2QARC

Structure of the 2tel crystallization module fused to t4 lysozyme with a helical linker.
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
163
structure length
163
Chain Sequence
GPNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFCQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDCVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase regulator
molecule keywords E80-TELSAM domain
publication title Polymer-driven crystallization.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 41
structure length 163
sequence length 163
chains with identical sequence F
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2007-06-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2qarC00
3L64A 2B75A 1CUQA 1L33A 1L13A 1L14A 3DMZA 3HTGA 161LA 1L21A 1LGXA 3D4SA 237LA 3DN1A 1L15A 206LA 1CU5A 2O7AA 3HDFA 2RBOA 1CV0A 1L34A 2B7XA 1L12A 3G3XA 1DYEA 1L0KA 177LA 1L97A 4ARMB 2RAYX 138LA 217LA 1L86A 1QTZA 3HT6A 172LA 1L38A 1L54A 111LA 3GUKA 1D3NA 1L98A 1L88A 2LCBA 249LA 1K28A 1T6HA 1QUHA 1C6MA 126LA 1OYUA 1C6NA 2B73A 159LA 3HUKA 1L41A 1L22A 3OE0A 2HULA 1G0QA 3C7WA 152LA 157LA 223LA 4I7KA 1C69A 1QT7A 165LA 200LA 2LC9A 1C62A 3FA0A 1OVKA 1C6PA 1L72A 2OEAX 3G3VA 1C67A 3HUQA 222LA 4K5YA 257LA 4ARPA 247LA 169LA 3DKEX 1P64A 3SB6A 4AQNA 162LA 1L02A 2OU9A 2RB0X 4EXMA 1KNIA 3F9LA 1CV1A 164LA 3G3WA 1CU3A 201LA 188LA 1L29A 3K2RA 244LA 2RH1A 1LGWA 4LDOA 1P6YA 4EKRA 1L43A 197LA 1L56A 1L70A 3HTFA 1CU0A 4W54A 3OE9A 1SWZA 1L16A 1P3NA 212LA 1G0MA 1L36A 1T8GA 148LE 1JTNA 3HTDA 252LA 131LA 1LI3A 3GUJA 139LA 178LA 128LA 1L69A 205LA 1L76A 254LA 112LA 3C81A 1C64A 1LYDA 3FI5A 1XEPA 3CDRA 7LZMA 130LA 1CU2A 3RZEA 1C6QA 1G0LA 1L35A 1L25A 185LA 167LA 1JQUA 1L00A 220LA 4ARQB 2B6XA 1LW9A 1C61A 1L07A 144LA 1L10A 1C6GA 3GUMA 4I7MA 3ODUA 1QSBA 1OV5A 4ARLA 1P56A 2B74A 3RUNA 4W52A 160LA 241LA 4I7QA 192LA 1L17A 195LA 2HUKA 113LA 214LA 1P46A 1DYFA 232LA 2HUMA 3FADA 3UONA 225LA 1L24A 1C6BA 2O4WA 198LA 3CDTA 1C6DA 1L83A 1CU6A 259LA 1SX7A 235LA 1OVHA 1L46A 3HTBA 1QTBA 2OTYX 141LA 1L62A 1L67A 122LA 1SSYA 209LA 2Q9DA 1OWZA 1L65A 1TLAA 2ANXA 2IGCA 1QSQA 4EKPA 1L77A 4YXAC 1LYJA 4ARJA 187LA 256LA 1C6FA 253LA 1G0PA 1L89A 1P36A 1ZWNA 3L2XA 233LA 1L40A 1G0JA 1D2YA 102LA 3C8QA 1L47A 213LA 1D3MA 236LA 2Z6BA 2B6YA 146LA 3NY8A 1CV5A 1C6AA 2B72A 137LA 1L45A 1L91A 1L05A 1L44A 190LA 1L20A 2F47A 140LA 3OE6A 4YX7C 3SB5A 1CV6A 1LPYA 3HWLA 166LA 1PQDA 1QS5A 4EJ4A 1L39A 1XJUA 1QTDA 1ZURA 3DMVA 1L11A 218LA 3LZMA 4OO9A 1L59A 2RB1X 103LA 1G0GA 123LA 3DN0A 6LZMA 3CDOA 1C6TA 1L63A 168LA 1LYGA 1T97A 4LDEA 4I7TA 1L0JA 2OE7X 1C65A 3OE8A 4I7RA 1D9WA 1L84A 2NTHA 1C68A 1LYFA 1QTCA 250LA 4S0WA 143LA 125LA 180LA 4IAPA 1L06A 1OV7A 1L01A 2Q9EA 186LA 2RBNA 1L48A 2F2QA 1G0KA 1KY1A 191LA 1L28A 1SSWA 2ANVA 3GUOA 3GUIA 248LA 4DKLA 4ZPUA 109LA 4W51A 170LA 1SX2A 181LA 4W59A 4I7LA 224LA 3GUPA 182LA 2OU0X 2B6WA 1SWYA 3DN2A 1G1VA 1JTMA 4ARMA 2RBRA 1L68A 3HUAA 238LA 1L75A 1L96A 4PK0A 2QARC 255LA 2B6ZA 4YXCA 1D3JA 1PQIA 4LDLA 1CUPA 1DYAA 1L87A 1D2WA 4EKSA 4GRVA 258LA 151LA 2CUUA 108LA 175LA 242LA 1L81A 118LA 227LA 1LGUA 119LA 1QUOA 1QT5A 4EKQA 1I6SA 1KY0A 155LA 1L26A 1L18A 1P2RA 3GULA 1QT3A 1L79A 1C6KA 189LA 163LA 3NY9A 3V2WA 243LA 196LA 1L32A 1XJTA 4I7JA 211LA 3C82A 1CVKA 127LA 1QT8A 4W56A 3DN3A 3SBBC 1C6JA 3C83A 184LA 216LA 4W53A 2RBPA 228LA 142LA 2L78A 147LA 4I7SA 3NYAA 3VW7A 1L50A 174LA 1L51A 3C7YA 4DJHA 145LA 1L57A 1CTWA 2RB2X 2O79A 3EMLA 183LA 3HDEA 1C60A 1L53A 1C66A 1C6EA 1ZYTA 1L82A 1LYEA 1LYHA 2B6TA 1G07A 230LA 3SB7A 3DNAA 234LA 1B6IA 114LA 4W58A 1CV3A 240LA 3HH5A 1NHBA 115LA 1QTVA 3HH3A 173LA 3HT9A 1P5CA 3C8RA 1LWKA 245LA 1L58A 210LA 3HH4A 1DYCA 1L94A 3HT7A 251LA 1L95A 3JR6A 4W55A 229LA 3SN6R 3V2YA 1CV4A 262LA 4PJZA 4ARQA 1QTHA 1CX6A 246LA 3DN8A 2OE4X 2A4TA 1L93A 2OTZX 1L52A 1PQOA 3F8VA 107LA 1DYGA 1L31A 5LZMA 4E97A 1L23A 2OU8A 2RAZX 1OWYA 1L49A 3QAKA 1L92A 3HU9A 1L64A 1C6IA 1C6CA 3DN4A 226LA 129LA 1PQMA 1C6HA 1LI2A 3HU8A 3HT8A 261LA 1LI6A 1L03A 104LA 3DN6A 1L09A 1L80A 1LWGA 1G06A 231LA 2OE9X 3C7ZA 4EPFA 219LA 3PBLA 1D3FA 176LA 1L61A 1L30A 1L60A 2RBSA 4EPIA 1OVJA 1WTHA 2RBQA 2B70A 2LZMA 1QUDA 1L42A 1QUGA 4I7OA 1KS3A 1QT4A 1QS9A 171LA 1L85A 1C63A 4LZMA 1L90A 1QT6A 1L19A 239LA 2NTGA 1G1WA 260LA 3SBAA 1L71A 1L37A 1T8AA 3C80A 149LA 3PDSA 3SB9A 1DYDA 1P7SA 1CX7A 1LYIA 2QB0B 3SB8A 1L55A 1L66A 1KW5A 4W57A 3GUNA 1LLHA 120LA 110LA 2F32A 4I7PA 1DYBA 3CDVA 3CDQA 150LA 5I14A 158LA 1PQJA 1L99A 4I7NA 1KW7A 3DMXA 3HH6A 1L27A 1L73A 4DAJA 1L74A 215LA 1P2LA 156LA 1C6LA 1L04A 1L08A 4GBRB 221LA 3C8SA 1EPYA 1P37A 199LA 1T8FA 1PQKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1VDTA 1CUQA 1GAZA 4Z98A 2H9KA 3CSZA 4ET8A 1GB7A 3HDFA 1REYA 1IP3A 1CV0A 1DYEA 1L97A 4LT1A 2BQFA 1L86A 1BVXA 1QTZA 2ZIKA 3HT6A 5F14A 4WMGA 5KXRA 1IX0A 5C6LA 1KIPC 3HUKA 1L22A 3N9EA 5DM9A 4H93A 1LZ6A 3C7WA 165LA 2LC9A 3OK0A 2Z18A 4WO6A 2Z39A 4OOTA 1OUGA 4N8ZA 1BHZA 3A96A 4ET9A 1VFBC 169LA 3DKEX 1YL0X 1P64A 2OU9A 2ZILA 1GB8A 1J1XY 5KXYA 1CV1A 2BLXA 1CU3A 3WXTA 201LA 1L29A 1L43A 1IIZA 1D0MA 1CU0A 4W54A 2ZWBA 2Z2EA 1OUIA 2DQDY 1NBZC 212LA 1G0MA 1L36A 1LKRA 1H6MA 1T8GA 3HTDA 252LA 2MEEA 4WG7A 139LA 2BQEA 1DI3A 254LA 5B1FA 3C81A 1LYDA 3FI5A 1XEPA 3CDRA 7LZMA 130LA 4TSBA 1OQMA 3SP3A 1GAYA 4KPMA 2BQHA 1LSAA 1UACY 5KY1A 5HNLA 4ARQB 4NGJA 3K3TA 2FBBA 4H9EA 1C61A 1L07A 5KXZA 5T3FA 4G49A 5K7OA 4ARLA 5FEKA 3N9CA 5FHWA 4GCEA 1GDWA 3CT1A 214LA 5KXXA 3FADA 198LA 1QSWA 4LYTA 3WU9A 1CU6A 1OVHA 5LIOA 1L67A 1C46A 1LYYA 2Q9DA 1OUHA 3ATNA 208LA 4YXAC 4EKPA 3J6KA 1IC5Y 1ALCA 2GV0A 233LA 1SQ2L 1L40A 1G0JA 1D2YA 2EQLA 3G3AB 1L47A 5APCA 4ZEEA 1LSEA 1GFRA 2B72A 1L45A 1IP5A 1IOTA 1L05A 1UBZA 1ZVYB 1L44A 3B0IA 1LSMA 4YX7C 4H9BA 3HWLA 5KXOA 1OUFA 1XGRC 1QS5A 5KXTA 1JEFA 1QTDA 3DMVA 1JKCA 218LA 3LZMA 4OO9A 1LZGA 1GXV2 2RB1X 4II8A 1YAOA 1FLYA 1EQEA 1RCMA 4LT2A 1KIRC 2G4QA 6LZMA 1IR8A 1LZDA 1LYGA 5IDDA 1YKYX 1JTOL 1L0JA 2F4GA 3EBAB 4ANRA 1L84A 2NTHA 3D9AC 1GEZA 1BWIA 4NGVA 2BQJA 3WULA 5I4WA 4IAPA 1GXXA 2RBNA 1L48A 3MGWA 3W6CA 4ETEA 5APEA 170LA 182LA 3LZTA 2OU0X 2ZNXY 5AMYA 2B6WA 2HEDA 4ARMA 4XYYA 1XEKA 1WQRA 1L68A 3HUAA 238LA 1NBYC 4PK0A 4NHIA 255LA 1LJHA 2B6ZA 4LDLA 1CUPA 5LAFA 2HTXA 4LYCA 4WM6A 1CKGA 4N1EI 3WVYA 1EQ5A 1DKJA 108LA 4ZIXA 4KXIA 4D9ZA 1QUOA 4UWNA 4EKQA 1IP1A 1KY0A 155LA 1G7HC 4DD2A 3WMKA 4NFVA 163LA 243LA 196LA 4IASA 1XJTA 1F0WA 2EKSC 211LA 4I7JA 5FSTA 4H9IA 3C82A 133LA 1XFPL 3C83A 216LA 1A2YC 1GB3A 2L78A 2ZYCA 1LHIA 3VW7A 3C7YA 4DJHA 1VATA 1CTWA 2O79A 5LYZA 3TXIA 183LA 5A3ZA 1JJ0A 1HMKA 4DDAA 1B7PA 1LSGA 1IP7A 4KT3A 3SB7A 1B6IA 114LA 240LA 3HT9A 1OUCA 3C8RA 1LZ5A 1HELA 3HT7A 3TXHA 4HJZA 4N1CC 3ZEKA 246LA 1LMNA 5B06A 4QGZA 1B7OA 5F81A 1XGUC 107LA 1L31A 2LYZA 2OU8A 1OWYA 1BB5A 3QAKA 1C6IA 4H91A 4EMNA 4J0LA 4HV2A 4C5FA 226LA 1PQMA 2C8OA 1LYZA 1TDYA 3HU8A 3WPKA 4MR1A 2OE9X 3IJUA 3W3EA 1ZMYL 1IC7Y 4DYGA 1YANA 1F6RA 1OUJA 4DQJA 1IOSA 1L30A 1NKHA 4EPIA 4RW1A 4YEOA 2B70A 2LZMA 1QUDA 1QUGA 2PC2A 1LHLA 4NGLA 2MEGA 1BWHA 1UCOA 3OJPA 3F6ZA 4TUNA 5I54A 1XSFA 2G4PA 2YBIA 1P2CC 4G4HA 1B7SA 3PDSA 1LJ3A 4NG8A 3SB9A 1LYIA 1FKVA 1L66A 3TXBA 1KXWA 3AGGG 3GUNA 1LLHA 120LA 2F32A 5L3IA 4HTQA 1MLCE 4OWEA 2A7FA 4NHQA 1L73A 4FDYA 1GBXA 1C6LA 1G7LC 5LINA 1F10A 1P37A 1YAQA 1L13A 4HP0A 2MEDA 1IOQA 4NSGA 1HFXA 1L21A 1LGXA 1LZSA 1W08A 4HSFA 1CU5A 1L34A 3P4ZA 1L0KA 1LZYA 138LA 3KAMA 4J1BA 1PS5A 4GCCA 1A4VA 1L54A 111LA 3GUKA 5LXWA 1LCNA 1L98A 1YQVY 4NSJA 2LCBA 249LA 1AT6A 126LA 1OYUA 1C6NA 1L41A 2W1MA 3OE0A 3N9AA 2HULA 1G0QA 1KXXA 4I7KA 1GPQC 1IR7A 1C62A 1XEIA 1C6PA 4AXTA 2OEAX 3WXUA 4B49A 4H9FA 3B0OA 3HBDA 222LA 257LA 3AGHA 1CNSA 5L3HA 1SLYA 2F30A 2BLYA 1UIHA 4KL7A 3QY4A 4EXMA 1C45A 2DKVA 164LA 4U3XB 188LA 4EKRA 244LA 1LGWA 4LDOA 3WW6A 197LA 1L56A 3AGIA 3A67Y 3OE9A 5KXKA 1SWZA 1LMCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1VDT A;  1CUQ A;  1GAZ A;  4Z98 A;  2H9K A;  3CSZ A;  4ET8 A;  1GB7 A;  3HDF A;  1REY A;  1IP3 A;  1CV0 A;  1DYE A;  1L97 A;  4LT1 A;  2BQF A;  1L86 A;  1BVX A;  1QTZ A;  2ZIK A;  3HT6 A;  5F14 A;  4WMG A;  5KXR A;  1IX0 A;  5C6L A;  1KIP C;  3HUK A;  1L22 A;  3N9E A;  5DM9 A;  4H93 A;  1LZ6 A;  3C7W A;  165L A;  2LC9 A;  3OK0 A;  2Z18 A;  4WO6 A;  2Z39 A;  4OOT A;  1OUG A;  4N8Z A;  1BHZ A;  3A96 A;  4ET9 A;  1VFB C;  169L A;  3DKE X;  1YL0 X;  1P64 A;  2OU9 A;  2ZIL A;  1GB8 A;  1J1X Y;  5KXY A;  1CV1 A;  2BLX A;  1CU3 A;  3WXT A;  201L A;  1L29 A;  1L43 A;  1IIZ A;  1D0M A;  1CU0 A;  4W54 A;  2ZWB A;  2Z2E A;  1OUI A;  2DQD Y;  1NBZ C;  212L A;  1G0M A;  1L36 A;  1LKR A;  1H6M A;  1T8G A;  3HTD A;  252L A;  2MEE A;  4WG7 A;  139L A;  2BQE A;  1DI3 A;  254L A;  5B1F A;  3C81 A;  1LYD A;  3FI5 A;  1XEP A;  3CDR A;  7LZM A;  130L A;  4TSB A;  1OQM A;  3SP3 A;  1GAY A;  4KPM A;  2BQH A;  1LSA A;  1UAC Y;  5KY1 A;  5HNL A;  4ARQ B;  4NGJ A;  3K3T A;  2FBB A;  4H9E A;  1C61 A;  1L07 A;  5KXZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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