152LA

Conservation of solvent-binding sites in 10 crystal forms of t4 lysozyme
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNCFEMLRCDEGLRLKIYKDCEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQCPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Conservation of solvent-binding sites in 10 crystal forms of T4 lysozyme.
pubmed rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 54
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1994-01-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 152lA00
1DYFA 187LA 2HUMA 162LA 1L41A 1JQUA 1QT7A 1G0JA 2RAZX 3HU9A 1DYBA 1P3NA 205LA 182LA 1CV1A 3FI5A 151LA 4W51A 262LA 2HULA 4ARLA 1D9WA 1KW7A 4GRVA 1ZYTA 2ANVA 1L08A 118LA 1DYCA 4ARQA 1C6BA 1L77A 238LA 233LA 115LA 1PQDA 1L70A 1C6KA 3FA0A 4I7QA 155LA 1DYAA 260LA 1LWGA 2LZMA 261LA 1L96A 4EPIA 7LZMA 3SN6R 247LA 176LA 1L55A 2A4TA 1OYUA 1L33A 1CVKA 3CDRA 157LA 1P46A 189LA 1G06A 1L46A 1LYJA 159LA 3HTGA 3OE0A 3SBBC 1L12A 1L64A 1L16A 1OWZA 1PQKA 2RB2X 1G0MA 1PQOA 1G0LA 4W53A 1L0KA 232LA 1QT3A 1KS3A 4EKRA 1CU0A 4IAPA 1D3FA 219LA 1P64A 251LA 168LA 4I7RA 206LA 237LA 1LPYA 1QS5A 181LA 1L09A 4I7KA 1L57A 3OE6A 209LA 1JTMA 2OE9X 173LA 1T8GA 1L73A 1L40A 2QB0B 167LA 1C6FA 1L86A 1C6EA 3C80A 230LA 1DYGA 2IGCA 235LA 1L34A 3L2XA 2QARC 1PQIA 252LA 1D2WA 1CU6A 4ARJA 1OV5A 1SSWA 120LA 1L85A 2NTHA 1LYIA 1L89A 1C6QA 2Q9EA 123LA 188LA 1L02A 1XJUA 1CU2A 3C8SA 2RBSA 2B73A 3HT8A 1L94A 1D3MA 4ARQB 1D2YA 1L36A 2Z6BA 4I7OA 4EKQA 3C83A 3PBLA 1C63A 4EKSA 3DMVA 1KY0A 131LA 111LA 1L43A 3GUMA 3G3XA 4I7JA 2O4WA 259LA 102LA 158LA 236LA 1L81A 1XEPA 4LDLA 3DMXA 1CU5A 2RAYX 4K5YA 1T6HA 1C67A 1QT4A 137LA 4W57A 3D4SA 3DNAA 1LGUA 125LA 1CX6A 199LA 190LA 1DYDA 1L45A 1OWYA 210LA 4I7MA 1CU3A 1LYEA 1QTHA 249LA 1JTNA 108LA 1QUDA 1L51A 1L28A 226LA 2O79A 1OVKA 1L54A 1L90A 2L78A 1L50A 198LA 1C6LA 2B6TA 4AQNA 1L22A 4DJHA 150LA 3CDTA 3QAKA 1G0PA 4YXCA 1C64A 1L84A 192LA 1L53A 1P7SA 3HTBA 3SBAA 1L04A 1QTCA 3HUAA 1L27A 1L42A 1TLAA 223LA 3LZMA 170LA 191LA 240LA 186LA 200LA 161LA 1XJTA 3C8RA 248LA 3SB8A 220LA 256LA 142LA 3OE8A 1EPYA 1CUPA 258LA 1NHBA 1KNIA 1PQMA 1T8AA 2B74A 3HDEA 3V2WA 109LA 1LW9A 1LI3A 1P36A 1L11A 1L47A 3RZEA 1C6GA 4I7PA 1L25A 1PQJA 1QT8A 1L29A 4YXAC 2B6YA 1D3NA 1LWKA 1C6PA 2OE7X 229LA 4W52A 1ZURA 1OV7A 1QS9A 2RBOA 3HH3A 1L18A 1C65A 1L05A 2OTZX 1L80A 3HUQA 119LA 1SWYA 1L63A 1T8FA 4PK0A 4W54A 3GUIA 1L20A 3C8QA 2B6ZA 1QUHA 1L48A 2F47A 4GBRB 1LYDA 4W58A 4ARMA 3SB9A 4LDEA 1L15A 171LA 3VW7A 3DN2A 3PDSA 2RBQA 213LA 5I14A 4EXMA 3C7ZA 2ANXA 1L88A 3HT7A 1KY1A 1C61A 163LA 2HUKA 3CDQA 138LA 129LA 3DMZA 156LA 3L64A 143LA 1QTVA 1L99A 2LCBA 195LA 1QT6A 4YX7C 3RUNA 3V2YA 3SB6A 1L07A 3HTFA 1L62A 3CDVA 4EKPA 3ODUA 1DYEA 1L60A 3GUPA 1L82A 244LA 3F9LA 3UONA 1C60A 2LC9A 146LA 3EMLA 1L66A 250LA 3GUOA 185LA 1L74A 1G1WA 1L93A 1C6MA 1LYGA 1D3JA 231LA 3DKEX 196LA 1C6NA 201LA 1P56A 1CV4A 1WTHA 1LYFA 4I7TA 122LA 2B72A 2OEAX 2B6XA 1L32A 1L58A 3SB5A 175LA 1L0JA 1C6DA 172LA 2RBRA 147LA 239LA 2O7AA 164LA 212LA 1L52A 2OE4X 1C6AA 1LGXA 149LA 255LA 2OTYX 243LA 4I7SA 4ARPA 215LA 4ARMB 127LA 1L69A 3K2RA 197LA 3HH4A 3DN3A 4DAJA 1L68A 1LI6A 2RBNA 3HH6A 3HU8A 1L24A 178LA 2B75A 1L44A 165LA 1C69A 234LA 3HDFA 2B6WA 4I7LA 1L61A 1CUQA 1CV3A 1L56A 3DN6A 4E97A 1K28A 4W56A 126LA 107LA 1C62A 1OVHA 3OE9A 139LA 4LDOA 3NY8A 1C6HA 1L26A 1CTWA 1L21A 1L72A 3C7WA 3C81A 1C6TA 222LA 4EPFA 1QSQA 2RBPA 140LA 1L83A 1P2RA 1L76A 1SX2A 3C7YA 6LZMA 2B70A 145LA 1C66A 1G07A 3GUJA 174LA 1L65A 1SWZA 1ZWNA 1SX7A 3GUNA 3C82A 217LA 1L92A 1SSYA 2OU0X 1L14A 253LA 1KW5A 3DN1A 1L59A 4S0WA 1L97A 2RH1A 3G3WA 1L31A 2OU8A 3DN4A 3HUKA 3HT9A 1L19A 1B6IA 103LA 2Q9DA 1C68A 3GUKA 114LA 3DN0A 2F32A 1L01A 2NTGA 1L87A 1L79A 1LLHA 227LA 2OU9A 130LA 180LA 1P2LA 228LA 254LA 110LA 3DN8A 183LA 4LZMA 4DKLA 3NY9A 2F2QA 104LA 1L39A 1L06A 128LA 4W55A 1QTDA 1OVJA 3HH5A 1CV5A 1L49A 257LA 1C6JA 166LA 1L71A 1L38A 3HTDA 3FADA 3CDOA 1CV6A 152LA 112LA 1C6CA 1QSBA 169LA 3NYAA 1P6YA 1L10A 3GULA 1L13A 1L35A 1QTBA 3G3VA 4ZPUA 1L37A 5LZMA 3HT6A 2RB0X 144LA 1P5CA 1I6SA 221LA 1C6IA 1G0KA 1T97A 246LA 2RB1X 245LA 4OO9A 1L95A 2CUUA 1QT5A 1L17A 1LI2A 1L23A 160LA 4EJ4A 1G1VA 1QUGA 1G0GA 218LA 177LA 211LA 4PJZA 1LGWA 1CX7A 1G0QA 241LA 3SB7A 1L03A 1L67A 1L98A 3F8VA 4I7NA 216LA 1L91A 1L75A 4W59A 148LE 2B7XA 1L00A 1LYHA 113LA 225LA 184LA 214LA 1QTZA 141LA 1QUOA 1P37A 1L30A 224LA 1CV0A 3HWLA 3JR6A 242LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IIZA 5HMVA 1L41A 1CJ6A 2GV0A 2RAZX 1XGRC 3EMSA 3AZ5A 2W1LA 2HEFA 2HULA 1LOZA 1VEDA 1L08A 1HNLA 1YKZX 1DYCA 1L77A 5KY1A 1C6KA 1CJ8A 1LJ3A 155LA 5LYZA 1L96A 1YAMA 7LZMA 2BQBA 2A4TA 4ETEA 3J4GA 3WVYA 157LA 1IC5Y 3ATOA 1GAZA 1IP2A 3SBBC 4YEOA 1PQKA 3A34A 4HV2A 4LYMA 4W53A 3AW7A 1KS3A 3EXDA 4IAPA 219LA 1PZYA 2XTHA 1XEJA 237LA 181LA 5IDDA 1L57A 4LYZA 209LA 3AZ4A 1L73A 3B0KA 1L86A 3L2XA 1L85A 3T36A 1OUGA 1C6QA 2BQOA 123LA 1WVVA 2RBSA 1GBSA 3IJUA 4MSTA 1D2YA 4NGWA 1GXV2 3C83A 5DLAA 208LA 1KY0A 1BB4A 4WO6A 3CT0A 1BB7A 1L81A 1XEPA 1LJKA 1C08C 4DD3A 1T6HA 137LA 4W57A 3D4SA 1CX6A 199LA 5F14A 1HERA 1L45A 249LA 4YOPA 1QUDA 108LA 1IX0A 1HFYA 2LYZA 3J6KA 5HNCA 1L50A 4II8A 2DQIY 1W6ZA 3RZ4A 1GFHA 3QAKA 1EQ5A 1GF4A 4I0CA 3SBAA 1QTCA 5B1GA 1TLAA 2X0AA 1HSWA 186LA 5KXTA 2D4IA 2DBTA 3IWRA 4GCBA 3TXFA 1Z55A 258LA 5F9UA 1KNIA 1T8AA 2YBNA 3HDEA 4G4HA 109LA 3ATNA 3A8ZA 4DD1A 1LI3A 1OUIA 1UIFA 1L11A 1L47A 1JIYA 1LHIA 1XGUC 4FDYA 5LVIA 4GN5C 1FKQA 3A96A 3HH3A 3W3EA 1B7NA 1OUEA 119LA 4PK0A 1L63A 3A93A 2YDGA 4DD7A 3AZ6A 3C8QA 1LZEA 1DI5A 1LYDA 1G7LC 4ARMA 1D0LA 2DQCY 3SB9A 1GE4A 1GB7A 154LA 3G3BB 4LT0A 3WUAA 4H9BA 3HBHA 3AW6A 2HUKA 1B5WA 2D4JA 1IY3A 1GB5A 3L64A 143LA 5LVKA 3AGGG 1QT6A 1GB3A 2G4QA 3CDVA 1UCOA 3WXUA 5DL9A 1L82A 3F9LA 4PJ2C 2LC9A 1LSNA 185LA 3TXJA 1JHLA 5KXWA 3WPJA 3TXKA 3W6CA 196LA 201LA 1FKVA 175LA 1LMAA 4X3BA 3LYTA 1MLCE 4WM3A 1L52A 5KXOA 4YF2A 215LA 1F6RA 3HH4A 2HEAA 1LZGA 1L68A 4MCKA 1B7RA 2CDSA 1KXXA 3HU8A 4LGKA 165LA 1CKGA 5D5CA 5EBHA 234LA 3HDFA 1DPXA 1GE0A 107LA 1C62A 1LAAA 3OE9A 1IP5A 4DC4A 5LAGA 4NEBA 1C6HA 1L26A 3C7WA 1YAOA 1DQJC 1B7QA 4NGYA 3WPKA 1GBOA 3ZVQB 1QTEA 2Z19A 6LZMA 2B70A 4DQ5A 4XJGA 2XJWA 145LA 1TBYA 174LA 4BAPA 1SX7A 3C82A 3GXRA 3QY4A 253LA 4S0WA 4WM6A 1IVMA 133LA 2MEAA 1L31A 4NGVA 3DN4A 3OJPA 114LA 1IP4A 1J1OY 1P2LA 2HU1A 254LA 1QDTA 3DN8A 1W08A 3NY9A 2F2QA 4DKLA 1L06A 1C6JA 1YILA 3A3RX 1LSGA 2HEEA 3B6LA 3HTDA 1CV6A 1WQPA 1QSBA 1IORA 4WOAA 3P4ZA 1FLWA 3GULA 1L13A 3A94A 4FJRA 2FYCA 2F30A 3AYQA 1HEPA 1BHZA 1G0KA 1GB8A 246LA 2RB1X 1WQOA 1L95A 2DQGY 1L17A 3AZ7A 4EJ4A 1QUGA 218LA 2MEDA 1JKDA 1HEWA 1IP1A 3SB7A 1FLUA 1JSEA 3F8VA 2B7XA 4CFPA 1CKCA 1QSAA 4OWAA 1UIAA 1DXJA 4C3WA 4AGAA 141LA 1L30A 1LZYA 1LSDA 4N1EI 3HWLA 1NQIA 187LA 4J1AA 2HUMA 5LAFA 3LZ2A 3F6ZA 1DYBA 1P3NA 205LA 4W51A 4GRVA 2XBSA 2DQJY 3CT5A 4ARQA 1ZMYL 1HFZA 2HTXA 4XJHA 3IJVA 1EL1A 1T6VL 1GFUA 5LVGA 5F9XA 115LA 1PQDA 1L70A 1VFBC 4I7QA 3CQLA 3LZTA 4B0DA 2LZ2A 1L55A 1GF3A 3CSQA 3CB7A 1C7PA 1IWVA 3OE0A 1LTMA 4NGJA 1L64A 4DWXA 5LINA 5LYMA 4NGKA 1WQQA 1CKFA 1G0LA 1GB6A 1L0KA 2MEGA 1CNSA 2EKSC 1QT3A 1GFRA 2BQNA 4DT3A 1D3FA 1OUDA 2Z39A 4Z3MA 1P64A 251LA 3WYHA 2HUBA 4LFPA 1GF6A 1LPYA 1CKHA 1QS5A 4NHSA 4TSCA 5T3FA 1IWYA 1L09A 3OE6A 4WL7A 4TSBA 4ZIXA 5A3EA 1LSFA 1L40A 2IGCA 1PQIA 4NWHA 3E3DA 2YVBA 1FDLY 1UIGA 1GD6A 4Z46A 1AZFA 4N1CC 3WXTA 4RLNA 2NTHA 1LYIA 2LZTA 2Q9EA 188LA 1LSCA 1L02A 1XEIA 3W6EA 1XJUA 1IOQA 1LZTA 1IP3A 3C8SA 3HT8A 1D3MA 1B5YA 1PS5A 1UA6Y 3WW6A 5HMJA 2Z6BA 4LT1A 4DD2A 3CT1A 4HP0A 2WARA 2BQDA 4EKSA 4AXTA 1L43A 2MEBA 3G3XA 3GUMA 5KJ9A 2NWDX 1RE2A 1LZRA 1FLQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1IIZ A;  5HMV A;  1L41 A;  1CJ6 A;  2GV0 A;  2RAZ X;  1XGR C;  3EMS A;  3AZ5 A;  2W1L A;  2HEF A;  2HUL A;  1LOZ A;  1VED A;  1L08 A;  1HNL A;  1YKZ X;  1DYC A;  1L77 A;  5KY1 A;  1C6K A;  1CJ8 A;  1LJ3 A;  155L A;  5LYZ A;  1L96 A;  1YAM A;  7LZM A;  2BQB A;  2A4T A;  4ETE A;  3J4G A;  3WVY A;  157L A;  1IC5 Y;  3ATO A;  1GAZ A;  1IP2 A;  3SBB C;  4YEO A;  1PQK A;  3A34 A;  4HV2 A;  4LYM A;  4W53 A;  3AW7 A;  1KS3 A;  3EXD A;  4IAP A;  219L A;  1PZY A;  2XTH A;  1XEJ A;  237L A;  181L A;  5IDD A;  1L57 A;  4LYZ A;  209L A;  3AZ4 A;  1L73 A;  3B0K A;  1L86 A;  3L2X A;  1L85 A;  3T36 A;  1OUG A;  1C6Q A;  2BQO A;  123L A;  1WVV A;  2RBS A;  1GBS A;  3IJU A;  4MST A;  1D2Y A;  4NGW A;  1GXV 2;  3C83 A;  5DLA A;  208L A;  1KY0 A;  1BB4 A;  4WO6 A;  3CT0 A;  1BB7 A;  1L81 A;  1XEP A;  1LJK A;  1C08 C;  4DD3 A;  1T6H A;  137L A;  4W57 A;  3D4S A;  1CX6 A;  199L A;  5F14 A;  1HER A;  1L45 A;  249L A;  4YOP A;  1QUD A;  108L A;  1IX0 A;  1HFY A;  2LYZ A;  3J6K A;  5HNC A;  1L50 A;  4II8 A;  2DQI Y; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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