3CT5A

Crystal and cryoem structural studies of a cell wall degrading enzyme in the bacteriophage phi29 tail
Total Genus 62
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
62
sequence length
159
structure length
159
Chain Sequence
MVYVSNKYLTMSEMKVNAQYILNYLSSNGWTKQAICGMLGNMQSESTINPGLWQNLDEGNTSLGFGLVQWTPASNYINWANSQGLPYKNMDSELKRIIWEVNNNAQWINLRDMTFKEYIKSTKTPRELAMIFLASYERPANPNQPERGDQAEYWYKNLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Bacteriophage phi-29
publication title Crystal and cryoEM structural studies of a cell wall degrading enzyme in the bacteriophage phi29 tail.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Morphogenesis protein 1
total genus 62
structure length 159
sequence length 159
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-04-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF18013 Phage_lysozyme2 Phage tail lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3ct5A00
5L9JA 1IP1A 1DKJA 1LSZA 4LT3A 1LZ9A 3A91A 1GB7A 4QY9A 4HJZA 1IWVA 2BQJA 4HJVA 4G9SA 4TTDA 1CKHA 2BQLA 1LJNA 4H9HA 1LHKA 2ZIKA 4EOFA 4Z46A 1TBYA 2HEAA 4PPOA 4HP0A 3A3RX 1A4VA 1GF6A 1GFEA 1VDQA 2DQDY 1XGQC 4H8ZA 4OW1A 5II3A 2C8OA 1BGIA 3WVXA 4LT1A 2ZYPA 2ZQ3A 4AGAA 1LZBA 2MEGA 2MEHA 4M4OA 4WL7A 5LVGA 1EQ5A 1GFHA 1JSEA 1LYSA 3GXRA 2G4NA 2D91A 1NWGA 4NGOA 2G4PA 3EO5A 1NDGC 4ETEA 1GE3A 2LYZA 5ILFA 4WLXA 1ZVYB 2HU3A 3AGHA 3CT0A 3P66A 4LT2A 4N9RA 1F10A 3LYMA 3P64A 4L41A 9LYZA 1LHLA 1J1XY 1YKYX 1LZDA 1IWZA 4HTQA 4MSTA 1KXXA 1JUGA 1PS5A 2BQDA 3CSZA 2Z38A 1OUCA 3CB7A 3A95A 1BWJA 2BQGA 2CDSA 1HSXA 3K3TA 1GFVA 3AGGG 4OWEA 3A96A 3M3UA 5A3EA 1GF8A 3D9AC 1CJ9A 1GFRA 2YBLA 1B5YA 2BQBA 1B5XA 5LYMA 1YANA 5I4WA 3WU8A 2ZNXY 2GV0A 4NHTA 4WM2A 3T36A 1GB3A 4GN3A 4NY5A 1LZTA 4QDNA 1RFPA 2LYMA 4H94A 5KXNA 4GN4A 5KXOA 5LYZA 1G7LC 193LA 1ZV5L 5KXWA 2RSCA 2DQIY 5D5CA 1IC7Y 3LZTA 1GFUA 4EMNA 2FYDA 3CT1A 1QUTA 5B05A 1YROA 1I20A 2DQJY 2BPUA 4HV2A 3QE8A 4NHPA 3LYOA 3B72A 3B6LA 3IJVA 4BAFA 3IWRA 1IWUA 4TWSA 4RLMA 1YIKA 4QGZA 3RT5X 1HFXA 3TXEA 2FBBA 1B7LA 1LZ1A 1KXYA 3N9AA 4LYTA 4GCBA 1IR7A 4NWHA 1LJ3A 1GD6A 1WQQA 1B5WA 2MEEA 3CT5A 1JWRA 153LA 4W96A 2WARA 1CNSA 3TXDA 2Z2FA 4M6DA 4NGLA 2BLXA 1JKCA 2XTHA 2DBTA 5APEA 2MEDA 4NGZA 4DD3A 2F30A 2W1XA 5KXTA 134LA 4YENA 4OWBA 1HENA 1JITA 1C43A 4LYBA 1VAUA 5KXMA 4WM1A 2W1LA 1CKFA 1IWWA 1UIHA 1CJ6A 2VB1A 5EBHA 1BVKC 3B0KA 1OUFA 4G4CA 1NF5A 4LYMA 3W6BA 3WUAA 1F6SA 1BWHA 1H6MA 2G4QA 4H90A 1IC4Y 4DDAA 5I4XA 1GBZA 1IOQA 1WQOA 5E4PA 1IR9A 5HQ1A 3OK0A 4ETBA 5LIOA 2DQFC 1GF3A 5AMYA 4N8ZA 2Z2EA 4WM4A 5LINA 1UA6Y 2BQFA 2I25L 4N1EI 1JKDA 1OUGA 1FLQA 1HEWA 3AJNA 1A2YC 4RW2A 1DI4A 3ATOA 2FBDA 4DD1A 2BQIA 4PRUA 4WM3A 4ZEEA 4WLDA 5LA5A 4GCFA 1XGPC 2X0AA 4PGJB 2Z18A 1IP4A 1UICA 1XGTC 1XSFA 4IASA 4ZFPA 3GXKA 3MGWA 5LVKA 3A3QA 1GBWA 154LA 135LA 4J7VA 4KT3A 4J1AA 1INUA 1FDLY 4WO9A 5KXZA 1WQNA 1XFPL 2H9JA 1AT5A 4PHIA 4H91A 5C6LA 4HTNA 5LVIA 3WW5A 4RW1A 5FELA 2XBRA 4WM6A 4H9IA 1WTMA 3FE0A 5LVJA 5FSTA 1GF9A 1N4FA 1NMMA 1B0DA 1GB2A 1HFZA 1GB9A 4OWAA 194LA 3WPJA 3QNGA 2EPEA 1HEOA 1C45A 1LZEA 4NWEA 4TSBA 1DI5A 3AZ5A 2Z37A 1WVUA 1LZAA 1LYYA 1REYA 2MEAA 1LSPA 3A8ZA 3LYTA 5B07A 1IVMA 4DD9A 5IHGA 2D4JA 3ZVQB 2YSSC 4RLNA 2BQAA 1DPXA 2C8PA 1UC0A 1LHHA 2EIZC 4CJ2A 1UIAA 2DKVA 2EKSC 5APFA 2BQNA 4ETCA 2HUBA 1GEZA 3RNXA 4NG1A 4ET9A 1IP6A 1GBSA 1LZNA 3A6BY 5DL9A 1AT6A 1OUIA 3OJPA 3WPLA 1LJGA 1FKQA 1NBYC 1YL0X 2Z39A 4J0LA 1JTPL 3E3DA 2N5ZA 2Q0MX 1ZMYL 4G49A 1HEMA 2YBHA 4H1PA 1D6PA 2ZQ4A 2BLYA 4XYYA 5KXXA 3AYQA 1B7RA 1BB3A 1DPWA 4N0JA 4II8A 1LKRA 4P2EA 3TMUA 1FKVA 1GF0A 4WLYA 1O23A 5F81A 3W6AA 1TEWA 5B59A 1D6QA 3LYZA 1CJ7A 1C46A 4RDSA 1XEIA 2IHLA 1LCNA 1JKBA 2B5ZA 5HNCA 3KAMA 4IATA 4ETAA 1J1OY 1VDTA 4H9BA 4WOAA 3WULA 4D9ZA 5FCPA 1GEVA 3M18B 5HNLA 1MELL 1OUBA 3P65A 4PJ2C 1GDWA 1OUAA 1B5ZA 3A6CY 3LZ2A 2BQKA 1G7JC 4OWCA 1GXV2 1LJEA 1VATA 1W6ZA 6LYZA 4HV1A 1LZSA 4WG1A 1RCMA 1B7PA 1HF4A 1B5VA 2BAAA 4H93A 4J1BA 1B7OA 1LSFA 5KJ9A 1RJCB 1JHLA 4BADA 4H8XA 5LAFA 1HELA 2F2NA 5I5QA 4DC4A 1LZYA 3A34A 1LJHA 1DI3A 3J6KA 1LMAA 4NFVA 2ZILA 5IDDA 1LHIA 1LSBA 1FLUA 1LZ8A 1OUDA 2ZYCA 2HEDA 2MEFA 4UWVA 1GBYA 1BB4A 1HSWA 1OUEA 1RI8B 1YAQA 1D9UA 2D4KA 3A93A 4HPIA 2H5ZA 4NHIA 4XJFA 1JSFA 3TXIA 4B49A 3HBHA 5KY1A 3TXJA 3TXGA 1XEJA 2I6ZA 2PC2A 1CJ8A 4H9FA 1LSAA 3TMXA 1EL1A 3A67Y 3P68A 1IWTA 1GFTA 3ZVQA 4WM5A 5C6IA 1F6RA 2HU1A 1QUSA 2ZWBA 1LZCA 1UIFA 3W6EA 4ZIXA 208LA 3WU9A 1J1PY 2LZTA 1JJ1A 2YVBA 2D6BA 4YEMA 3G3BB 1V7SA 2Z19A 1IR8A 1JJ0A 1JTOL 1UIGA 4OWHA 1NQIA 1YAMA 4OOTA 1NBZC 4BAPA 3N9EA 1KIQC 4DD2A 4ET8A 2DQGY 5KXKA 1WQRA 1IOTA 4G4BA 4H9AA 1B5UA 1B9OA 1GAYA 4WLTA 4DD0A 1I56A 1SLYA 4WMGA 2FYCA 1GB0A 1JJ3A 4NGJA 1FBIX 1IY3A 1BB6A 1G7IC 4OOOA 5HMJA 2XBSA 1LJKA 1LMQA 3EMSA 4XJGA 1OP9B 1IP2A 4NGWA 4PRQA 2CWIA 4NSHA 1IO5A 1VDPA 4TSCA 4QEQA 2MEIA 4KXIA 3WU7A 1MLCE 1D0KA 2W1YA 4NGVA 1GFAA 4YOPA 4DWXA 1YILA 1P2CC 3F6ZA 3QY4A 4KPMA 4NSGA 4XN6A 5F16A 3HBDA 1VFBC 5KXYA 4R6CA 3AW6A 4AXTA 4LYOA 2HEEA 1LZ4A 3TMWA 1NDMC 1NHEA 4GN5C 5F9UA 5J7CA 3G3AB 4GLAA 4KL7A 1RE2A 1TDYA 1GFGA 1XEKA 2HECA 4N1CC 3W6CA 5FDJA 5K7OA 4FDYA 3WYHA 5DLAA 1LJFA 5LYTA 1CKDA 1HMKA 1T3PA 4HJYA 4CFPA 1LPIA 1UIEA 4XENA 4CFOA 3EBAB 2MECA 3WUMA 5HMVA 5KKIA 4C5FA 1BQLY 1C7PA 1B7MA 5A3ZA 4W94A 2YBIA 5B1GA 1C10A 2DQHY 1B7SA 3D3DA 4ML7A 1EQ4A 1CKCA 3LHMA 4NGKA 5KXPA 1KIPC 5B1FA 3ZEKA 3N9CA 5C6JA 5L3HA 3WW6A 3AZ6A 4HSFA 4C3WA 4XADA 4WL6A 1YKXX 1NKHA 1D0LA 1HEQA 1LHJA 1KXWA 2W1MA 2LZ2A 2HEFA 3BKVA 1HNLA 1QTEA 1HEPA 1LZ6A 1BB7A 1I1ZA 4UWUA 1FLWA 1QIOA 5LA8A 3TXFA 5IELA 1LMPA 1AZFA 1G7HC 4B4IA 1GE0A 4GLVA 4DDBA 2BQEA 4DDCA 1GFJA 3WMKA 1IOSA 1VDSA 2BQOA 3TMVA 1Z55A 4LZTA 1LMNA 4NSJA 4YEOA 1BWIA 3EXDA 1QQYA 1GBOA 3A92A 4Z98A 5KXSA 4H92A 1LYZA 1GFKA 1LMCA 1WQMA 2DQEY 4I0CA 1LMOA 5DN5A 1GF7A 1LSGA 4UWNA 4B0DA 5ILCA 5DN4A 4TUNA 3WPKA 1DXJA 4A7DA 5HLLA 1IC5Y 3ATNA 4Z41A 1LHMA 4G4HA 1HHLA 1LOZA 4MR1A 2AUBA 1BB5A 1AM7A 1GE1A 1FN5A 1LZRA 1C08C 1GB6A 1JPOA 5D5FA 1LJ4A 2A7DA 2NWDX 3RW8A 5I53A 4I8SA 1LSNA 2DQCY 1T6VL 1LSCA 1VEDA 2CGIA 5KXLA 1DKKA 3J4GA 1PZYA 2XJWA 1B2KA 1D0MA 3AW7A 4MCKA 133LA 1XGRC 4LYCA 2CJLA 3W6DA 4LFXA 1GE4A 2LHMA 3RZ4A 2EQLA 2MEBA 4H9EA 4NHQA 1V7TA 3WVYA 3TXKA 4B1AA 4YM8A 3IJUA 4GCDA 5JENB 1YL1X 2YBJA 1HC0A 2YBMA 4LYZA 4GCCA 2A7FA 1GB8A 1LTMA 2Y8PA 2YDGA 3TXBA 5F9XA 1IEEA 1OUHA 5E9RA 4XJBA 3AB6A 1LJIA 1REXA 1GPQC 3A90A 2HEBA 4ETDA 1SQ2L 1IOCA 5KXRA 4O34A 5B06A 4GCEA 4NGIA 1LSMA 5APCA 1LJJA 5KKJA 1ZVHL 1LSDA 1GF4A 1ALCA 1B7QA 1UIBA 4N5RA 1JIYA 1UBZA 5F14A 1IP3A 1YAOA 4HPEA 4U3XB 3FI7A 1UIDA 1YAPA 4LT0A 1OUJA 3ULRA 2ZIJA 1KIRC 4X3BA 3P4ZA 1GBXA 5FHWA 2HTXA 1IX0A 4IJ4A 1LSYA 1WTNA 2ZNWY 4YF2A 1IY4A 8LYZA 1LZ5A 1QDRA 1TCYA 5I54A 1BHZA 4XJDA 3WXUA 1REZA 3BKHA 3AGIA 1IIZA 2F4AA 1GF5A 2BQMA 1FLYA 1QSWA 1LKSA 3B0IA 4NG8A 5DM9A 3W3EA 4BS7A 1JTTL 1JKAA 1UCOA 132LA 1JEFA 1IP7A 6LYTA 1LAAA 1LYOA 1IWXA 1AKIA 4NEBA 4R0FA 5T3FA 4B4JA 5LVHA 5APDA 3LN2A 1LSEA 1CKGA 1WVVA 4TX7A 3T6UA 1REMA 1HERA 4LFPA 5LAGA 1EQEA 4DD7A 1UACY 4E3UA 1OQMA 3CSRA 4FJRA 1GB5A 4Z3MA 1QSAA 1DQJC 3A94A 1GWDA 4XJHA 3VWOA 4H8YA 4NGYA 1TAYA 1IP5A 2I26L 3CSQA 2DQAA 5FEKA 1GDXA 5L3IA 1HFYA 3WH1A 1GAZA 2BQCA 4LGKA 1W08A 3TXHA 4H9CA 3WUNA 4CGEA 4NHSA 1IORA 2Z12A 3WXTA 1LMTA 4ANRA 7LYZA 1IWYA 1GXXA 1WQPA 1YQVY 1QDTA 1YKZX 4CHXA 1GHLA 1UUZC 3HFMY 4XJIA 1LZGA 1QTKA 3WL2A 3CQLA 2H9KA 1XGUC 1F0WA 4DYGA 1B7NA 207LA 3W6FA 1GE2A 4WG7A 3RU5A 3HBEX 4HTKA 3SP3A 1E8LA 5LXWA 1G7MC 1BVXA 2YBNA 1DZBX 2D4IA 2IFFY 1H87A 4DT3A 5I4YA 5M1YA 1JISA 1HMLA 2BQHA 3AZ7A 4WO6A 4NSIA 3B0OA 3AZ4A 4B4EA 2LYOA 4NIJA 2F4GA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1DKJA 3DN3A 1L05A 1P2LA 1L69A 213LA 1LZ9A 3A91A 1GB7A 4ARQB 2BQJA 4TTDA 1LJNA 1QTHA 4EOFA 103LA 1TBYA 1C6QA 4HP0A 1VDQA 3WVXA 1LZBA 3C7YA 3HT8A 259LA 1JSEA 1LYSA 2F2QA 2G4NA 2D91A 2G4PA 1NDGC 2LYZA 1ZVYB 3QAKA 4DQ5A 3P66A 1L55A 1J1XY 1YKYX 4S0WA 2BQDA 1KNIA 3A95A 2CDSA 1HSXA 4W53A 1GFVA 5A3EA 1L44A 1LYGA 2B6ZA 184LA 1G07A 137LA 4DQJA 1L11A 255LA 193LA 1P56A 5KXWA 5D5CA 2NTGA 4ARQA 1C61A 3B6LA 3IJVA 4TWSA 1QSBA 2XQOA 1HFXA 3TXEA 1IR7A 4I7KA 4NWHA 178LA 1GD6A 1WQQA 1P46A 1L87A 4W96A 3TXDA 5APEA 176LA 4DD3A 2F30A 1CV0A 134LA 4OWBA 1HENA 2RBPA 1IWWA 1CJ6A 4I7NA 4DAJA 1L26A 4LYMA 3CDTA 1H6MA 4H90A 1IC4Y 4DDAA 1GBZA 1DYAA 3SN6R 4N8ZA 162LA 1UA6Y 2BQFA 4N1EI 3AJNA 4PRUA 5LA5A 1UICA 3MGWA 3A3QA 254LA 4KT3A 4J1AA 2H9JA 1AT5A 2XBRA 4WM6A 4GBRB 3FE0A 2OE9X 1C6GA 1C6CA 1GB2A 1HFZA 1QT8A 194LA 4NWEA 1DI5A 1L62A 231LA 3A8ZA 2BQAA 1JQUA 1DYGA 1L93A 1QTZA 1DPXA 1L81A 2C8PA 1QS5A 3GUMA 2EIZC 2EKSC 2DKVA 4NG1A 3L2XA 1AT6A 1LJGA 1FKQA 3C7WA 1K28A 2YBHA 3GUNA 1BB3A 2LCBA 1GF0A 5F81A 4WLYA 1O23A 3CDOA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5L9J A;  1IP1 A;  1DKJ A;  1LSZ A;  4LT3 A;  1LZ9 A;  3A91 A;  1GB7 A;  4QY9 A;  4HJZ A;  1IWV A;  2BQJ A;  4HJV A;  4G9S A;  4TTD A;  1CKH A;  2BQL A;  1LJN A;  4H9H A;  1LHK A;  2ZIK A;  4EOF A;  4Z46 A;  1TBY A;  2HEA A;  4PPO A;  4HP0 A;  3A3R X;  1A4V A;  1GF6 A;  1GFE A;  1VDQ A;  2DQD Y;  1XGQ C;  4H8Z A;  4OW1 A;  5II3 A;  2C8O A;  1BGI A;  3WVX A;  4LT1 A;  2ZYP A;  2ZQ3 A;  4AGA A;  1LZB A;  2MEG A;  2MEH A;  4M4O A;  4WL7 A;  5LVG A;  1EQ5 A;  1GFH A;  1JSE A;  1LYS A;  3GXR A;  2G4N A;  2D91 A;  1NWG A;  4NGO A;  2G4P A;  3EO5 A;  1NDG C;  4ETE A;  1GE3 A;  2LYZ A;  5ILF A;  4WLX A;  1ZVY B;  2HU3 A;  3AGH A;  3CT0 A;  3P66 A;  4LT2 A;  4N9R A;  1F10 A;  3LYM A;  3P64 A;  4L41 A;  9LYZ A;  1LHL A;  1J1X Y;  1YKY X;  1LZD A;  1IWZ A;  4HTQ A;  4MST A;  1KXX A;  1JUG A;  1PS5 A;  2BQD A;  3CSZ A;  2Z38 A;  1OUC A;  3CB7 A;  3A95 A;  1BWJ A;  2BQG A;  2CDS A;  1HSX A;  3K3T A;  1GFV A;  3AGG G;  4OWE A;  3A96 A;  3M3U A;  5A3E A;  1GF8 A;  3D9A C;  1CJ9 A;  1GFR A;  2YBL A;  1B5Y A; 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 1WTN A;  2ZNW Y;  4YF2 A;  1IY4 A;  8LYZ A;  1LZ5 A;  1QDR A;  1TCY A;  5I54 A;  1BHZ A;  4XJD A;  3WXU A;  1REZ A;  3BKH A;  3AGI A;  1IIZ A;  2F4A A;  1GF5 A;  2BQM A;  1FLY A;  1QSW A;  1LKS A;  3B0I A;  4NG8 A;  5DM9 A;  3W3E A;  4BS7 A;  1JTT L;  1JKA A;  1UCO A;  132L A;  1JEF A;  1IP7 A;  6LYT A;  1LAA A;  1LYO A;  1IWX A;  1AKI A;  4NEB A;  4R0F A;  5T3F A;  4B4J A;  5LVH A;  5APD A;  3LN2 A;  1LSE A;  1CKG A;  1WVV A;  4TX7 A;  3T6U A;  1REM A;  1HER A;  4LFP A;  5LAG A;  1EQE A;  4DD7 A;  1UAC Y;  4E3U A;  1OQM A;  3CSR A;  4FJR A;  1GB5 A;  4Z3M A;  1QSA A;  1DQJ C;  3A94 A;  1GWD A;  4XJH A;  3VWO A;  4H8Y A;  4NGY A;  1TAY A;  1IP5 A;  2I26 L;  3CSQ A;  2DQA A;  5FEK A;  1GDX A;  5L3I A;  1HFY A;  3WH1 A;  1GAZ A;  2BQC A;  4LGK A;  1W08 A;  3TXH A;  4H9C A;  3WUN A;  4CGE A;  4NHS A;  1IOR A;  2Z12 A;  3WXT A;  1LMT A;  4ANR A;  7LYZ A;  1IWY A;  1GXX A;  1WQP A;  1YQV Y;  1QDT A;  1YKZ X;  4CHX A;  1GHL A;  1UUZ C;  3HFM Y;  4XJI A;  1LZG A;  1QTK A;  3WL2 A;  3CQL A;  2H9K A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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