1L68A

Tolerance of t4 lysozyme to multiple xaa (right arrow) ala substitutions: a polyalanine alpha-helix containing ten consecutive alanines
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKAELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
molecule keywords LYSOZYME
publication title Folding and function of a T4 lysozyme containing 10 consecutive alanines illustrate the redundancy of information in an amino acid sequence.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 59
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1991-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l68A00
242LA 189LA 1QUGA 1L90A 1JQUA 198LA 3OE9A 110LA 4I7PA 3HU9A 1L59A 173LA 1L07A 1L25A 2O79A 2OU0X 170LA 1DYCA 122LA 2OU9A 1D3JA 3GUOA 177LA 222LA 4I7QA 215LA 1L64A 4DAJA 2F32A 4I7OA 1L13A 1B6IA 1P7SA 2RBOA 1L87A 4ARJA 1L67A 1C6CA 1L01A 3DN1A 3DN3A 1CVKA 1LYGA 3UONA 157LA 3FADA 3SBBC 237LA 1QTZA 1G06A 2CUUA 1QT7A 4GRVA 4EKQA 131LA 146LA 1P3NA 1QTDA 126LA 1DYGA 205LA 2ANXA 218LA 1QT5A 4AQNA 3GUMA 3NYAA 147LA 137LA 1L43A 200LA 1D2WA 3JR6A 1PQMA 1L00A 4I7JA 4LDEA 1LWKA 1LYFA 1L97A 2F2QA 4I7LA 1PQJA 4I7MA 175LA 1L56A 1L82A 2L78A 4EKPA 1CV0A 1OWZA 2NTHA 4W58A 1QUOA 3RZEA 3NY9A 171LA 2LCBA 155LA 3FA0A 2HUKA 115LA 129LA 1C65A 1L26A 1G0KA 1L84A 3SB6A 1CV1A 3SBAA 231LA 3CDQA 3PBLA 1L99A 1L54A 149LA 3DN4A 184LA 2QB0B 3V2YA 1L51A 3V2WA 1K28A 1C6FA 252LA 233LA 1DYBA 1LYEA 224LA 235LA 2B72A 1L80A 225LA 1XJTA 1C60A 4PJZA 2O7AA 239LA 2OTZX 1LYIA 3F9LA 3C83A 1L12A 2OE9X 1L29A 3GUIA 1L02A 2RBNA 1LYDA 1PQIA 3HWLA 158LA 1L0KA 3HTFA 1P64A 1C6NA 1L40A 4W57A 2O4WA 1OVHA 3CDVA 1QTBA 120LA 1L61A 5LZMA 4EPIA 2B6ZA 230LA 1L92A 2OE4X 3HDFA 201LA 3GUNA 4W54A 1L31A 4GBRB 1CV3A 1L44A 1L52A 1LW9A 4EPFA 1XJUA 148LE 2RAZX 1L38A 4ARMB 4S0WA 168LA 1C69A 250LA 3HUAA 253LA 1C6JA 3G3WA 1CTWA 213LA 3C80A 4W52A 1QTHA 1DYAA 1L81A 223LA 1L94A 3CDOA 1C6MA 190LA 1P36A 1LYHA 236LA 1EPYA 2RBPA 2RBSA 3HT8A 1C62A 1L42A 2RAYX 1C6QA 1DYEA 1L57A 227LA 2HULA 176LA 1L60A 4W53A 217LA 3HH3A 243LA 240LA 1L36A 3DMXA 221LA 3HT6A 3DMVA 1CU3A 1L77A 1G0JA 103LA 1L21A 4I7SA 1L85A 160LA 220LA 1L24A 162LA 4OO9A 1P56A 1T8AA 3NY8A 1L04A 1L11A 3DMZA 1SSYA 2NTGA 3GUJA 1L53A 1CU2A 1L68A 1SX7A 3HTDA 3HUKA 4I7NA 102LA 118LA 1T6HA 1D3FA 3DN0A 3SN6R 1QS5A 127LA 1G0MA 262LA 1L32A 3C82A 1PQOA 182LA 4W55A 1L88A 191LA 1OWYA 1L03A 3GUKA 4EJ4A 256LA 165LA 1XEPA 3C8SA 1L33A 1ZURA 1LGWA 167LA 1C6KA 3C8QA 2LZMA 1L49A 1C61A 112LA 143LA 228LA 1L34A 4ARLA 4W56A 183LA 114LA 1QS9A 4IAPA 4LDLA 1QT3A 1L35A 1NHBA 4YXAC 1QSBA 3SB7A 3FI5A 3HH6A 140LA 145LA 2A4TA 1P5CA 1KS3A 1C64A 159LA 1L14A 1L66A 1L75A 119LA 169LA 4LDOA 1L93A 3K2RA 3SB9A 1L95A 244LA 164LA 1KY0A 4K5YA 229LA 150LA 241LA 4E97A 1OVJA 1C66A 246LA 3HUQA 1I6SA 1LPYA 3VW7A 1L98A 2B6WA 206LA 1L73A 3DN6A 1T97A 1CU6A 1OYUA 1L50A 2B73A 4I7RA 1D3NA 1L96A 1L22A 181LA 1C6PA 142LA 209LA 3CDTA 3HT9A 144LA 1QUDA 1L06A 3GULA 1DYDA 125LA 1CV4A 3OE6A 104LA 4EKSA 2ANVA 1LLHA 1L41A 219LA 4W59A 1OV7A 1KNIA 212LA 2B6XA 3HT7A 180LA 1G0PA 1C6DA 1LI2A 1L16A 1LYJA 4W51A 174LA 1T8GA 216LA 1OV5A 1L48A 1C6GA 1L76A 1KW5A 3SB8A 199LA 4ARQA 3GUPA 188LA 245LA 1L20A 3LZMA 1G0GA 123LA 3DN8A 258LA 1QT6A 3L2XA 1CX6A 1JTNA 178LA 1L15A 1QSQA 3DNAA 3HTBA 108LA 4DKLA 1C6BA 109LA 3DN2A 186LA 1QT8A 5I14A 111LA 113LA 1L70A 1ZYTA 195LA 1P2LA 4EXMA 251LA 4I7TA 1L30A 1SX2A 1L65A 196LA 3C7WA 139LA 2OEAX 1JTMA 214LA 1CV5A 1L58A 163LA 2RBRA 3HU8A 226LA 1L69A 1DYFA 1SWZA 1L19A 1L72A 3G3XA 261LA 192LA 1C63A 4DJHA 1G1WA 6LZMA 3ODUA 1L86A 4EKRA 1L91A 1KW7A 1CV6A 1L55A 1P37A 172LA 152LA 211LA 4LZMA 1OVKA 247LA 2RB1X 3OE8A 234LA 260LA 1C6AA 7LZMA 1LI6A 156LA 2QARC 3C8RA 1C67A 3SB5A 1SWYA 4ARMA 1L45A 185LA 1L62A 2RB0X 3QAKA 3HTGA 138LA 161LA 1L83A 1L74A 3PDSA 4ARQB 4ARPA 248LA 4YX7C 1QT4A 187LA 3OE0A 254LA 1L37A 1QUHA 3C7YA 1P2RA 1C6LA 2RB2X 1L39A 1QTVA 1C6HA 3CDRA 1L47A 4I7KA 1ZWNA 4ZPUA 1LWGA 2IGCA 1L46A 3C81A 1G07A 3HDEA 1G1VA 1L63A 232LA 2B6TA 1C6TA 2OTYX 1L27A 3RUNA 259LA 1CU5A 238LA 1LGUA 2Q9EA 1L18A 2B74A 3L64A 4PK0A 1C6EA 1D9WA 2RBQA 2F47A 1LGXA 1LI3A 2LC9A 1CU0A 3G3VA 1WTHA 1TLAA 1L08A 1L23A 2B75A 2B7XA 4YXCA 1L10A 2B6YA 3F8VA 151LA 2Q9DA 2B70A 107LA 130LA 2OU8A 3DKEX 1PQDA 1L09A 210LA 197LA 1C6IA 2Z6BA 1L0JA 1L89A 1PQKA 1P6YA 1L28A 1D3MA 1P46A 1SSWA 1L71A 128LA 1T8FA 1G0QA 2RH1A 3HH5A 2OE7X 141LA 3C7ZA 166LA 1C68A 1D2YA 1CUPA 1CUQA 1L79A 1L17A 255LA 3D4SA 3HH4A 1L05A 1G0LA 257LA 1KY1A 1CX7A 249LA 2HUMA 3EMLA 1QTCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
242LA 1QUGA 2FBBA 4AGAA 4WLTA 1JQUA 198LA 1GF4A 4LYMA 208LA 2HUBA 1L25A 1D3JA 5M1YA 1C6CA 4XENA 1L01A 4H1PA 3TXJA 3UONA 4ML7A 1QSWA 1IWYA 4NGZA 4GRVA 1BB6A 2ZIJA 146LA 1QTDA 2ANXA 4J1AA 1DQJC 4ET8A 137LA 1L00A 4I7JA 2F2QA 3ATNA 1PQJA 2FYCA 175LA 1LZYA 1YKZX 2BPUA 1B5VA 2DQDY 5IELA 1TBYA 4MSTA 155LA 115LA 1C65A 1HERA 2HEEA 2DQEY 3CDQA 3PBLA 1LSGA 5KXLA 3DN4A 4WM1A 184LA 1KXWA 3A67Y 233LA 1CKGA 2LYMA 3F9LA 3CSQA 1FLUA 1LZNA 2RBNA 1PQIA 2DQGY 1RI8B 4EOFA 1C6NA 1UICA 1YAOA 1LJ3A 2O4WA 3ZVQB 4ZIXA 120LA 1TDYA 1L61A 4EPIA 3HDFA 4H94A 1GXV2 4PHIA 1LJFA 1L44A 4H9IA 1XJUA 3B72A 148LE 2D4IA 4N0JA 3HUAA 3TXFA 250LA 3WU8A 213LA 3F6ZA 1D6QA 1L81A 1W08A 3LYMA 1QDRA 190LA 1GBZA 2RBPA 1EPYA 2BQKA 1C62A 1GF7A 1C6QA 133LA 227LA 1B5ZA 3HH3A 4NHTA 1N4FA 1Z55A 1I56A 3HT6A 4YF2A 3D3DA 4B1AA 1CU3A 1GXXA 1XEIA 160LA 220LA 2BQBA 3WVXA 1LJKA 4OO9A 2G4PA 3NY8A 4NGWA 4Z98A 2MEDA 3DMZA 4D9ZA 4II8A 1GFTA 1UIAA 1LZCA 127LA 1O23A 5C6JA 1PQOA 1IR8A 4W55A 4DD1A 1L88A 4OWBA 3GUKA 256LA 5HQ1A 1GBOA 1ZURA 1WQPA 1C6KA 3C8QA 1LYSA 1GF5A 114LA 3LZ2A 5L3HA 1QT3A 5KXSA 1F6SA 4TX7A 1LTMA 1LSFA 159LA 1L14A 2RSCA 3K2RA 3EMSA 3SP3A 4OWCA 150LA 4KT3A 2HU3A 4E97A 1C66A 3AZ4A 1T97A 1CU6A 3P4ZA 1XGTC 1D3NA 1GB3A 3CSRA 1IWZA 1C6PA 5HMVA 142LA 209LA 2HEBA 2H5ZA 1LMAA 4LT1A 1QUDA 4LT3A 4C5FA 1WTNA 4MR1A 3RW8A 1GFHA 1KNIA 1CNSA 1AKIA 4CJ2A 1G0PA 3WUAA 3W6EA 216LA 1OV5A 4X3BA 1D9UA 3KAMA 4KL7A 1GFJA 199LA 5LINA 3GXRA 3WW5A 4XJHA 1I20A 4YM8A 5L3IA 1QT6A 3L2XA 1CX6A 178LA 4BADA 3HTBA 108LA 1UCOA 1LHIA 1A2YC 1LMPA 2HTXA 1KIQC 1P2LA 1IOTA 251LA 1JTMA 214LA 1CV5A 1LSBA 5LAFA 6LYTA 1IORA 1IIZA 1IC7Y 1IEEA 1C63A 2BQJA 3ODUA 3G3AB 5DL9A 3CT5A 1OUIA 1L55A 4NGYA 3LYTA 2ZWBA 152LA 1B7NA 4LZMA 2RB1X 3OE8A 1LMQA 1F6RA 5B59A 260LA 4GCFA 2IHLA 1CKDA 1QUTA 1IWWA 3IWRA 4MCKA 1XEKA 1HEWA 1L62A 3QAKA 3HTGA 138LA 161LA 2YBLA 4YX7C 4A7DA 2YSSC 1FLYA 4QDNA 1B7RA 1UBZA 3CDRA 4I7KA 2IGCA 1L46A 1GB5A 1LHKA 3HDEA 4RW2A 5KY1A 2EIZC 2OTYX 1FKVA 5A3EA 1L18A 1LZEA 2F47A 3G3VA 1WTHA 1BHZA 3A8ZA 4N1EI 4YXCA 130LA 4WLYA 3A92A 5E9RA 5LAGA 2N5ZA 1IVMA 2Z6BA 1L0JA 1DKJA 3AGIA 2XBRA 1OP9B 1YAQA 1JTPL 4GCCA 1L28A 1J1OY 3A90A 1I1ZA 3AW6A 1G0QA 4GN5C 4ZEEA 141LA 2G4NA 5F9XA 1IX0A 1L79A 1L17A 4XADA 4HSFA 255LA 2CJLA 1REZA 3OJPA 257LA 1UACY 2X0AA 5B1FA 2MEGA 1KY1A 1GFRA 4NHIA 4HJZA 2PC2A 3EMLA 4RLMA 1L90A 1CKFA 3HU9A 1H6MA 1L07A 2O79A 1NKHA 2OU0X 1NDMC 3GUOA 177LA 1BB7A 2Z18A 4DAJA 207LA 2ZYPA 4H9EA 1RJCB 4CHXA 1HHLA 2Z39A 3DN1A 1CVKA 4HV2A 157LA 1LSZA 3ZVQA 3TXIA 3SBBC 1G06A 4NSIA 2CUUA 2MEBA 1RFPA 4RDSA 218LA 3NYAA 1ZVHL 4WO6A 3P66A 1LWKA 1T3PA 1UIEA 1L56A 4EKPA 1QUSA 4G4CA 4W58A 1QUOA 3NY9A 1MLCE 2DQJY 2BQOA 2LCBA 4TSBA 129LA 2LYZA 4FJRA 4M4OA 1IWTA 3SB6A 4DD9A 231LA 1GBYA 1L99A 3B0IA 1L54A 4NHPA 2YBJA 149LA 2QB0B 1L51A 2EKSC 1DYBA 224LA 4LYCA 235LA 3J4GA 2B5ZA 1A4VA 2O7AA 4BS7A 3AB6A 5L9JA 1HSXA 134LA 1AT5A 4CGEA 1LYDA 3HBEX 3LYZA 1L40A 2HEDA 1OVHA 2Z38A 5F81A 3WXUA 4WM4A 2EQLA 201LA 3GUNA 1L31A 2YDGA 1VDTA 3QY4A 1GE4A 4H8YA 168LA 1B7PA 3G3WA 3WW6A 1QTHA 1DYAA 1DPXA 1OUGA 3A94A 4WM6A 3CB7A 4H9BA 1BVXA 1YANA 1ZVYB 1P2CC 2HULA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 242L A;  1QUG A;  2FBB A;  4AGA A;  4WLT A;  1JQU A;  198L A;  1GF4 A;  4LYM A;  208L A;  2HUB A;  1L25 A;  1D3J A;  5M1Y A;  1C6C A;  4XEN A;  1L01 A;  4H1P A;  3TXJ A;  3UON A;  4ML7 A;  1QSW A;  1IWY A;  4NGZ A;  4GRV A;  1BB6 A;  2ZIJ A;  146L A;  1QTD A;  2ANX A;  4J1A A;  1DQJ C;  4ET8 A;  137L A;  1L00 A;  4I7J A;  2F2Q A;  3ATN A;  1PQJ A;  2FYC A;  175L A;  1LZY A;  1YKZ X;  2BPU A;  1B5V A;  2DQD Y;  5IEL A;  1TBY A;  4MST A;  155L A;  115L A;  1C65 A;  1HER A;  2HEE A;  2DQE Y;  3CDQ A;  3PBL A;  1LSG A;  5KXL A;  3DN4 A;  4WM1 A;  184L A;  1KXW A;  3A67 Y;  233L A;  1CKG A;  2LYM A;  3F9L A;  3CSQ A;  1FLU A;  1LZN A;  2RBN A;  1PQI A;  2DQG Y;  1RI8 B;  4EOF A;  1C6N A;  1UIC A;  1YAO A;  1LJ3 A;  2O4W A;  3ZVQ B;  4ZIX A;  120L A;  1TDY A;  1L61 A;  4EPI A;  3HDF A;  4H94 A;  1GXV 2;  4PHI A;  1LJF A;  1L44 A;  4H9I A;  1XJU A;  3B72 A;  148L E;  2D4I A;  4N0J A;  3HUA A;  3TXF A;  250L A;  3WU8 A;  213L A;  3F6Z A;  1D6Q A;  1L81 A;  1W08 A;  3LYM A;  1QDR A;  190L A;  1GBZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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