2PC2A

Lysozyme cocrystallized with tris-dipicolinate eu complex
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title A dipicolinate lanthanide complex for solving protein structures using anomalous diffraction
pubmed doi rcsb
total genus 49
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2007-03-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2pc2A00
2I6ZA 1ZVHL 4IASA 4R0FA 4B4JA 3LYZA 4HTKA 4WG7A 3ZVQA 1H6MA 5L3IA 2DQIY 4H9CA 1JJ0A 3F6ZA 2D4IA 3TMXA 1NWGA 2MEBA 3IJUA 1NDMC 4NGIA 1OUGA 1QUSA 1MELL 1WVUA 2NWDX 4GCEA 4N8ZA 3A94A 1BB3A 4N9RA 4NSIA 1QUTA 3BKHA 1EQEA 3TXIA 5LVGA 3A6CY 1LHLA 1GEZA 2FYCA 1OUCA 2A7FA 3G3BB 4Z98A 1OUJA 4AXTA 3ULRA 4NSHA 1DQJC 4WLXA 5KXYA 5KKJA 5LVHA 1YKXX 2G4QA 1LZTA 2LZTA 2Z2FA 1UC0A 1EQ5A 5F9XA 4H91A 5APDA 5L9JA 1YKZX 1FN5A 3A34A 5KKIA 3LZ2A 3GXKA 1GFHA 1IC4Y 3VWOA 1HEOA 2DQJY 3B0KA 3CT1A 5KXLA 1GBYA 1TBYA 4QGZA 1IP4A 2VB1A 4A7DA 2CDSA 3WU7A 3TXEA 1LZNA 3FI7A 3AJNA 4I8SA 5FDJA 5F9UA 1QDTA 5I4XA 4HPIA 1GB2A 1HFZA 1IWWA 4DDBA 3RZ4A 2LHMA 1LHMA 4W94A 3LYMA 3WL2A 2ZQ4A 3M3UA 1LMCA 1NF5A 3P68A 1DXJA 5KXMA 3A67Y 1LJKA 1GBSA 3AGIA 4NEBA 1VDQA 3ATNA 3B0IA 4OW1A 1UIBA 1G7JC 4J7VA 3T36A 1KXXA 4H90A 1FBIX 2Z18A 1C10A 132LA 3SP3A 1GF5A 4OOTA 1LSYA 4YEMA 1LMNA 1PS5A 1D6QA 1GWDA 2Z2EA 1DPXA 4ZFPA 2BQLA 3CB7A 1LZ6A 1IR7A 4TX7A 1J1XY 4WLDA 4C5FA 5LVKA 4CHXA 1XEIA 1LSMA 207LA 1OUDA 3A90A 3AZ6A 3TXBA 3HBEX 1IWUA 3WXUA 3P4ZA 2WARA 4NHQA 2H9KA 1GB5A 3WXTA 1FKVA 1LMQA 1F10A 2FBDA 1LZ8A 1VAUA 4KL7A 3N9CA 1REYA 4G49A 1B0DA 5JENB 1BB7A 2BQDA 1C43A 2CWIA 2ZYCA 2F30A 4KXIA 1IX0A 1OQMA 1QTEA 1P2CC 1ZMYL 3G3AB 4XJGA 5FSTA 1UACY 2N5ZA 4WLTA 3W6CA 1QDRA 1HEMA 1A2YC 5KXSA 4B0DA 1INUA 4H9AA 1DI3A 1JJ3A 4GCDA 3HBHA 4RW2A 2YBHA 2YBNA 4LT3A 5KXNA 5HNCA 1DKJA 1FLUA 2EQLA 1LJJA 3BKVA 1YIKA 3WVXA 5LYMA 1LHIA 1UICA 1NKHA 1VFBC 4OWEA 1NBYC 2DKVA 2RSCA 4YF2A 3TXHA 1HENA 1LZGA 1IP6A 4GLAA 1XGTC 2W1LA 1DPWA 1B7SA 1B5ZA 1GBOA 1BQLY 2I25L 1H87A 1UA6Y 2DQAA 4OWCA 4O34A 1AM7A 2Z37A 1UIGA 1LMTA 2FBBA 3A3RX 1IC7Y 1IOSA 1GPQC 1VDPA 2MEFA 4OWBA 3AGGG 4CFPA 4DD3A 1HFXA 1WQOA 1XEKA 3EO5A 2ZWBA 1GB6A 2GV0A 1JWRA 5KXPA 1BWHA 4H8YA 1LAAA 1KXYA 1GB8A 2I26L 1LCNA 3WPJA 4J1BA 4RLNA 3WVYA 1LSCA 1IP7A 1BB4A 1LTMA 3CT5A 3WMKA 1YL1X 4X3BA 4YENA 5AMYA 5LAFA 4P2EA 3QNGA 5A3EA 1B5UA 3RU5A 3T6UA 1GFTA 4G9SA 3WUMA 2HEDA 5ILFA 2IHLA 2D4JA 3A91A 1CKGA 3FE0A 5L3HA 2BQNA 2BLXA 135LA 1GF4A 2ZILA 1J1PY 1G7IC 1LZBA 1JKBA 2DQDY 2Z38A 4H9FA 4KT3A 4DD7A 4UWNA 2MEHA 2MEEA 1GF6A 2C8PA 4WM1A 5B1FA 1QTKA 1PZYA 1VEDA 2DQGY 1LJHA 1FLQA 4H8ZA 5LYZA 5I5QA 2HEEA 4N1CC 2A7DA 2H9JA 1J1OY 2BQFA 4Z3MA 1IP2A 2DQEY 1LSEA 4BAPA 1QSAA 5II3A 4H92A 1YILA 2Y8PA 1OUHA 3WH1A 4PJ2C 3A92A 1GDXA 4LYZA 4H9BA 1GB0A 2XBSA 3TMUA 3TXKA 4GCFA 4ETBA 2W1XA 1LZEA 4N0JA 7LYZA 1HSWA 3P65A 4XENA 3CT0A 4HJZA 2G4NA 4DD9A 1BHZA 1GFVA 2AUBA 3LN2A 1OUIA 5EBHA 1RE2A 4DDAA 1UBZA 1IWYA 1UIHA 5I4YA 3W3EA 1KIPC 1GFGA 2ZNWY 3RW8A 1IR8A 1HERA 1LMAA 3QY4A 5LA5A 1UIDA 4N1EI 1GE2A 4LYTA 2BQAA 1LSBA 4NWHA 1IO5A 2LYOA 1LZAA 1XEJA 4NGKA 1GFKA 3TXJA 3WULA 5I4WA 4U3XB 3W6BA 4ET8A 4MSTA 1HSXA 1WTMA 1RJCB 4HJYA 1O23A 1XGPC 4UWVA 2DQFC 4GN3A 4DWXA 2Z39A 4LZTA 4QDNA 5KXZA 1IWTA 5C6IA 4GLVA 1F0WA 2EKSC 3LYTA 1CJ6A 1NQIA 4HV2A 3A6BY 4NGYA 4OOOA 1CKHA 1IP3A 1IEEA 1LHKA 2EIZC 2LYZA 5APFA 1LHHA 1LSGA 1HEPA 1Z55A 4XJHA 1CKFA 2YVBA 4CGEA 2HEBA 1LZYA 2BQBA 1LJ4A 1IY4A 1UCOA 2F2NA 2YSSC 1D0LA 2ZNXY 2ZYPA 4WL7A 5I54A 5IELA 4ETEA 1BWJA 1HNLA 6LYZA 4II8A 3N9EA 4R6CA 1G7LC 1WQPA 2ZIJA 1IVMA 3W6DA 2MEAA 1GXV2 2BQOA 3LZTA 2HUBA 4HP0A 4XYYA 5C6LA 3B72A 4H93A 1GFUA 1C45A 2F4AA 5DN4A 4WMGA 1BVXA 1D0MA 4OWHA 1HEWA 4RDSA 3EBAB 1HFYA 1KXWA 4LT0A 1JEFA 4YOPA 3TXDA 4ETDA 1LKRA 1GE3A 2DQHY 2BQKA 4XADA 2BAAA 4DYGA 5F81A 4FDYA 4IATA 3W6EA 1GFAA 1OUEA 2XBRA 3HBDA 4M4OA 1BGIA 1DZBX 1IWVA 1FLYA 1BB5A 2C8OA 4LT2A 4NHIA 5DLAA 5DM9A 1GFJA 4QY9A 4AGAA 5B05A 5C6JA 4XJIA 2BQIA 1JHLA 1JTPL 2ZIKA 3CSQA 2H5ZA 5K7OA 5J7CA 1WTNA 4MR1A 1GF7A 1B7QA 1GBXA 1F6RA 5T3FA 2YBLA 4DDCA 1OUFA 4I0CA 2MEIA 1BWIA 1OP9B 1HMKA 4HPEA 1D9UA 3E3DA 3AYQA 1TCYA 4BADA 1LHJA 4LYCA 5APEA 1B7PA 1JKCA 1LSFA 1LYZA 2YBMA 1IP5A 3M18B 3CQLA 5LVIA 3WU8A 4ET9A 1AT5A 1B5YA 4WM4A 1XGUC 5B59A 4GN4A 5KXXA 1LYYA 4ML7A 1I56A 1RFPA 4DD1A 1TEWA 5LXWA 193LA 1REZA 2CGIA 3P66A 3OK0A 4MCKA 4CFOA 1W08A 1CKCA 1VDSA 1LZ5A 1GE1A 1D0KA 2Q0MX 3AW6A 1GFEA 4DT3A 2HECA 5KXKA 1XFPL 3KAMA 1YANA 1GAZA 2MECA 1CJ7A 1OUBA 4Z41A 4ZIXA 1LPIA 4NGJA 1GXXA 1B7MA 4H9HA 3EXDA 1LKSA 1HMLA 1VATA 1QSWA 3N9AA 5B07A 5LVJA 1GB3A 4PPOA 1LZCA 1LYSA 5DN5A 1GEVA 1T6VL 4RW1A 1GF0A 1YAOA 1GHLA 2G4PA 3W6FA 4WL6A 2LZ2A 2XTHA 1LZ4A 2HU1A 1IC5Y 1LJ3A 2HEAA 1IOCA 1RCMA 4KPMA 5LIOA 4NSJA 1LJIA 2CJLA 5IDDA 1JUGA 4PRUA 5HLLA 3WU9A 1WQRA 2MEGA 4NGOA 4WO6A 4RLMA 1DKKA 3IJVA 4B4IA 1WQNA 5M1YA 2DQCY 1B5WA 1LZDA 2YDGA 3A3QA 2HEFA 5D5FA 5HMVA 4L41A 4LT1A 9LYZA 1GF3A 1GB7A 1MLCE 5FELA 1I1ZA 4WLYA 5KY1A 1LSAA 4E3UA 4DC4A 3WPKA 1LZ9A 2YBJA 2IFFY 1AT6A 4YEOA 4M6DA 5E4PA 4J0LA 1JSEA 4H9EA 3A8ZA 4B4EA 1CJ9A 2BQGA 3ZVQB 4ETAA 5FHWA 4G4BA 1JTOL 1D6PA 2MEDA 1W6ZA 1LMPA 1ZV5L 4GN5C 3RNXA 1AKIA 1B2KA 134LA 1UIAA 5F16A 4LGKA 1CKDA 2ZQ3A 3A93A 5A3ZA 1C46A 3TMWA 2BQMA 4B49A 4NG1A 1DI4A 1KIQC 1SQ2L 1B7NA 1V7SA 1JKDA 4YM8A 4ANRA 1GF8A 5LA8A 4ZEEA 1UIFA 1GF9A 1LJNA 208LA 3IWRA 1HHLA 1HF4A 5KJ9A 3AB6A 4N5RA 4TSCA 1NDGC 5IHGA 1HC0A 5LINA 1XGRC 4IJ4A 3WPLA 4PRQA 2BQEA 4NHSA 3B6LA 1XGQC 4B1AA 1B7RA 1AZFA 3CSRA 1EL1A 1FKQA 1YQVY 1ZVYB 4NGLA 4TSBA 4NWEA 4GCCA 4XN6A 1LJGA 3A96A 1IP1A 1IWXA 1JJ1A 3A95A 4PHIA 3ZEKA 4W96A 1E8LA 1LSPA 1REXA 4WG1A 1GAYA 3HFMY 5KXTA 4Z46A 3CSZA 1LZRA 1TDYA 1YKYX 3WUAA 1BB6A 1LSNA 1LZ1A 5DL9A 2PC2A 2B5ZA 4NHTA 4TTDA 8LYZA 1IIZA 1B5VA 1FLWA 1GBWA 3LHMA 6LYTA 5HQ1A 3B0OA 4FJRA 1LOZA 2DBTA 4LYMA 4LYOA 1IORA 2D4KA 5D5CA 4D9ZA 133LA 1OUAA 4WM6A 1GBZA 2EPEA 5ILCA 1XSFA 3TXFA 4NIJA 1SLYA 4PGJB 4XJDA 3AZ7A 1NHEA 4NGVA 1I20A 1NMMA 3GXRA 3W6AA 5KXRA 2W1YA 4NGZA 5KXWA 1BVKC 1C7PA 1LSZA 2BPUA 4NSGA 2F4GA 4BAFA 4XJBA 1TAYA 1WQQA 1B5XA 1LSDA 3J6KA 153LA 5B1GA 4NG8A 2D91A 3D3DA 4H9IA 1JTTL 4XJFA 3ATOA 1JISA 2BQJA 4TWSA 2LYMA 4WM5A 4WO9A 1GE0A 3K3TA 4UWUA 5HMJA 3TXGA 2YBIA 4NHPA 1QIOA 1F6SA 1YAMA 3QE8A 1HELA 4ETCA 1WVVA 4WM2A 1C08C 1IY3A 1JSFA 1KIRC 1DI5A 1WQMA 4HJVA 1FDLY 4BS7A 1LJFA 3RT5X 2BLYA 5I53A 4HSFA 4HV1A 1LMOA 4EMNA 194LA 4H8XA 3TMVA 1CJ8A 1YL0X 2BQHA 4LFXA 1JITA 2W1MA 3J4GA 5LYTA 4NGWA 4H94A 4H1PA 4QEQA 1VDTA 4NY5A 4G4HA 1YAPA 1LYOA 1UIEA 1N4FA 1B7LA 2XJWA 3D9AC 4J1AA 3EMSA 4WOAA 1GFRA 1LZSA 5APCA 1IOQA 1NBZC 4NFVA 4C3WA 1CNSA 1UUZC 1GB9A 1REMA 4CJ2A 1G7MC 1IR9A 1G7HC 3MGWA 5F14A 1YAQA 3WUNA 1B9OA 2HTXA 4HTQA 4DD2A 5FEKA 5KXOA 2BQCA 2D6BA 3LYOA 1GE4A 5B06A 1JKAA 1GDWA 4LYBA 1EQ4A 1HEQA 3WW6A 1YROA 3WYHA 154LA 4OWAA 1LJEA 1A4VA 2X0AA 5LAGA 5E9RA 3AW7A 1JPOA 1JIYA 3AGHA 1B7OA 2FYDA 2HU3A 4HTNA 4WM3A 4EOFA 4LFPA 4GCBA 3WW5A 1IOTA 1ALCA 4DD0A 2Z19A 1GD6A 3AZ4A 3AZ5A 3P64A 1QQYA 1V7TA 5FCPA 1IWZA 4TUNA 5HNLA 1RI8B 1T3PA 2Z12A 4G4CA 3OJPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4R0FA 4HTKA 1LPYA 1NWGA 2MEBA 1SWZA 1MELL 2NWDX 4GCEA 2Q9DA 3A94A 4N9RA 3A6CY 4Z98A 1GEZA 2FYCA 2F2QA 1DQJC 1YKXX 1LZTA 1UC0A 3C7ZA 1EQ5A 5APDA 3A34A 5KKIA 3LZ2A 1L11A 1GFHA 1IC4Y 1L0KA 1LGXA 1HEOA 3B0KA 5KXLA 4DQJA 2VB1A 5F9UA 1QDTA 173LA 252LA 1GB2A 3HT6A 1LMCA 1NF5A 5KXMA 4OW1A 4I7RA 3T36A 1PQDA 4J7VA 141LA 1GF5A 1LMNA 2OU0X 1DPXA 1C66A 3CB7A 1LZ6A 1IR7A 1XEIA 207LA 1L59A 3A90A 1L55A 3P4ZA 152LA 3WXTA 1PQMA 2FBDA 4G49A 1L22A 2BQDA 5FSTA 4WLTA 5KXSA 4H9AA 2YBNA 3DN8A 4LT3A 2O79A 5KXNA 246LA 2CUUA 1L73A 1L17A 1L18A 1GBOA 4OWCA 3F8VA 1L89A 1AM7A 234LA 3CDQA 2FBBA 3A3RX 2MEFA 1VDPA 4CFPA 3G3VA 166LA 2QARC 4DD3A 1HFXA 118LA 5KXPA 1LAAA 1GB8A 2I26L 3WVYA 4RLNA 1D2WA 1LSCA 1IP7A 3WMKA 1YL1X 3PDSA 1LI3A 251LA 4YENA 5AMYA 1L83A 2HEDA 4LDLA 2IHLA 1L69A 1J1PY 1G7IC 1KY0A 3UONA 2MEEA 1GF6A 5I5QA 4Z3MA 2RAYX 1IP2A 243LA 2Y8PA 259LA 4PJ2C 3A92A 4H9BA 1C6GA 218LA 143LA 1LYEA 4N0JA 3P65A 4XENA 4DD9A 1BHZA 5EBHA 1G0KA 1RE2A 1UBZA 4OO9A 3HDFA 191LA 3QY4A 1D3MA 4EPFA 2LYOA 1GFKA 4MSTA 2LCBA 144LA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2I6Z A;  1ZVH L;  4IAS A;  4R0F A;  4B4J A;  3LYZ A;  4HTK A;  4WG7 A;  3ZVQ A;  1H6M A;  5L3I A;  2DQI Y;  4H9C A;  1JJ0 A;  3F6Z A;  2D4I A;  3TMX A;  1NWG A;  2MEB A;  3IJU A;  1NDM C;  4NGI A;  1OUG A;  1QUS A;  1MEL L;  1WVU A;  2NWD X;  4GCE A;  4N8Z A;  3A94 A;  1BB3 A;  4N9R A;  4NSI A;  1QUT A;  3BKH A;  1EQE A;  3TXI A;  5LVG A;  3A6C Y;  1LHL A;  1GEZ A;  2FYC A;  1OUC A;  2A7F A;  3G3B B;  4Z98 A;  1OUJ A;  4AXT A;  3ULR A;  4NSH A;  1DQJ C;  4WLX A;  5KXY A;  5KKJ A;  5LVH A;  1YKX X;  2G4Q A;  1LZT A;  2LZT A;  2Z2F A;  1UC0 A;  1EQ5 A;  5F9X A;  4H91 A;  5APD A;  5L9J A;  1YKZ X;  1FN5 A;  3A34 A;  5KKI A;  3LZ2 A;  3GXK A;  1GFH A;  1IC4 Y;  3VWO A;  1HEO A;  2DQJ Y;  3B0K A;  3CT1 A;  5KXL A;  1GBY A;  1TBY A;  4QGZ A;  1IP4 A;  2VB1 A;  4A7D A;  2CDS A;  3WU7 A;  3TXE A;  1LZN A;  3FI7 A;  3AJN A;  4I8S A;  5FDJ A;  5F9U A;  1QDT A;  5I4X A;  4HPI A;  1GB2 A;  1HFZ A;  1IWW A;  4DDB A;  3RZ4 A;  2LHM A;  1LHM A;  4W94 A;  3LYM A;  3WL2 A;  2ZQ4 A;  3M3U A;  1LMC A;  1NF5 A; 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 3D3D A;  4H9I A;  1JTT L;  4XJF A;  3ATO A;  1JIS A;  2BQJ A;  4TWS A;  2LYM A;  4WM5 A;  4WO9 A;  1GE0 A;  3K3T A;  4UWU A;  5HMJ A;  3TXG A;  2YBI A;  4NHP A;  1QIO A;  1F6S A;  1YAM A;  3QE8 A;  1HEL A;  4ETC A;  1WVV A;  4WM2 A;  1C08 C;  1IY3 A;  1JSF A;  1KIR C;  1DI5 A;  1WQM A;  4HJV A;  1FDL Y;  4BS7 A;  1LJF A;  3RT5 X;  2BLY A;  5I53 A;  4HSF A;  4HV1 A;  1LMO A;  4EMN A;  194L A;  4H8X A;  3TMV A;  1CJ8 A;  1YL0 X;  2BQH A;  4LFX A;  1JIT A;  2W1M A;  3J4G A;  5LYT A;  4NGW A;  4H94 A;  4H1P A;  4QEQ A;  1VDT A;  4NY5 A;  4G4H A;  1YAP A;  1LYO A;  1UIE A;  1N4F A;  1B7L A;  2XJW A;  3D9A C;  4J1A A;  3EMS A;  4WOA A;  1GFR A;  1LZS A;  5APC A;  1IOQ A;  1NBZ C;  4NFV A;  4C3W A;  1CNS A;  1UUZ C;  1GB9 A;  1REM A;  4CJ2 A;  1G7M C;  1IR9 A;  1G7H C;  3MGW A;  5F14 A;  1YAQ A;  3WUN A;  1B9O A;  2HTX A;  4HTQ A;  4DD2 A;  5FEK A;  5KXO A;  2BQC A;  2D6B A;  3LYO A;  1GE4 A;  5B06 A;  1JKA A;  1GDW A;  4LYB A;  1EQ4 A;  1HEQ A;  3WW6 A;  1YRO A;  3WYH A;  154L A;  4OWA A;  1LJE A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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