4TSCA

Structure of a lysozyme antibody complex
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Immune system/hydrolase
source organism Homo sapiens
publication title Structure of a lysozyme antibody complex
rcsb
molecule keywords Lysozyme C
total genus 50
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2014-06-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4tscA00
1GB9A 2CGIA 1D9UA 1GF6A 1B5WA 1J1XY 3WVYA 1WQOA 4H9HA 3HBDA 1V7TA 1LHLA 4NWHA 4RDSA 1ALCA 5LA8A 4YEOA 2MEHA 4BS7A 2WARA 3WXTA 1JEFA 1LJIA 1JTPL 1GFKA 3HBHA 1WTMA 5D5FA 5LVJA 1AZFA 1LJJA 3N9CA 4G49A 4WM4A 3RZ4A 1HENA 4WM2A 1IP1A 4GCDA 4HV2A 1OQMA 3WPKA 4DDAA 1V7SA 5E4PA 4XENA 4DYGA 1MELL 4H94A 1GFAA 1RE2A 1QTKA 2XBRA 1JIYA 1HSXA 1LZGA 1REMA 1IWWA 1LSBA 1LSPA 1OUGA 2HEDA 3AB6A 3WU9A 4Z3MA 5B05A 2G4PA 2D4KA 1QQYA 4WG7A 5I4XA 1B2KA 5KY1A 4HJYA 1WQMA 1IORA 3WMKA 2B5ZA 5APCA 1A4VA 3AJNA 4NSHA 4WLDA 2DQGY 9LYZA 4NSGA 1VDTA 4LYZA 1NDGC 135LA 1GE1A 1LMPA 1EQ5A 1BWIA 4PRQA 2BQLA 5K7OA 1GB3A 4IJ4A 1GB0A 1P2CC 4NSJA 4GN4A 5LINA 1IWYA 1LJ4A 1VDPA 2YBMA 2ZIJA 1DXJA 1LSGA 5HLLA 1FKQA 1B5ZA 4R0FA 1QUTA 5APFA 4GCFA 2HECA 3A90A 1FLUA 1SLYA 3RU5A 1GF4A 4DD0A 2I26L 5KXNA 1B7QA 1NQIA 1W6ZA 1IR7A 3MGWA 4AXTA 1HSWA 5HNCA 4I0CA 2LHMA 3CT5A 1GBOA 3A6BY 1OUJA 1LZAA 1OUBA 4DC4A 3RNXA 2F2NA 4LYMA 4J7VA 4RLMA 1LZ6A 2EIZC 2HEAA 2RSCA 3P4ZA 1HFXA 1IY3A 3IWRA 4H91A 1DI5A 1GXV2 4H9CA 1LMTA 1XGRC 4O34A 5IHGA 3VWOA 2EQLA 4B4JA 4WMGA 1DI4A 2LYMA 3CT1A 4HTKA 4NWEA 3ZVQA 2MEEA 4PPOA 1IC7Y 5AMYA 2EPEA 4XJHA 2MEAA 3RT5X 4H9AA 1UIFA 4DD2A 1JSEA 1VDQA 1BB4A 3D3DA 1LZ5A 1BVXA 4HTNA 1CJ6A 1GF5A 1DI3A 2ZYCA 3AZ4A 4LT0A 1ZV5L 5FSTA 3TMXA 1YKZX 3WW5A 1B7SA 5LYZA 1KXWA 2YBJA 4LYBA 2C8PA 1LYSA 1G7HC 3M3UA 6LYZA 5B1GA 134LA 1GB6A 5LA5A 5M1YA 3AW7A 1IO5A 3AGGG 1NBYC 1GF0A 3B0OA 4N0JA 4WO9A 2A7FA 5KKIA 1QDTA 1C45A 4GCEA 2FBDA 2ZQ4A 4DD7A 4H90A 1CKFA 5I5QA 1B5UA 1HHLA 1BWHA 2HEFA 1LZ9A 3W3EA 4H8XA 4HPIA 1JKAA 4GN5C 5E9RA 1IY4A 5KXZA 1IVMA 1LMAA 3CT0A 4OOTA 1IP3A 1LZBA 1F6RA 2DQIY 2HU3A 2PC2A 2Z38A 4NHPA 1G7JC 3TXJA 5C6JA 1IIZA 1DZBX 5B1FA 5FHWA 1LJFA 4ANRA 4XN6A 1F6SA 4Z46A 1C10A 1LZNA 1LOZA 3WH1A 4KL7A 1E8LA 3LYTA 5B06A 5HQ1A 3WPJA 3QNGA 1LZSA 1NBZC 1IR9A 1TEWA 1XGQC 1LCNA 1XEKA 5EBHA 4NY5A 4WG1A 4PJ2C 1T3PA 1YILA 4GLAA 4C3WA 4B0DA 5LYTA 4OWCA 3WVXA 4LT3A 3WUAA 5ILFA 5J7CA 4XJGA 1HEOA 1NWGA 1LZYA 2GV0A 4ET9A 1HEPA 5A3ZA 1IWZA 1C43A 1LZDA 2YBNA 4ETDA 4TTDA 1B0DA 4N5RA 1WQRA 4HSFA 1CJ7A 4E3UA 1LZTA 1AT5A 3CSZA 1UIAA 1PZYA 1XGPC 4LFXA 1TAYA 3AGIA 1WVUA 3LYZA 3P66A 4MCKA 2IHLA 1LMQA 5DN5A 5FEKA 5LYMA 5LIOA 5KXKA 3A93A 1QSAA 2H5ZA 4DWXA 4WM5A 1A2YC 1HERA 1JJ0A 4G4CA 1QDRA 1IC4Y 1SQ2L 1RJCB 1WTNA 5KJ9A 4TSBA 1B9OA 1IOCA 3EO5A 4WM3A 4OW1A 4QDNA 3P65A 1UC0A 4UWNA 4ETCA 5B59A 207LA 1LJNA 154LA 3FI7A 3BKHA 1BQLY 194LA 2MECA 1JPOA 4NGLA 1B7MA 1JWRA 4I8SA 1KIRC 1IOTA 1ZMYL 2XBSA 1CJ8A 3J6KA 3RW8A 1GB2A 2Z19A 4RLNA 3A3RX 4KT3A 1JJ3A 1OUAA 4DDCA 5HMJA 5KKJA 3ZEKA 2ZILA 1MLCE 5LVGA 1GFHA 4NHQA 1UUZC 2ZIKA 1OUDA 1B7OA 1PS5A 2BQJA 4B4EA 1B7PA 3F6ZA 1O23A 4LT2A 1YANA 1GEZA 1LMCA 4G4BA 3B0KA 5DM9A 4BAFA 1D6QA 1AKIA 1WQPA 5LXWA 1IWTA 1LZ1A 2FYDA 2IFFY 1B7RA 4WLXA 4NGJA 4QGZA 1C7PA 1LHKA 2YBHA 1B7LA 2F4AA 2D6BA 1YL1X 3B0IA 1FDLY 1LYYA 1Z55A 2H9JA 2Y8PA 2ZWBA 4L41A 2A7DA 3EBAB 1IP5A 3GXKA 1YL0X 1DPXA 1YKXX 2D4IA 3LZTA 5APEA 1UBZA 4NFVA 4WL7A 4NGIA 1LJGA 4NG1A 1GPQC 1HEMA 1GFUA 4NIJA 1G7LC 5I54A 5APDA 3W6AA 1GF8A 1LZ8A 1LPIA 3W6CA 4QY9A 5I4YA 2DQEY 3TXEA 4CHXA 2D4JA 4ZEEA 1VDSA 3W6BA 1LHMA 4WLTA 2N5ZA 4H9BA 4UWUA 4CFPA 1YQVY 3QY4A 1BB3A 1OUCA 2BQEA 3A34A 5KXMA 1OUEA 4ETAA 1LMNA 2HEBA 1HFZA 1LAAA 2H9KA 3EXDA 3FE0A 4CGEA 5C6LA 2BQGA 1XGTC 2BQAA 1JKCA 1D6PA 1GE3A 4XYYA 4NEBA 3CSRA 1GBWA 1FKVA 1REXA 3TXHA 1UCOA 1NDMC 4YM8A 4DD1A 2ZYPA 133LA 1OP9B 4YF2A 1GWDA 2YVBA 3T36A 3ULRA 5F14A 1BHZA 3LZ2A 5T3FA 4NHTA 2XJWA 4HJVA 4TWSA 1C46A 1FLYA 3A94A 5DN4A 2BQKA 3W6DA 4ETEA 2MEIA 2W1LA 5DLAA 1LJHA 1GAZA 2Z2EA 3LHMA 1G7IC 5KXXA 2BAAA 1J1PY 1LJKA 4N9RA 4ET8A 5HMVA 1B5YA 4GCBA 1RI8B 2Z12A 1FN5A 1YKYX 1GFRA 1LSAA 1CKHA 1H87A 2Q0MX 1KXYA 2W1XA 2Z2FA 4GCCA 4H9IA 4IASA 4YEMA 1YROA 1LHIA 1WVVA 2BPUA 4LYOA 4N1CC 1XSFA 3M18B 4WL6A 1UA6Y 2CJLA 3J4GA 3TXFA 2YDGA 1FLQA 3AZ7A 4NG8A 4J1AA 5I53A 2CDSA 1NMMA 2BLYA 1NHEA 4M6DA 4M4OA 1JHLA 4UWVA 5HNLA 4NGOA 4WLYA 3WXUA 4GLVA 4XJIA 1GB7A 2F30A 2Z39A 4H8ZA 4OWAA 2BQHA 4MSTA 4HTQA 7LYZA 3A8ZA 4KXIA 3B72A 5F16A 1D0KA 3TXDA 1HC0A 4J1BA 1B5VA 2BQDA 1IR8A 5KXWA 1D0MA 1XEIA 4OWBA 4N8ZA 4MR1A 4KPMA 1IOSA 1JITA 4HJZA 1WQQA 3A96A 2LYOA 4FDYA 4DD9A 1I56A 1QSWA 2ZNWY 3AZ6A 5IELA 1GE0A 4XADA 1I1ZA 2DQCY 1JTTL 4C5FA 2DQHY 4Z41A 4RW2A 1LSYA 1QIOA 2BQFA 3QE8A 5LAGA 1GDWA 2LZ2A 3TXIA 5FDJA 5ILCA 3A92A 3KAMA 1BWJA 1IEEA 1BVKC 3N9AA 3E3DA 1GHLA 1TCYA 1GFGA 1IOQA 1OUFA 5D5CA 2YBLA 3G3AB 4B1AA 1IP4A 4LYCA 1CKCA 1GBXA 1VEDA 8LYZA 3IJUA 4QEQA 1TDYA 3A3QA 3CSQA 3OK0A 2ZQ3A 2FBBA 1LHJA 1GAYA 1JTOL 1IP6A 193LA 1GB5A 4HV1A 2YBIA 2I6ZA 4LT1A 4NGVA 5KXYA 3WL2A 5I4WA 1BGIA 1W08A 2G4NA 5A3EA 1LYOA 1LYZA 4H9FA 1XGUC 4WM6A 2HUBA 2BQBA 2X0AA 4R6CA 1UACY 1BB7A 1UIDA 1IWXA 4RW1A 4XJFA 1LMOA 2BQCA 1GEVA 2BQIA 3T6UA 4B49A 2BQNA 4D9ZA 4DD3A 4J0LA 1YAOA 1KXXA 2DBTA 3WYHA 4EOFA 4TSCA 4B4IA 1GBYA 1LSZA 2W1MA 1LZCA 1BB5A 1GB8A 1UIEA 4P2EA 1DKKA 1JSFA 4TUNA 4W94A 3W6EA 1LKRA 1NF5A 1HMLA 4NGWA 4HP0A 2Z37A 3G3BB 4Z98A 132LA 4WOAA 5KXOA 3HFMY 5C6IA 5DL9A 3P68A 1D0LA 1GFEA 1FLWA 4X3BA 3AYQA 5FCPA 3BKVA 2CWIA 1YAQA 4FJRA 1F0WA 1VATA 2BQMA 1B5XA 5F81A 2D91A 1REZA 4XJBA 2DQDY 2VB1A 1T6VL 2ZNXY 208LA 2EKSC 3ATOA 1HEWA 1EQ4A 2BLXA 4NGZA 5KXLA 3CQLA 4LYTA 1H6MA 3TXBA 1GFTA 4ZFPA 1GF9A 2F4GA 3CB7A 1GFJA 5KXTA 1QTEA 1VFBC 1GE2A 3AGHA 3WU8A 2DKVA 1KIQC 1LSCA 1HF4A 1XEJA 4WO6A 1NKHA 4ETBA 2I25L 2HEEA 4H1PA 4H8YA 1C08C 1LZRA 2MEFA 2MEBA 4LGKA 5IDDA 4PRUA 1LJ3A 4YOPA 4EMNA 4ZIXA 2HTXA 3TXKA 1LTMA 1JISA 1GFVA 1J1OY 1LSFA 4OWEA 5L3IA 3P64A 1LZEA 2XTHA 1IX0A 2DQAA 3TMVA 1QUSA 3LYOA 4G9SA 5LAFA 1GE4A 3GXRA 1BB6A 6LYTA 4H93A 1GF3A 4NHSA 4N1EI 1CKGA 5LVKA 1LKSA 1EL1A 1HELA 1DPWA 1JUGA 1IWVA 1LSMA 2FYCA 1IP7A 1JKBA 4U3XB 2W1YA 3LN2A 2BQOA 1LSNA 1OUIA 4NGKA 153LA 2DQJY 4PGJB 2C8OA 2MEGA 5F9UA 1TBYA 3TMWA 4ML7A 3AZ5A 4WM1A 1CJ9A 3WW6A 3WPLA 1RFPA 1OUHA 1KIPC 5II3A 1DQJC 4CFOA 1YAMA 3D9AC 1ZVYB 5KXSA 2YSSC 3W6FA 3EMSA 1GXXA 4IATA 4LZTA 4II8A 3A91A 5LVHA 4DT3A 3N9EA 5FELA 4LFPA 2AUBA 1IP2A 4PHIA 1CKDA 1IC5Y 3OJPA 4W96A 1EQEA 2Z18A 2LZTA 3SP3A 1HNLA 4YENA 4A7DA 1AT6A 1F10A 1YIKA 3B6LA 1LSEA 1LJEA 1GD6A 3TMUA 1GF7A 1RCMA 3IJVA 3WUMA 4DDBA 5JENB 4TX7A 3WU7A 5L9JA 4XJDA 3LYMA 1VAUA 1N4FA 3TXGA 3WUNA 5LVIA 1GBSA 4OOOA 4CJ2A 1XFPL 4AGAA 5KXRA 1JJ1A 1GDXA 1IWUA 1UIBA 3HBEX 4H9EA 5F9XA 2MEDA 5L3HA 1DKJA 1LHHA 3A6CY 1YAPA 1LSDA 3A95A 2HU1A 2LYZA 1UIGA 4HPEA 3ZVQB 3ATNA 1I20A 1REYA 1UIHA 5B07A 1HMKA 2NWDX 1CNSA 2G4QA 1FBIX 3K3TA 4OWHA 4NSIA 1G7MC 1HFYA 1HEQA 4BAPA 1WQNA 4GN3A 4G4HA 3A67Y 3WULA 1LZ4A 1AM7A 1INUA 5KXPA 4H92A 1GBZA 1UICA 1JKDA 1ZVHL 2DQFC 3AW6A 4NHIA 4BADA 4NGYA 1B7NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L37A 2CGIA 1GF6A 1DYBA 1L21A 1V7TA 4NWHA 1ALCA 3GUIA 4BS7A 3WXTA 2RB1X 1WTMA 3RZEA 1L08A 3RZ4A 4HV2A 4H94A 1GFAA 1RE2A 1QTKA 1L30A 1LZGA 1L62A 1QQYA 5I4XA 5KY1A 5LZMA 1WQMA 3WMKA 2B5ZA 5APCA 1L0KA 6LZMA 135LA 1GE1A 1BWIA 5K7OA 1GB3A 4LZMA 5LINA 2YBMA 5HLLA 2HUMA 3RU5A 3A90A 1GF4A 2I26L 1NQIA 1IR7A 1L43A 3MGWA 234LA 1LI6A 2L78A 1L71A 1L64A 1P37A 4J7VA 2HEAA 2RSCA 1LMTA 1C6NA 126LA 3DMVA 1DI4A 1P3NA 2MEEA 215LA 2EPEA 4XJHA 3D4SA 4DD2A 163LA 1BB4A 1BVXA 1CJ6A 1GF5A 219LA 1KXWA 2YBJA 4LYBA 4W56A 1G7HC 1L86A 6LYZA 3AW7A 1IO5A 1L91A 3HU8A 4EJ4A 1L80A 187LA 1GF0A 3B0OA 2FBDA 1B5UA 1LZ9A 1L06A 1PQIA 1IVMA 1ZYTA 1ZURA 3TXJA 1F6RA 2HU3A 5C6JA 4NHPA 3C8RA 1QTBA 3SB8A 1LZNA 1LOZA 3WH1A 4KL7A 140LA 5HQ1A 1QTCA 3QNGA 174LA 1IR9A 5EBHA 4WG1A 1YILA 170LA 214LA 5LYTA 191LA 3WUAA 123LA 245LA 1HEOA 223LA 1LZYA 4HSFA 249LA 4E3UA 1DYCA 1AT5A 1SSWA 1UIAA 5FEKA 2OTZX 5LYMA 1XEPA 4WM5A 1ZWNA 1L18A 1HERA 3HT7A 1RJCB 5KJ9A 4TSBA 4DKLA 1B9OA 229LA 1IOCA 3EO5A 4OW1A 3P65A 4ETCA 1LJNA 2MECA 1L84A 1JPOA 4NGLA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1GB9 A;  2CGI A;  1D9U A;  1GF6 A;  1B5W A;  1J1X Y;  3WVY A;  1WQO A;  4H9H A;  3HBD A;  1V7T A;  1LHL A;  4NWH A;  4RDS A;  1ALC A;  5LA8 A;  4YEO A;  2MEH A;  4BS7 A;  2WAR A;  3WXT A;  1JEF A;  1LJI A;  1JTP L;  1GFK A;  3HBH A;  1WTM A;  5D5F A;  5LVJ A;  1AZF A;  1LJJ A;  3N9C A;  4G49 A;  4WM4 A;  3RZ4 A;  1HEN A;  4WM2 A;  1IP1 A;  4GCD A;  4HV2 A;  1OQM A;  3WPK A;  4DDA A;  1V7S A;  5E4P A;  4XEN A;  4DYG A;  1MEL L;  4H94 A;  1GFA A;  1RE2 A;  1QTK A;  2XBR A;  1JIY A;  1HSX A;  1LZG A;  1REM A;  1IWW A;  1LSB A;  1LSP A;  1OUG A;  2HED A;  3AB6 A;  3WU9 A;  4Z3M A;  5B05 A;  2G4P A;  2D4K A;  1QQY A;  4WG7 A;  5I4X A;  1B2K A;  5KY1 A;  4HJY A;  1WQM A;  1IOR A;  3WMK A;  2B5Z A;  5APC A;  1A4V A;  3AJN A;  4NSH A;  4WLD A;  2DQG Y;  9LYZ A;  4NSG A;  1VDT A;  4LYZ A;  1NDG C;  135L A;  1GE1 A;  1LMP A;  1EQ5 A;  1BWI A;  4PRQ A;  2BQL A;  5K7O A;  1GB3 A;  4IJ4 A;  1GB0 A;  1P2C C;  4NSJ A;  4GN4 A;  5LIN A;  1IWY A;  1LJ4 A;  1VDP A;  2YBM A;  2ZIJ A;  1DXJ A;  1LSG A;  5HLL A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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