3HH6A

New azaborine compounds bind to the t4 lysozyme l99a cavity -ethylbenzene as control
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
163
structure length
163
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAAAINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme
publication title Boron mimetics: 1,2-dihydro-1,2-azaborines bind inside a nonpolar cavity of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 61
structure length 163
sequence length 163
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2009-05-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3hh6A00
217LA 2LZMA 1EPYA 4I7RA 1OV7A 244LA 3SB6A 1G06A 1CU2A 1KY0A 1QUHA 1L35A 1CX6A 3L2XA 3GUOA 1DYGA 140LA 3DMXA 1B6IA 1L02A 1L60A 1SSYA 1C6CA 2QB0B 1L87A 1CV3A 1JTMA 1XJUA 1L08A 182LA 1L04A 1L26A 1L39A 1D3MA 184LA 1C61A 2Z6BA 205LA 1L69A 1L61A 1C6KA 158LA 2B6ZA 1L99A 196LA 1L71A 139LA 3HU8A 1L24A 144LA 4LDLA 1L88A 3DNAA 1T97A 3G3VA 130LA 1L49A 3C8RA 108LA 3C80A 212LA 1L46A 3JR6A 3DMZA 114LA 3SB8A 1L51A 1TLAA 4I7NA 1LYHA 1L12A 3G3WA 245LA 1L94A 2B6XA 156LA 5I14A 1L06A 1L89A 4IAPA 4YX7C 3HT6A 2OEAX 1LYFA 1C6BA 1KNIA 222LA 198LA 1L76A 1JQUA 1LWGA 4W53A 3SBBC 2O7AA 3UONA 1OVKA 1L79A 188LA 1SWZA 160LA 4ARJA 3G3XA 4I7QA 129LA 3GUPA 2NTHA 4ZPUA 4DJHA 3L64A 128LA 197LA 1L11A 4I7PA 4GRVA 238LA 1P5CA 3FI5A 1C68A 1CV1A 1L28A 253LA 111LA 110LA 1L19A 166LA 2HUKA 3C81A 2B70A 1LPYA 1T8AA 6LZMA 3HUKA 1KW7A 107LA 1QT4A 4ARLA 165LA 2OU9A 1C6HA 1KW5A 4PJZA 1L33A 4EKPA 122LA 1LYJA 3SB9A 3NY9A 3HUAA 259LA 159LA 3DKEX 231LA 1CUQA 200LA 4I7TA 1L20A 1PQOA 3CDOA 1L52A 3GUMA 1L64A 247LA 4OO9A 1QT3A 1XJTA 2OE4X 151LA 1CV6A 3CDVA 2F2QA 1DYFA 3FA0A 1PQKA 254LA 157LA 2RAYX 3D4SA 4LDEA 3C7YA 2B75A 2CUUA 1C6GA 1L56A 4E97A 125LA 1C6QA 229LA 4W56A 234LA 4ARMA 1C69A 1CU5A 3HDFA 173LA 137LA 118LA 216LA 2RBRA 195LA 2Q9DA 4EJ4A 255LA 3C8SA 145LA 1CU6A 1L81A 4W54A 1D9WA 1QTVA 3C83A 1LGWA 1C6TA 2F47A 4W58A 1L36A 141LA 1L14A 4PK0A 1JTNA 167LA 1P64A 1L50A 3GUNA 1ZYTA 4LZMA 1G1VA 152LA 1L77A 4DKLA 1CX7A 1DYCA 1L48A 1L01A 2O4WA 3C8QA 235LA 1L86A 1L23A 4W52A 190LA 246LA 2Q9EA 3DMVA 109LA 3DN6A 1L90A 104LA 1C66A 1L98A 242LA 3DN4A 210LA 1L59A 232LA 5LZMA 1D2WA 1L97A 241LA 3HH5A 2RBPA 1KY1A 1LGUA 1C6EA 2A4TA 1L17A 4W59A 1OV5A 2L78A 1L45A 1CTWA 3HTFA 126LA 1G07A 176LA 1L16A 2RBQA 1P2LA 1L38A 1G0GA 4GBRB 1CV0A 2OU8A 1P36A 1L80A 1L25A 2B6TA 260LA 243LA 150LA 172LA 1C65A 1L40A 3GUJA 1G0QA 1T8FA 3PDSA 1D2YA 3OE8A 123LA 3QAKA 4EKQA 2HUMA 161LA 1C6DA 227LA 1C60A 224LA 3HT9A 1L21A 3C82A 1CV5A 185LA 1LI2A 1LLHA 2OTYX 1ZURA 3SB5A 1OYUA 251LA 1G1WA 183LA 138LA 2OU0X 2O79A 1XEPA 4EKSA 1L82A 3NYAA 2B73A 1ZWNA 181LA 3CDQA 3C7ZA 1QTCA 258LA 4W57A 2HULA 175LA 4W51A 2OE9X 1L66A 1WTHA 1C6AA 3HDEA 103LA 1QSBA 1SX2A 1OWYA 1PQIA 1LYEA 250LA 1L91A 2LCBA 1P3NA 1LI3A 1L0JA 1QTZA 1QTDA 3OE9A 1LWKA 3HH4A 3SBAA 131LA 3HH6A 1L44A 1LGXA 163LA 3FADA 4W55A 2B72A 1L22A 4ARPA 1QUOA 1T6HA 1L72A 1SX7A 3HTDA 3C7WA 1L29A 1L05A 1CU0A 1QT7A 1QTBA 3HWLA 3V2WA 1L42A 209LA 2F32A 178LA 3LZMA 1C6LA 239LA 1P37A 4I7KA 1QT8A 256LA 3HUQA 3OE0A 1P56A 1DYAA 3VW7A 1L67A 1QS5A 3F8VA 2QARC 2IGCA 2RH1A 3CDRA 262LA 1OVHA 3PBLA 1P2RA 1SSWA 1QT6A 2B7XA 4I7OA 191LA 1CV4A 1L41A 4LDOA 1L85A 1OWZA 221LA 1L74A 3CDTA 1G0LA 146LA 155LA 148LE 4I7SA 1L54A 1QS9A 3HT7A 3HT8A 3SB7A 1DYBA 1LI6A 1PQJA 3V2YA 4DAJA 1QUDA 1L65A 1PQMA 1I6SA 1L13A 1G0JA 142LA 201LA 1C67A 1L63A 213LA 3NY8A 1D3JA 1T8GA 1L93A 1G0PA 1QTHA 225LA 1C63A 4I7JA 171LA 2RBNA 113LA 2B6YA 226LA 4EPIA 1D3FA 1L83A 1P7SA 1QUGA 3K2RA 4ARQB 1P46A 3DN1A 3DN8A 2ANVA 4YXCA 174LA 1DYEA 1L32A 3DN0A 1OVJA 1CU3A 1L70A 2RB0X 1DYDA 1C6MA 1L34A 177LA 1QSQA 3SN6R 1K28A 206LA 189LA 1L15A 237LA 2OTZX 180LA 1L10A 4I7LA 1CVKA 4AQNA 1L58A 1LYGA 1SWYA 1G0MA 1LW9A 1PQDA 3HTBA 1C6PA 4EPFA 3DN2A 168LA 115LA 1KS3A 1L37A 2B6WA 1L75A 4ARMB 2B74A 211LA 1L09A 3OE6A 1NHBA 219LA 230LA 228LA 2OE7X 1C6NA 1L18A 2RAZX 4I7MA 252LA 102LA 1QT5A 2RBOA 1C64A 249LA 169LA 1L31A 1L96A 1L47A 3HU9A 2LC9A 2NTGA 119LA 1L84A 3GUIA 1L53A 147LA 1L62A 187LA 1G0KA 218LA 1C6FA 2RBSA 170LA 4EKRA 186LA 164LA 4ARQA 220LA 1L27A 1C6JA 1L00A 3GULA 1L03A 3HTGA 240LA 1L07A 1LYDA 1P6YA 199LA 248LA 1L68A 4S0WA 223LA 7LZMA 120LA 1C6IA 3RZEA 1L43A 3RUNA 1D3NA 1L30A 236LA 3DN3A 3HH3A 1L95A 2RB1X 214LA 192LA 1CUPA 233LA 4K5YA 3EMLA 1L92A 1LYIA 4YXAC 127LA 2ANXA 215LA 4EXMA 2RB2X 1L0KA 1C62A 1L57A 3F9LA 162LA 1L73A 3GUKA 3ODUA 143LA 257LA 112LA 149LA 261LA 1L55A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CT0A 4YF2A 5F81A 4G49A 3SB6A 1N4FA 2HECA 1WQNA 3GUOA 3ZVQA 1L02A 1L60A 1SSYA 4OWCA 2QB0B 4H94A 1JTMA 1D3MA 1L69A 1L61A 1CJ7A 4YM8A 3RZ4A 1T6VL 2D4KA 196LA 3WW5A 139LA 3CSQA 4ET8A 1OUDA 3DNAA 1T97A 1IORA 3C80A 1L46A 1LZCA 4M4OA 4G4HA 4I7NA 4WM4A 1HF4A 4PPOA 245LA 1C10A 1CKGA 1B5XA 3A3RX 4NSJA 3EO5A 3G3AB 1RE2A 1D6PA 1C6BA 1KNIA 198LA 1NHEA 1L76A 2VB1A 4KPMA 2LYMA 1JQUA 4NWHA 4H8XA 5HMJA 3G3XA 4I7QA 129LA 4LT1A 4P2EA 4DJHA 128LA 197LA 3CT1A 4TUNA 4WM1A 4GRVA 4ZEEA 1KIPC 1ALCA 2W1LA 1L19A 3TMWA 4W94A 5LVHA 1LPYA 5FDJA 2YBLA 1LZ8A 1B7PA 3W6FA 1C6HA 1G7MC 4LT2A 1LYJA 1W08A 3DKEX 1LZAA 1XGPC 1BB6A 1L20A 3CDOA 2X0AA 1L64A 4OO9A 1IP5A 1LHKA 1IP3A 3CDVA 2BQHA 4G4BA 3A6BY 254LA 2MEHA 2B75A 2CUUA 1FBIX 125LA 1LZSA 4WLTA 3AZ5A 234LA 3IWRA 4C5FA 1B7NA 4HJZA 1JISA 3C8SA 2XTHA 4XENA 1FLUA 3C83A 4RDSA 5IHGA 1WVUA 2F47A 4W58A 1L36A 1VDPA 1L14A 4PK0A 5LVIA 1YAMA 1JKDA 4YEMA 1G1VA 152LA 1L77A 4N9RA 2O4WA 3C8QA 4GLVA 1L86A 3P66A 1EQEA 190LA 246LA 1LYOA 3DMVA 3DN6A 1JSEA 3DN4A 1AKIA 1KIQC 1B5ZA 5HMVA 3WUAA 2BQOA 4H9HA 1LGUA 4BS7A 1LJ4A 1O23A 5F16A 2L78A 1CTWA 1LMQA 5DN4A 2EPEA 5I4XA 3RU5A 1P36A 2I6ZA 4HV1A 1F10A 243LA 150LA 1L40A 1T8FA 1LMOA 3OE8A 3QAKA 2HUMA 4HPEA 5I4WA 1C6DA 227LA 1C60A 224LA 1L21A 3C82A 1A2YC 1UIBA 1YAPA 1BQLY 3SB5A 251LA 183LA 1HEPA 1L82A 2B73A 3WVXA 4BADA 1QTEA 2ZIJA 1YAOA 175LA 4W51A 2OE9X 103LA 1QSBA 1L91A 1L0JA 1QTZA 3W6DA 131LA 2LZ2A 3HBHA 3FADA 4W55A 5APDA 1LYSA 3HTDA 4Z98A 3CSZA 1GEZA 5D5CA 1GBZA 1QTBA 2ZYCA 1UCOA 154LA 4YEOA 5C6JA 1OUHA 1L42A 4B4IA 2F32A 4J1BA 3TXKA 133LA 1NDGC 1H87A 3HUQA 1P56A 1CKFA 3VW7A 1LHHA 1L67A 4ETBA 3CDRA 262LA 4KXIA 4DD1A 3WUMA 3P68A 5APFA 191LA 1CV4A 1L41A 1L85A 1CNSA 5B1GA 1GFGA 134LA 1VFBC 3HT8A 1WTMA 2I25L 4CFOA 1HFYA 1LI6A 4J7VA 4NGJA 5A3EA 3V2YA 1VAUA 1PQMA 5FCPA 4NSGA 1UIDA 5HNLA 5KKJA 1GF8A 4ZFPA 2BQIA 1T8GA 1G0PA 1QTHA 1C63A 4NHPA 1LJGA 226LA 4GCDA 1V7TA 1L83A 1UUZC 3AGIA 1P46A 3DN1A 1WQRA 2DBTA 4HJVA 4NG8A 1GFVA 3DN0A 1OVJA 4IASA 2MEDA 1IP7A 4NSHA 1QSQA 1GF4A 1L15A 2ZNWY 1CVKA 1GWDA 1OUBA 1L58A 1SWYA 2MEBA 4XJHA 1XGUC 1I56A 1IWVA 1RI8B 1L75A 4NSIA 3WVYA 4NIJA 1D0LA 1B7QA 1GFJA 3WU9A 3CT5A 252LA 1D9UA 169LA 4AGAA 1C08C 2NTGA 1HSXA 3GUIA 1QSWA 1AM7A 147LA 1SQ2L 218LA 4DT3A 5APEA 5LAGA 220LA 1ZVHL 1LSNA 1GDXA 3HTGA 2D4JA 2DQGY 3TXDA 4ETAA 1LMNA 1LYDA 2BQCA 4S0WA 4I8SA 3MGWA 4ML7A 192LA 1G7IC 1CUPA 2EQLA 127LA 1DZBX 1H6MA 2MEAA 1GF9A 1C62A 4NHSA 5B05A 162LA 1L73A 257LA 1LHIA 3K2RA 2XQOA 261LA 1L55A 217LA 4I7RA 1INUA 1NKHA 1OV7A 1B5YA 1KIRC 1KY0A 1L35A 1VDTA 3L2XA 4L41A 1JWRA 1JTTL 2MEFA 1CV3A 5DM9A 182LA 1IWUA 1DKKA 184LA 5EBHA 4FJRA 132LA 4MCKA 1LZ1A 1GFRA 1L71A 5LAFA 2Z12A 4H8ZA 5KXXA 2ZILA 3HU8A 1L88A 1FDLY 3G3VA 3C8RA 212LA 4QEQA 5FELA 2YSSC 4WG7A 3DMZA 114LA 1L51A 4WL6A 4H9EA 1VEDA 1YQVY 4A7DA 1HSWA 4DD2A 1L06A 1L89A 4HTKA 1AZFA 222LA 1DI3A 3SBBC 1GFEA 1REMA 4LFPA 1HEQA 2MEEA 160LA 2NTHA 1L11A 4I7PA 1LKSA 1UICA 4NGLA 1OUFA 1P5CA 1C68A 1CV1A 1L28A 111LA 110LA 3A95A 1IO5A 1IVMA 3C81A 5LVGA 1KXXA 1T8AA 6LZMA 135LA 1DPXA 1IWTA 1QT4A 4LT0A 3AJNA 4H9AA 4NHQA 5B07A 165LA 2OU9A 3TXFA 3LYMA 1L33A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3CT0 A;  4YF2 A;  5F81 A;  4G49 A;  3SB6 A;  1N4F A;  2HEC A;  1WQN A;  3GUO A;  3ZVQ A;  1L02 A;  1L60 A;  1SSY A;  4OWC A;  2QB0 B;  4H94 A;  1JTM A;  1D3M A;  1L69 A;  1L61 A;  1CJ7 A;  4YM8 A;  3RZ4 A;  1T6V L;  2D4K A;  196L A;  3WW5 A;  139L A;  3CSQ A;  4ET8 A;  1OUD A;  3DNA A;  1T97 A;  1IOR A;  3C80 A;  1L46 A;  1LZC A;  4M4O A;  4G4H A;  4I7N A;  4WM4 A;  1HF4 A;  4PPO A;  245L A;  1C10 A;  1CKG A;  1B5X A;  3A3R X;  4NSJ A;  3EO5 A;  3G3A B;  1RE2 A;  1D6P A;  1C6B A;  1KNI A;  198L A;  1NHE A;  1L76 A;  2VB1 A;  4KPM A;  2LYM A;  1JQU A;  4NWH A;  4H8X A;  5HMJ A;  3G3X A;  4I7Q A;  129L A;  4LT1 A;  4P2E A;  4DJH A;  128L A;  197L A;  3CT1 A;  4TUN A;  4WM1 A;  4GRV A;  4ZEE A;  1KIP C;  1ALC A;  2W1L A;  1L19 A;  3TMW A;  4W94 A;  5LVH A;  1LPY A;  5FDJ A;  2YBL A;  1LZ8 A;  1B7P A;  3W6F A;  1C6H A;  1G7M C;  4LT2 A;  1LYJ A;  1W08 A;  3DKE X;  1LZA A;  1XGP C;  1BB6 A;  1L20 A;  3CDO A;  2X0A A;  1L64 A;  4OO9 A;  1IP5 A;  1LHK A;  1IP3 A;  3CDV A;  2BQH A;  4G4B A;  3A6B Y; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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