4NHPA

X-ray structure of the complex between the hen egg white lysozyme and pentachlorocarbonyliridate (iii) (4 days)
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title Interaction between proteins and Ir based CO releasing molecules: mechanism of adduct formation and CO release.
pubmed doi rcsb
total genus 46
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-11-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4nhpA00
4GN5C 1KXWA 4HJYA 1B7RA 1YAPA 3CB7A 3TXGA 3WU8A 4M4OA 8LYZA 4X3BA 2HU3A 1GB7A 1LSBA 4R0FA 1GFEA 1JHLA 5B05A 1IC5Y 2BQBA 2ZIKA 5HNLA 1LHLA 1GEVA 1LZNA 2MECA 5EBHA 1D0KA 4G4CA 1UIDA 1FLYA 4TTDA 5LA5A 1HF4A 5JENB 1HEWA 4R6CA 3ULRA 2I26L 2YDGA 4XJHA 1D6PA 1LSDA 1NBYC 4LGKA 3WU7A 1UIHA 5LYTA 1WQNA 1B5XA 4DD3A 3WXUA 1F10A 3AGGG 4QY9A 4Z41A 1LSZA 1VATA 2LYOA 1GB6A 1G7LC 5D5CA 1SQ2L 3AW7A 1IWWA 3FI7A 3ZVQB 2DQIY 1UIAA 1W08A 1UBZA 3N9EA 3A8ZA 1BB5A 1OUAA 1UIGA 4NIJA 4H9EA 1IR8A 3WUAA 5LVHA 5LINA 4H9IA 2YSSC 1F0WA 154LA 1EQ4A 2Q0MX 1LZSA 1HEPA 4HTNA 5DN5A 4GLVA 1JKCA 1WTMA 3A92A 1FLUA 4RDSA 4OWAA 2MEHA 1HSWA 2Z18A 5APEA 2D4JA 4RW2A 1BB3A 1LJFA 4YM8A 2DQFC 2YBJA 3WU9A 1GE0A 4QDNA 4B4JA 5KXXA 1GXXA 1LMNA 4RW1A 1IP5A 1IOCA 1NBZC 1IP4A 1LHHA 1D0LA 1LSNA 3P65A 1GE2A 3RNXA 3TMXA 1F6SA 1IOTA 2DQHY 4IATA 1EQEA 4H92A 3W6CA 1GBOA 1NKHA 1T6VL 2MEBA 2XBSA 1E8LA 1GAYA 3ATOA 1JPOA 4ETDA 3W6EA 1YANA 3TXBA 1IORA 2HUBA 4XJGA 1IP7A 2Z39A 5KKJA 1OUCA 4O34A 4N9RA 2YBLA 4IJ4A 1EL1A 2BLYA 2DQDY 2RSCA 1HMLA 1REYA 1IP2A 1RJCB 5IDDA 1JSFA 1LCNA 5B1GA 1GF9A 2A7FA 3ZVQA 1HERA 4WM4A 4WLXA 3SP3A 1IWYA 1FDLY 1LJ3A 1HFZA 4DD0A 4WM6A 2MEGA 1TEWA 2HU1A 3QE8A 1B5UA 5B1FA 1JTPL 3A3RX 7LYZA 1B7SA 1C45A 1BVKC 2GV0A 1QTEA 4TX7A 4NGYA 4WM1A 1LJKA 4WG1A 5LYZA 4AXTA 1UUZC 1LZAA 2DKVA 3FE0A 1B7OA 3TMVA 1UIEA 1NDMC 4UWNA 2BQNA 1BGIA 4NWEA 5IELA 5HLLA 3K3TA 4U3XB 4NFVA 4H9HA 1GF5A 1JJ1A 1HEOA 4XJBA 4DDCA 2D4IA 1BWHA 1ZMYL 4BAPA 1SLYA 4H9CA 3HBEX 1RI8B 1LZCA 4TUNA 4WM3A 1WTNA 1LHKA 1LZGA 5KXKA 1JUGA 1FLWA 4H9AA 4NGWA 1IEEA 4WM2A 4H9FA 1D9UA 3P4ZA 1V7TA 3A94A 3E3DA 4ML7A 3WUMA 4NGVA 1OUGA 2F2NA 1LZEA 3B72A 1IC4Y 5B07A 3LYZA 4LYMA 5KXZA 2W1XA 1GD6A 5KXWA 4NGLA 4N1CC 4MCKA 3EXDA 1DI5A 5B06A 3QNGA 3LYMA 4YENA 4ET9A 2C8PA 2ZYPA 132LA 2CDSA 4GN3A 1O23A 4HTQA 1REXA 5C6JA 1LMCA 4H8ZA 4DD9A 1IY3A 1JITA 207LA 1LZ1A 1GE1A 4H90A 1FBIX 5K7OA 1D6QA 1DKKA 2BLXA 2ZWBA 3TXEA 4H8YA 4HPIA 1BQLY 1LZBA 4HJZA 5HMVA 1YAOA 2BQCA 1BB4A 4PJ2C 3W6AA 1UICA 1YQVY 1VDPA 4OWHA 5I54A 1CKDA 2NWDX 4LZTA 5KY1A 1JTOL 1B2KA 1GWDA 1C46A 1QSWA 5APCA 2DQGY 3J4GA 3A95A 1B9OA 1CNSA 3WUNA 4DT3A 3A96A 5LAGA 3TXDA 2DQJY 1CJ7A 1GF6A 1LZ5A 3AJNA 1XGRC 2D6BA 2D4KA 2X0AA 4QEQA 2HEBA 4XYYA 2WARA 2Z38A 3AZ6A 1GF0A 3WULA 3RZ4A 3P64A 1BWIA 4H94A 4NSJA 1XFPL 4ZEEA 4KPMA 1G7JC 1LHIA 3J6KA 3OK0A 1HNLA 1PZYA 3GXRA 4YEOA 2ZQ3A 3LN2A 2YBNA 4W94A 4WOAA 3ZEKA 1LMTA 1GF7A 1XGPC 5KJ9A 1XSFA 4YF2A 1BHZA 4LYTA 4LFPA 5A3EA 1G7IC 5FDJA 1IR9A 1AZFA 3AW6A 1MELL 1LSPA 4HTKA 4XADA 1G7HC 1REZA 4NG1A 3HFMY 5KXPA 1LZRA 4NSHA 1MLCE 2XJWA 3IJUA 5F14A 1UIBA 1GFRA 4J7VA 3A67Y 5I4YA 3WVYA 1WQMA 3CSRA 2PC2A 5KXTA 1UC0A 4DDBA 2BQAA 1QUTA 1WQRA 3A6BY 4B0DA 5F81A 4OWCA 4DD7A 153LA 4N1EI 1UACY 1IWXA 1FN5A 5D5FA 2Y8PA 4PRQA 4LYOA 1BB6A 5LAFA 4WLTA 4B4EA 4GCEA 2BQKA 2BQHA 1AKIA 1RFPA 1VEDA 4B4IA 5I5QA 1LTMA 5KXLA 1NHEA 4LFXA 4WG7A 1GFAA 4PHIA 2HEAA 5KXYA 2MEFA 1GAZA 1IY4A 2MEDA 2Z19A 1INUA 3P66A 4C3WA 2BPUA 1GHLA 1LMPA 1LJEA 1P2CC 5KXSA 4NGIA 4NY5A 1GEZA 1LSGA 4J1AA 1TBYA 2ZQ4A 3W6DA 1LKRA 5KKIA 5APFA 1CJ8A 1GFHA 5HMJA 3LHMA 1KIRC 3CT1A 4ETBA 5AMYA 2FBDA 1XGTC 1IO5A 1GDXA 3GXKA 1B0DA 1DI3A 1JJ0A 4MSTA 2ZNXY 5LVIA 3B6LA 1LZYA 5L9JA 1LJNA 1LZ4A 2YVBA 4RLMA 1LHJA 4CGEA 1JKBA 2YBHA 4NHSA 3WXTA 1OUHA 4ETEA 2XBRA 3IWRA 4LT3A 3TXHA 4NGJA 4NGOA 1GFGA 4LT1A 1YAQA 4ANRA 5LVJA 1GFJA 4ZFPA 1AT6A 3LYTA 4KXIA 4ZIXA 1LSEA 3TXKA 4DYGA 1IVMA 1I1ZA 5ILCA 4IASA 4J1BA 4GCBA 2Z12A 4XN6A 1LSFA 1LHMA 1GF3A 3RU5A 1C08C 2H9JA 2G4QA 5C6LA 4NSIA 3CQLA 4NG8A 4NSGA 4MR1A 2D91A 4WL7A 4W96A 5M1YA 1TDYA 1ZVHL 3TXIA 3A3QA 1UIFA 4NHIA 1LJGA 1XEIA 1GBZA 1NWGA 5FELA 1OP9B 4BADA 2DQCY 3B0IA 3AZ5A 4GCDA 4G4BA 4OW1A 2A7DA 4PRUA 1HELA 1ZVYB 3WVXA 1XEJA 2CJLA 1DI4A 1UA6Y 1BB7A 2H9KA 1YAMA 1YKXX 4UWUA 5FSTA 4E3UA 1RCMA 2XTHA 3BKHA 4RLNA 1VFBC 3W6BA 4DDAA 3RT5X 1JKDA 4DWXA 9LYZA 5A3ZA 1B5YA 1FKQA 4LT0A 1C43A 5KXOA 1GB9A 2B5ZA 1WVUA 1LMQA 3AZ4A 4WO6A 4OOOA 4PPOA 4OWEA 1KXXA 2EPEA 4XJFA 2EQLA 1NF5A 3HBDA 5C6IA 5L3IA 1IOSA 1WQPA 5KXMA 4UWVA 3P68A 1ALCA 4XJIA 3A6CY 1REMA 4WLDA 4M6DA 4L41A 5I4XA 1BVXA 1YROA 4PGJB 4CFOA 2G4NA 1JJ3A 1HENA 1IWUA 4HV2A 1V7SA 1LYZA 1A4VA 1AT5A 1IP3A 5I4WA 4NWHA 5KXNA 1GBYA 4ETCA 1CKHA 4YEMA 1GB2A 4NHPA 1DPWA 1LZ6A 2LYZA 3EBAB 4N0JA 1GPQC 2G4PA 1BWJA 3M3UA 2BQLA 3TMWA 194LA 1XEKA 3A91A 1H87A 3W3EA 4XJDA 1H6MA 4NGZA 1LZ8A 2F30A 1GF8A 1HC0A 2BAAA 2I25L 1OQMA 2Z37A 1B7QA 5L3HA 4KL7A 2W1MA 5F16A 1XGQC 3IJVA 4II8A 1LKSA 2BQFA 2BQDA 1C10A 3CSZA 2MEEA 3WPKA 5DN4A 1FLQA 4DD1A 1HSXA 3B0OA 4GCCA 3WYHA 1WQOA 5HQ1A 1B7MA 2W1LA 1PS5A 1WVVA 3CT5A 1GB8A 3G3AB 5J7CA 1JISA 1YL1X 1LJHA 1LJ4A 5LIOA 1C7PA 2AUBA 4TSBA 133LA 1QDTA 1VAUA 1QIOA 2LZTA 3KAMA 1B7NA 3A90A 1YL0X 1CJ6A 2ZNWY 4NHTA 2DQEY 4NHQA 3T36A 4N8ZA 3AGHA 1GXV2 2I6ZA 1DKJA 3LYOA 1I20A 1XGUC 2BQOA 4HV1A 2IFFY 2LHMA 1KXYA 1GFUA 1ZV5L 2HECA 1WQQA 1LZ9A 5FCPA 3MGWA 1LPIA 1J1OY 2FBBA 4DD2A 4HPEA 5F9UA 2VB1A 1B5WA 4QGZA 3QY4A 1DPXA 4LYZA 4FJRA 4P2EA 3VWOA 1GBSA 1IC7Y 2EKSC 6LYZA 2BQGA 4G49A 4CJ2A 3G3BB 5II3A 1CJ9A 1NQIA 1GFTA 3A34A 3N9CA 4Z3MA 6LYTA 5APDA 1CKGA 4HP0A 1LMOA 1RE2A 4WM5A 1D0MA 1OUBA 4B49A 1IP6A 1GDWA 2Z2EA 5FEKA 3RW8A 1NDGC 2HEFA 5FHWA 3HBHA 5HNCA 2DBTA 1IR7A 5LA8A 3D3DA 2ZYCA 4B1AA 4BS7A 1LSCA 1HMKA 2LYMA 5DL9A 2MEAA 4NGKA 4GLAA 4HJVA 3TMUA 4DC4A 4H9BA 4ETAA 5LVGA 1JEFA 3CT0A 3WW5A 4CHXA 1JKAA 2F4GA 1OUIA 5IHGA 5E9RA 2ZILA 2F4AA 3OJPA 1GB0A 3WPLA 3F6ZA 1JWRA 1HFYA 1AM7A 1B5ZA 2HTXA 2DQAA 4Z98A 1GB5A 4LYCA 3TXJA 1GBXA 1GF4A 1KIQC 3WPJA 3N9AA 1GE3A 1B5VA 1TCYA 4C5FA 3CSQA 1N4FA 1LZDA 1HFXA 1QSAA 1UCOA 2LZ2A 1LZTA 1YIKA 1J1XY 3AYQA 3EO5A 1B7LA 4OWBA 4NEBA 4XENA 3T6UA 1YKZX 3TXFA 3LZ2A 3WH1A 4H8XA 1FKVA 2IHLA 1LYYA 3AB6A 134LA 3ATNA 4G4HA 1JSEA 3LZTA 208LA 1GBWA 1VDSA 3D9AC 2C8OA 3M18B 4H1PA 2MEIA 1J1PY 1DZBX 1LMAA 1W6ZA 1DXJA 1TAYA 1LSAA 1HEQA 4YOPA 5ILFA 1QTKA 4D9ZA 4Z46A 2FYDA 2Z2FA 2FYCA 4G9SA 4I0CA 1JIYA 2HEEA 1IX0A 1LJIA 4FDYA 1A2YC 4WMGA 2EIZC 1KIPC 1IOQA 1IIZA 1HHLA 1YILA 3AGIA 1IWTA 1CKFA 1JTTL 4LYBA 4WL6A 1LSMA 2W1YA 5F9XA 2ZIJA 4TWSA 1DQJC 1HEMA 3WW6A 1LYOA 4H93A 1IP1A 1B7PA 1LAAA 2BQIA 4OOTA 1QUSA 4TSCA 1EQ5A 3W6FA 1VDTA 2BQEA 3A93A 4GCFA 5DLAA 1OUJA 4WLYA 4EOFA 193LA 1VDQA 1QQYA 1Z55A 1IWVA 5E4PA 4BAFA 4HSFA 1YKYX 1LJJA 1OUFA 4KT3A 5LYMA 2CWIA 135LA 3AZ7A 4N5RA 4WO9A 3EMSA 1GE4A 1I56A 4AGAA 4H91A 1OUEA 4J0LA 4LT2A 3BKVA 1LSYA 4CFPA 1F6RA 1LYSA 1IWZA 1NMMA 5LVKA 4ET8A 5LXWA 1G7MC 2HEDA 1GFKA 1T3PA 2N5ZA 3WMKA 2BQJA 4EMNA 1QDRA 2BQMA 5B59A 2H5ZA 2YBMA 1GFVA 1OUDA 2YBIA 1LOZA 4I8SA 4GN4A 4A7DA 2CGIA 5T3FA 5DM9A 1CKCA 3B0KA 1GB3A 5KXRA 5I53A 3WL2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4HJYA 3TXGA 4EPFA 8LYZA 2HU3A 241LA 1L80A 4R0FA 1GFEA 5B05A 1IC5Y 212LA 1LHLA 1UIDA 2B7XA 1HEWA 1L48A 2I26L 1L93A 4LGKA 4DD3A 1G0LA 4QY9A 4Z41A 3DN4A 1VATA 5D5CA 3AW7A 2LC9A 1L25A 4NIJA 4EKSA 3WUAA 3SB7A 3GUOA 5APEA 2D4JA 4RW2A 4YM8A 1L16A 3HH5A 1KW5A 3TMXA 1EQEA 3CDTA 1E8LA 1GAYA 1L84A 3W6EA 1YANA 1G0PA 2B72A 224LA 252LA 1IP7A 2Z39A 1PQIA 5KKJA 1OUCA 2YBLA 4IJ4A 2DQDY 2RSCA 1HMLA 1IP2A 233LA 1RJCB 1JSFA 1HFZA 2MEGA 1B5UA 3A3RX 2O4WA 1B7SA 4DKLA 4WM1A 4AXTA 2OE7X 225LA 1LZAA 1B7OA 3TMVA 4UWNA 4W51A 4NWEA 1GF5A 1SLYA 4H9CA 3HBEX 1LZCA 1LHKA 1LZGA 178LA 1JUGA 1FLWA 238LA 4YX7C 2HULA 1LZEA 3ODUA 197LA 1L02A 249LA 172LA 2OE4X 5KXWA 4NGLA 4MCKA 5B06A 3LYMA 4ET9A 1L21A 1DYGA 132LA 2CDSA 187LA 217LA 1REXA 191LA 4DD9A 1JITA 1T8GA 2BLXA 1DKKA 3EMLA 1YAOA 4PJ2C 1VDPA 260LA 1QSWA 2DQGY 3A95A 3TXDA 3HTDA 2D6BA 4QEQA 113LA 4LZMA 4NSJA 198LA 1G7JC 1HNLA 3LN2A 3OE8A 4W94A 4WOAA 3ZEKA 1GF7A 1XGPC 4YF2A 4LYTA 4LFPA 1G7IC 1AZFA 1MELL 4HTKA 1L82A 1REZA 5I4YA 2BQAA 3A6BY 1WQRA 4B0DA 4OWCA 215LA 1L01A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4GN5 C;  1KXW A;  4HJY A;  1B7R A;  1YAP A;  3CB7 A;  3TXG A;  3WU8 A;  4M4O A;  8LYZ A;  4X3B A;  2HU3 A;  1GB7 A;  1LSB A;  4R0F A;  1GFE A;  1JHL A;  5B05 A;  1IC5 Y;  2BQB A;  2ZIK A;  5HNL A;  1LHL A;  1GEV A;  1LZN A;  2MEC A;  5EBH A;  1D0K A;  4G4C A;  1UID A;  1FLY A;  4TTD A;  5LA5 A;  1HF4 A;  5JEN B;  1HEW A;  4R6C A;  3ULR A;  2I26 L;  2YDG A;  4XJH A;  1D6P A;  1LSD A;  1NBY C;  4LGK A;  3WU7 A;  1UIH A;  5LYT A;  1WQN A;  1B5X A;  4DD3 A;  3WXU A;  1F10 A;  3AGG G;  4QY9 A;  4Z41 A;  1LSZ A;  1VAT A;  2LYO A;  1GB6 A;  1G7L C;  5D5C A;  1SQ2 L;  3AW7 A;  1IWW A;  3FI7 A;  3ZVQ B;  2DQI Y;  1UIA A;  1W08 A;  1UBZ A;  3N9E A;  3A8Z A;  1BB5 A;  1OUA A;  1UIG A;  4NIJ A;  4H9E A;  1IR8 A;  3WUA A;  5LVH A;  5LIN A;  4H9I A;  2YSS C;  1F0W A;  154L A;  1EQ4 A;  2Q0M X;  1LZS A;  1HEP A;  4HTN A;  5DN5 A;  4GLV A;  1JKC A;  1WTM A;  3A92 A;  1FLU A;  4RDS A;  4OWA A;  2MEH A;  1HSW A;  2Z18 A;  5APE A;  2D4J A;  4RW2 A;  1BB3 A;  1LJF A;  4YM8 A;  2DQF C;  2YBJ A;  3WU9 A;  1GE0 A; 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 3WH1 A;  4H8X A;  1FKV A;  2IHL A;  1LYY A;  3AB6 A;  134L A;  3ATN A;  4G4H A;  1JSE A;  3LZT A;  208L A;  1GBW A;  1VDS A;  3D9A C;  2C8O A;  3M18 B;  4H1P A;  2MEI A;  1J1P Y;  1DZB X;  1LMA A;  1W6Z A;  1DXJ A;  1TAY A;  1LSA A;  1HEQ A;  4YOP A;  5ILF A;  1QTK A;  4D9Z A;  4Z46 A;  2FYD A;  2Z2F A;  2FYC A;  4G9S A;  4I0C A;  1JIY A;  2HEE A;  1IX0 A;  1LJI A;  4FDY A;  1A2Y C;  4WMG A;  2EIZ C;  1KIP C;  1IOQ A;  1IIZ A;  1HHL A;  1YIL A;  3AGI A;  1IWT A;  1CKF A;  1JTT L;  4LYB A;  4WL6 A;  1LSM A;  2W1Y A;  5F9X A;  2ZIJ A;  4TWS A;  1DQJ C;  1HEM A;  3WW6 A;  1LYO A;  4H93 A;  1IP1 A;  1B7P A;  1LAA A;  2BQI A;  4OOT A;  1QUS A;  4TSC A;  1EQ5 A;  3W6F A;  1VDT A;  2BQE A;  3A93 A;  4GCF A;  5DLA A;  1OUJ A;  4WLY A;  4EOF A;  193L A;  1VDQ A;  1QQY A;  1Z55 A;  1IWV A;  5E4P A;  4BAF A;  4HSF A;  1YKY X;  1LJJ A;  1OUF A;  4KT3 A;  5LYM A;  2CWI A;  135L A;  3AZ7 A;  4N5R A;  4WO9 A;  3EMS A;  1GE4 A;  1I56 A;  4AGA A;  4H91 A;  1OUE A;  4J0L A;  4LT2 A;  3BKV A;  1LSY A;  4CFP A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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