4DD0A

Eval processed hewl, cisplatin aqueous glycerol
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
publication title Structural studies of the effect that dimethyl sulfoxide (DMSO) has on cisplatin and carboplatin binding to histidine in a protein.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
total genus 49
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-01-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4dd0A00
5KJ9A 5LIOA 5AMYA 1F6SA 5L3HA 5KXLA 5LVGA 1J1XY 3EMSA 4WG1A 2HEEA 4UWUA 2D4IA 4OWAA 4CFOA 4NEBA 1WQPA 1MLCE 1LJ3A 4G4HA 1AT6A 4R0FA 3W6BA 2BQEA 2MEGA 154LA 153LA 1JPOA 2A7FA 1QDTA 2F2NA 3RNXA 2G4PA 5F9UA 1XFPL 134LA 1NDMC 1W6ZA 4TSCA 5HQ1A 1FBIX 2XBRA 4GN4A 4PPOA 1WVUA 1GB7A 3ZVQA 1LZTA 3LZ2A 4P2EA 2CGIA 1GB3A 4H91A 1RE2A 2D6BA 1YANA 2DQHY 5LVIA 1BB7A 3A67Y 1WQOA 5F9XA 1VDTA 1GAZA 1JIYA 1IC5Y 1YKZX 5LXWA 4WOAA 4Z3MA 1YL1X 2MEDA 2MEEA 8LYZA 1INUA 3M18B 1IP6A 4NY5A 1C45A 4LT3A 1G7JC 2BQAA 1HEPA 4MCKA 4TX7A 1D0KA 3TXHA 1T6VL 1G7LC 4B49A 1UC0A 1HELA 2DQCY 2F4GA 1FLWA 1FDLY 1FLYA 4LYCA 3W6DA 1REXA 3ZEKA 1W08A 3F6ZA 4G9SA 5K7OA 1LKRA 1Z55A 1JSEA 1TAYA 1B7NA 1B7OA 1LSAA 2FBBA 4TTDA 4KPMA 2Z39A 1FN5A 4HTQA 3W6CA 3WH1A 3TXGA 1HMKA 2BQOA 4N9RA 4NG1A 4J0LA 1KXYA 1LJKA 9LYZA 1LZRA 5IHGA 1VDSA 5LVHA 1YAQA 5DL9A 1RFPA 1OUBA 2H5ZA 5EBHA 3G3AB 4MR1A 1GD6A 4NSIA 3LYOA 3A94A 4RLNA 2EIZC 3B72A 1HMLA 4WL6A 1HSWA 4CGEA 1GFEA 1IO5A 1VEDA 1GFAA 1LZ6A 2DQAA 3CQLA 1B5VA 4WM5A 2MEBA 4CJ2A 2EKSC 2LYZA 4TUNA 1D6PA 4QGZA 4XJGA 1RCMA 4ETAA 1C43A 1IOTA 1LYYA 5JENB 5KXTA 5DLAA 2X0AA 5B06A 4H9CA 1KIQC 2VB1A 2WARA 2W1YA 2Y8PA 2LZTA 3W6FA 3WUMA 4YM8A 1HFYA 4MSTA 1JSFA 3B0OA 1LSCA 3HFMY 3OJPA 4RDSA 1FLUA 1OUAA 1LZSA 1YL0X 5C6LA 4G49A 1HEOA 1LMCA 4NHSA 4XJFA 5I54A 2F30A 3CSQA 4KT3A 5D5FA 4Z46A 3A90A 2D4JA 4RW2A 4WLTA 1B7RA 1REYA 1EQEA 4XENA 1SQ2L 1JJ0A 5LVKA 1EQ4A 1LYOA 1UIFA 1UIDA 1YAPA 2HTXA 3AGIA 1ZVYB 3AW7A 3WL2A 5I5QA 1GFJA 2EQLA 5KXWA 2ZILA 3M3UA 4GLVA 3CT0A 2HU3A 3A92A 3A96A 3A3RX 5HNLA 1UACY 1V7SA 1YROA 4ETBA 3CB7A 4HPIA 4PGJB 1JEFA 2YBMA 2Z38A 1IR7A 1OUFA 2BAAA 4N5RA 5E4PA 4NFVA 1HSXA 1GF5A 1IY4A 3AZ7A 5FDJA 1GWDA 2LYMA 2YVBA 2N5ZA 4R6CA 1RJCB 1IOQA 4HPEA 1DI3A 5LVJA 1WTMA 2H9JA 4NGKA 1YAOA 5LAGA 2D4KA 1N4FA 5M1YA 1B7PA 1KXWA 1J1PY 1OUEA 1PS5A 1VFBC 1XEIA 2B5ZA 4B1AA 3CSRA 2BQGA 1XEJA 2HECA 6LYZA 4LT0A 1MELL 2C8PA 1DKKA 3WPLA 1JTPL 2AUBA 3AGGG 4H9HA 5DM9A 3WU8A 4H9FA 1GB6A 4UWVA 2DQIY 4DD9A 4G4BA 4RLMA 3A95A 1LSNA 4YEMA 135LA 2ZYCA 1LSDA 1NWGA 2W1XA 4ZFPA 4GN5C 4HJYA 1LZYA 2ZQ3A 1JHLA 4NWHA 5B1FA 4WL7A 2HEAA 4C3WA 1GB2A 2I26L 4XJDA 1IR8A 3WVXA 4GCFA 3MGWA 4NGJA 4NSJA 5T3FA 1GB9A 3AB6A 5LYZA 1IWVA 1LZDA 3A6CY 3LYZA 4BADA 3LYMA 3B0KA 3TXFA 2YBLA 3FE0A 4DC4A 1GF4A 1LZNA 3WPKA 3AW6A 1LSFA 1LMPA 4J7VA 5F14A 1JISA 5IDDA 2ZWBA 1IR9A 5KKIA 5KXXA 2DQJY 1QTEA 2NWDX 1EL1A 3ATNA 2G4QA 1KXXA 1B5ZA 4H93A 4LZTA 1ZV5L 4IJ4A 4PJ2C 1HFXA 1LZ9A 4WLDA 5E9RA 4IASA 1GDWA 1LZCA 1LJIA 2DKVA 1IP5A 3WPJA 1UIEA 5APCA 1OUCA 3AZ4A 5APDA 1HENA 1LZ4A 4Z98A 1LZ8A 3TMWA 4N8ZA 1IVMA 4NGOA 1AT5A 1HEMA 1LTMA 2I25L 4H9IA 2BQBA 3J4GA 4HP0A 4KL7A 1HC0A 4H94A 1LZGA 3RW8A 1LSBA 3FI7A 1GFRA 4WMGA 1BB3A 1GBOA 1LMAA 4NGLA 4GCEA 1HERA 2W1MA 4NWEA 4W96A 2BQHA 2I6ZA 1CNSA 1B5WA 1KIPC 1AKIA 1GBSA 1LKSA 1UCOA 3A3QA 1DI5A 3EBAB 4NGYA 2XJWA 4NSGA 4B0DA 4WM1A 1BQLY 1GFHA 5KXPA 1G7IC 207LA 3QY4A 1CKFA 4H8YA 5LINA 1CJ7A 4OWHA 2BQIA 1C7PA 1GBWA 2RSCA 2ZIKA 1GFVA 1LMOA 4PRQA 5F81A 4DYGA 2F4AA 4QEQA 1OUIA 4H9BA 4LT1A 3WUAA 2DBTA 1HF4A 4ETCA 5KXZA 1YAMA 1OUDA 3N9CA 1FKVA 4WM4A 3TXKA 3WXUA 4H9EA 1B7MA 2A7DA 4I8SA 3W6AA 1DQJC 1HEWA 4TSBA 1OUHA 4LYOA 4OWEA 3EO5A 1BWIA 1LHJA 4LYTA 1LHKA 4NHIA 1GHLA 4H8ZA 4GCBA 4HV2A 1B7QA 4OOOA 2HEDA 1OP9B 1BB5A 1LZ1A 2DQFC 3AZ6A 194LA 4X3BA 1JUGA 3RU5A 4CFPA 5KXOA 1XGPC 2YBJA 1IWWA 133LA 1BB4A 3LN2A 5B59A 2BQLA 4B4EA 1JJ1A 4IATA 4ET8A 1O23A 3TMVA 1BB6A 1J1OY 1GFTA 4N0JA 1GPQC 5D5CA 1JKDA 2MEFA 4DWXA 4M4OA 3HBHA 1F10A 1IOCA 3P64A 5IELA 3N9AA 4ET9A 1IWZA 1I56A 2EPEA 1D0LA 1VATA 1JWRA 1GF8A 3T36A 5LA8A 1GF9A 3IWRA 4LYBA 3WYHA 1A2YC 3RT5X 2YBHA 1LJEA 3K3TA 3WW5A 4WO9A 4XJHA 1JITA 1GBXA 3CT5A 4G4CA 5KXRA 1IC7Y 1A4VA 1CKCA 3P68A 4XN6A 2BQJA 2W1LA 2H9KA 1GFGA 1GB5A 1JTTL 1WQRA 2FYDA 1QSAA 1CJ8A 4OWBA 2YBIA 3WULA 2XTHA 1F6RA 193LA 4BAFA 4YF2A 1P2CC 5I4WA 1AZFA 3IJVA 1QTKA 1H6MA 1B9OA 4YOPA 1IP2A 2CWIA 4AXTA 4NHPA 1ZMYL 1GB0A 2BQNA 5HMJA 5LA5A 3N9EA 1IWYA 2CJLA 1NKHA 1IWUA 1CJ9A 132LA 1IC4Y 1GF6A 1JKBA 3ATOA 3P66A 1GE3A 4HTNA 4DD3A 1GEVA 1GBYA 1UUZC 4J1AA 1UIBA 1CKHA 1C10A 1T3PA 2Z12A 4H9AA 6LYTA 5A3EA 1LSMA 4YENA 4M6DA 1QQYA 3WW6A 4HV1A 5FEKA 5LYTA 2DQEY 4N1EI 1NBZC 1IWXA 4HSFA 4LFPA 1IP3A 4N1CC 1GFUA 1LCNA 3WXTA 4WG7A 5FSTA 1WQQA 4NGVA 5L9JA 1LYZA 1HHLA 2YDGA 3TMUA 3TXJA 4AGAA 1G7MC 3TXEA 1BWHA 1DI4A 5L3IA 1GXV2 1LJNA 2G4NA 2ZQ4A 1HFZA 1ZVHL 1UIGA 3GXKA 3TXDA 3WU9A 5C6IA 1XGQC 5HMVA 1H87A 1LMNA 4HJZA 1HNLA 1UIHA 1AM7A 1LJFA 3W6EA 1DZBX 4NG8A 3A8ZA 4LFXA 1JKAA 1DPWA 1YKYX 3LHMA 4BAPA 4OW1A 1XGRC 5I4XA 4DDAA 1LYSA 1RI8B 3P65A 1NHEA 3RZ4A 2Z2EA 2Z18A 4RW1A 1OUGA 5ILFA 1IWTA 2BQMA 3WU7A 1IEEA 2YSSC 4WLYA 1LAAA 3GXRA 1B7LA 2Z19A 4PRUA 4WO6A 1VAUA 2MEIA 1GF7A 4DD1A 2ZNWY 2FYCA 4EOFA 5A3ZA 4FJRA 2YBNA 1UA6Y 1LMQA 1IORA 2Q0MX 1QDRA 3W3EA 4CHXA 1UBZA 3AGHA 1OQMA 1GXXA 1NMMA 4ZEEA 2IHLA 1CKDA 1GE1A 2ZNXY 1WTNA 1OUJA 1QUTA 4NIJA 1D9UA 2BQFA 2ZYPA 4OOTA 1UICA 4GCDA 1LOZA 1XEKA 4B4IA 2HEFA 1IP7A 3A34A 5DN4A 2MEHA 1D6QA 4DDBA 3B6LA 5F16A 4DD0A 1CKGA 4GLAA 1LZEA 1QUSA 2BQDA 1LSYA 5B07A 1ALCA 2CDSA 1REZA 5LAFA 4NGIA 5C6JA 4NGZA 1NF5A 1YILA 2DQGY 5LYMA 1LJGA 1DKJA 4HTKA 1B5UA 1IIZA 4DD2A 5KY1A 1BHZA 4U3XB 3OK0A 4NHTA 3HBDA 5KXSA 4ANRA 4Z41A 1YQVY 4FDYA 4BS7A 1B0DA 4I0CA 4GCCA 4OWCA 1VDQA 2Z2FA 5HNCA 1B2KA 1LJHA 4PHIA 5KXYA 3ULRA 5J7CA 1GEZA 4XJIA 5DN5A 4EMNA 1JJ3A 1B5XA 4NHQA 1FKQA 5I4YA 1I20A 1LSPA 3T6UA 3TXIA 4C5FA 1LHLA 1LZAA 3CSZA 4WM6A 4NSHA 1LMTA 4ZIXA 1LZ5A 1IP4A 1G7HC 1LSEA 4HJVA 5FCPA 3TXBA 4YEOA 1XGUC 3WUNA 1TEWA 3A6BY 5APEA 1IOSA 1QIOA 1XSFA 3G3BB 1GF3A 2BLXA 3KAMA 4KXIA 3B0IA 4H1PA 4LGKA 1WQNA 1LJ4A 3J6KA 4J1BA 1GBZA 4LT2A 1JKCA 2ZIJA 3AZ5A 1BGIA 1XGTC 2DQDY 2FBDA 4WM2A 4QY9A 3BKVA 1HEQA 4II8A 5I53A 1REMA 4UWNA 4DDCA 2HUBA 5KXNA 1IX0A 1VDPA 5II3A 5FELA 4DD7A 5HLLA 1GDXA 1GFKA 1FLQA 1LJJA 4TWSA 7LYZA 4O34A 4WM3A 2PC2A 4ML7A 4LYMA 3P4ZA 2IFFY 1YIKA 4L41A 5APFA 4D9ZA 1EQ5A 3QNGA 1DXJA 1GB8A 2BPUA 1GE2A 1TCYA 3A93A 2GV0A 1BWJA 1UIAA 2D91A 3E3DA 3AYQA 3IJUA 5B1GA 4DT3A 1LPIA 1NQIA 1LZBA 4XJBA 5ILCA 4ETEA 4W94A 3EXDA 1WQMA 4QDNA 2MEAA 1BVKC 1I1ZA 1QSWA 3VWOA 1IP1A 1LSZA 3WMKA 1GE0A 1CJ6A 1E8LA 1V7TA 1YKXX 1LHMA 3CT1A 1LHIA 2Z37A 208LA 1GF0A 2BQCA 2LHMA 3BKHA 3ZVQB 3LYTA 2LYOA 1JTOL 1NBYC 1SLYA 2XBSA 2LZ2A 4A7DA 4H90A 1B7SA 1C08C 1WVVA 5KXMA 1GE4A 5FHWA 5B05A 1IY3A 1D0MA 1TBYA 4WLXA 5KKJA 3D9AC 2BLYA 3A91A 3AJNA 4XYYA 3LZTA 4H8XA 2C8OA 4GN3A 1GAYA 1PZYA 3TMXA 4NGWA 1BVXA 4E3UA 1TDYA 4ETDA 5KXKA 3D3DA 2HEBA 3QE8A 1LHHA 4B4JA 4LYZA 1C46A 2MECA 1F0WA 2HU1A 3HBEX 1DPXA 2BQKA 3WVYA 1LSGA 4XADA 4H92A 3SP3A 1B5YA 1NDGC 1KIRC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5LIOA 1L96A 1T6HA 1J1XY 2D4IA 1L47A 1LPYA 1MLCE 3W6BA 1C6IA 4OO9A 1QSQA 1W6ZA 1FBIX 4PPOA 3ZVQA 1GB3A 1T97A 4H91A 5LVIA 113LA 1C6FA 1JTNA 8LYZA 3M18B 4MCKA 1LYFA 4W58A 1G7LC 1UC0A 1HELA 1C6KA 1W08A 1Z55A 3FI5A 1LSAA 1QUGA 4HTQA 1HMKA 1C6BA 130LA 5EBHA 3A94A 4RLNA 1HSWA 224LA 1IO5A 2DQAA 1B5VA 4CJ2A 2RBSA 4TUNA 4QGZA 2LZMA 1C43A 1LYYA 2WARA 2VB1A 2Y8PA 1L04A 3B0OA 3HFMY 4RDSA 1HEOA 5I54A 4LDOA 2F30A 4KT3A 1B6IA 1EQEA 5LVKA 1EQ4A 1LYOA 1YAPA 1ZVYB 2ZILA 109LA 152LA 1UACY 4I7KA 4PGJB 2YBMA 4N5RA 1IR7A 1PQKA 1L85A 1HSXA 2F47A 1IY4A 3AZ7A 5FDJA 1P36A 1QUDA 1DI3A 1L79A 5LAGA 163LA 1C6AA 1KXWA 4B1AA 1XEIA 1VFBC 2B5ZA 3CSRA 1G0JA 6LYZA 1MELL 182LA 1DKKA 3WPLA 2Z6BA 4DD9A 4W54A 219LA 135LA 1C68A 156LA 211LA 4NWHA 1JHLA 5B1FA 3HDEA 4XJDA 1L77A 3WVXA 4GCFA 3MGWA 4NGJA 1GB9A 5LYZA 1C6CA 3LYZA 2YBLA 1GF4A 1L30A 1CVKA 3HDFA 3HH5A 1P7SA 1LMPA 1JISA 3HT9A 107LA 1L71A 4LZTA 4PJ2C 1LZCA 1LJIA 1IP5A 1G0KA 1UIEA 1D2WA 5APDA 1LZ4A 4Z98A 181LA 1C6TA 3CDTA 1LI2A 2Q9EA 1LTMA 4HP0A 2F2QA 2RB2X 4H94A 3DKEX 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5KJ9 A;  5LIO A;  5AMY A;  1F6S A;  5L3H A;  5KXL A;  5LVG A;  1J1X Y;  3EMS A;  4WG1 A;  2HEE A;  4UWU A;  2D4I A;  4OWA A;  4CFO A;  4NEB A;  1WQP A;  1MLC E;  1LJ3 A;  4G4H A;  1AT6 A;  4R0F A;  3W6B A;  2BQE A;  2MEG A;  154L A;  153L A;  1JPO A;  2A7F A;  1QDT A;  2F2N A;  3RNX A;  2G4P A;  5F9U A;  1XFP L;  134L A;  1NDM C;  1W6Z A;  4TSC A;  5HQ1 A;  1FBI X;  2XBR A;  4GN4 A;  4PPO A;  1WVU A;  1GB7 A;  3ZVQ A;  1LZT A;  3LZ2 A;  4P2E A;  2CGI A;  1GB3 A;  4H91 A;  1RE2 A;  2D6B A;  1YAN A;  2DQH Y;  5LVI A;  1BB7 A;  3A67 Y;  1WQO A;  5F9X A;  1VDT A;  1GAZ A;  1JIY A;  1IC5 Y;  1YKZ X;  5LXW A;  4WOA A;  4Z3M A;  1YL1 X;  2MED A;  2MEE A;  8LYZ A;  1INU A;  3M18 B;  1IP6 A;  4NY5 A;  1C45 A;  4LT3 A;  1G7J C;  2BQA A;  1HEP A;  4MCK A;  4TX7 A;  1D0K A;  3TXH A;  1T6V L;  1G7L C;  4B49 A;  1UC0 A;  1HEL A;  2DQC Y;  2F4G A;  1FLW A;  1FDL Y;  1FLY A;  4LYC A;  3W6D A;  1REX A;  3ZEK A;  1W08 A;  3F6Z A;  4G9S A;  5K7O A;  1LKR A;  1Z55 A;  1JSE A;  1TAY A;  1B7N A;  1B7O A;  1LSA A; 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 1BGI A;  1XGT C;  2DQD Y;  2FBD A;  4WM2 A;  4QY9 A;  3BKV A;  1HEQ A;  4II8 A;  5I53 A;  1REM A;  4UWN A;  4DDC A;  2HUB A;  5KXN A;  1IX0 A;  1VDP A;  5II3 A;  5FEL A;  4DD7 A;  5HLL A;  1GDX A;  1GFK A;  1FLQ A;  1LJJ A;  4TWS A;  7LYZ A;  4O34 A;  4WM3 A;  2PC2 A;  4ML7 A;  4LYM A;  3P4Z A;  2IFF Y;  1YIK A;  4L41 A;  5APF A;  4D9Z A;  1EQ5 A;  3QNG A;  1DXJ A;  1GB8 A;  2BPU A;  1GE2 A;  1TCY A;  3A93 A;  2GV0 A;  1BWJ A;  1UIA A;  2D91 A;  3E3D A;  3AYQ A;  3IJU A;  5B1G A;  4DT3 A;  1LPI A;  1NQI A;  1LZB A;  4XJB A;  5ILC A;  4ETE A;  4W94 A;  3EXD A;  1WQM A;  4QDN A;  2MEA A;  1BVK C;  1I1Z A;  1QSW A;  3VWO A;  1IP1 A;  1LSZ A;  3WMK A;  1GE0 A;  1CJ6 A;  1E8L A;  1V7T A;  1YKX X;  1LHM A;  3CT1 A;  1LHI A;  2Z37 A;  208L A;  1GF0 A;  2BQC A;  2LHM A;  3BKH A;  3ZVQ B;  3LYT A;  2LYO A;  1JTO L;  1NBY C;  1SLY A;  2XBS A;  2LZ2 A;  4A7D A;  4H90 A;  1B7S A;  1C08 C;  1WVV A;  5KXM A;  1GE4 A;  5FHW A;  5B05 A;  1IY3 A;  1D0M A;  1TBY A;  4WLX A;  5KKJ A;  3D9A C;  2BLY A;  3A91 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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