3A6BY

Crystal structure of hyhel-10 fv mutant ln32d complexed with hen egg white lysozyme
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Immune system/hydrolase
molecule keywords Lysozyme binding ig kappa chain V23-J2 region
publication title Contribution of asparagine residues to the stabilization of a proteinaceous antigen-antibody complex, HyHEL-10-hen egg white lysozyme
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
total genus 45
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2009-08-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
Y PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3a6bY00
2BQKA 1BB5A 4ZFPA 3W3EA 1B5UA 1RI8B 2RSCA 2Z19A 4HSFA 3T36A 4YEMA 1D0MA 1LMPA 1W08A 1YL1X 2I6ZA 3CT5A 5T3FA 154LA 1IR7A 1LHLA 1IVMA 1LMTA 1HMLA 1YIKA 1CKCA 1LZTA 2MEHA 4OWAA 4PRQA 3IJVA 3M18B 2BQBA 5LVKA 4C5FA 4II8A 4ETCA 1A4VA 1UIFA 3TXEA 2BQIA 1DI3A 1C45A 4WM2A 4XJFA 4GN4A 1LZSA 2CGIA 3G3BB 4LT1A 3A67Y 1GFJA 4QGZA 3CQLA 1PS5A 3EBAB 4H9BA 4WG1A 5C6JA 1VFBC 3P65A 1G7LC 5F9XA 5F9UA 1QTEA 1GAYA 1LZ6A 5FELA 1G7IC 1WQPA 3RZ4A 1GAZA 1QUSA 3CSZA 4M4OA 4MR1A 1IOSA 2BQAA 5JENB 4DC4A 4XJDA 3WVXA 4OW1A 1GF6A 3RU5A 1KXYA 3EXDA 4H8YA 4Z46A 1LHIA 1J1OY 4BS7A 4H9IA 5J7CA 2YBIA 4HTNA 1NWGA 1YKZX 5L3IA 1CKGA 1LZ5A 2ZQ3A 4YENA 1KXXA 1GPQC 1LSEA 4WO9A 1XSFA 5I4WA 1D0LA 3E3DA 2D4KA 4WM4A 1B5YA 3WPLA 2EPEA 4N1CC 1GDWA 1IO5A 2BQOA 4EMNA 2IFFY 1IP7A 1G7JC 4HV2A 5A3EA 2MEEA 4BADA 3A6CY 1LPIA 5B1FA 1KIPC 3AZ7A 4RDSA 1ALCA 3TXKA 1JKDA 1XEJA 4NGLA 1JTOL 5DL9A 1B9OA 4WLTA 5LYTA 4NSGA 1QIOA 2WARA 4YEOA 2DQCY 1GE0A 4WMGA 1GB8A 132LA 1GBYA 1KXWA 1YL0X 4OWHA 4PRUA 3HFMY 1CKFA 1NHEA 2HU3A 3CT0A 1IEEA 5E9RA 5B59A 1T6VL 3TXGA 4NSHA 3B0IA 4DD0A 4DYGA 1AM7A 1C10A 2DQFC 5HMVA 4NSJA 4NY5A 1JJ3A 1I1ZA 4ETBA 4NG8A 1AKIA 1IC7Y 1SQ2L 2BQJA 1UBZA 1BVXA 1KIRC 1V7TA 2YSSC 3W6EA 2XBSA 1YAPA 1REMA 2Y8PA 2W1YA 1GXXA 3TXJA 3RW8A 1TAYA 1IR8A 1BB4A 3WPJA 4H8XA 4ET9A 1LSAA 4DDBA 3A90A 1QDRA 4J0LA 1D9UA 3FI7A 1IC4Y 4GCFA 5LVHA 2HTXA 1LKRA 5L9JA 5APEA 1YAOA 2EIZC 4GCCA 1F6RA 3QE8A 4B4IA 1KIQC 1REZA 1LHJA 5LXWA 1D6PA 3A95A 1VATA 1EQ5A 1HEQA 1NQIA 1LZCA 2ZIKA 4WLYA 1AT5A 3A3RX 3TMWA 3TXFA 1GBSA 4BAFA 1C7PA 1GEZA 1IC5Y 4LT2A 5A3ZA 1FBIX 2DBTA 2MEGA 4TSBA 1LZYA 1JEFA 5HQ1A 4HV1A 2YBNA 4NWHA 4XJBA 1C46A 1VAUA 5B07A 1SLYA 1CKHA 1LSZA 5E4PA 4LYOA 3FE0A 4H91A 4DDAA 1JJ0A 1LJHA 2Z37A 2LHMA 4I8SA 3VWOA 1JSEA 1LYZA 4ZIXA 1LMOA 3WW5A 4YM8A 3AYQA 3GXKA 2F30A 1OUBA 1NDMC 3MGWA 1B5WA 4WM5A 5K7OA 1UIBA 2YVBA 2BLYA 1TDYA 5FSTA 1IY3A 1WVVA 4LZTA 3WUNA 1LZ8A 4H9FA 3RNXA 1IY4A 4NGWA 4LYBA 3N9AA 2ZWBA 1O23A 1HFZA 3A34A 1QSAA 3GXRA 3G3AB 1DPWA 1GF8A 1GWDA 2DQEY 2FBBA 2LYMA 2HEEA 4OWEA 5APCA 2Z38A 1GB3A 4GN3A 4WLDA 3W6CA 1FDLY 3AGIA 5I5QA 1LSCA 4N0JA 3B6LA 1PZYA 2B5ZA 3LHMA 3P66A 3K3TA 4R0FA 1UIGA 1IORA 1GB2A 4OOOA 5HNLA 3WUAA 1H6MA 1HEPA 5KXMA 4NEBA 1JISA 5KXYA 5APDA 4N1EI 3EO5A 4RW2A 1IP2A 1JUGA 3LYZA 4FJRA 4AGAA 1WQOA 8LYZA 2ZNWY 1YROA 4G4BA 4LGKA 1GFGA 6LYZA 2MECA 3WUMA 1INUA 1LZRA 1LJGA 2D4IA 208LA 4NGYA 1GF3A 1LJ4A 2CWIA 1ZVYB 134LA 2HEFA 1LTMA 3LYMA 5F16A 1JSFA 1WQQA 3LN2A 4NHIA 1B7OA 2BPUA 1LHMA 1FLYA 1NDGC 4DD2A 4LYMA 4LT3A 1LSBA 2XTHA 5LYZA 1AT6A 1QQYA 1LSYA 2ZYPA 1IP3A 2DQDY 3P4ZA 4UWNA 3SP3A 1I20A 4GLVA 5C6IA 1QUTA 3BKVA 1TCYA 5HMJA 2BQNA 1GE2A 1LHHA 1LSPA 3OK0A 4OWCA 1NBZC 1LKSA 1LZGA 4H8ZA 4HTQA 3W6FA 2G4PA 3AW6A 1CJ8A 3ZEKA 4ZEEA 1IWYA 1GE1A 1GFKA 5KXRA 5KXWA 4MCKA 3TMXA 1MELL 4ET8A 1YKYX 1GBOA 3IJUA 4B0DA 3AZ6A 3AGGG 5I53A 1FKQA 1BB7A 1HEMA 4DDCA 1LJKA 2BQHA 1WTNA 4KT3A 4IASA 1IWUA 4NHTA 4H94A 4ETEA 2CDSA 2PC2A 1LMNA 2XBRA 4H9EA 4DWXA 5IELA 3HBHA 1HMKA 2BQCA 3W6AA 2MEDA 5II3A 5LYMA 1GB6A 1LJEA 3D9AC 4AXTA 1DKKA 1MLCE 1YAQA 1IWXA 2IHLA 1HFXA 3LYTA 1UIEA 4O34A 1NKHA 5KXSA 1HELA 1F10A 1LZBA 1UACY 1GBXA 5IHGA 1LJIA 3A92A 1FLUA 1W6ZA 1IWWA 2ZNXY 5C6LA 3N9CA 2BQGA 4G49A 4DD3A 4WL6A 3CT1A 4PHIA 2GV0A 4LT0A 1LZAA 1B5XA 1IP6A 3WMKA 1LZEA 4G9SA 4QEQA 1UIHA 4NIJA 1GFAA 1BB6A 4GN5C 1HENA 1NMMA 3WXTA 2Q0MX 4CFPA 3B72A 1OP9B 1VDPA 1B5VA 1HEWA 3ATNA 1C43A 2HU1A 4LYZA 6LYTA 5KY1A 2G4QA 2DQHY 3TXBA 1YKXX 1V7SA 1GFEA 1JJ1A 4U3XB 1WQNA 4XN6A 1YAMA 1GB0A 5EBHA 5KXKA 4M6DA 4DD7A 1BVKC 193LA 1RJCB 1JPOA 1DI5A 2DQJY 1VEDA 1OUDA 3A3QA 3IWRA 4GCBA 2HEBA 1AZFA 2HEAA 4KXIA 3WULA 4ETDA 3WVYA 4Z3MA 4WM3A 5F14A 1DKJA 1BGIA 3B0OA 3F6ZA 2ZIJA 1HERA 3A93A 4WM6A 3AGHA 4HPIA 3WYHA 4J7VA 4ANRA 4IJ4A 5M1YA 5DLAA 1LZ1A 5DN5A 4QY9A 1VDTA 1B7SA 1GF7A 3AJNA 1GB9A 4H93A 4E3UA 1DPXA 4NSIA 4HP0A 1JKAA 3KAMA 4W94A 1IWZA 4X3BA 194LA 4CJ2A 4I0CA 1DI4A 1DZBX 1GFTA 1HNLA 1B7NA 1UA6Y 4LFPA 1UCOA 3A94A 3ZVQB 1D0KA 4P2EA 4CGEA 2D91A 1LSNA 5HNCA 3J6KA 1YANA 3OJPA 1FKVA 1GB7A 4L41A 2H5ZA 1GBZA 4YF2A 1OUFA 1CKDA 2YBMA 1LJNA 1LAAA 1ZV5L 4RLNA 2Z18A 1BWHA 2AUBA 1CJ9A 2W1XA 1OUIA 3P68A 4H92A 4RLMA 2BQFA 2D4JA 2F2NA 1BHZA 2LZ2A 2BLXA 5B05A 1HSWA 1GB5A 4IATA 5LINA 1BWIA 3W6DA 1XEKA 3A96A 3ATOA 5IDDA 4DT3A 5KXLA 1GFUA 3T6UA 4G4CA 207LA 5ILFA 4NWEA 1GD6A 5KKIA 4J1AA 3WU9A 1BB3A 4NGVA 2Z12A 3LZ2A 4LYTA 3TMVA 1OQMA 1IWTA 5KXTA 5ILCA 1LSGA 2CJLA 1WQMA 3EMSA 4WLXA 1GBWA 3ULRA 1HF4A 4N9RA 1QDTA 1RFPA 3LZTA 4FDYA 1F6SA 1EQEA 4TSCA 4D9ZA 3WU7A 1DQJC 1JHLA 1NBYC 3AZ4A 1WQRA 4UWVA 4NG1A 5I54A 5HLLA 1HEOA 1LCNA 4HTKA 1H87A 1JIYA 1LJ3A 2XJWA 1E8LA 1GE4A 1ZMYL 3WW6A 1F0WA 4B4EA 4ML7A 1QSWA 1EQ4A 1VDQA 2H9KA 4N8ZA 3WU8A 1UICA 5I4YA 3TXDA 1OUGA 1IOTA 4TX7A 1LHKA 133LA 4MSTA 1Z55A 5FDJA 4BAPA 3CB7A 5LVGA 4WL7A 4NGJA 4CFOA 5I4XA 4WOAA 1RCMA 2EQLA 3AW7A 1LMCA 4GCEA 5DN4A 1JWRA 2C8OA 4NHQA 1GF0A 2W1LA 4HJVA 4PJ2C 3HBDA 1GFVA 1B7PA 5KXXA 1A2YC 1RE2A 4LFXA 1GXV2 1OUHA 4B4JA 3D3DA 3QY4A 4QDNA 1XGQC 4H9CA 1LOZA 1TEWA 2HUBA 2DKVA 1TBYA 3RT5X 1YILA 2LYOA 5LA8A 5KXOA 1UUZC 1B2KA 4WM1A 2H9JA 3J4GA 4HJYA 4XYYA 3AB6A 1GHLA 1XGUC 4GLAA 3AZ5A 5KJ9A 2FYDA 4DD1A 1YQVY 2NWDX 1B7RA 4TTDA 1FN5A 1OUAA 3ZVQA 2YDGA 1OUJA 4XJHA 3TXHA 4B1AA 4B49A 1B0DA 1B7MA 7LYZA 4XJGA 1LSDA 4C3WA 1WTMA 3A91A 1OUEA 5FEKA 5F81A 1IX0A 1CJ6A 2FYCA 1UC0A 1IIZA 1GFRA 2Z2EA 1XFPL 3CSQA 1G7MC 1LSMA 1DXJA 1P2CC 1CJ7A 2MEFA 2I26L 3N9EA 1HC0A 5LVIA 1GF9A 4NHSA 4DD9A 4GCDA 1UIDA 3HBEX 5D5FA 1IOQA 1JTPL 2BQMA 2YBLA 2BQEA 4NGZA 153LA 2MEBA 3A6BY 4NGKA 1LYOA 4XADA 1JTTL 1GE3A 2C8PA 4WG7A 4NGOA 1GDXA 1NF5A 4XENA 2LYZA 1BQLY 1GF4A 9LYZA 1LZDA 4HJZA 2EKSC 1C08C 4ETAA 4NHPA 2ZILA 1B7LA 2A7FA 3CSRA 1IR9A 3LYOA 2G4NA 4NGIA 5D5CA 3QNGA 3WPKA 4H9AA 1G7HC 1D6QA 1UIAA 1J1XY 2N5ZA 1OUCA 2FBDA 2I25L 5LAGA 4EOFA 1I56A 4XJIA 1LYYA 1XEIA 4H9HA 4Z98A 4R6CA 1EL1A 1GF5A 1IOCA 2BQDA 1LZ4A 4PPOA 1QTKA 5KXZA 1J1PY 1LSFA 3WL2A 2YBHA 1IP1A 2MEAA 1JITA 4WO6A 4HPEA 4CHXA 4W96A 2ZYCA 3M3UA 2HECA 5LVJA 4KL7A 1IP5A 1JKCA 2VB1A 1LMQA 5KXPA 4LYCA 1FLWA 5AMYA 4NFVA 4A7DA 1IP4A 5B06A 2Z2FA 2BAAA 2D6BA 1LYSA 2DQGY 1XGRC 2F4AA 2ZQ4A 3W6BA 1LJJA 4Z41A 4OWBA 1JKBA 2YBJA 1BWJA 1LZ9A 1IWVA 5LAFA 1GEVA 3TMUA 2DQAA 3A8ZA 1FLQA 1N4FA 5LA5A 2F4GA 1WVUA 4TUNA 4J1BA 1HFYA 4KPMA 4N5RA 1LZNA 2X0AA 1XGTC 5B1GA 1LMAA 5KXNA 5LIOA 1HHLA 2MEIA 1ZVHL 4H1PA 4G4HA 4UWUA 2A7DA 5DM9A 3TXIA 1B7QA 2LZTA 4PGJB 1REYA 5FCPA 1VDSA 5FHWA 2W1MA 2BQLA 1CNSA 1LJFA 2Z39A 1B5ZA 5KKJA 1XGPC 1HSXA 3B0KA 5APFA 135LA 3BKHA 4H90A 5L3HA 4RW1A 1REXA 3WXUA 2DQIY 1T3PA 3P64A 1GFHA 2HEDA 4TWSA 3WH1A 4OOTA 4YOPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3DN6A 138LA 3W3EA 1RI8B 170LA 2Z19A 4YEMA 3IJVA 3L64A 1UIFA 4WM2A 2CGIA 3G3BB 3VW7A 1PS5A 5FELA 1WQPA 4M4OA 3WVXA 1KXYA 4H8YA 1J1OY 1NWGA 1YKZX 4LDEA 1LSEA 4WO9A 1D0LA 4E97A 4WM4A 1SWYA 1L86A 2IFFY 1IP7A 1G7JC 1LI6A 2MEEA 5B1FA 1KIPC 3TXKA 1ALCA 3HH4A 1JKDA 1XEJA 4NGLA 5DL9A 1B9OA 4WLTA 1QIOA 4YEOA 2DQCY 3DMXA 102LA 4WMGA 197LA 1GBYA 1KXWA 3NYAA 3HFMY 3CT0A 1P6YA 1P2LA 5HMVA 1C10A 4NY5A 1JJ3A 3GUNA 1UBZA 1G0JA 1BVXA 2YSSC 2XBSA 2O4WA 3DMZA 1QTVA 3RW8A 1TAYA 1LWKA 3WPJA 1LYHA 4DDBA 184LA 3A90A 4I7KA 5LVHA 2HTXA 1LKRA 5APEA 1YAOA 188LA 3QE8A 1KIQC 1REZA 1L0KA 1DYEA 2L78A 1LYJA 4DJHA 1VATA 2ZIKA 1LZCA 1AT5A 1C7PA 1GEZA 4S0WA 2DBTA 4TSBA 4DKLA 5HQ1A 4HV1A 1C6PA 4XJBA 1C46A 125LA 3DN3A 1LYGA 1L47A 1LYZA 1L83A 1LMOA 3WW5A 2F30A 1OUBA 3MGWA 226LA 2YVBA 2BLYA 5FSTA 4LZTA 1L67A 4NGWA 3LZMA 1O23A 128LA 2LYMA 2FBBA 2HEEA 4OWEA 4GN3A 1FDLY 2HULA 2NTHA 3AGIA 4N0JA 4R0FA 1G0KA 3HT7A 3JR6A 3SBAA 2RBOA 4NEBA 5KXYA 4N1EI 2RB2X 1L08A 6LZMA 1NHBA 1GFGA 3WUMA 208LA 4EPFA 1LJ4A 2RAZX 3LYMA 3DN2A 3LN2A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2BQK A;  1BB5 A;  4ZFP A;  3W3E A;  1B5U A;  1RI8 B;  2RSC A;  2Z19 A;  4HSF A;  3T36 A;  4YEM A;  1D0M A;  1LMP A;  1W08 A;  1YL1 X;  2I6Z A;  3CT5 A;  5T3F A;  154L A;  1IR7 A;  1LHL A;  1IVM A;  1LMT A;  1HML A;  1YIK A;  1CKC A;  1LZT A;  2MEH A;  4OWA A;  4PRQ A;  3IJV A;  3M18 B;  2BQB A;  5LVK A;  4C5F A;  4II8 A;  4ETC A;  1A4V A;  1UIF A;  3TXE A;  2BQI A;  1DI3 A;  1C45 A;  4WM2 A;  4XJF A;  4GN4 A;  1LZS A;  2CGI A;  3G3B B;  4LT1 A;  3A67 Y;  1GFJ A;  4QGZ A;  3CQL A;  1PS5 A;  3EBA B;  4H9B A;  4WG1 A;  5C6J A;  1VFB C;  3P65 A;  1G7L C;  5F9X A;  5F9U A;  1QTE A;  1GAY A;  1LZ6 A;  5FEL A;  1G7I C;  1WQP A;  3RZ4 A;  1GAZ A;  1QUS A;  3CSZ A;  4M4O A;  4MR1 A;  1IOS A;  2BQA A;  5JEN B;  4DC4 A;  4XJD A;  3WVX A;  4OW1 A;  1GF6 A;  3RU5 A;  1KXY A;  3EXD A;  4H8Y A;  4Z46 A;  1LHI A;  1J1O Y;  4BS7 A;  4H9I A;  5J7C A;  2YBI A;  4HTN A;  1NWG A;  1YKZ X;  5L3I A;  1CKG A;  1LZ5 A;  2ZQ3 A;  4YEN A;  1KXX A;  1GPQ C;  1LSE A;  4WO9 A;  1XSF A;  5I4W A;  1D0L A;  3E3D A;  2D4K A; 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 4NHP A;  2ZIL A;  1B7L A;  2A7F A;  3CSR A;  1IR9 A;  3LYO A;  2G4N A;  4NGI A;  5D5C A;  3QNG A;  3WPK A;  4H9A A;  1G7H C;  1D6Q A;  1UIA A;  1J1X Y;  2N5Z A;  1OUC A;  2FBD A;  2I25 L;  5LAG A;  4EOF A;  1I56 A;  4XJI A;  1LYY A;  1XEI A;  4H9H A;  4Z98 A;  4R6C A;  1EL1 A;  1GF5 A;  1IOC A;  2BQD A;  1LZ4 A;  4PPO A;  1QTK A;  5KXZ A;  1J1P Y;  1LSF A;  3WL2 A;  2YBH A;  1IP1 A;  2MEA A;  1JIT A;  4WO6 A;  4HPE A;  4CHX A;  4W96 A;  2ZYC A;  3M3U A;  2HEC A;  5LVJ A;  4KL7 A;  1IP5 A;  1JKC A;  2VB1 A;  1LMQ A;  5KXP A;  4LYC A;  1FLW A;  5AMY A;  4NFV A;  4A7D A;  1IP4 A;  5B06 A;  2Z2F A;  2BAA A;  2D6B A;  1LYS A;  2DQG Y;  1XGR C;  2F4A A;  2ZQ4 A;  3W6B A;  1LJJ A;  4Z41 A;  4OWB A;  1JKB A;  2YBJ A;  1BWJ A;  1LZ9 A;  1IWV A;  5LAF A;  1GEV A;  3TMU A;  2DQA A;  3A8Z A;  1FLQ A;  1N4F A;  5LA5 A;  2F4G A;  1WVU A;  4TUN A;  4J1B A;  1HFY A;  4KPM A;  4N5R A;  1LZN A;  2X0A A;  1XGT C;  5B1G A;  1LMA A;  5KXN A;  5LIO A;  1HHL A;  2MEI A;  1ZVH L;  4H1P A;  4G4H A;  4UWU A;  2A7D A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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