4B1AA

Crystal structure of lysozyme with keggin molecule
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
publication title Characterization of a Versatile Organometallic Pro-Drug (Corm) for Experimental Co Based Therapeutics.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME C
total genus 46
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-07-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4b1aA00
1AKIA 5L3HA 3AZ7A 4NG1A 3TXBA 1IWYA 1UIFA 1HERA 4CFPA 5LVHA 3WXUA 1JJ1A 4PPOA 1UIHA 1CNSA 5M1YA 3TXJA 1LMCA 4UWNA 2DQDY 1GXXA 1LTMA 1XGPC 4QEQA 3K3TA 3CQLA 1GE4A 1VATA 3BKVA 5C6LA 5FDJA 1A4VA 1YKYX 2X0AA 4LYMA 4J1BA 2I25L 3HBEX 1D0LA 1HFYA 1FLWA 2BQHA 3B0OA 1LSCA 1LYSA 4HTKA 3WPJA 4PRUA 3AZ5A 1YANA 1PS5A 1YKZX 2MEBA 4B4IA 1QDTA 1LHKA 1OUDA 4B0DA 4NWHA 4AXTA 1OQMA 2ZQ4A 3CSRA 2Q0MX 5DN5A 3T36A 2BQEA 2XBRA 1INUA 2G4NA 1IY4A 4BAPA 1IR8A 4H8ZA 1OUIA 1GFAA 5LINA 2LYMA 1GB5A 1NHEA 4LT2A 4W94A 2BQDA 2W1XA 5LVKA 3ULRA 2DQGY 1REXA 4HJVA 1B5WA 4ETEA 1GBYA 1LJ3A 1LJJA 1LZDA 1NWGA 4RW1A 1HFZA 4LT3A 4NGIA 4QDNA 2ZWBA 3HBDA 3WU9A 4LYZA 3BKHA 4J0LA 3WL2A 1BWIA 1OUFA 1GFJA 3TMUA 3F6ZA 4ANRA 2IFFY 4H1PA 2BQBA 4YF2A 2Z2EA 3AGIA 3AW7A 3AYQA 2FYDA 1IOTA 1JEFA 5KXPA 4G4CA 1LZ9A 1O23A 3P68A 1LJ4A 3A3RX 3LZTA 2BQIA 1LJEA 4A7DA 3QE8A 3N9EA 5B1GA 3WULA 1LSBA 4TUNA 5L9JA 2YBJA 2HTXA 5LAGA 3WU7A 1VDQA 1TEWA 5B07A 5T3FA 4FJRA 1OUEA 1B7MA 132LA 1IWVA 1DKJA 1VEDA 2YBNA 3RNXA 5I4XA 1UCOA 1HEQA 4QGZA 1LZGA 1LCNA 4DD1A 1LZ8A 1AM7A 4DT3A 5F14A 1VDSA 5B05A 4OWEA 7LYZA 2YBIA 3B6LA 1NDGC 1LJHA 1YAQA 2IHLA 3GXRA 4QY9A 5I4WA 2ZYCA 3SP3A 5FSTA 3AZ4A 1VDPA 4CJ2A 4W96A 1UUZC 2PC2A 3ATOA 1D6QA 5KXZA 3P64A 2BQMA 1TCYA 2BLXA 5K7OA 3W6DA 1B5VA 1LZAA 4G4BA 1FKQA 1KXYA 4N1EI 4WL6A 2GV0A 1IP7A 1C46A 3RT5X 3WMKA 1JSFA 1LYYA 1LMPA 3A94A 4IJ4A 1JKCA 1HFXA 5KXWA 2BQOA 1WQMA 3TMWA 3WYHA 1LSMA 1YL0X 2DQAA 4LGKA 1CKGA 1AT6A 1GFHA 1GDWA 2D6BA 1JWRA 1WQPA 1UC0A 4OWHA 3W6EA 1GE3A 1LSAA 1MELL 5IHGA 3B72A 4LYCA 3G3AB 3RW8A 1GBZA 2BQNA 2BAAA 2AUBA 4HJYA 3T6UA 2RSCA 4IASA 2HUBA 3WUAA 1XSFA 1UA6Y 5LYMA 1A2YC 4HV1A 5APFA 3TXFA 207LA 4DYGA 1GB9A 208LA 5AMYA 1GB8A 3CSZA 3CT5A 4HSFA 5B59A 3A6CY 1JKBA 4OWAA 1GHLA 1JITA 4R0FA 1NQIA 4YENA 5KJ9A 2EPEA 4WLTA 1J1XY 4Z3MA 3W6FA 5EBHA 2ZIJA 4RLMA 2H5ZA 1GXV2 1LSDA 1B2KA 1D0KA 1BB4A 1LHIA 1LZ1A 4O34A 3AGHA 5FCPA 5KKJA 1GF8A 1WTNA 1B7RA 1YILA 1BQLY 3TMVA 3TXDA 4LYBA 1HSXA 4KXIA 1J1PY 1HMLA 1YAOA 4ETAA 5KXRA 1UIDA 3E3DA 3OK0A 4H9AA 4B4JA 2BQKA 3P66A 4XJBA 2Z2FA 1IP3A 1OUAA 1TAYA 4WM4A 4MCKA 1IIZA 1LZSA 5FELA 1F10A 5KKIA 1V7TA 1N4FA 3GXKA 4G9SA 4XJFA 4NSHA 1D0MA 3B0IA 1QUTA 3CSQA 1JUGA 2C8PA 4N9RA 2YVBA 3LYMA 1KXXA 4WLDA 5HMVA 1HELA 1IWWA 4WO9A 1IC4Y 1LSNA 1WVUA 2ZQ3A 1QQYA 1B7OA 1BB6A 1IEEA 4WM2A 4C5FA 2LZTA 1JHLA 1HMKA 3ZEKA 4DD3A 3RU5A 1SLYA 1BB7A 5B1FA 3TXEA 1LZEA 1T6VL 3IJVA 1NF5A 1BVKC 1IWUA 3WPKA 1LJGA 3WUMA 1IP6A 2HEAA 4DDAA 1TDYA 1XGUC 4ET8A 154LA 2DKVA 4WM3A 1BHZA 2ZYPA 4N8ZA 1NMMA 4NFVA 3EMSA 1SQ2L 1LZTA 3CT1A 4WLYA 4RLNA 3J6KA 4GLVA 1LZRA 1ZVYB 1MLCE 4XYYA 1PZYA 4OOTA 4PRQA 1WVVA 3A93A 4M6DA 5JENB 1LZNA 4HPIA 4D9ZA 1GFGA 2YBMA 1C10A 1GFKA 4H93A 4H9CA 4WO6A 5FEKA 4TWSA 1IOSA 5LA8A 5A3EA 1YAMA 3WXTA 5LVGA 1UIAA 1C43A 4WG7A 1JJ0A 4Z41A 2Z38A 2EKSC 3N9AA 1JTOL 4HP0A 3WU8A 1KXWA 3WVYA 2W1YA 5IDDA 4DDCA 4EMNA 3A3QA 1LZYA 4NSGA 3MGWA 1GE1A 4ETCA 3CB7A 1GAZA 1KIPC 1LHMA 4U3XB 4B4EA 2A7FA 2BPUA 4XJDA 1GWDA 2DQIY 2A7DA 2WARA 2CDSA 5A3ZA 1GE2A 4ML7A 1I1ZA 5LYTA 1WQQA 2XTHA 3LN2A 3WW6A 1IORA 4XENA 2BQLA 5LA5A 1GB3A 2HEEA 4NGWA 3D3DA 4NHTA 5I53A 1QIOA 1GB2A 5KXNA 1DI3A 1B7NA 1CJ8A 1WQRA 2DBTA 2FYCA 3FI7A 1BVXA 1CJ9A 5LIOA 1HC0A 2H9KA 3W6AA 1ZVHL 1GF9A 1GF6A 2BQGA 1XEKA 1LKRA 1CKDA 4AGAA 4GCEA 1GEZA 2W1LA 4H9EA 5LAFA 1UACY 1VFBC 1XGRC 4LZTA 1ALCA 1QSWA 1CJ7A 1LZ6A 1G7JC 2MECA 5KY1A 3TXGA 5I54A 4WOAA 2YBLA 1GFUA 1GFTA 4N1CC 3A96A 4XJGA 4ETDA 193LA 1GBOA 3HBHA 4FDYA 1BWHA 2Z12A 3M18B 3P65A 194LA 1VAUA 9LYZA 2XJWA 5KXOA 2F2NA 1UIEA 2FBDA 1RFPA 1HSWA 4KL7A 4ET9A 3M3UA 4HTQA 4EOFA 1LHJA 5HQ1A 3TXIA 2CGIA 2G4PA 5LVJA 1C45A 1LYOA 1GB0A 5HNLA 3A34A 2H9JA 1HEPA 4G4HA 1GBWA 5HMJA 1JKAA 2MEDA 5I4YA 1LMAA 4WMGA 1UBZA 1NKHA 1RJCB 3EO5A 2I26L 1GFEA 1DXJA 1LSFA 1GE0A 2F30A 4LFPA 1IP4A 1UICA 3G3BB 1DI4A 4NIJA 4XADA 4DWXA 4H8YA 1JISA 3AW6A 4H92A 4YM8A 2BQJA 4NGLA 1JSEA 1I56A 1W08A 1DI5A 2LYOA 3AB6A 1LMQA 1B5ZA 3B0KA 4II8A 1DPXA 1GPQC 1QSAA 1NBYC 1NDMC 1HNLA 5DM9A 1REZA 3A8ZA 1H87A 1IX0A 3RZ4A 3W3EA 4UWVA 2ZILA 1GF4A 2HEDA 5DL9A 3IJUA 4DC4A 1LJIA 5KXSA 1OUHA 1GB6A 1HHLA 2VB1A 3LHMA 2B5ZA 1CKHA 4TX7A 1QTKA 1FN5A 8LYZA 1YAPA 4XJHA 1JKDA 2YSSC 1BB3A 1FLUA 2ZIKA 1HF4A 1EL1A 2BQAA 2YBHA 1DZBX 4HTNA 1LZ4A 4H8XA 4HJZA 1B7PA 4H9FA 5DN4A 4DD0A 3TXHA 3ATNA 5KXLA 4NGOA 4NGZA 1DQJC 4CGEA 2D4KA 4H94A 1ZMYL 3OJPA 4J1AA 1OUGA 4HPEA 3D9AC 5HNCA 3LYOA 1LJFA 2YDGA 1FBIX 4B1AA 5E9RA 1GF5A 2MEFA 3P4ZA 1D6PA 1Z55A 4GCCA 1LMTA 1GBSA 4RDSA 2BLYA 1B9OA 4YEOA 4R6CA 5LXWA 1XEIA 5IELA 1FLQA 1G7HC 2FBBA 1NBZC 3A91A 4E3UA 4GN5C 1LSEA 1EQEA 1LHLA 1B5UA 3WH1A 3WUNA 2DQFC 2MEIA 3CT0A 4BADA 1LSPA 4IATA 4DD7A 1LZ5A 1TBYA 4ZFPA 1FDLY 5APEA 4H9HA 3TXKA 4NHIA 1LJNA 1XFPL 4MSTA 5F9XA 1G7LC 2G4QA 1B7SA 1YL1X 2DQJY 2CWIA 5F9UA 1IP5A 1GF0A 2MEEA 2C8OA 5ILCA 3KAMA 4H9IA 1REMA 4DD9A 1IO5A 4NGJA 1GD6A 1JTPL 4NGYA 5APCA 3ZVQA 4HV2A 1BGIA 2HECA 4N0JA 1LSZA 4GCBA 1IR7A 4GLAA 1F6SA 5II3A 1OUBA 4OOOA 1UIBA 3QNGA 1HEWA 1YROA 1GFVA 3IWRA 1IVMA 1OP9B 5ILFA 1LKSA 3N9CA 4NG8A 3ZVQB 4CHXA 1IP1A 1CKFA 4H90A 4TTDA 2HEFA 4DDBA 1LZBA 1IWXA 1GDXA 1JIYA 2XBSA 5E4PA 1FKVA 1B5YA 2CJLA 1B7QA 1LJKA 1YIKA 2DQCY 2BQCA 2Z39A 1IC5Y 4YOPA 4WG1A 1WQNA 5DLAA 3W6CA 6LYTA 4LYOA 3A6BY 5D5FA 1WTMA 4NHSA 3WVXA 1E8LA 1JJ3A 4KT3A 4TSBA 4OWCA 5C6JA 2BQFA 5LVIA 5L3IA 5D5CA 4XN6A 4BAFA 1LHHA 4ZIXA 2Z37A 1C7PA 1EQ4A 1F0WA 1LOZA 4KPMA 3EXDA 5J7CA 1QDRA 3A67Y 4LT0A 2W1MA 4I0CA 2Y8PA 4N5RA 1LZCA 1XEJA 5KXYA 4PJ2C 1UIGA 5C6IA 3WW5A 1B5XA 1G7IC 2NWDX 2ZNXY 1IY3A 1F6RA 1JTTL 3HFMY 1GF3A 2LZ2A 2EQLA 5F81A 3LYZA 135LA 1AZFA 3AJNA 1J1OY 4B49A 4M4OA 4NSIA 5LYZA 4ZEEA 3A95A 4WLXA 1CKCA 1EQ5A 1KIQC 1IOQA 4NGKA 2MEGA 2MEHA 1QUSA 5FHWA 1OUCA 1GEVA 1XGQC 4L41A 4MR1A 4PGJB 1LMOA 1ZV5L 4X3BA 1W6ZA 4GN4A 1GF7A 3W6BA 3QY4A 4NHQA 4LT1A 3VWOA 3WPLA 4GN3A 3J4GA 3AGGG 1IWTA 1I20A 4RW2A 1LSGA 1H6MA 1C08C 2D4IA 1IR9A 4H91A 1IOCA 1T3PA 1RCMA 5KXXA 2ZNWY 5KXKA 5I5QA 4LYTA 4PHIA 1LYZA 3AZ6A 1AT5A 2N5ZA 2DQHY 4H9BA 6LYZA 153LA 4OW1A 3TMXA 1IC7Y 5HLLA 1YKXX 134LA 1HEOA 4P2EA 4G49A 4GCFA 1DKKA 1IWZA 1DPWA 1YQVY 4I8SA 2I6ZA 2LYZA 4ETBA 1VDTA 3LZ2A 5KXTA 2HU3A 1OUJA 4YEMA 4WM1A 4BS7A 2F4AA 4NGVA 3FE0A 4J7VA 4CFOA 4XJIA 3EBAB 133LA 1LMNA 1HENA 1HEMA 4TSCA 5B06A 2DQEY 1RI8B 1XGTC 4GCDA 2Z18A 4NWEA 1B7LA 1GFRA 1KIRC 4WL7A 1D9UA 4NHPA 1RE2A 4WM5A 1GB7A 4C3WA 2MEAA 1QTEA 1V7SA 1CJ6A 4OWBA 1IP2A 5F16A 4WM6A 5APDA 2LHMA 1LPIA 1G7MC 4Z98A 1P2CC 1B0DA 1BB5A 1LAAA 4UWUA 1WQOA 3A90A 1FLYA 2Z19A 2F4GA 4NY5A 3LYTA 5KXMA 4LFXA 1JPOA 2HEBA 1GAYA 3A92A 1GBXA 2EIZC 1BWJA 2D91A 1LSYA 4NEBA 4Z46A 2HU1A 4DD2A 4NSJA 2D4JA 1REYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1QS9A 5L3HA 4CFPA 7LZMA 185LA 1CNSA 5M1YA 1LMCA 1L50A 3K3TA 1GE4A 1YKYX 1D0LA 2Z6BA 3B0OA 1CU3A 1LSCA 2B6TA 3CDRA 1YANA 1PS5A 4LDOA 4B4IA 1OUDA 1OQMA 1INUA 2G4NA 2LYMA 4W94A 2BQDA 219LA 1B5WA 1L05A 1LZDA 1L04A 4DJHA 248LA 4RW1A 2HUKA 3HBDA 2B6XA 4J0LA 1OUFA 3AW7A 2RBQA 2FYDA 1IOTA 3P68A 3A3RX 3LZTA 3HUAA 1LWGA 4A7DA 3N9EA 5L9JA 229LA 1TEWA 5B07A 4FJRA 1UCOA 1L57A 2OE9X 4YXAC 1OVKA 4OWEA 7LYZA 4I7JA 1LJHA 173LA 1YAQA 2IHLA 5I4WA 2ZYCA 5FSTA 3AZ4A 1VDPA 3SB6A 4W96A 3ATOA 5KXZA 4DKLA 2BQMA 3C8RA 2BLXA 3W6DA 4G4BA 1PQOA 4WL6A 1LYYA 234LA 4IJ4A 2BQOA 2RBPA 1CKGA 1QT6A 1GE3A 1MELL 4LYCA 258LA 237LA 2RSCA 119LA 1L47A 1L45A 5LYMA 207LA 4DYGA 5B59A 3CDTA 1JKBA 4OWAA 2Q9EA 3W6FA 5EBHA 4EPIA 4W56A 4O34A 1LZ1A 1GF8A 3TMVA 217LA 4LYBA 1HSXA 3C8SA 1J1PY 3GUIA 1UIDA 3OK0A 3P66A 4XJBA 4WM4A 1D3MA 4NSHA 1QUGA 3B0IA 128LA 1IWWA 4WO9A 2RB1X 4E97A 1WVUA 2ZQ3A 1BB6A 4C5FA 1HMKA 1C68A 1SLYA 5B1FA 3SB7A 1NF5A 1BVKC 1LJGA 3HTBA 1IP6A 4ET8A 1P37A 3V2YA 154LA 2DKVA 1C6TA 1L51A 4NFVA 1SQ2L 1LZTA 3L2XA 2ANXA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1AKI A;  5L3H A;  3AZ7 A;  4NG1 A;  3TXB A;  1IWY A;  1UIF A;  1HER A;  4CFP A;  5LVH A;  3WXU A;  1JJ1 A;  4PPO A;  1UIH A;  1CNS A;  5M1Y A;  3TXJ A;  1LMC A;  4UWN A;  2DQD Y;  1GXX A;  1LTM A;  1XGP C;  4QEQ A;  3K3T A;  3CQL A;  1GE4 A;  1VAT A;  3BKV A;  5C6L A;  5FDJ A;  1A4V A;  1YKY X;  2X0A A;  4LYM A;  4J1B A;  2I25 L;  3HBE X;  1D0L A;  1HFY A;  1FLW A;  2BQH A;  3B0O A;  1LSC A;  1LYS A;  4HTK A;  3WPJ A;  4PRU A;  3AZ5 A;  1YAN A;  1PS5 A;  1YKZ X;  2MEB A;  4B4I A;  1QDT A;  1LHK A;  1OUD A;  4B0D A;  4NWH A;  4AXT A;  1OQM A;  2ZQ4 A;  3CSR A;  2Q0M X;  5DN5 A;  3T36 A;  2BQE A;  2XBR A;  1INU A;  2G4N A;  1IY4 A;  4BAP A;  1IR8 A;  4H8Z A;  1OUI A;  1GFA A;  5LIN A;  2LYM A;  1GB5 A;  1NHE A;  4LT2 A;  4W94 A;  2BQD A;  2W1X A;  5LVK A;  3ULR A;  2DQG Y;  1REX A;  4HJV A;  1B5W A;  4ETE A;  1GBY A;  1LJ3 A;  1LJJ A;  1LZD A;  1NWG A;  4RW1 A;  1HFZ A;  4LT3 A;  4NGI A;  4QDN A;  2ZWB A;  3HBD A;  3WU9 A;  4LYZ A;  3BKH A;  4J0L A;  3WL2 A;  1BWI A;  1OUF A;  1GFJ A;  3TMU A; 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 2MEH A;  1QUS A;  5FHW A;  1OUC A;  1GEV A;  1XGQ C;  4L41 A;  4MR1 A;  4PGJ B;  1LMO A;  1ZV5 L;  4X3B A;  1W6Z A;  4GN4 A;  1GF7 A;  3W6B A;  3QY4 A;  4NHQ A;  4LT1 A;  3VWO A;  3WPL A;  4GN3 A;  3J4G A;  3AGG G;  1IWT A;  1I20 A;  4RW2 A;  1LSG A;  1H6M A;  1C08 C;  2D4I A;  1IR9 A;  4H91 A;  1IOC A;  1T3P A;  1RCM A;  5KXX A;  2ZNW Y;  5KXK A;  5I5Q A;  4LYT A;  4PHI A;  1LYZ A;  3AZ6 A;  1AT5 A;  2N5Z A;  2DQH Y;  4H9B A;  6LYZ A;  153L A;  4OW1 A;  3TMX A;  1IC7 Y;  5HLL A;  1YKX X;  134L A;  1HEO A;  4P2E A;  4G49 A;  4GCF A;  1DKK A;  1IWZ A;  1DPW A;  1YQV Y;  4I8S A;  2I6Z A;  2LYZ A;  4ETB A;  1VDT A;  3LZ2 A;  5KXT A;  2HU3 A;  1OUJ A;  4YEM A;  4WM1 A;  4BS7 A;  2F4A A;  4NGV A;  3FE0 A;  4J7V A;  4CFO A;  4XJI A;  3EBA B;  133L A;  1LMN A;  1HEN A;  1HEM A;  4TSC A;  5B06 A;  2DQE Y;  1RI8 B;  1XGT C;  4GCD A;  2Z18 A;  4NWE A;  1B7L A;  1GFR A;  1KIR C;  4WL7 A;  1D9U A;  4NHP A;  1RE2 A;  4WM5 A;  1GB7 A;  4C3W A;  2MEA A;  1QTE A;  1V7S A;  1CJ6 A;  4OWB A;  1IP2 A;  5F16 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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