2NTHA

Structure of spin-labeled t4 lysozyme mutant l118r1
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSCRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Structural determinants of nitroxide motion in spin-labeled proteins: Tertiary contact and solvent-inaccessible sites in helix G of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
total genus 56
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2006-11-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2nthA00
3F9LA 3HUAA 1P2LA 1L45A 125LA 1T8FA 1OWYA 4ARLA 1L84A 170LA 227LA 1OVKA 4GRVA 3HH4A 1LWGA 2RAZX 4YXCA 1L63A 1KW7A 1L77A 1D2WA 1C62A 1L85A 3JR6A 1T8AA 4EJ4A 3HH5A 2B75A 1L69A 177LA 156LA 2B73A 115LA 1L39A 184LA 2B74A 1G0JA 2B70A 217LA 4ARQA 1L62A 1ZWNA 1L19A 1L58A 1C6FA 3OE0A 2B7XA 157LA 3C7ZA 3SBAA 1L09A 1DYEA 165LA 141LA 3GUIA 1DYFA 1P36A 2F47A 148LE 1QUDA 1QT7A 1L50A 3SB6A 4I7PA 1PQDA 1CV5A 3FA0A 172LA 1L67A 199LA 1B6IA 1L34A 1TLAA 1G1WA 2B6ZA 2O79A 109LA 2Q9DA 190LA 113LA 1L25A 235LA 110LA 3CDOA 3FI5A 1L83A 3HT7A 2OE4X 189LA 1L30A 162LA 1KS3A 1L93A 2ANVA 3HU9A 3RUNA 1L57A 3GUMA 3HWLA 1L37A 1KW5A 1L16A 1DYDA 2OE9X 176LA 1JTMA 1QS5A 1OWZA 4I7RA 1P64A 4LZMA 224LA 1SSWA 3OE6A 147LA 258LA 228LA 4ZPUA 2RBOA 4ARMB 2NTGA 1QTBA 1L90A 1LYDA 3GUJA 143LA 4W56A 4DKLA 1D3JA 3FADA 186LA 3CDQA 1L10A 206LA 149LA 1C6EA 2O4WA 2QB0B 1SWZA 1C6HA 146LA 1D2YA 4W58A 1C65A 103LA 1P46A 1C64A 2NTHA 1C6BA 107LA 216LA 2RBSA 1L05A 1L11A 119LA 1KY0A 4I7NA 1L41A 1QSBA 1XJTA 1LPYA 2RAYX 1L73A 1L32A 1L27A 3EMLA 1L55A 163LA 3DN4A 1L95A 2F2QA 3GUOA 1C6LA 1QTDA 4ARQB 3C7WA 4S0WA 2RBNA 3QAKA 2B6TA 209LA 231LA 1C6PA 1L99A 2HUMA 1ZYTA 3C81A 249LA 2RBRA 166LA 4OO9A 3SB7A 1L18A 223LA 236LA 1CV6A 3LZMA 247LA 1CTWA 152LA 1L64A 151LA 250LA 3HH3A 1QT6A 1WTHA 3NY9A 1QTHA 3DNAA 1L17A 1JQUA 1L0KA 1T6HA 1L87A 1QS9A 4K5YA 2RBQA 1P7SA 3GULA 168LA 1L26A 1C66A 3GUNA 1LI6A 1P37A 138LA 1C6KA 1L86A 1QTVA 112LA 1L53A 259LA 1G0KA 1CU5A 1LW9A 3DKEX 2HULA 1LWKA 139LA 1DYGA 3F8VA 1QUOA 1C6IA 3NYAA 1L22A 1L88A 1L96A 210LA 3C8RA 1L36A 5LZMA 1CV1A 160LA 1L74A 102LA 1L28A 244LA 4W53A 2F32A 1D3FA 2RB2X 1L44A 1L75A 131LA 1PQKA 1XJUA 237LA 233LA 3L64A 181LA 1PQIA 3DN3A 144LA 1L70A 4EKSA 1L47A 3OE8A 130LA 2ANXA 3DN0A 4IAPA 1L92A 1L72A 4AQNA 1KNIA 120LA 3HT6A 1SX2A 1T8GA 195LA 1L56A 242LA 1G1VA 3G3WA 3RZEA 1L03A 1PQJA 1QT4A 2OU8A 4E97A 232LA 2OTYX 182LA 225LA 3HUQA 1LLHA 108LA 1EPYA 2OU9A 240LA 4YX7C 3HT9A 3C8SA 1L80A 2B6XA 3VW7A 3SB8A 4EPFA 1CV3A 257LA 4I7KA 238LA 4PK0A 201LA 253LA 3HTFA 4I7TA 1K28A 3DMZA 252LA 1G0GA 114LA 3HH6A 3HT8A 2L78A 1CU2A 3ODUA 1G0PA 2Q9EA 1L33A 155LA 1LGWA 4EPIA 4W55A 3DN2A 1QSQA 4I7QA 126LA 1CUPA 226LA 1QUGA 4YXAC 164LA 1L14A 1P6YA 174LA 1G0MA 2OE7X 1C67A 1QT5A 1CU0A 4EKQA 254LA 1D3NA 185LA 1L04A 3DN1A 188LA 4I7OA 211LA 3GUKA 234LA 255LA 137LA 1OV5A 2OU0X 2QARC 1C61A 2RBPA 3CDRA 1I6SA 262LA 218LA 175LA 1L66A 1QTCA 213LA 167LA 3DN6A 1QTZA 1DYBA 140LA 243LA 1L35A 1D3MA 127LA 1L38A 1LYFA 1L76A 3HDFA 2HUKA 1L82A 2RB0X 4LDOA 205LA 3CDVA 5I14A 1L24A 1DYCA 1L31A 200LA 2B6YA 1P5CA 1QT8A 4ARPA 1L01A 6LZMA 1LYHA 197LA 1P2RA 1L20A 1L43A 128LA 1L65A 123LA 159LA 187LA 2LC9A 3PDSA 4W54A 1QUHA 1L29A 1L79A 3L2XA 3PBLA 1SSYA 251LA 2A4TA 1SX7A 1LGXA 1L59A 239LA 1XEPA 2O7AA 4ARJA 1L13A 256LA 1PQOA 212LA 3C80A 161LA 2B6WA 1OVHA 1OYUA 1CX6A 3V2WA 1L71A 1LYEA 2RB1X 180LA 1L42A 4DJHA 1L89A 1L06A 4W59A 1L07A 1L61A 3K2RA 1OVJA 3SB5A 1G06A 2IGCA 248LA 178LA 2Z6BA 1LGUA 3C82A 2RH1A 3CDTA 3OE9A 3C83A 3V2YA 1P56A 1C6GA 1L08A 229LA 222LA 1C6DA 230LA 1L51A 1C6TA 214LA 4LDEA 3HTGA 1C6CA 1L46A 1L02A 245LA 4DAJA 4I7JA 2OTZX 158LA 1CV0A 3SB9A 261LA 1G0LA 111LA 1CU3A 4GBRB 1PQMA 3G3VA 169LA 1L48A 4W57A 1C6QA 122LA 1L54A 1LI3A 3SBBC 2LZMA 1L21A 3NY8A 3DMVA 3DMXA 4EKRA 183LA 1CVKA 1LYIA 171LA 1L12A 1C6JA 1L40A 1P3NA 1L15A 1L60A 3SN6R 3HUKA 3HTBA 3HTDA 1L00A 1ZURA 1C69A 1L98A 1D9WA 4I7SA 2CUUA 1CX7A 1LYJA 192LA 3C8QA 3D4SA 145LA 1LI2A 4I7LA 118LA 1NHBA 1C6NA 150LA 219LA 1C60A 1L0JA 1DYAA 1L81A 1LYGA 3G3XA 1QT3A 3GUPA 173LA 1C6MA 1L49A 1C63A 3C7YA 142LA 1CV4A 1G07A 3DN8A 4PJZA 1L68A 1L52A 1L23A 129LA 1L91A 1T97A 221LA 4I7MA 2B72A 1OV7A 196LA 1SWYA 4ARMA 3HDEA 260LA 241LA 1L94A 2LCBA 220LA 104LA 2OEAX 198LA 3HU8A 1C68A 246LA 191LA 4EKPA 1CU6A 1C6AA 1G0QA 1KY1A 4EXMA 4LDLA 4W52A 1CUQA 1JTNA 215LA 3UONA 1L97A 7LZMA 4W51A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1P2LA 5LVIA 2BQEA 2LYOA 1JIYA 4ARLA 4QY9A 2BQHA 170LA 227LA 1OVKA 3HH4A 1A4VA 1XFPL 2RAZX 4C3WA 4NGYA 4YXCA 4R0FA 1GB5A 5KKJA 5LIOA 1EQEA 4GCBA 3AGGG 184LA 132LA 2B74A 1IWVA 1G0JA 2B70A 1ZWNA 1OUJA 2XBSA 4N8ZA 1C6FA 3OE0A 1FLQA 157LA 4NHSA 2Z2FA 3C7ZA 1JPOA 4I0CA 165LA 4YEOA 141LA 1LSFA 3GUIA 3A92A 1L50A 1ZMYL 1T3PA 4XN6A 3FA0A 1TLAA 1L34A 4NY5A 3TXIA 109LA 4NHPA 2Q9DA 4DWXA 1RE2A 2Y8PA 1L83A 4LYZA 4OWAA 1L30A 2MEEA 1WTNA 1KS3A 1L93A 3HU9A 1L57A 3GUMA 3QY4A 3HWLA 2OE9X 3J4GA 1IY3A 258LA 228LA 2NTGA 3P68A 1IP1A 4HSFA 3A34A 143LA 4DKLA 2ZWBA 3EXDA 3RU5A 1C10A 186LA 1C6EA 1HFZA 1LZGA 1D2YA 1AT5A 3W6DA 1LZSA 1C7PA 1N4FA 1YKZX 4WG1A 5KXWA 1NF5A 1GBSA 1A2YC 3ZVQA 5AMYA 4J0LA 4A7DA 2DKVA 1GXV2 1REXA 1B5UA 1L11A 1IOCA 3N9AA 4I7NA 1B7RA 4ET8A 1XJTA 4WLDA 1LPYA 1L32A 4NWHA 3DN4A 1OUGA 1QUTA 3GUOA 1C6LA 1QTDA 2BQMA 3LYMA 1XGPC 3C7WA 4S0WA 2B6TA 4WLYA 209LA 1UC0A 4WG7A 3CB7A 1REZA 1ZYTA 1LSBA 2RBRA 4HJVA 166LA 3SB7A 1HFXA 1L18A 3M3UA 1CV6A 1LMQA 1CTWA 1GB2A 1GFVA 5FELA 3NY9A 1WTHA 1JJ3A 5F9XA 1JQUA 1FLUA 1QS9A 168LA 1IWYA 5IHGA 1IEEA 4Z46A 1C6KA 1DI4A 1FLYA 1G0KA 1LYSA 4Z41A 1DYGA 4ETBA 3K3TA 4TSBA 1JKBA 3F8VA 1QQYA 5LZMA 1GAYA 5A3EA 2HU1A 2BAAA 1OUBA 5I54A 4B49A 1PZYA 1AM7A 2ZIKA 3LYOA 237LA 3D3DA 4PHIA 3LZ2A 4AGAA 144LA 1LJIA 2HEBA 1L47A 1LZRA 1IO5A 4IAPA 1HSXA 1L92A 1L72A 120LA 3HT6A 1LYOA 3TXFA 3ZVQB 1PQJA 1QT4A 2OU8A 3HUQA 1LLHA 4XJFA 4YOPA 5KXNA 240LA 4YX7C 2BPUA 3HT9A 3C8SA 2MEAA 5L3IA 3A67Y 1B7OA 2F2NA 201LA 253LA 1YILA 252LA 4DQ7A 1HHLA 2Q9EA 2D4IA 1LGWA 1B7NA 4W55A 126LA 1YAOA 1QUGA 4WL7A 164LA 3G3AB 1GF6A 5LVJA 3B0KA 1HEWA 1QT5A 2GV0A 1CU0A 3WXTA 1LJ3A 5FHWA 3T36A 4XYYA 1D3NA 188LA 1QDRA 4NFVA 255LA 2QARC 1GWDA 1I6SA 4GLAA 218LA 1JHLA 1IP5A 3BKHA 1QTCA 3DN6A 140LA 3GXKA 1GFAA 127LA 3IWRA 2HUKA 2RB0X 1LJNA 5DN5A 1ZVHL 1L31A 200LA 1QT8A 4ARPA 5HNCA 4HTNA 187LA 1JTOL 1B5ZA 3PBLA 1TBYA 4FDYA 3AZ4A 1L59A 1VFBC 239LA 1L13A 256LA 4NSGA 3TMVA 4DDCA 1JEFA 4H9HA 1OYUA 1CX6A 1DXJA 5KXLA 9LYZA 1IVMA 1L61A 2Z6BA 5HMJA 1LGUA 3C82A 2RH1A 3V2YA 1LZDA 4H9EA 1C6GA 1L08A 4WM3A 222LA 3RT5X 1C6DA 1GF3A 230LA 1C6TA 3A91A 1C6CA 4DAJA 2NWDX 3IJVA 4PJ2C 4LT1A 4KPMA 4DDBA 4CJ2A 2YDGA 1LKRA 169LA 4W57A 2DQIY 1B5YA 1XEJA 5ILFA 1VDSA 5F9UA 1GBXA 2ZNXY 1P3NA 4NSHA 1L60A 1G7IC 1G7LC 4LT2A 6LYZA 1WQNA 2I26L 1D9WA 4NSJA 1EL1A 1LI2A 1NHBA 150LA 3GXRA 3GUPA 1WQRA 1LZ8A 1OUIA 1C63A 2H5ZA 5APEA 1G07A 2Z38A 133LA 4FJRA 3B0OA 1HF4A 3A6BY 129LA 1L91A 4B0DA 1J1XY 4B4IA 5FEKA 1OV7A 4Z98A 1IWWA 2LCBA 2XJWA 1NBZC 4MR1A 1NDGC 1G0QA 3P4ZA 3A90A 1CUQA 1HC0A 4B1AA 3WL2A 1L97A 4XJDA 7LZMA 5K7OA 5DLAA 1G7JC 1YAPA 3HUAA 2F4GA 207LA 4X3BA 1OWYA 1LMNA 2LYMA 4XJIA 4ANRA 1L84A 5IELA 1IP2A 1D2WA 3JR6A 177LA 2B73A 115LA 3TXEA 1GF9A 217LA 4RDSA 1CKGA 1NDMC 1LZ6A 2B7XA 5I4XA 1DI3A 5LYZA 3WVYA 4PRQA 1LSYA 4H9FA 3SB6A 4I7PA 1CV5A 5D5CA 172LA 1L67A 199LA 1B6IA 1LMOA 2O79A 5DM9A 5APDA 3AZ7A 235LA 1GF8A 3FI5A 4NGKA 2W1LA 1OP9B 1GEVA 3W6CA 3RUNA 4HV1A 1GBOA 2A7DA 1L37A 1WQPA 3WUNA 4WM4A 3A6CY 6LYTA 1GAZA 1OWZA 4TX7A 4QGZA 135LA 1P64A 3OE6A 3LYTA 4ZPUA 3B0IA 1LYDA 3AGHA 1D0LA 1D6QA 2EKSC 4WOAA 1P2CC 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234LA 2MEGA 1OV5A 2OU0X 1IWTA 4WM2A 2HTXA 2Z2EA 3CDRA 1G7MC 262LA 1YL0X 1LHKA 1JJ1A 213LA 243LA 1L38A 2I25L 1LYFA 1H6MA 4OWHA 4EOFA 3CDVA 1L24A 2DQEY 4OWBA 3LN2A 6LZMA 3A8ZA 1GF4A 4P2EA 3E3DA 1BHZA 1LTMA 3FI7A 1L79A 3TMUA 251LA 2A4TA 3LHMA 1LGXA 1LMTA 1BWHA 2O7AA 1VAUA 3A93A 1B7LA 212LA 5I53A 4BAFA 1GE4A 4MCKA 161LA 2FYCA 5KKIA 1KXWA 2RB1X 3TXHA 1L42A 1XGRC 1AZFA 4M4OA 4NHTA 1G06A 248LA 1TEWA 178LA 2MEDA 1LMCA 4H92A 3CDTA 1YAQA 2YBMA 1CKHA 2BQOA 1LSNA 3HTGA 245LA 3AZ5A 4RW1A 5F14A 5DN4A 3CSRA 4HPEA 1FDLY 261LA 1G0LA 3W6BA 1CU3A 2BQBA 1PQMA 1J1PY 1C45A 1HNLA 3SBBC 1L54A 1LI3A 2WARA 3NY8A 2HECA 5FDJA 4EKRA 3W6EA 1LYIA 3QNGA 1L12A 1C6JA 1L40A 3SN6R 2I6ZA 2YBNA 3CT5A 3HTDA 1CJ6A 1L00A 1L98A 208LA 3C8QA 3D4SA 3EMSA 3WW5A 2DQAA 4I7LA 2D6BA 5A3ZA 1L0JA 1L81A 1REMA 1QT3A 4J1AA 3TXGA 173LA 1C6MA 1GFKA 3C7YA 142LA 1LHHA 1CV4A 4W94A 4PJZA 1L52A 1L23A 4LT3A 3WULA 4I7MA 3P66A 5M1YA 2BLXA 3HDEA 4XENA 220LA 104LA 2OEAX 4LYCA 4WLTA 198LA 1C68A 191LA 1JKCA 3WPJA 1GF7A 4EXMA 4W52A 4AXTA 2W1MA 3UONA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1P2L A;  5LVI A;  2BQE A;  2LYO A;  1JIY A;  4ARL A;  4QY9 A;  2BQH A;  170L A;  227L A;  1OVK A;  3HH4 A;  1A4V A;  1XFP L;  2RAZ X;  4C3W A;  4NGY A;  4YXC A;  4R0F A;  1GB5 A;  5KKJ A;  5LIO A;  1EQE A;  4GCB A;  3AGG G;  184L A;  132L A;  2B74 A;  1IWV A;  1G0J A;  2B70 A;  1ZWN A;  1OUJ A;  2XBS A;  4N8Z A;  1C6F A;  3OE0 A;  1FLQ A;  157L A;  4NHS A;  2Z2F A;  3C7Z A;  1JPO A;  4I0C A;  165L A;  4YEO A;  141L A;  1LSF A;  3GUI A;  3A92 A;  1L50 A;  1ZMY L;  1T3P A;  4XN6 A;  3FA0 A;  1TLA A;  1L34 A;  4NY5 A;  3TXI A;  109L A;  4NHP A;  2Q9D A;  4DWX A;  1RE2 A;  2Y8P A;  1L83 A;  4LYZ A;  4OWA A;  1L30 A;  2MEE A;  1WTN A;  1KS3 A;  1L93 A;  3HU9 A;  1L57 A;  3GUM A;  3QY4 A;  3HWL A;  2OE9 X;  3J4G A;  1IY3 A;  258L A;  228L A;  2NTG A;  3P68 A;  1IP1 A;  4HSF A;  3A34 A;  143L A;  4DKL A;  2ZWB A;  3EXD A;  3RU5 A;  1C10 A;  186L A;  1C6E A;  1HFZ A;  1LZG A;  1D2Y A;  1AT5 A;  3W6D A;  1LZS A;  1C7P A;  1N4F A;  1YKZ X;  4WG1 A;  5KXW A;  1NF5 A;  1GBS A;  1A2Y C;  3ZVQ A;  5AMY A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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