2NTHA

Structure of spin-labeled t4 lysozyme mutant l118r1
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSCRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme
publication title Structural determinants of nitroxide motion in spin-labeled proteins: Tertiary contact and solvent-inaccessible sites in helix G of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 56
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2006-11-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2nthA00
1QUHA 1CV5A 4W59A 1L37A 1C6JA 1L59A 218LA 201LA 1DYAA 1CV1A 3CDQA 1CX6A 128LA 1C6MA 237LA 4ARJA 1EPYA 2L78A 3NY8A 4ZPUA 1L89A 4EPIA 111LA 198LA 3GUMA 2B6ZA 1L80A 103LA 2RBOA 2F47A 145LA 1XJTA 1QTDA 1OYUA 217LA 1L60A 1LYEA 252LA 1L00A 4K5YA 1CU5A 258LA 1L77A 4LDOA 1L97A 112LA 185LA 4ARLA 1T8AA 1XJUA 129LA 3V2WA 206LA 222LA 256LA 3PBLA 3HTDA 1CTWA 175LA 1G07A 2RH1A 3G3XA 239LA 4I7KA 3LZMA 209LA 3C8SA 1LYGA 1OWYA 1LI2A 130LA 229LA 3HH5A 1L23A 2RB2X 118LA 1G0QA 1L73A 1PQOA 2NTGA 4EPFA 1QS5A 182LA 3HH3A 2QB0B 107LA 249LA 3HT9A 1L92A 3FADA 1C63A 1L07A 4ARMA 1SWZA 4I7OA 1DYBA 4PJZA 1CV3A 1LWKA 2A4TA 2RB1X 189LA 3CDRA 210LA 184LA 171LA 1CV6A 257LA 156LA 1P3NA 2B6XA 3DMXA 3K2RA 2QARC 1NHBA 4ARPA 146LA 139LA 113LA 1L46A 190LA 1L19A 3V2YA 3SB7A 1P46A 242LA 2OE9X 173LA 142LA 1L75A 1D9WA 1P64A 4GRVA 3SN6R 2RB0X 4W56A 1L01A 1L83A 4LDEA 3JR6A 4I7QA 1P56A 1L04A 1QT7A 2OU8A 3DN6A 3QAKA 4IAPA 1L86A 1OVHA 1L06A 1L96A 1L88A 1L35A 1LWGA 3F9LA 2Q9EA 1ZYTA 108LA 1L53A 1PQIA 122LA 223LA 234LA 165LA 127LA 3DN2A 164LA 4EKRA 1QT5A 1L28A 1L38A 3SB8A 251LA 3OE9A 4I7RA 261LA 174LA 186LA 3PDSA 1C6BA 1L52A 1P5CA 2CUUA 236LA 1D3JA 1KW5A 1QTCA 1P2RA 3HT7A 1C6PA 1L90A 1L20A 192LA 1L79A 2OTYX 4I7JA 4W57A 3C80A 1LYDA 1L94A 1C60A 123LA 1D3FA 213LA 3L64A 1CV4A 3F8VA 1C6LA 1OWZA 3DN1A 3HWLA 1DYDA 1QTHA 3GUOA 3DN4A 2NTHA 3G3VA 1L66A 211LA 1L71A 1LI6A 2OEAX 1L14A 161LA 1C6HA 1L31A 2B6WA 1OVJA 4PK0A 1L99A 1C6CA 1SWYA 4W53A 1L68A 1P37A 216LA 1C6QA 254LA 255LA 1C6DA 3OE8A 1T8FA 233LA 1C6GA 3HTFA 181LA 1L62A 4ARMB 1L56A 221LA 1L76A 1LGWA 157LA 1P2LA 2OU0X 3HU8A 115LA 188LA 1L18A 1C6FA 1L44A 3UONA 1L72A 3RUNA 4DAJA 3FI5A 226LA 1L08A 1C6EA 168LA 1L34A 1G0KA 1ZURA 260LA 140LA 1D3NA 1L49A 4LZMA 1L81A 3OE0A 2O79A 163LA 1L64A 3CDVA 149LA 1C66A 253LA 3C8RA 3NY9A 4YXAC 2RAZX 2RAYX 3EMLA 1L32A 1L69A 3CDTA 3DKEX 4W55A 1C61A 220LA 2B7XA 1L41A 1L91A 1L36A 2RBRA 4YX7C 183LA 166LA 131LA 138LA 2IGCA 2RBNA 1QTZA 3DMZA 2B6YA 1L29A 3HTBA 1LYIA 1P6YA 1L45A 1L47A 4EKSA 1L61A 151LA 1L17A 1LGUA 2B70A 4I7PA 1KY1A 1L95A 2O7AA 1I6SA 3HH4A 1L12A 1L98A 104LA 3HUQA 235LA 1KY0A 1L55A 3C7WA 1QT3A 1L24A 1L70A 1L13A 1L87A 1JTNA 1D2WA 3GUIA 240LA 3G3WA 230LA 3L2XA 4I7NA 1C68A 1SX7A 1WTHA 1KW7A 3D4SA 3DMVA 1T8GA 1P7SA 4AQNA 187LA 2OTZX 3FA0A 212LA 162LA 3HDEA 4EXMA 1LYJA 1C64A 144LA 232LA 1C65A 1P36A 4DKLA 1CU0A 1T97A 2LC9A 3SB9A 1L42A 205LA 6LZMA 1G0GA 1L30A 245LA 250LA 1SSYA 4EKPA 1LYFA 1XEPA 4LDLA 7LZMA 1DYGA 4YXCA 3C7ZA 1JQUA 238LA 3C83A 1L33A 3C82A 4E97A 1CX7A 1OVKA 3DN8A 3HDFA 3DN0A 3HT6A 1L93A 1KNIA 1L10A 4ARQB 199LA 102LA 159LA 1G0LA 3HT8A 248LA 152LA 158LA 1QTBA 1PQDA 160LA 1C6NA 1C69A 1G0PA 1LYHA 170LA 2O4WA 155LA 195LA 1QT6A 243LA 2B73A 259LA 2B74A 247LA 1G1WA 1L74A 3C81A 1QTVA 1L85A 4W51A 3VW7A 1G0JA 1QT4A 120LA 200LA 1L65A 110LA 1L39A 1CU2A 1KS3A 1QUGA 141LA 3HH6A 4EKQA 4W58A 3SBAA 4GBRB 1OV7A 4S0WA 1CU3A 1C6KA 1QSQA 1CV0A 4ARQA 3CDOA 180LA 2F32A 1L54A 3HUAA 3HTGA 3HUKA 1LPYA 3SBBC 4W52A 1TLAA 1L67A 2OU9A 225LA 1QUOA 1CUQA 1L02A 169LA 3SB6A 2Q9DA 2OE4X 147LA 1PQJA 3SB5A 1PQMA 1L0JA 1CVKA 109LA 3GUNA 1QS9A 1D3MA 2LCBA 114LA 1C6IA 3NYAA 1L25A 3HU9A 1JTMA 5I14A 4DJHA 3DNAA 1CUPA 1LW9A 4I7TA 1DYEA 1L21A 150LA 3GULA 227LA 1L15A 3RZEA 2RBSA 3GUPA 1L57A 1QT8A 1L05A 231LA 178LA 177LA 172LA 1L40A 228LA 241LA 4OO9A 214LA 196LA 1L27A 1L63A 2F2QA 2HULA 137LA 262LA 1L16A 1SSWA 1ZWNA 4I7SA 191LA 1L03A 1LLHA 2ANXA 1T6HA 1L11A 148LE 1K28A 1L50A 3GUKA 1L22A 1C67A 1DYCA 3C8QA 2HUKA 3DN3A 4EJ4A 1L58A 3ODUA 2OE7X 2RBQA 219LA 215LA 125LA 4W54A 126LA 1QUDA 2LZMA 1OV5A 119LA 143LA 1QSBA 244LA 1G06A 1G1VA 2RBPA 167LA 1L0KA 1LGXA 4I7LA 176LA 5LZMA 2ANVA 3OE6A 1L09A 1L43A 246LA 1L48A 2B75A 1LI3A 1C6AA 2Z6BA 2B72A 197LA 3GUJA 4I7MA 1B6IA 1C62A 1DYFA 1C6TA 224LA 2HUMA 1G0MA 1L51A 1L26A 1D2YA 2B6TA 3C7YA 1L82A 1PQKA 1CU6A 1L84A 1SX2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1QUHA 4RW2A 1IOQA 1L37A 5LINA 2W1XA 1B7PA 4U3XB 237LA 1TAYA 1BB7A 2FBBA 1EPYA 3NY8A 1LJHA 1OUHA 1LZTA 1L80A 1HELA 1FLUA 1GE3A 1V7SA 2LYMA 2HU1A 1LYEA 4LDOA 1F6SA 1AT6A 5B06A 1W08A 4P2EA 1F10A 1YILA 1XJUA 1JSFA 3V2WA 4ZIXA 3B0KA 4H9HA 3PBLA 1IWTA 1G07A 3W6FA 2RH1A 3G3XA 239LA 4BS7A 1AZFA 5KKJA 209LA 1XFPL 1OWYA 5T3FA 1LYYA 229LA 3HH5A 3RW8A 1G0QA 2HEAA 1L73A 4EPFA 1NBYC 3FADA 1C63A 4ARMA 133LA 153LA 2HEBA 5LVIA 4WO9A 2I26L 3TXJA 2RB1X 2XQOA 3CDRA 210LA 171LA 257LA 1VAUA 3RZ4A 1LMNA 3AZ4A 113LA 1L46A 1L19A 1HSWA 1IP7A 4OWCA 1HEMA 1CJ7A 1GFUA 2F30A 4I7QA 1GB9A 1GE2A 1REMA 4ETCA 4W94A 2OU8A 1L06A 1L88A 1L35A 3A6CY 2CWIA 1DQJC 2Q9EA 3CSRA 3LZTA 1KXXA 4WMGA 2ZNWY 1IOCA 122LA 2C8PA 3T36A 165LA 3TMUA 5LAGA 4FJRA 154LA 1L28A 1L38A 6LYZA 1YAOA 1P5CA 1D3JA 1JPOA 1G7LC 1L20A 192LA 4RLNA 1C60A 3L64A 5FELA 3GUOA 5LVJA 1IR7A 3DN4A 3G3VA 4H1PA 1LZRA 3WVXA 4DC4A 4NGWA 5LYMA 1GB2A 5DL9A 3A34A 1LZ4A 1UIEA 1NBZC 5AMYA 2ZNXY 4J0LA 1C6CA 5B1FA 2D4JA 4N0JA 1YAPA 1WQQA 4H8ZA 1DI5A 3AZ7A 1LZ8A 3IJUA 1LZYA 4ETBA 4HV2A 1P2LA 1B7MA 4DAJA 8LYZA 3ATNA 3FI5A 1L08A 1DI3A 1IEEA 1IORA 1ZURA 260LA 4YEOA 140LA 4NY5A 163LA 5F81A 4NGKA 149LA 1C66A 3ZVQA 1WQOA 4LZTA 1FLYA 3EMLA 5B05A 3CDTA 2XJWA 1INUA 1LCNA 1L36A 2RBRA 4YX7C 183LA 4WM1A 131LA 4AXTA 1NHEA 4LYOA 1OP9B 4ML7A 2G4NA 1JKDA 3DMZA 4LT3A 4IATA 5KXRA 4NHIA 1L29A 4DQJA 1LYIA 3AGGG 3CT1A 5IDDA 151LA 1J1PY 4YOPA 2B70A 4Z98A 1L98A 5DM9A 104LA 4WM3A 1HNLA 1L55A 3C7WA 5LVGA 3AW7A 1OUIA 1JTNA 3A93A 4GCCA 5I4WA 230LA 2HTXA 1DPWA 4UWVA 3FA0A 212LA 3CB7A 3K3TA 162LA 4EXMA 4H9EA 4DKLA 1UICA 1CU0A 1DXJA 5DLAA 5B59A 4GCFA 1SSYA 1I56A 3ATOA 1LYFA 1DZBX 3CSZA 5FHWA 4B4IA 1DYGA 1CX7A 3DN8A 2DQJY 5JENB 3HDFA 5I4YA 3A92A 3FI7A 4DDCA 199LA 4ET8A 3CT0A 4N8ZA 1HFZA 3P68A 158LA 4NIJA 1PQDA 1LSMA 1T6VL 1C6NA 4RLMA 1LZ9A 1ZMYL 2O4WA 155LA 1LSGA 2B73A 3BKVA 5LIOA 3C81A 5KXZA 1CKHA 3A3RX 110LA 1L39A 3HBHA 141LA 4W58A 2YSSC 4NGVA 4S0WA 2BAAA 4O34A 1LSCA 1G7JC 3HUAA 3HTGA 2RSCA 4DT3A 1PQJA 3SB5A 4OOOA 109LA 3LYTA 3WL2A 1WTNA 3NYAA 3TXHA 1QSWA 4DJHA 4NHSA 1CUPA 1LW9A 4I7TA 1HSXA 1LZDA 4B0DA 3F6ZA 5M1YA 4B49A 2RBSA 1BB4A 1L57A 1HEQA 2BQKA 2MEGA 5I5QA 5FDJA 214LA 196LA 1L27A 2HULA 1L16A 1LZBA 1SSWA 2W1YA 1ZWNA 4B4JA 1XSFA 1LJ4A 2YBNA 1K28A 2ZQ3A 1LJIA 3C8QA 3WH1A 1PS5A 3DN3A 1C43A 3LN2A 125LA 3GXRA 1LZNA 2RBPA 2FYDA 1LGXA 1RCMA 1HMLA 2Z12A 5LZMA 5D5FA 3G3BB 4H9CA 3OE6A 4ZEEA 4NGYA 1LI3A 1C6AA 3AB6A 1GFJA 3GUJA 4OWEA 1E8LA 1LMCA 1B6IA 5FSTA 224LA 2HEFA 1G0MA 4B4EA 1D2YA 2B6TA 1L82A 1UA6Y 4GN5C 4LGKA 4G49A 1CV5A 2NWDX 4CJ2A 2W1MA 201LA 3AZ5A 2LYOA 4KL7A 1CX6A 1C6MA 1HMKA 1EQEA 4OWBA 1L89A 4EPIA 2I6ZA 2WARA 3GUMA 3WUNA 103LA 1VFBC 2CJLA 1OYUA 1L60A 4XADA 1KXYA 258LA 5E9RA 1L77A 3AYQA 4LYCA 2D4IA 1IWVA 1T8AA 4H9FA 4J1BA 1IY3A 4NGOA 1JIYA 206LA 1GDWA 5KXYA 1I20A 1LYSA 1LJJA 1YROA 4R0FA 3LZMA 5KXOA 4TWSA 1LYGA 1OUEA 1D6PA 2DQIY 1GBXA 1LI2A 1B7NA 1PQOA 1LSBA 4WL7A 182LA 3HH3A 1KXWA 2N5ZA 2MEBA 1SWZA 1UIBA 3J4GA 1LWKA 4LYZA 1UIAA 2ZIJA 189LA 3J6KA 184LA 1CV6A 134LA 4PRQA 1P3NA 2QARC 1LSDA 1GFAA 1CJ9A 4LT2A 1IO5A 2F4AA 4GN3A 1D9WA 3SN6R 2RB0X 1L01A 1L83A 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2HEEA 2Z2EA 4G9SA 3RT5X 2OTZX 2EQLA 1OUAA 4BAFA 1C65A 3W6EA 1MELL 1W6ZA 6LZMA 1G0GA 250LA 3P65A 3CQLA 3C7ZA 4TSCA 1GD6A 1L33A 4XJDA 1OVKA 3WXTA 4WL6A 4H9BA 1B7OA 3DN0A 3HT6A 102LA 159LA 3IWRA 1RE2A 248LA 1N4FA 152LA 1QTBA 1O23A 1LMPA 1D9UA 1D0LA 132LA 2BPUA 4HJZA 1LYHA 195LA 1LYOA 193LA 259LA 1GF0A 4H8XA 1IY4A 1G1WA 1L74A 3VW7A 3LYOA 1L85A 4W51A 2DQDY 1QT4A 1WVUA 1KS3A 4EKQA 3SBAA 4GBRB 1OV7A 1QUTA 1QIOA 1CV0A 4ARQA 5HQ1A 3CDOA 1VDSA 2F32A 3WU7A 1L54A 4WLDA 4WG7A 3AW6A 1LPYA 3SBBC 3N9EA 1TLAA 1QUOA 1L02A 169LA 4LYTA 1FKVA 1ZV5L 1IC7Y 2I25L 1GF5A 2HEDA 1GF8A 3HFMY 3HU9A 1I1ZA 1LKRA 1RI8B 3T6UA 4KXIA 3DNAA 2A7FA 1L21A 4NWEA 1UIHA 150LA 4YENA 1G7IC 3RZEA 5APCA 231LA 2BQLA 2MECA 1L40A 228LA 137LA 4II8A 1FBIX 4I7SA 3P64A 1VDPA 4MR1A 1IR9A 1OUBA 2G4PA 1J1OY 4NHPA 5LA5A 1C67A 3WUAA 2OE7X 215LA 4W54A 1HERA 1B5YA 2LZMA 1EL1A 2YBLA 1JKBA 6LYTA 143LA 1GF3A 1QSBA 2FYCA 4LFPA 2YBMA 3P66A 4TTDA 1DI4A 2ZILA 1L48A 2B75A 2Z6BA 2MEFA 5HLLA 4I7MA 1RJCB 3A3QA 1C62A 5LXWA 1DYFA 1REXA 1BB5A 2HUMA 1GF7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1QUH A;  4RW2 A;  1IOQ A;  1L37 A;  5LIN A;  2W1X A;  1B7P A;  4U3X B;  237L A;  1TAY A;  1BB7 A;  2FBB A;  1EPY A;  3NY8 A;  1LJH A;  1OUH A;  1LZT A;  1L80 A;  1HEL A;  1FLU A;  1GE3 A;  1V7S A;  2LYM A;  2HU1 A;  1LYE A;  4LDO A;  1F6S A;  1AT6 A;  5B06 A;  1W08 A;  4P2E A;  1F10 A;  1YIL A;  1XJU A;  1JSF A;  3V2W A;  4ZIX A;  3B0K A;  4H9H A;  3PBL A;  1IWT A;  1G07 A;  3W6F A;  2RH1 A;  3G3X A;  239L A;  4BS7 A;  1AZF A;  5KKJ A;  209L A;  1XFP L;  1OWY A;  5T3F A;  1LYY A;  229L A;  3HH5 A;  3RW8 A;  1G0Q A;  2HEA A;  1L73 A;  4EPF A;  1NBY C;  3FAD A;  1C63 A;  4ARM A;  133L A;  153L A;  2HEB A;  5LVI A;  4WO9 A;  2I26 L;  3TXJ A;  2RB1 X;  2XQO A;  3CDR A;  210L A;  171L A;  257L A;  1VAU A;  3RZ4 A;  1LMN A;  3AZ4 A;  113L A;  1L46 A;  1L19 A;  1HSW A;  1IP7 A;  4OWC A;  1HEM A;  1CJ7 A;  1GFU A;  2F30 A;  4I7Q A;  1GB9 A;  1GE2 A;  1REM A;  4ETC A;  4W94 A;  2OU8 A;  1L06 A;  1L88 A;  1L35 A;  3A6C Y;  2CWI A;  1DQJ C;  2Q9E A;  3CSR A;  3LZT A;  1KXX A;  4WMG A;  2ZNW Y;  1IOC A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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