2QARC

Structure of the 2tel crystallization module fused to t4 lysozyme with a helical linker.
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
163
structure length
163
Chain Sequence
GPNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFCQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDCVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Polymer-driven crystallization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords E80-TELSAM domain
molecule tags Hydrolase regulator
source organism Escherichia coli
total genus 41
structure length 163
sequence length 163
chains with identical sequence F
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2007-06-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2qarC00
223LA 2B6WA 1KNIA 1SSYA 2RAZX 249LA 172LA 3V2YA 1DYGA 142LA 3G3VA 109LA 165LA 1D9WA 1L20A 1L72A 3NY8A 244LA 3HT9A 1L43A 3HUAA 3L2XA 1C6CA 1C60A 2ANXA 3V2WA 2RBNA 210LA 2IGCA 1OYUA 1P2LA 4I7QA 4OO9A 1G0GA 177LA 181LA 1OVJA 3HT7A 1P56A 125LA 1T97A 103LA 3HUKA 166LA 1L76A 1C6AA 2B73A 3SB9A 4E97A 1CV1A 1L59A 3SB5A 1KW5A 171LA 3DN1A 1L41A 252LA 1LI6A 1L21A 161LA 4EKSA 131LA 3HTBA 254LA 1C67A 5LZMA 1L05A 251LA 137LA 3OE0A 248LA 1QS5A 1G0MA 111LA 3DN8A 1L16A 1NHBA 168LA 1L12A 2B74A 1L06A 1L55A 2A4TA 3C7WA 1L87A 1C68A 1L90A 1LGWA 3G3WA 3HTFA 2RBPA 174LA 4EPFA 1LW9A 1L89A 1G0PA 4LDLA 170LA 4I7SA 1LYHA 183LA 3NY9A 1L39A 3RUNA 222LA 3HTGA 1C6LA 1CUPA 1L33A 2B6YA 3L64A 3FA0A 186LA 1L81A 6LZMA 1TLAA 3JR6A 110LA 157LA 1G1VA 3RZEA 1C66A 236LA 3NYAA 149LA 178LA 1L22A 1L67A 224LA 3HWLA 1SX2A 1L17A 2Z6BA 3PBLA 2RB1X 3CDVA 4IAPA 2O7AA 1C64A 1L15A 1L99A 123LA 1CTWA 1LYEA 1CV3A 3HT6A 1L35A 3DN0A 1L77A 3C8QA 2B6ZA 146LA 4W51A 1C6FA 1C6DA 163LA 1WTHA 243LA 1ZURA 160LA 3G3XA 3K2RA 2RBOA 1L74A 200LA 3HUQA 1DYEA 1DYAA 253LA 4EXMA 169LA 1CU3A 192LA 196LA 151LA 199LA 1L54A 2Q9DA 3OE8A 4S0WA 1L44A 3SB7A 3CDRA 4LDEA 1QT6A 209LA 1L53A 114LA 3UONA 1L95A 4GRVA 2RBQA 4EPIA 4I7JA 1OWZA 1L82A 1DYFA 229LA 2HUKA 1LWKA 1T8GA 3HH4A 3SBAA 1QUGA 3DN4A 1L63A 213LA 4EKRA 1L40A 1L31A 1QT4A 1LYGA 1LI3A 1B6IA 1DYDA 1QUHA 4ARQA 3DMZA 198LA 3GUMA 4I7LA 1QUOA 259LA 1OV7A 1L93A 1L88A 1L26A 4I7OA 3OE6A 1SSWA 1G06A 1C69A 1L10A 2B6TA 1L86A 1OWYA 1G0KA 1ZWNA 3LZMA 1QS9A 1DYBA 214LA 138LA 1QUDA 1P36A 228LA 3SN6R 3C8RA 1P6YA 1L38A 1L79A 3C80A 1C6BA 1D3JA 1D3NA 7LZMA 1L66A 129LA 148LE 261LA 1LYDA 158LA 2OE9X 4ARMB 4ARPA 2B72A 190LA 187LA 156LA 237LA 2L78A 1L62A 4DKLA 1QT5A 1QT8A 1C6MA 1LLHA 1L60A 141LA 245LA 3PDSA 145LA 1L84A 235LA 1PQKA 3GUPA 1QTBA 1CV4A 2HULA 1LGXA 2B7XA 144LA 1PQIA 212LA 4K5YA 185LA 4I7TA 1L49A 1QSBA 3F8VA 1L56A 1L57A 4ZPUA 3C7ZA 220LA 1QTVA 1L27A 2F47A 1T6HA 4ARMA 1L02A 2OU0X 1L51A 2LZMA 1P7SA 240LA 1C6JA 1QTDA 1L34A 167LA 173LA 4I7PA 1L75A 104LA 2OE7X 1L97A 260LA 1D2WA 3GULA 3GUNA 3FI5A 1L83A 1QT3A 3SB8A 122LA 1CU6A 4W52A 159LA 3CDQA 113LA 250LA 1C6EA 258LA 3C83A 140LA 1C6IA 1CX7A 227LA 2B75A 5I14A 4ARLA 1CX6A 1CV6A 2Q9EA 1L24A 1L29A 247LA 182LA 1QT7A 1PQJA 1C61A 2RAYX 175LA 1L42A 1KS3A 4ARJA 1C65A 3SBBC 3HH6A 191LA 3C81A 1C63A 1L11A 257LA 1C6HA 3DNAA 3HU8A 4EKQA 108LA 1SX7A 1G0QA 2QB0B 1D2YA 2RBSA 4YXCA 1G0LA 1P3NA 1LYJA 4EKPA 219LA 3SB6A 128LA 242LA 3HTDA 2B6XA 1L61A 1L19A 1QTHA 3HH5A 3CDOA 3QAKA 205LA 4DJHA 195LA 4I7NA 1OVHA 232LA 1ZYTA 1C6NA 1OV5A 2HUMA 1CVKA 1XJUA 102LA 1L73A 1L80A 1LI2A 3OE9A 218LA 2OTZX 150LA 3HDFA 1L94A 118LA 1PQOA 3C7YA 119LA 115LA 1L25A 1CV5A 1P64A 3D4SA 2CUUA 3GUKA 1KW7A 1L23A 1L71A 1L36A 1L14A 1EPYA 1KY0A 1D3MA 197LA 2ANVA 1L07A 1LWGA 4W56A 1XEPA 1L48A 152LA 1LGUA 1L70A 1CU2A 225LA 1L0KA 1L37A 1L96A 1L18A 3ODUA 1L28A 1KY1A 184LA 1XJTA 4YX7C 3F9LA 127LA 1LPYA 3EMLA 255LA 215LA 1C6KA 201LA 233LA 1C6GA 3DMVA 4LDOA 2O4WA 1P37A 1L0JA 1CV0A 1QTZA 2OE4X 1L03A 1DYCA 1G1WA 2O79A 4YXAC 4W54A 262LA 1P2RA 4I7RA 4GBRB 1L50A 1L92A 4PJZA 1P46A 1C6TA 1CU5A 1CU0A 3DN2A 1OVKA 139LA 2RH1A 2LC9A 1L85A 2RB2X 3DN3A 2OTYX 3C82A 230LA 1T8AA 4W57A 3HT8A 4PK0A 1D3FA 143LA 231LA 2OU8A 3DN6A 1L01A 3GUJA 246LA 2QARC 1L08A 1L98A 4W59A 4AQNA 4W53A 1L32A 1JTMA 147LA 1L30A 1L47A 3GUIA 4W55A 1C6QA 3HU9A 3C8SA 1L65A 1PQMA 211LA 217LA 4W58A 1JQUA 1L52A 226LA 1QSQA 239LA 162LA 164LA 1L58A 234LA 176LA 216LA 3GUOA 1I6SA 107LA 1L00A 1G0JA 2OU9A 1L09A 180LA 2RBRA 1T8FA 189LA 4LZMA 120LA 1CUQA 1L04A 2NTHA 1L68A 2F32A 1SWYA 3CDTA 3DMXA 112LA 1C6PA 4I7MA 2RB0X 1L91A 130LA 1L45A 1SWZA 4ARQB 155LA 1LYIA 2OEAX 1L46A 3HH3A 3DKEX 3FADA 4EJ4A 1L69A 1P5CA 1L13A 1PQDA 188LA 1JTNA 206LA 1K28A 256LA 1C62A 1G07A 3HDEA 238LA 1QTCA 1LYFA 4DAJA 126LA 1L64A 2B70A 3VW7A 221LA 2F2QA 2LCBA 2NTGA 241LA 4I7KA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2EQLA 1HFZA 5B05A 1KNIA 1SSYA 4W94A 1YAMA 2RAZX 1IWYA 5I4XA 1L20A 3NY8A 1IWVA 3LYOA 3HUAA 4BS7A 2BQGA 4NY5A 1XSFA 2RBNA 4WM2A 210LA 1YQVY 4LT2A 4OO9A 181LA 1GEVA 134LA 1P56A 3HT7A 1GB3A 1GF4A 103LA 3HUKA 5LYMA 4E97A 3SB5A 1KW5A 171LA 1GFHA 1GB2A 3DN1A 1L41A 1IOSA 1L05A 248LA 5J7CA 4M4OA 1B9OA 4N0JA 1IP1A 1WTMA 1NBYC 2B74A 2XBSA 3RW8A 1LGWA 3HTFA 1J1OY 174LA 3AW6A 1J1XY 4EPFA 1L89A 1G0PA 1I20A 5LAFA 1XFPL 3TXDA 1LSEA 1GFVA 3WYHA 3HTGA 5F9UA 4WMGA 3FA0A 2G4NA 1WVVA 1L81A 1XEJA 1G1VA 157LA 2W1LA 236LA 3NYAA 1LMAA 178LA 1LMOA 224LA 1LSAA 2ZNXY 1ALCA 1HNLA 2RB1X 3CDVA 1JEFA 4CJ2A 1C64A 1HHLA 3HT6A 5KXMA 1GEZA 1L77A 2F4AA 2B6ZA 146LA 1GBSA 4NGJA 1WTHA 4HV2A 2BQNA 3G3XA 2RBOA 200LA 5EBHA 3HUQA 1QTEA 1DYEA 4YEOA 4EXMA 1YAPA 4NSIA 1LZYA 169LA 1CU3A 1REMA 1LHKA 1H6MA 151LA 1WQQA 2Q9DA 4E3UA 3OE8A 5KXOA 1VATA 3AGIA 1LHIA 4LDEA 3P64A 4GCDA 1CJ9A 3AZ6A 1OWZA 1CJ6A 1F10A 1L82A 1DYFA 3E3DA 1T8GA 3WPJA 1HC0A 1L63A 4EKRA 1L40A 1QT4A 1LYGA 1LI3A 1QUHA 4GN4A 4ARQA 3DMZA 1OV7A 4II8A 1IWXA 3WU8A 5II3A 1BQLY 3B0IA 1SSWA 7LYZA 4WLXA 2F2NA 3AB6A 1OP9B 3LZMA 5T3FA 1QS9A 138LA 1UCOA 2HECA 4GLVA 228LA 3A92A 3WW6A 2ZWBA 1JTPL 1D3NA 4KL7A 1L66A 148LE 261LA 4H9IA 158LA 2BPUA 4YOPA 5F81A 187LA 2XTHA 1YKZX 1QT5A 3A6BY 1QT8A 1L60A 2Z19A 1YAOA 1LYOA 2DQJY 1PQKA 1LZGA 2HULA 5LVIA 1LGXA 3P66A 1XEKA 4NGKA 1YANA 1UBZA 3F8VA 3AZ5A 5FEKA 1L57A 1REYA 220LA 1GFKA 5I5QA 1LAAA 1L02A 3QE8A 2OU0X 1P7SA 5HQ1A 3CSQA 4HJVA 5KY1A 5DLAA 260LA 5IHGA 5KXKA 1HMKA 2PC2A 1C6EA 227LA 1C6IA 2B75A 4ARLA 4IATA 4PHIA 1NF5A 1GBWA 2DKVA 1QT7A 1LSCA 5KXRA 2BQLA 1KS3A 1C65A 4YENA 4NG1A 3WULA 1F6RA 1LJ4A 1D6PA 3MGWA 1C7PA 1LJ3A 1SX7A 1G0QA 2QB0B 1V7SA 5C6LA 1GXV2 2B6XA 2Z2EA 1L61A 3B72A 2MEAA 4NSHA 205LA 4DJHA 1LMNA 5APCA 5LVHA 1GBOA 4H94A 4NGZA 1IP3A 2HUMA 1CVKA 4CFOA 2XQOA 1DKJA 4B4JA 5HNLA 2OTZX 1LYSA 2FBDA 3D9AC 119LA 1UIBA 2LZTA 1JKAA 1KW7A 1L23A 3W6AA 2VB1A 5IELA 1D3MA 3QY4A 3P4ZA 4W56A 1L48A 152LA 1CU2A 1L37A 1GF7A 1LPYA 2H5ZA 4Z41A 1SLYA 1C6KA 1MELL 4LDOA 1C10A 1P37A 2EKSC 4HP0A 1OUCA 1QTZA 2HEFA 1B7LA 262LA 3AJNA 1P2RA 4I7RA 4GBRB 4NHTA 1GE1A 5LA8A 4PJZA 4RLMA 1HENA 1KIQC 4NWHA 139LA 2LC9A 2RB2X 2W1XA 4B4IA 1CJ8A 2OTYX 230LA 1OUJA 4WM1A 4G4BA 2HEBA 143LA 5LAGA 4LFXA 4DDCA 1YROA 1IWTA 1VFBC 4AQNA 1L32A 1EQ4A 3TXHA 3C8SA 1PQMA 211LA 1G7LC 3TXEA 2BQBA 5KXSA 1G7JC 1JQUA 239LA 162LA 234LA 176LA 3GUOA 2Z2FA 1NWGA 180LA 1B5VA 1GF6A 1LZTA 1LZEA 4ETEA 1L68A 2F32A 4KT3A 1LMTA 1TDYA 1UUZC 1QSWA 3A96A 5APEA 2BQDA 3WPKA 4ARQB 4H9HA 1LYIA 3FADA 1P5CA 1L13A 1H87A 206LA 1JTNA 1GDWA 1RFPA 1G07A 3HDEA 1BHZA 1C08C 1LZ4A 1B7MA 4DAJA 3HFMY 2DQIY 207LA 4DYGA 1L64A 2B70A 2NTGA 2F2QA 2LCBA 4I7KA 223LA 3W6FA 2XJWA 4EOFA 5F9XA 172LA 3V2YA 1DYGA 3G3VA 1IWUA 3A93A 244LA 1GB9A 3HT9A 1L43A 3L2XA 1GAYA 2B5ZA 2ZIJA 1DZBX 3V2WA 1IO5A 1OYUA 1FLWA 2X0AA 1OVJA 1UACY 177LA 1B5XA 125LA 2CWIA 1B5YA 166LA 5FSTA 1CKCA 2DQFC 5I54A 4Z3MA 1LI6A 161LA 2MEDA 3HTBA 4EKSA 1GF8A 4NFVA 1C67A 137LA 3OE0A 4M6DA 3W6CA 1G0MA 111LA 3DN8A 1L16A 2ZYCA 1AT6A 168LA 1L06A 2A4TA 1GF0A 1BB4A 1LW9A 1OUFA 4LDLA 4WM3A 1LYHA 1L39A 4DQ5A 1CUPA 1HEMA 1JSEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2EQL A;  1HFZ A;  5B05 A;  1KNI A;  1SSY A;  4W94 A;  1YAM A;  2RAZ X;  1IWY A;  5I4X A;  1L20 A;  3NY8 A;  1IWV A;  3LYO A;  3HUA A;  4BS7 A;  2BQG A;  4NY5 A;  1XSF A;  2RBN A;  4WM2 A;  210L A;  1YQV Y;  4LT2 A;  4OO9 A;  181L A;  1GEV A;  134L A;  1P56 A;  3HT7 A;  1GB3 A;  1GF4 A;  103L A;  3HUK A;  5LYM A;  4E97 A;  3SB5 A;  1KW5 A;  171L A;  1GFH A;  1GB2 A;  3DN1 A;  1L41 A;  1IOS A;  1L05 A;  248L A;  5J7C A;  4M4O A;  1B9O A;  4N0J A;  1IP1 A;  1WTM A;  1NBY C;  2B74 A;  2XBS A;  3RW8 A;  1LGW A;  3HTF A;  1J1O Y;  174L A;  3AW6 A;  1J1X Y;  4EPF A;  1L89 A;  1G0P A;  1I20 A;  5LAF A;  1XFP L;  3TXD A;  1LSE A;  1GFV A;  3WYH A;  3HTG A;  5F9U A;  4WMG A;  3FA0 A;  2G4N A;  1WVV A;  1L81 A;  1XEJ A;  1G1V A;  157L A;  2W1L A;  236L A;  3NYA A;  1LMA A;  178L A;  1LMO A;  224L A;  1LSA A;  2ZNX Y;  1ALC A;  1HNL A;  2RB1 X;  3CDV A;  1JEF A;  4CJ2 A;  1C64 A;  1HHL A;  3HT6 A;  5KXM A;  1GEZ A;  1L77 A;  2F4A A;  2B6Z A;  146L A;  1GBS A;  4NGJ A;  1WTH A;  4HV2 A;  2BQN A;  3G3X A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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