2B6XA

T4 lysozyme mutant l99a at 200 mpa
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAAAINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Cooperative water filling of a nonpolar protein cavity observed by high-pressure crystallography and simulation
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2005-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2b6xA00
1L97A 4W53A 1QUHA 1L12A 1CU6A 4I7TA 2RB1X 2Z6BA 1LYJA 4AQNA 260LA 1SSYA 1L93A 1QTVA 2OEAX 166LA 169LA 147LA 4YXCA 246LA 4K5YA 3FI5A 2IGCA 1L35A 110LA 1D2WA 3L2XA 131LA 1L39A 3OE0A 4LDLA 1C6FA 1L58A 1OYUA 143LA 1L25A 3SB6A 1G0JA 1L30A 242LA 3DN0A 1L68A 2A4TA 3HU8A 119LA 2L78A 1C6IA 1C6HA 4GRVA 1JTMA 3SB9A 1KW7A 4PJZA 3CDTA 244LA 2ANXA 1I6SA 3HT6A 1L64A 3GUOA 178LA 152LA 1DYFA 1C6QA 158LA 212LA 4YX7C 1TLAA 1L87A 3SB5A 1L19A 1B6IA 3FA0A 2RBQA 1T8AA 1K28A 3NY9A 2B72A 1LWGA 199LA 1L18A 1C6KA 1DYBA 3SN6R 1L09A 5I14A 161LA 2ANVA 148LE 103LA 1C67A 1LYGA 4ARJA 1L03A 2B6XA 1L99A 1DYDA 1L96A 239LA 1L14A 4IAPA 254LA 175LA 174LA 1D3MA 2RBOA 3DMVA 200LA 224LA 1L53A 205LA 2B6TA 1PQIA 1L89A 1QT6A 1LPYA 1QSQA 222LA 4ARMA 2OTYX 3CDVA 195LA 3GULA 1C6MA 1L20A 1LYHA 4I7SA 1QUDA 1L72A 3DKEX 235LA 129LA 1L84A 1D3JA 1P6YA 1L10A 1PQJA 4ARPA 213LA 2HUMA 3DN2A 3K2RA 1CV5A 3HT8A 1L81A 1KS3A 1L98A 1KY0A 2LZMA 1L57A 1OWZA 251LA 4PK0A 1L41A 227LA 3C81A 1L31A 259LA 1L22A 4LDEA 1L00A 4EKPA 1CV6A 165LA 3HH6A 1G1WA 1NHBA 2RBSA 217LA 1L49A 1L77A 1L59A 4I7RA 145LA 3G3WA 2B75A 1C6NA 1C63A 181LA 234LA 139LA 1SX7A 1DYEA 3VW7A 1XJUA 1QTHA 144LA 1SSWA 1L04A 1L46A 1P2RA 1PQDA 2CUUA 3HT9A 1L90A 157LA 1P37A 164LA 3SB7A 1WTHA 3FADA 2RBPA 233LA 1G07A 5LZMA 3V2WA 1L69A 4ZPUA 3DMXA 1C61A 141LA 250LA 1L65A 186LA 2QB0B 3C7WA 182LA 1DYCA 4W56A 1PQMA 1L86A 1L66A 1L02A 1G0MA 3OE9A 4W55A 1QT8A 3DN3A 3DN6A 1LWKA 183LA 248LA 172LA 1C6BA 1CU0A 1OVKA 1C6AA 1QT5A 3NYAA 1CV0A 237LA 3HT7A 1C66A 2Q9DA 1C65A 4ARLA 3HTGA 1LI6A 196LA 6LZMA 3EMLA 1CX6A 1L17A 1LI3A 1L48A 1L54A 150LA 173LA 1C62A 1OV5A 1L11A 1L70A 1G06A 1L79A 3F9LA 232LA 3JR6A 2NTHA 255LA 1L40A 1KW5A 3HTBA 4ARMB 241LA 1L34A 122LA 3DNAA 214LA 115LA 2HUKA 1PQOA 1L27A 221LA 3L64A 104LA 126LA 184LA 1L0JA 4I7PA 1L15A 1L60A 1L52A 1P2LA 228LA 4DJHA 1SWZA 252LA 2B73A 192LA 2QARC 1LYDA 2B6ZA 1L38A 1C6PA 236LA 3OE8A 4EPFA 1CV1A 257LA 140LA 225LA 127LA 4W59A 3C7ZA 2O7AA 2B70A 3HUAA 2B6WA 149LA 1L92A 1CX7A 1L08A 3NY8A 1CVKA 2OE4X 2RB2X 1L95A 1L16A 1LGWA 1G0QA 114LA 113LA 1C6TA 1DYAA 206LA 107LA 1L36A 3DN1A 245LA 2OE9X 2OU9A 190LA 1CV4A 249LA 4W57A 123LA 1QUGA 253LA 1CUPA 1QS5A 151LA 238LA 3C83A 1G1VA 2O79A 146LA 191LA 4I7OA 138LA 220LA 3G3XA 3GUKA 240LA 118LA 1L33A 4I7MA 1KNIA 1L76A 230LA 163LA 3DN4A 1JTNA 3PBLA 177LA 2F2QA 3HDEA 4OO9A 1L71A 3HU9A 4ARQA 1LLHA 1L05A 3SBBC 1L62A 189LA 1LYEA 102LA 1C60A 4I7JA 1ZWNA 3C7YA 4DKLA 1C6CA 1CTWA 188LA 1T97A 2RAZX 2OU0X 3C82A 3PDSA 243LA 4EJ4A 4LZMA 4I7KA 1L80A 1QTZA 1G0LA 1P7SA 1C69A 209LA 1ZURA 1G0PA 2B74A 1C64A 2Q9EA 1L42A 3DMZA 1KY1A 1C68A 2HULA 3QAKA 210LA 2OU8A 3F8VA 2OE7X 4EKQA 1C6EA 3HH4A 128LA 1L61A 258LA 1P3NA 4EXMA 160LA 4EKSA 1L74A 201LA 1XEPA 1LGXA 1T6HA 1L51A 4W54A 1P46A 1P56A 1L83A 3C8QA 1L28A 1P64A 1CV3A 111LA 1XJTA 3ODUA 3CDOA 1L50A 1QT7A 155LA 142LA 2F32A 216LA 4I7NA 1L07A 2NTGA 156LA 219LA 2F47A 2RAYX 1CUQA 1P36A 1D3NA 1L06A 226LA 229LA 1LYFA 3HUQA 4W58A 187LA 108LA 137LA 1L21A 1LYIA 2RB0X 1DYGA 185LA 1QSBA 1L37A 2OTZX 3V2YA 162LA 4YXAC 1OVHA 3SBAA 1CU5A 1L0KA 3HWLA 1L75A 211LA 1T8GA 3GUIA 1QT4A 1L47A 130LA 109LA 1QTBA 1L56A 4GBRB 1T8FA 4W52A 4I7QA 198LA 4E97A 1OWYA 1L85A 2RH1A 1C6LA 176LA 4DAJA 3HTDA 3LZMA 215LA 4I7LA 4EKRA 1D2YA 2RBRA 4W51A 1EPYA 1L24A 1L91A 1D9WA 1L29A 262LA 112LA 1LW9A 3GUNA 2RBNA 171LA 1L13A 1L44A 3HUKA 1D3FA 3GUPA 2B7XA 1G0KA 261LA 1L26A 1OVJA 4LDOA 1PQKA 2O4WA 1ZYTA 3RZEA 1C6JA 218LA 4S0WA 3HDFA 4EPIA 7LZMA 2LCBA 167LA 3C80A 1QUOA 3HTFA 3RUNA 120LA 1JQUA 3HH3A 4ARQB 1L88A 1L73A 1QTDA 1L67A 1C6DA 1L32A 1QT3A 247LA 3SB8A 3CDQA 2B6YA 1G0GA 1L01A 231LA 3GUMA 1QS9A 1L23A 1P5CA 3G3VA 1CU2A 1C6GA 168LA 1L63A 256LA 1L55A 1QTCA 180LA 3HH5A 1CU3A 159LA 197LA 170LA 3GUJA 3C8SA 3DN8A 125LA 1L82A 1LI2A 1L43A 1SX2A 3CDRA 1L45A 1LGUA 1OV7A 1SWYA 3UONA 223LA 3OE6A 3D4SA 3C8RA 2LC9A 1L94A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4AGAA 5KKJA 1SSYA 2ZILA 2LYOA 4YXCA 246LA 3WUMA 2IGCA 1D2WA 131LA 1BWIA 4NHTA 3OE0A 5EBHA 3SB6A 4XJHA 1UIDA 3B0OA 4DD3A 1IOQA 3KAMA 3HBEX 4Z98A 1LJJA 1HHLA 2LYMA 244LA 4C3WA 1ZVHL 1L64A 1KXWA 1GBSA 5FDJA 5A3EA 4YX7C 2BQFA 4BAPA 1L19A 1B5UA 1B6IA 2BAAA 5B1GA 1GBOA 4OW1A 2EKSC 4ARJA 1C67A 1LPIA 2LZTA 1PZYA 1L03A 3B72A 1L96A 4ZEEA 4IAPA 174LA 2RBOA 3DMVA 1DZBX 200LA 4YEMA 3TXDA 1PQIA 1L89A 1QSQA 222LA 2OTYX 1L20A 2RSCA 3WMKA 4I7SA 4LFPA 2FYCA 1L72A 235LA 2MEIA 5KXRA 1P6YA 1CNSA 3A34A 1REYA 213LA 1BWJA 1JTPL 1C43A 5B06A 3HT8A 1L81A 1JKBA 1WTNA 251LA 4PK0A 3C81A 1L00A 1VDSA 1LCNA 2YBNA 3A90A 1J1XY 1NHBA 3P66A 1L77A 3G3WA 2Z19A 2B75A 1C6NA 1O23A 5LVHA 1SX7A 1DYEA 1SSWA 1LZRA 1IOTA 1IR9A 1GB8A 4EMNA 1L90A 164LA 3SB7A 3WXTA 1JJ1A 1F10A 4WLYA 3V2WA 4TSCA 3DMXA 3ZVQA 250LA 5A3ZA 3A93A 3C7WA 182LA 3AYQA 1V7TA 1G0MA 1JTOL 4GLAA 5I5QA 4NWEA 4H94A 1YAOA 3N9AA 4L41A 1XFPL 4II8A 1OVKA 1C6AA 1IOCA 4IATA 4BADA 4YM8A 1QQYA 4ARLA 1TBYA 3WW5A 1CX6A 4W94A 4NGWA 4TUNA 2CJLA 4UWVA 1CKCA 5D5FA 5I53A 5B05A 150LA 1IWXA 2D4KA 4ZFPA 3JR6A 4QEQA 4RW1A 3HTBA 3DNAA 2HTXA 1G7LC 1IWUA 4BAFA 2DQDY 1JIYA 4WL6A 1T6VL 1OUAA 1D0KA 1P2LA 228LA 2ZYPA 3WPJA 1G7JC 2QARC 1DQJC 5LA8A 4MR1A 1C6PA 4DD2A 1GF8A 236LA 1LMCA 4C5FA 4B0DA 2CWIA 3C7ZA 2B70A 4N9RA 1LJEA 6LYTA 2DQAA 5F14A 4OOTA 2BQGA 3BKVA 1FN5A 1L16A 154LA 1RJCB 1HFZA 1C6TA 206LA 1GFTA 5ILCA 1W6ZA 2OE9X 1ZVYB 1CV4A 4W57A 3P65A 1QS5A 238LA 3C83A 4B1AA 146LA 1IP6A 2XTHA 5KXKA 1KNIA 1OP9B 230LA 5I4WA 3PBLA 177LA 1IWZA 1LMAA 3HU9A 3LYZA 3ZVQB 3CQLA 3SBBC 1BVKC 1L62A 1LYSA 1LYEA 102LA 1T97A 4QGZA 3QNGA 5M1YA 4EJ4A 3GXRA 4LZMA 1JKDA 1YAPA 1B7OA 1C64A 2C8PA 1D0LA 1XGRC 4O34A 1OUDA 3DMZA 1C68A 3QAKA 1PS5A 4TSBA 2OU8A 3F8VA 2OE7X 1MLCE 3E3DA 3A96A 2DQGY 4EXMA 1IO5A 1AZFA 1L74A 1NDMC 1LGXA 4PHIA 1P46A 1QIOA 2CDSA 4DD1A 1LHIA 1J1OY 3CT5A 155LA 142LA 3CSZA 2F32A 216LA 219LA 2F47A 2RAYX 1IR7A 2D4JA 1L06A 226LA 229LA 4W58A 1GFEA 8LYZA 4NEBA 2Z37A 1LYIA 2MEBA 4TWSA 1L37A 162LA 1OVHA 3W3EA 1L0KA 1L75A 1LSYA 1L47A 130LA 1GBWA 1LYZA 1IWWA 1XGTC 4WM4A 1OWYA 1JKCA 5LA5A 1FKQA 1IR8A 2YBMA 3OJPA 1C46A 2IHLA 2HEDA 4WOAA 215LA 1UICA 1EPYA 1L24A 262LA 2Z2EA 2RBNA 4XADA 153LA 1IP5A 3GUPA 1OVJA 1PQKA 2BQBA 3VWOA 2N5ZA 4HTNA 4OWEA 1C6JA 218LA 4S0WA 7LZMA 2LCBA 1AT6A 3C80A 4DD9A 1GFUA 2BPUA 5HNLA 5IDDA 5B1FA 3AGHA 9LYZA 1L67A 3WU8A 4TTDA 1VFBC 208LA 231LA 2HU1A 3HFMY 1LSEA 4H9AA 1UBZA 1L63A 1L55A 3G3AB 5HQ1A 3P68A 180LA 1GB7A 4G4CA 2BQIA 4WM2A 3CT1A 3C8SA 1TAYA 1L82A 3W6DA 1C45A 4LYBA 1VDQA 3TXIA 5KXLA 1UA6Y 1LJNA 3D4SA 3C8RA 1LTMA 4I0CA 3AW6A 5DN4A 4H8XA 4HJYA 2D91A 3WH1A 2RB1X 3ZEKA 1I1ZA 2B5ZA 4AQNA 1GF6A 4M6DA 166LA 207LA 1GDXA 1YKYX 1VEDA 5B59A 4HJVA 4LDLA 2D4IA 1C6FA 1L58A 1B7PA 1BB5A 4I8SA 1L30A 3J4GA 242LA 3DN0A 2A4TA 2L78A 4XJBA 1C6IA 5E4PA 4GRVA 1JTMA 5APFA 2BQDA 4PJZA 5F9XA 1C08C 2ANXA 1WTMA 1DYFA 1QTKA 3M3UA 1LZBA 4WLXA 1LHJA 1L87A 3SB5A 4ETEA 1K28A 1VAUA 3NY9A 2B72A 1IWVA 4KPMA 1L18A 3SN6R 1L09A 1NBYC 4DC4A 161LA 2ANVA 1WQMA 2GV0A 103LA 4Z3MA 2B6XA 5KXSA 1DKJA 1D3MA 2LYZA 1INUA 1HEMA 1L53A 1B7SA 205LA 2B6TA 2F30A 1LPYA 1BVXA 4ARMA 1LSMA 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1CUPA 1QSWA 1UUZC 4Z41A 1XEJA 1ALCA 1QSAA 4H92A 2YDGA 4LGKA 5LINA 1D9UA 1HELA 4HSFA 138LA 220LA 1LJ3A 3GUKA 240LA 118LA 1NQIA 1L33A 1I56A 4I7MA 2Z18A 1L76A 1GB2A 1LHLA 1P2CC 3DN4A 2FBBA 1JKAA 1LLHA 1L05A 4B4IA 189LA 1C7PA 4H90A 5DN5A 1C60A 4N1CC 4I7JA 3RW8A 1GF7A 1C6CA 1CTWA 3C82A 4DD0A 4I7KA 1G0LA 1ZURA 2MEHA 1XEIA 1G0PA 2W1XA 2ZWBA 1NBZC 2Q9EA 2HULA 4R6CA 1GFVA 3LN2A 128LA 3CSRA 1LZGA 1P3NA 1GPQC 4EKSA 1XEPA 1T6HA 1P56A 3C8QA 6LYZA 4HV2A 1YL0X 5K7OA 111LA 3ODUA 1GE4A 1L50A 4NSJA 3RU5A 4I7NA 1XSFA 1CUQA 1P36A 5L9JA 3D3DA 4WLTA 4MCKA 137LA 1SQ2L 2BQLA 4GLVA 5HLLA 3V2YA 2OTZX 4H8YA 3AGIA 4WO6A 3SBAA 1CU5A 3GUIA 1FLWA 1QTBA 1L56A 1LMNA 1HF4A 4W52A 2ZIJA 4E97A 1JWRA 3TXBA 4H91A 176LA 4HTQA 3LZMA 4EKRA 3P4ZA 1D2YA 4W51A 112LA 1L44A 1YKXX 1D3FA 1IWTA 4LDOA 4ETAA 3TXHA 2O4WA 1UC0A 4EPIA 4H9CA 2BQCA 4DQ7A 3HTFA 3RUNA 1LJ4A 2HEFA 3LZTA 1JQUA 1QTDA 247LA 1DPXA 2B6YA 4Z46A 1JHLA 1G0GA 1L01A 3GUMA 1JSFA 1L23A 2ZNXY 1C6GA 256LA 1GFJA 1QTCA 2DBTA 4OWHA 3HH5A 1LMPA 1LJKA 159LA 170LA 1VDPA 133LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4AGA A;  5KKJ A;  1SSY A;  2ZIL A;  2LYO A;  4YXC A;  246L A;  3WUM A;  2IGC A;  1D2W A;  131L A;  1BWI A;  4NHT A;  3OE0 A;  5EBH A;  3SB6 A;  4XJH A;  1UID A;  3B0O A;  4DD3 A;  1IOQ A;  3KAM A;  3HBE X;  4Z98 A;  1LJJ A;  1HHL A;  2LYM A;  244L A;  4C3W A;  1ZVH L;  1L64 A;  1KXW A;  1GBS A;  5FDJ A;  5A3E A;  4YX7 C;  2BQF A;  4BAP A;  1L19 A;  1B5U A;  1B6I A;  2BAA A;  5B1G A;  1GBO A;  4OW1 A;  2EKS C;  4ARJ A;  1C67 A;  1LPI A;  2LZT A;  1PZY A;  1L03 A;  3B72 A;  1L96 A;  4ZEE A;  4IAP A;  174L A;  2RBO A;  3DMV A;  1DZB X;  200L A;  4YEM A;  3TXD A;  1PQI A;  1L89 A;  1QSQ A;  222L A;  2OTY X;  1L20 A;  2RSC A;  3WMK A;  4I7S A;  4LFP A;  2FYC A;  1L72 A;  235L A;  2MEI A;  5KXR A;  1P6Y A;  1CNS A;  3A34 A;  1REY A;  213L A;  1BWJ A;  1JTP L;  1C43 A;  5B06 A;  3HT8 A;  1L81 A;  1JKB A;  1WTN A;  251L A;  4PK0 A;  3C81 A;  1L00 A;  1VDS A;  1LCN A;  2YBN A;  3A90 A;  1J1X Y;  1NHB A;  3P66 A;  1L77 A;  3G3W A;  2Z19 A;  2B75 A;  1C6N A;  1O23 A;  5LVH A;  1SX7 A;  1DYE A;  1SSW A; 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