2LZ2A

The three dimensional structure of turkey egg white lysozyme at 2.2 angstroms resolution
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVYGRCELAAAMKRLGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTHATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSKNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIASGGNGMNAWVAWRNRCKGTDVHAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
molecule keywords TURKEY EGG WHITE LYSOZYME
publication title The Three Dimensional Structure of Turkey Egg White Lysozyme at 2.2 Angstroms Resolution
rcsb
source organism Meleagris gallopavo
total genus 38
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1988-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2lz2A00
1FLYA 1BB6A 4OWHA 4GN3A 3WMKA 1YQVY 3A6CY 1HSXA 133LA 5KXOA 2BQFA 1B5WA 4NGJA 4J1BA 3P64A 4LFPA 4U3XB 2YSSC 1LJ4A 1AT6A 2Q0MX 1YANA 1GF8A 1ALCA 1JSFA 3A34A 1OUBA 2HEFA 1F0WA 1OUAA 2Z18A 5I4XA 1GF3A 2YBIA 1DQJC 1IOSA 1QQYA 1BB4A 5FELA 2XBRA 5K7OA 3LN2A 2Z12A 5F9XA 3B6LA 4B0DA 4DD7A 1IOQA 1GF0A 2EIZC 1IX0A 1CKHA 3E3DA 4N5RA 1TCYA 1GFVA 5T3FA 3TXFA 4DDAA 5B59A 1IP4A 1EQEA 1LSZA 3P4ZA 4EOFA 1XSFA 3A6BY 3LYZA 4NGIA 4LYOA 1IR8A 5L3HA 1JWRA 1Z55A 1WQMA 1B2KA 1CJ8A 1EQ4A 4H9HA 4Z3MA 3CT5A 4QEQA 1VDTA 4G4BA 4GCEA 4G4CA 3ULRA 194LA 1G7JC 2BQLA 2YBHA 3W6EA 5KXWA 1VDSA 4NSIA 2Z39A 1DKJA 2HUBA 4H9AA 1LSBA 1G7LC 3LYMA 1GB2A 5KXSA 1UUZC 1UC0A 1HFZA 1HFXA 2FBDA 2ZWBA 1IP7A 1J1OY 4TUNA 3B0OA 1CKFA 1GBOA 3TXEA 5J7CA 2MEGA 3TXBA 4NHTA 4WL7A 3P65A 5KXPA 2F4GA 2VB1A 4HJVA 4MR1A 2H9KA 1BB3A 5I5QA 5C6LA 1LPIA 1OP9B 1YKXX 2W1XA 1QSAA 1B7QA 1J1PY 1REYA 2Z2FA 3TXJA 2DQIY 1UBZA 1LMPA 3QY4A 1GE4A 5B07A 5B1FA 1H6MA 1IP3A 207LA 1FLQA 2BQNA 3IJUA 3FI7A 4HJZA 1GB9A 3BKVA 4ET8A 4NHIA 5F9UA 5LVKA 4RLMA 2BQEA 2DBTA 1LJEA 4NGOA 2DQGY 2ZQ4A 3IWRA 4LGKA 1FDLY 5LYZA 1LJGA 4PRUA 1G7HC 3P66A 1DKKA 1JTOL 1FBIX 1BB7A 1IWUA 1YL0X 1TBYA 1G7MC 1LMCA 4NSHA 5LVIA 3TMXA 3EBAB 5HMVA 1F6SA 1B7MA 1NBYC 1LZCA 4ETDA 1UCOA 4YENA 6LYZA 5I53A 1GBYA 4TX7A 1B7RA 1B7LA 4WL6A 2HU1A 3LYOA 4ML7A 2BQBA 4ZFPA 1MELL 1DPWA 4NFVA 1LMAA 1O23A 2D4KA 5DN5A 4YEMA 1GEVA 1GB5A 4H93A 4YEOA 3CB7A 1IP2A 2ZYPA 4I0CA 5KXZA 5I54A 2DQEY 4E3UA 1LHLA 4DD1A 1JKBA 4QY9A 3TMUA 4UWVA 3OK0A 1YROA 2YBJA 4NGVA 5B05A 4GLVA 3N9EA 3A94A 2GV0A 1JUGA 2I26L 1GFEA 5FHWA 2BQHA 4J0LA 4P2EA 4X3BA 3WW6A 3BKHA 2MEEA 1HMKA 4CHXA 1CJ6A 1LJNA 3HBDA 1REXA 3G3BB 3TXDA 1LZAA 4RW2A 1OUGA 1I20A 1D0LA 4IASA 4ETBA 3RZ4A 1PZYA 4B1AA 4PPOA 1G7IC 1GE0A 1CKCA 1LMOA 5FEKA 1JKDA 1LSYA 1UA6Y 1LJFA 1HEOA 5APFA 3A3QA 5HNLA 1WQQA 2B5ZA 1GBWA 2ZQ3A 4OWBA 2FYDA 1B5UA 3K3TA 4RLNA 4WM4A 5B1GA 4WLXA 4M4OA 5IELA 1BB5A 1DI4A 1DI5A 4NG8A 4NHQA 1D0KA 1D6PA 3TXIA 3T36A 1C43A 1UIDA 1UIGA 2LYOA 1FKVA 1LYSA 1XEKA 5KXKA 5APCA 1IC5Y 1BHZA 3RT5X 4H91A 4CFPA 5ILFA 3A3RX 1A2YC 1TAYA 2BQIA 4XENA 1LHHA 5DM9A 1B9OA 1UIEA 4G9SA 2D91A 1IR7A 3AGHA 4XJIA 1UIAA 3ZVQB 2DKVA 1GF7A 1YILA 1YL1X 3QE8A 2A7FA 1GF6A 2MECA 5KXNA 1IY3A 154LA 1XGUC 1GBZA 3WU8A 5APDA 1XGRC 5KY1A 4N1EI 2MEFA 1NDMC 4PHIA 2YDGA 3WL2A 2D4IA 2BQKA 3WPKA 1IWTA 5IDDA 1OUEA 1LZ9A 1DI3A 5L3IA 4C5FA 8LYZA 1LMNA 4LYCA 4NEBA 1FN5A 1NBZC 2FBBA 2LYZA 4RW1A 4EMNA 1AKIA 4ANRA 2I6ZA 1HHLA 4KT3A 1F6RA 1YAOA 4OWCA 3TMVA 1GB0A 2N5ZA 3W6DA 3ZVQA 4ETEA 5I4WA 4DD9A 1B5ZA 1BVKC 1XEIA 1GHLA 3AZ5A 4N1CC 4RDSA 3WUAA 5KXYA 4DT3A 3AGIA 4WO9A 3AB6A 1LZ8A 1GFJA 2BQDA 4ZEEA 1NF5A 1JEFA 4B4EA 4NG1A 5A3EA 4PRQA 5DLAA 1REMA 2NWDX 1WQNA 1CKGA 3A93A 1IP1A 1OUDA 4XADA 4H9EA 4LYZA 1I1ZA 4AGAA 4NGWA 5FDJA 3TXKA 3N9CA 1LZ5A 1GF9A 2ZIKA 1GEZA 5JENB 1IORA 2MEAA 5LIOA 3LHMA 4LT1A 1HMLA 2IHLA 4DC4A 132LA 5KXTA 1CNSA 1OQMA 1UIFA 1LTMA 1UIBA 4H92A 3RU5A 2YBMA 1LZTA 1IP6A 1QDRA 4HPEA 1RCMA 3CQLA 4KPMA 3HBEX 1HNLA 1GFKA 1D6QA 4N9RA 1FLWA 2MEIA 2DQAA 2CJLA 4J1AA 4NGZA 5F81A 3AYQA 3J4GA 1HSWA 5FCPA 4H8ZA 2F30A 3HFMY 3WH1A 1KIRC 2XBSA 4Z98A 5IHGA 1LZ1A 5HMJA 1LZ4A 4WMGA 1LJIA 2AUBA 4OWAA 3W6BA 3W6CA 5LVGA 4H8YA 1NMMA 2LZ2A 1AT5A 1GE3A 3WVYA 3WW5A 3WXUA 3RW8A 4BAFA 1GB8A 1AZFA 1JKAA 1LAAA 1ZV5L 1C10A 2Y8PA 1LHKA 2BQMA 4UWUA 5KXRA 2W1MA 4KXIA 1WQRA 3B0IA 1WVVA 4CJ2A 1OUHA 4PGJB 1JSEA 4I8SA 1CJ9A 1BVXA 1GFTA 4YOPA 2YBNA 1C46A 4J7VA 3AW7A 4HP0A 1GE1A 3AJNA 2FYCA 1NDGC 1LJ3A 3J6KA 1JJ0A 3LZ2A 3WU9A 1GWDA 3W3EA 3FE0A 4HTNA 1INUA 1LZBA 1LZYA 1LJKA 2LHMA 4LZTA 3WUMA 2HEBA 1I56A 4BADA 1JIYA 4NIJA 4ETCA 2ZNWY 4Z41A 1HEPA 2EQLA 3WPJA 1QIOA 4WLTA 1WQPA 2ZILA 1GXXA 5KXMA 1RI8B 1LYYA 3B72A 1IOTA 2W1LA 1QTKA 4R6CA 1HEQA 3AW6A 1BGIA 1YKYX 2EKSC 1ZVYB 1KIQC 2ZYCA 1JTPL 1LYZA 2YVBA 3OJPA 4DDCA 1BWHA 2C8OA 2G4NA 2BPUA 4HTQA 135LA 4WM5A 4DD0A 1DXJA 2Z2EA 1GXV2 1WTMA 2BLXA 1KXYA 3TXGA 4TSCA 1SQ2L 1LSPA 3F6ZA 4OWEA 2ZNXY 1B7NA 5APEA 3MGWA 3WU7A 4LYTA 1A4VA 5KKIA 1QDTA 4XJDA 1LZDA 1B5YA 2HTXA 4XJBA 4MCKA 4NHPA 1GB6A 1LSFA 4G4HA 2Z37A 1V7SA 4GN4A 1GFUA 5LAGA 7LYZA 4WLYA 1IR9A 1IO5A 5M1YA 2I25L 4MSTA 4BAPA 9LYZA 4H94A 4NGYA 1VDQA 1T6VL 1IWZA 2EPEA 1IWXA 3ATNA 2A7DA 1SLYA 1IWYA 2MEBA 1QUSA 2MEHA 4D9ZA 3ZEKA 4WM2A 1LZSA 5ILCA 5C6IA 2BQCA 1C45A 4XJHA 1LKSA 1GBSA 3A92A 4HTKA 3A67Y 2F2NA 5A3ZA 2HECA 4LFXA 2D4JA 2HEDA 3WXTA 1QUTA 1LZNA 3D3DA 4LT2A 1GD6A 1LSNA 2H9JA 2IFFY 4WOAA 1VATA 5HQ1A 4W94A 1RFPA 1W6ZA 3ATOA 4GLAA 3N9AA 3P68A 4AXTA 3AZ7A 1LYOA 4XJGA 4NWEA 1VEDA 1T3PA 1B7OA 3CSZA 4O34A 1JITA 1WQOA 5DL9A 4HV1A 5FSTA 1UACY 1CKDA 5C6JA 2HU3A 3CSQA 4R0FA 2BQGA 4G49A 2BQAA 4LYBA 4FDYA 1JHLA 2Z38A 3AZ6A 1LSMA 4UWNA 1UIHA 1RE2A 2LYMA 4NGKA 5II3A 3GXKA 1IIZA 2BLYA 2LZTA 4H9FA 3WULA 1IWVA 5KXXA 4NWHA 3CT0A 1GFRA 2G4QA 3W6AA 1KXXA 4W96A 1LHIA 4B49A 1YAPA 3EO5A 2G4PA 3VWOA 1C7PA 1LSEA 3G3AB 1D0MA 4TSBA 1GFAA 2DQHY 2YBLA 4QDNA 4DD3A 1HF4A 1KXWA 1GF4A 5EBHA 3LYTA 1HEMA 1J1XY 1LOZA 2H5ZA 4HPIA 1LCNA 4WLDA 4WO6A 5DN4A 4BS7A 3A95A 5LYMA 4DDBA 1B0DA 1LSGA 4HSFA 4KL7A 4PJ2C 1XGPC 2MEDA 5KXLA 1LZRA 153LA 5LVJA 2ZIJA 3SP3A 3CSRA 1LSAA 2XTHA 1ZVHL 1W08A 3GXRA 4B4JA 1F10A 1V7TA 4IATA 5LYTA 1BWIA 1GFHA 2W1YA 1GDWA 1DPXA 5L9JA 4LT3A 3KAMA 1P2CC 3D9AC 1PS5A 4WM6A 1VDPA 2DQCY 1NHEA 4GN5C 1FKQA 1IC7Y 208LA 2D6BA 4XYYA 1CJ7A 3A96A 1LKRA 1GF5A 3M18B 4C3WA 4TTDA 1DZBX 5E4PA 1GE2A 1IC4Y 4H90A 4H9IA 4DWXA 4ZIXA 5I4YA 1GB3A 4N0JA 6LYTA 1JJ3A 1OUIA 2HEAA 3T6UA 1KIPC 1LJJA 1C08C 1TEWA 1B5VA 3CT1A 1XGTC 1HENA 1E8LA 1IOCA 4ETAA 1GBXA 4WM1A 5HLLA 4FJRA 5HNCA 4OW1A 5D5FA 5KJ9A 4B4IA 1EQ5A 1EL1A 4HJYA 3A91A 1BWJA 2BQOA 1VAUA 5E9RA 3AGGG 1GAZA 4NGLA 2RSCA 4OOOA 1B5XA 3WUNA 3HBHA 1IP5A 3A8ZA 4LYMA 4TWSA 1LHJA 3WYHA 4NY5A 3TXHA 2XJWA 4NSJA 1BQLY 1LHMA 2CWIA 1GFGA 1NQIA 1YAMA 1AM7A 4H9BA 4YM8A 1LJHA 1VFBC 2CDSA 1NKHA 3RNXA 1IWWA 1H87A 4H1PA 3WVXA 4GCDA 4ET9A 134LA 1HERA 1GAYA 2HEEA 4CFOA 1OUFA 3IJVA 4H9CA 4CGEA 5LINA 1IEEA 1HELA 1WVUA 1YKZX 3EXDA 4XN6A 1LZ6A 1LMTA 1LSDA 1FLUA 1IY4A 1B7SA 1N4FA 4WG1A 1RJCB 4NSGA 4Z46A 1LZEA 1HC0A 5LA5A 1UICA 1D9UA 2Z19A 5F16A 1WTNA 4GCFA 4XJFA 3B0KA 4IJ4A 5KKJA 1LSCA 1JPOA 4L41A 5LXWA 1QSWA 3LZTA 1LMQA 1XGQC 4II8A 1JTTL 1ZMYL 2DQFC 4HV2A 2F4AA 4WM3A 4NHSA 1JKCA 5F14A 2C8PA 1B7PA 2PC2A 4H8XA 1GPQC 1REZA 1IVMA 1MLCE 3QNGA 1XEJA 1NWGA 1HFYA 4N8ZA 4WG7A 2BAAA 4YF2A 5AMYA 5LVHA 5LAFA 4DD2A 1JJ1A 1OUCA 1YIKA 4GCCA 4DYGA 5LA8A 1LZGA 2BQJA 4QGZA 1HEWA 2WARA 3A90A 1QTEA 1YAQA 4OOTA 4GCBA 3AZ4A 1GB7A 4A7DA 2X0AA 1GDXA 1OUJA 3EMSA 3M3UA 5D5CA 2DQDY 4LT0A 2DQJY 3W6FA 3TMWA 1TDYA 2CGIA 5B06A 1JISA 4M6DA 3WPLA 1XFPL 193LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1FLYA 7LZMA 1BB6A 1DYDA 1YQVY 3A6CY 1HSXA 133LA 5KXOA 2BQFA 1L03A 1L15A 1C6BA 1LJ4A 1AT6A 2HEFA 2Z18A 5I4XA 1DQJC 5FELA 2XBRA 109LA 5K7OA 5F9XA 1IX0A 4N5RA 1TCYA 1GFVA 5T3FA 187LA 1PQOA 2RBRA 1LSZA 4DDAA 1P46A 178LA 5L3HA 1L41A 142LA 1L34A 131LA 4H9HA 222LA 4Z3MA 4QEQA 4G4BA 166LA 224LA 194LA 1D3NA 4NSIA 5KXSA 1LSBA 1G7LC 3LYMA 1GB2A 2FBDA 1IP7A 1GBOA 4NHTA 4HJVA 195LA 200LA 1BB3A 5I5QA 1OP9B 2W1XA 1QSAA 1REYA 2QB0B 1C6CA 1LMPA 1GE4A 3CDQA 2BQNA 4W59A 3FI7A 3BKVA 4ET8A 4LGKA 5LYZA 4ZPUA 1TBYA 1LMCA 2OEAX 191LA 1P6YA 3EBAB 1C66A 1B7MA 3V2YA 2HU1A 4ZFPA 1DPWA 1O23A 4YEMA 4W56A 4E3UA 1LHLA 3OK0A 1L76A 3A94A 3SB6A 1GFEA 1L35A 2BQHA 4J0LA 1L10A 3WW6A 4CHXA 1KY0A 4PPOA 1G7IC 1CKCA 1LSYA 5APFA 1WQQA 4RLNA 1B5UA 1DI5A 1C6GA 1D6PA 1C43A 1LYSA 1L14A 2OE4X 2O7AA 1CU6A 1L66A 1B9OA 3AGHA 1C63A 1YILA 1L37A 1YL1X 1L98A 169LA 1GBZA 5APDA 3C7WA 173LA 3HDEA 1IWTA 5L3IA 2FBBA 4EMNA 2I6ZA 1F6RA 1YAOA 1GB0A 4DD9A 1BVKC 1QUHA 2OTYX 3AGIA 1GFJA 2BQDA 2F32A 1NF5A 1JEFA 1CUQA 4NG1A 209LA 4PRQA 1WQNA 1CKGA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1FLY A;  1BB6 A;  4OWH A;  4GN3 A;  3WMK A;  1YQV Y;  3A6C Y;  1HSX A;  133L A;  5KXO A;  2BQF A;  1B5W A;  4NGJ A;  4J1B A;  3P64 A;  4LFP A;  4U3X B;  2YSS C;  1LJ4 A;  1AT6 A;  2Q0M X;  1YAN A;  1GF8 A;  1ALC A;  1JSF A;  3A34 A;  1OUB A;  2HEF A;  1F0W A;  1OUA A;  2Z18 A;  5I4X A;  1GF3 A;  2YBI A;  1DQJ C;  1IOS A;  1QQY A;  1BB4 A;  5FEL A;  2XBR A;  5K7O A;  3LN2 A;  2Z12 A;  5F9X A;  3B6L A;  4B0D A;  4DD7 A;  1IOQ A;  1GF0 A;  2EIZ C;  1IX0 A;  1CKH A;  3E3D A;  4N5R A;  1TCY A;  1GFV A;  5T3F A;  3TXF A;  4DDA A;  5B59 A;  1IP4 A;  1EQE A;  1LSZ A;  3P4Z A;  4EOF A;  1XSF A;  3A6B Y;  3LYZ A;  4NGI A;  4LYO A;  1IR8 A;  5L3H A;  1JWR A;  1Z55 A;  1WQM A;  1B2K A;  1CJ8 A;  1EQ4 A;  4H9H A;  4Z3M A;  3CT5 A;  4QEQ A;  1VDT A;  4G4B A;  4GCE A;  4G4C A;  3ULR A;  194L A;  1G7J C;  2BQL A;  2YBH A;  3W6E A;  5KXW A;  1VDS A;  4NSI A;  2Z39 A;  1DKJ A;  2HUB A;  4H9A A;  1LSB A;  1G7L C;  3LYM A;  1GB2 A;  5KXS A;  1UUZ C;  1UC0 A;  1HFZ A;  1HFX A;  2FBD A;  2ZWB A;  1IP7 A;  1J1O Y; 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 3WUN A;  3HBH A;  1IP5 A;  3A8Z A;  4LYM A;  4TWS A;  1LHJ A;  3WYH A;  4NY5 A;  3TXH A;  2XJW A;  4NSJ A;  1BQL Y;  1LHM A;  2CWI A;  1GFG A;  1NQI A;  1YAM A;  1AM7 A;  4H9B A;  4YM8 A;  1LJH A;  1VFB C;  2CDS A;  1NKH A;  3RNX A;  1IWW A;  1H87 A;  4H1P A;  3WVX A;  4GCD A;  4ET9 A;  134L A;  1HER A;  1GAY A;  2HEE A;  4CFO A;  1OUF A;  3IJV A;  4H9C A;  4CGE A;  5LIN A;  1IEE A;  1HEL A;  1WVU A;  1YKZ X;  3EXD A;  4XN6 A;  1LZ6 A;  1LMT A;  1LSD A;  1FLU A;  1IY4 A;  1B7S A;  1N4F A;  4WG1 A;  1RJC B;  4NSG A;  4Z46 A;  1LZE A;  1HC0 A;  5LA5 A;  1UIC A;  1D9U A;  2Z19 A;  5F16 A;  1WTN A;  4GCF A;  4XJF A;  3B0K A;  4IJ4 A;  5KKJ A;  1LSC A;  1JPO A;  4L41 A;  5LXW A;  1QSW A;  3LZT A;  1LMQ A;  1XGQ C;  4II8 A;  1JTT L;  1ZMY L;  2DQF C;  4HV2 A;  2F4A A;  4WM3 A;  4NHS A;  1JKC A;  5F14 A;  2C8P A;  1B7P A;  2PC2 A;  4H8X A;  1GPQ C;  1REZ A;  1IVM A;  1MLC E;  3QNG A;  1XEJ A;  1NWG A;  1HFY A;  4N8Z A;  4WG7 A;  2BAA A;  4YF2 A;  5AMY A;  5LVH A;  5LAF A;  4DD2 A;  1JJ1 A;  1OUC A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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