2B6XA

T4 lysozyme mutant l99a at 200 mpa
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAAAINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme
publication title Cooperative water filling of a nonpolar protein cavity observed by high-pressure crystallography and simulation
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2005-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2b6xA00
1L21A 1L92A 4IAPA 1L16A 109LA 1L13A 1P64A 1PQJA 3LZMA 3SN6R 3SB9A 1L79A 3HH4A 1LWKA 1L96A 3RUNA 2A4TA 2RB0X 2B6WA 1L83A 2NTGA 158LA 4W54A 3NY9A 1L50A 1L24A 1LYGA 1L88A 210LA 1P6YA 1QUOA 1L18A 159LA 3C7YA 4W58A 4EKRA 1L89A 3HUAA 3OE0A 3QAKA 119LA 1LYIA 201LA 1QSBA 137LA 118LA 1B6IA 1CUQA 2LC9A 249LA 1G0GA 3C81A 3C8QA 114LA 4EJ4A 1CV1A 3HH3A 171LA 1G0QA 192LA 2RBPA 3SB7A 1ZURA 3C8RA 3GUKA 2Q9DA 1L28A 3HDFA 2RBSA 199LA 1L86A 1QTVA 141LA 3CDVA 3OE9A 4I7NA 1L48A 1D9WA 3GUMA 3GUIA 182LA 189LA 113LA 226LA 1KNIA 2OU8A 3DN1A 1SX2A 1QT8A 3FI5A 142LA 1L76A 250LA 4LZMA 1P5CA 4ARMA 3HU9A 2Q9EA 1D2YA 166LA 205LA 1CX6A 1L08A 1LGUA 190LA 4I7MA 3HWLA 163LA 1DYEA 224LA 2B6YA 4W52A 4ARQA 128LA 1C6TA 1G0PA 1OVKA 4ARJA 3HTDA 5I14A 1XJTA 230LA 3HT6A 2HUMA 1LI2A 1L58A 1CU6A 1XJUA 4DKLA 185LA 3V2WA 4I7KA 1K28A 1DYCA 2HULA 1C6AA 238LA 3HT7A 1L33A 229LA 1D2WA 2RBQA 140LA 2F32A 1L14A 3SB6A 1L26A 4EKPA 200LA 258LA 3D4SA 3GUJA 3CDTA 120LA 1OV5A 3ODUA 2F2QA 2L78A 1C6HA 1L41A 4ARLA 1L51A 4AQNA 1JQUA 3CDOA 1DYBA 3HT8A 1G1WA 1LWGA 2B75A 1QT7A 1G0KA 1LI6A 3DN2A 4I7JA 3SBAA 1L12A 1L36A 206LA 2OE4X 125LA 1QT5A 1C6EA 1C6LA 1L91A 1LYDA 6LZMA 2OU9A 4I7TA 209LA 2ANXA 1L04A 3VW7A 1L47A 149LA 4I7RA 1JTNA 1L55A 3HTGA 3V2YA 237LA 1L49A 4OO9A 1L81A 2RAYX 177LA 1I6SA 260LA 3NY8A 2RB2X 4W57A 1L77A 1JTMA 1LYHA 1L25A 1QT3A 248LA 3HTBA 1PQIA 3CDRA 1CU5A 1OWYA 1L23A 1L72A 1OVHA 3DN4A 1L17A 1P3NA 3GULA 4GBRB 1EPYA 1L69A 3C80A 4PJZA 108LA 144LA 1C6IA 111LA 3HH6A 1SX7A 3UONA 1T97A 251LA 112LA 1L39A 3G3WA 1L07A 2CUUA 146LA 1QSQA 115LA 1L66A 178LA 2OE9X 2B73A 1L10A 1L64A 1L46A 1L62A 234LA 2F47A 1QTZA 1C6DA 227LA 1L70A 1L82A 3OE6A 102LA 1C64A 2B72A 3SB5A 4EPIA 1NHBA 3DMZA 1L03A 1L59A 219LA 241LA 3FA0A 1CV0A 1L27A 2OTYX 1QTCA 213LA 1L71A 2B6ZA 1CUPA 1C65A 1CU0A 1L05A 4S0WA 1KS3A 4E97A 162LA 1C62A 1L31A 2QB0B 1C6PA 1LI3A 218LA 1C6CA 1SSYA 4W55A 4I7SA 1QUHA 1L56A 1LPYA 1L35A 127LA 7LZMA 242LA 1QT4A 1L94A 231LA 1QS5A 3L2XA 1T6HA 2Z6BA 104LA 3DKEX 164LA 198LA 1L01A 3RZEA 1C63A 2B7XA 262LA 123LA 1LW9A 3HUQA 1TLAA 2RBOA 1L11A 191LA 1T8FA 1G07A 1DYFA 3PDSA 4W51A 5LZMA 197LA 3DN3A 3HTFA 1G0JA 1L53A 1L80A 3GUPA 1L0JA 1C60A 2NTHA 239LA 1L0KA 122LA 3L64A 1G0MA 1L06A 3DMVA 1L95A 167LA 186LA 1L42A 2B74A 3DMXA 1CU2A 1C6BA 3C7WA 1L37A 157LA 143LA 4LDOA 1DYDA 211LA 2OEAX 1C66A 1LYFA 1CTWA 148LE 1CV5A 1P2RA 1XEPA 1KY1A 1L45A 225LA 1SSWA 1QS9A 223LA 2HUKA 3C83A 145LA 232LA 1CU3A 212LA 160LA 139LA 221LA 1G1VA 1L44A 1L68A 1C6QA 236LA 228LA 3FADA 165LA 3F9LA 3K2RA 1ZWNA 1L54A 3CDQA 126LA 1CVKA 1L40A 2RBNA 1CX7A 1D3FA 3C8SA 222LA 3GUNA 4W53A 138LA 1D3MA 254LA 3G3XA 1P7SA 2IGCA 103LA 1QT6A 3GUOA 3HDEA 1L34A 2LCBA 4W59A 1KW5A 4EPFA 1L98A 4EKQA 1OVJA 4W56A 1LLHA 1L00A 259LA 1L99A 1QUDA 1QTBA 245LA 1QTDA 175LA 253LA 220LA 1P36A 1DYGA 2LZMA 240LA 2RB1X 4EXMA 3SBBC 1T8AA 255LA 2O4WA 129LA 4K5YA 4ARPA 1C6JA 1C69A 3OE8A 2O79A 1L32A 4DJHA 196LA 2OU0X 4DAJA 1L84A 1L20A 1L61A 183LA 172LA 1CV6A 3EMLA 156LA 2OE7X 1C6FA 1QUGA 1L65A 233LA 252LA 4GRVA 4EKSA 1L73A 1L43A 1PQKA 257LA 2RBRA 3SB8A 1L97A 1P46A 1OYUA 1OWZA 3HU8A 187LA 217LA 1L93A 1OV7A 1SWYA 4ARMB 2O7AA 261LA 1CV3A 147LA 1L09A 1L38A 184LA 1KY0A 130LA 1QTHA 168LA 2B70A 1D3NA 1P37A 1T8GA 4ARQB 2B6TA 3NYAA 174LA 1KW7A 1L67A 1G0LA 1LYEA 1C6NA 1D3JA 1L15A 150LA 1C67A 1L75A 1L74A 1PQOA 3DN8A 1CV4A 3DN6A 256LA 1C68A 1DYAA 2QARC 3G3VA 173LA 3C82A 195LA 1L85A 247LA 1C6KA 1L02A 1L22A 4PK0A 2OTZX 216LA 4LDLA 2B6XA 3C7ZA 176LA 1SWZA 151LA 214LA 1LYJA 243LA 4YXAC 1L29A 215LA 161LA 3HT9A 155LA 2RH1A 3PBLA 3JR6A 3F8VA 3DNAA 1L52A 2ANVA 1L90A 152LA 246LA 170LA 110LA 1L19A 235LA 1PQDA 1WTHA 169LA 1LGXA 107LA 181LA 1P56A 188LA 3DN0A 1L30A 180LA 1G06A 4I7QA 1LGWA 1C6MA 1PQMA 1C6GA 1L60A 3HH5A 4I7PA 4YX7C 3HUKA 1C61A 4ZPUA 4I7OA 1P2LA 1L57A 1L87A 4YXCA 244LA 2RAZX 4I7LA 4LDEA 1ZYTA 1L63A 131LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3LZMA 1PQJA 8LYZA 1ALCA 3RUNA 1IR7A 1WQQA 2B6WA 2IHLA 1L83A 3TXIA 4DD1A 1IC4Y 3NY9A 5DL9A 1L50A 3W6EA 2MEEA 4YEMA 1QUOA 159LA 1FDLY 4W58A 5L9JA 3HUAA 3OE0A 4DD9A 2FYCA 1LYIA 201LA 1QSBA 1B5YA 2YBMA 4H8XA 137LA 4XJIA 2LC9A 1IIZA 3C81A 5APFA 2D6BA 5II3A 4RW2A 171LA 192LA 5L3HA 2VB1A 2Q9DA 3A95A 3AZ4A 4HJZA 3HDFA 3WH1A 1IVMA 1L86A 1QTVA 141LA 4I7NA 1LSBA 1WQNA 1D9WA 1IOSA 182LA 113LA 2MEIA 1SX2A 1GFAA 2DQIY 1L76A 4H9CA 4ETBA 1L08A 5F16A 1YL1X 1ZVHL 3HWLA 3AB6A 5F81A 2F4AA 2BQOA 4LT2A 1K28A 1LHHA 4OWEA 5APDA 1L33A 229LA 1JEFA 2CGIA 2D4KA 1L26A 1LSMA 1LYOA 3GUJA 4WO6A 4OWAA 133LA 1LMQA 1C6HA 2Y8PA 1IC5Y 1L51A 4AQNA 1LZDA 1XGTC 2GV0A 5M1YA 1BGIA 1HEOA 1G0KA 1LI6A 4I7JA 3SBAA 3TMWA 206LA 125LA 1C6LA 2YSSC 1L91A 1YIKA 6LZMA 209LA 2ANXA 1GBOA 2NWDX 208LA 4OO9A 4XJHA 4EMNA 1BVXA 177LA 260LA 3NY8A 1LMNA 4H92A 1LYYA 2RB2X 4W57A 1L77A 1QT3A 2DQCY 4YEOA 1LSPA 3HTBA 3CDRA 2A7DA 1P3NA 3GULA 1BB4A 4GBRB 4QDNA 5IDDA 144LA 3CSZA 3WUMA 3HH6A 1SX7A 251LA 3QE8A 1XGUC 1L07A 4Z41A 1J1PY 1TEWA 178LA 1JSFA 2HEAA 1UCOA 1QTZA 4HPIA 1AT5A 102LA 1C64A 2B72A 3SB5A 4EPIA 1NHBA 1V7SA 1LJFA 3DMZA 1L59A 1OQMA 1UC0A 1IC7Y 5LA8A 4LT1A 5I4YA 1FLYA 5KXLA 1BVKC 4S0WA 4NEBA 3ZEKA 1OUEA 1RE2A 1CJ7A 2QB0B 4HTNA 4OWHA 1T6VL 1IO5A 5KKIA 1LHMA 1SSYA 4W55A 4I7SA 2ZYCA 1L56A 2A7FA 1L35A 127LA 1UIDA 4WL6A 1B5UA 1L94A 2HEDA 231LA 1T6HA 2Z6BA 104LA 198LA 3RZEA 3TXKA 1HELA 123LA 1B7NA 5B07A 5FSTA 191LA 1LZ1A 1T8FA 1JJ3A 3GXRA 3CQLA 2HEFA 3DN3A 4W51A 3HTFA 197LA 1LZSA 3GUPA 4NHSA 1L0JA 5I53A 1LHLA 239LA 4H8ZA 4H9IA 1LSGA 4WG7A 1GEZA 122LA 1L42A 2G4NA 1GXXA 2OEAX 5KXYA 2D4JA 1L45A 3EO5A 1GE3A 225LA 3AW6A 2HUKA 1B2KA 1KXXA 3W3EA 4DDBA 232LA 1O23A 1JKCA 2YBHA 4NGOA 1C6QA 1BQLY 3FADA 3F9LA 3K2RA 1EQ4A 2ZNXY 1L54A 4M6DA 4NFVA 3C8SA 1D3MA 3G3XA 4ETCA 1P7SA 3HDEA 4EPFA 1LLHA 1L00A 1QTBA 1QTDA 175LA 253LA 1PZYA 220LA 2BQGA 1GFUA 2LZMA 5JENB 2DQAA 1T8AA 4MR1A 4OOTA 4K5YA 4G49A 1GF7A 1GHLA 2MECA 4XYYA 3OE8A 2O79A 1HMKA 3A94A 1L63A 1JKDA 2CDSA 183LA 2XTHA 4A7DA 5KXXA 156LA 1YILA 1C6FA 1QUGA 1L65A 233LA 4EKSA 1L73A 1HMLA 3SB8A 1L97A 1ZV5L 1OWZA 3A34A 3TXBA 4NGIA 4ET9A 3HU8A 217LA 2D4IA 1QTKA 2ZIJA 4DD0A 3ULRA 1HFXA 147LA 1XEJA 4NSGA 2B6TA 3NYAA 1DPWA 4TSBA 1LJHA 1D3JA 4DQ5A 1L75A 1PQOA 3F6ZA 1IWUA 1CV4A 1HERA 4GCFA 1JITA 2QARC 173LA 1GF9A 1YKZX 3C82A 4NSHA 3W6FA 5KXNA 247LA 2Z2FA 1GBXA 4LDLA 1LZTA 2B6XA 176LA 5I4WA 2W1XA 1LYJA 243LA 4YXAC 3HT9A 2RH1A 3JR6A 5B1FA 3DNAA 1LMPA 2ANVA 152LA 1UIGA 4LYOA 110LA 4QGZA 188LA 1L30A 1YQVY 4I7QA 1LJ3A 2XBSA 4CHXA 3WU8A 1PQMA 4I7PA 3HUKA 4NHIA 1GB5A 1P2LA 3T6UA 2HEEA 4YXCA 4ARLA 1BB6A 214LA 1GAYA 1L21A 4IAPA 4ETEA 1L13A 1P64A 2A4TA 2RB0X 3TMVA 1EQEA 1NBZC 1F6RA 1LYGA 1LZYA 1GPQC 1P6YA 1L18A 3C7YA 3D3DA 3WL2A 1GE2A 3P64A 5FHWA 1XFPL 3WW5A 3LYTA 1RFPA 1LSDA 1HFYA 3A91A 1T3PA 2BQJA 2DBTA 3WMKA 4HV2A 1CUQA 1LHJA 249LA 1G0GA 4C3WA 114LA 1CV1A 3EXDA 1H87A 4MSTA 2C8OA 3W6DA 1LZ6A 3C8RA 3D9AC 4I0CA 4TSCA 1IWYA 2BQHA 3CDVA 1GFHA 1GD6A 3WUAA 1C46A 1YKXX 5K7OA 1B7PA 4WO9A 1G7JC 1I56A 250LA 3ZVQA 4LZMA 2ZQ4A 2CJLA 4GCEA 1LGUA 2RSCA 5HNLA 4W52A 1QTEA 1IOCA 5KXTA 1UIBA 230LA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3LZM A;  1PQJ A;  8LYZ A;  1ALC A;  3RUN A;  1IR7 A;  1WQQ A;  2B6W A;  2IHL A;  1L83 A;  3TXI A;  4DD1 A;  1IC4 Y;  3NY9 A;  5DL9 A;  1L50 A;  3W6E A;  2MEE A;  4YEM A;  1QUO A;  159L A;  1FDL Y;  4W58 A;  5L9J A;  3HUA A;  3OE0 A;  4DD9 A;  2FYC A;  1LYI A;  201L A;  1QSB A;  1B5Y A;  2YBM A;  4H8X A;  137L A;  4XJI A;  2LC9 A;  1IIZ A;  3C81 A;  5APF A;  2D6B A;  5II3 A;  4RW2 A;  171L A;  192L A;  5L3H A;  2VB1 A;  2Q9D A;  3A95 A;  3AZ4 A;  4HJZ A;  3HDF A;  3WH1 A;  1IVM A;  1L86 A;  1QTV A;  141L A;  4I7N A;  1LSB A;  1WQN A;  1D9W A;  1IOS A;  182L A;  113L A;  2MEI A;  1SX2 A;  1GFA A;  2DQI Y;  1L76 A;  4H9C A;  4ETB A;  1L08 A;  5F16 A;  1YL1 X;  1ZVH L;  3HWL A;  3AB6 A;  5F81 A;  2F4A A;  2BQO A;  4LT2 A;  1K28 A;  1LHH A;  4OWE A;  5APD A;  1L33 A;  229L A;  1JEF A;  2CGI A;  2D4K A;  1L26 A;  1LSM A;  1LYO A;  3GUJ A;  4WO6 A;  4OWA A;  133L A;  1LMQ A;  1C6H A;  2Y8P A;  1IC5 Y;  1L51 A;  4AQN A;  1LZD A;  1XGT C;  2GV0 A;  5M1Y A;  1BGI A;  1HEO A;  1G0K A;  1LI6 A;  4I7J A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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