156LA

Control of enzyme activity by an engineered disulfide bond
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFANSLAMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Alanine scanning mutagenesis of the alpha-helix 115-123 of phage T4 lysozyme: effects on structure, stability and the binding of solvent.
pubmed doi rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 59
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1994-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 156lA00
197LA 1G0JA 187LA 219LA 1CV6A 1L35A 1LW9A 1C6HA 1L73A 2Q9EA 3C83A 1L88A 4ARQA 2Q9DA 3K2RA 3HT8A 1NHBA 2L78A 1QT8A 1OV5A 4I7QA 1L69A 2NTHA 4PJZA 1OVHA 3DMZA 4I7RA 1ZURA 2RB2X 145LA 1C63A 4GBRB 1LYJA 3DN4A 4LDEA 1SSYA 199LA 1QSBA 1CV0A 1L86A 235LA 4I7TA 1L33A 4DJHA 1D3MA 1C60A 1DYDA 1T8AA 166LA 3V2YA 123LA 1L62A 3HT9A 220LA 1L94A 184LA 3SB6A 111LA 1T8FA 3LZMA 3QAKA 2B73A 1XJUA 1L96A 2O4WA 1DYCA 3HWLA 2RBPA 1L34A 1L91A 3HDEA 253LA 258LA 178LA 125LA 1L99A 1JTNA 1L51A 2B75A 1CX6A 4I7KA 261LA 1L29A 2NTGA 2OTZX 1PQIA 3SB7A 1C6EA 1KS3A 256LA 2QARC 247LA 1PQOA 1L77A 3FA0A 1QTCA 3V2WA 3RZEA 180LA 260LA 2LZMA 1QUOA 1L93A 227LA 1L01A 2OEAX 1QT3A 3C7YA 108LA 3CDQA 1CX7A 4ZPUA 241LA 2B74A 4W55A 1C65A 246LA 1C62A 1C6JA 151LA 1L32A 1L26A 4ARMA 2ANXA 3FI5A 3PDSA 3GUMA 2RH1A 1LWGA 1I6SA 4GRVA 1L47A 3DN2A 3CDOA 2B70A 4EKSA 1C67A 1C6MA 1DYEA 1L02A 168LA 4W54A 144LA 2OU0X 1L59A 1L72A 1LYHA 1PQDA 2IGCA 139LA 3C8SA 1SX7A 107LA 1JTMA 4EPIA 1L63A 259LA 1SWYA 4LDLA 2OE7X 1QUHA 231LA 1L0JA 1KW7A 1L76A 3F9LA 1D3NA 1L58A 113LA 1L41A 1LWKA 3DNAA 3CDVA 3HU9A 215LA 3DN1A 201LA 226LA 162LA 1L95A 1D3JA 237LA 1L83A 1CV4A 170LA 1C6CA 1QT6A 3OE6A 142LA 248LA 163LA 3SBAA 3OE0A 4EKPA 4EKRA 1C6BA 224LA 1L31A 1QUGA 118LA 1C6NA 1P7SA 2HULA 1LLHA 1SSWA 1L48A 214LA 2HUKA 3PBLA 1L37A 152LA 5I14A 1QT4A 1L39A 4I7OA 1OYUA 1L23A 3OE9A 3DN6A 3DMVA 3HT6A 1L52A 1G0MA 242LA 1CU6A 156LA 3C8QA 4E97A 3GUOA 1T8GA 1T6HA 1CUQA 1DYBA 243LA 198LA 143LA 1P64A 4PK0A 1CV5A 3G3WA 3C8RA 1LGUA 4W59A 1QUDA 104LA 3CDTA 1DYAA 1L85A 1CUPA 1L14A 1P3NA 1OVKA 1OWYA 3HH5A 1SWZA 4DKLA 1DYFA 228LA 1QS5A 222LA 1CV3A 1L79A 238LA 1LGWA 1K28A 2A4TA 1L25A 160LA 110LA 1L98A 2O79A 174LA 1L30A 1C6LA 129LA 1CU2A 2F2QA 3C82A 233LA 140LA 122LA 3L64A 138LA 1L19A 1PQMA 3HTFA 4ARPA 7LZMA 4YX7C 239LA 244LA 1L17A 1L49A 141LA 1L16A 1LYEA 2RBOA 1C66A 2OE9X 3GULA 3NY9A 3EMLA 255LA 5LZMA 252LA 146LA 230LA 191LA 4ARJA 3HH6A 2OU9A 3ODUA 3GUPA 251LA 2OTYX 137LA 245LA 206LA 1L57A 218LA 172LA 1L50A 1QSQA 176LA 1P6YA 1D2YA 3HH4A 1C64A 249LA 1C69A 2RB1X 1L89A 1L80A 3OE8A 2Z6BA 3SB8A 221LA 131LA 158LA 196LA 1C6IA 217LA 1XEPA 1G0QA 4EXMA 3GUJA 3RUNA 250LA 3FADA 2RBSA 1L22A 2LC9A 4I7SA 4OO9A 1LYFA 171LA 128LA 1G1WA 1G06A 186LA 1G0KA 225LA 2ANVA 1EPYA 185LA 3C7WA 234LA 181LA 1PQKA 3DKEX 175LA 4YXAC 1L13A 3SN6R 3NYAA 1L92A 1L20A 1C61A 3HUKA 1L65A 4W52A 4S0WA 1QTVA 3C80A 2B7XA 3F8VA 209LA 2B6ZA 1L28A 2B72A 1P56A 211LA 4I7MA 102LA 2B6TA 1C6FA 1G07A 4W56A 1OVJA 1C6QA 1QT7A 1C6AA 1QTZA 109LA 148LE 200LA 3GUKA 1L10A 2QB0B 3DN0A 1G1VA 3SB9A 2B6XA 2RB0X 119LA 1L75A 1L81A 1PQJA 1TLAA 1C6GA 177LA 1OWZA 1CVKA 1L11A 1L54A 3HTDA 2B6YA 3SBBC 1LI6A 1L18A 2OU8A 103LA 1LI3A 1P5CA 2RBRA 1CU5A 4ARQB 1C6KA 130LA 1L44A 1WTHA 4YXCA 1L40A 1D3FA 4I7LA 3C7ZA 169LA 3HTBA 212LA 4EJ4A 6LZMA 195LA 2RAZX 3UONA 3NY8A 157LA 2RBQA 3HDFA 1LYGA 1L64A 1L0KA 3HH3A 1LPYA 1L00A 4W51A 189LA 1L27A 1KW5A 3C81A 2RBNA 1L55A 2F32A 1L67A 1D2WA 4I7NA 1ZYTA 1C68A 4EPFA 147LA 4W53A 3DMXA 3D4SA 1L61A 4I7JA 2OE4X 150LA 1L53A 127LA 1L21A 120LA 112LA 1L15A 1KNIA 182LA 1XJTA 192LA 155LA 4IAPA 4ARLA 3HUQA 4W58A 164LA 1L56A 3HT7A 1P37A 223LA 4AQNA 1L43A 1G0LA 1CU3A 1LI2A 1L36A 1CU0A 254LA 1QTBA 1P2LA 1L38A 216LA 1JQUA 1P36A 1C6DA 4ARMB 3DN3A 1L97A 2HUMA 3GUIA 3HUAA 1LYIA 1L24A 1C6PA 126LA 1L45A 1L74A 183LA 1G0GA 1L68A 165LA 1C6TA 115LA 1QTDA 3HTGA 1KY0A 213LA 4W57A 1L71A 1L12A 210LA 2O7AA 1G0PA 190LA 4LDOA 1B6IA 4K5YA 4LZMA 3GUNA 232LA 3CDRA 2F47A 1OV7A 1L09A 1T97A 1QTHA 2B6WA 3SB5A 3DN8A 1L05A 1P2RA 1L87A 1SX2A 4I7PA 159LA 4EKQA 1L07A 1L60A 1L46A 229LA 2LCBA 1L42A 1QS9A 1KY1A 1L66A 1ZWNA 1CV1A 2RAYX 149LA 3HU8A 161LA 188LA 2CUUA 1L84A 1P46A 114LA 1L03A 205LA 3G3XA 1QT5A 1L82A 1L90A 1D9WA 1DYGA 1LYDA 3G3VA 3JR6A 1CTWA 173LA 167LA 1L70A 262LA 236LA 240LA 3L2XA 4DAJA 1L04A 1L08A 1L06A 3VW7A 1LGXA 257LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
197LA 1G0JA 219LA 4KXIA 1CV6A 2CGIA 1LZDA 1LZEA 2Q9DA 3HFMY 1LHHA 1QT8A 1YKXX 3FI7A 1IP1A 1OV5A 2YBJA 1WQQA 1LSMA 1OVHA 5LAFA 2GV0A 1ZURA 1QSBA 1NHEA 1CV0A 4GN4A 3EXDA 4I7TA 3GXRA 4TTDA 1T8AA 1C60A 3V2YA 166LA 2LZTA 134LA 2G4PA 1L94A 2BQDA 1UCOA 2XBSA 5KKIA 111LA 1NKHA 3LZMA 3QAKA 2B73A 1L96A 1JPOA 1BB6A 2RBPA 5KXYA 1L91A 1FLUA 4WLYA 1LJJA 2Z2FA 2HUBA 1L51A 4I7KA 1DKJA 2NTGA 5LAGA 4YOPA 256LA 4D9ZA 1YROA 3RZEA 3VWOA 180LA 1XGRC 2XJWA 1QUOA 3E3DA 1L01A 3C7YA 4XYYA 4DQJA 1GF0A 1B5UA 1IP7A 1C62A 2EKSC 1IR7A 4J0LA 1L32A 4E3UA 1L26A 1YIKA 1LYYA 1CKGA 4GRVA 1JKCA 1L47A 1F0WA 3ULRA 4B49A 4HJZA 1FN5A 4WM4A 1L02A 4B0DA 1WTMA 3WMKA 1L59A 1L72A 1LYHA 2XTHA 5II3A 3M3UA 4WL6A 1HEOA 1L76A 3F9LA 113LA 1QDTA 5B05A 5KXNA 1LWKA 3DNAA 2Z2EA 5A3EA 1GBYA 162LA 2C8OA 1L83A 1CV4A 1GE4A 4RDSA 1LZ8A 3OE6A 5HNCA 1GPQC 3AW7A 3OJPA 3IWRA 5DN5A 224LA 1T3PA 4OWCA 1QUGA 118LA 4OWAA 1DPXA 1C6NA 1GFGA 2HULA 1GE2A 1LLHA 1I56A 4NHQA 1GB3A 2RSCA 4NHSA 3WPJA 1IOCA 1OYUA 1L23A 3HT6A 4WL7A 1L52A 242LA 1RCMA 4HTNA 156LA 1T8GA 1DYBA 1REXA 1B0DA 2ZIJA 143LA 4BADA 1CV5A 4AXTA 1UIGA 1LGUA 1LZRA 1QUDA 3CDTA 2DQGY 4A7DA 3B0IA 1SWZA 4DKLA 2EIZC 1LZ4A 3EO5A 5B06A 1YQVY 1LGWA 1IEEA 2DQEY 3RZ4A 4IASA 2LYMA 1CNSA 5LXWA 110LA 1L98A 3WUMA 4GLAA 5LYTA 5JENB 1C6LA 2BQCA 5C6JA 4TSBA 122LA 4NG8A 3L64A 138LA 1FLYA 1A2YC 3HTFA 4C3WA 3QE8A 3LYTA 1L17A 2C8PA 1L49A 3EMLA 2BQLA 2I26L 4HJVA 252LA 1UUZC 3BKVA 1UACY 251LA 206LA 5B59A 1CKHA 1LJKA 4NG1A 1T6VL 1L50A 5LINA 1OUIA 3HH4A 3TMXA 1QUTA 249LA 2W1MA 3SB8A 1NWGA 131LA 2MEHA 4G49A 1G0QA 1ALCA 4OO9A 133LA 171LA 4DC4A 128LA 1G7LC 1GEZA 1PS5A 4WG7A 1EPYA 5DM9A 3C7WA 234LA 5FEKA 181LA 4M4OA 3LYOA 175LA 5APFA 4ETAA 8LYZA 3SN6R 3NYAA 1UIFA 4R6CA 4W52A 1UIDA 1HEPA 5HMVA 209LA 4I7MA 1BB4A 1LJGA 5B07A 1G7JC 2B6TA 1CJ7A 4ET9A 2DQFC 2MEBA 5KXTA 4ZIXA 5HQ1A 4WOAA 5HNLA 1C6QA 1C6AA 1NMMA 1UIHA 4WM2A 5LA5A 2RB0X 119LA 1L81A 1IP5A 2HEBA 2WARA 2N5ZA 2D4JA 3WULA 3WUAA 1L18A 3WU9A 1LI3A 3AYQA 1P5CA 5IDDA 1CU5A 4ARQB 1C6KA 130LA 1GFVA 3LN2A 1D3FA 3HTBA 6LZMA 212LA 4EJ4A 195LA 1WQRA 2RAZX 1QIOA 157LA 2RBQA 3HDFA 4N0JA 1JJ1A 1LSZA 1L64A 3QNGA 3D9AC 1KW5A 3C81A 2RBNA 1IP2A 1L67A 147LA 4W53A 4ML7A 3LZ2A 4XJHA 3A94A 1WQNA 150LA 4W94A 1GF8A 2BQFA 4WM1A 3KAMA 1KXXA 1GFAA 1L15A 1XJTA 192LA 3ATOA 1BB3A 1IY3A 2NWDX 4IAPA 3HUQA 5LIOA 1LZ1A 1L56A 5I53A 1TAYA 1TEWA 223LA 1LMAA 3WXUA 1CU3A 1LI2A 1L36A 1LSBA 1CU0A 1P2LA 4GCBA 1SLYA 1N4FA 1P36A 1C6DA 4LFPA 1LYZA 4ARMB 2HUMA 3HUAA 3TXIA 1GB6A 2Z38A 4OW1A 1G0GA 4DDAA 1ZMYL 2G4QA 115LA 2O7AA 4LT1A 1B6IA 1BGIA 1YAPA 4LZMA 1JTTL 3GUNA 2F47A 1GF9A 1OV7A 1JJ0A 4EMNA 3DN8A 1QSAA 1P2RA 4ET8A 1JUGA 159LA 1W6ZA 1L60A 1LYOA 2LYOA 1L66A 3AJNA 1CV1A 4H9AA 161LA 5LVKA 1EQEA 1P46A 3A95A 1IIZA 1OUAA 1DYGA 3AW6A 3JR6A 1CTWA 1FKQA 167LA 1L70A 1LOZA 4M6DA 2YDGA 1D0LA 1JKBA 4NY5A 1L08A 5C6LA 1LGXA 3CSZA 7LYZA 1GB0A 4CGEA 5F9XA 3C83A 4PGJB 1D6PA 3K2RA 1VFBC 1NHBA 2L78A 2ZIKA 3J4GA 3P64A 4I7QA 2NTHA 1LHLA 1OQMA 1QQYA 3GXKA 9LYZA 145LA 1C63A 1LYJA 3DN4A 4LDEA 1SSYA 5APDA 1PZYA 4HPEA 235LA 1LZTA 2YBNA 3HT9A 220LA 2IHLA 4G9SA 3SB6A 1LSPA 5HMJA 1T8FA 1XJUA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 197L A;  1G0J A;  219L A;  4KXI A;  1CV6 A;  2CGI A;  1LZD A;  1LZE A;  2Q9D A;  3HFM Y;  1LHH A;  1QT8 A;  1YKX X;  3FI7 A;  1IP1 A;  1OV5 A;  2YBJ A;  1WQQ A;  1LSM A;  1OVH A;  5LAF A;  2GV0 A;  1ZUR A;  1QSB A;  1NHE A;  1CV0 A;  4GN4 A;  3EXD A;  4I7T A;  3GXR A;  4TTD A;  1T8A A;  1C60 A;  3V2Y A;  166L A;  2LZT A;  134L A;  2G4P A;  1L94 A;  2BQD A;  1UCO A;  2XBS A;  5KKI A;  111L A;  1NKH A;  3LZM A;  3QAK A;  2B73 A;  1L96 A;  1JPO A;  1BB6 A;  2RBP A;  5KXY A;  1L91 A;  1FLU A;  4WLY A;  1LJJ A;  2Z2F A;  2HUB A;  1L51 A;  4I7K A;  1DKJ A;  2NTG A;  5LAG A;  4YOP A;  256L A;  4D9Z A;  1YRO A;  3RZE A;  3VWO A;  180L A;  1XGR C;  2XJW A;  1QUO A;  3E3D A;  1L01 A;  3C7Y A;  4XYY A;  4DQJ A;  1GF0 A;  1B5U A;  1IP7 A;  1C62 A;  2EKS C;  1IR7 A;  4J0L A;  1L32 A;  4E3U A;  1L26 A;  1YIK A;  1LYY A;  1CKG A;  4GRV A;  1JKC A;  1L47 A;  1F0W A;  3ULR A;  4B49 A;  4HJZ A;  1FN5 A;  4WM4 A;  1L02 A;  4B0D A;  1WTM A;  3WMK A;  1L59 A;  1L72 A;  1LYH A;  2XTH A;  5II3 A;  3M3U A;  4WL6 A; 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