3HH6A

New azaborine compounds bind to the t4 lysozyme l99a cavity -ethylbenzene as control
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
163
structure length
163
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAAAINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Boron mimetics: 1,2-dihydro-1,2-azaborines bind inside a nonpolar cavity of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
total genus 61
structure length 163
sequence length 163
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2009-05-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3hh6A00
1L26A 2OE7X 3HTFA 1L98A 3HDEA 1KS3A 197LA 3HT6A 3OE9A 191LA 3SB6A 3SB7A 1G0QA 1L55A 259LA 223LA 2OU8A 190LA 2B6ZA 1L51A 126LA 1L03A 1L53A 3C8QA 4YX7C 253LA 155LA 3C80A 4E97A 3JR6A 1SX2A 3L64A 1L42A 3DNAA 1L06A 1C6QA 2OU9A 120LA 3NY9A 4EJ4A 1L65A 231LA 2OTZX 3GUJA 2Q9DA 1L28A 2RAYX 2F32A 3DN1A 2B74A 1D9WA 256LA 1OV5A 4EKPA 2OE4X 1C6NA 1L02A 196LA 1L81A 2O79A 3HH4A 1P64A 1L15A 3HU8A 1G1WA 151LA 165LA 1C6IA 1QT6A 2ANXA 4LDOA 161LA 174LA 252LA 2OE9X 2LZMA 2RB1X 1P36A 250LA 1OWYA 166LA 4I7LA 2F47A 162LA 164LA 188LA 1L75A 4GBRB 1LYIA 1L19A 4I7OA 138LA 242LA 245LA 159LA 1ZWNA 1L50A 219LA 4DKLA 137LA 1L33A 3HTGA 217LA 1QS9A 3SN6R 3GUPA 184LA 1C6FA 1L58A 1CV1A 1L69A 112LA 1L89A 244LA 1L29A 1L73A 1KW7A 1DYAA 181LA 3GUOA 1QTBA 1CX7A 213LA 156LA 1LGXA 139LA 262LA 140LA 2HUMA 241LA 1LYJA 1L01A 1L57A 4EKRA 1D3NA 2B73A 3CDVA 4ARQB 1L63A 4I7PA 4ZPUA 1C6CA 1L27A 1P2LA 177LA 3ODUA 3SBAA 4ARPA 1L45A 2HULA 3C83A 251LA 4I7JA 2IGCA 1PQIA 1XJTA 3HTBA 1T8FA 2LCBA 3G3VA 1C6PA 1L56A 1L0JA 1QTZA 215LA 2O4WA 3L2XA 3NYAA 118LA 1C63A 1LW9A 4EPFA 1C6EA 248LA 236LA 1L48A 4EXMA 119LA 1QUHA 214LA 1TLAA 1L39A 1OV7A 1G07A 104LA 1L04A 255LA 3GUNA 3SBBC 246LA 163LA 173LA 3C8RA 4AQNA 3HDFA 1G0PA 1B6IA 4W54A 3DMXA 1DYFA 1D3MA 1D3JA 1L54A 1C6LA 3DN3A 1L93A 4I7RA 1L71A 199LA 4W51A 240LA 1L67A 1G0JA 2OU0X 1L95A 5I14A 160LA 1C6BA 1PQJA 1L90A 187LA 1P37A 1L14A 180LA 1DYDA 1LGUA 2RB0X 3C81A 3SB5A 114LA 3PBLA 3F8VA 1KW5A 3EMLA 2OEAX 3HTDA 3SB9A 1L94A 1L22A 1CU6A 195LA 2LC9A 1L25A 3C8SA 1G1VA 1D2YA 1XJUA 1ZYTA 3HT8A 1CV5A 152LA 1L70A 211LA 1LWGA 1L47A 1OVHA 4LDEA 1KNIA 1KY1A 1K28A 1LLHA 1L08A 1CUQA 2B7XA 3DN4A 1L30A 1L18A 113LA 209LA 1P6YA 3V2WA 1L32A 1L24A 1CV4A 3HT9A 1G0GA 3NY8A 3C7YA 1SWYA 167LA 1L21A 183LA 3G3WA 1G0KA 2B72A 3QAKA 1SWZA 3F9LA 1CU2A 238LA 1L43A 1I6SA 2QB0B 142LA 157LA 1P56A 3HT7A 4LDLA 1CV6A 1P5CA 1L76A 1PQKA 4W53A 1T8AA 1C6KA 1L31A 1L46A 1LPYA 1L10A 3GUKA 1LGWA 1L16A 1L13A 1SSWA 1OYUA 249LA 1XEPA 4I7KA 3OE6A 1C6MA 198LA 148LE 2B70A 222LA 4DJHA 2CUUA 1L17A 228LA 189LA 1CU5A 3DN0A 4DAJA 1L00A 1CX6A 1QT3A 1L99A 218LA 141LA 1L83A 206LA 3K2RA 1QUDA 102LA 1SSYA 1QSQA 4EKSA 3C7WA 2NTHA 237LA 1LYEA 3RZEA 1DYGA 221LA 1C6AA 1L96A 2B6WA 1LYDA 192LA 1C6HA 1QUGA 4W56A 1L91A 1C6TA 1CU3A 1ZURA 4K5YA 3VW7A 3GUMA 3D4SA 3HUAA 1LYFA 5LZMA 1C60A 2B6XA 1KY0A 150LA 3HH3A 1C6GA 3FA0A 1L12A 103LA 3HU9A 1L35A 171LA 149LA 2A4TA 1LYGA 1L59A 1L77A 2B6YA 1QTDA 1CUPA 111LA 1G0LA 2RAZX 4OO9A 3C7ZA 1LI3A 1QT5A 4W58A 3DN8A 1QUOA 123LA 7LZMA 1JTNA 3HH5A 1L36A 4I7MA 1LWKA 1L92A 4ARMA 1C66A 4PK0A 170LA 4LZMA 4EPIA 4ARJA 1QTVA 1QSBA 143LA 3DN6A 6LZMA 210LA 4W57A 1C68A 2Q9EA 1CVKA 1L79A 3OE8A 3DMVA 3DN2A 2RBRA 147LA 205LA 224LA 216LA 3OE0A 4YXCA 3CDRA 4I7QA 3SB8A 2L78A 3UONA 1L86A 2QARC 1L84A 3HUKA 229LA 2HUKA 1QS5A 3HH6A 1P7SA 1C6JA 2RBPA 225LA 1L23A 220LA 3CDOA 1L49A 4W55A 3GUIA 1C67A 1L87A 1L52A 1L20A 3GULA 1LYHA 1CV0A 3RUNA 144LA 239LA 3FI5A 110LA 1CU0A 1QT7A 1OVJA 131LA 1P46A 260LA 1L34A 3CDQA 1EPYA 1L05A 168LA 3LZMA 3G3XA 2F2QA 1L09A 233LA 2RB2X 176LA 1L66A 1L41A 1L37A 257LA 2ANVA 4EKQA 146LA 1C69A 175LA 2RBQA 1L0KA 1L88A 4YXAC 2RBNA 129LA 127LA 1L68A 1PQOA 122LA 1L40A 1T8GA 107LA 1JQUA 1D2WA 1L60A 1WTHA 1L64A 1T6HA 2RBOA 1L97A 1NHBA 1CV3A 2Z6BA 4I7TA 158LA 1L62A 1D3FA 1QTCA 200LA 1CTWA 247LA 3C82A 128LA 145LA 235LA 109LA 3DMZA 4I7SA 1P2RA 1C65A 2RBSA 4ARMB 2OTYX 1QTHA 4S0WA 3FADA 1C64A 182LA 1LI6A 2B75A 3HWLA 1JTMA 1L72A 1DYCA 4ARLA 125LA 1L80A 1C61A 1OVKA 243LA 1PQMA 3PDSA 130LA 3DKEX 1L44A 254LA 4IAPA 1G06A 1L38A 212LA 4I7NA 115LA 1QT4A 226LA 1LI2A 261LA 227LA 3V2YA 1L07A 169LA 1L74A 3HUQA 258LA 1T97A 108LA 1SX7A 2RH1A 1PQDA 1G0MA 2NTGA 1OWZA 1L61A 1P3NA 4W59A 3CDTA 185LA 1DYBA 1C6DA 1DYEA 178LA 172LA 1L85A 4PJZA 1L82A 1C62A 4ARQA 1QT8A 1L11A 4GRVA 186LA 2B6TA 232LA 2O7AA 4W52A 201LA 230LA 234LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1KS3A 3OE9A 4DD0A 3M3UA 1L55A 4KPMA 223LA 3N9EA 4N8ZA 2YBIA 1GB9A 126LA 4WO6A 3LYMA 4HTKA 155LA 4E97A 3LYOA 5FEKA 5B59A 1C6QA 1LZ4A 231LA 1BB6A 4EKPA 1C6NA 196LA 3HH4A 4GCFA 4XN6A 151LA 1D6PA 2Q0MX 1VDSA 3RNXA 161LA 1LSPA 1FLYA 3W6BA 4I7LA 1LSBA 3TXKA 4OWCA 188LA 1L75A 4GBRB 1LYIA 1L19A 159LA 219LA 4TSCA 2I25L 1JTPL 1L33A 217LA 1QS9A 2BQGA 1CJ9A 1L58A 112LA 1IWWA 1L29A 5DLAA 1L73A 5E4PA 1QTBA 1QQYA 156LA 1LGXA 139LA 262LA 2WARA 1KIQC 1LYJA 4P2EA 1GE0A 4N1EI 3BKHA 1KXXA 207LA 5ILFA 1C6CA 2ZILA 2XBRA 4LT3A 1GFGA 1P2LA 4L41A 4ZEEA 1GEVA 177LA 3ODUA 3SBAA 4B4IA 5F16A 1TDYA 3C83A 251LA 1B2KA 1XJTA 1T8FA 2BAAA 3G3VA 1JSFA 4DD9A 4R0FA 1L0JA 215LA 1BB4A 1LW9A 3TXFA 2C8OA 4H9FA 1G07A 3GUNA 2DQIY 3SBBC 4Z41A 3C8RA 3A96A 3DMXA 2ZYPA 4HJZA 1D3MA 1FDLY 4G4CA 1LMTA 4RLNA 3DN3A 1IX0A 3A94A 2ZYCA 1L93A 4X3BA 2XTHA 5I14A 1PQJA 3AZ6A 4LYMA 1YROA 1L90A 187LA 1KIRC 1L14A 1DYDA 1EQEA 2RB0X 3C81A 1LSMA 5LYZA 2H9KA 3PBLA 1KW5A 4GLVA 1HFXA 1UICA 195LA 1XJUA 3P68A 152LA 1RCMA 3TMVA 154LA 1OVHA 4LDEA 1D0KA 1RI8B 3WW6A 1LLHA 4H92A 3WPLA 4DDAA 4LGKA 3W6CA 1CUQA 1ZVHL 1B7SA 4XYYA 1L30A 209LA 3V2WA 1IC5Y 4LYOA 1CV4A 3NY8A 1IWTA 1G7JC 1SWYA 167LA 183LA 3LYZA 2BQHA 4WM6A 3QAKA 1VFBC 5APCA 1UC0A 1L43A 1LTMA 3LYTA 1I6SA 4XJBA 157LA 3W3EA 1YL0X 153LA 4N0JA 3CQLA 1L31A 2LYZA 1UIFA 1W6ZA 4I0CA 1SSWA 1OYUA 2ZWBA 1XEPA 148LE 5LYMA 4DJHA 2CUUA 228LA 4LFXA 4DAJA 1QT3A 4NGIA 4LT1A 5DN5A 1DQJC 1L83A 1GB6A 1WQQA 1QSQA 4EKSA 4ETAA 1F10A 1LJIA 1DYGA 1C6AA 4WLXA 2HEBA 1C6HA 1NF5A 4W56A 1L91A 1CU3A 3VW7A 4HPEA 3WMKA 2DQJY 3ZEKA 1LYFA 5LZMA 3TXBA 1KY0A 1QSAA 3TXHA 2LHMA 3HH3A 2F4GA 1L12A 3WXTA 2A4TA 1GB2A 3EBAB 1FLQA 2B6YA 2GV0A 3HBDA 1B7PA 1CUPA 1BB3A 111LA 2RAZX 4XADA 1I1ZA 1GFEA 1QUOA 123LA 3FI7A 1L92A 4ARMA 3LZ2A 4NGVA 4ARJA 3K3TA 3B6LA 4DC4A 4ETCA 4W57A 4EMNA 2Q9EA 1L79A 1JITA 4GN3A 1LSDA 3DN2A 1G7LC 1YANA 1T3PA 1NDGC 4O34A 1GB0A 224LA 4YXCA 3CDRA 1I20A 2A7DA 4NGWA 2F30A 229LA 2Z2FA 1C46A 4OWAA 1C6JA 1C67A 1GB5A 3D9AC 4B0DA 1HC0A 4C5FA 1CV0A 1NHEA 1XGUC 1QT7A 1JWRA 2ZNXY 5FDJA 1WQMA 4XJGA 3T36A 1UACY 8LYZA 5HNLA 3G3XA 4IATA 3P65A 4PJ2C 1L09A 233LA 176LA 1L41A 1LSCA 4PRUA 2BLXA 1L0KA 1L88A 4YXAC 4ZFPA 3QE8A 1KXWA 1L68A 2XQOA 122LA 4OW1A 1L40A 1WQOA 2HTXA 1L60A 4II8A 4I7TA 1L62A 3WU8A 3WVXA 1BVXA 4G49A 1AT5A 4LYTA 247LA 1GFAA 2ZIJA 4HJYA 4HP0A 4I7SA 4TWSA 4YOPA 1J1XY 4ARMB 1YAPA 1WTNA 4H8YA 4ARLA 1L80A 1GF9A 1OVKA 1LMNA 4XJHA 1L44A 3TXJA 254LA 3OJPA 1VAUA 1L38A 1XEKA 1LHKA 1ALCA 1C7PA 1QT4A 1IEEA 1LZ9A 4J1AA 4YEMA 1GAYA 1L74A 5HMVA 3RZ4A 2Y8PA 1QTEA 1G0MA 4G4HA 1OWZA 1GF6A 1LCNA 4WM1A 4PPOA 3CDTA 1NDMC 1LJFA 172LA 1LKRA 4DDCA 4ARQA 4TSBA 1MLCE 4DYGA 5LVJA 3HTFA 1L98A 1DPXA 197LA 4RLMA 191LA 1P2CC 2DQEY 190LA 1LJ4A 1L03A 3TMXA 4WOAA 253LA 3C80A 3JR6A 1BWHA 1SX2A 1HHLA 1L42A 3DNAA 1L06A 1D6QA 1B5ZA 5LA8A 2BQAA 1GBXA 2F32A 2B74A 5B1GA 2OE4X 3CB7A 1D0LA 5JENB 3HU8A 4MSTA 1LZAA 3IWRA 1BWIA 1QT6A 3P66A 2ANXA 252LA 4H9HA 2LZMA 2DQAA 1LZGA 1P36A 1RJCB 250LA 1LHLA 3WU9A 2A7FA 4CHXA 5LVKA 1DKKA 1A2YC 1WQRA 138LA 1F6RA 4PGJB 4GCCA 1GPQC 184LA 2Z18A 5KXSA 1CV1A 5ILCA 2RSCA 181LA 4MCKA 1NWGA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1KS3 A;  3OE9 A;  4DD0 A;  3M3U A;  1L55 A;  4KPM A;  223L A;  3N9E A;  4N8Z A;  2YBI A;  1GB9 A;  126L A;  4WO6 A;  3LYM A;  4HTK A;  155L A;  4E97 A;  3LYO A;  5FEK A;  5B59 A;  1C6Q A;  1LZ4 A;  231L A;  1BB6 A;  4EKP A;  1C6N A;  196L A;  3HH4 A;  4GCF A;  4XN6 A;  151L A;  1D6P A;  2Q0M X;  1VDS A;  3RNX A;  161L A;  1LSP A;  1FLY A;  3W6B A;  4I7L A;  1LSB A;  3TXK A;  4OWC A;  188L A;  1L75 A;  4GBR B;  1LYI A;  1L19 A;  159L A;  219L A;  4TSC A;  2I25 L;  1JTP L;  1L33 A;  217L A;  1QS9 A;  2BQG A;  1CJ9 A;  1L58 A;  112L A;  1IWW A;  1L29 A;  5DLA A;  1L73 A;  5E4P A;  1QTB A;  1QQY A;  156L A;  1LGX A;  139L A;  262L A;  2WAR A;  1KIQ C;  1LYJ A;  4P2E A;  1GE0 A;  4N1E I;  3BKH A;  1KXX A;  207L A;  5ILF A;  1C6C A;  2ZIL A;  2XBR A;  4LT3 A;  1GFG A;  1P2L A;  4L41 A;  4ZEE A;  1GEV A;  177L A;  3ODU A;  3SBA A;  4B4I A;  5F16 A;  1TDY A;  3C83 A;  251L A;  1B2K A;  1XJT A;  1T8F A;  2BAA A;  3G3V A;  1JSF A;  4DD9 A;  4R0F A;  1L0J A;  215L A;  1BB4 A;  1LW9 A;  3TXF A;  2C8O A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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