4OWBA

Cisplatin binding to hewl under sodium bromide crystallisation conditions
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
publication title Chemical conversion of cisplatin and carboplatin with histidine in a model protein crystallized under sodium iodide conditions.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
total genus 44
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2014-01-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4owbA00
1IR7A 4LYCA 3P65A 1B2KA 2BQBA 2FYCA 5AMYA 1KIPC 4XJHA 1LSPA 4J1AA 3WUAA 1RFPA 1CNSA 4GLAA 1IP7A 1OUFA 5JENB 5FEKA 5KXYA 1Z55A 5F81A 4LYMA 4ET8A 2HUBA 2RSCA 1HSWA 1LSMA 2DQIY 5HMJA 1JEFA 154LA 1JKAA 1LHLA 1ZVHL 1JPOA 5LAGA 5KXWA 1LHKA 1BB5A 2HEBA 2LZ2A 1BQLY 1LHHA 3EXDA 1BVKC 3B6LA 4NGKA 1RI8B 3QY4A 1GBZA 2D91A 1XGPC 1LZ9A 3A94A 4HJYA 4R6CA 1GDXA 3B72A 4GN5C 2Z2EA 3HFMY 4UWNA 2MEBA 3N9CA 3TXEA 1B7NA 4B4IA 1CJ7A 1LMAA 5APDA 1GFGA 1IC5Y 1WQRA 1DXJA 5C6LA 1QUSA 1DKJA 4ETCA 1IOTA 4ZIXA 1IP1A 1IORA 1LMTA 4BADA 1OUBA 3A96A 4LYZA 3P68A 1JKBA 4W96A 1QTEA 1HFYA 5LVKA 1LJNA 2XTHA 4RDSA 1EQ5A 1VDPA 1UCOA 3D3DA 4TUNA 2DBTA 3BKVA 4HJVA 4KPMA 4DD2A 4NGWA 3AZ6A 5FSTA 1WQOA 4G4BA 4Z46A 2BQFA 5APFA 9LYZA 2W1MA 1OUDA 2Z19A 1F0WA 4N1CC 3CSQA 1IY4A 3QNGA 3P66A 2W1YA 4NGIA 1VAUA 4YEMA 4WLDA 1UIDA 4GCBA 1HEMA 1QIOA 1UIBA 3K3TA 1GF0A 3GXRA 4ETAA 1LJHA 4NFVA 2C8OA 3HBEX 2D4JA 1LZ4A 2CWIA 1KIQC 2H5ZA 4RW1A 1NKHA 4UWUA 3A8ZA 4YEOA 4ETDA 1DI3A 1JSEA 1V7TA 3CT0A 2BQEA 5FHWA 1LSNA 3G3BB 2MEAA 3OJPA 4PRUA 1GXV2 1YQVY 1HEWA 2XBSA 4X3BA 5KXOA 3ZVQB 1H6MA 1IWVA 1D6QA 2ZQ3A 2F4GA 4GCCA 4QEQA 4OOOA 4E3UA 1NDGC 1JTTL 1BB7A 3HBDA 1IP2A 4LT2A 5KXNA 4H94A 1DQJC 1WVVA 4WM2A 2MEFA 3AZ4A 3P4ZA 4NHTA 4P2EA 2LYOA 3AW7A 1F6RA 3W6DA 4CHXA 5F16A 4DD9A 4H9IA 1XGTC 2Z37A 5B59A 1IOSA 3A92A 1DPXA 4XYYA 1GE3A 3AGHA 1B5VA 1UACY 1YROA 1JITA 4BS7A 5LXWA 1KXYA 1N4FA 1FLUA 3E3DA 4I8SA 3TMUA 1GEZA 3WULA 2BLYA 1BWIA 2HEEA 3CT1A 2YBLA 3WVYA 1YKYX 2EKSC 2A7DA 2HTXA 2BQMA 1WTMA 1CKFA 2EQLA 1HEQA 3ULRA 4NG1A 1HFXA 3EBAB 4PPOA 3WL2A 1EQ4A 3TXJA 3A3QA 4KXIA 1YAMA 3A90A 3IJVA 1GDWA 3A34A 1GF9A 1NWGA 1W6ZA 2MEEA 3WPKA 4AGAA 2YBIA 1REYA 4XJGA 3AJNA 1JTOL 1GFRA 4DDCA 3RW8A 1YAQA 4M4OA 4NSGA 2ZNWY 1HC0A 1GFTA 4GCFA 1D0KA 1IWZA 5K7OA 4WO6A 3CB7A 1IWTA 3AW6A 1QTKA 1GE0A 1RJCB 208LA 2D6BA 3WXUA 2Y8PA 2BQAA 1XGQC 4HP0A 1EQEA 4LT1A 1YKZX 1C45A 1JWRA 1LSDA 1LZ5A 5HQ1A 1INUA 1WQQA 2HU3A 2G4PA 4HTKA 4IATA 4OWCA 2B5ZA 4RLNA 1ALCA 4RLMA 4DDBA 1LJKA 4WM5A 4EOFA 5B1FA 1LJ4A 1FBIX 1NDMC 4LYTA 1JUGA 3LHMA 1UIHA 5II3A 5HNCA 1O23A 4WL6A 1IP4A 1I56A 1YL0X 1GXXA 1JJ3A 2Q0MX 4WM3A 1HELA 1QDRA 2VB1A 2Z2FA 3MGWA 5FDJA 4C3WA 1IO5A 1AT6A 1HNLA 3W6AA 1KXXA 3WH1A 1LZBA 5DLAA 1LZSA 5KXZA 2G4NA 1CKDA 3VWOA 3TXBA 1J1OY 4G9SA 1IWXA 5L9JA 1NBYC 4MSTA 1NQIA 3A93A 1IWUA 3CSRA 4HJZA 5LA8A 1LZTA 1UBZA 4NIJA 1C10A 1IVMA 2BPUA 4KT3A 4TSCA 1FKVA 1BHZA 1BWJA 4XENA 4H8ZA 3AB6A 5L3IA 1LJ3A 1GFHA 2MEIA 1REMA 3G3AB 1IP3A 1F10A 1QSAA 7LYZA 1OUEA 1VEDA 2Z18A 4N9RA 4NSHA 4M6DA 1C7PA 1LJIA 1P2CC 1CKHA 1XEKA 1IR9A 2ZQ4A 3FI7A 1GE4A 5I5QA 5KXRA 1VATA 3RNXA 4CFPA 1GWDA 1TCYA 3A95A 4WO9A 5T3FA 1IWYA 4NHIA 4WMGA 4CJ2A 1CKCA 1XFPL 1GF8A 1YL1X 3N9EA 4O34A 3TXIA 2YBNA 1GF5A 4PRQA 4D9ZA 3F6ZA 4H9AA 1RCMA 1A4VA 1LMQA 1XEJA 1SLYA 1GBXA 4H9HA 1JSFA 5F14A 4N1EI 1PZYA 4LT0A 1IC7Y 1LSEA 4C5FA 2DQEY 4H93A 1HEOA 3WW6A 4Z3MA 3GXKA 4N0JA 1JJ1A 4Z98A 4DT3A 4NGYA 134LA 1I20A 3IJUA 1WQPA 1GB5A 2LZTA 1LJEA 1B7RA 1HERA 3CQLA 4H90A 5D5CA 4ZEEA 4YF2A 1GFKA 1B7LA 1YANA 3T36A 4GCEA 1GB9A 2Z38A 5DL9A 1XGRC 193LA 3A3RX 5I4YA 2A7FA 1TEWA 1UC0A 5APCA 4B1AA 4HTNA 3OK0A 4WOAA 4WM4A 5KXXA 3TMXA 1LCNA 2DQCY 4LGKA 4WLYA 1LSZA 1DI4A 4WLTA 1LZ8A 2D4IA 3ATOA 3QE8A 3ZVQA 4J7VA 4B4JA 5KXMA 4NHSA 1B0DA 4BAFA 1G7IC 1KXWA 1B5YA 1REZA 194LA 1JKDA 4RW2A 1G7JC 3WU7A 1HMKA 1YIKA 4HTQA 4DD7A 1GE2A 2YSSC 3WPLA 2X0AA 1HEPA 1LSBA 3TMWA 5KKIA 5KXKA 4GCDA 1LKRA 4FDYA 1GD6A 2I25L 4LT3A 2F4AA 3W3EA 4ETEA 1GAYA 4H91A 1CJ6A 1LMNA 4NGOA 1LJFA 1OUJA 2D4KA 1CJ8A 1BWHA 5C6IA 3M18B 1HENA 1LZYA 4YOPA 1D6PA 1LMPA 3ZEKA 1DZBX 3LYMA 2HEDA 2BAAA 3EO5A 1TBYA 2NWDX 4B0DA 1B5UA 1LZDA 1B7QA 1GBOA 1LYOA 1JIYA 3LYOA 4PJ2C 4NHQA 2HEAA 4MR1A 4ET9A 4KL7A 3KAMA 1BVXA 2PC2A 1JISA 1LZGA 2XBRA 5LVIA 2ZWBA 5LIOA 3J6KA 4XN6A 1LSCA 2BQNA 2C8PA 4WM1A 4Z41A 3TXFA 4H1PA 1LYYA 1WVUA 1LHIA 4I0CA 5LYMA 5A3ZA 5I4WA 135LA 4XJBA 4G49A 1LZ1A 5APEA 5IHGA 3A6BY 4YENA 1PS5A 1QDTA 2W1LA 6LYTA 2CGIA 2ZIKA 2FBBA 3AZ7A 4L41A 4OWHA 1LZRA 2ZILA 4B4EA 1GHLA 3B0IA 2BLXA 1FDLY 4N8ZA 1HHLA 4A7DA 5DN4A 4DWXA 4II8A 5EBHA 1LOZA 1LJJA 1UIEA 4NGVA 2WARA 5LVJA 4QY9A 2ZNXY 2XJWA 1J1XY 4HV2A 4FJRA 2MEDA 1AM7A 1XSFA 1OP9B 1B7MA 2HU1A 4MCKA 2BQIA 1LMOA 1UA6Y 4HSFA 3WUNA 3LN2A 1IC4Y 3AZ5A 3WMKA 5LVGA 4DDAA 5I54A 1GFVA 4NEBA 5DM9A 1BB4A 1GFAA 1OUIA 1IIZA 4U3XB 4WG1A 4AXTA 1B5XA 3BKHA 4W94A 3B0KA 4XJFA 2LYZA 4R0FA 5KJ9A 4G4HA 1LHJA 5DN5A 1IOCA 2LHMA 4H9EA 2BQOA 5IELA 2I6ZA 3TXDA 4ANRA 5HMVA 2CDSA 4DD1A 4WG7A 1GF6A 1ZVYB 1OUGA 5IDDA 3TXKA 3T6UA 5LVHA 4IASA 1BB6A 3M3UA 4QDNA 3WU9A 5J7CA 5FELA 1D9UA 2Z12A 1GFUA 4H9FA 2H9KA 4PGJB 3WXTA 3TXGA 1SQ2L 4H8XA 2YVBA 5LAFA 4HPIA 4GLVA 1LSFA 4GN4A 4OWEA 1UICA 5LYZA 1UIGA 1YILA 4NG8A 1GAZA 5M1YA 2LYMA 1YKXX 4YM8A 2N5ZA 4TX7A 2DQGY 5ILFA 5B07A 1GF7A 2DQHY 4EMNA 1T6VL 5B05A 1LSGA 3AGIA 4G4CA 1LPIA 1GBWA 1IP5A 1CKGA 1ZMYL 3TXHA 1IR8A 3LYZA 4NGZA 3WYHA 2BQDA 4OW1A 3WU8A 4NGJA 2EIZC 1EL1A 3RU5A 207LA 1MELL 1DPWA 1TAYA 5L3HA 4XJDA 1GB0A 4DD0A 1WQNA 3SP3A 1AZFA 1JKCA 1OUCA 4OWBA 1HF4A 1VDQA 3W6FA 4LYBA 3P64A 5HNLA 1W08A 4TWSA 3W6CA 132LA 1UUZC 3EMSA 5E4PA 1LSAA 5LYTA 153LA 2IHLA 2BQKA 2HEFA 4NGLA 1B7PA 1LZAA 1OUHA 2YBMA 1B7SA 1C43A 1DI5A 1QQYA 5A3EA 2I26L 1GB2A 4J1BA 1FKQA 1B5WA 1YAOA 1QSWA 1F6SA 1AT5A 3AGGG 2EPEA 3N9AA 1UIAA 4LFXA 5ILCA 4N5RA 4HPEA 2CJLA 2YBHA 2ZIJA 4NSJA 3CSZA 1BB3A 1FLQA 1VDTA 2BQLA 1OUAA 1RE2A 2BQCA 2Z39A 1GB8A 1H87A 1MLCE 2BQHA 2F30A 3IWRA 3B0OA 5B1GA 1HMLA 1FN5A 1TDYA 1KIRC 3CT5A 1NHEA 4GN3A 3D9AC 5F9UA 1HFZA 3A6CY 1LMCA 5C6JA 1GEVA 2F2NA 1IOQA 1C08C 1WTNA 4XADA 4DC4A 1C46A 1LYSA 1LZ6A 1UIFA 3WPJA 1ZV5L 2FBDA 2FYDA 4H8YA 2BQJA 1GB6A 2YDGA 4PHIA 1G7MC 4WLXA 6LYZA 1IEEA 2HECA 4OOTA 4CFOA 5KXLA 4NWHA 3LZTA 4UWVA 1FLWA 4H9BA 1LZEA 4WL7A 4XJIA 1IP6A 1LKSA 5D5FA 1GB3A 3WUMA 1QUTA 3RZ4A 2G4QA 4QGZA 2DQDY 1HSXA 5F9XA 1IX0A 2DQFC 4LYOA 4TTDA 4HV1A 4DYGA 3AYQA 1J1PY 4NY5A 5KXSA 1LAAA 1XEIA 2BQGA 2DQAA 5KXPA 1G7LC 4ML7A 1DKKA 1GBYA 2W1XA 1LTMA 4J0LA 5I4XA 1WQMA 5FCPA 1NMMA 3LZ2A 4OWAA 3A91A 5LINA 4NSIA 1V7SA 5B06A 1IY3A 1JHLA 133LA 1GB7A 1GFJA 2MEHA 3TMVA 4ZFPA 2AUBA 3A67Y 4B49A 4H92A 1GBSA 1GF4A 1LZNA 4BAPA 3WW5A 1FLYA 3RT5X 2MEGA 2H9JA 1LYZA 2YBJA 3W6BA 1B5ZA 5LA5A 1BGIA 1IWWA 1JTPL 1OQMA 1LJGA 2GV0A 2ZYPA 1D0MA 1LHMA 1CJ9A 3ATNA 5I53A 3W6EA 2ZYCA 8LYZA 1JJ0A 1G7HC 2IFFY 4NHPA 4NWEA 4LZTA 1GE1A 4DD3A 4CGEA 1GFEA 2DKVA 1GF3A 1A2YC 4ETBA 5KKJA 1LZCA 2MECA 5KY1A 1VFBC 4LFPA 1E8LA 1XGUC 3WVXA 1REXA 1AKIA 4WM6A 4IJ4A 4TSBA 1B7OA 1GPQC 3LYTA 1T3PA 1NF5A 4H9CA 3FE0A 1LSYA 3HBHA 1I1ZA 1VDSA 5HLLA 5KXTA 1NBZC 1D0LA 1B9OA 3J4GA 5E9RA 2DQJY 1YAPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1B2KA 2FYCA 1KIPC 4XJHA 1CNSA 4GLAA 1OUFA 5FEKA 4ET8A 1HSWA 1L96A 1LSMA 5HMJA 1JEFA 1OWYA 1XEPA 5LAGA 3EXDA 161LA 1LHHA 3QY4A 1XGPC 3A94A 1L86A 107LA 4B4IA 200LA 1GFGA 4EXMA 1EPYA 1LMTA 1JTNA 1QTEA 1EQ5A 2DBTA 3AZ6A 5FSTA 4G4BA 1G0MA 2W1MA 1L07A 1OUDA 3QNGA 4WLDA 111LA 1DYFA 1L72A 1QIOA 2C8OA 3HBEX 3C81A 1KIQC 4RW1A 1NKHA 4UWUA 1JSEA 3HUQA 2BQEA 2QB0B 5FHWA 2OE9X 1TLAA 219LA 195LA 4X3BA 1L04A 2ZQ3A 2F4GA 4QEQA 1D3FA 5KXNA 4H94A 4WM2A 3P4ZA 168LA 4P2EA 1XGTC 2B73A 123LA 2F2QA 3A92A 4XYYA 1JITA 1C6DA 3E3DA 1GEZA 1BWIA 2HEEA 1L35A 2YBLA 1L52A 1HEQA 3ULRA 4NG1A 4YXAC 4KXIA 1YAMA 3A90A 185LA 1GDWA 2OU8A 1GF9A 1NWGA 1W6ZA 3A34A 165LA 2B6ZA 3AJNA 2F32A 1L77A 1L58A 1SWYA 1GE0A 1RJCB 174LA 208LA 3WXUA 2BQAA 4EKPA 1EQEA 4LT1A 1C45A 1JWRA 1LSDA 3SB7A 213LA 2HU3A 2G4PA 4HTKA 1P2LA 2B5ZA 4DDBA 2OE4X 3GUOA 1LJKA 1FBIX 162LA 1DYEA 4LYTA 1UIHA 5II3A 1KXXA 3C8QA 1L85A 1LZSA 3VWOA 3CDTA 249LA 1IWXA 4DQ7A 4MSTA 1L06A 1IWUA 1QTCA 1LZTA 1FKVA 4XENA 5L3IA 2MEIA 1T8GA 1QSAA 1OUEA 1VEDA 1L32A 5I5QA 1CKHA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1IR7 A;  4LYC A;  3P65 A;  1B2K A;  2BQB A;  2FYC A;  5AMY A;  1KIP C;  4XJH A;  1LSP A;  4J1A A;  3WUA A;  1RFP A;  1CNS A;  4GLA A;  1IP7 A;  1OUF A;  5JEN B;  5FEK A;  5KXY A;  1Z55 A;  5F81 A;  4LYM A;  4ET8 A;  2HUB A;  2RSC A;  1HSW A;  1LSM A;  2DQI Y;  5HMJ A;  1JEF A;  154L A;  1JKA A;  1LHL A;  1ZVH L;  1JPO A;  5LAG A;  5KXW A;  1LHK A;  1BB5 A;  2HEB A;  2LZ2 A;  1BQL Y;  1LHH A;  3EXD A;  1BVK C;  3B6L A;  4NGK A;  1RI8 B;  3QY4 A;  1GBZ A;  2D91 A;  1XGP C;  1LZ9 A;  3A94 A;  4HJY A;  4R6C A;  1GDX A;  3B72 A;  4GN5 C;  2Z2E A;  3HFM Y;  4UWN A;  2MEB A;  3N9C A;  3TXE A;  1B7N A;  4B4I A;  1CJ7 A;  1LMA A;  5APD A;  1GFG A;  1IC5 Y;  1WQR A;  1DXJ A;  5C6L A;  1QUS A;  1DKJ A;  4ETC A;  1IOT A;  4ZIX A;  1IP1 A;  1IOR A;  1LMT A;  4BAD A;  1OUB A;  3A96 A;  4LYZ A;  3P68 A;  1JKB A;  4W96 A;  1QTE A;  1HFY A;  5LVK A;  1LJN A;  2XTH A;  4RDS A;  1EQ5 A;  1VDP A;  1UCO A;  3D3D A;  4TUN A;  2DBT A;  3BKV A;  4HJV A;  4KPM A;  4DD2 A;  4NGW A;  3AZ6 A;  5FST A;  1WQO A;  4G4B A; 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 6LYZ A;  1IEE A;  2HEC A;  4OOT A;  4CFO A;  5KXL A;  4NWH A;  3LZT A;  4UWV A;  1FLW A;  4H9B A;  1LZE A;  4WL7 A;  4XJI A;  1IP6 A;  1LKS A;  5D5F A;  1GB3 A;  3WUM A;  1QUT A;  3RZ4 A;  2G4Q A;  4QGZ A;  2DQD Y;  1HSX A;  5F9X A;  1IX0 A;  2DQF C;  4LYO A;  4TTD A;  4HV1 A;  4DYG A;  3AYQ A;  1J1P Y;  4NY5 A;  5KXS A;  1LAA A;  1XEI A;  2BQG A;  2DQA A;  5KXP A;  1G7L C;  4ML7 A;  1DKK A;  1GBY A;  2W1X A;  1LTM A;  4J0L A;  5I4X A;  1WQM A;  5FCP A;  1NMM A;  3LZ2 A;  4OWA A;  3A91 A;  5LIN A;  4NSI A;  1V7S A;  5B06 A;  1IY3 A;  1JHL A;  133L A;  1GB7 A;  1GFJ A;  2MEH A;  3TMV A;  4ZFP A;  2AUB A;  3A67 Y;  4B49 A;  4H92 A;  1GBS A;  1GF4 A;  1LZN A;  4BAP A;  3WW5 A;  1FLY A;  3RT5 X;  2MEG A;  2H9J A;  1LYZ A;  2YBJ A;  3W6B A;  1B5Z A;  5LA5 A;  1BGI A;  1IWW A;  1JTP L;  1OQM A;  1LJG A;  2GV0 A;  2ZYP A;  1D0M A;  1LHM A;  1CJ9 A;  3ATN A;  5I53 A;  3W6E A;  2ZYC A;  8LYZ A;  1JJ0 A;  1G7H C;  2IFF Y;  4NHP A;  4NWE A;  4LZT A;  1GE1 A;  4DD3 A;  4CGE A;  1GFE A;  2DKV A;  1GF3 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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