC 1AT5A 1GAZA 1GXV2 1GF5A 1PZYA 4J0LA 5EBHA 5I4YA 1JIYA 2Z12A 4AGAA 4NGVA 1BB6A 3QE8A 4YEOA 1XGTC 4NG1A 5ILCA 1LYZA 1KXYA 1UA6Y 2C8OA 3F6ZA 4B49A 5KKIA 1QDTA 4NHQA 4NSIA 4B4EA 1IVMA 2BQEA 3A91A 3J4GA 5LYMA 3WH1A 3E3DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3DN2A 3B6LA 1TAYA 223LA 2RBSA 1GBOA 1UIFA 5J7CA 1P36A 5LYTA 1QUSA 4WM1A 3WUAA 2X0AA 3HH6A 4YX7C 3CDOA 4G4CA 5AMYA 1NBZC 1UIHA 4YXAC 3CDVA 4GLAA 109LA 3M3UA 1C67A 1OUAA 1LHJA 1REMA 1GFAA 1L44A 4Z98A 1OUCA 4RW2A 1L94A 3HH3A 2DQFC 1P7SA 5KXTA 1KY0A 1NKHA 4HTQA 1GBZA 1L33A 1Z55A 1JKBA 1GDWA 3A95A 3TXKA 1D0KA 4I7OA 2A4TA 3SBBC 2OE4X 1LMCA 1D6PA 1LMAA 1L42A 3W6BA 2WARA 1QQYA 2G4QA 4KT3A 4NGLA 1BB7A 1KXWA 1DKJA 2FBBA 1SLYA 3ZEKA 2MEEA 1JHLA 1G1VA 3LN2A 4Z46A 1G7JC 1XJUA 3WU7A 1L58A 1P5CA 4DWXA 1L76A 1C46A 1L80A 1LZRA 4GCBA 1GHLA 2XBRA 227LA 4R0FA 1L43A 1A4VA 1GBSA 4ET8A 5KXNA 3DKEX 4HJYA 1IORA 1DI3A 1CNSA 1P2RA 1QTHA 1LZ6A 1T6HA 1D0LA 1D2YA 1JISA 1DYCA 5I4WA 2HEBA 1HEPA 1GF9A 3P4ZA 1KY1A 1KXXA 1WTHA 4CFOA 2DQJY 3BKVA 1IR8A 1L79A 1QS5A 1CJ9A 1HSWA 1PQOA 2I26L 1QT7A 1C6FA 1L91A 248LA 4XJDA 1C6EA 5KXYA 4EPIA 3PBLA 5FEKA 4QEQA 1GB6A 4DJHA 1CKHA 4DD0A 4DC4A 1UIBA 1QT3A 4B4JA 1L23A 3C8QA 2ANVA 150LA 1GE0A 4NGZA 3FI7A 2G4PA 3CDRA 3CT0A 3T36A 1TDYA 242LA 2L78A 226LA 4DKLA 4ZEEA 1XSFA 1L06A 4TX7A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4TWS A;  3LYZ A;  1B5X A;  3CSQ A;  4LYZ A;  1FLU A;  2W1X A;  4UWU A;  2H5Z A;  3B6L A;  1TAY A;  2DQI Y;  1T3P A;  1GBO A;  1UIF A;  1RJC B;  3VWO A;  3WPJ A;  1GBX A;  1OUG A;  1UIG A;  4M6D A;  2D4K A;  5J7C A;  4XJF A;  4MR1 A;  5LYT A;  2MEI A;  1QUS A;  1B7R A;  1IOT A;  4WM1 A;  3CT5 A;  3WUA A;  2X0A A;  1LSB A;  4CHX A;  1B5Y A;  2ZYC A;  1GF8 A;  5HLL A;  1GEZ A;  4G4C A;  2ZIK A;  4ETA A;  3HFM Y;  5AMY A;  5KXX A;  1NBZ C;  1UIH A;  2EIZ C;  1LMP A;  4GLA A;  1OUE A;  1LSN A;  1UIE A;  2BQM A;  1G7L C;  3M3U A;  3ZVQ B;  4WM2 A;  1OUA A;  1LHJ A;  4LYT A;  1DPW A;  1GFA A;  1REM A;  1UCO A;  1NDG C;  3AYQ A;  3HBH A;  1J1X Y;  1GDX A;  3AZ4 A;  4Z98 A;  4XYY A;  1IR7 A;  1LKS A;  3AGI A;  1OUC A;  4RW2 A;  5DN4 A;  1YAN A;  2BQH A;  1WQM A;  2DQF C;  1VED A;  4YF2 A;  1UAC Y;  1RE2 A;  2CDS A;  2FYD A;  4HPE A;  1NKH A;  5KXT A;  2G4N A;  1IWY A;  1GF4 A;  1OUH A;  4H8Z A;  4HSF A;  1DZB X;  4HTQ A;  1LHK A;  1IX0 A;  2FYC A;  1ZV5 L;  1YAM A;  4ET9 A;  1IP1 A;  153L A;  2DBT A; 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 4WLD A;  2YBJ A;  4LYC A;  2HTX A;  1YQV Y;  2ZIL A;  3AB6 A;  1C7P A;  1HNL A;  1LMT A;  4LT2 A;  4C3W A;  1GFV A;  2BPU A;  4PRQ A;  3RNX A;  2DQD Y;  4D9Z A;  1B7Q A;  1LZ1 A;  2BQF A;  4NSG A;  4DD7 A;  1EQ4 A;  2C8P A;  2MEB A;  1LSA A;  4QDN A;  1NDM C;  1WQQ A;  1TEW A;  2D4I A;  3AGG G;  5FST A;  3TXI A;  5KXP A;  5C6L A;  4MCK A;  3A67 Y;  1LZA A;  1VDS A;  1WTM A;  1LPI A;  1JSE A;  1REZ A;  3A92 A;  1B7S A;  3M18 B;  1LZ5 A;  4C5F A;  2MEF A;  2BQJ A;  4J7V A;  5IDD A;  4B1A A;  4WG7 A;  3W6A A;  1IC5 Y;  5M1Y A;  2YBI A;  4NWH A;  1HEW A;  1J1O Y;  4GCD A;  1LKR A;  1JEF A;  132L A;  1LZ8 A;  4HV1 A;  4R6C A;  4BAD A;  1LSM A;  1I56 A;  1B5U A;  1IR9 A;  3A90 A;  5I5Q A;  4LFP A;  4PRU A;  1LZS A;  5IEL A;  3W6E A;  5LIN A;  4GCC A;  5KXW A;  1C08 C;  1BWH A;  5LIO A;  3CT1 A;  4W94 A;  1QTK A;  1LYS A;  5DL9 A;  1HC0 A;  5II3 A;  1YAP A;  1WQP A;  1BQL Y;  1WVV A;  4NWE A;  1GEV A;  1I1Z A;  4N9R A;  4J1B A;  2DQC Y;  3W6C A;  1I20 A;  4HTK A;  2ZIJ A;  4GN4 A;  5KXM A;  1XGR C; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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