1IP4A

G72a human lysozyme
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPAAVNACHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords LYSOZYME C
publication title Role of amino acid residues in left-handed helical conformation for the conformational stability of a protein.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 53
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2001-04-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1ip4A00
5HQ1A 1JISA 3MGWA 1LHJA 3ZEKA 3P65A 3CT5A 154LA 1RCMA 2C8OA 1LZDA 4NHTA 1G7MC 2ZILA 4MSTA 4DWXA 3AGGG 4W94A 1LZBA 1QQYA 2HU3A 2YBJA 5A3EA 3J4GA 2F4GA 3CQLA 1WQMA 2G4QA 3W6FA 4DD7A 1GE0A 1D9UA 3TXIA 1BWHA 2Z38A 1JUGA 3GXKA 1GB8A 4LYMA 4H9IA 4XJDA 1OQMA 4ANRA 1D0MA 1JJ1A 1GB7A 3IJUA 4H8YA 4DDCA 1IX0A 1FKVA 1HEMA 1QTKA 1TEWA 1HEWA 4WM3A 1B7MA 1MELL 1XGUC 5B1GA 5LAFA 1YQVY 4KT3A 1UBZA 1IOCA 3B0OA 1RE2A 3WXTA 1HEQA 3P64A 5KXYA 1LSBA 2EPEA 1HMKA 4H94A 4CFOA 4NGZA 4WM2A 1C45A 4NGIA 3CT0A 1DI4A 1G7LC 2FBDA 1LZCA 1OUDA 1IP4A 1GF8A 3B72A 5B06A 5M1YA 1B7QA 1G7HC 1IP7A 4HJYA 4FDYA 1LSZA 2B5ZA 4WL7A 1HERA 3W6EA 2EKSC 1IO5A 1LMCA 4II8A 3G3AB 4B4JA 1TDYA 2BQFA 1WQQA 2BQLA 4LT0A 4R0FA 1LAAA 3F6ZA 3T6UA 3TMUA 1LSAA 208LA 2DQDY 5C6LA 2LZ2A 3VWOA 5F81A 3OK0A 4N8ZA 1XSFA 2DBTA 5HLLA 1IOTA 3CT1A 3TXDA 3T36A 1IP1A 1BVKC 3A93A 4DD9A 1IY3A 1XFPL 3A96A 2BQDA 3B0KA 3TXKA 4HV2A 1HFXA 4M6DA 1LHIA 3EO5A 6LYTA 1WVUA 4ETEA 1QIOA 1JSFA 1C08C 2HEFA 1NBZC 4XJHA 1IWXA 4NHSA 1BWIA 2FYCA 1LZ4A 4NFVA 5L3HA 1LSNA 4LYCA 1LMTA 1TCYA 2MEAA 1CKCA 2MEDA 2ZIKA 4CHXA 1LJ3A 3TMXA 1H6MA 4H92A 3TMVA 5KXKA 3A91A 2BPUA 5APCA 1ALCA 1VAUA 2A7DA 4H9EA 4HJVA 1XGRC 4ML7A 1GFRA 2W1LA 4YENA 1REMA 2HU1A 5DN5A 2BQGA 5T3FA 1GB9A 1UACY 4RLNA 1GE2A 3WUAA 1B7NA 1A2YC 2Z2EA 4NHQA 4GN4A 4DT3A 8LYZA 4OWBA 1YAMA 1C46A 1D0LA 3E3DA 1GF6A 1WQNA 2H9JA 4WOAA 3OJPA 4N1EI 5KKJA 4NSIA 1C10A 2MEGA 1GD6A 5DL9A 5LYZA 1AM7A 2N5ZA 1UCOA 4GCFA 2LZTA 4H8ZA 2H9KA 4QEQA 1QUSA 3G3BB 1LZYA 4G4HA 1BWJA 2ZQ4A 3AYQA 5FDJA 2BQHA 2XBRA 4H90A 1IOQA 2D6BA 1IR9A 2C8PA 1LZ6A 2I25L 4O34A 3LN2A 1UA6Y 1GDXA 2FYDA 3A94A 4KL7A 3N9AA 1XGQC 4LFPA 3AB6A 5DM9A 2BQAA 4LYTA 1GAYA 3FE0A 5F9UA 1UIGA 5KXOA 5LIOA 3WH1A 4ETDA 1T6VL 1OUEA 4HP0A 1JWRA 4NSGA 2CWIA 4NGWA 2H5ZA 4PRUA 1GBWA 1SQ2L 2GV0A 4LT3A 5B07A 1VDQA 5B05A 1GEZA 1IWUA 4XN6A 1VEDA 3WU7A 5ILCA 4ET8A 4D9ZA 2DQAA 1GB0A 1RI8B 2X0AA 5E9RA 5HNCA 1BB7A 1CKHA 1B5ZA 2BLXA 1LCNA 4QGZA 1XGTC 2BQNA 1F6RA 1UICA 2MEIA 5APEA 1LPIA 4LGKA 1IIZA 4WLXA 3WYHA 5KXTA 3WULA 1GFEA 1HHLA 1GE4A 1V7SA 4DDAA 4Z46A 4DDBA 5L3IA 1GPQC 3AJNA 1YKZX 2DQHY 3P66A 4HV1A 1J1PY 1IP2A 1IEEA 3M18B 5I53A 2YBHA 3A90A 1HMLA 3N9CA 4WLTA 1FDLY 4J0LA 2DKVA 3B0IA 4R6CA 1LYOA 1LMAA 1EQ4A 3TXEA 2F2NA 4EOFA 1GFAA 4MCKA 3TXHA 1LZ1A 4KXIA 1UIDA 3WUMA 3ZVQA 194LA 4A7DA 2IFFY 5APDA 5KXZA 4B49A 1UIBA 4CFPA 1LOZA 3AGIA 1GFJA 3TMWA 4WG7A 5FEKA 1LSCA 1JJ0A 1IVMA 1HELA 4IATA 3WUNA 3A3QA 4MR1A 4NHIA 3KAMA 4B0DA 1DPXA 1LZSA 1GAZA 1INUA 4BADA 1YKYX 1LJNA 2HEBA 4AXTA 5E4PA 1FN5A 1VFBC 1F0WA 1ZV5L 1BVXA 1GBSA 1UIEA 2FBBA 2MEFA 2PC2A 2Z39A 1LTMA 1LMPA 1GEVA 4WM6A 1IWYA 1HFYA 1VDSA 4GN5C 1GWDA 1LYYA 4NIJA 1B7SA 1QDTA 1OUAA 2NWDX 4G4CA 1JKCA 4IASA 2YBMA 3TXGA 4J7VA 5LVHA 1B5WA 1LSEA 2D4IA 2Z19A 5KKIA 1YAOA 1QUTA 5F16A 2YBLA 1AKIA 1GF5A 5K7OA 1TAYA 1B7RA 1JITA 5I4XA 1JTOL 2W1MA 3J6KA 1JHLA 5FSTA 3LYTA 1B7LA 2DQGY 2ZIJA 4LT1A 2BAAA 3RZ4A 4LZTA 4PGJB 1CJ8A 4KPMA 1IWTA 153LA 2BQJA 1J1XY 3A8ZA 1EQ5A 1NKHA 4YF2A 1UIHA 1A4VA 1G7IC 1UUZC 2MEHA 3AW6A 4TSCA 1ZVYB 1DQJC 4XJFA 4YOPA 5FELA 1BB5A 4B1AA 3LZ2A 2YSSC 2BQMA 2ZYCA 3CSZA 3FI7A 1AT6A 4NEBA 1REYA 4PPOA 4WM4A 4NGKA 1LHKA 1DKJA 4ETAA 1DZBX 1LZ8A 1GF9A 5LA8A 5LINA 1JPOA 1V7TA 4H1PA 1WVVA 3A3RX 1B0DA 2YVBA 1OUJA 1IC4Y 1NQIA 4CGEA 3AZ7A 2AUBA 5DLAA 4PJ2C 4X3BA 1T3PA 4GCBA 4YEOA 3ATNA 4WMGA 1P2CC 2ZNWY 4NSHA 4HTNA 3P68A 4OWCA 3WL2A 5I54A 1HEOA 1GBYA 1XEIA 1GB5A 4HTQA 4L41A 1BGIA 1YAQA 4ZFPA 1BB6A 2CJLA 1AT5A 1HSWA 3N9EA 4GCEA 1I20A 2Z18A 135LA 3A34A 2EQLA 4LYBA 1IWVA 4LFXA 1OUHA 1DPWA 1GXV2 1LJ4A 1JEFA 1OUIA 2DQJY 3A95A 3AZ4A 5LYMA 9LYZA 1F10A 2BQIA 4G49A 2BQEA 4WG1A 1QSAA 1PZYA 4NWEA 1HFZA 1DI3A 3EBAB 5EBHA 4OWEA 2HEDA 2WARA 2CGIA 1LSDA 3A6CY 2DQEY 1CKDA 1IC7Y 1D6QA 1LZGA 4H9HA 4XENA 4C5FA 1XEJA 2YBIA 3D3DA 3W6AA 5F14A 4NG8A 3HFMY 193LA 1LJKA 1UIFA 1IWZA 3TXBA 1LMNA 1B5YA 4OWHA 1IORA 4TX7A 1GHLA 4NGVA 1C43A 4XYYA 1PS5A 1GFUA 4GN3A 1YKXX 4H9BA 207LA 4H9AA 3K3TA 1GFKA 3WXUA 1NHEA 4H9CA 4DD2A 1RJCB 1IR8A 4B4IA 1B5XA 3WW6A 4W96A 5KXSA 1QSWA 1B5UA 1IR7A 3WVYA 4TWSA 3GXRA 4WO9A 1GFTA 3RW8A 1YAPA 1YROA 3LZTA 2ZQ3A 1LJGA 4WL6A 2EIZC 5IELA 3IJVA 4XJIA 3TXFA 5LVKA 5HMJA 3WVXA 4DYGA 5LVIA 5FCPA 2DQFC 2BQOA 1LMOA 1OUBA 5LA5A 3TXJA 4AGAA 1KXWA 4LT2A 5D5FA 1NF5A 4I8SA 5LYTA 4P2EA 5KJ9A 3EMSA 3M3UA 4NSJA 4H93A 4XJGA 5DN4A 4DD0A 4XJBA 1FBIX 1MLCE 133LA 1LZAA 4I0CA 4PHIA 4GCCA 4YM8A 1LKRA 1WQRA 5B59A 2BQCA 4RDSA 4WLYA 3LYZA 1NDMC 1YL1X 2MECA 2Q0MX 4GLAA 4N5RA 4ZEEA 1JJ3A 2D91A 1REXA 2IHLA 4WLDA 4U3XB 3SP3A 4OOTA 2MEEA 1GF3A 2YDGA 3AZ5A 3D9AC 4HTKA 4UWVA 5AMYA 5KXXA 4DD3A 3WU8A 3BKHA 2LHMA 5B1FA 5KXMA 1HSXA 1KXXA 4UWNA 2Z37A 1W6ZA 1YILA 1WTMA 3HBEX 4H9FA 3A67Y 5I4WA 3CSQA 1GB3A 1BQLY 1SLYA 4M4OA 4H8XA 1E8LA 1GB2A 5APFA 4WO6A 3WMKA 4J1AA 1HEPA 5L9JA 5I4YA 4N0JA 1LZ5A 1GFHA 1JKDA 1I1ZA 3W3EA 5KXWA 4NGJA 2XBSA 1N4FA 4UWUA 3QE8A 4GLVA 1NDGC 2I6ZA 1IC5Y 1KIPC 3AZ6A 4N1CC 7LYZA 1OUGA 5IHGA 1TBYA 3EXDA 4ET9A 4YEMA 3P4ZA 4PRQA 4E3UA 5KXPA 5C6JA 1B7OA 1JSEA 1NMMA 1OUFA 1B7PA 1YIKA 3WU9A 3LHMA 2LYMA 1AZFA 1LZ9A 4B4EA 2Z2FA 5KXNA 4H91A 1W08A 4OWAA 2BQBA 1BB4A 4HSFA 4TUNA 1CJ7A 4G9SA 5F9XA 132LA 4Z98A 1IP3A 4OOOA 1CJ9A 1XGPC 1LJJA 3AGHA 1GE3A 3HBHA 4J1BA 1IWWA 5LVJA 2F4AA 1REZA 4NY5A 4RW1A 1DKKA 1LSMA 3A92A 4BAPA 1CJ6A 3RT5X 4N9RA 2W1YA 1GF4A 2HUBA 4TTDA 1LSFA 1GBZA 1GFVA 1IOSA 2DQCY 1OUCA 1JIYA 1FLWA 4HPIA 4EMNA 5HMVA 4NHPA 1D0KA 1NBYC 1LJHA 3ZVQB 1I56A 1EQEA 1WQOA 1QTEA 2CDSA 2LYZA 1ZMYL 1VATA 2MEBA 1GF7A 3LYOA 1LJFA 3W6BA 1YANA 1ZVHL 4WM1A 2VB1A 1HENA 5J7CA 4BS7A 5JENB 1B9OA 1D6PA 1J1OY 2ZNXY 1UIAA 1CKGA 2W1XA 1NWGA 1O23A 5FHWA 1GXXA 1B2KA 1OP9B 2LYOA 3QNGA 2DQIY 4LYZA 4OW1A 2G4PA 1B5VA 1WTNA 4NGLA 3WPJA 1LSGA 2HECA 1F6SA 1LHMA 1GFGA 3AW7A 1LJEA 3BKVA 4FJRA 5HNLA 1FLUA 3W6CA 3LYMA 5KXRA 1JTTL 2XJWA 2D4KA 2BLYA 4Z41A 1LSPA 4RLMA 1RFPA 3RNXA 2HTXA 3WPKA 4QY9A 4HJZA 1LHLA 1JKBA 1KXYA 4HPEA 4NG1A 1KIRC 1QDRA 4WM5A 3RU5A 1HF4A 4GCDA 4IJ4A 1KIQC 2RSCA 1LZNA 1JKAA 5II3A 4ETCA 134LA 1G7JC 1UC0A 1CKFA 1WQPA 1FKQA 2HEEA 2I26L 3ATOA 1GBOA 1VDTA 1LKSA 4XADA 5A3ZA 5LXWA 3CB7A 1EL1A 1Z55A 3CSRA 2G4NA 4LYOA 1FLYA 4G4BA 3IWRA 1LYSA 3WPLA 4C3WA 2Z12A 4TSBA 2A7FA 2YBNA 1LMQA 4CJ2A 2D4JA 1LZTA 2F30A 3A6BY 4NGYA 2ZWBA 3B6LA 1HC0A 5ILFA 4BAFA 5I5QA 5LVGA 1LJIA 1GBXA 1JTPL 1LZEA 2ZYPA 4Z3MA 2HEAA 1BB3A 4ETBA 5C6IA 4QDNA 5D5CA 1IP5A 1GB6A 1LHHA 1YL0X 1VDPA 3WW5A 2XTHA 1HNLA 1XEKA 3ULRA 3QY4A 1GE1A 5KY1A 5LAGA 6LYZA 4RW2A 1C7PA 4DC4A 4ZIXA 1FLQA 1BHZA 1GDWA 1LSYA 4NGOA 5IDDA 1LYZA 5KXLA 4DD1A 3HBDA 2BQKA 1DI5A 1CNSA 1GF0A 2Y8PA 1IP6A 4NWHA 1DXJA 1LZRA 1H87A 3W6DA 1IY4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5HQ1A 1K28A 2RBQA 154LA 3CT5A 1RCMA 2C8OA 196LA 1G7MC 3AGGG 1LZBA 2HU3A 4DD7A 3TXIA 1SSYA 4EJ4A 1L40A 3GXKA 1GB8A 1OQMA 1GB7A 3IJUA 4DDCA 1G0LA 1MELL 2B6TA 1CU5A 3B0OA 1HEQA 3P64A 1L39A 4WM2A 143LA 3QAKA 1G7LC 2FBDA 1OUDA 1L23A 1G0GA 1L36A 4HJYA 4FDYA 4WL7A 1HERA 4W53A 3FA0A 3W6EA 4I7KA 1TDYA 187LA 4K5YA 1G0JA 4LT0A 4R0FA 1LAAA 3T6UA 1LSAA 2DQDY 3OK0A 5HLLA 1XSFA 3TXDA 114LA 1B6IA 177LA 3B0KA 3TXKA 1C08C 251LA 4XJHA 3JR6A 227LA 4NFVA 173LA 4DAJA 2MEAA 2ZIKA 1H6MA 4H92A 2QB0B 3A91A 2BPUA 4W55A 181LA 2A7DA 1L51A 4GN4A 4I7MA 1C46A 1GF6A 3OJPA 5DL9A 1SSWA 1UCOA 4ZPUA 3G3BB 1LZYA 2ZQ4A 182LA 2D6BA 1IR9A 1LZ6A 2I25L 1L08A 2HUMA 1GDXA 4KL7A 3N9AA 2BQAA 3HT6A 3FE0A 3GUOA 4ETDA 4HP0A 1JWRA 4YX7C 2GV0A 1VEDA 3WU7A 4ET8A 3NYAA 5E9RA 140LA 2B7XA 1B5ZA 2BQNA 4I7LA 1L71A 4GBRB 4LGKA 3WULA 1HHLA 4ARPA 5L3IA 243LA 3P66A 1J1PY 1IEEA 5I53A 2YBHA 2HUKA 4DJHA 1UIDA 230LA 5KXZA 4CFPA 1LOZA 3AGIA 2RBSA 1D3FA 1XJUA 3A3QA 4NHIA 4B0DA 1CU3A 3HH6A 1DPXA 3NY8A 1L64A 3SB9A 4BADA 213LA 4AXTA 1VFBC 1ZV5L 1BVXA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5HQ1 A;  1JIS A;  3MGW A;  1LHJ A;  3ZEK A;  3P65 A;  3CT5 A;  154L A;  1RCM A;  2C8O A;  1LZD A;  4NHT A;  1G7M C;  2ZIL A;  4MST A;  4DWX A;  3AGG G;  4W94 A;  1LZB A;  1QQY A;  2HU3 A;  2YBJ A;  5A3E A;  3J4G A;  2F4G A;  3CQL A;  1WQM A;  2G4Q A;  3W6F A;  4DD7 A;  1GE0 A;  1D9U A;  3TXI A;  1BWH A;  2Z38 A;  1JUG A;  3GXK A;  1GB8 A;  4LYM A;  4H9I A;  4XJD A;  1OQM A;  4ANR A;  1D0M A;  1JJ1 A;  1GB7 A;  3IJU A;  4H8Y A;  4DDC A;  1IX0 A;  1FKV A;  1HEM A;  1QTK A;  1TEW A;  1HEW A;  4WM3 A;  1B7M A;  1MEL L;  1XGU C;  5B1G A;  5LAF A;  1YQV Y;  4KT3 A;  1UBZ A;  1IOC A;  3B0O A;  1RE2 A;  3WXT A;  1HEQ A;  3P64 A;  5KXY A;  1LSB A;  2EPE A;  1HMK A;  4H94 A;  4CFO A;  4NGZ A;  4WM2 A;  1C45 A;  4NGI A;  3CT0 A;  1DI4 A;  1G7L C;  2FBD A;  1LZC A;  1OUD A;  1IP4 A;  1GF8 A;  3B72 A;  5B06 A;  5M1Y A;  1B7Q A;  1G7H C;  1IP7 A;  4HJY A;  4FDY A;  1LSZ A;  2B5Z A;  4WL7 A;  1HER A;  3W6E A;  2EKS C;  1IO5 A;  1LMC A;  4II8 A;  3G3A B;  4B4J A;  1TDY A;  2BQF A;  1WQQ A;  2BQL A;  4LT0 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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