1L68A

Tolerance of t4 lysozyme to multiple xaa (right arrow) ala substitutions: a polyalanine alpha-helix containing ten consecutive alanines
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKAELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Folding and function of a T4 lysozyme containing 10 consecutive alanines illustrate the redundancy of information in an amino acid sequence.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME
total genus 59
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1991-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l68A00
2F32A 4I7TA 1L73A 1L21A 4ZPUA 1L04A 1D9WA 1T8GA 1C6LA 3C82A 1TLAA 1QT4A 1D3JA 3VW7A 140LA 1L59A 3SB8A 1XEPA 1KY1A 216LA 1LPYA 4W55A 250LA 4I7QA 1L99A 252LA 1L36A 213LA 176LA 2O7AA 4EKQA 2OTYX 4OO9A 3JR6A 1L47A 1C63A 230LA 4YX7C 1L87A 3C8QA 1L81A 1CU6A 1P56A 3G3XA 1G07A 1C6QA 1SSYA 242LA 3SB6A 2OE7X 1KW7A 1L0KA 2B6TA 2B74A 3V2WA 1L17A 3DN8A 4LZMA 1SX2A 1L51A 3DMXA 152LA 102LA 1L88A 3QAKA 1ZYTA 1C6EA 3GUPA 171LA 128LA 1QTVA 161LA 4ARMB 1OVJA 1L16A 2OU9A 1L41A 4I7OA 2OTZX 1PQMA 3SN6R 112LA 1DYDA 201LA 147LA 2B73A 1L68A 1QUHA 2A4TA 1QT3A 1B6IA 1T6HA 1QUGA 1C6AA 243LA 1QS9A 1L94A 2O79A 1KW5A 1L20A 211LA 3HDEA 1QT5A 1L67A 2OE9X 1L19A 3HTDA 1G0LA 1SX7A 1L80A 1L75A 1L61A 1CU0A 1LYDA 1ZURA 1L79A 1QTZA 1DYAA 155LA 2B7XA 151LA 1DYEA 1PQOA 1C66A 3SBAA 1L44A 1P36A 1QTCA 2B6ZA 3HUAA 3UONA 158LA 221LA 175LA 1L45A 1C6TA 224LA 1G0KA 1L46A 1L08A 3RZEA 170LA 234LA 1G0QA 1L33A 108LA 236LA 4S0WA 1L14A 2QB0B 3GUNA 3L2XA 1JTMA 3NYAA 3FADA 123LA 1L31A 1L30A 145LA 1C6HA 240LA 3DKEX 3EMLA 1CU5A 255LA 113LA 1L27A 200LA 210LA 3HU9A 1C64A 2B72A 165LA 166LA 3OE0A 1L91A 162LA 4LDLA 4EPFA 3HH4A 1CV4A 238LA 185LA 104LA 1P46A 232LA 248LA 1P2RA 258LA 214LA 244LA 4YXAC 245LA 1L60A 1C60A 3ODUA 3CDRA 1SWYA 247LA 1L96A 3L64A 246LA 4GBRB 109LA 1LYJA 1T8FA 174LA 2B6XA 199LA 3HU8A 1QT8A 1L05A 1C6JA 1L86A 6LZMA 2F47A 1LWKA 146LA 3CDOA 160LA 1L63A 168LA 1L83A 130LA 1L76A 1G0GA 1P2LA 3HWLA 1QTHA 3GUMA 1ZWNA 1L49A 4DJHA 1EPYA 1C68A 1L52A 3DMZA 1P6YA 3DN3A 1L48A 139LA 1L18A 181LA 2RH1A 2RBPA 1L28A 1L06A 1LWGA 1KNIA 3NY8A 1L57A 3HUQA 1K28A 2ANXA 1CV5A 1C6IA 1OYUA 4ARQA 4I7LA 198LA 195LA 1L82A 184LA 219LA 138LA 3HTBA 1OV7A 4I7NA 142LA 156LA 1CV6A 173LA 4ARLA 257LA 1CU3A 163LA 1C65A 251LA 1L58A 2NTGA 3SB7A 1G0JA 2HULA 3PBLA 239LA 1SSWA 3HTFA 4LDEA 1PQKA 1KS3A 206LA 2OEAX 1CV0A 149LA 1L53A 1L89A 129LA 1T8AA 1L01A 1OVKA 3C7WA 3G3WA 1L62A 259LA 114LA 126LA 167LA 4EKRA 1CX6A 1L90A 220LA 1C6PA 2OU8A 2HUKA 1LYFA 2CUUA 231LA 186LA 3LZMA 1LGXA 2Z6BA 1DYFA 2IGCA 1L07A 119LA 2B75A 1CU2A 1L74A 4YXCA 254LA 2O4WA 225LA 261LA 1JQUA 7LZMA 1P3NA 1L09A 143LA 229LA 235LA 1L38A 249LA 1L93A 2Q9EA 3V2YA 3HUKA 218LA 3DNAA 228LA 1C6MA 1C6NA 1QT6A 2B6WA 1L69A 3G3VA 1C6KA 1C6CA 1OV5A 1CV3A 1L11A 4I7PA 256LA 4ARQB 4EKPA 3GUKA 2Q9DA 3CDTA 1XJTA 1C69A 3C8SA 192LA 1L15A 2B6YA 3FI5A 1P37A 1PQJA 188LA 2RB1X 1L29A 3HTGA 148LE 4W52A 1L34A 1L77A 4IAPA 3C80A 1LI3A 260LA 4PK0A 1L37A 1OVHA 4GRVA 1LI6A 3GULA 1L0JA 1PQIA 144LA 1L70A 215LA 2ANVA 1L66A 1LW9A 3FA0A 4DAJA 209LA 1D2YA 1P7SA 3OE9A 1L42A 1L13A 1CTWA 3DN6A 3HT8A 2RB0X 1I6SA 1C67A 5LZMA 1LLHA 1L55A 4K5YA 1T97A 157LA 115LA 177LA 4EXMA 237LA 3D4SA 222LA 4W54A 1G06A 1QUOA 3DN2A 1WTHA 197LA 2OU0X 1L98A 110LA 1CX7A 3SB5A 137LA 164LA 4PJZA 1P64A 2LCBA 3GUIA 1L97A 2QARC 1LGWA 1C6GA 3C7YA 3DN4A 3OE6A 2RBQA 4W59A 3F9LA 3DMVA 189LA 150LA 1L85A 1L23A 3CDQA 1L40A 3F8VA 3HDFA 3SB9A 1LI2A 1XJUA 4W53A 1L72A 4AQNA 1LYEA 159LA 1L64A 1QSQA 3HH5A 107LA 1P5CA 2LC9A 3GUJA 1D2WA 180LA 241LA 4EJ4A 1CUQA 4EPIA 2RBRA 1C61A 141LA 1G1VA 1L00A 2HUMA 2RB2X 118LA 1QS5A 2OE4X 4W56A 1L24A 191LA 111LA 223LA 1L26A 1DYCA 1QUDA 227LA 1L95A 1C6DA 178LA 1OWZA 1G0MA 125LA 3HH3A 4E97A 3OE8A 2B70A 3GUOA 1QTBA 1OWYA 3C7ZA 1CV1A 1PQDA 183LA 1L10A 1C6BA 4W57A 103LA 1D3MA 1LYGA 1C62A 127LA 253LA 3DN0A 262LA 1L65A 1L54A 4I7SA 120LA 187LA 2RAZX 1L92A 1L12A 1L71A 1CUPA 1DYGA 1L50A 131LA 2RBSA 5I14A 3SBBC 3C8RA 4ARPA 1L32A 1L22A 4ARJA 3HT7A 4I7MA 3C81A 1D3FA 3RUNA 1DYBA 4EKSA 217LA 2RAYX 1L84A 1G0PA 1JTNA 1SWZA 226LA 1G1WA 233LA 3HT9A 1NHBA 212LA 122LA 196LA 1C6FA 1L35A 2NTHA 1L56A 1L39A 2RBOA 4I7RA 1QSBA 1L02A 4I7JA 1L25A 1D3NA 3CDVA 2RBNA 1QT7A 3C83A 1LYHA 1KY0A 4LDOA 3DN1A 4W58A 2L78A 169LA 4I7KA 2F2QA 3HH6A 172LA 4ARMA 1QTDA 205LA 2LZMA 4DKLA 190LA 182LA 3PDSA 3NY9A 4W51A 3HT6A 1CVKA 3K2RA 1L43A 1L03A 1LYIA 1LGUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2EIZC 1WQRA 1D9WA 1GEVA 2HEEA 2AUBA 2DQEY 1NDMC 1IORA 1KY1A 1XEPA 1QSWA 2LYOA 1TEWA 176LA 3ZVQB 5F81A 3JR6A 3A6CY 4HP0A 4I0CA 2Z2FA 4CGEA 1L87A 1HENA 3G3XA 1SSYA 1YKZX 2HEBA 4B4EA 1FLQA 1KW7A 4NGKA 2B74A 3V2WA 1L17A 4LZMA 1LMCA 1UIGA 2YBIA 152LA 2G4QA 102LA 1GFEA 1BB4A 3GUPA 4GN5C 1QTVA 1LZYA 5E4PA 1I20A 2FYDA 4LFPA 1L41A 4I7OA 5A3ZA 4DD3A 1CKCA 3HFMY 4WL6A 1B6IA 4WM2A 1FKQA 3TXFA 8LYZA 1EQ4A 1L94A 4J7VA 1VAUA 4OWAA 3HDEA 1QT5A 5KJ9A 4BAFA 1G0LA 1G7LC 4DDBA 1L80A 4DQ5A 2C8PA 1GDWA 1LYDA 1XGUC 5DM9A 2F30A 1G7JC 2B6ZA 2Z39A 5E9RA 1IOCA 1IWTA 3E3DA 2HECA 2F4AA 234LA 1HHLA 236LA 1L14A 3GUNA 3HBDA 1JTMA 3NYAA 4DD2A 1L31A 4H8YA 4UWNA 1GFAA 4HPIA 3A8ZA 210LA 1GB9A 5FSTA 5L9JA 1L91A 1LZCA 162LA 1UIBA 4EPFA 1B9OA 1IOQA 5HMVA 1CV4A 2YBMA 2HEAA 4RLNA 185LA 5LVGA 104LA 1P46A 2MEEA 3A96A 5KKIA 4TSCA 2BQMA 1C60A 5KXZA 4ETBA 3CDRA 1SLYA 3L64A 246LA 1GHLA 1T8FA 1IOSA 1BQLY 1QT8A 1OUFA 3HU8A 1L86A 1CJ9A 1L63A 4N1EI 4GN4A 130LA 1G0GA 1P2LA 2MEDA 1JPOA 4DQ7A 1PS5A 1QDRA 1P6YA 1IP4A 4XYYA 1IOTA 4KPMA 1YIKA 1JJ3A 2RBPA 4XJHA 1L28A 1LJGA 6LYZA 1G7MC 2ZNXY 3WPJA 5LA5A 3FI7A 1GFHA 3MGWA 1WQPA 2FBBA 3HTBA 1OV7A 4ARLA 251LA 2YBLA 3WULA 3SB7A 2HULA 3HTFA 1V7SA 1KS3A 149LA 1T8AA 1GXXA 2LHMA 114LA 5F14A 3A91A 220LA 1LZ9A 3GXRA 1C6PA 1WQMA 2OU8A 1N4FA 2HUKA 3A3QA 1DYFA 2IGCA 119LA 1QIOA 1LMAA 3B0OA 3LZTA 3TMXA 1I56A 229LA 235LA 4GCBA 3HUKA 218LA 2ZNWY 1JWRA 1OV5A 1L11A 1BWJA 4HTNA 3GUKA 4RDSA 1L15A 1PQJA 4CHXA 1BB3A 2BQLA 188LA 2BQDA 4XJGA 5DLAA 3C80A 2DQHY 2BQFA 1W6ZA 4LYBA 2LZ2A 3B6LA 5EBHA 5I4YA 1L0JA 3W6FA 1L70A 1GFKA 4NGJA 1LZEA 1HMKA 1AZFA 5FDJA 3OE9A 1L42A 4BS7A 4H94A 1CTWA 2RB0X 1F10A 1C67A 4WLDA 157LA 2WARA 1DKKA 2DKVA 4EXMA 177LA 4GCCA 4W54A 4OOOA 3DN2A 197LA 1WTHA 4R0FA 1KIRC 3TMUA 3SB5A 1CX7A 1IWWA 4L41A 164LA 5KXPA 1P64A 5I53A 5K7OA 1NWGA 4DD9A 1EL1A 3IWRA 1NHEA 1EQEA 4H9BA 3DMVA 189LA 2BQIA 150LA 1L85A 1LSFA 5KXRA 1GB5A 4W53A 4DDAA 5LINA 1C10A 4H92A 1GF5A 1L64A 1LZTA 1YANA 1DQJC 241LA 1VDQA 1GPQC 1LMPA 1AKIA 141LA 1G1VA 1V7TA 1L00A 2OE4X 2YBNA 227LA 2D91A 4TTDA 2I26L 1YAQA 1C45A 2I6ZA 1GB2A 4LYZA 3OE8A 2B70A 3GUOA 3C7ZA 4H9FA 1PQDA 5D5CA 4W57A 1D3MA 5D5FA 2Z38A 4HTQA 1GF6A 1L54A 4YF2A 4NWEA 1KXWA 3WXUA 1L12A 3D9AC 1L71A 3CT5A 2RBSA 5I14A 1YKXX 3CT1A 4I7MA 3F6ZA 4GN3A 3AGGG 3RUNA 5AMYA 1DYBA 1B5XA 1GE2A 2BQNA 5FHWA 3ZVQA 5KKJA 2RAYX 1LYOA 3GXKA 1G0PA 4KL7A 1DI5A 4GLVA 1WTMA 1NHBA 3N9EA 1L56A 4I7RA 4N9RA 1LHJA 1L02A 4I7JA 1IP2A 2XBRA 4H9EA 2RBNA 5HQ1A 1LZDA 2L78A 4DQJA 1IX0A 1LSGA 4I7KA 2BQGA 2BAAA 1GF4A 4W51A 4II8A 4LT0A 1IVMA 2D4JA 5LVKA 5F9XA 1L03A 1GWDA 2ZYPA 1C46A 4WLYA 4YM8A 2BQEA 1L21A 3WUAA 1AT5A 1TLAA 1D3JA 3VW7A 5ILCA 140LA 216LA 4W55A 2DQAA 1WTNA 250LA 4I7QA 1LZAA 1CKGA 4Z98A 252LA 4NGYA 4OO9A 4Z3MA 1JHLA 3C8QA 1L81A 1HEPA 3B0KA 242LA 1CJ8A 4WM6A 2OE7X 2BQAA 1DXJA 4FJRA 1L88A 3QAKA 3CSRA 4NHTA 4PRUA 2MEIA 1ZYTA 1HEMA 4OWBA 128LA 4QDNA 4N5RA 161LA 4ARMB 1OUBA 4ET9A 2OTZX 3SN6R 112LA 1DYDA 1L68A 1REZA 4B49A 1B7MA 1B5WA 1J1PY 4N1CC 3AW7A 1C6AA 1UIFA 1GFJA 5LIOA 1NMMA 3CQLA 1L67A 2OE9X 4HSFA 1LZSA 4LYCA 2ZWBA 2BQOA 1L75A 1OUAA 1KIPC 1L61A 1C7PA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2EIZ C;  1WQR A;  1D9W A;  1GEV A;  2HEE A;  2AUB A;  2DQE Y;  1NDM C;  1IOR A;  1KY1 A;  1XEP A;  1QSW A;  2LYO A;  1TEW A;  176L A;  3ZVQ B;  5F81 A;  3JR6 A;  3A6C Y;  4HP0 A;  4I0C A;  2Z2F A;  4CGE A;  1L87 A;  1HEN A;  3G3X A;  1SSY A;  1YKZ X;  2HEB A;  4B4E A;  1FLQ A;  1KW7 A;  4NGK A;  2B74 A;  3V2W A;  1L17 A;  4LZM A;  1LMC A;  1UIG A;  2YBI A;  152L A;  2G4Q A;  102L A;  1GFE A;  1BB4 A;  3GUP A;  4GN5 C;  1QTV A;  1LZY A;  5E4P A;  1I20 A;  2FYD A;  4LFP A;  1L41 A;  4I7O A;  5A3Z A;  4DD3 A;  1CKC A;  3HFM Y;  4WL6 A;  1B6I A;  4WM2 A;  1FKQ A;  3TXF A;  8LYZ A;  1EQ4 A;  1L94 A;  4J7V A;  1VAU A;  4OWA A;  3HDE A;  1QT5 A;  5KJ9 A;  4BAF A;  1G0L A;  1G7L C;  4DDB A;  1L80 A;  4DQ5 A;  2C8P A;  1GDW A;  1LYD A;  1XGU C;  5DM9 A;  2F30 A;  1G7J C;  2B6Z A;  2Z39 A;  5E9R A;  1IOC A;  1IWT A;  3E3D A;  2HEC A;  2F4A A;  234L A;  1HHL A;  236L A;  1L14 A;  3GUN A;  3HBD A;  1JTM A;  3NYA A;  4DD2 A;  1L31 A;  4H8Y A;  4UWN A;  1GFA A;  4HPI A;  3A8Z A;  210L A;  1GB9 A;  5FST A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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